diff --git a/.gitignore b/.gitignore
index a0a8984108bab4c902ecf3a73bfa0fd28693fce6..9b07fc7475e1906093243482147dbf84ff7c1613 100755
--- a/.gitignore
+++ b/.gitignore
@@ -6,3 +6,4 @@ rulegraph.pdf
resources/bakta_db
facienda.md
workshop/pggb_latest.sif
+workshop/results
diff --git a/README.md b/README.md
index 8c55244bbf6722b8d81e5043a3caf63a993814da..0807a4d8976cf491b13b893e4d73f92831d8a5ab 100755
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -14,10 +14,10 @@ All this software is ready-to-use in a container (see the .def and .yml files in
## Set up conda environment with snakemake and singularity
```
-conda env create -f ./environment.yml
+conda env create -f config/environment.yml
```
## Run the pipeline
-It is assumed that the pipeline is run from within the PacbioSnake folder. If not, adapt paths accordingly.
+It is assumed that the pipeline is run from within the PacbioSnake folder. If not, adapt paths accordingly. If the pipeline is run from a different place than the pipeline folder, absolute paths for the input file and the output directory need to be provided.
```
# Connect to sciCORE through the terminal
diff --git a/README_old.md b/README_old.md
deleted file mode 100755
index 1efd40ab1e1511b030bbff1686be9ef149f8eaad..0000000000000000000000000000000000000000
--- a/README_old.md
+++ /dev/null
@@ -1,44 +0,0 @@
-# Genome assembly and variant calling from PacBio HiFi reads
-
-This folder contains two Snakemake workflows:
- - [*assembly*](assembly/README.md): from PacBio HiFi consensus reads to annotated genome assemblies
- - [*variantcalling*](variantcalling/README.md): combine assemblies into a pangenome graph and call variants from the graph
-
-This is ongoing work, some things will change.
-
-
-## Requirements
-On the sciCORE cluster, the pipeline is installed in the GROUP folder (**/scicore/home/gagneux/GROUP/PacbioSnake**) and ready to run.
-
-In other contexts, four things need to be set up before the pipeline can be run:
-
- 1. Install Snakemake and Singularity
- 2. Build the singularity container for the assembly pipeline
- 3. Download the bakta database for genome annotation
- 4. Pull the singularity container for the variant calling pipeline
-
-These steps are detailed below.
-
-
-### 1. Install Snakemake and Singularity
-As described on the [Snakemake](https://snakemake.readthedocs.io) and the [Singularity](https://docs.sylabs.io/guides/latest/user-guide/) sites.
-
-
-### 2. Build the singularity container for the assembly pipeline
-```
-cd assembly/container
-sudo singularity build assemblySC.sif assemblySC.def
-```
-
-
-### 3. Download the bakta database for genome annotation
-Light-weight (1.3 Gb) and full (33.1 Gb) databases for the *bakta* annotation tool can be downloaded from https://zenodo.org/records/7669534.
-The extracted folder should be located at assembly/resources/bakta_db/. Otherwise the path to the database can be modified in the assembly config file.
-
-
-### 4. Pull the singularity container for the variant calling pipeline
-```
-singularity pull docker://ghcr.io/pangenome/pggb:latest
-```
-
-
diff --git a/container/environment.yml b/container/environment.yml
index adfc0d230e3be14cdf5a5a7ce5606bff32e6805f..c164e6947164301eca6140d8b91857a5f9b68990 100755
--- a/container/environment.yml
+++ b/container/environment.yml
@@ -24,4 +24,4 @@ dependencies:
- ca-certificates
- certifi
- openssl
-prefix: /home/cristobal/anaconda3/envs/assemblySC
+
diff --git a/workflow/rules/circularize.smk b/workflow/rules/circularize.smk
index 94d3a62f95204b94689d88a6d848ec0679db847d..d5e731caee16f25ffb306f546eed74dd4ee89950 100755
--- a/workflow/rules/circularize.smk
+++ b/workflow/rules/circularize.smk
@@ -30,17 +30,27 @@ rule circlator_removeduplicates:
output: config["outdir"] +"/{sample}/circlator/02.bam2reads.nodup.fasta"
run:
- import sys
- from Bio import SeqIO
-
- record_dict = {}
+ seen = set()
+ output_handle = open(output[0], "w")
- for record in SeqIO.parse(input[0], "fasta"):
- record_dict[record.id] = record
-
- # record_dict = SeqIO.to_dict(SeqIO.parse(input[0], "fasta")) # Does not allow duplicate entries...
- with open(output[0], "w") as output_handle:
- SeqIO.write(record_dict.values(), output_handle, "fasta")
+ skip = False
+
+ with open(input[0], 'r') as f:
+ for line in f:
+ if line.startswith('>'):
+
+ seq_name = line[1:].strip()
+
+ if seq_name not in seen:
+ seen.add(seq_name)
+ output_handle.write(line)
+ skip = False
+ else:
+ skip = True
+
+ else:
+ if not skip:
+ output_handle.write(line)
rule circlator_localassembly:
diff --git a/workshop/A_create_graph.ipynb b/workshop/A_create_graph.ipynb
index 8d02ef63a5ee23d9a1069e20948989baf307e01c..d1be4f9d7a8f2fe20a06f1742adcd4fbd38aa898 100644
--- a/workshop/A_create_graph.ipynb
+++ b/workshop/A_create_graph.ipynb
@@ -27,7 +27,7 @@
},
{
"cell_type": "code",
- "execution_count": 18,
+ "execution_count": 2,
"metadata": {},
"outputs": [
{
@@ -136,7 +136,7 @@
"4 PB000196 contig_42 1662 52 N N 1 * -41,42"
]
},
- "execution_count": 18,
+ "execution_count": 2,
"metadata": {},
"output_type": "execute_result"
}
@@ -157,7 +157,7 @@
},
{
"cell_type": "code",
- "execution_count": 16,
+ "execution_count": 3,
"metadata": {},
"outputs": [
{
@@ -186,7 +186,7 @@
"Name: count, dtype: int64"
]
},
- "execution_count": 16,
+ "execution_count": 3,
"metadata": {},
"output_type": "execute_result"
}
@@ -204,7 +204,7 @@
},
{
"cell_type": "code",
- "execution_count": 17,
+ "execution_count": 4,
"metadata": {},
"outputs": [
{
@@ -460,7 +460,7 @@
"75 1 "
]
},
- "execution_count": 17,
+ "execution_count": 4,
"metadata": {},
"output_type": "execute_result"
}
@@ -478,7 +478,7 @@
},
{
"cell_type": "code",
- "execution_count": 35,
+ "execution_count": 5,
"metadata": {},
"outputs": [
{
@@ -776,7 +776,7 @@
"76 2,1,2 "
]
},
- "execution_count": 35,
+ "execution_count": 5,
"metadata": {},
"output_type": "execute_result"
}
@@ -794,14 +794,14 @@
},
{
"cell_type": "code",
- "execution_count": 24,
+ "execution_count": 6,
"metadata": {},
"outputs": [
{
"name": "stdout",
"output_type": "stream",
"text": [
- "{'PB000202', 'PB000220', 'PB000198', 'PB000196'}\n"
+ "{'PB000220', 'PB000202', 'PB000198', 'PB000196'}\n"
]
}
],
@@ -824,7 +824,7 @@
},
{
"cell_type": "code",
- "execution_count": 34,
+ "execution_count": 12,
"metadata": {},
"outputs": [
{
@@ -861,72 +861,708 @@
" </thead>\n",
" <tbody>\n",
" <tr>\n",
- " <th>1</th>\n",
- " <td>PB000196</td>\n",
- " <td>contig_10</td>\n",
- " <td>4421359</td>\n",
- " <td>133</td>\n",
+ " <th>20</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_50</td>\n",
+ " <td>4420883</td>\n",
+ " <td>37</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>2</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>50</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>21</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_49</td>\n",
+ " <td>216232</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
" <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,49,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>22</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_53</td>\n",
+ " <td>163344</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
" <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
" <td>1</td>\n",
" <td>*</td>\n",
- " <td>10,41</td>\n",
+ " <td>*,53,*</td>\n",
" </tr>\n",
" <tr>\n",
- " <th>2</th>\n",
- " <td>PB000196</td>\n",
- " <td>contig_47</td>\n",
- " <td>13589</td>\n",
- " <td>32</td>\n",
+ " <th>23</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_51</td>\n",
+ " <td>142109</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
" <td>N</td>\n",
" <td>Y</td>\n",
" <td>1</td>\n",
- " <td>48</td>\n",
- " <td>*,47,*</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,51,*</td>\n",
" </tr>\n",
" <tr>\n",
- " <th>3</th>\n",
- " <td>PB000196</td>\n",
- " <td>contig_1</td>\n",
- " <td>10270</td>\n",
- " <td>45</td>\n",
+ " <th>24</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_9</td>\n",
+ " <td>131264</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,9,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>25</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_8</td>\n",
+ " <td>120360</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,8,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>26</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_37</td>\n",
+ " <td>117735</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,37,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>27</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_2</td>\n",
+ " <td>117435</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,2,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>28</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_33</td>\n",
+ " <td>104292</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,33,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>29</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_44</td>\n",
+ " <td>102971</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,44,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>30</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_31</td>\n",
+ " <td>93943</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,31,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>31</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_6</td>\n",
+ " <td>89619</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,6,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>32</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_5</td>\n",
+ " <td>87578</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,5,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>33</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_23</td>\n",
+ " <td>85152</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,23,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>34</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_13</td>\n",
+ " <td>84548</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,13,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>35</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_19</td>\n",
+ " <td>76959</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,19,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>36</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_54</td>\n",
+ " <td>74739</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,54,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>37</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_52</td>\n",
+ " <td>72581</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,52,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>38</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_21</td>\n",
+ " <td>69776</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,21,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>39</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_20</td>\n",
+ " <td>68663</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,20,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>40</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_22</td>\n",
+ " <td>68060</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,22,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>41</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_15</td>\n",
+ " <td>67068</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,15,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>42</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_25</td>\n",
+ " <td>66397</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,25,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>43</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_12</td>\n",
+ " <td>55613</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,12,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>44</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_18</td>\n",
+ " <td>52108</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,18,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>45</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_17</td>\n",
+ " <td>51926</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
" <td>N</td>\n",
" <td>Y</td>\n",
" <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,17,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>46</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_1</td>\n",
+ " <td>47711</td>\n",
" <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
" <td>*,1,*</td>\n",
" </tr>\n",
" <tr>\n",
- " <th>4</th>\n",
- " <td>PB000196</td>\n",
+ " <th>47</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_48</td>\n",
+ " <td>45758</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,48,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>48</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
" <td>contig_42</td>\n",
- " <td>1662</td>\n",
- " <td>52</td>\n",
+ " <td>45451</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,42,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>49</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_38</td>\n",
+ " <td>45013</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
" <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,38,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>50</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_43</td>\n",
+ " <td>41645</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
" <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
" <td>1</td>\n",
" <td>*</td>\n",
- " <td>-41,42</td>\n",
+ " <td>*,43,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>51</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_34</td>\n",
+ " <td>39550</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,34,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>52</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_26</td>\n",
+ " <td>38539</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,26,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>53</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_30</td>\n",
+ " <td>37006</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,30,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>54</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_47</td>\n",
+ " <td>35474</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,47,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>55</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_28</td>\n",
+ " <td>33249</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,28,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>56</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_32</td>\n",
+ " <td>33146</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,32,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>57</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_41</td>\n",
+ " <td>32796</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,41,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>58</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_3</td>\n",
+ " <td>31924</td>\n",
+ " <td>7</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,3,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>59</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_40</td>\n",
+ " <td>31087</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,40,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>60</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_16</td>\n",
+ " <td>28303</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,16,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>61</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_36</td>\n",
+ " <td>26152</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,36,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>62</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_46</td>\n",
+ " <td>24509</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,46,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>63</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_45</td>\n",
+ " <td>19766</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,45,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>64</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_14</td>\n",
+ " <td>15999</td>\n",
+ " <td>5</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,14,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>65</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_24</td>\n",
+ " <td>15160</td>\n",
+ " <td>8</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,24,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>66</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_29</td>\n",
+ " <td>13880</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,29,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>67</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_39</td>\n",
+ " <td>12605</td>\n",
+ " <td>8</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,39,*</td>\n",
+ " </tr>\n",
+ " <tr>\n",
+ " <th>68</th>\n",
+ " <td>PB000205</td>\n",
+ " <td>contig_4</td>\n",
+ " <td>11914</td>\n",
+ " <td>6</td>\n",
+ " <td>N</td>\n",
+ " <td>Y</td>\n",
+ " <td>1</td>\n",
+ " <td>*</td>\n",
+ " <td>*,4,*</td>\n",
" </tr>\n",
" </tbody>\n",
"</table>\n",
"</div>"
],
"text/plain": [
- " sample #seq_name length cov. circ. repeat mult. alt_group graph_path\n",
- "1 PB000196 contig_10 4421359 133 N N 1 * 10,41\n",
- "2 PB000196 contig_47 13589 32 N Y 1 48 *,47,*\n",
- "3 PB000196 contig_1 10270 45 N Y 1 6 *,1,*\n",
- "4 PB000196 contig_42 1662 52 N N 1 * -41,42"
+ " sample #seq_name length cov. circ. repeat mult. alt_group \\\n",
+ "20 PB000205 contig_50 4420883 37 Y Y 2 * \n",
+ "21 PB000205 contig_49 216232 6 N Y 1 * \n",
+ "22 PB000205 contig_53 163344 6 N Y 1 * \n",
+ "23 PB000205 contig_51 142109 6 N Y 1 * \n",
+ "24 PB000205 contig_9 131264 6 N Y 1 * \n",
+ "25 PB000205 contig_8 120360 6 N Y 1 * \n",
+ "26 PB000205 contig_37 117735 6 N Y 1 * \n",
+ "27 PB000205 contig_2 117435 7 N Y 1 * \n",
+ "28 PB000205 contig_33 104292 6 N Y 1 * \n",
+ "29 PB000205 contig_44 102971 6 N Y 1 * \n",
+ "30 PB000205 contig_31 93943 5 N Y 1 * \n",
+ "31 PB000205 contig_6 89619 5 N Y 1 * \n",
+ "32 PB000205 contig_5 87578 6 N Y 1 * \n",
+ "33 PB000205 contig_23 85152 5 N Y 1 * \n",
+ "34 PB000205 contig_13 84548 5 N Y 1 * \n",
+ "35 PB000205 contig_19 76959 5 N Y 1 * \n",
+ "36 PB000205 contig_54 74739 5 N Y 1 * \n",
+ "37 PB000205 contig_52 72581 5 N Y 1 * \n",
+ "38 PB000205 contig_21 69776 6 N Y 1 * \n",
+ "39 PB000205 contig_20 68663 5 N Y 1 * \n",
+ "40 PB000205 contig_22 68060 6 N Y 1 * \n",
+ "41 PB000205 contig_15 67068 6 N Y 1 * \n",
+ "42 PB000205 contig_25 66397 7 N Y 1 * \n",
+ "43 PB000205 contig_12 55613 7 N Y 1 * \n",
+ "44 PB000205 contig_18 52108 5 N Y 1 * \n",
+ "45 PB000205 contig_17 51926 6 N Y 1 * \n",
+ "46 PB000205 contig_1 47711 6 N Y 1 * \n",
+ "47 PB000205 contig_48 45758 6 N Y 1 * \n",
+ "48 PB000205 contig_42 45451 5 N Y 1 * \n",
+ "49 PB000205 contig_38 45013 6 N Y 1 * \n",
+ "50 PB000205 contig_43 41645 5 N Y 1 * \n",
+ "51 PB000205 contig_34 39550 6 N Y 1 * \n",
+ "52 PB000205 contig_26 38539 7 N Y 1 * \n",
+ "53 PB000205 contig_30 37006 7 N Y 1 * \n",
+ "54 PB000205 contig_47 35474 6 N Y 1 * \n",
+ "55 PB000205 contig_28 33249 7 N Y 1 * \n",
+ "56 PB000205 contig_32 33146 5 N Y 1 * \n",
+ "57 PB000205 contig_41 32796 5 N Y 1 * \n",
+ "58 PB000205 contig_3 31924 7 N Y 1 * \n",
+ "59 PB000205 contig_40 31087 6 N Y 1 * \n",
+ "60 PB000205 contig_16 28303 6 N Y 1 * \n",
+ "61 PB000205 contig_36 26152 6 N Y 1 * \n",
+ "62 PB000205 contig_46 24509 6 N Y 1 * \n",
+ "63 PB000205 contig_45 19766 6 N Y 1 * \n",
+ "64 PB000205 contig_14 15999 5 N Y 1 * \n",
+ "65 PB000205 contig_24 15160 8 N Y 1 * \n",
+ "66 PB000205 contig_29 13880 6 N Y 1 * \n",
+ "67 PB000205 contig_39 12605 8 N Y 1 * \n",
+ "68 PB000205 contig_4 11914 6 N Y 1 * \n",
+ "\n",
+ " graph_path \n",
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+ "21 *,49,* \n",
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+ "24 *,9,* \n",
+ "25 *,8,* \n",
+ "26 *,37,* \n",
+ "27 *,2,* \n",
+ "28 *,33,* \n",
+ "29 *,44,* \n",
+ "30 *,31,* \n",
+ "31 *,6,* \n",
+ "32 *,5,* \n",
+ "33 *,23,* \n",
+ "34 *,13,* \n",
+ "35 *,19,* \n",
+ "36 *,54,* \n",
+ "37 *,52,* \n",
+ "38 *,21,* \n",
+ "39 *,20,* \n",
+ "40 *,22,* \n",
+ "41 *,15,* \n",
+ "42 *,25,* \n",
+ "43 *,12,* \n",
+ "44 *,18,* \n",
+ "45 *,17,* \n",
+ "46 *,1,* \n",
+ "47 *,48,* \n",
+ "48 *,42,* \n",
+ "49 *,38,* \n",
+ "50 *,43,* \n",
+ "51 *,34,* \n",
+ "52 *,26,* \n",
+ "53 *,30,* \n",
+ "54 *,47,* \n",
+ "55 *,28,* \n",
+ "56 *,32,* \n",
+ "57 *,41,* \n",
+ "58 *,3,* \n",
+ "59 *,40,* \n",
+ "60 *,16,* \n",
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+ "63 *,45,* \n",
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+ "66 *,29,* \n",
+ "67 *,39,* \n",
+ "68 *,4,* "
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- "execution_count": 34,
+ "execution_count": 12,
"metadata": {},
"output_type": "execute_result"
}
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"source": [
- "md[md['sample'] == 'PB000196']"
+ "md[md['sample'] == 'PB000205']"
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"cell_type": "markdown",
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- "# Run PGGB!\n",
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- "\n",
+ "# Run PGGB\n",
"\n",
"Important paramters:\n",
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" -p : Similarity of contigs\n",
" -s : Maximum length of repeats in the genome"
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diff --git a/workshop/D_graph_annotation.ipynb b/workshop/D_graph_annotation.ipynb
index e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391..85a70907df153fb706fcee7c541f58be39f0cf87 100644
--- a/workshop/D_graph_annotation.ipynb
+++ b/workshop/D_graph_annotation.ipynb
@@ -0,0 +1,18 @@
+{
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+ "source": [
+ "focus on esx, or pe/ppe"
+ ]
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+ "metadata": {
+ "language_info": {
+ "name": "python"
+ }
+ },
+ "nbformat": 4,
+ "nbformat_minor": 2
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diff --git a/workshop/README.md b/workshop/README.md
index c96d3aa6369f17750d7525064a19ff653769de40..880ebf2e2bdac7b6475f1b5d4ccef1c385f0902f 100644
--- a/workshop/README.md
+++ b/workshop/README.md
@@ -1,21 +1,22 @@
# Workshop: Long-read genome assembly and pangenome graph analysis
Swiss TPH, 5.11.2024
-The aim of this workshop is to get familiar with the pangenome graph framework,
+The aim of this workshop is to get familiar with the pangenome graph framework, which, given a set of accurate assemblies, allows a full characterization of genetic variation of any type in any region of the genome.
-It consists of a series of Jupyter notebooks in which we progress from creating
+It consists of two basic modules where we create a graph, visulize it, and call variants from it; and five "biological inference" modules where the graph is used to various things:
-This workshop consists of a collection of Jupyter notebooks that
+**Basics**
+* [Create a graph and visualize it](#create-a-graph--visualize-it)
+* [Call variants from a graph](#call-variants-from-a-graph)
-* [Set up](#set-up)
-* [The data](#the-data)
-* [A) Create a graph and visualize it](#a-create-a-graph--visualize)
-* [B) Call variants from a graph](#b-call-variants-from-a-graph)
-* [C) Core genome alignment](#c-core-genome-alignment)
-* [D) Graph annotation & liftovers](#d-graph-annotation--liftovers)
-* [E) SV categorization](#e-categorize-svs-into-insertions-and-deletions)
-* [F) Identify gene conversion events](#f-identify-gene-conversion-events)
+**Biological inference**
+* [Core genome alignment](#core-genome-alignment)
+* [Graph annotation & liftovers](#graph-annotation--liftovers)
+* [Insertion or deletion?](#categorize-svs-into-insertions-and-deletions)
+* [Identify gene conversion events](#identify-gene-conversion-events)
+* [Large unassembled duplications](#large-unassembled-duplications)
+* [Aligning sequences to a graph (to do)](#aligning-sequences-to-a-graph)
## Set up
@@ -46,26 +47,32 @@ conda create -n genomegraphs pandas biopython
## The data
The data we will explore in this workshop are 19 genomes that have been assembled from PacBio HiFi reads by Venus for her PhD project. All should be *Mycobacterium tuberculosis* strains belonging to lineage 1, and we expect them to be fairly diverse because they have been selected from across the diverse L1 clade. These genomes have neither been published nor thoroughly analyzed, so genuine discoveries are possible during the workshop!
+## Basics
-## A. Create a graph & visualize it
+### Create a graph & visualize it
Given a set of assemblies and some assembly metadata, we select assemblies, rename them, and write them to a single fasta file. This is the only mandatory input for PGGB. We also explore the effect of two key parameters of PGGB, the minimum pairwise identity between seeds (-p) and the seed length (-s).
-
-## B. Call variants from a graph
+### Call variants from a graph
In this part, we obtain variants in classic vcf format from the graph, using an arbitrary reference assembly. A summary is created of the indels and SVs, and the complication of nested SVs is explored.
-## C. Core genome alignment
-To make sense of genetic variation we need a phylogenetic tree. Here we traverse the graph and extract SNPs in nodes that are s in single strains. hared by all assemblies (i.e. the core genome). These SNPs are used to create an alignment and to estimate a tree.
+## Biological inference
+### Core genome alignment
+To make sense of genetic variation we need a phylogenetic tree. Here we traverse the graph and extract SNPs in nodes that are s in single strains. hared by all assemblies (i.e. the core genome). These SNPs are used to create an alignment and to estimate a tree.
-## D. Graph annotation & liftovers
+### Graph annotation & liftovers
In this part we explore variants in genes and regions of interest, making use of the lift-over functionalities of PGGB. These allow to translate positions in one genome to any other genome in the graph.
-
-## E. Categorize SVs into insertions and deletions
+### Categorize SVs into insertions and deletions
To tell whether a sequence missing in genome A reflects a deletion in an ancestor of A or an insertion elsewhere requires information about this sequence in more than two strains. Here we assess the frequency of he structural variant and its presence/absence in an outgroup strain in order to distinguish insertions from deletions.
-
-## F. Identify gene conversion events
+### Identify gene conversion events
Gene conversion occurs through recombination between close paralogs and can result in heavily mutated genes. Gene conversion in the MTBC affects the functionally interesting PE/PPE gene families. Furthermore, treating SNPs introduced throug gene conversion as point mutations can bias various downstream analyses. Here we identify gene conversion events, which give themselves away as variant hotspots in single strains.
+
+### Large unassembled duplications
+Large duplications and amplifications pose a challenge for long-read sequencing. But even if these regions may not be assembled properly, duplications can be identified and studied.
+
+
+### Aligning sequences to a graph
+Work in progress...
\ No newline at end of file
diff --git a/workshop/data/GCF_000195955.2_ASM19595v2_genomic.fna b/workshop/data/GCF_000195955.2_ASM19595v2_genomic.fna
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..75496be99c3e3a743470c444746808dfc480b607
--- /dev/null
+++ b/workshop/data/GCF_000195955.2_ASM19595v2_genomic.fna
@@ -0,0 +1,55146 @@
+>NC_000962.3 Mycobacterium tuberculosis H37Rv, complete genome
+TTGACCGATGACCCCGGTTCAGGCTTCACCACAGTGTGGAACGCGGTCGTCTCCGAACTTAACGGCGACCCTAAGGTTGA
+CGACGGACCCAGCAGTGATGCTAATCTCAGCGCTCCGCTGACCCCTCAGCAAAGGGCTTGGCTCAATCTCGTCCAGCCAT
+TGACCATCGTCGAGGGGTTTGCTCTGTTATCCGTGCCGAGCAGCTTTGTCCAAAACGAAATCGAGCGCCATCTGCGGGCC
+CCGATTACCGACGCTCTCAGCCGCCGACTCGGACATCAGATCCAACTCGGGGTCCGCATCGCTCCGCCGGCGACCGACGA
+AGCCGACGACACTACCGTGCCGCCTTCCGAAAATCCTGCTACCACATCGCCAGACACCACAACCGACAACGACGAGATTG
+ATGACAGCGCTGCGGCACGGGGCGATAACCAGCACAGTTGGCCAAGTTACTTCACCGAGCGCCCGCACAATACCGATTCC
+GCTACCGCTGGCGTAACCAGCCTTAACCGTCGCTACACCTTTGATACGTTCGTTATCGGCGCCTCCAACCGGTTCGCGCA
+CGCCGCCGCCTTGGCGATCGCAGAAGCACCCGCCCGCGCTTACAACCCCCTGTTCATCTGGGGCGAGTCCGGTCTCGGCA
+AGACACACCTGCTACACGCGGCAGGCAACTATGCCCAACGGTTGTTCCCGGGAATGCGGGTCAAATATGTCTCCACCGAG
+GAATTCACCAACGACTTCATTAACTCGCTCCGCGATGACCGCAAGGTCGCATTCAAACGCAGCTACCGCGACGTAGACGT
+GCTGTTGGTCGACGACATCCAATTCATTGAAGGCAAAGAGGGTATTCAAGAGGAGTTCTTCCACACCTTCAACACCTTGC
+ACAATGCCAACAAGCAAATCGTCATCTCATCTGACCGCCCACCCAAGCAGCTCGCCACCCTCGAGGACCGGCTGAGAACC
+CGCTTTGAGTGGGGGCTGATCACTGACGTACAACCACCCGAGCTGGAGACCCGCATCGCCATCTTGCGCAAGAAAGCACA
+GATGGAACGGCTCGCGGTCCCCGACGATGTCCTCGAACTCATCGCCAGCAGTATCGAACGCAATATCCGTGAACTCGAGG
+GCGCGCTGATCCGGGTCACCGCGTTCGCCTCATTGAACAAAACACCAATCGACAAAGCGCTGGCCGAGATTGTGCTTCGC
+GATCTGATCGCCGACGCCAACACCATGCAAATCAGCGCGGCGACGATCATGGCTGCCACCGCCGAATACTTCGACACTAC
+CGTCGAAGAGCTTCGCGGGCCCGGCAAGACCCGAGCACTGGCCCAGTCACGACAGATTGCGATGTACCTGTGTCGTGAGC
+TCACCGATCTTTCGTTGCCCAAAATCGGCCAAGCGTTCGGCCGTGATCACACAACCGTCATGTACGCCCAACGCAAGATC
+CTGTCCGAGATGGCCGAGCGCCGTGAGGTCTTTGATCACGTCAAAGAACTCACCACTCGCATCCGTCAGCGCTCCAAGCG
+CTAGCACGGCGTGTTCTTCCGACAACGTTCTTAAAAAAACTTCTCTCTCCCAGGTCACACCAGTCACAGAGATTGGCTGT
+GAGTGTCGCTGTGCACAAACCGCGCACAGACTCATACAGTCCCGGCGGTTCCGTTCACAACCCACGCCTCATCCCCACCG
+ACCCAACACACACCCCACAGTCATCGCCACCGTCATCCACAACTCCGACCGACGTCGACCTGCACCAAGACCAGACTGTC
+CCCAAACTGCACACCCTCTAATACTGTTACCGAGATTTCTTCGTCGTTTGTTCTTGGAAAGACAGCGCTGGGGATCGTTC
+GCTGGATACCACCCGCATAACTGGCTCGTCGCGGTGGGTCAGAGGTCAATGATGAACTTTCAAGTTGACGTGAGAAGCTC
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+CGCCGTGCTGACGGGTCCAAAGATGGAAAGACAAAGCTTTCCGATCGTGCCGGCCCCCCGGCGGCAGTAGACGATCAGCT
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 14914 15612 . + 0 ID=cds-YP_177615.1;Parent=gene-Rv0013;Dbxref=Genbank:YP_177615.1,GeneID:885955;Name=YP_177615.1;Note=glutamine amidotransferase%3B note that previously known as pabA.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=trpG;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv0013;product=anthranilate synthase component II;protein_id=YP_177615.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 15590 17470 . - . ID=gene-Rv0014c;Dbxref=GeneID:887072;Name=pknB;gbkey=Gene;gene=pknB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0014c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 15590 17470 . - 0 ID=cds-NP_214528.1;Parent=gene-Rv0014c;Dbxref=Genbank:NP_214528.1,GeneID:887072;Name=NP_214528.1;Note=Belongs to the Ser/Thr family of protein kinases. Experimental studies show evidence of auto-phosphorylation on serine/threonine residues. PknB has been shown to be a substrate for PstP and its kinase activity is affected by PstP-mediated dephosphorylation. PknB and PstP (Rv0018c) may act as a functional pair in vivo to control mycobacterial cell growth.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pknB;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv0014c;product=serine/threonine-protein kinase PknB;protein_id=NP_214528.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 17467 18762 . - . ID=gene-Rv0015c;Dbxref=GeneID:885953;Name=pknA;gbkey=Gene;gene=pknA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0015c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 17467 18762 . - 0 ID=cds-NP_214529.1;Parent=gene-Rv0015c;Dbxref=Genbank:NP_214529.1,GeneID:885953;Name=NP_214529.1;Note=Belongs to the Ser/Thr family of protein kinases. It has been shown that sodium orthovanadate inhibits the activity of the enzyme in vitro.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:21423706];gbkey=CDS;gene=pknA;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv0015c;product=serine/threonine-protein kinase PknA;protein_id=NP_214529.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 18759 20234 . - . ID=gene-Rv0016c;Dbxref=GeneID:887078;Name=pbpA;gbkey=Gene;gene=pbpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0016c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 18759 20234 . - 0 ID=cds-NP_214530.1;Parent=gene-Rv0016c;Dbxref=Genbank:NP_214530.1,GeneID:887078;Name=NP_214530.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pbpA;locus_tag=Rv0016c;product=penicillin-binding protein PbpA;protein_id=NP_214530.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 20231 21640 . - . ID=gene-Rv0017c;Dbxref=GeneID:887075;Name=rodA;gbkey=Gene;gene=rodA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ftsW;locus_tag=Rv0017c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 20231 21640 . - 0 ID=cds-NP_214531.1;Parent=gene-Rv0017c;Dbxref=Genbank:NP_214531.1,GeneID:887075;Name=NP_214531.1;Note=Belongs to the FTSW/RODA/SPOVE family.;gbkey=CDS;gene=rodA;locus_tag=Rv0017c;product=cell division protein RodA;protein_id=NP_214531.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 21637 23181 . - . ID=gene-Rv0018c;Dbxref=GeneID:887070;Name=pstP;gbkey=Gene;gene=pstP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0018c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 21637 23181 . - 0 ID=cds-NP_214532.1;Parent=gene-Rv0018c;Dbxref=Genbank:NP_214532.1,GeneID:887070;Name=NP_214532.1;Note=Experimental studies have shown that PstP specifically dephosporylates model phospho-Ser/Thr substrates and it is likely that PknB (Rv0014c) and PstP may act as a functional pair in vivo to control mycobacterial cell growth.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:21423706];gbkey=CDS;gene=pstP;locus_tag=Rv0018c;product=phosphoserine/threonine phosphatase PstP;protein_id=NP_214532.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 23173 23273 . - . ID=id-NC_000962.3:23173..23273;Note=101 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I. See Supply et al. (1997) Molecular Microbiology 26%2C 991-1003;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 23270 23737 . - . ID=gene-Rv0019c;Dbxref=GeneID:887079;Name=fhaB;gbkey=Gene;gene=fhaB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0019c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 23270 23737 . - 0 ID=cds-NP_214533.1;Parent=gene-Rv0019c;Dbxref=Genbank:NP_214533.1,GeneID:887079;Name=NP_214533.1;Note=FtsZ-interacting protein A;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein localization[PMID:20066037];gbkey=CDS;gene=fhaB;locus_tag=Rv0019c;product=FHA domain-containing protein FhaB;protein_id=NP_214533.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 23861 25444 . - . ID=gene-Rv0020c;Dbxref=GeneID:887067;Name=fhaA;gbkey=Gene;gene=fhaA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=TB39.8;locus_tag=Rv0020c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 23861 25444 . - 0 ID=cds-NP_214534.1;Parent=gene-Rv0020c;Dbxref=Genbank:NP_214534.1,GeneID:887067;Name=NP_214534.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fhaA;locus_tag=Rv0020c;product=FHA domain-containing protein FhaA;protein_id=NP_214534.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 25644 25726 . + . ID=gene-Rvnt03;Dbxref=GeneID:2700444;Name=leuT;gbkey=Gene;gene=leuT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt03
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 25644 25726 . + . ID=rna-Rvnt03;Parent=gene-Rvnt03;Dbxref=GeneID:2700444;Note=leuT%2C tRNA-Leu%2C anticodon cag%2C length %3D 83;anticodon=(pos:25677..25679);codons=19;gbkey=tRNA;gene=leuT;locus_tag=Rvnt03;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq exon 25644 25726 . + . ID=exon-Rvnt03-1;Parent=rna-Rvnt03;Dbxref=GeneID:2700444;Note=leuT%2C tRNA-Leu%2C anticodon cag%2C length %3D 83;anticodon=(pos:25677..25679);codons=19;gbkey=tRNA;gene=leuT;locus_tag=Rvnt03;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq gene 25913 26881 . - . ID=gene-Rv0021c;Dbxref=GeneID:887066;Name=Rv0021c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0021c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 25913 26881 . - 0 ID=cds-NP_214535.1;Parent=gene-Rv0021c;Dbxref=Genbank:NP_214535.1,GeneID:887066;Name=NP_214535.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0021c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214535.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 27023 27442 . - . ID=gene-Rv0022c;Dbxref=GeneID:887071;Name=whiB5;gbkey=Gene;gene=whiB5;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=whmG;locus_tag=Rv0022c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 27023 27442 . - 0 ID=cds-NP_214536.1;Parent=gene-Rv0022c;Dbxref=Genbank:NP_214536.1,GeneID:887071;Name=NP_214536.1;Note=alternate gene name: whmG%2C WhiB-like regulatory protein.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:22733573];gbkey=CDS;gene=whiB5;locus_tag=Rv0022c;product=transcriptional regulator WhiB5;protein_id=NP_214536.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 27595 28365 . + . ID=gene-Rv0023;Dbxref=GeneID:887062;Name=Rv0023;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0023
+NC_000962.3 RefSeq CDS 27595 28365 . + 0 ID=cds-NP_214537.1;Parent=gene-Rv0023;Dbxref=Genbank:NP_214537.1,GeneID:887062;Name=NP_214537.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0023;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214537.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 28362 29207 . + . ID=gene-Rv0024;Dbxref=GeneID:887061;Name=Rv0024;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0024
+NC_000962.3 RefSeq CDS 28362 29207 . + 0 ID=cds-NP_214538.1;Parent=gene-Rv0024;Dbxref=Genbank:NP_214538.1,GeneID:887061;Name=NP_214538.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0024;product=NLP/P60 family protein;protein_id=NP_214538.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 29245 29607 . + . ID=gene-Rv0025;Dbxref=GeneID:887060;Name=Rv0025;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0025
+NC_000962.3 RefSeq CDS 29245 29607 . + 0 ID=cds-NP_214539.1;Parent=gene-Rv0025;Dbxref=Genbank:NP_214539.1,GeneID:887060;Name=NP_214539.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0025;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214539.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 29722 31068 . + . ID=gene-Rv0026;Dbxref=GeneID:887057;Name=Rv0026;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0026
+NC_000962.3 RefSeq CDS 29722 31068 . + 0 ID=cds-NP_214540.1;Parent=gene-Rv0026;Dbxref=Genbank:NP_214540.1,GeneID:887057;Name=NP_214540.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0026;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214540.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 31189 31506 . + . ID=gene-Rv0027;Dbxref=GeneID:887054;Name=Rv0027;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0027
+NC_000962.3 RefSeq CDS 31189 31506 . + 0 ID=cds-NP_214541.1;Parent=gene-Rv0027;Dbxref=Genbank:NP_214541.1,GeneID:887054;Name=NP_214541.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0027;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214541.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 31514 31819 . + . ID=gene-Rv0028;Dbxref=GeneID:885812;Name=Rv0028;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0028
+NC_000962.3 RefSeq CDS 31514 31819 . + 0 ID=cds-NP_214542.1;Parent=gene-Rv0028;Dbxref=Genbank:NP_214542.1,GeneID:885812;Name=NP_214542.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0028;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214542.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 32057 33154 . + . ID=gene-Rv0029;Dbxref=GeneID:887053;Name=Rv0029;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0029
+NC_000962.3 RefSeq CDS 32057 33154 . + 0 ID=cds-NP_214543.1;Parent=gene-Rv0029;Dbxref=Genbank:NP_214543.1,GeneID:887053;Name=NP_214543.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0029;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214543.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 33224 33553 . + . ID=gene-Rv0030;Dbxref=GeneID:887051;Name=Rv0030;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0030
+NC_000962.3 RefSeq CDS 33224 33553 . + 0 ID=cds-NP_214544.1;Parent=gene-Rv0030;Dbxref=Genbank:NP_214544.1,GeneID:887051;Name=NP_214544.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0030;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214544.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 34295 36610 . + . ID=gene-Rv0032;Dbxref=GeneID:887050;Name=bioF2;gbkey=Gene;gene=bioF2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0032
+NC_000962.3 RefSeq CDS 34295 36610 . + 0 ID=cds-NP_214546.1;Parent=gene-Rv0032;Dbxref=Genbank:NP_214546.1,GeneID:887050;Name=NP_214546.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=bioF2;inference=protein motif:PROSITE:PS00599;locus_tag=Rv0032;product=8-amino-7-oxononanoate synthase;protein_id=NP_214546.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 36607 36870 . + . ID=gene-Rv0033;Dbxref=GeneID:887052;Name=acpA;gbkey=Gene;gene=acpA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=acpP;locus_tag=Rv0033
+NC_000962.3 RefSeq CDS 36607 36870 . + 0 ID=cds-NP_214547.1;Parent=gene-Rv0033;Dbxref=Genbank:NP_214547.1,GeneID:887052;Name=NP_214547.1;gbkey=CDS;gene=acpA;locus_tag=Rv0033;product=acyl carrier protein AcpA;protein_id=NP_214547.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 36867 37262 . + . ID=gene-Rv0034;Dbxref=GeneID:887046;Name=Rv0034;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0034
+NC_000962.3 RefSeq CDS 36867 37262 . + 0 ID=cds-NP_214548.1;Parent=gene-Rv0034;Dbxref=Genbank:NP_214548.1,GeneID:887046;Name=NP_214548.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0034;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214548.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 37259 38947 . + . ID=gene-Rv0035;Dbxref=GeneID:887048;Name=fadD34;gbkey=Gene;gene=fadD34;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0035
+NC_000962.3 RefSeq CDS 37259 38947 . + 0 ID=cds-YP_177686.1;Parent=gene-Rv0035;Dbxref=Genbank:YP_177686.1,GeneID:887048;Name=YP_177686.1;gbkey=CDS;gene=fadD34;locus_tag=Rv0035;product=fatty-acid--CoA ligase FadD34;protein_id=YP_177686.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 39056 39829 . - . ID=gene-Rv0036c;Dbxref=GeneID:887043;Name=Rv0036c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0036c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 39056 39829 . - 0 ID=cds-NP_214550.1;Parent=gene-Rv0036c;Dbxref=Genbank:NP_214550.1,GeneID:887043;Name=NP_214550.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0036c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214550.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 39877 41202 . - . ID=gene-Rv0037c;Dbxref=GeneID:887042;Name=Rv0037c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0037c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 39877 41202 . - 0 ID=cds-NP_214551.1;Parent=gene-Rv0037c;Dbxref=Genbank:NP_214551.1,GeneID:887042;Name=NP_214551.1;Note=member of major facilitator superfamily (MFS) possibly involved in transport of macrolide%3B integral membrane protein;experiment=DESCRIPTION:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0037c;product=MFS-type transporter;protein_id=NP_214551.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 41304 41912 . + . ID=gene-Rv0038;Dbxref=GeneID:887045;Name=Rv0038;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0038
+NC_000962.3 RefSeq CDS 41304 41912 . + 0 ID=cds-NP_214552.1;Parent=gene-Rv0038;Dbxref=Genbank:NP_214552.1,GeneID:887045;Name=NP_214552.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0038;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214552.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 42004 42351 . - . ID=gene-Rv0039c;Dbxref=GeneID:887038;Name=Rv0039c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0039c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 42004 42351 . - 0 ID=cds-NP_214553.1;Parent=gene-Rv0039c;Dbxref=Genbank:NP_214553.1,GeneID:887038;Name=NP_214553.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0039c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214553.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 42433 43365 . - . ID=gene-Rv0040c;Dbxref=GeneID:887037;Name=mtc28;gbkey=Gene;gene=mtc28;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0040c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 42433 43365 . - 0 ID=cds-NP_214554.2;Parent=gene-Rv0040c;Dbxref=Genbank:NP_214554.2,GeneID:887037;Name=NP_214554.2;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927)%3B secreted antigen;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=mtc28;locus_tag=Rv0040c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214554.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 43562 46471 . + . ID=gene-Rv0041;Dbxref=GeneID:887040;Name=leuS;gbkey=Gene;gene=leuS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0041
+NC_000962.3 RefSeq CDS 43562 46471 . + 0 ID=cds-NP_214555.1;Parent=gene-Rv0041;Dbxref=Genbank:NP_214555.1,GeneID:887040;Name=NP_214555.1;Note=leucyl-tRNA synthetase LeuS%3B Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-I signature. Belongs to class-I aminoacyl-tRNA synthetase family.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=leuS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv0041;product=leucine--tRNA ligase;protein_id=NP_214555.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 46581 47207 . - . ID=gene-Rv0042c;Dbxref=GeneID:887034;Name=Rv0042c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0042c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 46581 47207 . - 0 ID=cds-NP_214556.1;Parent=gene-Rv0042c;Dbxref=Genbank:NP_214556.1,GeneID:887034;Name=NP_214556.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0042c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214556.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 47366 48100 . - . ID=gene-Rv0043c;Dbxref=GeneID:887032;Name=Rv0043c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0043c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 47366 48100 . - 0 ID=cds-NP_214557.1;Parent=gene-Rv0043c;Dbxref=Genbank:NP_214557.1,GeneID:887032;Name=NP_214557.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0043c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214557.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 48233 49027 . - . ID=gene-Rv0044c;Dbxref=GeneID:887030;Name=Rv0044c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0044c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 48233 49027 . - 0 ID=cds-NP_214558.1;Parent=gene-Rv0044c;Dbxref=Genbank:NP_214558.1,GeneID:887030;Name=NP_214558.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0044c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214558.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 49043 49939 . - . ID=gene-Rv0045c;Dbxref=GeneID:887029;Name=Rv0045c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0045c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 49043 49939 . - 0 ID=cds-NP_214559.1;Parent=gene-Rv0045c;Dbxref=Genbank:NP_214559.1,GeneID:887029;Name=NP_214559.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0045c;product=hydrolase;protein_id=NP_214559.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 50021 51124 . - . ID=gene-Rv0046c;Dbxref=GeneID:887028;Name=ino1;gbkey=Gene;gene=ino1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=tbINO;locus_tag=Rv0046c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 50021 51124 . - 0 ID=cds-NP_214560.1;Parent=gene-Rv0046c;Dbxref=Genbank:NP_214560.1,GeneID:887028;Name=NP_214560.1;Note=Myo-inositol 1-phosphate synthase (MI-1-P synthase) (MIP synthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ino1;locus_tag=Rv0046c;product=inositol-3-phosphate synthase;protein_id=NP_214560.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 51185 51727 . - . ID=gene-Rv0047c;Dbxref=GeneID:887031;Name=Rv0047c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0047c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 51185 51727 . - 0 ID=cds-NP_214561.1;Parent=gene-Rv0047c;Dbxref=Genbank:NP_214561.1,GeneID:887031;Name=NP_214561.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0047c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214561.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 51828 52697 . - . ID=gene-Rv0048c;Dbxref=GeneID:887027;Name=Rv0048c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0048c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 51828 52697 . - 0 ID=cds-NP_214562.1;Parent=gene-Rv0048c;Dbxref=Genbank:NP_214562.1,GeneID:887027;Name=NP_214562.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0048c;product=membrane protein;protein_id=NP_214562.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 52831 53244 . + . ID=gene-Rv0049;Dbxref=GeneID:887024;Name=Rv0049;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0049
+NC_000962.3 RefSeq CDS 52831 53244 . + 0 ID=cds-NP_214563.1;Parent=gene-Rv0049;Dbxref=Genbank:NP_214563.1,GeneID:887024;Name=NP_214563.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0049;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214563.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 53663 55699 . + . ID=gene-Rv0050;Dbxref=GeneID:887065;Name=ponA1;gbkey=Gene;gene=ponA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0050
+NC_000962.3 RefSeq CDS 53663 55699 . + 0 ID=cds-YP_177687.1;Parent=gene-Rv0050;Dbxref=Genbank:YP_177687.1,GeneID:887065;Name=YP_177687.1;Note=penicillin-binding protein (class A)%2C bienzymatic protein with transglycosylase and transpeptidase activities;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:11802794];gbkey=CDS;gene=ponA1;locus_tag=Rv0050;product=bifunctional penicillin-insensitive transglycosylase/penicillin-sensitive transpeptidase;protein_id=YP_177687.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 55696 57378 . + . ID=gene-Rv0051;Dbxref=GeneID:887018;Name=Rv0051;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0051
+NC_000962.3 RefSeq CDS 55696 57378 . + 0 ID=cds-NP_214565.1;Parent=gene-Rv0051;Dbxref=Genbank:NP_214565.1,GeneID:887018;Name=NP_214565.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0051;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214565.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 57410 57973 . + . ID=gene-Rv0052;Dbxref=GeneID:887015;Name=Rv0052;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0052
+NC_000962.3 RefSeq CDS 57410 57973 . + 0 ID=cds-NP_214566.3;Parent=gene-Rv0052;Dbxref=Genbank:NP_214566.3,GeneID:887015;Name=NP_214566.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0052;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214566.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 58192 58482 . + . ID=gene-Rv0053;Dbxref=GeneID:887020;Name=rpsF;gbkey=Gene;gene=rpsF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0053
+NC_000962.3 RefSeq CDS 58192 58482 . + 0 ID=cds-NP_214567.1;Parent=gene-Rv0053;Dbxref=Genbank:NP_214567.1,GeneID:887020;Name=NP_214567.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsF;inference=protein motif:PROSITE:PS01048;locus_tag=Rv0053;product=30S ribosomal protein S6;protein_id=NP_214567.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 58586 59080 . + . ID=gene-Rv0054;Dbxref=GeneID:887013;Name=ssb;gbkey=Gene;gene=ssb;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0054
+NC_000962.3 RefSeq CDS 58586 59080 . + 0 ID=cds-NP_214568.1;Parent=gene-Rv0054;Dbxref=Genbank:NP_214568.1,GeneID:887013;Name=NP_214568.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ssb;locus_tag=Rv0054;product=single-strand DNA-binding protein;protein_id=NP_214568.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 59122 59376 . + . ID=gene-Rv0055;Dbxref=GeneID:887022;Name=rpsR1;gbkey=Gene;gene=rpsR1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rpsR;locus_tag=Rv0055
+NC_000962.3 RefSeq CDS 59122 59376 . + 0 ID=cds-YP_177688.1;Parent=gene-Rv0055;Dbxref=Genbank:YP_177688.1,GeneID:887022;Name=YP_177688.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsR1;locus_tag=Rv0055;product=30S ribosomal protein S18;protein_id=YP_177688.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 59409 59867 . + . ID=gene-Rv0056;Dbxref=GeneID:887010;Name=rplI;gbkey=Gene;gene=rplI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0056
+NC_000962.3 RefSeq CDS 59409 59867 . + 0 ID=cds-NP_214570.1;Parent=gene-Rv0056;Dbxref=Genbank:NP_214570.1,GeneID:887010;Name=NP_214570.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplI;inference=protein motif:PROSITE:PS00651;locus_tag=Rv0056;product=50S ribosomal protein L9;protein_id=NP_214570.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 59896 60417 . + . ID=gene-Rv0057;Dbxref=GeneID:887008;Name=Rv0057;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0057
+NC_000962.3 RefSeq CDS 59896 60417 . + 0 ID=cds-NP_214571.1;Parent=gene-Rv0057;Dbxref=Genbank:NP_214571.1,GeneID:887008;Name=NP_214571.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0057;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214571.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 60396 63020 . + . ID=gene-Rv0058;Dbxref=GeneID:887009;Name=dnaB;gbkey=Gene;gene=dnaB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0058
+NC_000962.3 RefSeq CDS 60396 63020 . + 0 ID=cds-NP_214572.1;Parent=gene-Rv0058;Dbxref=Genbank:NP_214572.1,GeneID:887009;Name=NP_214572.1;Note=Contains an intein (position 61630..62838). This protein undergoes a protein self splicing that involves a post-translational excision of the intervening region (intein) followed by peptide ligation. In the intein section%3B belongs to the homing endonuclease family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=dnaB;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0058;product=replicative DNA helicase;protein_id=NP_214572.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 63200 63892 . + . ID=gene-Rv0059;Dbxref=GeneID:887006;Name=Rv0059;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0059
+NC_000962.3 RefSeq CDS 63200 63892 . + 0 ID=cds-NP_214573.1;Parent=gene-Rv0059;Dbxref=Genbank:NP_214573.1,GeneID:887006;Name=NP_214573.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0059;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214573.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 63909 64967 . + . ID=gene-Rv0060;Dbxref=GeneID:887004;Name=Rv0060;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0060
+NC_000962.3 RefSeq CDS 63909 64967 . + 0 ID=cds-NP_214574.1;Parent=gene-Rv0060;Dbxref=Genbank:NP_214574.1,GeneID:887004;Name=NP_214574.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0060;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214574.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 65012 65350 . - . ID=gene-Rv0061c;Dbxref=GeneID:14515843;Name=Rv0061c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0061c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 65012 65350 . - 0 ID=cds-YP_007408697.1;Parent=gene-Rv0061c;Dbxref=Genbank:YP_007408697.1,GeneID:14515843;Name=YP_007408697.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0061c;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007408697.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 65552 66694 . + . ID=gene-Rv0062;Dbxref=GeneID:887007;Name=celA1;gbkey=Gene;gene=celA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cel6,celA;locus_tag=Rv0062
+NC_000962.3 RefSeq CDS 65552 66694 . + 0 ID=cds-YP_177689.1;Parent=gene-Rv0062;Dbxref=Genbank:YP_177689.1,GeneID:887007;Name=YP_177689.1;Note=belongs to cellulase family B (family 6 of glycosyl hydrolases);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=celA1;locus_tag=Rv0062;product=cellulase CelA;protein_id=YP_177689.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 66923 68362 . + . ID=gene-Rv0063;Dbxref=GeneID:886999;Name=Rv0063;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0063
+NC_000962.3 RefSeq CDS 66923 68362 . + 0 ID=cds-NP_214577.1;Parent=gene-Rv0063;Dbxref=Genbank:NP_214577.1,GeneID:886999;Name=NP_214577.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00862;locus_tag=Rv0063;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214577.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 68418 68579 . + . ID=gene-Rv0063a;Dbxref=GeneID:19394667;Name=Rv0063a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0063a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 68418 68579 . + 0 ID=cds-YP_009030026.1;Parent=gene-Rv0063a;Dbxref=Genbank:YP_009030026.1,GeneID:19394667;Name=YP_009030026.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0063a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030026.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 68620 71559 . + . ID=gene-Rv0064;Dbxref=GeneID:886996;Name=Rv0064;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0064
+NC_000962.3 RefSeq CDS 68620 71559 . + 0 ID=cds-NP_214578.1;Parent=gene-Rv0064;Dbxref=Genbank:NP_214578.1,GeneID:886996;Name=NP_214578.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0064;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214578.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 71589 71828 . + . ID=gene-Rv0064A;Dbxref=GeneID:14515844;Name=vapB1;gbkey=Gene;gene=vapB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0064A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 71589 71828 . + 0 ID=cds-YP_007408701.1;Parent=gene-Rv0064A;Dbxref=Genbank:YP_007408701.1,GeneID:14515844;Name=YP_007408701.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0065;gbkey=CDS;gene=vapB1;locus_tag=Rv0064A;product=antitoxin VapB1;protein_id=YP_007408701.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 71821 72222 . + . ID=gene-Rv0065;Dbxref=GeneID:886993;Name=vapC1;gbkey=Gene;gene=vapC1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0065
+NC_000962.3 RefSeq CDS 71821 72222 . + 0 ID=cds-NP_214579.1;Parent=gene-Rv0065;Dbxref=Genbank:NP_214579.1,GeneID:886993;Name=NP_214579.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0064A;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:22539524];gbkey=CDS;gene=vapC1;locus_tag=Rv0065;product=ribonuclease VapC1;protein_id=NP_214579.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 72274 74511 . - . ID=gene-Rv0066c;Dbxref=GeneID:887016;Name=icd2;gbkey=Gene;gene=icd2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0066c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 72274 74511 . - 0 ID=cds-NP_214580.1;Parent=gene-Rv0066c;Dbxref=Genbank:NP_214580.1,GeneID:887016;Name=NP_214580.1;Note=Belongs to the monomeric-type family of IDH. Note that in H37Rv;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=icd2;locus_tag=Rv0066c;product=isocitrate dehydrogenase;protein_id=NP_214580.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 74629 75198 . - . ID=gene-Rv0067c;Dbxref=GeneID:886991;Name=Rv0067c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0067c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 74629 75198 . - 0 ID=cds-NP_214581.1;Parent=gene-Rv0067c;Dbxref=Genbank:NP_214581.1,GeneID:886991;Name=NP_214581.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0067c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214581.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 75301 76212 . + . ID=gene-Rv0068;Dbxref=GeneID:886989;Name=Rv0068;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0068
+NC_000962.3 RefSeq CDS 75301 76212 . + 0 ID=cds-NP_214582.1;Parent=gene-Rv0068;Dbxref=Genbank:NP_214582.1,GeneID:886989;Name=NP_214582.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0068;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214582.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 76237 77622 . - . ID=gene-Rv0069c;Dbxref=GeneID:886986;Name=sdaA;gbkey=Gene;gene=sdaA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0069c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 76237 77622 . - 0 ID=cds-NP_214583.1;Parent=gene-Rv0069c;Dbxref=Genbank:NP_214583.1,GeneID:886986;Name=NP_214583.1;Note=Belongs to the iron-sulfur dependent L-serine dehydratase family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=sdaA;locus_tag=Rv0069c;product=L-serine dehydratase;protein_id=NP_214583.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 77619 78896 . - . ID=gene-Rv0070c;Dbxref=GeneID:886983;Name=glyA2;gbkey=Gene;gene=glyA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0070c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 77619 78896 . - 0 ID=cds-NP_214584.1;Parent=gene-Rv0070c;Dbxref=Genbank:NP_214584.1,GeneID:886983;Name=NP_214584.1;Note=Belongs to the ShmT family. Cofactor: pyridoxal phosphate.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=glyA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00096;locus_tag=Rv0070c;product=serine hydroxymethyltransferase;protein_id=NP_214584.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 79486 80193 . + . ID=gene-Rv0071;Dbxref=GeneID:886988;Name=Rv0071;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0071
+NC_000962.3 RefSeq CDS 79486 80193 . + 0 ID=cds-NP_214585.1;Parent=gene-Rv0071;Dbxref=Genbank:NP_214585.1,GeneID:886988;Name=NP_214585.1;Note=group II intron maturase family. Contains 5 VDP repeats at N-terminus.;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0071;product=maturase;protein_id=NP_214585.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 79507 79551 . + . ID=id-Rv0071;Dbxref=GeneID:886988;Note=5 x 9 bp GTGGACCCG repeats;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv0071
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 80236 80550 . + . ID=id-NC_000962.3:80236..80550;Note=(MTV030.15)%2C len: 315 nt. Probable REP'-1 pseudogene fragment;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 80624 81673 . + . ID=gene-Rv0072;Dbxref=GeneID:886984;Name=Rv0072;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0072
+NC_000962.3 RefSeq CDS 80624 81673 . + 0 ID=cds-NP_214586.1;Parent=gene-Rv0072;Dbxref=Genbank:NP_214586.1,GeneID:886984;Name=NP_214586.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0072;product=glutamine ABC transporter permease;protein_id=NP_214586.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 81676 82668 . + . ID=gene-Rv0073;Dbxref=GeneID:886977;Name=Rv0073;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0073
+NC_000962.3 RefSeq CDS 81676 82668 . + 0 ID=cds-NP_214587.1;Parent=gene-Rv0073;Dbxref=Genbank:NP_214587.1,GeneID:886977;Name=NP_214587.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00889;locus_tag=Rv0073;product=glutamine ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_214587.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 82748 83983 . + . ID=gene-Rv0074;Dbxref=GeneID:886976;Name=Rv0074;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0074
+NC_000962.3 RefSeq CDS 82748 83983 . + 0 ID=cds-NP_214588.1;Parent=gene-Rv0074;Dbxref=Genbank:NP_214588.1,GeneID:886976;Name=NP_214588.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0074;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214588.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 83996 85168 . + . ID=gene-Rv0075;Dbxref=GeneID:886982;Name=Rv0075;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0075
+NC_000962.3 RefSeq CDS 83996 85168 . + 0 ID=cds-NP_214589.1;Parent=gene-Rv0075;Dbxref=Genbank:NP_214589.1,GeneID:886982;Name=NP_214589.1;Note=class-II pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferases (MALY/PATB subfamily);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0075;product=aminotransferase;protein_id=NP_214589.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 85183 85572 . - . ID=gene-Rv0076c;Dbxref=GeneID:886992;Name=Rv0076c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0076c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 85183 85572 . - 0 ID=cds-NP_214590.1;Parent=gene-Rv0076c;Dbxref=Genbank:NP_214590.1,GeneID:886992;Name=NP_214590.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0076c;product=membrane protein;protein_id=NP_214590.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 85636 86466 . - . ID=gene-Rv0077c;Dbxref=GeneID:886969;Name=Rv0077c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0077c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 85636 86466 . - 0 ID=cds-NP_214591.1;Parent=gene-Rv0077c;Dbxref=Genbank:NP_214591.1,GeneID:886969;Name=NP_214591.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0077c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214591.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 86528 87133 . + . ID=gene-Rv0078;Dbxref=GeneID:886990;Name=Rv0078;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0078
+NC_000962.3 RefSeq CDS 86528 87133 . + 0 ID=cds-NP_214592.1;Parent=gene-Rv0078;Dbxref=Genbank:NP_214592.1,GeneID:886990;Name=NP_214592.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0078;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214592.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 87208 87801 . - . ID=gene-Rv0078A;Dbxref=GeneID:3205053;Name=Rv0078A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0078A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 87208 87801 . - 0 ID=cds-YP_177616.1;Parent=gene-Rv0078A;Dbxref=Genbank:YP_177616.1,GeneID:3205053;Name=YP_177616.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0078A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177616.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 87798 88004 . - . ID=gene-Rv0078B;Dbxref=GeneID:14515845;Name=Rv0078B;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0078B
+NC_000962.3 RefSeq CDS 87798 88004 . - 0 ID=cds-YP_007408717.1;Parent=gene-Rv0078B;Dbxref=Genbank:YP_007408717.1,GeneID:14515845;Name=YP_007408717.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0078B;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007408717.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 88204 89025 . + . ID=gene-Rv0079;Dbxref=GeneID:886995;Name=Rv0079;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0079
+NC_000962.3 RefSeq CDS 88204 89025 . + 0 ID=cds-NP_214593.1;Parent=gene-Rv0079;Dbxref=Genbank:NP_214593.1,GeneID:886995;Name=NP_214593.1;Note=possible vaccine candidate (See Zvi et al.%2C2008 PMID:8505592).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0079;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214593.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 89022 89480 . + . ID=gene-Rv0080;Dbxref=GeneID:886966;Name=Rv0080;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0080
+NC_000962.3 RefSeq CDS 89022 89480 . + 0 ID=cds-NP_214594.1;Parent=gene-Rv0080;Dbxref=Genbank:NP_214594.1,GeneID:886966;Name=NP_214594.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0080;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214594.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 89575 89919 . + . ID=gene-Rv0081;Dbxref=GeneID:887012;Name=Rv0081;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0081
+NC_000962.3 RefSeq CDS 89575 89919 . + 0 ID=cds-NP_214595.1;Parent=gene-Rv0081;Dbxref=Genbank:NP_214595.1,GeneID:887012;Name=NP_214595.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0081;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214595.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 89924 90403 . + . ID=gene-Rv0082;Dbxref=GeneID:886968;Name=Rv0082;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0082
+NC_000962.3 RefSeq CDS 89924 90403 . + 0 ID=cds-NP_214596.2;Parent=gene-Rv0082;Dbxref=Genbank:NP_214596.2,GeneID:886968;Name=NP_214596.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0082;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214596.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 90400 92322 . + . ID=gene-Rv0083;Dbxref=GeneID:886965;Name=Rv0083;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0083
+NC_000962.3 RefSeq CDS 90400 92322 . + 0 ID=cds-NP_214597.1;Parent=gene-Rv0083;Dbxref=Genbank:NP_214597.1,GeneID:886965;Name=NP_214597.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0083;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214597.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 92328 93278 . + . ID=gene-Rv0084;Dbxref=GeneID:886959;Name=hycD;gbkey=Gene;gene=hycD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=hevD;locus_tag=Rv0084
+NC_000962.3 RefSeq CDS 92328 93278 . + 0 ID=cds-NP_214598.1;Parent=gene-Rv0084;Dbxref=Genbank:NP_214598.1,GeneID:886959;Name=NP_214598.1;Note=alternate gene name: hevD%2C formate hydrogenlyase%2Cintegral membrane protein%2C belongs to the complex I subunit 1 family.;gbkey=CDS;gene=hycD;locus_tag=Rv0084;product=formate hydrogenlyase HycD;protein_id=NP_214598.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 93289 93951 . + . ID=gene-Rv0085;Dbxref=GeneID:886973;Name=hycP;gbkey=Gene;gene=hycP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0085
+NC_000962.3 RefSeq CDS 93289 93951 . + 0 ID=cds-NP_214599.1;Parent=gene-Rv0085;Dbxref=Genbank:NP_214599.1,GeneID:886973;Name=NP_214599.1;Note=belongs to NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L superfamily;gbkey=CDS;gene=hycP;locus_tag=Rv0085;product=hydrogenase HycP;protein_id=NP_214599.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 93951 95417 . + . ID=gene-Rv0086;Dbxref=GeneID:886963;Name=hycQ;gbkey=Gene;gene=hycQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0086
+NC_000962.3 RefSeq CDS 93951 95417 . + 0 ID=cds-NP_214600.1;Parent=gene-Rv0086;Dbxref=Genbank:NP_214600.1,GeneID:886963;Name=NP_214600.1;Note=belongs to the NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) superfamily;gbkey=CDS;gene=hycQ;locus_tag=Rv0086;product=hydrogenase HycQ;protein_id=NP_214600.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 95414 96892 . + . ID=gene-Rv0087;Dbxref=GeneID:886956;Name=hycE;gbkey=Gene;gene=hycE;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=hevE;locus_tag=Rv0087
+NC_000962.3 RefSeq CDS 95414 96892 . + 0 ID=cds-NP_214601.1;Parent=gene-Rv0087;Dbxref=Genbank:NP_214601.1,GeneID:886956;Name=NP_214601.1;Note=alternate gene name: hevE%2C formate hydrogenlyase%2C belongs to the complex I 49 kDa subunit family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=hycE;locus_tag=Rv0087;product=formate hydrogenase HycE;protein_id=NP_214601.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 96927 97601 . + . ID=gene-Rv0088;Dbxref=GeneID:886954;Name=Rv0088;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0088
+NC_000962.3 RefSeq CDS 96927 97601 . + 0 ID=cds-NP_214602.1;Parent=gene-Rv0088;Dbxref=Genbank:NP_214602.1,GeneID:886954;Name=NP_214602.1;Note=belongs to the SRPBCC ligand-binding domain superfamily;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0088;product=polyketide cyclase/dehydrase;protein_id=NP_214602.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 97758 98351 . + . ID=gene-Rv0089;Dbxref=GeneID:886949;Name=Rv0089;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0089
+NC_000962.3 RefSeq CDS 97758 98351 . + 0 ID=cds-NP_214603.1;Parent=gene-Rv0089;Dbxref=Genbank:NP_214603.1,GeneID:886949;Name=NP_214603.1;Note=Belongs to the methyltransferase superfamily.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0089;product=methyltransferase;protein_id=NP_214603.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 98480 99250 . + . ID=gene-Rv0090;Dbxref=GeneID:886961;Name=Rv0090;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0090
+NC_000962.3 RefSeq CDS 98480 99250 . + 0 ID=cds-NP_214604.1;Parent=gene-Rv0090;Dbxref=Genbank:NP_214604.1,GeneID:886961;Name=NP_214604.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0090;product=membrane protein;protein_id=NP_214604.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 99684 100451 . + . ID=gene-Rv0091;Dbxref=GeneID:886953;Name=mtn;gbkey=Gene;gene=mtn;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=pfs;locus_tag=Rv0091
+NC_000962.3 RefSeq CDS 99684 100451 . + 0 ID=cds-NP_214605.1;Parent=gene-Rv0091;Dbxref=Genbank:NP_214605.1,GeneID:886953;Name=NP_214605.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mtn;locus_tag=Rv0091;product=5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase;protein_id=NP_214605.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 100583 102868 . + . ID=gene-Rv0092;Dbxref=GeneID:886946;Name=ctpA;gbkey=Gene;gene=ctpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0092
+NC_000962.3 RefSeq CDS 100583 102868 . + 0 ID=cds-NP_214606.1;Parent=gene-Rv0092;Dbxref=Genbank:NP_214606.1,GeneID:886946;Name=NP_214606.1;Note=Belongs to the cation transport ATPases family (E1-E2 ATPases)%2C subfamily IB.;gbkey=CDS;gene=ctpA;inference=protein motif:PROSITE:PS01047;locus_tag=Rv0092;product=cation transporter ATPase A;protein_id=NP_214606.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 102815 103663 . - . ID=gene-Rv0093c;Dbxref=GeneID:886945;Name=Rv0093c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0093c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 102815 103663 . - 0 ID=cds-NP_214607.1;Parent=gene-Rv0093c;Dbxref=Genbank:NP_214607.1,GeneID:886945;Name=NP_214607.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0093c;product=membrane protein;protein_id=NP_214607.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 103710 104663 . - . ID=gene-Rv0094c;Dbxref=GeneID:886943;Name=Rv0094c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0094c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 103710 104663 . - 0 ID=cds-NP_214608.1;Parent=gene-Rv0094c;Dbxref=Genbank:NP_214608.1,GeneID:886943;Name=NP_214608.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0094c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214608.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 103713 105215 . - . ID=id-NC_000962.3:103713..105215;Note=REP-2%2C len: 1503 nt. REP251%2C member of REP13E12 family.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 104805 105215 . - . ID=gene-Rv0095c;Dbxref=GeneID:886940;Name=Rv0095c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0095c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 104805 105215 . - 0 ID=cds-NP_214609.1;Parent=gene-Rv0095c;Dbxref=Genbank:NP_214609.1,GeneID:886940;Name=NP_214609.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0095c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214609.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 105324 106715 . + . ID=gene-Rv0096;Dbxref=GeneID:886938;Name=PPE1;gbkey=Gene;gene=PPE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0096
+NC_000962.3 RefSeq CDS 105324 106715 . + 0 ID=cds-YP_177690.1;Parent=gene-Rv0096;Dbxref=Genbank:YP_177690.1,GeneID:886938;Name=YP_177690.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE1;locus_tag=Rv0096;product=PPE family protein PPE1;protein_id=YP_177690.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 106734 107603 . + . ID=gene-Rv0097;Dbxref=GeneID:886942;Name=Rv0097;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0097
+NC_000962.3 RefSeq CDS 106734 107603 . + 0 ID=cds-NP_214611.1;Parent=gene-Rv0097;Dbxref=Genbank:NP_214611.1,GeneID:886942;Name=NP_214611.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:11271494];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00077;locus_tag=Rv0097;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214611.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 107600 108151 . + . ID=gene-Rv0098;Dbxref=GeneID:886935;Name=fcoT;gbkey=Gene;gene=fcoT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0098
+NC_000962.3 RefSeq CDS 107600 108151 . + 0 ID=cds-NP_214612.1;Parent=gene-Rv0098;Dbxref=Genbank:NP_214612.1,GeneID:886935;Name=NP_214612.1;Note=type III%2C conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:17524985];gbkey=CDS;gene=fcoT;locus_tag=Rv0098;product=fatty acyl CoA thioesterase FcoT;protein_id=NP_214612.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 108156 109778 . + . ID=gene-Rv0099;Dbxref=GeneID:886933;Name=fadD10;gbkey=Gene;gene=fadD10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0099
+NC_000962.3 RefSeq CDS 108156 109778 . + 0 ID=cds-NP_214613.1;Parent=gene-Rv0099;Dbxref=Genbank:NP_214613.1,GeneID:886933;Name=NP_214613.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fadD10;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0099;product=fatty-acid--CoA ligase FadD10;protein_id=NP_214613.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 109783 110019 . + . ID=gene-Rv0100;Dbxref=GeneID:886931;Name=Rv0100;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0100
+NC_000962.3 RefSeq CDS 109783 110019 . + 0 ID=cds-NP_214614.1;Parent=gene-Rv0100;Dbxref=Genbank:NP_214614.1,GeneID:886931;Name=NP_214614.1;Note=conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0100;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214614.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 110001 117539 . + . ID=gene-Rv0101;Dbxref=GeneID:886951;Name=nrp;gbkey=Gene;gene=nrp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0101
+NC_000962.3 RefSeq CDS 110001 117539 . + 0 ID=cds-NP_214615.1;Parent=gene-Rv0101;Dbxref=Genbank:NP_214615.1,GeneID:886951;Name=NP_214615.1;Note=Belongs to the ATP-dependent AMP-binding enzyme family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=nrp;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0101;product=peptide synthetase Nrp;protein_id=NP_214615.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 117714 119699 . + . ID=gene-Rv0102;Dbxref=GeneID:886926;Name=Rv0102;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0102
+NC_000962.3 RefSeq CDS 117714 119699 . + 0 ID=cds-NP_214616.1;Parent=gene-Rv0102;Dbxref=Genbank:NP_214616.1,GeneID:886926;Name=NP_214616.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00343;locus_tag=Rv0102;product=integral membrane protein;protein_id=NP_214616.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 119915 122173 . - . ID=gene-Rv0103c;Dbxref=GeneID:886928;Name=ctpB;gbkey=Gene;gene=ctpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0103c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 119915 122173 . - 0 ID=cds-NP_214617.1;Parent=gene-Rv0103c;Dbxref=Genbank:NP_214617.1,GeneID:886928;Name=NP_214617.1;Note=Belongs to the cation transport ATPases family (E1-E2 ATPases)%2C subfamily IB.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=ctpB;inference=protein motif:PROSITE:PS01047;locus_tag=Rv0103c;product=cation-transporter P-type ATPase B;protein_id=NP_214617.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 122317 123831 . + . ID=gene-Rv0104;Dbxref=GeneID:886923;Name=Rv0104;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0104
+NC_000962.3 RefSeq CDS 122317 123831 . + 0 ID=cds-NP_214618.1;Parent=gene-Rv0104;Dbxref=Genbank:NP_214618.1,GeneID:886923;Name=NP_214618.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0104;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214618.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 123980 124264 . - . ID=gene-Rv0105c;Dbxref=GeneID:886920;Name=rpmB1;gbkey=Gene;gene=rpmB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0105c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 123980 124264 . - 0 ID=cds-YP_177691.1;Parent=gene-Rv0105c;Dbxref=Genbank:YP_177691.1,GeneID:886920;Name=YP_177691.1;Note=Belongs to the L28P family of ribosomal proteins.;gbkey=CDS;gene=rpmB1;locus_tag=Rv0105c;product=50S ribosomal protein L28;protein_id=YP_177691.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 124374 125570 . + . ID=gene-Rv0106;Dbxref=GeneID:886919;Name=Rv0106;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0106
+NC_000962.3 RefSeq CDS 124374 125570 . + 0 ID=cds-NP_214620.1;Parent=gene-Rv0106;Dbxref=Genbank:NP_214620.1,GeneID:886919;Name=NP_214620.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0106;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214620.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 125643 130541 . - . ID=gene-Rv0107c;Dbxref=GeneID:886915;Name=ctpI;gbkey=Gene;gene=ctpI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0107c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 125643 130541 . - 0 ID=cds-NP_214621.1;Parent=gene-Rv0107c;Dbxref=Genbank:NP_214621.1,GeneID:886915;Name=NP_214621.1;Note=Belongs to the cation transport ATPases family (E1-E2 ATPases).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=ctpI;inference=protein motif:PROSITE:PS00154;locus_tag=Rv0107c;product=cation-transporter ATPase I;protein_id=NP_214621.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 130895 131104 . - . ID=gene-Rv0108c;Dbxref=GeneID:886918;Name=Rv0108c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0108c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 130895 131104 . - 0 ID=cds-NP_214622.1;Parent=gene-Rv0108c;Dbxref=Genbank:NP_214622.1,GeneID:886918;Name=NP_214622.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0108c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214622.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 131382 132872 . + . ID=gene-Rv0109;Dbxref=GeneID:886912;Name=PE_PGRS1;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0109
+NC_000962.3 RefSeq CDS 131382 132872 . + 0 ID=cds-YP_177692.1;Parent=gene-Rv0109;Dbxref=Genbank:YP_177692.1,GeneID:886912;Name=YP_177692.1;Note=Member of the M. tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS1;locus_tag=Rv0109;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS1;protein_id=YP_177692.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 133020 133769 . + . ID=gene-Rv0110;Dbxref=GeneID:886917;Name=Rv0110;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0110
+NC_000962.3 RefSeq CDS 133020 133769 . + 0 ID=cds-NP_214624.1;Parent=gene-Rv0110;Dbxref=Genbank:NP_214624.1,GeneID:886917;Name=NP_214624.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0110;product=integral membrane protein;protein_id=NP_214624.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 133950 136007 . + . ID=gene-Rv0111;Dbxref=GeneID:886909;Name=Rv0111;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0111
+NC_000962.3 RefSeq CDS 133950 136007 . + 0 ID=cds-NP_214625.1;Parent=gene-Rv0111;Dbxref=Genbank:NP_214625.1,GeneID:886909;Name=NP_214625.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0111;product=acyltransferase;protein_id=NP_214625.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 136289 137245 . + . ID=gene-Rv0112;Dbxref=GeneID:886907;Name=gca;gbkey=Gene;gene=gca;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0112
+NC_000962.3 RefSeq CDS 136289 137245 . + 0 ID=cds-NP_214626.1;Parent=gene-Rv0112;Dbxref=Genbank:NP_214626.1,GeneID:886907;Name=NP_214626.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=gca;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv0112;product=GDP-mannose 4%2C6-dehydratase;protein_id=NP_214626.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 137319 137909 . + . ID=gene-Rv0113;Dbxref=GeneID:886905;Name=gmhA;gbkey=Gene;gene=gmhA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=lpcA;locus_tag=Rv0113
+NC_000962.3 RefSeq CDS 137319 137909 . + 0 ID=cds-NP_214627.1;Parent=gene-Rv0113;Dbxref=Genbank:NP_214627.1,GeneID:886905;Name=NP_214627.1;Note=sedoheptulose-7-phosphate isomerase GmhA. Belongs to the sis family%2C LPCA subfamily. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=gmhA;locus_tag=Rv0113;product=phosphoheptose isomerase;protein_id=NP_214627.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 137941 138513 . + . ID=gene-Rv0114;Dbxref=GeneID:886903;Name=gmhB;gbkey=Gene;gene=gmhB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0114
+NC_000962.3 RefSeq CDS 137941 138513 . + 0 ID=cds-NP_214628.1;Parent=gene-Rv0114;Dbxref=Genbank:NP_214628.1,GeneID:886903;Name=NP_214628.1;Note=D-alpha%2Cbeta-D-heptose-1%2C7-biphosphate phosphatase GmhB. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=gmhB;locus_tag=Rv0114;product=D-glycero-alpha-D-manno-heptose-1%2C7-bisphosphate 7-phosphatase;protein_id=NP_214628.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 138513 139673 . + . ID=gene-Rv0115;Dbxref=GeneID:886902;Name=hddA;gbkey=Gene;gene=hddA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0115
+NC_000962.3 RefSeq CDS 138513 139673 . + 0 ID=cds-NP_214629.1;Parent=gene-Rv0115;Dbxref=Genbank:NP_214629.1,GeneID:886902;Name=NP_214629.1;gbkey=CDS;gene=hddA;inference=protein motif:PROSITE:PS00435;locus_tag=Rv0115;product=D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase HddA;protein_id=NP_214629.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 139956 140144 . + . ID=gene-Rv0115a;Dbxref=GeneID:19394668;Name=Rv0115a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0115a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 139956 140144 . + 0 ID=cds-YP_009030027.1;Parent=gene-Rv0115a;Dbxref=Genbank:YP_009030027.1,GeneID:19394668;Name=YP_009030027.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0115a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030027.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 140267 141022 . - . ID=gene-Rv0116c;Dbxref=GeneID:886900;Name=ldtA;gbkey=Gene;gene=ldtA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0116c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 140267 141022 . - 0 ID=cds-NP_214630.1;Parent=gene-Rv0116c;Dbxref=Genbank:NP_214630.1,GeneID:886900;Name=NP_214630.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=ldtA;locus_tag=Rv0116c;product=L%2CD-transpeptidase LdtA;protein_id=NP_214630.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 141200 142144 . + . ID=gene-Rv0117;Dbxref=GeneID:886914;Name=oxyS;gbkey=Gene;gene=oxyS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0117
+NC_000962.3 RefSeq CDS 141200 142144 . + 0 ID=cds-NP_214631.1;Parent=gene-Rv0117;Dbxref=Genbank:NP_214631.1,GeneID:886914;Name=NP_214631.1;Note=LysR family%2C involved in the resistance to organic hydroperoxides;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:1489419];gbkey=CDS;gene=oxyS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv0117;product=oxidative stress response regulatory protein OxyS;protein_id=NP_214631.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 142128 143876 . - . ID=gene-Rv0118c;Dbxref=GeneID:886898;Name=oxcA;gbkey=Gene;gene=oxcA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0118c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 142128 143876 . - 0 ID=cds-NP_214632.1;Parent=gene-Rv0118c;Dbxref=Genbank:NP_214632.1,GeneID:886898;Name=NP_214632.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=oxcA;locus_tag=Rv0118c;product=oxalyl-CoA decarboxylase OxcA;protein_id=NP_214632.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 144049 145626 . + . ID=gene-Rv0119;Dbxref=GeneID:886896;Name=fadD7;gbkey=Gene;gene=fadD7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0119
+NC_000962.3 RefSeq CDS 144049 145626 . + 0 ID=cds-NP_214633.1;Parent=gene-Rv0119;Dbxref=Genbank:NP_214633.1,GeneID:886896;Name=NP_214633.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadD7;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0119;product=fatty-acid--CoA ligase FadD7;protein_id=NP_214633.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 145627 147771 . - . ID=gene-Rv0120c;Dbxref=GeneID:886894;Name=fusA2;gbkey=Gene;gene=fusA2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=fus2;locus_tag=Rv0120c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 145627 147771 . - 0 ID=cds-NP_214634.1;Parent=gene-Rv0120c;Dbxref=Genbank:NP_214634.1,GeneID:886894;Name=NP_214634.1;Note=Belongs to the GTP-binding elongation factor family%2C EF-G/EF-2 subfamily.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fusA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0120c;product=elongation factor G;protein_id=NP_214634.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 147908 148342 . - . ID=gene-Rv0121c;Dbxref=GeneID:886892;Name=Rv0121c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0121c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 147908 148342 . - 0 ID=cds-NP_214635.1;Parent=gene-Rv0121c;Dbxref=Genbank:NP_214635.1,GeneID:886892;Name=NP_214635.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0121c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214635.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 148491 148859 . + . ID=gene-Rv0122;Dbxref=GeneID:886888;Name=Rv0122;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0122
+NC_000962.3 RefSeq CDS 148491 148859 . + 0 ID=cds-NP_214636.1;Parent=gene-Rv0122;Dbxref=Genbank:NP_214636.1,GeneID:886888;Name=NP_214636.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0122;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214636.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 148856 149224 . + . ID=gene-Rv0123;Dbxref=GeneID:886887;Name=Rv0123;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0123
+NC_000962.3 RefSeq CDS 148856 149224 . + 0 ID=cds-NP_214637.1;Parent=gene-Rv0123;Dbxref=Genbank:NP_214637.1,GeneID:886887;Name=NP_214637.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0123;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214637.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 149533 150996 . + . ID=gene-Rv0124;Dbxref=GeneID:886883;Name=PE_PGRS2;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0124
+NC_000962.3 RefSeq CDS 149533 150996 . + 0 ID=cds-YP_177693.1;Parent=gene-Rv0124;Dbxref=Genbank:YP_177693.1,GeneID:886883;Name=YP_177693.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS2;locus_tag=Rv0124;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS2;protein_id=YP_177693.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 151148 152215 . + 0 ID=cds-NP_214639.1;Parent=gene-Rv0125;Dbxref=Genbank:NP_214639.1,GeneID:886924;Name=NP_214639.1;Note=Belongs to the serine protease family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pepA;inference=protein motif:PROSITE:PS00135;locus_tag=Rv0125;product=serine protease PepA;protein_id=NP_214639.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 152324 154129 . + 0 ID=cds-NP_214640.1;Parent=gene-Rv0126;Dbxref=Genbank:NP_214640.1,GeneID:886881;Name=NP_214640.1;experiment=DESCRIPTION:Protein characterization[PMID:10658666];gbkey=CDS;gene=treS;locus_tag=Rv0126;product=trehalose synthase/amylase TreS;protein_id=NP_214640.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 154179 154231 . + . ID=id-NC_000962.3:154179..154231;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 154232 155599 . + . ID=gene-Rv0127;Dbxref=GeneID:886880;Name=mak;gbkey=Gene;gene=mak;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0127
+NC_000962.3 RefSeq CDS 154232 155599 . + 0 ID=cds-NP_214641.1;Parent=gene-Rv0127;Dbxref=Genbank:NP_214641.1,GeneID:886880;Name=NP_214641.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mak;locus_tag=Rv0127;product=maltokinase;protein_id=NP_214641.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 155667 156446 . + . ID=gene-Rv0128;Dbxref=GeneID:886878;Name=Rv0128;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0128
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+NC_000962.3 RefSeq gene 156578 157600 . - . ID=gene-Rv0129c;Dbxref=GeneID:886885;Name=fbpC;gbkey=Gene;gene=fbpC;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=85C,fbpC2,mpt45;locus_tag=Rv0129c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 157847 158302 . + . ID=gene-Rv0130;Dbxref=GeneID:886876;Name=htdZ;gbkey=Gene;gene=htdZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0130
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+NC_000962.3 RefSeq gene 158315 159658 . - . ID=gene-Rv0131c;Dbxref=GeneID:886874;Name=fadE1;gbkey=Gene;gene=fadE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0131c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 158315 159658 . - 0 ID=cds-NP_214645.1;Parent=gene-Rv0131c;Dbxref=Genbank:NP_214645.1,GeneID:886874;Name=NP_214645.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadE1;locus_tag=Rv0131c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE1;protein_id=NP_214645.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 159700 160782 . - . ID=gene-Rv0132c;Dbxref=GeneID:886877;Name=fgd2;gbkey=Gene;gene=fgd2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0132c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 159700 160782 . - 0 ID=cds-NP_214646.1;Parent=gene-Rv0132c;Dbxref=Genbank:NP_214646.1,GeneID:886877;Name=NP_214646.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fgd2;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0132c;product=F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase;protein_id=NP_214646.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 160869 161474 . + . ID=gene-Rv0133;Dbxref=GeneID:886873;Name=Rv0133;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0133
+NC_000962.3 RefSeq CDS 160869 161474 . + 0 ID=cds-NP_214647.1;Parent=gene-Rv0133;Dbxref=Genbank:NP_214647.1,GeneID:886873;Name=NP_214647.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0133;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_214647.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 161771 162673 . + . ID=gene-Rv0134;Dbxref=GeneID:886871;Name=ephF;gbkey=Gene;gene=ephF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0134
+NC_000962.3 RefSeq CDS 161771 162673 . + 0 ID=cds-NP_214648.1;Parent=gene-Rv0134;Dbxref=Genbank:NP_214648.1,GeneID:886871;Name=NP_214648.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ephF;locus_tag=Rv0134;product=epoxide hydrolase EphF;protein_id=NP_214648.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 162644 163249 . - . ID=gene-Rv0135c;Dbxref=GeneID:886869;Name=Rv0135c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0135c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 162644 163249 . - 0 ID=cds-NP_214649.1;Parent=gene-Rv0135c;Dbxref=Genbank:NP_214649.1,GeneID:886869;Name=NP_214649.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0135c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214649.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 163366 164691 . + . ID=gene-Rv0136;Dbxref=GeneID:886868;Name=cyp138;gbkey=Gene;gene=cyp138;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0136
+NC_000962.3 RefSeq CDS 163366 164691 . + 0 ID=cds-NP_214650.1;Parent=gene-Rv0136;Dbxref=Genbank:NP_214650.1,GeneID:886868;Name=NP_214650.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cyp138;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv0136;product=cytochrome P450 Cyp138;protein_id=NP_214650.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 164712 165260 . - . ID=gene-Rv0137c;Dbxref=GeneID:886865;Name=msrA;gbkey=Gene;gene=msrA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0137c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 164712 165260 . - 0 ID=cds-NP_214651.1;Parent=gene-Rv0137c;Dbxref=Genbank:NP_214651.1,GeneID:886865;Name=NP_214651.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=msrA;locus_tag=Rv0137c;product=peptide methionine sulfoxide reductase MsrA;protein_id=NP_214651.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 165323 165826 . + . ID=gene-Rv0138;Dbxref=GeneID:886863;Name=Rv0138;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0138
+NC_000962.3 RefSeq CDS 165323 165826 . + 0 ID=cds-NP_214652.1;Parent=gene-Rv0138;Dbxref=Genbank:NP_214652.1,GeneID:886863;Name=NP_214652.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0138;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214652.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 165827 166849 . + . ID=gene-Rv0139;Dbxref=GeneID:886860;Name=Rv0139;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0139
+NC_000962.3 RefSeq CDS 165827 166849 . + 0 ID=cds-NP_214653.1;Parent=gene-Rv0139;Dbxref=Genbank:NP_214653.1,GeneID:886860;Name=NP_214653.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0139;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214653.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 166910 167290 . + . ID=gene-Rv0140;Dbxref=GeneID:886859;Name=Rv0140;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0140
+NC_000962.3 RefSeq CDS 166910 167290 . + 0 ID=cds-NP_214654.1;Parent=gene-Rv0140;Dbxref=Genbank:NP_214654.1,GeneID:886859;Name=NP_214654.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0140;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214654.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 167271 167681 . - . ID=gene-Rv0141c;Dbxref=GeneID:886872;Name=Rv0141c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0141c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 167271 167681 . - 0 ID=cds-NP_214655.1;Parent=gene-Rv0141c;Dbxref=Genbank:NP_214655.1,GeneID:886872;Name=NP_214655.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0141c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214655.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 167711 168637 . + . ID=gene-Rv0142;Dbxref=GeneID:886858;Name=Rv0142;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0142
+NC_000962.3 RefSeq CDS 167711 168637 . + 0 ID=cds-NP_214656.1;Parent=gene-Rv0142;Dbxref=Genbank:NP_214656.1,GeneID:886858;Name=NP_214656.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0142;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214656.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 168704 170182 . - . ID=gene-Rv0143c;Dbxref=GeneID:886856;Name=Rv0143c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0143c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 168704 170182 . - 0 ID=cds-NP_214657.1;Parent=gene-Rv0143c;Dbxref=Genbank:NP_214657.1,GeneID:886856;Name=NP_214657.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0143c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214657.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 170284 171126 . + . ID=gene-Rv0144;Dbxref=GeneID:886854;Name=Rv0144;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0144
+NC_000962.3 RefSeq CDS 170284 171126 . + 0 ID=cds-NP_214658.1;Parent=gene-Rv0144;Dbxref=Genbank:NP_214658.1,GeneID:886854;Name=NP_214658.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0144;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214658.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 171215 172168 . + . ID=gene-Rv0145;Dbxref=GeneID:886851;Name=Rv0145;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0145
+NC_000962.3 RefSeq CDS 171215 172168 . + 0 ID=cds-NP_214659.1;Parent=gene-Rv0145;Dbxref=Genbank:NP_214659.1,GeneID:886851;Name=NP_214659.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0145;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_214659.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 172211 173143 . + . ID=gene-Rv0146;Dbxref=GeneID:886849;Name=Rv0146;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0146
+NC_000962.3 RefSeq CDS 172211 173143 . + 0 ID=cds-NP_214660.1;Parent=gene-Rv0146;Dbxref=Genbank:NP_214660.1,GeneID:886849;Name=NP_214660.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0146;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_214660.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 173238 174758 . + . ID=gene-Rv0147;Dbxref=GeneID:886847;Name=Rv0147;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0147
+NC_000962.3 RefSeq CDS 173238 174758 . + 0 ID=cds-NP_214661.1;Parent=gene-Rv0147;Dbxref=Genbank:NP_214661.1,GeneID:886847;Name=NP_214661.1;Note=Belongs to the aldehyde dehydrogenases family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00687;locus_tag=Rv0147;product=aldehyde dehydrogenase;protein_id=NP_214661.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 174833 175693 . + . ID=gene-Rv0148;Dbxref=GeneID:886845;Name=Rv0148;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0148
+NC_000962.3 RefSeq CDS 174833 175693 . + 0 ID=cds-NP_214662.1;Parent=gene-Rv0148;Dbxref=Genbank:NP_214662.1,GeneID:886845;Name=NP_214662.1;Note=belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv0148;product=short-chain type dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_214662.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 175700 176668 . + . ID=gene-Rv0149;Dbxref=GeneID:886843;Name=Rv0149;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0149
+NC_000962.3 RefSeq CDS 175700 176668 . + 0 ID=cds-NP_214663.1;Parent=gene-Rv0149;Dbxref=Genbank:NP_214663.1,GeneID:886843;Name=NP_214663.1;Note=belongs to the zinc-containing alcohol dehydrogenase family%2C quinone oxidoreductase subfamily;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01162;locus_tag=Rv0149;product=quinone oxidoreductase;protein_id=NP_214663.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 176665 176952 . - . ID=gene-Rv0150c;Dbxref=GeneID:886840;Name=Rv0150c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0150c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 176665 176952 . - 0 ID=cds-NP_214664.1;Parent=gene-Rv0150c;Dbxref=Genbank:NP_214664.1,GeneID:886840;Name=NP_214664.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0150c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214664.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 177543 179309 . - . ID=gene-Rv0151c;Dbxref=GeneID:886857;Name=PE1;gbkey=Gene;gene=PE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0151c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 177543 179309 . - 0 ID=cds-YP_177695.1;Parent=gene-Rv0151c;Dbxref=Genbank:YP_177695.1,GeneID:886857;Name=YP_177695.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE1;locus_tag=Rv0151c;product=PE family protein PE1;protein_id=YP_177695.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 179319 180896 . - . ID=gene-Rv0152c;Dbxref=GeneID:886838;Name=PE2;gbkey=Gene;gene=PE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0152c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 179319 180896 . - 0 ID=cds-YP_177696.1;Parent=gene-Rv0152c;Dbxref=Genbank:YP_177696.1,GeneID:886838;Name=YP_177696.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=PE2;locus_tag=Rv0152c;product=PE family protein PE2;protein_id=YP_177696.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 181987 183198 . - . ID=gene-Rv0154c;Dbxref=GeneID:886836;Name=fadE2;gbkey=Gene;gene=fadE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0154c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 181987 183198 . - 0 ID=cds-NP_214668.1;Parent=gene-Rv0154c;Dbxref=Genbank:NP_214668.1,GeneID:886836;Name=NP_214668.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadE2;locus_tag=Rv0154c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE2;protein_id=NP_214668.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 183622 184722 . + . ID=gene-Rv0155;Dbxref=GeneID:886832;Name=pntAa;gbkey=Gene;gene=pntAa;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0155
+NC_000962.3 RefSeq CDS 183622 184722 . + 0 ID=cds-NP_214669.1;Parent=gene-Rv0155;Dbxref=Genbank:NP_214669.1,GeneID:886832;Name=NP_214669.1;Note=Probable pntAa%2Cfirst part of NAD(P) transhydrogenase subunit alpha;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pntAa;locus_tag=Rv0155;product=NAD(P) transhydrogenase subunit alpha PntAa;protein_id=NP_214669.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 184723 185055 . + . ID=gene-Rv0156;Dbxref=GeneID:886890;Name=pntAb;gbkey=Gene;gene=pntAb;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0156
+NC_000962.3 RefSeq CDS 184723 185055 . + 0 ID=cds-NP_214670.1;Parent=gene-Rv0156;Dbxref=Genbank:NP_214670.1,GeneID:886890;Name=NP_214670.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=pntAb;locus_tag=Rv0156;product=NAD(P) transhydrogenase subunit alpha PntAb;protein_id=NP_214670.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 185052 186479 . + . ID=gene-Rv0157;Dbxref=GeneID:886830;Name=pntB;gbkey=Gene;gene=pntB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0157
+NC_000962.3 RefSeq CDS 185052 186479 . + 0 ID=cds-NP_214671.1;Parent=gene-Rv0157;Dbxref=Genbank:NP_214671.1,GeneID:886830;Name=NP_214671.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=pntB;locus_tag=Rv0157;product=NAD(P) transhydrogenase subunit beta PntB;protein_id=NP_214671.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 186495 186623 . - . ID=gene-Rv0157A;Dbxref=GeneID:3205086;Name=Rv0157A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0157A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 186495 186623 . - 0 ID=cds-YP_007408797.1;Parent=gene-Rv0157A;Dbxref=Genbank:YP_007408797.1,GeneID:3205086;Name=YP_007408797.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0157A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007408797.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 186785 187429 . + . ID=gene-Rv0158;Dbxref=GeneID:886828;Name=Rv0158;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0158
+NC_000962.3 RefSeq CDS 186785 187429 . + 0 ID=cds-NP_214672.1;Parent=gene-Rv0158;Dbxref=Genbank:NP_214672.1,GeneID:886828;Name=NP_214672.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0158;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214672.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 187433 188839 . - . ID=gene-Rv0159c;Dbxref=GeneID:886826;Name=PE3;gbkey=Gene;gene=PE3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0159c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 187433 188839 . - 0 ID=cds-YP_177697.1;Parent=gene-Rv0159c;Dbxref=Genbank:YP_177697.1,GeneID:886826;Name=YP_177697.1;gbkey=CDS;gene=PE3;locus_tag=Rv0159c;product=PE family protein PE3;protein_id=YP_177697.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 188931 190439 . - . ID=gene-Rv0160c;Dbxref=GeneID:886825;Name=PE4;gbkey=Gene;gene=PE4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0160c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 188931 190439 . - 0 ID=cds-YP_177698.1;Parent=gene-Rv0160c;Dbxref=Genbank:YP_177698.1,GeneID:886825;Name=YP_177698.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE4;locus_tag=Rv0160c;product=PE family protein PE4;protein_id=YP_177698.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 190607 191956 . + . ID=gene-Rv0161;Dbxref=GeneID:886835;Name=Rv0161;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0161
+NC_000962.3 RefSeq CDS 190607 191956 . + 0 ID=cds-NP_214675.1;Parent=gene-Rv0161;Dbxref=Genbank:NP_214675.1,GeneID:886835;Name=NP_214675.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0161;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214675.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 191984 193135 . - . ID=gene-Rv0162c;Dbxref=GeneID:886824;Name=adhE1;gbkey=Gene;gene=adhE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0162c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 191984 193135 . - 0 ID=cds-YP_177699.1;Parent=gene-Rv0162c;Dbxref=Genbank:YP_177699.1,GeneID:886824;Name=YP_177699.1;Note=Belongs to the zinc-containing alcohol dehydrogenase family%2Cclass-I subfamily. Cofactor: zinc.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=adhE1;inference=protein motif:PROSITE:PS00059;locus_tag=Rv0162c;product=zinc-type alcohol dehydrogenase subunit E;protein_id=YP_177699.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 193117 193572 . + . ID=gene-Rv0163;Dbxref=GeneID:886821;Name=Rv0163;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0163
+NC_000962.3 RefSeq CDS 193117 193572 . + 0 ID=cds-NP_214677.1;Parent=gene-Rv0163;Dbxref=Genbank:NP_214677.1,GeneID:886821;Name=NP_214677.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0163;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214677.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 193626 194111 . + . ID=gene-Rv0164;Dbxref=GeneID:886267;Name=TB18.5;gbkey=Gene;gene=TB18.5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0164
+NC_000962.3 RefSeq CDS 193626 194111 . + 0 ID=cds-YP_177617.1;Parent=gene-Rv0164;Dbxref=Genbank:YP_177617.1,GeneID:886267;Name=YP_177617.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=TB18.5;locus_tag=Rv0164;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177617.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 194144 194815 . - . ID=gene-Rv0165c;Dbxref=GeneID:886818;Name=mce1R;gbkey=Gene;gene=mce1R;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0165c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 194144 194815 . - 0 ID=cds-YP_177700.2;Parent=gene-Rv0165c;Dbxref=Genbank:YP_177700.2,GeneID:886818;Name=YP_177700.2;Note=belongs to the GntR family of transcriptional regulators.;gbkey=CDS;gene=mce1R;locus_tag=Rv0165c;product=transcriptional regulator Mce1R;protein_id=YP_177700.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 194993 196657 . + . ID=gene-Rv0166;Dbxref=GeneID:886822;Name=fadD5;gbkey=Gene;gene=fadD5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0166
+NC_000962.3 RefSeq CDS 194993 196657 . + 0 ID=cds-NP_214680.1;Parent=gene-Rv0166;Dbxref=Genbank:NP_214680.1,GeneID:886822;Name=NP_214680.1;gbkey=CDS;gene=fadD5;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0166;product=fatty-acid--CoA ligase FadD5;protein_id=NP_214680.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 196861 197658 . + . ID=gene-Rv0167;Dbxref=GeneID:886816;Name=yrbE1A;gbkey=Gene;gene=yrbE1A;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0167
+NC_000962.3 RefSeq CDS 196861 197658 . + 0 ID=cds-NP_214681.1;Parent=gene-Rv0167;Dbxref=Genbank:NP_214681.1,GeneID:886816;Name=NP_214681.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=yrbE1A;locus_tag=Rv0167;product=membrane protein;protein_id=NP_214681.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 197660 198529 . + . ID=gene-Rv0168;Dbxref=GeneID:886812;Name=yrbE1B;gbkey=Gene;gene=yrbE1B;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0168
+NC_000962.3 RefSeq CDS 197660 198529 . + 0 ID=cds-NP_214682.1;Parent=gene-Rv0168;Dbxref=Genbank:NP_214682.1,GeneID:886812;Name=NP_214682.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=yrbE1B;locus_tag=Rv0168;product=membrane protein;protein_id=NP_214682.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 198534 199898 . + . ID=gene-Rv0169;Dbxref=GeneID:886823;Name=mce1A;gbkey=Gene;gene=mce1A;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mce1;locus_tag=Rv0169
+NC_000962.3 RefSeq CDS 198534 199898 . + 0 ID=cds-YP_177701.1;Parent=gene-Rv0169;Dbxref=Genbank:YP_177701.1,GeneID:886823;Name=YP_177701.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mce1A;locus_tag=Rv0169;product=Mce family protein Mce1A;protein_id=YP_177701.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 199895 200935 . + . ID=gene-Rv0170;Dbxref=GeneID:886810;Name=mce1B;gbkey=Gene;gene=mce1B;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mceD;locus_tag=Rv0170
+NC_000962.3 RefSeq CDS 199895 200935 . + 0 ID=cds-NP_214684.1;Parent=gene-Rv0170;Dbxref=Genbank:NP_214684.1,GeneID:886810;Name=NP_214684.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mce1B;locus_tag=Rv0170;product=Mce family protein Mce1B;protein_id=NP_214684.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 200932 202479 . + . ID=gene-Rv0171;Dbxref=GeneID:886808;Name=mce1C;gbkey=Gene;gene=mce1C;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0171
+NC_000962.3 RefSeq CDS 200932 202479 . + 0 ID=cds-NP_214685.1;Parent=gene-Rv0171;Dbxref=Genbank:NP_214685.1,GeneID:886808;Name=NP_214685.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mce1C;locus_tag=Rv0171;product=Mce family protein Mce1C;protein_id=NP_214685.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 202476 204068 . + . ID=gene-Rv0172;Dbxref=GeneID:886807;Name=mce1D;gbkey=Gene;gene=mce1D;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0172
+NC_000962.3 RefSeq CDS 202476 204068 . + 0 ID=cds-NP_214686.1;Parent=gene-Rv0172;Dbxref=Genbank:NP_214686.1,GeneID:886807;Name=NP_214686.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mce1D;locus_tag=Rv0172;product=Mce family protein Mce1D;protein_id=NP_214686.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 204065 205237 . + . ID=gene-Rv0173;Dbxref=GeneID:886804;Name=lprK;gbkey=Gene;gene=lprK;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mce1E;locus_tag=Rv0173
+NC_000962.3 RefSeq CDS 204065 205237 . + 0 ID=cds-NP_214687.1;Parent=gene-Rv0173;Dbxref=Genbank:NP_214687.1,GeneID:886804;Name=NP_214687.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprK;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0173;product=Mce family lipoprotein LprK;protein_id=NP_214687.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 205231 206778 . + . ID=gene-Rv0174;Dbxref=GeneID:886820;Name=mce1F;gbkey=Gene;gene=mce1F;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0174
+NC_000962.3 RefSeq CDS 205231 206778 . + 0 ID=cds-NP_214688.1;Parent=gene-Rv0174;Dbxref=Genbank:NP_214688.1,GeneID:886820;Name=NP_214688.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mce1F;locus_tag=Rv0174;product=Mce family protein Mce1F;protein_id=NP_214688.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 206812 206850 . + . ID=id-NC_000962.3:206812..206850;Note=39 bp direct repeat 1%2CAGGTGAAGGCGGCGGATTCGGCGGAATCTGACGCCGGAG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 206814 207455 . + . ID=gene-Rv0175;Dbxref=GeneID:886801;Name=Rv0175;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0175
+NC_000962.3 RefSeq CDS 206814 207455 . + 0 ID=cds-NP_214689.3;Parent=gene-Rv0175;Dbxref=Genbank:NP_214689.3,GeneID:886801;Name=NP_214689.3;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0175;product=Mce associated membrane protein;protein_id=NP_214689.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 206869 206907 . + . ID=id-Rv0175;Dbxref=GeneID:886801;Note=39 bp direct repeat 2%2CAGGTGAAGGCGGCGGATTCGGCGGAATCTGACGCCGGAG;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv0175
+NC_000962.3 RefSeq gene 207452 208420 . + . ID=gene-Rv0176;Dbxref=GeneID:886799;Name=Rv0176;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0176
+NC_000962.3 RefSeq CDS 207452 208420 . + 0 ID=cds-NP_214690.1;Parent=gene-Rv0176;Dbxref=Genbank:NP_214690.1,GeneID:886799;Name=NP_214690.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0176;product=Mce associated transmembrane protein;protein_id=NP_214690.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 208417 208971 . + . ID=gene-Rv0177;Dbxref=GeneID:886795;Name=Rv0177;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0177
+NC_000962.3 RefSeq CDS 208417 208971 . + 0 ID=cds-NP_214691.1;Parent=gene-Rv0177;Dbxref=Genbank:NP_214691.1,GeneID:886795;Name=NP_214691.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0177;product=Mce associated protein;protein_id=NP_214691.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 208938 209672 . + . ID=gene-Rv0178;Dbxref=GeneID:886814;Name=Rv0178;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0178
+NC_000962.3 RefSeq CDS 208938 209672 . + 0 ID=cds-NP_214692.1;Parent=gene-Rv0178;Dbxref=Genbank:NP_214692.1,GeneID:886814;Name=NP_214692.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0178;product=Mce associated membrane protein;protein_id=NP_214692.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 209703 210812 . - . ID=gene-Rv0179c;Dbxref=GeneID:886796;Name=lprO;gbkey=Gene;gene=lprO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0179c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 209703 210812 . - 0 ID=cds-NP_214693.1;Parent=gene-Rv0179c;Dbxref=Genbank:NP_214693.1,GeneID:886796;Name=NP_214693.1;gbkey=CDS;gene=lprO;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0179c;product=lipoprotein LprO;protein_id=NP_214693.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 215715 216224 . + . ID=gene-Rv0185;Dbxref=GeneID:886782;Name=Rv0185;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0185
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+NC_000962.3 RefSeq gene 216269 218344 . + . ID=gene-Rv0186;Dbxref=GeneID:886780;Name=bglS;gbkey=Gene;gene=bglS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0186
+NC_000962.3 RefSeq CDS 216269 218344 . + 0 ID=cds-NP_214700.1;Parent=gene-Rv0186;Dbxref=Genbank:NP_214700.1,GeneID:886780;Name=NP_214700.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=bglS;locus_tag=Rv0186;product=beta-glucosidase BglS;protein_id=NP_214700.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 218390 218551 . - . ID=gene-Rv0186A;Dbxref=GeneID:14515880;Name=mymT;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:18724363];gbkey=Gene;gene=mymT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0186A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 218390 218551 . - 0 ID=cds-YP_004837046.2;Parent=gene-Rv0186A;Dbxref=Genbank:YP_004837046.2,GeneID:14515880;Name=YP_004837046.2;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:18724363];gbkey=CDS;gene=mymT;locus_tag=Rv0186A;product=metallothionein;protein_id=YP_004837046.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 218705 219367 . + . ID=gene-Rv0187;Dbxref=GeneID:886779;Name=Rv0187;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0187
+NC_000962.3 RefSeq CDS 218705 219367 . + 0 ID=cds-NP_214701.1;Parent=gene-Rv0187;Dbxref=Genbank:NP_214701.1,GeneID:886779;Name=NP_214701.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0187;product=O-methyltransferase;protein_id=NP_214701.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 219486 219917 . + . ID=gene-Rv0188;Dbxref=GeneID:886776;Name=Rv0188;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0188
+NC_000962.3 RefSeq CDS 219486 219917 . + 0 ID=cds-NP_214702.1;Parent=gene-Rv0188;Dbxref=Genbank:NP_214702.1,GeneID:886776;Name=NP_214702.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0188;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214702.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 219996 221723 . - . ID=gene-Rv0189c;Dbxref=GeneID:886774;Name=ilvD;gbkey=Gene;gene=ilvD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0189c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 219996 221723 . - 0 ID=cds-NP_214703.1;Parent=gene-Rv0189c;Dbxref=Genbank:NP_214703.1,GeneID:886774;Name=NP_214703.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ilvD;inference=protein motif:PROSITE:PS00886;locus_tag=Rv0189c;product=dihydroxy-acid dehydratase;protein_id=NP_214703.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 221871 222161 . + . ID=gene-Rv0190;Dbxref=GeneID:886772;Name=Rv0190;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0190
+NC_000962.3 RefSeq CDS 221871 222161 . + 0 ID=cds-NP_214704.1;Parent=gene-Rv0190;Dbxref=Genbank:NP_214704.1,GeneID:886772;Name=NP_214704.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0190;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214704.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 222289 223530 . + . ID=gene-Rv0191;Dbxref=GeneID:886770;Name=Rv0191;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0191
+NC_000962.3 RefSeq CDS 222289 223530 . + 0 ID=cds-NP_214705.1;Parent=gene-Rv0191;Dbxref=Genbank:NP_214705.1,GeneID:886770;Name=NP_214705.1;Note=integral membrane protein;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0191;product=MFS-type transporter;protein_id=NP_214705.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 223564 224664 . + . ID=gene-Rv0192;Dbxref=GeneID:886768;Name=Rv0192;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0192
+NC_000962.3 RefSeq CDS 223564 224664 . + 0 ID=cds-NP_214706.1;Parent=gene-Rv0192;Dbxref=Genbank:NP_214706.1,GeneID:886768;Name=NP_214706.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0192;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214706.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 224724 226571 . - . ID=gene-Rv0193c;Dbxref=GeneID:886764;Name=Rv0193c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0193c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 224724 226571 . - 0 ID=cds-NP_214707.1;Parent=gene-Rv0193c;Dbxref=Genbank:NP_214707.1,GeneID:886764;Name=NP_214707.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0193c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214707.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 226878 230462 . + . ID=gene-Rv0194;Dbxref=GeneID:886790;Name=Rv0194;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0194
+NC_000962.3 RefSeq CDS 226878 230462 . + 0 ID=cds-NP_214708.1;Parent=gene-Rv0194;Dbxref=Genbank:NP_214708.1,GeneID:886790;Name=NP_214708.1;Note=Belongs to the ATP-binding transport protein family (ABC transporters).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv0194;product=multidrug ABC transporter ATPase/permease;protein_id=NP_214708.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 230899 231534 . + . ID=gene-Rv0195;Dbxref=GeneID:886762;Name=Rv0195;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0195
+NC_000962.3 RefSeq CDS 230899 231534 . + 0 ID=cds-NP_214709.1;Parent=gene-Rv0195;Dbxref=Genbank:NP_214709.1,GeneID:886762;Name=NP_214709.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0195;product=two component transcriptional regulator;protein_id=NP_214709.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 231647 232231 . + . ID=gene-Rv0196;Dbxref=GeneID:886760;Name=Rv0196;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0196
+NC_000962.3 RefSeq CDS 231647 232231 . + 0 ID=cds-NP_214710.1;Parent=gene-Rv0196;Dbxref=Genbank:NP_214710.1,GeneID:886760;Name=NP_214710.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0196;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214710.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 232231 234519 . + . ID=gene-Rv0197;Dbxref=GeneID:886758;Name=Rv0197;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0197
+NC_000962.3 RefSeq CDS 232231 234519 . + 0 ID=cds-NP_214711.1;Parent=gene-Rv0197;Dbxref=Genbank:NP_214711.1,GeneID:886758;Name=NP_214711.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0197;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214711.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 234516 236507 . - . ID=gene-Rv0198c;Dbxref=GeneID:886755;Name=zmp1;gbkey=Gene;gene=zmp1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0198c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 234516 236507 . - 0 ID=cds-NP_214712.1;Parent=gene-Rv0198c;Dbxref=Genbank:NP_214712.1,GeneID:886755;Name=NP_214712.1;Note=belongs to peptidase family M13 (zinc metalloprotease)%3B also known as the neprilysin subfamily.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=zmp1;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv0198c;product=zinc metalloprotease;protein_id=NP_214712.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 236550 237209 . + . ID=gene-Rv0199;Dbxref=GeneID:886753;Name=Rv0199;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0199
+NC_000962.3 RefSeq CDS 236550 237209 . + 0 ID=cds-NP_214713.1;Parent=gene-Rv0199;Dbxref=Genbank:NP_214713.1,GeneID:886753;Name=NP_214713.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0199;product=membrane protein;protein_id=NP_214713.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 237206 237895 . + . ID=gene-Rv0200;Dbxref=GeneID:886803;Name=Rv0200;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0200
+NC_000962.3 RefSeq CDS 237206 237895 . + 0 ID=cds-NP_214714.1;Parent=gene-Rv0200;Dbxref=Genbank:NP_214714.1,GeneID:886803;Name=NP_214714.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0200;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214714.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 237892 238395 . - . ID=gene-Rv0201c;Dbxref=GeneID:886756;Name=Rv0201c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0201c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 237892 238395 . - 0 ID=cds-NP_214715.1;Parent=gene-Rv0201c;Dbxref=Genbank:NP_214715.1,GeneID:886756;Name=NP_214715.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0201c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214715.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 238392 241292 . - . ID=gene-Rv0202c;Dbxref=GeneID:886750;Name=mmpL11;gbkey=Gene;gene=mmpL11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0202c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 238392 241292 . - 0 ID=cds-NP_214716.1;Parent=gene-Rv0202c;Dbxref=Genbank:NP_214716.1,GeneID:886750;Name=NP_214716.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=mmpL11;locus_tag=Rv0202c;product=transmembrane transport protein MmpL11;protein_id=NP_214716.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 241514 241924 . + . ID=gene-Rv0203;Dbxref=GeneID:886748;Name=Rv0203;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0203
+NC_000962.3 RefSeq CDS 241514 241924 . + 0 ID=cds-NP_214717.1;Parent=gene-Rv0203;Dbxref=Genbank:NP_214717.1,GeneID:886748;Name=NP_214717.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0203;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214717.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 241976 243214 . - . ID=gene-Rv0204c;Dbxref=GeneID:886747;Name=Rv0204c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0204c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 241976 243214 . - 0 ID=cds-NP_214718.2;Parent=gene-Rv0204c;Dbxref=Genbank:NP_214718.2,GeneID:886747;Name=NP_214718.2;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0204c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214718.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 243384 244487 . + . ID=gene-Rv0205;Dbxref=GeneID:886766;Name=Rv0205;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0205
+NC_000962.3 RefSeq CDS 243384 244487 . + 0 ID=cds-NP_214719.1;Parent=gene-Rv0205;Dbxref=Genbank:NP_214719.1,GeneID:886766;Name=NP_214719.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0205;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214719.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 244484 247318 . - . ID=gene-Rv0206c;Dbxref=GeneID:886752;Name=mmpL3;gbkey=Gene;gene=mmpL3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0206c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 244484 247318 . - 0 ID=cds-NP_214720.1;Parent=gene-Rv0206c;Dbxref=Genbank:NP_214720.1,GeneID:886752;Name=NP_214720.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpL3;locus_tag=Rv0206c;product=transmembrane transport protein MmpL3;protein_id=NP_214720.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 247384 248112 . - . ID=gene-Rv0207c;Dbxref=GeneID:886742;Name=Rv0207c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0207c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 247384 248112 . - 0 ID=cds-NP_214721.1;Parent=gene-Rv0207c;Dbxref=Genbank:NP_214721.1,GeneID:886742;Name=NP_214721.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0207c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214721.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 248115 248906 . - . ID=gene-Rv0208c;Dbxref=GeneID:886740;Name=Rv0208c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0208c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 256064 257677 . + . ID=gene-Rv0214;Dbxref=GeneID:886737;Name=fadD4;gbkey=Gene;gene=fadD4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0214
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+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 257719 258856 . - . ID=gene-Rv0215c;Dbxref=GeneID:886730;Name=Rv0215c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv0215c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 258913 259926 . + . ID=gene-Rv0216;Dbxref=GeneID:886729;Name=Rv0216;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0216
+NC_000962.3 RefSeq CDS 258913 259926 . + 0 ID=cds-NP_214730.1;Parent=gene-Rv0216;Dbxref=Genbank:NP_214730.1,GeneID:886729;Name=NP_214730.1;Note=Double hotdog R-specific hydratase of unknown function;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0216;product=hydratase;protein_id=NP_214730.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 259923 260831 . - . ID=gene-Rv0217c;Dbxref=GeneID:886726;Name=lipW;gbkey=Gene;gene=lipW;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0217c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 259923 260831 . - 0 ID=cds-NP_214731.1;Parent=gene-Rv0217c;Dbxref=Genbank:NP_214731.1,GeneID:886726;Name=NP_214731.1;gbkey=CDS;gene=lipW;locus_tag=Rv0217c;product=esterase LipW;protein_id=NP_214731.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 260924 262252 . + . ID=gene-Rv0218;Dbxref=GeneID:886727;Name=Rv0218;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0218
+NC_000962.3 RefSeq CDS 260924 262252 . + 0 ID=cds-NP_214732.1;Parent=gene-Rv0218;Dbxref=Genbank:NP_214732.1,GeneID:886727;Name=NP_214732.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0218;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214732.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 262254 262802 . + . ID=gene-Rv0219;Dbxref=GeneID:886725;Name=Rv0219;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0219
+NC_000962.3 RefSeq CDS 262254 262802 . + 0 ID=cds-NP_214733.1;Parent=gene-Rv0219;Dbxref=Genbank:NP_214733.1,GeneID:886725;Name=NP_214733.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0219;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214733.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 262812 264023 . + . ID=gene-Rv0220;Dbxref=GeneID:886722;Name=lipC;gbkey=Gene;gene=lipC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0220
+NC_000962.3 RefSeq CDS 262812 264023 . + 0 ID=cds-NP_214734.1;Parent=gene-Rv0220;Dbxref=Genbank:NP_214734.1,GeneID:886722;Name=NP_214734.1;gbkey=CDS;gene=lipC;inference=protein motif:PROSITE:PS00122;locus_tag=Rv0220;product=esterase LipC;protein_id=NP_214734.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 264067 265476 . + . ID=gene-Rv0221;Dbxref=GeneID:886719;Name=Rv0221;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0221
+NC_000962.3 RefSeq CDS 264067 265476 . + 0 ID=cds-NP_214735.1;Parent=gene-Rv0221;Dbxref=Genbank:NP_214735.1,GeneID:886719;Name=NP_214735.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15262939];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0221;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_214735.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 265507 266295 . + . ID=gene-Rv0222;Dbxref=GeneID:886723;Name=echA1;gbkey=Gene;gene=echA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0222
+NC_000962.3 RefSeq CDS 265507 266295 . + 0 ID=cds-NP_214736.1;Parent=gene-Rv0222;Dbxref=Genbank:NP_214736.1,GeneID:886723;Name=NP_214736.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA1;locus_tag=Rv0222;product=enoyl-CoA hydratase EchA1;protein_id=NP_214736.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 266301 267764 . - . ID=gene-Rv0223c;Dbxref=GeneID:886718;Name=Rv0223c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0223c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 266301 267764 . - 0 ID=cds-NP_214737.1;Parent=gene-Rv0223c;Dbxref=Genbank:NP_214737.1,GeneID:886718;Name=NP_214737.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00687;locus_tag=Rv0223c;product=aldehyde dehydrogenase;protein_id=NP_214737.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 267863 268627 . - . ID=gene-Rv0224c;Dbxref=GeneID:886715;Name=Rv0224c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0224c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 267863 268627 . - 0 ID=cds-NP_214738.1;Parent=gene-Rv0224c;Dbxref=Genbank:NP_214738.1,GeneID:886715;Name=NP_214738.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0224c;product=methyltransferase;protein_id=NP_214738.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 268663 269817 . + . ID=gene-Rv0225;Dbxref=GeneID:886713;Name=Rv0225;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0225
+NC_000962.3 RefSeq CDS 268663 269817 . + 0 ID=cds-NP_214739.1;Parent=gene-Rv0225;Dbxref=Genbank:NP_214739.1,GeneID:886713;Name=NP_214739.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0225;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214739.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 269834 271564 . - . ID=gene-Rv0226c;Dbxref=GeneID:886711;Name=Rv0226c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0226c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 269834 271564 . - 0 ID=cds-NP_214740.1;Parent=gene-Rv0226c;Dbxref=Genbank:NP_214740.1,GeneID:886711;Name=NP_214740.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0226c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214740.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 271574 272839 . - . ID=gene-Rv0227c;Dbxref=GeneID:886710;Name=Rv0227c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0227c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 271574 272839 . - 0 ID=cds-NP_214741.1;Parent=gene-Rv0227c;Dbxref=Genbank:NP_214741.1,GeneID:886710;Name=NP_214741.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0227c;product=membrane protein;protein_id=NP_214741.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 272855 272955 . - . ID=id-NC_000962.3:272855..272955;Note=101 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2Cclass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 273055 274278 . + . ID=gene-Rv0228;Dbxref=GeneID:886708;Name=Rv0228;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0228
+NC_000962.3 RefSeq CDS 273055 274278 . + 0 ID=cds-NP_214742.1;Parent=gene-Rv0228;Dbxref=Genbank:NP_214742.1,GeneID:886708;Name=NP_214742.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0228;product=acyltransferase;protein_id=NP_214742.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 274306 274986 . - . ID=gene-Rv0229c;Dbxref=GeneID:886724;Name=Rv0229c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0229c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 274306 274719 . - 0 ID=cds-NP_214743.2;Parent=gene-Rv0229c;Dbxref=Genbank:NP_214743.2,GeneID:886724;Name=NP_214743.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0229c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214743.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 274983 275963 . - . ID=gene-Rv0230c;Dbxref=GeneID:886705;Name=php;gbkey=Gene;gene=php;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0230c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 274983 275963 . - 0 ID=cds-NP_214744.1;Parent=gene-Rv0230c;Dbxref=Genbank:NP_214744.1,GeneID:886705;Name=NP_214744.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=php;locus_tag=Rv0230c;product=phosphotriesterase;protein_id=NP_214744.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 276058 277764 . + . ID=gene-Rv0231;Dbxref=GeneID:886703;Name=fadE4;gbkey=Gene;gene=fadE4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0231
+NC_000962.3 RefSeq CDS 276058 277764 . + 0 ID=cds-NP_214745.1;Parent=gene-Rv0231;Dbxref=Genbank:NP_214745.1,GeneID:886703;Name=NP_214745.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE4;locus_tag=Rv0231;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE4;protein_id=NP_214745.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 277899 278588 . + . ID=gene-Rv0232;Dbxref=GeneID:886701;Name=Rv0232;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0232
+NC_000962.3 RefSeq CDS 277899 278588 . + 0 ID=cds-NP_214746.1;Parent=gene-Rv0232;Dbxref=Genbank:NP_214746.1,GeneID:886701;Name=NP_214746.1;Note=Belongs to the TetR/AcrR family of transcriptional regulators.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01081;locus_tag=Rv0232;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214746.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 278585 279529 . + . ID=gene-Rv0233;Dbxref=GeneID:886699;Name=nrdB;gbkey=Gene;gene=nrdB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rnrS;locus_tag=Rv0233
+NC_000962.3 RefSeq CDS 278585 279529 . + 0 ID=cds-NP_214747.1;Parent=gene-Rv0233;Dbxref=Genbank:NP_214747.1,GeneID:886699;Name=NP_214747.1;Note=Belongs to the ribonucleoside diphosphate reductase small chain family. Cofactor: iron%2C manganese;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nrdB;locus_tag=Rv0233;product=ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta NrdB;protein_id=NP_214747.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 279605 281140 . - . ID=gene-Rv0234c;Dbxref=GeneID:886732;Name=gabD1;gbkey=Gene;gene=gabD1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gabD2;locus_tag=Rv0234c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 279605 281140 . - 0 ID=cds-NP_216247.2;Parent=gene-Rv0234c;Dbxref=Genbank:NP_216247.2,GeneID:886732;Name=NP_216247.2;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:16027371];gbkey=CDS;gene=gabD1;inference=protein motif:PROSITE:PS00070;locus_tag=Rv0234c;product=succinate-semialdehyde dehydrogenase;protein_id=NP_216247.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 281166 282614 . - . ID=gene-Rv0235c;Dbxref=GeneID:886695;Name=Rv0235c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0235c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 281166 282614 . - 0 ID=cds-NP_214749.1;Parent=gene-Rv0235c;Dbxref=Genbank:NP_214749.1,GeneID:886695;Name=NP_214749.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0235c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214749.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 282649 286851 . - . ID=gene-Rv0236c;Dbxref=GeneID:886707;Name=aftD;gbkey=Gene;gene=aftD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0236c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 282649 286851 . - 0 ID=cds-NP_214750.1;Parent=gene-Rv0236c;Dbxref=Genbank:NP_214750.1,GeneID:886707;Name=NP_214750.1;Note=arabinofuranosyltransferase AftD. A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=aftD;locus_tag=Rv0236c;product=alpha-(1->3)-arabinofuranosyltransferase;protein_id=NP_214750.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 286898 287071 . - . ID=gene-Rv0236A;Dbxref=GeneID:3205106;Name=Rv0236A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0236A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 286898 287071 . - 0 ID=cds-YP_177619.1;Parent=gene-Rv0236A;Dbxref=Genbank:YP_177619.1,GeneID:3205106;Name=YP_177619.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0236A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177619.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 287186 288352 . + . ID=gene-Rv0237;Dbxref=GeneID:886693;Name=lpqI;gbkey=Gene;gene=lpqI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0237
+NC_000962.3 RefSeq CDS 287186 288352 . + 0 ID=cds-YP_177702.1;Parent=gene-Rv0237;Dbxref=Genbank:YP_177702.1,GeneID:886693;Name=YP_177702.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqI;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0237;product=lipoprotein LpqI;protein_id=YP_177702.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 288428 289042 . + . ID=gene-Rv0238;Dbxref=GeneID:886691;Name=Rv0238;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0238
+NC_000962.3 RefSeq CDS 288428 289042 . + 0 ID=cds-NP_214752.1;Parent=gene-Rv0238;Dbxref=Genbank:NP_214752.1,GeneID:886691;Name=NP_214752.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0238;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214752.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 289104 289337 . + . ID=gene-Rv0239;Dbxref=GeneID:886689;Name=vapB24;gbkey=Gene;gene=vapB24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0239
+NC_000962.3 RefSeq CDS 289104 289337 . + 0 ID=cds-NP_214753.1;Parent=gene-Rv0239;Dbxref=Genbank:NP_214753.1,GeneID:886689;Name=NP_214753.1;gbkey=CDS;gene=vapB24;locus_tag=Rv0239;product=antitoxin VapB24;protein_id=NP_214753.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 289345 289782 . + . ID=gene-Rv0240;Dbxref=GeneID:886688;Name=vapC24;gbkey=Gene;gene=vapC24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0240
+NC_000962.3 RefSeq CDS 289345 289782 . + 0 ID=cds-NP_214754.1;Parent=gene-Rv0240;Dbxref=Genbank:NP_214754.1,GeneID:886688;Name=NP_214754.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=vapC24;locus_tag=Rv0240;product=ribonuclease VapC24;protein_id=NP_214754.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 289812 290654 . - . ID=gene-Rv0241c;Dbxref=GeneID:886686;Name=htdX;gbkey=Gene;gene=htdX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0241c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 289812 290654 . - 0 ID=cds-NP_214755.1;Parent=gene-Rv0241c;Dbxref=Genbank:NP_214755.1,GeneID:886686;Name=NP_214755.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=htdX;locus_tag=Rv0241c;product=3-hydroxyacyl-thioester dehydratase HtdX;protein_id=NP_214755.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 290665 292029 . - . ID=gene-Rv0242c;Dbxref=GeneID:886697;Name=fabG4;gbkey=Gene;gene=fabG4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0242c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 290665 292029 . - 0 ID=cds-NP_214756.1;Parent=gene-Rv0242c;Dbxref=Genbank:NP_214756.1,GeneID:886697;Name=NP_214756.1;Note=Belongs to the short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fabG4;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv0242c;product=3-oxoacyl-ACP reductase FabG;protein_id=NP_214756.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 292171 293493 . + . ID=gene-Rv0243;Dbxref=GeneID:886682;Name=fadA2;gbkey=Gene;gene=fadA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0243
+NC_000962.3 RefSeq CDS 292171 293493 . + 0 ID=cds-NP_214757.1;Parent=gene-Rv0243;Dbxref=Genbank:NP_214757.1,GeneID:886682;Name=NP_214757.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00099;locus_tag=Rv0243;product=acetyl-CoA acetyltransferase FadA;protein_id=NP_214757.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 293604 293705 . + . ID=gene-RVnc0008;Dbxref=GeneID:14515886;Name=F6;gbkey=Gene;gene=F6;gene_biotype=ncRNA;gene_synonym=mcr14,mpr13;locus_tag=RVnc0008
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 293604 293705 . + . ID=rna-RVnc0008;Parent=gene-RVnc0008;Dbxref=GeneID:14515886;Note=F6%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009%3B DiChiara et al.%2C 2010). Alternate 3'-ends at positions 293641 and 293661.;gbkey=ncRNA;gene=F6;locus_tag=RVnc0008;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 293604 293705 . + . ID=exon-RVnc0008-1;Parent=rna-RVnc0008;Dbxref=GeneID:14515886;Note=F6%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009%3B DiChiara et al.%2C 2010). Alternate 3'-ends at positions 293641 and 293661.;gbkey=ncRNA;gene=F6;locus_tag=RVnc0008;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 293798 295633 . - . ID=gene-Rv0244c;Dbxref=GeneID:886698;Name=fadE5;gbkey=Gene;gene=fadE5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0244c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 293798 295633 . - 0 ID=cds-NP_214758.1;Parent=gene-Rv0244c;Dbxref=Genbank:NP_214758.1,GeneID:886698;Name=NP_214758.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadE5;locus_tag=Rv0244c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE5;protein_id=NP_214758.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 296005 296493 . + . ID=gene-Rv0245;Dbxref=GeneID:886680;Name=Rv0245;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0245
+NC_000962.3 RefSeq CDS 296005 296493 . + 0 ID=cds-NP_214759.1;Parent=gene-Rv0245;Dbxref=Genbank:NP_214759.1,GeneID:886680;Name=NP_214759.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0245;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214759.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 296809 298119 . + . ID=gene-Rv0246;Dbxref=GeneID:886678;Name=Rv0246;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0246
+NC_000962.3 RefSeq CDS 296809 298119 . + 0 ID=cds-NP_214760.1;Parent=gene-Rv0246;Dbxref=Genbank:NP_214760.1,GeneID:886678;Name=NP_214760.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0246;product=integral membrane protein;protein_id=NP_214760.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 298116 298862 . - . ID=gene-Rv0247c;Dbxref=GeneID:886677;Name=Rv0247c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0247c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 298116 298862 . - 0 ID=cds-NP_214761.1;Parent=gene-Rv0247c;Dbxref=Genbank:NP_214761.1,GeneID:886677;Name=NP_214761.1;Note=Note that succinate dehydrogenase forms generally part of an enzyme complex containing four subunits: a flavoprotein (Rv0248c)%2C an iron-sulfur (Rv0247c)%2C and two hydrophobic anchor proteins (Rv0249c).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00197;locus_tag=Rv0247c;product=succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit;protein_id=NP_214761.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 298863 300803 . - . ID=gene-Rv0248c;Dbxref=GeneID:886675;Name=Rv0248c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0248c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 298863 300803 . - 0 ID=cds-NP_214762.1;Parent=gene-Rv0248c;Dbxref=Genbank:NP_214762.1,GeneID:886675;Name=NP_214762.1;Note=Note that succinate dehydrogenase forms generally part of an enzyme complex containing four subunits: a flavoprotein (Rv0248c)%2C an iron-sulfur (Rv0247c)%2C and two hydrophobic anchor proteins (Rv0249c).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00141;locus_tag=Rv0248c;product=succinate dehydrogenase flavoprotein subunit;protein_id=NP_214762.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 300834 301655 . - . ID=gene-Rv0249c;Dbxref=GeneID:886671;Name=Rv0249c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0249c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 300834 301655 . - 0 ID=cds-NP_214763.1;Parent=gene-Rv0249c;Dbxref=Genbank:NP_214763.1,GeneID:886671;Name=NP_214763.1;Note=Note that succinate dehydrogenase forms generally part of an enzyme complex containing four subunits: a flavoprotein (Rv0248c)%2C an iron-sulfur (Rv0247c)%2C and two hydrophobic anchor proteins (Rv0249c).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0249c;product=succinate dehydrogenase membrane anchor subunit;protein_id=NP_214763.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 301735 302028 . - . ID=gene-Rv0250c;Dbxref=GeneID:886669;Name=Rv0250c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0250c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 301735 302028 . - 0 ID=cds-NP_214764.1;Parent=gene-Rv0250c;Dbxref=Genbank:NP_214764.1,GeneID:886669;Name=NP_214764.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0250c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214764.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 302173 302652 . - . ID=gene-Rv0251c;Dbxref=GeneID:886667;Name=hsp;gbkey=Gene;gene=hsp;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=acr2,hrpA,hsp20;locus_tag=Rv0251c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 302173 302652 . - 0 ID=cds-NP_214765.1;Parent=gene-Rv0251c;Dbxref=Genbank:NP_214765.1,GeneID:886667;Name=NP_214765.1;Note=Hsp (alternate gene name: hsp20%2C hrpA%2C acr2)%2C heat-stress-induced ribosome-binding protein A. Belongs to the small heat shock protein (HSP20) family.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hsp;locus_tag=Rv0251c;product=heat shock protein;protein_id=NP_214765.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 302866 305427 . + . ID=gene-Rv0252;Dbxref=GeneID:886665;Name=nirB;gbkey=Gene;gene=nirB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nasB;locus_tag=Rv0252
+NC_000962.3 RefSeq CDS 302866 305427 . + 0 ID=cds-NP_214766.1;Parent=gene-Rv0252;Dbxref=Genbank:NP_214766.1,GeneID:886665;Name=NP_214766.1;Note=nirB (alternate gene name: nasB)%2C nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit%2C flavoprotein containing siroheme and a 2FE-2S iron-sulfur center. Cofactors: FAD%3B Iron%3B Siroheme.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=nirB;inference=protein motif:PROSITE:PS00365;locus_tag=Rv0252;product=nitrite reductase large subunit NirB;protein_id=NP_214766.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 305453 305809 . + . ID=gene-Rv0253;Dbxref=GeneID:886664;Name=nirD;gbkey=Gene;gene=nirD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0253
+NC_000962.3 RefSeq CDS 305453 305809 . + 0 ID=cds-NP_214767.1;Parent=gene-Rv0253;Dbxref=Genbank:NP_214767.1,GeneID:886664;Name=NP_214767.1;Note=nirD%2Cnitrite reductase [NAD(P)H] small subunit;gbkey=CDS;gene=nirD;locus_tag=Rv0253;product=nitrite reductase small subunit NirD;protein_id=NP_214767.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 305825 306349 . - . ID=gene-Rv0254c;Dbxref=GeneID:886661;Name=cobU;gbkey=Gene;gene=cobU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0254c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 305825 306349 . - 0 ID=cds-NP_214768.1;Parent=gene-Rv0254c;Dbxref=Genbank:NP_214768.1,GeneID:886661;Name=NP_214768.1;Note=cobU%2Ccobalamin biosynthesis protein including a cobinamide kinase and cobinamide phosphate guanylyltransferase.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cobU;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0254c;product=bifunctional cobinamide kinase/cobinamide phosphate guanylyltransferase;protein_id=NP_214768.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 306374 307858 . - . ID=gene-Rv0255c;Dbxref=GeneID:886673;Name=cobQ1;gbkey=Gene;gene=cobQ1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cobQ;locus_tag=Rv0255c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 306374 307858 . - 0 ID=cds-YP_177703.1;Parent=gene-Rv0255c;Dbxref=Genbank:YP_177703.1,GeneID:886673;Name=YP_177703.1;Note=Belongs to the COBB/COBQ family%2C COBQ subfamily.;gbkey=CDS;gene=cobQ1;locus_tag=Rv0255c;product=cobyric acid synthase;protein_id=YP_177703.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 307877 309547 . - . ID=gene-Rv0256c;Dbxref=GeneID:886684;Name=PPE2;gbkey=Gene;gene=PPE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0256c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 307877 309547 . - 0 ID=cds-YP_177704.1;Parent=gene-Rv0256c;Dbxref=Genbank:YP_177704.1,GeneID:886684;Name=YP_177704.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=PPE2;locus_tag=Rv0256c;product=PPE family protein PPE2;protein_id=YP_177704.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 309699 310073 . + . ID=gene-Rv0257;Dbxref=GeneID:3205110;Name=Rv0257;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0257
+NC_000962.3 RefSeq CDS 309699 310073 . + 0 ID=cds-YP_177620.1;Parent=gene-Rv0257;Dbxref=Genbank:YP_177620.1,GeneID:3205110;Name=YP_177620.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927);gbkey=CDS;locus_tag=Rv0257;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177620.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 310294 310749 . - . ID=gene-Rv0258c;Dbxref=GeneID:886654;Name=Rv0258c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0258c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 310294 310749 . - 0 ID=cds-NP_214772.1;Parent=gene-Rv0258c;Dbxref=Genbank:NP_214772.1,GeneID:886654;Name=NP_214772.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0258c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214772.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 310774 311517 . - . ID=gene-Rv0259c;Dbxref=GeneID:886657;Name=Rv0259c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0259c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 310774 311517 . - 0 ID=cds-NP_214773.1;Parent=gene-Rv0259c;Dbxref=Genbank:NP_214773.1,GeneID:886657;Name=NP_214773.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0259c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214773.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 311514 312659 . - . ID=gene-Rv0260c;Dbxref=GeneID:886651;Name=Rv0260c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0260c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 311514 312659 . - 0 ID=cds-NP_214774.1;Parent=gene-Rv0260c;Dbxref=Genbank:NP_214774.1,GeneID:886651;Name=NP_214774.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0260c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214774.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 312759 314168 . - . ID=gene-Rv0261c;Dbxref=GeneID:886663;Name=narK3;gbkey=Gene;gene=narK3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0261c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 312759 314168 . - 0 ID=cds-NP_214775.1;Parent=gene-Rv0261c;Dbxref=Genbank:NP_214775.1,GeneID:886663;Name=NP_214775.1;Note=Belongs to the nark/NASA family of transporters.;gbkey=CDS;gene=narK3;locus_tag=Rv0261c;product=nitrate/nitrite transporter;protein_id=NP_214775.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 314309 314854 . - . ID=gene-Rv0262c;Dbxref=GeneID:886648;Name=aac;gbkey=Gene;gene=aac;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0262c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 314309 314854 . - 0 ID=cds-NP_214776.1;Parent=gene-Rv0262c;Dbxref=Genbank:NP_214776.1,GeneID:886648;Name=NP_214776.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=aac;locus_tag=Rv0262c;product=aminoglycoside 2'-N-acetyltransferase;protein_id=NP_214776.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 314864 315766 . - . ID=gene-Rv0263c;Dbxref=GeneID:886659;Name=Rv0263c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0263c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 314864 315766 . - 0 ID=cds-NP_214777.1;Parent=gene-Rv0263c;Dbxref=Genbank:NP_214777.1,GeneID:886659;Name=NP_214777.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0263c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214777.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 322764 323273 . - . ID=gene-Rv0268c;Dbxref=GeneID:886647;Name=Rv0268c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0268c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 323338 324531 . - . ID=gene-Rv0269c;Dbxref=GeneID:886640;Name=Rv0269c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0269c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 324567 326249 . + . ID=gene-Rv0270;Dbxref=GeneID:886637;Name=fadD2;gbkey=Gene;gene=fadD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0270
+NC_000962.3 RefSeq CDS 324567 326249 . + 0 ID=cds-NP_214784.1;Parent=gene-Rv0270;Dbxref=Genbank:NP_214784.1,GeneID:886637;Name=NP_214784.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadD2;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0270;product=fatty-acid--CoA ligase FadD2;protein_id=NP_214784.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 326266 328461 . - . ID=gene-Rv0271c;Dbxref=GeneID:886641;Name=fadE6;gbkey=Gene;gene=fadE6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0271c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 326266 328461 . - 0 ID=cds-NP_214785.1;Parent=gene-Rv0271c;Dbxref=Genbank:NP_214785.1,GeneID:886641;Name=NP_214785.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE6;locus_tag=Rv0271c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE6;protein_id=NP_214785.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 328575 329708 . - . ID=gene-Rv0272c;Dbxref=GeneID:886635;Name=Rv0272c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0272c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 329705 330325 . - . ID=gene-Rv0273c;Dbxref=GeneID:886633;Name=Rv0273c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0273c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 329705 330325 . - 0 ID=cds-NP_214787.1;Parent=gene-Rv0273c;Dbxref=Genbank:NP_214787.1,GeneID:886633;Name=NP_214787.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0273c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214787.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 330422 331003 . + . ID=gene-Rv0274;Dbxref=GeneID:886631;Name=Rv0274;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0274
+NC_000962.3 RefSeq CDS 330422 331003 . + 0 ID=cds-NP_214788.1;Parent=gene-Rv0274;Dbxref=Genbank:NP_214788.1,GeneID:886631;Name=NP_214788.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00082;locus_tag=Rv0274;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214788.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 330933 331658 . - . ID=gene-Rv0275c;Dbxref=GeneID:886629;Name=Rv0275c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0275c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 330933 331658 . - 0 ID=cds-YP_177706.1;Parent=gene-Rv0275c;Dbxref=Genbank:YP_177706.1,GeneID:886629;Name=YP_177706.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0275c;product=transcriptional regulator;protein_id=YP_177706.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 331748 332668 . + . ID=gene-Rv0276;Dbxref=GeneID:886627;Name=Rv0276;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0276
+NC_000962.3 RefSeq CDS 331748 332668 . + 0 ID=cds-NP_214790.1;Parent=gene-Rv0276;Dbxref=Genbank:NP_214790.1,GeneID:886627;Name=NP_214790.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0276;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214790.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 332708 333136 . - . ID=gene-Rv0277c;Dbxref=GeneID:886625;Name=vapC25;gbkey=Gene;gene=vapC25;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0277c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 332708 333136 . - 0 ID=cds-NP_214791.1;Parent=gene-Rv0277c;Dbxref=Genbank:NP_214791.1,GeneID:886625;Name=NP_214791.1;Note=toxin%2C contains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC25;locus_tag=Rv0277c;product=ribonuclease VapC25;protein_id=NP_214791.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 333160 333417 . - . ID=gene-Rv0277A;Dbxref=GeneID:14515902;Name=vapB25;gbkey=Gene;gene=vapB25;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv0277A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 333160 333417 . - . ID=id-Rv0277A;Dbxref=GeneID:14515902;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0277c;gbkey=misc_feature;gene=vapB25;locus_tag=Rv0277A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 333437 336310 . - . ID=gene-Rv0278c;Dbxref=GeneID:886623;Name=Rv0278c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0278c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 333437 336310 . - 0 ID=cds-YP_177707.1;Parent=gene-Rv0278c;Dbxref=Genbank:YP_177707.1,GeneID:886623;Name=YP_177707.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00583;locus_tag=Rv0278c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS3;protein_id=YP_177707.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 336560 339073 . - . ID=gene-Rv0279c;Dbxref=GeneID:886621;Name=PE_PGRS4;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0279c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 336560 339073 . - 0 ID=cds-YP_177708.1;Parent=gene-Rv0279c;Dbxref=Genbank:YP_177708.1,GeneID:886621;Name=YP_177708.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS4;locus_tag=Rv0279c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS4;protein_id=YP_177708.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 339364 340974 . + . ID=gene-Rv0280;Dbxref=GeneID:886619;Name=PPE3;gbkey=Gene;gene=PPE3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0280
+NC_000962.3 RefSeq CDS 339364 340974 . + 0 ID=cds-YP_177709.1;Parent=gene-Rv0280;Dbxref=Genbank:YP_177709.1,GeneID:886619;Name=YP_177709.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE3;locus_tag=Rv0280;product=PPE family protein PPE3;protein_id=YP_177709.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 340998 341906 . + . ID=gene-Rv0281;Dbxref=GeneID:886618;Name=Rv0281;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0281
+NC_000962.3 RefSeq CDS 340998 341906 . + 0 ID=cds-NP_214795.1;Parent=gene-Rv0281;Dbxref=Genbank:NP_214795.1,GeneID:886618;Name=NP_214795.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0281;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_214795.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 342130 344025 . + . ID=gene-Rv0282;Dbxref=GeneID:886613;Name=eccA3;gbkey=Gene;gene=eccA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0282
+NC_000962.3 RefSeq CDS 342130 344025 . + 0 ID=cds-NP_214796.1;Parent=gene-Rv0282;Dbxref=Genbank:NP_214796.1,GeneID:886613;Name=NP_214796.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccA3;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0282;product=ESX-3 secretion system protein EccA;protein_id=NP_214796.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 344022 345638 . + . ID=gene-Rv0283;Dbxref=GeneID:886645;Name=eccB3;gbkey=Gene;gene=eccB3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0283
+NC_000962.3 RefSeq CDS 344022 345638 . + 0 ID=cds-NP_214797.1;Parent=gene-Rv0283;Dbxref=Genbank:NP_214797.1,GeneID:886645;Name=NP_214797.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccB3;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0283;product=ESX-3 secretion system protein EccB3;protein_id=NP_214797.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 345635 349627 . + . ID=gene-Rv0284;Dbxref=GeneID:886611;Name=eccC3;gbkey=Gene;gene=eccC3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0284
+NC_000962.3 RefSeq CDS 345635 349627 . + 0 ID=cds-NP_214798.1;Parent=gene-Rv0284;Dbxref=Genbank:NP_214798.1,GeneID:886611;Name=NP_214798.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccC3;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0284;product=ESX-3 secretion system protein EccC3;protein_id=NP_214798.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 349624 349932 . + . ID=gene-Rv0285;Dbxref=GeneID:886608;Name=PE5;gbkey=Gene;gene=PE5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0285
+NC_000962.3 RefSeq CDS 349624 349932 . + 0 ID=cds-YP_177710.1;Parent=gene-Rv0285;Dbxref=Genbank:YP_177710.1,GeneID:886608;Name=YP_177710.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PE5;locus_tag=Rv0285;product=PE family protein PE5;protein_id=YP_177710.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 349935 351476 . + . ID=gene-Rv0286;Dbxref=GeneID:886607;Name=PPE4;gbkey=Gene;gene=PPE4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0286
+NC_000962.3 RefSeq CDS 349935 351476 . + 0 ID=cds-YP_177711.1;Parent=gene-Rv0286;Dbxref=Genbank:YP_177711.1,GeneID:886607;Name=YP_177711.1;gbkey=CDS;gene=PPE4;locus_tag=Rv0286;product=PPE family protein PPE4;protein_id=YP_177711.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 351525 351818 . + . ID=gene-Rv0287;Dbxref=GeneID:886604;Name=esxG;gbkey=Gene;gene=esxG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=TB9.8;locus_tag=Rv0287
+NC_000962.3 RefSeq CDS 351525 351818 . + 0 ID=cds-NP_214801.1;Parent=gene-Rv0287;Dbxref=Genbank:NP_214801.1,GeneID:886604;Name=NP_214801.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=esxG;locus_tag=Rv0287;product=ESAT-6 like protein EsxG;protein_id=NP_214801.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 351848 352138 . + . ID=gene-Rv0288;Dbxref=GeneID:886603;Name=esxH;gbkey=Gene;gene=esxH;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cfp7,TB10.4;locus_tag=Rv0288
+NC_000962.3 RefSeq CDS 351848 352138 . + 0 ID=cds-NP_214802.1;Parent=gene-Rv0288;Dbxref=Genbank:NP_214802.1,GeneID:886603;Name=NP_214802.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927). Predicted possible vaccine candidate (See Zvi et al.%2C2008).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10603390];gbkey=CDS;gene=esxH;locus_tag=Rv0288;product=ESAT-6-like protein EsxH;protein_id=NP_214802.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 352149 353036 . + . ID=gene-Rv0289;Dbxref=GeneID:886602;Name=espG3;gbkey=Gene;gene=espG3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0289
+NC_000962.3 RefSeq CDS 352149 353036 . + 0 ID=cds-NP_214803.1;Parent=gene-Rv0289;Dbxref=Genbank:NP_214803.1,GeneID:886602;Name=NP_214803.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;gene=espG3;locus_tag=Rv0289;product=ESX-3 secretion-associated protein EspG3;protein_id=NP_214803.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 353083 354501 . + . ID=gene-Rv0290;Dbxref=GeneID:886599;Name=eccD3;gbkey=Gene;gene=eccD3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0290
+NC_000962.3 RefSeq CDS 353083 354501 . + 0 ID=cds-NP_214804.1;Parent=gene-Rv0290;Dbxref=Genbank:NP_214804.1,GeneID:886599;Name=NP_214804.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=eccD3;locus_tag=Rv0290;product=ESX-3 secretion system protein EccD;protein_id=NP_214804.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 354498 355883 . + . ID=gene-Rv0291;Dbxref=GeneID:886615;Name=mycP3;gbkey=Gene;gene=mycP3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0291
+NC_000962.3 RefSeq CDS 354498 355883 . + 0 ID=cds-NP_214805.1;Parent=gene-Rv0291;Dbxref=Genbank:NP_214805.1,GeneID:886615;Name=NP_214805.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10974545];gbkey=CDS;gene=mycP3;inference=protein motif:PROSITE:PS00137;locus_tag=Rv0291;product=membrane-anchored mycosin MycP;protein_id=NP_214805.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 355880 356875 . + . ID=gene-Rv0292;Dbxref=GeneID:886601;Name=eccE3;gbkey=Gene;gene=eccE3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0292
+NC_000962.3 RefSeq CDS 355880 356875 . + 0 ID=cds-NP_214806.1;Parent=gene-Rv0292;Dbxref=Genbank:NP_214806.1,GeneID:886601;Name=NP_214806.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccE3;locus_tag=Rv0292;product=ESX-3 secretion system protein EccE;protein_id=NP_214806.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 356862 358064 . - . ID=gene-Rv0293c;Dbxref=GeneID:886594;Name=Rv0293c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0293c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 356862 358064 . - 0 ID=cds-NP_214807.1;Parent=gene-Rv0293c;Dbxref=Genbank:NP_214807.1,GeneID:886594;Name=NP_214807.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0293c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214807.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 358171 358956 . + . ID=gene-Rv0294;Dbxref=GeneID:886593;Name=tam;gbkey=Gene;gene=tam;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0294
+NC_000962.3 RefSeq CDS 358171 358956 . + 0 ID=cds-NP_214808.1;Parent=gene-Rv0294;Dbxref=Genbank:NP_214808.1,GeneID:886593;Name=NP_214808.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=tam;locus_tag=Rv0294;product=trans-aconitate methyltransferase;protein_id=NP_214808.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 358945 359748 . - . ID=gene-Rv0295c;Dbxref=GeneID:886596;Name=Rv0295c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0295c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 358945 359748 . - 0 ID=cds-NP_214809.1;Parent=gene-Rv0295c;Dbxref=Genbank:NP_214809.1,GeneID:886596;Name=NP_214809.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0295c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214809.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 359758 361155 . - . ID=gene-Rv0296c;Dbxref=GeneID:886600;Name=Rv0296c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=atsG;locus_tag=Rv0296c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 359758 361155 . - 0 ID=cds-YP_177712.1;Parent=gene-Rv0296c;Dbxref=Genbank:YP_177712.1,GeneID:886600;Name=YP_177712.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00523;locus_tag=Rv0296c;product=sulfatase;protein_id=YP_177712.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 361334 363109 . + . ID=gene-Rv0297;Dbxref=GeneID:885981;Name=PE_PGRS5;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0297
+NC_000962.3 RefSeq CDS 361334 363109 . + 0 ID=cds-YP_177713.1;Parent=gene-Rv0297;Dbxref=Genbank:YP_177713.1,GeneID:885981;Name=YP_177713.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS5;locus_tag=Rv0297;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS5;protein_id=YP_177713.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 363252 363479 . + . ID=gene-Rv0298;Dbxref=GeneID:886590;Name=Rv0298;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0298
+NC_000962.3 RefSeq CDS 363252 363479 . + 0 ID=cds-NP_214812.1;Parent=gene-Rv0298;Dbxref=Genbank:NP_214812.1,GeneID:886590;Name=NP_214812.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0298;product=antitoxin;protein_id=NP_214812.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 363476 363778 . + . ID=gene-Rv0299;Dbxref=GeneID:886598;Name=Rv0299;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0299
+NC_000962.3 RefSeq CDS 363476 363778 . + 0 ID=cds-NP_214813.1;Parent=gene-Rv0299;Dbxref=Genbank:NP_214813.1,GeneID:886598;Name=NP_214813.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0299;product=toxin;protein_id=NP_214813.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 363826 364047 . + . ID=gene-Rv0300;Dbxref=GeneID:886588;Name=vapB2;gbkey=Gene;gene=vapB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0300
+NC_000962.3 RefSeq CDS 363826 364047 . + 0 ID=cds-NP_214814.1;Parent=gene-Rv0300;Dbxref=Genbank:NP_214814.1,GeneID:886588;Name=NP_214814.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0301. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:23011806];gbkey=CDS;gene=vapB2;locus_tag=Rv0300;product=antitoxin VapB2;protein_id=NP_214814.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 364044 364469 . + . ID=gene-Rv0301;Dbxref=GeneID:886586;Name=vapC2;gbkey=Gene;gene=vapC2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0301
+NC_000962.3 RefSeq CDS 364044 364469 . + 0 ID=cds-NP_214815.1;Parent=gene-Rv0301;Dbxref=Genbank:NP_214815.1,GeneID:886586;Name=NP_214815.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0300%2C contains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:23011806];gbkey=CDS;gene=vapC2;locus_tag=Rv0301;product=ribonuclease VapC2;protein_id=NP_214815.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 364605 365237 . + . ID=gene-Rv0302;Dbxref=GeneID:886584;Name=Rv0302;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0302
+NC_000962.3 RefSeq CDS 364605 365237 . + 0 ID=cds-NP_214816.1;Parent=gene-Rv0302;Dbxref=Genbank:NP_214816.1,GeneID:886584;Name=NP_214816.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0302;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214816.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 365234 366142 . + . ID=gene-Rv0303;Dbxref=GeneID:886581;Name=Rv0303;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0303
+NC_000962.3 RefSeq CDS 365234 366142 . + 0 ID=cds-NP_214817.1;Parent=gene-Rv0303;Dbxref=Genbank:NP_214817.1,GeneID:886581;Name=NP_214817.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0303;product=dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_214817.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 366150 372764 . - . ID=gene-Rv0304c;Dbxref=GeneID:886592;Name=PPE5;gbkey=Gene;gene=PPE5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0304c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 366150 372764 . - 0 ID=cds-YP_177714.1;Parent=gene-Rv0304c;Dbxref=Genbank:YP_177714.1,GeneID:886592;Name=YP_177714.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE5;locus_tag=Rv0304c;product=PPE family protein PPE5;protein_id=YP_177714.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 372820 375711 . - . ID=gene-Rv0305c;Dbxref=GeneID:885978;Name=PPE6;gbkey=Gene;gene=PPE6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0305c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 372820 375711 . - 0 ID=cds-YP_177715.1;Parent=gene-Rv0305c;Dbxref=Genbank:YP_177715.1,GeneID:885978;Name=YP_177715.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=PPE6;locus_tag=Rv0305c;product=PPE family protein PPE6;protein_id=YP_177715.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 375914 376585 . + . ID=gene-Rv0306;Dbxref=GeneID:886577;Name=Rv0306;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0306
+NC_000962.3 RefSeq CDS 375914 376585 . + 0 ID=cds-NP_214820.1;Parent=gene-Rv0306;Dbxref=Genbank:NP_214820.1,GeneID:886577;Name=NP_214820.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0306;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214820.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 376573 377055 . - . ID=gene-Rv0307c;Dbxref=GeneID:886580;Name=Rv0307c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0307c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 376573 377055 . - 0 ID=cds-NP_214821.1;Parent=gene-Rv0307c;Dbxref=Genbank:NP_214821.1,GeneID:886580;Name=NP_214821.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0307c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214821.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 377113 377829 . + . ID=gene-Rv0308;Dbxref=GeneID:886583;Name=Rv0308;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0308
+NC_000962.3 RefSeq CDS 377113 377829 . + 0 ID=cds-NP_214822.1;Parent=gene-Rv0308;Dbxref=Genbank:NP_214822.1,GeneID:886583;Name=NP_214822.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0308;product=integral membrane protein;protein_id=NP_214822.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 377931 378587 . + . ID=gene-Rv0309;Dbxref=GeneID:886574;Name=Rv0309;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0309
+NC_000962.3 RefSeq CDS 377931 378587 . + 0 ID=cds-NP_214823.1;Parent=gene-Rv0309;Dbxref=Genbank:NP_214823.1,GeneID:886574;Name=NP_214823.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0309;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214823.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 378657 379148 . - . ID=gene-Rv0310c;Dbxref=GeneID:886570;Name=Rv0310c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0310c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 378657 379148 . - 0 ID=cds-NP_214824.1;Parent=gene-Rv0310c;Dbxref=Genbank:NP_214824.1,GeneID:886570;Name=NP_214824.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0310c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214824.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 379172 380401 . + . ID=gene-Rv0311;Dbxref=GeneID:886579;Name=Rv0311;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0311
+NC_000962.3 RefSeq CDS 379172 380401 . + 0 ID=cds-NP_214825.1;Parent=gene-Rv0311;Dbxref=Genbank:NP_214825.1,GeneID:886579;Name=NP_214825.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00881;locus_tag=Rv0311;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214825.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 380556 382418 . + . ID=gene-Rv0312;Dbxref=GeneID:886566;Name=Rv0312;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0312
+NC_000962.3 RefSeq CDS 380556 382418 . + 0 ID=cds-NP_214826.1;Parent=gene-Rv0312;Dbxref=Genbank:NP_214826.1,GeneID:886566;Name=NP_214826.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0312;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214826.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 382490 382876 . + . ID=gene-Rv0313;Dbxref=GeneID:886572;Name=Rv0313;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0313
+NC_000962.3 RefSeq CDS 382490 382876 . + 0 ID=cds-NP_214827.1;Parent=gene-Rv0313;Dbxref=Genbank:NP_214827.1,GeneID:886572;Name=NP_214827.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0313;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214827.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 382879 383541 . - . ID=gene-Rv0314c;Dbxref=GeneID:886564;Name=Rv0314c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0314c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 382879 383541 . - 0 ID=cds-NP_214828.1;Parent=gene-Rv0314c;Dbxref=Genbank:NP_214828.1,GeneID:886564;Name=NP_214828.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0314c;product=membrane protein;protein_id=NP_214828.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 383602 384486 . + . ID=gene-Rv0315;Dbxref=GeneID:886563;Name=Rv0315;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0315
+NC_000962.3 RefSeq CDS 383602 384486 . + 0 ID=cds-NP_214829.1;Parent=gene-Rv0315;Dbxref=Genbank:NP_214829.1,GeneID:886563;Name=NP_214829.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01034;locus_tag=Rv0315;product=beta-1%2C3-glucanase;protein_id=NP_214829.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 384535 385149 . + . ID=gene-Rv0316;Dbxref=GeneID:886560;Name=Rv0316;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0316
+NC_000962.3 RefSeq CDS 384535 385149 . + 0 ID=cds-NP_214830.1;Parent=gene-Rv0316;Dbxref=Genbank:NP_214830.1,GeneID:886560;Name=NP_214830.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0316;product=muconolactone isomerase;protein_id=NP_214830.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 385173 385943 . - . ID=gene-Rv0317c;Dbxref=GeneID:886559;Name=glpQ2;gbkey=Gene;gene=glpQ2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0317c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 385173 385943 . - 0 ID=cds-NP_214831.1;Parent=gene-Rv0317c;Dbxref=Genbank:NP_214831.1,GeneID:886559;Name=NP_214831.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=glpQ2;locus_tag=Rv0317c;product=glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ;protein_id=NP_214831.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 386204 386274 . - . ID=gene-Rvnt04;Dbxref=GeneID:2700441;Name=glyU;gbkey=Gene;gene=glyU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt04
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 386204 386274 . - . ID=rna-Rvnt04;Parent=gene-Rvnt04;Dbxref=GeneID:2700441;Note=glyU%2C tRNA-Gly%2C anticodon ccc%2C length %3D 71;anticodon=(pos:complement(386240..386242));codons=63;gbkey=tRNA;gene=glyU;locus_tag=Rvnt04;product=tRNA-Gly
+NC_000962.3 RefSeq exon 386204 386274 . - . ID=exon-Rvnt04-1;Parent=rna-Rvnt04;Dbxref=GeneID:2700441;Note=glyU%2C tRNA-Gly%2C anticodon ccc%2C length %3D 71;anticodon=(pos:complement(386240..386242));codons=63;gbkey=tRNA;gene=glyU;locus_tag=Rvnt04;product=tRNA-Gly
+NC_000962.3 RefSeq gene 386305 387099 . - . ID=gene-Rv0318c;Dbxref=GeneID:886576;Name=Rv0318c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0318c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 386305 387099 . - 0 ID=cds-YP_177716.1;Parent=gene-Rv0318c;Dbxref=Genbank:YP_177716.1,GeneID:886576;Name=YP_177716.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0318c;product=integral membrane protein;protein_id=YP_177716.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 387148 387816 . + . ID=gene-Rv0319;Dbxref=GeneID:886555;Name=pcp;gbkey=Gene;gene=pcp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0319
+NC_000962.3 RefSeq CDS 387148 387816 . + 0 ID=cds-NP_214833.1;Parent=gene-Rv0319;Dbxref=Genbank:NP_214833.1,GeneID:886555;Name=NP_214833.1;Note=Belongs to peptidase family C15 (thiol protease).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pcp;locus_tag=Rv0319;product=pyrrolidone-carboxylate peptidase;protein_id=NP_214833.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 387888 388550 . + . ID=gene-Rv0320;Dbxref=GeneID:886553;Name=Rv0320;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0320
+NC_000962.3 RefSeq CDS 387888 388550 . + 0 ID=cds-NP_214834.1;Parent=gene-Rv0320;Dbxref=Genbank:NP_214834.1,GeneID:886553;Name=NP_214834.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0320;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214834.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 388582 389154 . + . ID=gene-Rv0321;Dbxref=GeneID:886552;Name=dcd;gbkey=Gene;gene=dcd;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dus,paxA;locus_tag=Rv0321
+NC_000962.3 RefSeq CDS 388582 389154 . + 0 ID=cds-NP_214835.1;Parent=gene-Rv0321;Dbxref=Genbank:NP_214835.1,GeneID:886552;Name=NP_214835.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=dcd;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0321;product=deoxycytidine triphosphate deaminase;protein_id=NP_214835.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 389260 390591 . + . ID=gene-Rv0322;Dbxref=GeneID:886550;Name=udgA;gbkey=Gene;gene=udgA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rkpK;locus_tag=Rv0322
+NC_000962.3 RefSeq CDS 389260 390591 . + 0 ID=cds-NP_214836.1;Parent=gene-Rv0322;Dbxref=Genbank:NP_214836.1,GeneID:886550;Name=NP_214836.1;Note=Belongs to the UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenases family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=udgA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0322;product=UDP-glucose 6-dehydrogenase UdgA;protein_id=NP_214836.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 390580 391251 . - . ID=gene-Rv0323c;Dbxref=GeneID:886557;Name=Rv0323c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0323c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 390580 391251 . - 0 ID=cds-NP_214837.1;Parent=gene-Rv0323c;Dbxref=Genbank:NP_214837.1,GeneID:886557;Name=NP_214837.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0323c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214837.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 391352 392032 . + . ID=gene-Rv0324;Dbxref=GeneID:886548;Name=Rv0324;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0324
+NC_000962.3 RefSeq CDS 391352 392032 . + 0 ID=cds-NP_214838.1;Parent=gene-Rv0324;Dbxref=Genbank:NP_214838.1,GeneID:886548;Name=NP_214838.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0324;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214838.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 392039 392263 . + . ID=gene-Rv0325;Dbxref=GeneID:886546;Name=Rv0325;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0325
+NC_000962.3 RefSeq CDS 392039 392263 . + 0 ID=cds-NP_214839.1;Parent=gene-Rv0325;Dbxref=Genbank:NP_214839.1,GeneID:886546;Name=NP_214839.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0325;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214839.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 392273 392728 . + . ID=gene-Rv0326;Dbxref=GeneID:886544;Name=Rv0326;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0326
+NC_000962.3 RefSeq CDS 392273 392728 . + 0 ID=cds-NP_214840.1;Parent=gene-Rv0326;Dbxref=Genbank:NP_214840.1,GeneID:886544;Name=NP_214840.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0326;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214840.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 392696 394045 . - . ID=gene-Rv0327c;Dbxref=GeneID:886538;Name=cyp135A1;gbkey=Gene;gene=cyp135A1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0327c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 392696 394045 . - 0 ID=cds-NP_214841.1;Parent=gene-Rv0327c;Dbxref=Genbank:NP_214841.1,GeneID:886538;Name=NP_214841.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=cyp135A1;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv0327c;product=cytochrome P450 Cyp135A1;protein_id=NP_214841.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 394111 394713 . + . ID=gene-Rv0328;Dbxref=GeneID:886542;Name=Rv0328;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0328
+NC_000962.3 RefSeq CDS 394111 394713 . + 0 ID=cds-NP_214842.1;Parent=gene-Rv0328;Dbxref=Genbank:NP_214842.1,GeneID:886542;Name=NP_214842.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0328;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214842.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 394694 395320 . - . ID=gene-Rv0329c;Dbxref=GeneID:886536;Name=Rv0329c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0329c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 394694 395320 . - 0 ID=cds-NP_214843.1;Parent=gene-Rv0329c;Dbxref=Genbank:NP_214843.1,GeneID:886536;Name=NP_214843.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0329c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214843.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 395347 396087 . - . ID=gene-Rv0330c;Dbxref=GeneID:886540;Name=Rv0330c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0330c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 395347 396087 . - 0 ID=cds-NP_214844.1;Parent=gene-Rv0330c;Dbxref=Genbank:NP_214844.1,GeneID:886540;Name=NP_214844.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0330c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214844.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 396201 397367 . + . ID=gene-Rv0331;Dbxref=GeneID:886534;Name=Rv0331;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0331
+NC_000962.3 RefSeq CDS 396201 397367 . + 0 ID=cds-NP_214845.1;Parent=gene-Rv0331;Dbxref=Genbank:NP_214845.1,GeneID:886534;Name=NP_214845.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0331;product=dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_214845.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 397442 398227 . + . ID=gene-Rv0332;Dbxref=GeneID:886532;Name=Rv0332;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0332
+NC_000962.3 RefSeq CDS 397442 398227 . + 0 ID=cds-NP_214846.1;Parent=gene-Rv0332;Dbxref=Genbank:NP_214846.1,GeneID:886532;Name=NP_214846.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0332;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214846.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 398254 398628 . + . ID=gene-Rv0333;Dbxref=GeneID:886528;Name=Rv0333;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0333
+NC_000962.3 RefSeq CDS 398254 398628 . + 0 ID=cds-NP_214847.1;Parent=gene-Rv0333;Dbxref=Genbank:NP_214847.1,GeneID:886528;Name=NP_214847.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0333;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214847.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 398658 399524 . + . ID=gene-Rv0334;Dbxref=GeneID:886568;Name=rmlA;gbkey=Gene;gene=rmlA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rfbA;locus_tag=Rv0334
+NC_000962.3 RefSeq CDS 398658 399524 . + 0 ID=cds-NP_214848.1;Parent=gene-Rv0334;Dbxref=Genbank:NP_214848.1,GeneID:886568;Name=NP_214848.1;Note=alpha-D-glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:9084178];gbkey=CDS;gene=rmlA;locus_tag=Rv0334;product=glucose-1-phosphate thymidylyltransferase;protein_id=NP_214848.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 399535 400050 . - . ID=gene-Rv0335c;Dbxref=GeneID:886527;Name=PE6;gbkey=Gene;gene=PE6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0335c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 399535 400050 . - 0 ID=cds-YP_177717.1;Parent=gene-Rv0335c;Dbxref=Genbank:YP_177717.1,GeneID:886527;Name=YP_177717.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=PE6;locus_tag=Rv0335c;product=PE family protein PE6;protein_id=YP_177717.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 400192 401703 . + . ID=gene-Rv0336;Dbxref=GeneID:886524;Name=Rv0336;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0336
+NC_000962.3 RefSeq CDS 400192 401703 . + 0 ID=cds-NP_214850.1;Parent=gene-Rv0336;Dbxref=Genbank:NP_214850.1,GeneID:886524;Name=NP_214850.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0336;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214850.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 401873 403162 . - . ID=gene-Rv0337c;Dbxref=GeneID:886522;Name=aspC;gbkey=Gene;gene=aspC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0337c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 401873 403162 . - 0 ID=cds-NP_214851.1;Parent=gene-Rv0337c;Dbxref=Genbank:NP_214851.1,GeneID:886522;Name=NP_214851.1;Note=Belongs to class-I of pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferases. Cofactor: pyridoxal phosphate.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=aspC;locus_tag=Rv0337c;product=aspartate aminotransferase;protein_id=NP_214851.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 403193 405841 . - . ID=gene-Rv0338c;Dbxref=GeneID:886520;Name=Rv0338c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0338c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 403193 405841 . - 0 ID=cds-NP_214852.1;Parent=gene-Rv0338c;Dbxref=Genbank:NP_214852.1,GeneID:886520;Name=NP_214852.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00198;locus_tag=Rv0338c;product=iron-sulfur-binding reductase;protein_id=NP_214852.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 405950 408448 . - . ID=gene-Rv0339c;Dbxref=GeneID:886516;Name=Rv0339c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0339c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 405950 408448 . - 0 ID=cds-NP_214853.1;Parent=gene-Rv0339c;Dbxref=Genbank:NP_214853.1,GeneID:886516;Name=NP_214853.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0339c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214853.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 408634 409173 . + . ID=gene-Rv0340;Dbxref=GeneID:886514;Name=Rv0340;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0340
+NC_000962.3 RefSeq CDS 408634 409173 . + 0 ID=cds-NP_214854.1;Parent=gene-Rv0340;Dbxref=Genbank:NP_214854.1,GeneID:886514;Name=NP_214854.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0340;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214854.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 409362 410801 . + . ID=gene-Rv0341;Dbxref=GeneID:886518;Name=iniB;gbkey=Gene;gene=iniB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0341
+NC_000962.3 RefSeq CDS 409362 410801 . + 0 ID=cds-NP_214855.1;Parent=gene-Rv0341;Dbxref=Genbank:NP_214855.1,GeneID:886518;Name=NP_214855.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=iniB;locus_tag=Rv0341;product=isoniazid inducible protein IniB;protein_id=NP_214855.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 410838 412760 . + . ID=gene-Rv0342;Dbxref=GeneID:886510;Name=iniA;gbkey=Gene;gene=iniA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0342
+NC_000962.3 RefSeq CDS 410838 412760 . + 0 ID=cds-NP_214856.1;Parent=gene-Rv0342;Dbxref=Genbank:NP_214856.1,GeneID:886510;Name=NP_214856.1;Note=Note that the iniA gene is also induced by the antibiotic ethambutol%2C an agent that inhibits cell wall biosynthesis by a mechanism that is distinct from isoniazid.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15752203];gbkey=CDS;gene=iniA;locus_tag=Rv0342;product=isoniazid inductible protein IniA;protein_id=NP_214856.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 412757 414238 . + . ID=gene-Rv0343;Dbxref=GeneID:886508;Name=iniC;gbkey=Gene;gene=iniC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0343
+NC_000962.3 RefSeq CDS 412757 414238 . + 0 ID=cds-NP_214857.1;Parent=gene-Rv0343;Dbxref=Genbank:NP_214857.1,GeneID:886508;Name=NP_214857.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=iniC;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0343;product=iIsoniazid inductible protein IniC;protein_id=NP_214857.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 414381 414941 . - . ID=gene-Rv0344c;Dbxref=GeneID:886512;Name=lpqJ;gbkey=Gene;gene=lpqJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0344c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 414381 414941 . - 0 ID=cds-NP_214858.1;Parent=gene-Rv0344c;Dbxref=Genbank:NP_214858.1,GeneID:886512;Name=NP_214858.1;gbkey=CDS;gene=lpqJ;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0344c;product=lipoprotein LpqJ;protein_id=NP_214858.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 415050 415460 . + . ID=gene-Rv0345;Dbxref=GeneID:886505;Name=Rv0345;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0345
+NC_000962.3 RefSeq CDS 415050 415460 . + 0 ID=cds-NP_214859.1;Parent=gene-Rv0345;Dbxref=Genbank:NP_214859.1,GeneID:886505;Name=NP_214859.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0345;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214859.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 415502 416965 . - . ID=gene-Rv0346c;Dbxref=GeneID:886530;Name=ansP2;gbkey=Gene;gene=ansP2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=aroP2;locus_tag=Rv0346c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 415502 416965 . - 0 ID=cds-YP_177718.1;Parent=gene-Rv0346c;Dbxref=Genbank:YP_177718.1,GeneID:886530;Name=YP_177718.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=ansP2;locus_tag=Rv0346c;product=L-asparagine permease;protein_id=YP_177718.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 417304 418290 . + . ID=gene-Rv0347;Dbxref=GeneID:886501;Name=Rv0347;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0347
+NC_000962.3 RefSeq CDS 417304 418290 . + 0 ID=cds-NP_214861.1;Parent=gene-Rv0347;Dbxref=Genbank:NP_214861.1,GeneID:886501;Name=NP_214861.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0347;product=membrane protein;protein_id=NP_214861.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 418293 418946 . + . ID=gene-Rv0348;Dbxref=GeneID:886500;Name=Rv0348;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0348
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+NC_000962.3 RefSeq gene 423639 424019 . + . ID=gene-Rv0353;Dbxref=GeneID:885929;Name=hspR;gbkey=Gene;gene=hspR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0353
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+NC_000962.3 RefSeq gene 424269 424694 . - . ID=gene-Rv0354c;Dbxref=GeneID:886498;Name=PPE7;gbkey=Gene;gene=PPE7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0354c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 424269 424694 . - 0 ID=cds-YP_177720.1;Parent=gene-Rv0354c;Dbxref=Genbank:YP_177720.1,GeneID:886498;Name=YP_177720.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE7;locus_tag=Rv0354c;product=PPE family protein PPE7;protein_id=YP_177720.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 424777 434679 . - . ID=gene-Rv0355c;Dbxref=GeneID:886491;Name=PPE8;gbkey=Gene;gene=PPE8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0355c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 424777 434679 . - 0 ID=cds-YP_177721.2;Parent=gene-Rv0355c;Dbxref=Genbank:YP_177721.2,GeneID:886491;Name=YP_177721.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE8;locus_tag=Rv0355c;product=PPE family protein PPE8;protein_id=YP_177721.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 434830 435474 . - . ID=gene-Rv0356c;Dbxref=GeneID:886490;Name=Rv0356c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0356c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 434830 435474 . - 0 ID=cds-NP_214870.1;Parent=gene-Rv0356c;Dbxref=Genbank:NP_214870.1,GeneID:886490;Name=NP_214870.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0356c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214870.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 435471 436769 . - . ID=gene-Rv0357c;Dbxref=GeneID:886484;Name=purA;gbkey=Gene;gene=purA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0357c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 435471 436769 . - 0 ID=cds-NP_214871.1;Parent=gene-Rv0357c;Dbxref=Genbank:NP_214871.1,GeneID:886484;Name=NP_214871.1;Note=imp--aspartate ligase (ADSS) (ampsase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=purA;locus_tag=Rv0357c;product=adenylosuccinate synthetase;protein_id=NP_214871.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 436860 437507 . + . ID=gene-Rv0358;Dbxref=GeneID:886493;Name=Rv0358;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0358
+NC_000962.3 RefSeq CDS 436860 437507 . + 0 ID=cds-NP_214872.1;Parent=gene-Rv0358;Dbxref=Genbank:NP_214872.1,GeneID:886493;Name=NP_214872.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0358;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214872.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 437518 438297 . + . ID=gene-Rv0359;Dbxref=GeneID:886482;Name=Rv0359;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0359
+NC_000962.3 RefSeq CDS 437518 438297 . + 0 ID=cds-NP_214873.1;Parent=gene-Rv0359;Dbxref=Genbank:NP_214873.1,GeneID:886482;Name=NP_214873.1;Note=integral membrane protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv0359;product=zinc metalloprotease;protein_id=NP_214873.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 438302 438739 . - . ID=gene-Rv0360c;Dbxref=GeneID:886480;Name=Rv0360c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0360c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 438302 438739 . - 0 ID=cds-NP_214874.1;Parent=gene-Rv0360c;Dbxref=Genbank:NP_214874.1,GeneID:886480;Name=NP_214874.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0360c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214874.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 438822 439649 . + . ID=gene-Rv0361;Dbxref=GeneID:886478;Name=Rv0361;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0361
+NC_000962.3 RefSeq CDS 438822 439649 . + 0 ID=cds-NP_214875.1;Parent=gene-Rv0361;Dbxref=Genbank:NP_214875.1,GeneID:886478;Name=NP_214875.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0361;product=membrane protein;protein_id=NP_214875.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 439871 441253 . + . ID=gene-Rv0362;Dbxref=GeneID:886476;Name=mgtE;gbkey=Gene;gene=mgtE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0362
+NC_000962.3 RefSeq CDS 439871 441253 . + 0 ID=cds-NP_214876.1;Parent=gene-Rv0362;Dbxref=Genbank:NP_214876.1,GeneID:886476;Name=NP_214876.1;gbkey=CDS;gene=mgtE;locus_tag=Rv0362;product=Mg2+ transport transmembrane protein MgtE;protein_id=NP_214876.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 441265 442299 . - . ID=gene-Rv0363c;Dbxref=GeneID:886474;Name=fba;gbkey=Gene;gene=fba;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=fda;locus_tag=Rv0363c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 441265 442299 . - 0 ID=cds-NP_214877.1;Parent=gene-Rv0363c;Dbxref=Genbank:NP_214877.1,GeneID:886474;Name=NP_214877.1;Note=Belongs to class II fructose-bisphosphate aldolase family. Cofactor: zinc.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fba;locus_tag=Rv0363c;product=fructose-bisphosphate aldolase;protein_id=NP_214877.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 442395 443078 . + . ID=gene-Rv0364;Dbxref=GeneID:886473;Name=Rv0364;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0364
+NC_000962.3 RefSeq CDS 442395 443078 . + 0 ID=cds-NP_214878.1;Parent=gene-Rv0364;Dbxref=Genbank:NP_214878.1,GeneID:886473;Name=NP_214878.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0364;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214878.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 443067 444197 . - . ID=gene-Rv0365c;Dbxref=GeneID:886487;Name=Rv0365c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0365c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 443067 444197 . - 0 ID=cds-NP_214879.1;Parent=gene-Rv0365c;Dbxref=Genbank:NP_214879.1,GeneID:886487;Name=NP_214879.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0365c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214879.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 444222 444815 . - . ID=gene-Rv0366c;Dbxref=GeneID:886471;Name=Rv0366c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0366c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 444222 444815 . - 0 ID=cds-NP_214880.1;Parent=gene-Rv0366c;Dbxref=Genbank:NP_214880.1,GeneID:886471;Name=NP_214880.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00850;locus_tag=Rv0366c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214880.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 444844 445233 . - . ID=gene-Rv0367c;Dbxref=GeneID:886468;Name=Rv0367c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0367c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 444844 445233 . - 0 ID=cds-NP_214881.1;Parent=gene-Rv0367c;Dbxref=Genbank:NP_214881.1,GeneID:886468;Name=NP_214881.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0367c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214881.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 445314 446525 . - . ID=gene-Rv0368c;Dbxref=GeneID:886469;Name=Rv0368c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0368c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 445314 446525 . - 0 ID=cds-NP_214882.1;Parent=gene-Rv0368c;Dbxref=Genbank:NP_214882.1,GeneID:886469;Name=NP_214882.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00213;locus_tag=Rv0368c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214882.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 446531 447046 . - . ID=gene-Rv0369c;Dbxref=GeneID:886485;Name=Rv0369c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0369c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 446531 447046 . - 0 ID=cds-NP_214883.1;Parent=gene-Rv0369c;Dbxref=Genbank:NP_214883.1,GeneID:886485;Name=NP_214883.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0369c;product=membrane oxidoreductase;protein_id=NP_214883.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 447147 448043 . - . ID=gene-Rv0370c;Dbxref=GeneID:886465;Name=Rv0370c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0370c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 447147 448043 . - 0 ID=cds-NP_214884.1;Parent=gene-Rv0370c;Dbxref=Genbank:NP_214884.1,GeneID:886465;Name=NP_214884.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0370c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_214884.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 448040 448633 . - . ID=gene-Rv0371c;Dbxref=GeneID:886463;Name=Rv0371c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0371c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 448040 448633 . - 0 ID=cds-NP_214885.1;Parent=gene-Rv0371c;Dbxref=Genbank:NP_214885.1,GeneID:886463;Name=NP_214885.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0371c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214885.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 448630 449385 . - . ID=gene-Rv0372c;Dbxref=GeneID:886460;Name=Rv0372c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0372c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 448630 449385 . - 0 ID=cds-NP_214886.1;Parent=gene-Rv0372c;Dbxref=Genbank:NP_214886.1,GeneID:886460;Name=NP_214886.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0372c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214886.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 449404 451803 . - . ID=gene-Rv0373c;Dbxref=GeneID:886472;Name=Rv0373c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0373c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 449404 451803 . - 0 ID=cds-NP_214887.1;Parent=gene-Rv0373c;Dbxref=Genbank:NP_214887.1,GeneID:886472;Name=NP_214887.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0373c;product=carbon monoxyde dehydrogenase large subunit;protein_id=NP_214887.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 451800 452279 . - . ID=gene-Rv0374c;Dbxref=GeneID:886462;Name=Rv0374c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0374c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 451800 452279 . - 0 ID=cds-NP_214888.1;Parent=gene-Rv0374c;Dbxref=Genbank:NP_214888.1,GeneID:886462;Name=NP_214888.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0374c;product=carbon monoxyde dehydrogenase small subunit;protein_id=NP_214888.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 452294 453154 . - . ID=gene-Rv0375c;Dbxref=GeneID:886456;Name=Rv0375c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0375c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 452294 453154 . - 0 ID=cds-NP_214889.1;Parent=gene-Rv0375c;Dbxref=Genbank:NP_214889.1,GeneID:886456;Name=NP_214889.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0375c;product=carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit;protein_id=NP_214889.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 453230 454372 . - . ID=gene-Rv0376c;Dbxref=GeneID:886454;Name=Rv0376c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0376c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 453230 454372 . - 0 ID=cds-NP_214890.1;Parent=gene-Rv0376c;Dbxref=Genbank:NP_214890.1,GeneID:886454;Name=NP_214890.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0376c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214890.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 454421 455386 . + . ID=gene-Rv0377;Dbxref=GeneID:886452;Name=Rv0377;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0377
+NC_000962.3 RefSeq CDS 454421 455386 . + 0 ID=cds-NP_214891.1;Parent=gene-Rv0377;Dbxref=Genbank:NP_214891.1,GeneID:886452;Name=NP_214891.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv0377;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214891.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 455637 455858 . + . ID=gene-Rv0378;Dbxref=GeneID:886450;Name=Rv0378;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0378
+NC_000962.3 RefSeq CDS 455637 455858 . + 0 ID=cds-NP_214892.1;Parent=gene-Rv0378;Dbxref=Genbank:NP_214892.1,GeneID:886450;Name=NP_214892.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0378;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214892.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 455977 456192 . + . ID=gene-Rv0379;Dbxref=GeneID:886449;Name=secE2;gbkey=Gene;gene=secE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0379
+NC_000962.3 RefSeq CDS 455977 456192 . + 0 ID=cds-YP_177722.1;Parent=gene-Rv0379;Dbxref=Genbank:YP_177722.1,GeneID:886449;Name=YP_177722.1;Note=Could be a part of the prokaryotic protein translocation apparatus which comprise SECA|Rv3240c%2C SECD|Rv2587c%2CSECE|Rv0638%2C SECF|Rv2586c%2C SECG|Rv1440 and SECY|Rv0732.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=secE2;locus_tag=Rv0379;product=protein translocase subunit SecE;protein_id=YP_177722.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 456268 456819 . - . ID=gene-Rv0380c;Dbxref=GeneID:886446;Name=Rv0380c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0380c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 456268 456819 . - 0 ID=cds-NP_214894.1;Parent=gene-Rv0380c;Dbxref=Genbank:NP_214894.1,GeneID:886446;Name=NP_214894.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0380c;product=RNA methyltransferase;protein_id=NP_214894.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 456915 457823 . - . ID=gene-Rv0381c;Dbxref=GeneID:886444;Name=Rv0381c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0381c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 456915 457823 . - 0 ID=cds-NP_214895.1;Parent=gene-Rv0381c;Dbxref=Genbank:NP_214895.1,GeneID:886444;Name=NP_214895.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0381c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214895.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 457841 458380 . - . ID=gene-Rv0382c;Dbxref=GeneID:886443;Name=pyrE;gbkey=Gene;gene=pyrE;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=umpA;locus_tag=Rv0382c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 457841 458380 . - 0 ID=cds-YP_177723.1;Parent=gene-Rv0382c;Dbxref=Genbank:YP_177723.1,GeneID:886443;Name=YP_177723.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pyrE;inference=protein motif:PROSITE:PS00589;locus_tag=Rv0382c;product=orotate phosphoribosyltransferase;protein_id=YP_177723.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 458461 459315 . - . ID=gene-Rv0383c;Dbxref=GeneID:886458;Name=Rv0383c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0383c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 458461 459315 . - 0 ID=cds-NP_214897.1;Parent=gene-Rv0383c;Dbxref=Genbank:NP_214897.1,GeneID:886458;Name=NP_214897.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0383c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214897.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 459456 462002 . - . ID=gene-Rv0384c;Dbxref=GeneID:886440;Name=clpB;gbkey=Gene;gene=clpB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=htpM;locus_tag=Rv0384c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 459456 462002 . - 0 ID=cds-NP_214898.1;Parent=gene-Rv0384c;Dbxref=Genbank:NP_214898.1,GeneID:886440;Name=NP_214898.1;Note=heat shock protein F84.1%3B endopeptidase ATP binding protein ClpB;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=clpB;inference=protein motif:PROSITE:PS00871;locus_tag=Rv0384c;product=chaperone protein ClpB;protein_id=NP_214898.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 462135 463307 . + . ID=gene-Rv0385;Dbxref=GeneID:886441;Name=Rv0385;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0385
+NC_000962.3 RefSeq CDS 462135 463307 . + 0 ID=cds-NP_214899.1;Parent=gene-Rv0385;Dbxref=Genbank:NP_214899.1,GeneID:886441;Name=NP_214899.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0385;product=monooxygenase;protein_id=NP_214899.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 463411 466668 . + . ID=gene-Rv0386;Dbxref=GeneID:886030;Name=Rv0386;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0386
+NC_000962.3 RefSeq CDS 463411 466668 . + 0 ID=cds-NP_214900.1;Parent=gene-Rv0386;Dbxref=Genbank:NP_214900.1,GeneID:886030;Name=NP_214900.1;Note=Belongs to the LuxR/UhpA family of transcriptional regulators.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00622;locus_tag=Rv0386;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214900.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 466672 468001 . - . ID=gene-Rv0387c;Dbxref=GeneID:886436;Name=Rv0387c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv0387c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 468335 469594 . + . ID=gene-Rv0389;Dbxref=GeneID:886032;Name=purT;gbkey=Gene;gene=purT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0389
+NC_000962.3 RefSeq CDS 468335 469594 . + 0 ID=cds-NP_214903.1;Parent=gene-Rv0389;Dbxref=Genbank:NP_214903.1,GeneID:886032;Name=NP_214903.1;Note=gar transformylase 2 (5'-phosphoribosylglycinamide transformylase 2) (formate-dependent gar transformylase). Belongs to the PurK / PurT family. Cofactor: magnesium.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=purT;locus_tag=Rv0389;product=phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurT;protein_id=NP_214903.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 469591 470013 . + . ID=gene-Rv0390;Dbxref=GeneID:886433;Name=Rv0390;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0390
+NC_000962.3 RefSeq CDS 469591 470013 . + 0 ID=cds-NP_214904.1;Parent=gene-Rv0390;Dbxref=Genbank:NP_214904.1,GeneID:886433;Name=NP_214904.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0390;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214904.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 470010 471230 . + . ID=gene-Rv0391;Dbxref=GeneID:886431;Name=metZ;gbkey=Gene;gene=metZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0391
+NC_000962.3 RefSeq CDS 470010 471230 . + 0 ID=cds-NP_214905.1;Parent=gene-Rv0391;Dbxref=Genbank:NP_214905.1,GeneID:886431;Name=NP_214905.1;Note=OSH sulfhydrylase. Belongs to the trans-sulfuration enzymes family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=metZ;locus_tag=Rv0391;product=O-succinylhomoserine sulfhydrylase;protein_id=NP_214905.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 471227 472639 . - . ID=gene-Rv0392c;Dbxref=GeneID:886430;Name=ndhA;gbkey=Gene;gene=ndhA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0392c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 471227 472639 . - 0 ID=cds-NP_214906.1;Parent=gene-Rv0392c;Dbxref=Genbank:NP_214906.1,GeneID:886430;Name=NP_214906.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ndhA;locus_tag=Rv0392c;product=NADH dehydrogenase NdhA;protein_id=NP_214906.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 472781 474106 . + . ID=gene-Rv0393;Dbxref=GeneID:886428;Name=Rv0393;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0393
+NC_000962.3 RefSeq CDS 472781 474106 . + 0 ID=cds-NP_214907.1;Parent=gene-Rv0393;Dbxref=Genbank:NP_214907.1,GeneID:886428;Name=NP_214907.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0393;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214907.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 474122 474841 . - . ID=gene-Rv0394c;Dbxref=GeneID:886435;Name=Rv0394c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0394c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 474122 474841 . - 0 ID=cds-NP_214908.1;Parent=gene-Rv0394c;Dbxref=Genbank:NP_214908.1,GeneID:886435;Name=NP_214908.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0394c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214908.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 474940 475344 . + . ID=gene-Rv0395;Dbxref=GeneID:886425;Name=Rv0395;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0395
+NC_000962.3 RefSeq CDS 474940 475344 . + 0 ID=cds-NP_214909.1;Parent=gene-Rv0395;Dbxref=Genbank:NP_214909.1,GeneID:886425;Name=NP_214909.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0395;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214909.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 475350 475742 . + . ID=gene-Rv0396;Dbxref=GeneID:886423;Name=Rv0396;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0396
+NC_000962.3 RefSeq CDS 475350 475742 . + 0 ID=cds-NP_214910.1;Parent=gene-Rv0396;Dbxref=Genbank:NP_214910.1,GeneID:886423;Name=NP_214910.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0396;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214910.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 475816 476184 . + . ID=gene-Rv0397;Dbxref=GeneID:886421;Name=Rv0397;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0397
+NC_000962.3 RefSeq CDS 475816 476184 . + 0 ID=cds-NP_214911.1;Parent=gene-Rv0397;Dbxref=Genbank:NP_214911.1,GeneID:886421;Name=NP_214911.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0397;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214911.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 476394 476642 . + . ID=gene-Rv0397A;Dbxref=GeneID:14515846;Name=Rv0397A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0397A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 476394 476642 . + 0 ID=cds-YP_004837048.2;Parent=gene-Rv0397A;Dbxref=Genbank:YP_004837048.2,GeneID:14515846;Name=YP_004837048.2;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0397A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_004837048.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 476679 477320 . - . ID=gene-Rv0398c;Dbxref=GeneID:886419;Name=Rv0398c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0398c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 476679 477320 . - 0 ID=cds-NP_214912.1;Parent=gene-Rv0398c;Dbxref=Genbank:NP_214912.1,GeneID:886419;Name=NP_214912.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0398c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214912.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 477327 478556 . - . ID=gene-Rv0399c;Dbxref=GeneID:886416;Name=lpqK;gbkey=Gene;gene=lpqK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0399c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 477327 478556 . - 0 ID=cds-NP_214913.1;Parent=gene-Rv0399c;Dbxref=Genbank:NP_214913.1,GeneID:886416;Name=NP_214913.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqK;locus_tag=Rv0399c;product=lipoprotein LpqK;protein_id=NP_214913.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 478566 479753 . - . ID=gene-Rv0400c;Dbxref=GeneID:886427;Name=fadE7;gbkey=Gene;gene=fadE7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0400c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 478566 479753 . - 0 ID=cds-NP_214914.1;Parent=gene-Rv0400c;Dbxref=Genbank:NP_214914.1,GeneID:886427;Name=NP_214914.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE7;locus_tag=Rv0400c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE7;protein_id=NP_214914.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 479789 480160 . + . ID=gene-Rv0401;Dbxref=GeneID:886438;Name=Rv0401;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0401
+NC_000962.3 RefSeq CDS 479789 480160 . + 0 ID=cds-NP_214915.1;Parent=gene-Rv0401;Dbxref=Genbank:NP_214915.1,GeneID:886438;Name=NP_214915.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0401;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214915.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 480355 483231 . - . ID=gene-Rv0402c;Dbxref=GeneID:886413;Name=mmpL1;gbkey=Gene;gene=mmpL1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0402c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 480355 483231 . - 0 ID=cds-NP_214916.1;Parent=gene-Rv0402c;Dbxref=Genbank:NP_214916.1,GeneID:886413;Name=NP_214916.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpL1;locus_tag=Rv0402c;product=transmembrane transport protein MmpL1;protein_id=NP_214916.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 483228 483656 . - . ID=gene-Rv0403c;Dbxref=GeneID:886411;Name=mmpS1;gbkey=Gene;gene=mmpS1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0403c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 483228 483656 . - 0 ID=cds-NP_214917.1;Parent=gene-Rv0403c;Dbxref=Genbank:NP_214917.1,GeneID:886411;Name=NP_214917.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mmpS1;locus_tag=Rv0403c;product=membrane protein MmpS1;protein_id=NP_214917.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 483977 485734 . + . ID=gene-Rv0404;Dbxref=GeneID:886409;Name=fadD30;gbkey=Gene;gene=fadD30;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0404
+NC_000962.3 RefSeq CDS 483977 485734 . + 0 ID=cds-NP_214918.1;Parent=gene-Rv0404;Dbxref=Genbank:NP_214918.1,GeneID:886409;Name=NP_214918.1;Note=fadD30%2C fatty-acid-AMP synthetase;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:15042094];gbkey=CDS;gene=fadD30;locus_tag=Rv0404;product=long-chain-fatty-acid--AMP ligase FadD30;protein_id=NP_214918.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 485731 489939 . + . ID=gene-Rv0405;Dbxref=GeneID:886407;Name=pks6;gbkey=Gene;gene=pks6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0405
+NC_000962.3 RefSeq CDS 485731 489939 . + 0 ID=cds-NP_214919.1;Parent=gene-Rv0405;Dbxref=Genbank:NP_214919.1,GeneID:886407;Name=NP_214919.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=pks6;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv0405;product=membrane bound polyketide synthase;protein_id=NP_214919.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 489887 490705 . - . ID=gene-Rv0406c;Dbxref=GeneID:886403;Name=Rv0406c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0406c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 489887 490705 . - 0 ID=cds-NP_214920.1;Parent=gene-Rv0406c;Dbxref=Genbank:NP_214920.1,GeneID:886403;Name=NP_214920.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0406c;product=beta lactamase-like protein;protein_id=NP_214920.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 490783 491793 . + . ID=gene-Rv0407;Dbxref=GeneID:886418;Name=fgd1;gbkey=Gene;gene=fgd1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=fgd;locus_tag=Rv0407
+NC_000962.3 RefSeq CDS 490783 491793 . + 0 ID=cds-NP_214921.1;Parent=gene-Rv0407;Dbxref=Genbank:NP_214921.1,GeneID:886418;Name=NP_214921.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:17376702];gbkey=CDS;gene=fgd1;locus_tag=Rv0407;product=F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase;protein_id=NP_214921.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 507758 508555 . - . ID=gene-Rv0422c;Dbxref=GeneID:886375;Name=thiD;gbkey=Gene;gene=thiD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0422c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 508582 510225 . - . ID=gene-Rv0423c;Dbxref=GeneID:886379;Name=thiC;gbkey=Gene;gene=thiC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0423c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 510377 510652 . - . ID=gene-Rv0424c;Dbxref=GeneID:886374;Name=Rv0424c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0424c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 510377 510652 . - 0 ID=cds-NP_214938.1;Parent=gene-Rv0424c;Dbxref=Genbank:NP_214938.1,GeneID:886374;Name=NP_214938.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0424c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214938.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 510702 515321 . - . ID=gene-Rv0425c;Dbxref=GeneID:886373;Name=ctpH;gbkey=Gene;gene=ctpH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0425c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 510702 515321 . - 0 ID=cds-NP_214939.1;Parent=gene-Rv0425c;Dbxref=Genbank:NP_214939.1,GeneID:886373;Name=NP_214939.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=ctpH;locus_tag=Rv0425c;product=metal cation transporting ATPase H;protein_id=NP_214939.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 515373 515816 . - . ID=gene-Rv0426c;Dbxref=GeneID:886387;Name=Rv0426c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0426c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 515373 515816 . - 0 ID=cds-NP_214940.1;Parent=gene-Rv0426c;Dbxref=Genbank:NP_214940.1,GeneID:886387;Name=NP_214940.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0426c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214940.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 516017 516892 . - . ID=gene-Rv0427c;Dbxref=GeneID:886370;Name=xthA;gbkey=Gene;gene=xthA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=xth;locus_tag=Rv0427c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 516017 516892 . - 0 ID=cds-NP_214941.1;Parent=gene-Rv0427c;Dbxref=Genbank:NP_214941.1,GeneID:886370;Name=NP_214941.1;Note=exonuclease III (EXO III) (AP endonuclease VI) Belongs to the AP/EXOA family of DNA repair enzymes.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=xthA;locus_tag=Rv0427c;product=exodeoxyribonuclease III protein XthA;protein_id=NP_214941.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 516895 517803 . - . ID=gene-Rv0428c;Dbxref=GeneID:886368;Name=Rv0428c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0428c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 516895 517803 . - 0 ID=cds-NP_214942.1;Parent=gene-Rv0428c;Dbxref=Genbank:NP_214942.1,GeneID:886368;Name=NP_214942.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0428c;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_214942.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 517803 518396 . - . ID=gene-Rv0429c;Dbxref=GeneID:886366;Name=def;gbkey=Gene;gene=def;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0429c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 517803 518396 . - 0 ID=cds-NP_214943.1;Parent=gene-Rv0429c;Dbxref=Genbank:NP_214943.1,GeneID:886366;Name=NP_214943.1;Note=Cofactor: binds 1 zinc ion.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=def;locus_tag=Rv0429c;product=polypeptide deformylase;protein_id=NP_214943.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 518733 519041 . + . ID=gene-Rv0430;Dbxref=GeneID:886364;Name=Rv0430;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0430
+NC_000962.3 RefSeq CDS 518733 519041 . + 0 ID=cds-NP_214944.1;Parent=gene-Rv0430;Dbxref=Genbank:NP_214944.1,GeneID:886364;Name=NP_214944.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0430;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214944.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 519073 519567 . + . ID=gene-Rv0431;Dbxref=GeneID:886362;Name=Rv0431;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0431
+NC_000962.3 RefSeq CDS 519073 519567 . + 0 ID=cds-NP_214945.1;Parent=gene-Rv0431;Dbxref=Genbank:NP_214945.1,GeneID:886362;Name=NP_214945.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0431;product=tuberculin-like peptide;protein_id=NP_214945.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 519600 520322 . + . ID=gene-Rv0432;Dbxref=GeneID:886358;Name=sodC;gbkey=Gene;gene=sodC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0432
+NC_000962.3 RefSeq CDS 519600 520322 . + 0 ID=cds-NP_214946.1;Parent=gene-Rv0432;Dbxref=Genbank:NP_214946.1,GeneID:886358;Name=NP_214946.1;Note=Cu-Zn;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15155722];gbkey=CDS;gene=sodC;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0432;product=superoxide dismutase;protein_id=NP_214946.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 520324 521454 . + . ID=gene-Rv0433;Dbxref=GeneID:886356;Name=Rv0433;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0433
+NC_000962.3 RefSeq CDS 520324 521454 . + 0 ID=cds-NP_214947.1;Parent=gene-Rv0433;Dbxref=Genbank:NP_214947.1,GeneID:886356;Name=NP_214947.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0433;product=carboxylate-amine ligase;protein_id=NP_214947.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 521514 522167 . + . ID=gene-Rv0434;Dbxref=GeneID:886360;Name=Rv0434;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0434
+NC_000962.3 RefSeq CDS 521514 522167 . + 0 ID=cds-NP_214948.1;Parent=gene-Rv0434;Dbxref=Genbank:NP_214948.1,GeneID:886360;Name=NP_214948.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0434;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214948.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 522347 524533 . - . ID=gene-Rv0435c;Dbxref=GeneID:886352;Name=Rv0435c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0435c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 522347 524533 . - 0 ID=cds-NP_214949.1;Parent=gene-Rv0435c;Dbxref=Genbank:NP_214949.1,GeneID:886352;Name=NP_214949.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00674;locus_tag=Rv0435c;product=ATPase;protein_id=NP_214949.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 524530 525390 . - . ID=gene-Rv0436c;Dbxref=GeneID:886385;Name=pssA;gbkey=Gene;gene=pssA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0436c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 524530 525390 . - 0 ID=cds-NP_214950.1;Parent=gene-Rv0436c;Dbxref=Genbank:NP_214950.1,GeneID:886385;Name=NP_214950.1;Note=PS synthase (phosphatidylserine synthase). Belongs to the CDP-alcohol phosphatidyltransferase class-I family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=pssA;inference=protein motif:PROSITE:PS00379;locus_tag=Rv0436c;product=CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase;protein_id=NP_214950.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 525387 526082 . - . ID=gene-Rv0437c;Dbxref=GeneID:886350;Name=psd;gbkey=Gene;gene=psd;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0437c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 525387 526082 . - 0 ID=cds-NP_214951.1;Parent=gene-Rv0437c;Dbxref=Genbank:NP_214951.1,GeneID:886350;Name=NP_214951.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=psd;locus_tag=Rv0437c;product=phosphatidylserine decarboxylase;protein_id=NP_214951.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 526143 527360 . - . ID=gene-Rv0438c;Dbxref=GeneID:886348;Name=moeA2;gbkey=Gene;gene=moeA2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moeA3;locus_tag=Rv0438c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 526143 527360 . - 0 ID=cds-YP_177725.1;Parent=gene-Rv0438c;Dbxref=Genbank:YP_177725.1,GeneID:886348;Name=YP_177725.1;Note=molybdopterin biosynthesis protein MoeA;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=moeA2;locus_tag=Rv0438c;product=molybdopterin molybdenumtransferase;protein_id=YP_177725.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 527379 528314 . - . ID=gene-Rv0439c;Dbxref=GeneID:886342;Name=Rv0439c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0439c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 528608 530230 . + . ID=gene-Rv0440;Dbxref=GeneID:886354;Name=groEL2;gbkey=Gene;gene=groEL2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=groEL-2,groL2,hsp60,hsp65;locus_tag=Rv0440
+NC_000962.3 RefSeq CDS 528608 530230 . + 0 ID=cds-NP_214954.1;Parent=gene-Rv0440;Dbxref=Genbank:NP_214954.1,GeneID:886354;Name=NP_214954.1;Note=60 kDa chaperonin 2 GroEL2 (protein CPN60-2) (GroEL protein 2) (65 kDa antigen) (heat shock protein 65) (cell wall protein A) (antigen A). Purified 65 kDa antigen can elicit a strong delayed-type hypersensitivity reaction in experimental animals infected with M. tuberculosis. This protein is one of the major immunoreactive proteins of the mycobacteria. This antigen contains epitopes that are common to various species of mycobacteria.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=groEL2;inference=protein motif:PROSITE:PS00296;locus_tag=Rv0440;product=molecular chaperone GroEL;protein_id=NP_214954.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 530296 530724 . - . ID=gene-Rv0441c;Dbxref=GeneID:886344;Name=Rv0441c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0441c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 530296 530724 . - 0 ID=cds-NP_214955.1;Parent=gene-Rv0441c;Dbxref=Genbank:NP_214955.1,GeneID:886344;Name=NP_214955.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0441c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214955.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 530751 532214 . - . ID=gene-Rv0442c;Dbxref=GeneID:886340;Name=PPE10;gbkey=Gene;gene=PPE10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0442c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 530751 532214 . - 0 ID=cds-YP_177726.2;Parent=gene-Rv0442c;Dbxref=Genbank:YP_177726.2,GeneID:886340;Name=YP_177726.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE10;locus_tag=Rv0442c;product=PPE family protein PPE10;protein_id=YP_177726.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 532396 532911 . + . ID=gene-Rv0443;Dbxref=GeneID:886336;Name=Rv0443;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0443
+NC_000962.3 RefSeq CDS 532396 532911 . + 0 ID=cds-NP_214957.1;Parent=gene-Rv0443;Dbxref=Genbank:NP_214957.1,GeneID:886336;Name=NP_214957.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0443;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214957.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 533091 533789 . - . ID=gene-Rv0444c;Dbxref=GeneID:886346;Name=rskA;gbkey=Gene;gene=rskA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0444c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 533091 533789 . - 0 ID=cds-NP_214958.1;Parent=gene-Rv0444c;Dbxref=Genbank:NP_214958.1,GeneID:886346;Name=NP_214958.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rskA;locus_tag=Rv0444c;product=anti-sigma-K factor RskA;protein_id=NP_214958.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 533833 534396 . - . ID=gene-Rv0445c;Dbxref=GeneID:886334;Name=sigK;gbkey=Gene;gene=sigK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0445c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 533833 534396 . - 0 ID=cds-NP_214959.1;Parent=gene-Rv0445c;Dbxref=Genbank:NP_214959.1,GeneID:886334;Name=NP_214959.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sigK;locus_tag=Rv0445c;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigK;protein_id=NP_214959.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 534445 535215 . - . ID=gene-Rv0446c;Dbxref=GeneID:886332;Name=Rv0446c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0446c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 534445 535215 . - 0 ID=cds-NP_214960.1;Parent=gene-Rv0446c;Dbxref=Genbank:NP_214960.1,GeneID:886332;Name=NP_214960.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0446c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214960.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 535224 536507 . - . ID=gene-Rv0447c;Dbxref=GeneID:886330;Name=ufaA1;gbkey=Gene;gene=ufaA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0447c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 535224 536507 . - 0 ID=cds-NP_214961.1;Parent=gene-Rv0447c;Dbxref=Genbank:NP_214961.1,GeneID:886330;Name=NP_214961.1;gbkey=CDS;gene=ufaA1;locus_tag=Rv0447c;product=cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase UfaA;protein_id=NP_214961.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 536504 537169 . - . ID=gene-Rv0448c;Dbxref=GeneID:886328;Name=Rv0448c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0448c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 536504 537169 . - 0 ID=cds-NP_214962.1;Parent=gene-Rv0448c;Dbxref=Genbank:NP_214962.1,GeneID:886328;Name=NP_214962.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0448c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214962.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 537229 538548 . - . ID=gene-Rv0449c;Dbxref=GeneID:886326;Name=Rv0449c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0449c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 537229 538548 . - 0 ID=cds-NP_214963.1;Parent=gene-Rv0449c;Dbxref=Genbank:NP_214963.1,GeneID:886326;Name=NP_214963.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0449c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214963.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 538588 541491 . - . ID=gene-Rv0450c;Dbxref=GeneID:886323;Name=mmpL4;gbkey=Gene;gene=mmpL4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0450c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 538588 541491 . - 0 ID=cds-NP_214964.1;Parent=gene-Rv0450c;Dbxref=Genbank:NP_214964.1,GeneID:886323;Name=NP_214964.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpL4;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv0450c;product=transmembrane transport protein MmpL4;protein_id=NP_214964.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 541488 541910 . - . ID=gene-Rv0451c;Dbxref=GeneID:886321;Name=mmpS4;gbkey=Gene;gene=mmpS4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0451c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 541488 541910 . - 0 ID=cds-NP_214965.1;Parent=gene-Rv0451c;Dbxref=Genbank:NP_214965.1,GeneID:886321;Name=NP_214965.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mmpS4;locus_tag=Rv0451c;product=membrane protein MmpS4;protein_id=NP_214965.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 542142 542852 . + . ID=gene-Rv0452;Dbxref=GeneID:886319;Name=Rv0452;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0452
+NC_000962.3 RefSeq CDS 542142 542852 . + 0 ID=cds-NP_214966.1;Parent=gene-Rv0452;Dbxref=Genbank:NP_214966.1,GeneID:886319;Name=NP_214966.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0452;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214966.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 543174 544730 . + . ID=gene-Rv0453;Dbxref=GeneID:886317;Name=PPE11;gbkey=Gene;gene=PPE11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0453
+NC_000962.3 RefSeq CDS 543174 544730 . + 0 ID=cds-YP_177727.1;Parent=gene-Rv0453;Dbxref=Genbank:YP_177727.1,GeneID:886317;Name=YP_177727.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=PPE11;locus_tag=Rv0453;product=PPE family protein PPE11;protein_id=YP_177727.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 545375 545821 . - . ID=gene-Rv0455c;Dbxref=GeneID:886314;Name=Rv0455c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0455c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 545375 545821 . - 0 ID=cds-NP_214969.1;Parent=gene-Rv0455c;Dbxref=Genbank:NP_214969.1,GeneID:886314;Name=NP_214969.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0455c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214969.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 545889 546803 . - . ID=gene-Rv0456c;Dbxref=GeneID:886312;Name=echA2;gbkey=Gene;gene=echA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0456c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 545889 546803 . - 0 ID=cds-NP_214970.1;Parent=gene-Rv0456c;Dbxref=Genbank:NP_214970.1,GeneID:886312;Name=NP_214970.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=echA2;locus_tag=Rv0456c;product=enoyl-CoA hydratase EchA2;protein_id=NP_214970.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 547076 547357 . - . ID=gene-Rv0456A;Dbxref=GeneID:3205039;Name=mazF1;gbkey=Gene;gene=mazF1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt2;locus_tag=Rv0456A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 547076 547357 . - 0 ID=cds-YP_177621.1;Parent=gene-Rv0456A;Dbxref=Genbank:YP_177621.1,GeneID:3205039;Name=YP_177621.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0456B;gbkey=CDS;gene=mazF1;locus_tag=Rv0456A;product=toxin MazF1;protein_id=YP_177621.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 547344 547517 . - . ID=gene-Rv0456B;Dbxref=GeneID:14515889;Name=mazE1;gbkey=Gene;gene=mazE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0456B
+NC_000962.3 RefSeq CDS 547344 547517 . - 0 ID=cds-YP_007409102.1;Parent=gene-Rv0456B;Dbxref=Genbank:YP_007409102.1,GeneID:14515889;Name=YP_007409102.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0456A;gbkey=CDS;gene=mazE1;locus_tag=Rv0456B;product=antitoxin MazE1;protein_id=YP_007409102.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 547488 547517 . - . ID=id-Rv0456B;Dbxref=GeneID:14515889;Note=3 copies of a 10 bp near-perfect direct repeat%2CATTACTACCTATTACTACGTATTACTATCT;gbkey=repeat_region;gene=mazE1;locus_tag=Rv0456B
+NC_000962.3 RefSeq gene 547586 549607 . - . ID=gene-Rv0457c;Dbxref=GeneID:886310;Name=Rv0457c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0457c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 547586 549607 . - 0 ID=cds-NP_214971.1;Parent=gene-Rv0457c;Dbxref=Genbank:NP_214971.1,GeneID:886310;Name=NP_214971.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0457c;product=peptidase;protein_id=NP_214971.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 549675 551198 . + . ID=gene-Rv0458;Dbxref=GeneID:886306;Name=Rv0458;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0458
+NC_000962.3 RefSeq CDS 549675 551198 . + 0 ID=cds-NP_214972.1;Parent=gene-Rv0458;Dbxref=Genbank:NP_214972.1,GeneID:886306;Name=NP_214972.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0458;product=aldehyde dehydrogenase;protein_id=NP_214972.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 551198 551689 . + . ID=gene-Rv0459;Dbxref=GeneID:886372;Name=Rv0459;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0459
+NC_000962.3 RefSeq CDS 551198 551689 . + 0 ID=cds-NP_214973.1;Parent=gene-Rv0459;Dbxref=Genbank:NP_214973.1,GeneID:886372;Name=NP_214973.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0459;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214973.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 551749 551988 . + . ID=gene-Rv0460;Dbxref=GeneID:886304;Name=Rv0460;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0460
+NC_000962.3 RefSeq CDS 551749 551988 . + 0 ID=cds-NP_214974.1;Parent=gene-Rv0460;Dbxref=Genbank:NP_214974.1,GeneID:886304;Name=NP_214974.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0460;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214974.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 552026 552550 . + . ID=gene-Rv0461;Dbxref=GeneID:886302;Name=Rv0461;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0461
+NC_000962.3 RefSeq CDS 552026 552550 . + 0 ID=cds-NP_214975.1;Parent=gene-Rv0461;Dbxref=Genbank:NP_214975.1,GeneID:886302;Name=NP_214975.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0461;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214975.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 552614 554008 . + . ID=gene-Rv0462;Dbxref=GeneID:886300;Name=lpdC;gbkey=Gene;gene=lpdC;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=CIP50,TB49.2;locus_tag=Rv0462
+NC_000962.3 RefSeq CDS 552614 554008 . + 0 ID=cds-NP_214976.1;Parent=gene-Rv0462;Dbxref=Genbank:NP_214976.1,GeneID:886300;Name=NP_214976.1;Note=Belongs to the pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductases class-I;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=lpdC;locus_tag=Rv0462;product=dihydrolipoamide dehydrogenase;protein_id=NP_214976.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 554016 554309 . + . ID=gene-Rv0463;Dbxref=GeneID:886299;Name=Rv0463;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0463
+NC_000962.3 RefSeq CDS 554016 554309 . + 0 ID=cds-NP_214977.1;Parent=gene-Rv0463;Dbxref=Genbank:NP_214977.1,GeneID:886299;Name=NP_214977.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0463;product=membrane protein;protein_id=NP_214977.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 554313 554885 . - . ID=gene-Rv0464c;Dbxref=GeneID:886296;Name=Rv0464c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0464c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 554313 554885 . - 0 ID=cds-NP_214978.1;Parent=gene-Rv0464c;Dbxref=Genbank:NP_214978.1,GeneID:886296;Name=NP_214978.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0464c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214978.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 554882 556306 . - . ID=gene-Rv0465c;Dbxref=GeneID:886320;Name=Rv0465c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0465c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 554882 556306 . - 0 ID=cds-NP_214979.1;Parent=gene-Rv0465c;Dbxref=Genbank:NP_214979.1,GeneID:886320;Name=NP_214979.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0465c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214979.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 559888 560748 . + . ID=gene-Rv0469;Dbxref=GeneID:886286;Name=umaA;gbkey=Gene;gene=umaA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=umaA1;locus_tag=Rv0469
+NC_000962.3 RefSeq CDS 559888 560748 . + 0 ID=cds-YP_177729.1;Parent=gene-Rv0469;Dbxref=Genbank:YP_177729.1,GeneID:886286;Name=YP_177729.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:7604045];gbkey=CDS;gene=umaA;locus_tag=Rv0469;product=mycolic acid synthase UmaA;protein_id=YP_177729.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 560848 561711 . - . ID=gene-Rv0470c;Dbxref=GeneID:886284;Name=pcaA;gbkey=Gene;gene=pcaA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=umaA2;locus_tag=Rv0470c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 560848 561711 . - 0 ID=cds-YP_177730.1;Parent=gene-Rv0470c;Dbxref=Genbank:YP_177730.1,GeneID:886284;Name=YP_177730.1;Note=mycolic acid synthase PcaA;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pcaA;locus_tag=Rv0470c;product=cyclopropane mycolic acid synthase;protein_id=YP_177730.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 561854 562294 . - . ID=gene-Rv0470A;Dbxref=GeneID:3205059;Name=Rv0470A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0470A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 561854 562294 . - 0 ID=cds-YP_177622.1;Parent=gene-Rv0470A;Dbxref=Genbank:YP_177622.1,GeneID:3205059;Name=YP_177622.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0470A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177622.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 562225 562713 . - . ID=gene-Rv0471c;Dbxref=GeneID:886280;Name=Rv0471c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0471c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 562225 562713 . - 0 ID=cds-NP_214985.1;Parent=gene-Rv0471c;Dbxref=Genbank:NP_214985.1,GeneID:886280;Name=NP_214985.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0471c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214985.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 562723 563427 . - . ID=gene-Rv0472c;Dbxref=GeneID:886308;Name=Rv0472c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0472c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 562723 563427 . - 0 ID=cds-NP_214986.1;Parent=gene-Rv0472c;Dbxref=Genbank:NP_214986.1,GeneID:886308;Name=NP_214986.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0472c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214986.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 563564 564934 . + . ID=gene-Rv0473;Dbxref=GeneID:886279;Name=Rv0473;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0473
+NC_000962.3 RefSeq CDS 563564 564934 . + 0 ID=cds-NP_214987.2;Parent=gene-Rv0473;Dbxref=Genbank:NP_214987.2,GeneID:886279;Name=NP_214987.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0473;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214987.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 565021 565443 . + . ID=gene-Rv0474;Dbxref=GeneID:886276;Name=Rv0474;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0474
+NC_000962.3 RefSeq CDS 565021 565443 . + 0 ID=cds-NP_214988.1;Parent=gene-Rv0474;Dbxref=Genbank:NP_214988.1,GeneID:886276;Name=NP_214988.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0474;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_214988.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 565797 566396 . + . ID=gene-Rv0475;Dbxref=GeneID:886272;Name=hbhA;gbkey=Gene;gene=hbhA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0475
+NC_000962.3 RefSeq CDS 565797 566396 . + 0 ID=cds-NP_214989.1;Parent=gene-Rv0475;Dbxref=Genbank:NP_214989.1,GeneID:886272;Name=NP_214989.1;Note=iron-regulated adhesin A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hbhA;locus_tag=Rv0475;product=heparin binding hemagglutinin HbhA;protein_id=NP_214989.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 566508 566771 . + . ID=gene-Rv0476;Dbxref=GeneID:886282;Name=Rv0476;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0476
+NC_000962.3 RefSeq CDS 566508 566771 . + 0 ID=cds-NP_214990.1;Parent=gene-Rv0476;Dbxref=Genbank:NP_214990.1,GeneID:886282;Name=NP_214990.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv0476;product=transmembrane protein;protein_id=NP_214990.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 566776 567222 . + . ID=gene-Rv0477;Dbxref=GeneID:886273;Name=Rv0477;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0477
+NC_000962.3 RefSeq CDS 566776 567222 . + 0 ID=cds-NP_214991.1;Parent=gene-Rv0477;Dbxref=Genbank:NP_214991.1,GeneID:886273;Name=NP_214991.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0477;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214991.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 567222 567896 . + . ID=gene-Rv0478;Dbxref=GeneID:888425;Name=deoC;gbkey=Gene;gene=deoC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0478
+NC_000962.3 RefSeq CDS 567222 567896 . + 0 ID=cds-NP_214992.1;Parent=gene-Rv0478;Dbxref=Genbank:NP_214992.1,GeneID:888425;Name=NP_214992.1;Note=phosphodeoxyriboaldolase (deoxyriboaldolase) Belongs to the DEOC/FBAB family of aldolases%2C DEOC subfamily.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=deoC;locus_tag=Rv0478;product=2-deoxyribose-5-phosphate aldolase;protein_id=NP_214992.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 567921 568967 . - . ID=gene-Rv0479c;Dbxref=GeneID:885535;Name=Rv0479c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0479c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 567921 568967 . - 0 ID=cds-NP_214993.1;Parent=gene-Rv0479c;Dbxref=Genbank:NP_214993.1,GeneID:885535;Name=NP_214993.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0479c;product=membrane protein;protein_id=NP_214993.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 568964 569806 . - . ID=gene-Rv0480c;Dbxref=GeneID:887163;Name=Rv0480c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0480c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 568964 569806 . - 0 ID=cds-NP_214994.2;Parent=gene-Rv0480c;Dbxref=Genbank:NP_214994.2,GeneID:887163;Name=NP_214994.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0480c;product=amidohydrolase;protein_id=NP_214994.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 569988 570512 . - . ID=gene-Rv0481c;Dbxref=GeneID:887161;Name=Rv0481c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0481c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 569988 570512 . - 0 ID=cds-NP_214995.1;Parent=gene-Rv0481c;Dbxref=Genbank:NP_214995.1,GeneID:887161;Name=NP_214995.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0481c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_214995.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 570539 571648 . + . ID=gene-Rv0482;Dbxref=GeneID:887169;Name=murB;gbkey=Gene;gene=murB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0482
+NC_000962.3 RefSeq CDS 570539 571648 . + 0 ID=cds-NP_214996.1;Parent=gene-Rv0482;Dbxref=Genbank:NP_214996.1,GeneID:887169;Name=NP_214996.1;Note=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase Cofactor: FAD.;gbkey=CDS;gene=murB;locus_tag=Rv0482;product=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase;protein_id=NP_214996.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 571710 573065 . + . ID=gene-Rv0483;Dbxref=GeneID:887167;Name=lprQ;gbkey=Gene;gene=lprQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0483
+NC_000962.3 RefSeq CDS 571710 573065 . + 0 ID=cds-NP_214997.1;Parent=gene-Rv0483;Dbxref=Genbank:NP_214997.1,GeneID:887167;Name=NP_214997.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lprQ;locus_tag=Rv0483;product=lipoprotein LprQ;protein_id=NP_214997.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 573046 573801 . - . ID=gene-Rv0484c;Dbxref=GeneID:887158;Name=Rv0484c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0484c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 573046 573801 . - 0 ID=cds-NP_214998.1;Parent=gene-Rv0484c;Dbxref=Genbank:NP_214998.1,GeneID:887158;Name=NP_214998.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0484c;product=short-chain type oxidoreductase;protein_id=NP_214998.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 573984 575300 . + . ID=gene-Rv0485;Dbxref=GeneID:887170;Name=Rv0485;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0485
+NC_000962.3 RefSeq CDS 573984 575300 . + 0 ID=cds-NP_214999.1;Parent=gene-Rv0485;Dbxref=Genbank:NP_214999.1,GeneID:887170;Name=NP_214999.1;Note=NAGC/XYLR repressor family;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0485;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_214999.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 575033 575069 . + . ID=id-Rv0485;Dbxref=GeneID:887170;Note=mcr19%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C cloned from M. bovis BCG~~Pasteur%3B ends not mapped%2C 66-82 nt band detected by Northern blot in M. bovis BCG Pasteur.;gbkey=misc_feature;locus_tag=Rv0485
+NC_000962.3 RefSeq gene 575348 576790 . + . ID=gene-Rv0486;Dbxref=GeneID:887160;Name=mshA;gbkey=Gene;gene=mshA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0486
+NC_000962.3 RefSeq CDS 575348 576790 . + 0 ID=cds-NP_215000.1;Parent=gene-Rv0486;Dbxref=Genbank:NP_215000.1,GeneID:887160;Name=NP_215000.1;Note=glycosyltransferase MshA;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis[PMID:12754249];gbkey=CDS;gene=mshA;inference=protein motif:PROSITE:PS00039;locus_tag=Rv0486;product=D-inositol 3-phosphate glycosyltransferase;protein_id=NP_215000.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 576787 577338 . + . ID=gene-Rv0487;Dbxref=GeneID:887162;Name=Rv0487;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0487
+NC_000962.3 RefSeq CDS 576787 577338 . + 0 ID=cds-NP_215001.1;Parent=gene-Rv0487;Dbxref=Genbank:NP_215001.1,GeneID:887162;Name=NP_215001.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0487;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215001.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 577664 578269 . + . ID=gene-Rv0488;Dbxref=GeneID:887171;Name=Rv0488;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0488
+NC_000962.3 RefSeq CDS 577664 578269 . + 0 ID=cds-NP_215002.1;Parent=gene-Rv0488;Dbxref=Genbank:NP_215002.1,GeneID:887171;Name=NP_215002.1;Note=integral membrane protein;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0488;product=amino acid transporter;protein_id=NP_215002.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 578426 579175 . + . ID=gene-Rv0489;Dbxref=GeneID:887183;Name=gpm1;gbkey=Gene;gene=gpm1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gpm;locus_tag=Rv0489
+NC_000962.3 RefSeq CDS 578426 579175 . + 0 ID=cds-YP_177731.1;Parent=gene-Rv0489;Dbxref=Genbank:YP_177731.1,GeneID:887183;Name=YP_177731.1;Note=phosphoglyceromutase (PGAM) (BPG-dependent PGAM);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gpm1;inference=protein motif:PROSITE:PS00175;locus_tag=Rv0489;product=2%2C3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase;protein_id=YP_177731.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 579349 580581 . + . ID=gene-Rv0490;Dbxref=GeneID:887185;Name=senX3;gbkey=Gene;gene=senX3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0490
+NC_000962.3 RefSeq CDS 579349 580581 . + 0 ID=cds-NP_215004.1;Parent=gene-Rv0490;Dbxref=Genbank:NP_215004.1,GeneID:887185;Name=NP_215004.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:11101667];gbkey=CDS;gene=senX3;locus_tag=Rv0490;product=two component sensor histidine kinase SenX3;protein_id=NP_215004.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 580578 580654 . + . ID=id-NC_000962.3:580578..580654;Note=77 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I (see Supply et al.%2C 1997);gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 580655 580731 . + . ID=id-NC_000962.3:580655..580731;Note=77 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I (see Supply et al.%2C 1997);gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 580732 580808 . + . ID=id-NC_000962.3:580732..580808;Note=77 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I (see Supply et al.%2C 1997);gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 580809 581492 . + . ID=gene-Rv0491;Dbxref=GeneID:887195;Name=regX3;gbkey=Gene;gene=regX3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0491
+NC_000962.3 RefSeq CDS 580809 581492 . + 0 ID=cds-NP_215005.1;Parent=gene-Rv0491;Dbxref=Genbank:NP_215005.1,GeneID:887195;Name=NP_215005.1;Note=response regulator protein (sensory transduction protein);experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:11101667];gbkey=CDS;gene=regX3;locus_tag=Rv0491;product=two component sensory transduction protein RegX;protein_id=NP_215005.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 588325 589167 . + . ID=gene-Rv0498;Dbxref=GeneID:887238;Name=Rv0498;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0498
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+NC_000962.3 RefSeq gene 589183 590058 . + . ID=gene-Rv0499;Dbxref=GeneID:887243;Name=Rv0499;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0499
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+NC_000962.3 RefSeq gene 590083 590970 . + . ID=gene-Rv0500;Dbxref=GeneID:887256;Name=proC;gbkey=Gene;gene=proC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0500
+NC_000962.3 RefSeq CDS 590083 590970 . + 0 ID=cds-NP_215014.1;Parent=gene-Rv0500;Dbxref=Genbank:NP_215014.1,GeneID:887256;Name=NP_215014.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=proC;locus_tag=Rv0500;product=pyrroline-5-carboxylate reductase;protein_id=NP_215014.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 591111 591347 . + . ID=gene-Rv0500A;Dbxref=GeneID:3205035;Name=Rv0500A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0500A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 591111 591347 . + 0 ID=cds-YP_177624.1;Parent=gene-Rv0500A;Dbxref=Genbank:YP_177624.1,GeneID:3205035;Name=YP_177624.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0500A;product=DNA-binding protein;protein_id=YP_177624.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 591654 592784 . + . ID=gene-Rv0501;Dbxref=GeneID:887228;Name=galE2;gbkey=Gene;gene=galE2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=galE1;locus_tag=Rv0501
+NC_000962.3 RefSeq CDS 591654 592784 . + 0 ID=cds-NP_215050.2;Parent=gene-Rv0501;Dbxref=Genbank:NP_215050.2,GeneID:887228;Name=NP_215050.2;Note=galactowaldenase (UDP-galactose 4-epimerase) (uridine diphosphate galactose 4-epimerase) (uridine diphospho-galactose 4-epimerase) Cofactor: NAD;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=galE2;locus_tag=Rv0501;product=UDP-glucose 4-epimerase GalE;protein_id=NP_215050.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 592791 593867 . + . ID=gene-Rv0502;Dbxref=GeneID:887260;Name=Rv0502;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0502
+NC_000962.3 RefSeq CDS 592791 593867 . + 0 ID=cds-NP_215016.1;Parent=gene-Rv0502;Dbxref=Genbank:NP_215016.1,GeneID:887260;Name=NP_215016.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0502;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215016.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 593871 594779 . - . ID=gene-Rv0503c;Dbxref=GeneID:887264;Name=cmaA2;gbkey=Gene;gene=cmaA2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cma2;locus_tag=Rv0503c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 593871 594779 . - 0 ID=cds-NP_215017.1;Parent=gene-Rv0503c;Dbxref=Genbank:NP_215017.1,GeneID:887264;Name=NP_215017.1;Note=cyclopropane fatty acid synthase (CFA synthase) (cyclopropane mycolic acid synthase 2) (mycolic acid trans-cyclopropane synthetase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cmaA2;locus_tag=Rv0503c;product=cyclopropane mycolic acid synthase;protein_id=NP_215017.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 594802 595302 . - . ID=gene-Rv0504c;Dbxref=GeneID:887268;Name=Rv0504c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0504c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 594802 595302 . - 0 ID=cds-NP_215018.1;Parent=gene-Rv0504c;Dbxref=Genbank:NP_215018.1,GeneID:887268;Name=NP_215018.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0504c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215018.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 595464 596585 . - . ID=gene-Rv0505c;Dbxref=GeneID:887270;Name=serB1;gbkey=Gene;gene=serB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=serB;locus_tag=Rv0505c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 595464 596585 . - 0 ID=cds-YP_177732.1;Parent=gene-Rv0505c;Dbxref=Genbank:YP_177732.1,GeneID:887270;Name=YP_177732.1;Note=PSP (O-phosphoserine phosphohydrolase) (pspase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=serB1;locus_tag=Rv0505c;product=phosphoserine phosphatase SerB;protein_id=YP_177732.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 596759 597202 . + . ID=gene-Rv0506;Dbxref=GeneID:887279;Name=mmpS2;gbkey=Gene;gene=mmpS2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0506
+NC_000962.3 RefSeq CDS 596759 597202 . + 0 ID=cds-NP_215020.1;Parent=gene-Rv0506;Dbxref=Genbank:NP_215020.1,GeneID:887279;Name=NP_215020.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpS2;locus_tag=Rv0506;product=membrane protein MmpS2;protein_id=NP_215020.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 597199 600105 . + . ID=gene-Rv0507;Dbxref=GeneID:887248;Name=mmpL2;gbkey=Gene;gene=mmpL2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0507
+NC_000962.3 RefSeq CDS 597199 600105 . + 0 ID=cds-NP_215021.1;Parent=gene-Rv0507;Dbxref=Genbank:NP_215021.1,GeneID:887248;Name=NP_215021.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mmpL2;locus_tag=Rv0507;product=transmembrane transport protein MmpL2;protein_id=NP_215021.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 600098 600391 . + . ID=gene-Rv0508;Dbxref=GeneID:887301;Name=Rv0508;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0508
+NC_000962.3 RefSeq CDS 600098 600391 . + 0 ID=cds-NP_215022.1;Parent=gene-Rv0508;Dbxref=Genbank:NP_215022.1,GeneID:887301;Name=NP_215022.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0508;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215022.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 600441 601847 . + . ID=gene-Rv0509;Dbxref=GeneID:887292;Name=hemA;gbkey=Gene;gene=hemA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0509
+NC_000962.3 RefSeq CDS 600441 601847 . + 0 ID=cds-NP_215023.1;Parent=gene-Rv0509;Dbxref=Genbank:NP_215023.1,GeneID:887292;Name=NP_215023.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hemA;inference=protein motif:PROSITE:PS00747;locus_tag=Rv0509;product=glutamyl-tRNA reductase;protein_id=NP_215023.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 601857 602786 . + . ID=gene-Rv0510;Dbxref=GeneID:887306;Name=hemC;gbkey=Gene;gene=hemC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0510
+NC_000962.3 RefSeq CDS 601857 602786 . + 0 ID=cds-NP_215024.1;Parent=gene-Rv0510;Dbxref=Genbank:NP_215024.1,GeneID:887306;Name=NP_215024.1;Note=PBG (hydroxymethylbilane synthase) (HMBS) (pre-uroporphyrinogen synthase) Cofactor: covalently binds a dipyrromethane cofactor to which the porphobilinogen subunits are added.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=hemC;locus_tag=Rv0510;product=porphobilinogen deaminase;protein_id=NP_215024.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 602819 604516 . + . ID=gene-Rv0511;Dbxref=GeneID:887280;Name=hemD;gbkey=Gene;gene=hemD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cysG;locus_tag=Rv0511
+NC_000962.3 RefSeq CDS 602819 604516 . + 0 ID=cds-YP_177733.1;Parent=gene-Rv0511;Dbxref=Genbank:YP_177733.1,GeneID:887280;Name=YP_177733.1;Note=alternate gene name: cysG%2C uroporphyrinogen III methylase (urogen III methylase) (SUMT) (urogen III methylase) (UROM);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hemD;locus_tag=Rv0511;product=uroporphyrin-III C-methyltransferase;protein_id=YP_177733.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 604602 605591 . + . ID=gene-Rv0512;Dbxref=GeneID:887312;Name=hemB;gbkey=Gene;gene=hemB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0512
+NC_000962.3 RefSeq CDS 604602 605591 . + 0 ID=cds-NP_215026.1;Parent=gene-Rv0512;Dbxref=Genbank:NP_215026.1,GeneID:887312;Name=NP_215026.1;Note=porphobilinogen synthase (ALAD) (ALADH) Belongs to the ALADH family. Cofactor: zinc.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hemB;inference=protein motif:PROSITE:PS00169;locus_tag=Rv0512;product=delta-aminolevulinic acid dehydratase;protein_id=NP_215026.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 605604 606152 . + . ID=gene-Rv0513;Dbxref=GeneID:887307;Name=Rv0513;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0513
+NC_000962.3 RefSeq CDS 605604 606152 . + 0 ID=cds-NP_215027.1;Parent=gene-Rv0513;Dbxref=Genbank:NP_215027.1,GeneID:887307;Name=NP_215027.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0513;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215027.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 606149 606448 . + . ID=gene-Rv0514;Dbxref=GeneID:887319;Name=Rv0514;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0514
+NC_000962.3 RefSeq CDS 606149 606448 . + 0 ID=cds-NP_215028.1;Parent=gene-Rv0514;Dbxref=Genbank:NP_215028.1,GeneID:887319;Name=NP_215028.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0514;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215028.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 606551 608062 . + . ID=gene-Rv0515;Dbxref=GeneID:887322;Name=Rv0515;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0515
+NC_000962.3 RefSeq CDS 606551 608062 . + 0 ID=cds-NP_215029.1;Parent=gene-Rv0515;Dbxref=Genbank:NP_215029.1,GeneID:887322;Name=NP_215029.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0515;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215029.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 608059 608535 . - . ID=gene-Rv0516c;Dbxref=GeneID:887324;Name=Rv0516c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0516c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 608059 608535 . - 0 ID=cds-NP_215030.1;Parent=gene-Rv0516c;Dbxref=Genbank:NP_215030.1,GeneID:887324;Name=NP_215030.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0516c;product=anti-anti-sigma factor;protein_id=NP_215030.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 608746 610056 . + . ID=gene-Rv0517;Dbxref=GeneID:887323;Name=Rv0517;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0517
+NC_000962.3 RefSeq CDS 608746 610056 . + 0 ID=cds-NP_215031.1;Parent=gene-Rv0517;Dbxref=Genbank:NP_215031.1,GeneID:887323;Name=NP_215031.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0517;product=acyltransferase;protein_id=NP_215031.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 610188 610883 . + . ID=gene-Rv0518;Dbxref=GeneID:887321;Name=Rv0518;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0518
+NC_000962.3 RefSeq CDS 610188 610883 . + 0 ID=cds-NP_215032.1;Parent=gene-Rv0518;Dbxref=Genbank:NP_215032.1,GeneID:887321;Name=NP_215032.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0518;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215032.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 611172 612074 . - . ID=gene-Rv0519c;Dbxref=GeneID:887334;Name=Rv0519c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0519c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 611172 612074 . - 0 ID=cds-NP_215033.1;Parent=gene-Rv0519c;Dbxref=Genbank:NP_215033.1,GeneID:887334;Name=NP_215033.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv0519c;product=membrane protein;protein_id=NP_215033.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 616828 616878 . + . ID=id-NC_000962.3:616828..616878;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
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+NC_000962.3 RefSeq gene 618305 619894 . + . ID=gene-Rv0528;Dbxref=GeneID:887372;Name=Rv0528;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0528
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+NC_000962.3 RefSeq gene 620907 622124 . + . ID=gene-Rv0530;Dbxref=GeneID:887385;Name=Rv0530;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0530
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+NC_000962.3 RefSeq gene 622121 622282 . - . ID=gene-Rv0530A;Dbxref=GeneID:14515848;Name=Rv0530A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0530A
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+NC_000962.3 RefSeq gene 622329 622646 . + . ID=gene-Rv0531;Dbxref=GeneID:887376;Name=Rv0531;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0531
+NC_000962.3 RefSeq CDS 622329 622646 . + 0 ID=cds-NP_215045.1;Parent=gene-Rv0531;Dbxref=Genbank:NP_215045.1,GeneID:887376;Name=NP_215045.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0531;product=membrane protein;protein_id=NP_215045.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 622793 624577 . + . ID=gene-Rv0532;Dbxref=GeneID:887391;Name=PE_PGRS6;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0532
+NC_000962.3 RefSeq CDS 622793 624577 . + 0 ID=cds-YP_177736.1;Parent=gene-Rv0532;Dbxref=Genbank:YP_177736.1,GeneID:887391;Name=YP_177736.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS6;locus_tag=Rv0532;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS6;protein_id=YP_177736.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 624473 625480 . - . ID=gene-Rv0533c;Dbxref=GeneID:887381;Name=fabH;gbkey=Gene;gene=fabH;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtFabH;locus_tag=Rv0533c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 624473 625480 . - 0 ID=cds-NP_215047.1;Parent=gene-Rv0533c;Dbxref=Genbank:NP_215047.1,GeneID:887381;Name=NP_215047.1;Note=beta-ketoacyl-ACP synthase III (KAS III);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein characterization[PMID:10840036];gbkey=CDS;gene=fabH;locus_tag=Rv0533c;product=3-oxoacyl-ACP synthase III;protein_id=NP_215047.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 625562 626440 . - . ID=gene-Rv0534c;Dbxref=GeneID:887408;Name=menA;gbkey=Gene;gene=menA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0534c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 626457 627251 . + . ID=gene-Rv0535;Dbxref=GeneID:887430;Name=Rv0535;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0535
+NC_000962.3 RefSeq CDS 626457 627251 . + 0 ID=cds-NP_215049.1;Parent=gene-Rv0535;Dbxref=Genbank:NP_215049.1,GeneID:887430;Name=NP_215049.1;Note=MTA phosphorylase. Belongs to the PNP/MTAP family 2 of phosphorylases;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:22225784];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0535;product=5'-methylthioadenosine phosphorylase;protein_id=NP_215049.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 627248 628288 . + . ID=gene-Rv0536;Dbxref=GeneID:887457;Name=galE3;gbkey=Gene;gene=galE3;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=galE2;locus_tag=Rv0536
+NC_000962.3 RefSeq CDS 627248 628288 . + 0 ID=cds-YP_177737.1;Parent=gene-Rv0536;Dbxref=Genbank:YP_177737.1,GeneID:887457;Name=YP_177737.1;Note=galactowaldenase (UDP-galactose 4-epimerase) (uridine diphosphate galactose 4-epimerase) (uridine diphospho-galactose 4-epimerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=galE3;locus_tag=Rv0536;product=UDP-glucose 4-epimerase GalE;protein_id=YP_177737.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 628298 629731 . - . ID=gene-Rv0537c;Dbxref=GeneID:887465;Name=Rv0537c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0537c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 628298 629731 . - 0 ID=cds-NP_215051.1;Parent=gene-Rv0537c;Dbxref=Genbank:NP_215051.1,GeneID:887465;Name=NP_215051.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0537c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215051.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 630040 631686 . + . ID=gene-Rv0538;Dbxref=GeneID:887473;Name=Rv0538;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0538
+NC_000962.3 RefSeq CDS 630040 631686 . + 0 ID=cds-NP_215052.1;Parent=gene-Rv0538;Dbxref=Genbank:NP_215052.1,GeneID:887473;Name=NP_215052.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0538;product=membrane protein;protein_id=NP_215052.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 631743 632375 . + . ID=gene-Rv0539;Dbxref=GeneID:887476;Name=Rv0539;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0539
+NC_000962.3 RefSeq CDS 631743 632375 . + 0 ID=cds-NP_215053.1;Parent=gene-Rv0539;Dbxref=Genbank:NP_215053.1,GeneID:887476;Name=NP_215053.1;Note=dolichol-phosphate sugar synthetase (dolichol-phosphate sugar transferase) (sugar phosphoryldolichol synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0539;product=dolichyl-phosphate sugar synthase;protein_id=NP_215053.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 632372 633034 . + . ID=gene-Rv0540;Dbxref=GeneID:887489;Name=Rv0540;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0540
+NC_000962.3 RefSeq CDS 632372 633034 . + 0 ID=cds-NP_215054.1;Parent=gene-Rv0540;Dbxref=Genbank:NP_215054.1,GeneID:887489;Name=NP_215054.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0540;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215054.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 633055 634404 . - . ID=gene-Rv0541c;Dbxref=GeneID:887416;Name=Rv0541c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0541c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 633055 634404 . - 0 ID=cds-NP_215055.1;Parent=gene-Rv0541c;Dbxref=Genbank:NP_215055.1,GeneID:887416;Name=NP_215055.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00041;locus_tag=Rv0541c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215055.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 634416 635504 . - . ID=gene-Rv0542c;Dbxref=GeneID:887507;Name=menE;gbkey=Gene;gene=menE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0542c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 634416 635504 . - 0 ID=cds-NP_215056.1;Parent=gene-Rv0542c;Dbxref=Genbank:NP_215056.1,GeneID:887507;Name=NP_215056.1;Note=OSB-CoA synthetase (O-succinylbenzoate-CoA synthase);gbkey=CDS;gene=menE;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0542c;product=2-succinylbenzoic acid--CoA ligase;protein_id=NP_215056.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 635573 635875 . - . ID=gene-Rv0543c;Dbxref=GeneID:887494;Name=Rv0543c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0543c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 635573 635875 . - 0 ID=cds-NP_215057.1;Parent=gene-Rv0543c;Dbxref=Genbank:NP_215057.1,GeneID:887494;Name=NP_215057.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0543c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215057.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 635935 636213 . - . ID=gene-Rv0544c;Dbxref=GeneID:887511;Name=Rv0544c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0544c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 635935 636213 . - 0 ID=cds-NP_215058.1;Parent=gene-Rv0544c;Dbxref=Genbank:NP_215058.1,GeneID:887511;Name=NP_215058.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0544c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215058.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 636210 637463 . - . ID=gene-Rv0545c;Dbxref=GeneID:887517;Name=pitA;gbkey=Gene;gene=pitA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0545c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 636210 637463 . - 0 ID=cds-NP_215059.1;Parent=gene-Rv0545c;Dbxref=Genbank:NP_215059.1,GeneID:887517;Name=NP_215059.1;Note=integral membrane protein PitA;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=pitA;locus_tag=Rv0545c;product=low-affinity inorganic phosphate transporter;protein_id=NP_215059.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 637583 637969 . - . ID=gene-Rv0546c;Dbxref=GeneID:887509;Name=Rv0546c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0546c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 637583 637969 . - 0 ID=cds-NP_215060.1;Parent=gene-Rv0546c;Dbxref=Genbank:NP_215060.1,GeneID:887509;Name=NP_215060.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0546c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215060.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 638032 638916 . - . ID=gene-Rv0547c;Dbxref=GeneID:887527;Name=Rv0547c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0547c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 638032 638916 . - 0 ID=cds-NP_215061.1;Parent=gene-Rv0547c;Dbxref=Genbank:NP_215061.1,GeneID:887527;Name=NP_215061.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0547c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215061.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 639012 639956 . - . ID=gene-Rv0548c;Dbxref=GeneID:887529;Name=menB;gbkey=Gene;gene=menB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0548c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 639012 639956 . - 0 ID=cds-NP_215062.1;Parent=gene-Rv0548c;Dbxref=Genbank:NP_215062.1,GeneID:887529;Name=NP_215062.1;Note=naphthoate synthase MenB%3B dihydroxynaphthoic acid synthetase (DHNA synthetase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:10840036];gbkey=CDS;gene=menB;locus_tag=Rv0548c;product=1%2C4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase;protein_id=NP_215062.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 640228 640641 . - . ID=gene-Rv0549c;Dbxref=GeneID:887534;Name=vapC3;gbkey=Gene;gene=vapC3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0549c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 640228 640641 . - 0 ID=cds-NP_215063.1;Parent=gene-Rv0549c;Dbxref=Genbank:NP_215063.1,GeneID:887534;Name=NP_215063.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0550c%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=vapC3;locus_tag=Rv0549c;product=ribonuclease VapC3;protein_id=NP_215063.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 640638 640904 . - . ID=gene-Rv0550c;Dbxref=GeneID:887515;Name=vapB3;gbkey=Gene;gene=vapB3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0550c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 640638 640904 . - 0 ID=cds-NP_215064.1;Parent=gene-Rv0550c;Dbxref=Genbank:NP_215064.1,GeneID:887515;Name=NP_215064.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0549c;gbkey=CDS;gene=vapB3;locus_tag=Rv0550c;product=antitoxin VapB3;protein_id=NP_215064.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 641096 642811 . - . ID=gene-Rv0551c;Dbxref=GeneID:887526;Name=fadD8;gbkey=Gene;gene=fadD8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0551c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 641096 642811 . - 0 ID=cds-NP_215065.1;Parent=gene-Rv0551c;Dbxref=Genbank:NP_215065.1,GeneID:887526;Name=NP_215065.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=fadD8;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv0551c;product=fatty-acid--CoA ligase FadD8;protein_id=NP_215065.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 642754 642811 . - . ID=id-Rv0551c;Dbxref=GeneID:887526;Note=58 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region;gene=fadD8;locus_tag=Rv0551c
+NC_000962.3 RefSeq gene 642889 644493 . + . ID=gene-Rv0552;Dbxref=GeneID:887537;Name=Rv0552;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0552
+NC_000962.3 RefSeq CDS 642889 644493 . + 0 ID=cds-NP_215066.1;Parent=gene-Rv0552;Dbxref=Genbank:NP_215066.1,GeneID:887537;Name=NP_215066.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0552;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215066.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 644490 645470 . + . ID=gene-Rv0553;Dbxref=GeneID:887544;Name=menC;gbkey=Gene;gene=menC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0553
+NC_000962.3 RefSeq CDS 644490 645470 . + 0 ID=cds-NP_215067.1;Parent=gene-Rv0553;Dbxref=Genbank:NP_215067.1,GeneID:887544;Name=NP_215067.1;Note=cis%2Ccis-muconate lactonizing enzyme (MLE);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=menC;locus_tag=Rv0553;product=muconate cycloisomerase;protein_id=NP_215067.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 645467 646255 . + . ID=gene-Rv0554;Dbxref=GeneID:887535;Name=bpoC;gbkey=Gene;gene=bpoC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0554
+NC_000962.3 RefSeq CDS 645467 646255 . + 0 ID=cds-NP_215068.1;Parent=gene-Rv0554;Dbxref=Genbank:NP_215068.1,GeneID:887535;Name=NP_215068.1;Note=non-heme peroxidase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=bpoC;locus_tag=Rv0554;product=non-heme bromoperoxidase BpoC;protein_id=NP_215068.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 646298 647962 . + . ID=gene-Rv0555;Dbxref=GeneID:887554;Name=menD;gbkey=Gene;gene=menD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0555
+NC_000962.3 RefSeq CDS 646298 647962 . + 0 ID=cds-NP_215069.1;Parent=gene-Rv0555;Dbxref=Genbank:NP_215069.1,GeneID:887554;Name=NP_215069.1;Note=menaquinone biosynthesis protein%2C including 2-succinyl-6-hydroxy-2%2C4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase and 2-oxoglutarate decarboxylase activities. Cofactor: thiamine pyrophosphate.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=menD;locus_tag=Rv0555;product=bifunctional 2-succinyl-6-hydroxy-2%2C4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase/2-oxoglutarate decarboxylase;protein_id=NP_215069.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 647959 648474 . + . ID=gene-Rv0556;Dbxref=GeneID:887551;Name=Rv0556;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0556
+NC_000962.3 RefSeq CDS 647959 648474 . + 0 ID=cds-NP_215070.1;Parent=gene-Rv0556;Dbxref=Genbank:NP_215070.1,GeneID:887551;Name=NP_215070.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0556;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215070.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 648536 649672 . + . ID=gene-Rv0557;Dbxref=GeneID:887609;Name=mgtA;gbkey=Gene;gene=mgtA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtfB;locus_tag=Rv0557
+NC_000962.3 RefSeq CDS 648536 649672 . + 0 ID=cds-NP_215071.1;Parent=gene-Rv0557;Dbxref=Genbank:NP_215071.1,GeneID:887609;Name=NP_215071.1;Note=previously known as pimB;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:19395496];gbkey=CDS;gene=mgtA;locus_tag=Rv0557;product=GDP-mannose-dependent alpha-mannosyltransferase;protein_id=NP_215071.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 649689 650393 . + . ID=gene-Rv0558;Dbxref=GeneID:887591;Name=menH;gbkey=Gene;gene=menH;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=menG,ubiE;locus_tag=Rv0558
+NC_000962.3 RefSeq CDS 649689 650393 . + 0 ID=cds-YP_177738.1;Parent=gene-Rv0558;Dbxref=Genbank:YP_177738.1,GeneID:887591;Name=YP_177738.1;Note=alternate gene name: menG%2C ubiquinone/menaquinone (2-heptaprenyl-1%2C4-naphthoquinone methyltransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=menH;locus_tag=Rv0558;product=demethylmenaquinone methyltransferase;protein_id=YP_177738.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 650407 650745 . - . ID=gene-Rv0559c;Dbxref=GeneID:887569;Name=Rv0559c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0559c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 650407 650745 . - 0 ID=cds-NP_215073.1;Parent=gene-Rv0559c;Dbxref=Genbank:NP_215073.1,GeneID:887569;Name=NP_215073.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0559c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215073.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 650779 651504 . - . ID=gene-Rv0560c;Dbxref=GeneID:887637;Name=Rv0560c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0560c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 650779 651504 . - 0 ID=cds-NP_215074.1;Parent=gene-Rv0560c;Dbxref=Genbank:NP_215074.1,GeneID:887637;Name=NP_215074.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0560c;product=benzoquinone methyltransferase;protein_id=NP_215074.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 651529 652755 . - . ID=gene-Rv0561c;Dbxref=GeneID:887638;Name=Rv0561c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0561c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 651529 652755 . - 0 ID=cds-NP_215075.1;Parent=gene-Rv0561c;Dbxref=Genbank:NP_215075.1,GeneID:887638;Name=NP_215075.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0561c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215075.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 652771 653778 . + . ID=gene-Rv0562;Dbxref=GeneID:887647;Name=grcC1;gbkey=Gene;gene=grcC1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0562
+NC_000962.3 RefSeq CDS 652771 653778 . + 0 ID=cds-NP_215076.1;Parent=gene-Rv0562;Dbxref=Genbank:NP_215076.1,GeneID:887647;Name=NP_215076.1;Note=polyprenyl pyrophosphate synthetase Belongs to the FPP/GGPP synthetases family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=grcC1;inference=protein motif:PROSITE:PS00444;locus_tag=Rv0562;product=polyprenyl-diphosphate synthase GrcC;protein_id=NP_215076.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 653879 654739 . + . ID=gene-Rv0563;Dbxref=GeneID:887649;Name=htpX;gbkey=Gene;gene=htpX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0563
+NC_000962.3 RefSeq CDS 653879 654739 . + 0 ID=cds-NP_215077.1;Parent=gene-Rv0563;Dbxref=Genbank:NP_215077.1,GeneID:887649;Name=NP_215077.1;Note=transmembrane protein heat shock protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=htpX;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv0563;product=protease HtpX;protein_id=NP_215077.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 654924 655949 . - . ID=gene-Rv0564c;Dbxref=GeneID:887651;Name=gpdA1;gbkey=Gene;gene=gpdA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=glyC,gpsA;locus_tag=Rv0564c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 654924 655949 . - 0 ID=cds-NP_215078.1;Parent=gene-Rv0564c;Dbxref=Genbank:NP_215078.1,GeneID:887651;Name=NP_215078.1;Note=alternate gene names: gpsA%2C glyC%2C [NAD(P)+] GpdA1 (NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase) (NAD(P)H-dependent dihydroxyacetone-phosphate reductase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gpdA1;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0564c;product=glycerol-3-phosphate dehydrogenase;protein_id=NP_215078.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 656010 657470 . - . ID=gene-Rv0565c;Dbxref=GeneID:887662;Name=Rv0565c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0565c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 656010 657470 . - 0 ID=cds-NP_215079.1;Parent=gene-Rv0565c;Dbxref=Genbank:NP_215079.1,GeneID:887662;Name=NP_215079.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0565c;product=monooxygenase;protein_id=NP_215079.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 657548 658039 . - . ID=gene-Rv0566c;Dbxref=GeneID:887633;Name=Rv0566c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0566c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 657548 658039 . - 0 ID=cds-NP_215080.1;Parent=gene-Rv0566c;Dbxref=Genbank:NP_215080.1,GeneID:887633;Name=NP_215080.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0566c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215080.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 658109 658189 . + . ID=gene-Rvnt05;Dbxref=GeneID:2700426;Name=tyrT;gbkey=Gene;gene=tyrT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt05
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 658109 658189 . + . ID=rna-Rvnt05;Parent=gene-Rvnt05;Dbxref=GeneID:2700426;Note=tyrT%2C tRNA-Tyr%2C anticodon gta%2C length %3D 81;anticodon=(pos:658143..658145);codons=9;gbkey=tRNA;gene=tyrT;locus_tag=Rvnt05;product=tRNA-Tyr
+NC_000962.3 RefSeq exon 658109 658189 . + . ID=exon-Rvnt05-1;Parent=rna-Rvnt05;Dbxref=GeneID:2700426;Note=tyrT%2C tRNA-Tyr%2C anticodon gta%2C length %3D 81;anticodon=(pos:658143..658145);codons=9;gbkey=tRNA;gene=tyrT;locus_tag=Rvnt05;product=tRNA-Tyr
+NC_000962.3 RefSeq gene 658321 659340 . + . ID=gene-Rv0567;Dbxref=GeneID:887667;Name=Rv0567;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0567
+NC_000962.3 RefSeq CDS 658321 659340 . + 0 ID=cds-NP_215081.1;Parent=gene-Rv0567;Dbxref=Genbank:NP_215081.1,GeneID:887667;Name=NP_215081.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0567;product=methyltransferase/methylase;protein_id=NP_215081.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 659450 660868 . + . ID=gene-Rv0568;Dbxref=GeneID:887654;Name=cyp135B1;gbkey=Gene;gene=cyp135B1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0568
+NC_000962.3 RefSeq CDS 659450 660868 . + 0 ID=cds-NP_215082.1;Parent=gene-Rv0568;Dbxref=Genbank:NP_215082.1,GeneID:887654;Name=NP_215082.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cyp135B1;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv0568;product=cytochrome P450 Cyp135B1;protein_id=NP_215082.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 661003 661269 . + . ID=gene-Rv0569;Dbxref=GeneID:887678;Name=Rv0569;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0569
+NC_000962.3 RefSeq CDS 661003 661269 . + 0 ID=cds-NP_215083.1;Parent=gene-Rv0569;Dbxref=Genbank:NP_215083.1,GeneID:887678;Name=NP_215083.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0569;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215083.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 661295 663373 . + . ID=gene-Rv0570;Dbxref=GeneID:887666;Name=nrdZ;gbkey=Gene;gene=nrdZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0570
+NC_000962.3 RefSeq CDS 661295 663373 . + 0 ID=cds-NP_215084.1;Parent=gene-Rv0570;Dbxref=Genbank:NP_215084.1,GeneID:887666;Name=NP_215084.1;Note=ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit NrdZ;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=nrdZ;locus_tag=Rv0570;product=vitamin B12-dependent ribonucleoside-diphosphate reductase;protein_id=NP_215084.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 663487 664818 . - . ID=gene-Rv0571c;Dbxref=GeneID:887710;Name=Rv0571c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0571c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 663487 664818 . - 0 ID=cds-NP_215085.1;Parent=gene-Rv0571c;Dbxref=Genbank:NP_215085.1,GeneID:887710;Name=NP_215085.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0571c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215085.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 665042 665383 . - . ID=gene-Rv0572c;Dbxref=GeneID:887696;Name=Rv0572c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0572c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 665042 665383 . - 0 ID=cds-NP_215086.1;Parent=gene-Rv0572c;Dbxref=Genbank:NP_215086.1,GeneID:887696;Name=NP_215086.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0572c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215086.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 665851 667242 . - . ID=gene-Rv0573c;Dbxref=GeneID:887716;Name=pncB2;gbkey=Gene;gene=pncB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0573c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 665851 667242 . - 0 ID=cds-NP_215087.1;Parent=gene-Rv0573c;Dbxref=Genbank:NP_215087.1,GeneID:887716;Name=NP_215087.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18490451];gbkey=CDS;gene=pncB2;locus_tag=Rv0573c;product=nicotinic acid phosphoribosyltransferase PncB2;protein_id=NP_215087.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 667252 668394 . - . ID=gene-Rv0574c;Dbxref=GeneID:887721;Name=Rv0574c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0574c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 667252 668394 . - 0 ID=cds-NP_215088.1;Parent=gene-Rv0574c;Dbxref=Genbank:NP_215088.1,GeneID:887721;Name=NP_215088.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0574c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215088.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 668579 669745 . - . ID=gene-Rv0575c;Dbxref=GeneID:887720;Name=Rv0575c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0575c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 668579 669745 . - 0 ID=cds-NP_215089.1;Parent=gene-Rv0575c;Dbxref=Genbank:NP_215089.1,GeneID:887720;Name=NP_215089.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0575c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215089.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 677710 677925 . + 0 ID=cds-NP_215095.1;Parent=gene-Rv0581;Dbxref=Genbank:NP_215095.1,GeneID:887739;Name=NP_215095.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0582;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB26;locus_tag=Rv0581;product=antitoxin VapB26;protein_id=NP_215095.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 677922 678329 . + . ID=gene-Rv0582;Dbxref=GeneID:887747;Name=vapC26;gbkey=Gene;gene=vapC26;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0582
+NC_000962.3 RefSeq CDS 677922 678329 . + 0 ID=cds-NP_215096.1;Parent=gene-Rv0582;Dbxref=Genbank:NP_215096.1,GeneID:887747;Name=NP_215096.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0581%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC26;locus_tag=Rv0582;product=ribonuclease VapC26;protein_id=NP_215096.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 678389 679075 . - . ID=gene-Rv0583c;Dbxref=GeneID:887733;Name=lpqN;gbkey=Gene;gene=lpqN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0583c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 678389 679075 . - 0 ID=cds-NP_215097.1;Parent=gene-Rv0583c;Dbxref=Genbank:NP_215097.1,GeneID:887733;Name=NP_215097.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqN;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0583c;product=lipoprotein LpqN;protein_id=NP_215097.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 679229 681862 . + . ID=gene-Rv0584;Dbxref=GeneID:887752;Name=Rv0584;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0584
+NC_000962.3 RefSeq CDS 679229 681862 . + 0 ID=cds-NP_215098.1;Parent=gene-Rv0584;Dbxref=Genbank:NP_215098.1,GeneID:887752;Name=NP_215098.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00699;locus_tag=Rv0584;product=glycosidase;protein_id=NP_215098.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 681885 684272 . - . ID=gene-Rv0585c;Dbxref=GeneID:887753;Name=Rv0585c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0585c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 681885 684272 . - 0 ID=cds-NP_215099.1;Parent=gene-Rv0585c;Dbxref=Genbank:NP_215099.1,GeneID:887753;Name=NP_215099.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0585c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215099.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 684410 685132 . + . ID=gene-Rv0586;Dbxref=GeneID:887754;Name=mce2R;gbkey=Gene;gene=mce2R;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0586
+NC_000962.3 RefSeq CDS 684410 685132 . + 0 ID=cds-NP_215100.1;Parent=gene-Rv0586;Dbxref=Genbank:NP_215100.1,GeneID:887754;Name=NP_215100.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:19027363];gbkey=CDS;gene=mce2R;inference=protein motif:PROSITE:PS00043;locus_tag=Rv0586;product=HTH-type transcriptional regulator Mce2R;protein_id=NP_215100.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 685129 685926 . + . ID=gene-Rv0587;Dbxref=GeneID:887755;Name=yrbE2A;gbkey=Gene;gene=yrbE2A;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0587
+NC_000962.3 RefSeq CDS 685129 685926 . + 0 ID=cds-NP_215101.1;Parent=gene-Rv0587;Dbxref=Genbank:NP_215101.1,GeneID:887755;Name=NP_215101.1;gbkey=CDS;gene=yrbE2A;locus_tag=Rv0587;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215101.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 685928 686815 . + . ID=gene-Rv0588;Dbxref=GeneID:887761;Name=Rv0588;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0588
+NC_000962.3 RefSeq CDS 685928 686815 . + 0 ID=cds-NP_215102.1;Parent=gene-Rv0588;Dbxref=Genbank:NP_215102.1,GeneID:887761;Name=NP_215102.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0588;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215102.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 686821 688035 . + . ID=gene-Rv0589;Dbxref=GeneID:887745;Name=mce2A;gbkey=Gene;gene=mce2A;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mce2;locus_tag=Rv0589
+NC_000962.3 RefSeq CDS 686821 688035 . + 0 ID=cds-YP_177740.1;Parent=gene-Rv0589;Dbxref=Genbank:YP_177740.1,GeneID:887745;Name=YP_177740.1;gbkey=CDS;gene=mce2A;locus_tag=Rv0589;product=Mce family protein Mce2A;protein_id=YP_177740.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 689059 690504 . + . ID=gene-Rv0591;Dbxref=GeneID:887770;Name=mce2C;gbkey=Gene;gene=mce2C;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0591
+NC_000962.3 RefSeq CDS 689059 690504 . + 0 ID=cds-NP_215105.1;Parent=gene-Rv0591;Dbxref=Genbank:NP_215105.1,GeneID:887770;Name=NP_215105.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=mce2C;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0591;product=Mce family protein Mce2C;protein_id=NP_215105.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 690501 692027 . + . ID=gene-Rv0592;Dbxref=GeneID:887786;Name=mce2D;gbkey=Gene;gene=mce2D;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0592
+NC_000962.3 RefSeq CDS 690501 692027 . + 0 ID=cds-NP_215106.1;Parent=gene-Rv0592;Dbxref=Genbank:NP_215106.1,GeneID:887786;Name=NP_215106.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mce2D;locus_tag=Rv0592;product=Mce family protein Mce2D;protein_id=NP_215106.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 692024 693232 . + . ID=gene-Rv0593;Dbxref=GeneID:887829;Name=lprL;gbkey=Gene;gene=lprL;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mce2E;locus_tag=Rv0593
+NC_000962.3 RefSeq CDS 692024 693232 . + 0 ID=cds-NP_215107.1;Parent=gene-Rv0593;Dbxref=Genbank:NP_215107.1,GeneID:887829;Name=NP_215107.1;Note=alternate gene name mce2E;gbkey=CDS;gene=lprL;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0593;product=Mce family lipoprotein LprL;protein_id=NP_215107.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 693237 694787 . + . ID=gene-Rv0594;Dbxref=GeneID:887797;Name=mce2F;gbkey=Gene;gene=mce2F;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0594
+NC_000962.3 RefSeq CDS 693237 694787 . + 0 ID=cds-NP_215108.1;Parent=gene-Rv0594;Dbxref=Genbank:NP_215108.1,GeneID:887797;Name=NP_215108.1;gbkey=CDS;gene=mce2F;locus_tag=Rv0594;product=Mce family protein Mce2F;protein_id=NP_215108.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 694839 695231 . - . ID=gene-Rv0595c;Dbxref=GeneID:887835;Name=vapC4;gbkey=Gene;gene=vapC4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0595c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 694839 695231 . - 0 ID=cds-NP_215109.1;Parent=gene-Rv0595c;Dbxref=Genbank:NP_215109.1,GeneID:887835;Name=NP_215109.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0596c%2C contains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:22354968];gbkey=CDS;gene=vapC4;locus_tag=Rv0595c;product=ribonuclease VapC4;protein_id=NP_215109.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 695228 695485 . - . ID=gene-Rv0596c;Dbxref=GeneID:887846;Name=vapB4;gbkey=Gene;gene=vapB4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0596c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 695228 695485 . - 0 ID=cds-NP_215110.1;Parent=gene-Rv0596c;Dbxref=Genbank:NP_215110.1,GeneID:887846;Name=NP_215110.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0595c. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:22354968];gbkey=CDS;gene=vapB4;locus_tag=Rv0596c;product=antitoxin VapB4;protein_id=NP_215110.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 695668 696903 . - . ID=gene-Rv0597c;Dbxref=GeneID:887853;Name=Rv0597c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0597c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 695668 696903 . - 0 ID=cds-NP_215111.1;Parent=gene-Rv0597c;Dbxref=Genbank:NP_215111.1,GeneID:887853;Name=NP_215111.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0597c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215111.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 697154 697567 . - . ID=gene-Rv0598c;Dbxref=GeneID:887861;Name=vapC27;gbkey=Gene;gene=vapC27;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0598c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 697154 697567 . - 0 ID=cds-NP_215112.1;Parent=gene-Rv0598c;Dbxref=Genbank:NP_215112.1,GeneID:887861;Name=NP_215112.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv00599c%2C contains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC27;locus_tag=Rv0598c;product=ribonuclease VapC27;protein_id=NP_215112.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 697564 697800 . - . ID=gene-Rv0599c;Dbxref=GeneID:887856;Name=vapB27;gbkey=Gene;gene=vapB27;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0599c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 697564 697800 . - 0 ID=cds-NP_215113.1;Parent=gene-Rv0599c;Dbxref=Genbank:NP_215113.1,GeneID:887856;Name=NP_215113.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0598c. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB27;locus_tag=Rv0599c;product=antitoxin VapB27;protein_id=NP_215113.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 697904 698410 . - . ID=gene-Rv0600c;Dbxref=GeneID:887847;Name=Rv0600c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0600c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 697904 698410 . - 0 ID=cds-NP_215114.2;Parent=gene-Rv0600c;Dbxref=Genbank:NP_215114.2,GeneID:887847;Name=NP_215114.2;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:17434492];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0600c;product=two component sensor kinase HK1;protein_id=NP_215114.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 698524 698994 . - . ID=gene-Rv0601c;Dbxref=GeneID:887868;Name=Rv0601c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0601c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 698524 698994 . - 0 ID=cds-NP_215115.1;Parent=gene-Rv0601c;Dbxref=Genbank:NP_215115.1,GeneID:887868;Name=NP_215115.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:17434492];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0601c;product=two component sensor kinase HK2;protein_id=NP_215115.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 699038 699799 . - . ID=gene-Rv0602c;Dbxref=GeneID:887870;Name=tcrA;gbkey=Gene;gene=tcrA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0602c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 699038 699799 . - 0 ID=cds-NP_215116.1;Parent=gene-Rv0602c;Dbxref=Genbank:NP_215116.1,GeneID:887870;Name=NP_215116.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=tcrA;locus_tag=Rv0602c;product=two component DNA binding transcriptional regulator TcrA;protein_id=NP_215116.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 699856 700167 . + . ID=gene-Rv0603;Dbxref=GeneID:887863;Name=Rv0603;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0603
+NC_000962.3 RefSeq CDS 699856 700167 . + 0 ID=cds-NP_215117.1;Parent=gene-Rv0603;Dbxref=Genbank:NP_215117.1,GeneID:887863;Name=NP_215117.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0603;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215117.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 700239 701189 . + . ID=gene-Rv0604;Dbxref=GeneID:887879;Name=lpqO;gbkey=Gene;gene=lpqO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0604
+NC_000962.3 RefSeq CDS 700239 701189 . + 0 ID=cds-NP_215118.1;Parent=gene-Rv0604;Dbxref=Genbank:NP_215118.1,GeneID:887879;Name=NP_215118.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqO;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0604;product=lipoprotein LpqO;protein_id=NP_215118.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 701247 701369 . - . ID=id-NC_000962.3:701247..701369;Note=123 bp imperfect direct repeat 2%2C 92/103 bp identical to first copy at 709425..709548%2CAGCCCCGGCTCGACGCGGCATAGGGTGGCCACCGTGGCCGAAGCGTTCCATGCGACCGTGCCGTGGCGAGGATCCCGGCCGAACATGGCCCATTGAACGAGGACGTCATCGCACGACGCCTGC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 701384 702767 . + . ID=id-NC_000962.3:701384..702767;Note=IS1536%2C len: 1384 nt. Partial copy of insertion sequence IS_1536. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1536
+NC_000962.3 RefSeq gene 701430 702014 . + . ID=gene-Rv0605;Dbxref=GeneID:887872;Name=Rv0605;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0605
+NC_000962.3 RefSeq CDS 701430 702014 . + 0 ID=cds-NP_215119.2;Parent=gene-Rv0605;Dbxref=Genbank:NP_215119.2,GeneID:887872;Name=NP_215119.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00397;locus_tag=Rv0605;product=IS1536 family serine type transposase;protein_id=NP_215119.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 702813 703199 . + . ID=gene-Rv0607;Dbxref=GeneID:887883;Name=Rv0607;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0607
+NC_000962.3 RefSeq CDS 702813 703199 . + 0 ID=cds-NP_215121.1;Parent=gene-Rv0607;Dbxref=Genbank:NP_215121.1,GeneID:887883;Name=NP_215121.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0607;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215121.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 703244 703489 . + . ID=gene-Rv0608;Dbxref=GeneID:887895;Name=vapB28;gbkey=Gene;gene=vapB28;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0608
+NC_000962.3 RefSeq CDS 703244 703489 . + 0 ID=cds-NP_215122.1;Parent=gene-Rv0608;Dbxref=Genbank:NP_215122.1,GeneID:887895;Name=NP_215122.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0609. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapB28;locus_tag=Rv0608;product=antitoxin VapB28;protein_id=NP_215122.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 703486 703887 . + . ID=gene-Rv0609;Dbxref=GeneID:887896;Name=vapC28;gbkey=Gene;gene=vapC28;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0609
+NC_000962.3 RefSeq CDS 703486 703887 . + 0 ID=cds-NP_215123.1;Parent=gene-Rv0609;Dbxref=Genbank:NP_215123.1,GeneID:887896;Name=NP_215123.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0608%2C contains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC28;locus_tag=Rv0609;product=ribonuclease VapC28;protein_id=NP_215123.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 703830 704057 . + . ID=gene-Rv0609A;Dbxref=GeneID:3205046;Name=Rv0609A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0609A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 703830 704057 . + 0 ID=cds-YP_177628.1;Parent=gene-Rv0609A;Dbxref=Genbank:YP_177628.1,GeneID:3205046;Name=YP_177628.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0609A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177628.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 703912 703985 . - . ID=id-NC_000962.3:703912..703985;Note=74 bp imperfect direct repeat 2%2C 64/73 bp identical to first copy at 706790..706863%2CCACAGCGGACACCACAAAGCCCGCCGCTGCCACCGGATCGTCGGAACGAAAATAGTCGTACCCGTGAGCCTCGC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 704187 704247 . + . ID=gene-RVnc0005;Dbxref=GeneID:14515849;Name=B55;gbkey=Gene;gene=B55;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0005
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 704187 704247 . + . ID=rna-RVnc0005;Parent=gene-RVnc0005;Dbxref=GeneID:14515849;Note=B55%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=ncRNA;gene=B55;locus_tag=RVnc0005;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 704187 704247 . + . ID=exon-RVnc0005-1;Parent=rna-RVnc0005;Dbxref=GeneID:14515849;Note=B55%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=ncRNA;gene=B55;locus_tag=RVnc0005;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 704752 705909 . - . ID=gene-Rv0610c;Dbxref=GeneID:887890;Name=Rv0610c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0610c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 704752 705909 . - 0 ID=cds-NP_215124.1;Parent=gene-Rv0610c;Dbxref=Genbank:NP_215124.1,GeneID:887890;Name=NP_215124.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0610c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215124.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 705961 706182 . - . ID=gene-Rv0611c;Dbxref=GeneID:887906;Name=Rv0611c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0611c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 705961 706182 . - 0 ID=cds-NP_215125.2;Parent=gene-Rv0611c;Dbxref=Genbank:NP_215125.2,GeneID:887906;Name=NP_215125.2;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0611c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215125.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 706324 706929 . + . ID=gene-Rv0612;Dbxref=GeneID:887908;Name=Rv0612;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0612
+NC_000962.3 RefSeq CDS 706324 706929 . + 0 ID=cds-NP_215126.1;Parent=gene-Rv0612;Dbxref=Genbank:NP_215126.1,GeneID:887908;Name=NP_215126.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0612;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215126.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 706790 706863 . - . ID=id-NC_000962.3:706790..706863;Note=74 bp imperfect direct repeat 1%2C 64/73 bp identical to second copy at 703912..703985%2CCACATCGGACACGACGAAACCCGCCGCTGCCACCGGATCGTCGGAGCGGAAGTAGTCGTACCCGTCGGCCTCGC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 706948 709515 . - . ID=gene-Rv0613c;Dbxref=GeneID:887913;Name=Rv0613c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0613c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 706948 709515 . - 0 ID=cds-NP_215127.1;Parent=gene-Rv0613c;Dbxref=Genbank:NP_215127.1,GeneID:887913;Name=NP_215127.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0613c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215127.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 709356 710348 . + . ID=gene-Rv0614;Dbxref=GeneID:887914;Name=Rv0614;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0614
+NC_000962.3 RefSeq CDS 709599 710348 . + 0 ID=cds-NP_215128.2;Parent=gene-Rv0614;Dbxref=Genbank:NP_215128.2,GeneID:887914;Name=NP_215128.2;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0614;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215128.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 709585 709663 . + . ID=id-Rv0614;Dbxref=GeneID:887914;Note=79 bp imperfect direct repeat 1%2C 73/78 bp identical to second copy at 711624..711702%2CTAGGGTTCGGCGTTGTGACGGCGCCGACGCGGTGGACCCTGGCCGACGGACGTGAGCTGCTGTTCTTTTCGCTGCCCGG. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv0614
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 709425 709548 . - . ID=id-NC_000962.3:709425..709548;Note=123 bp imperfect direct repeat 1%2C 92/103 bp identical to second copy at 701247..701369%2CAGCCTCGGCTGGCCGCGGCATAAGGTGGCCACCGTGGCCGAAGCGTTCGATGCGACCCAAGCCGTGGCGAGAATCCTGGCCGAACATGGCCCATTGAGCGAGGACGACATCGCACGACGCCTGC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 710345 710587 . + . ID=gene-Rv0615;Dbxref=GeneID:887920;Name=Rv0615;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0615
+NC_000962.3 RefSeq CDS 710345 710587 . + 0 ID=cds-NP_215129.1;Parent=gene-Rv0615;Dbxref=Genbank:NP_215129.1,GeneID:887920;Name=NP_215129.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0615;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215129.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 710782 711009 . + . ID=gene-Rv0616A;Dbxref=GeneID:14515850;Name=vapB29;gbkey=Gene;gene=vapB29;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0616A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 710782 711009 . + 0 ID=cds-YP_007409270.1;Parent=gene-Rv0616A;Dbxref=Genbank:YP_007409270.1,GeneID:14515850;Name=YP_007409270.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0617;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapB29;locus_tag=Rv0616A;product=antitoxin VapB29;protein_id=YP_007409270.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 711006 711407 . + . ID=gene-Rv0617;Dbxref=GeneID:887926;Name=vapC29;gbkey=Gene;gene=vapC29;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0617
+NC_000962.3 RefSeq CDS 711006 711407 . + 0 ID=cds-NP_215131.1;Parent=gene-Rv0617;Dbxref=Genbank:NP_215131.1,GeneID:887926;Name=NP_215131.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0616A%2C contains PIN domain;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:22539524];gbkey=CDS;gene=vapC29;locus_tag=Rv0617;product=ribonuclease VapC29;protein_id=NP_215131.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 711624 711702 . + . ID=id-NC_000962.3:711624..711702;Note=79 bp imperfect direct repeat 2%2C 73/78 bp identical to first copy at 709585..709663%2CTAGGGTTCTGCGTTGTGACGGCGCCGACGCGGTGGACCCTGGCCGATGGCCGTGACCTGCTGTTCTTTTCGCTGCCCGG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 711638 712719 . + . ID=gene-Rv0618;Dbxref=GeneID:887932;Name=galT;gbkey=Gene;gene=galT;gene_biotype=pseudogene;gene_synonym=galT';locus_tag=Rv0618;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 712716 713807 . + . ID=gene-Rv0620;Dbxref=GeneID:887936;Name=galK;gbkey=Gene;gene=galK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0620
+NC_000962.3 RefSeq CDS 712716 713807 . + 0 ID=cds-NP_215134.1;Parent=gene-Rv0620;Dbxref=Genbank:NP_215134.1,GeneID:887936;Name=NP_215134.1;gbkey=CDS;gene=galK;inference=protein motif:PROSITE:PS00560;locus_tag=Rv0620;product=galactokinase;protein_id=NP_215134.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 714202 715266 . + . ID=gene-Rv0621;Dbxref=GeneID:887901;Name=Rv0621;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0621
+NC_000962.3 RefSeq CDS 714202 715266 . + 0 ID=cds-NP_215135.1;Parent=gene-Rv0621;Dbxref=Genbank:NP_215135.1,GeneID:887901;Name=NP_215135.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0621;product=membrane protein;protein_id=NP_215135.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 715370 716317 . + . ID=gene-Rv0622;Dbxref=GeneID:887942;Name=Rv0622;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0622
+NC_000962.3 RefSeq CDS 715370 716317 . + 0 ID=cds-NP_215136.2;Parent=gene-Rv0622;Dbxref=Genbank:NP_215136.2,GeneID:887942;Name=NP_215136.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0622;product=membrane protein;protein_id=NP_215136.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 716410 716664 . + . ID=gene-Rv0623;Dbxref=GeneID:887970;Name=vapB30;gbkey=Gene;gene=vapB30;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0623
+NC_000962.3 RefSeq CDS 716410 716664 . + 0 ID=cds-NP_215137.1;Parent=gene-Rv0623;Dbxref=Genbank:NP_215137.1,GeneID:887970;Name=NP_215137.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0624;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB30;locus_tag=Rv0623;product=antitoxin VapB30;protein_id=NP_215137.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 716664 717059 . + . ID=gene-Rv0624;Dbxref=GeneID:887951;Name=vapC30;gbkey=Gene;gene=vapC30;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0624
+NC_000962.3 RefSeq CDS 716664 717059 . + 0 ID=cds-NP_215138.1;Parent=gene-Rv0624;Dbxref=Genbank:NP_215138.1,GeneID:887951;Name=NP_215138.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0623%2C contains PIN domain;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=vapC30;locus_tag=Rv0624;product=ribonuclease VapC30;protein_id=NP_215138.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 717153 717893 . - . ID=gene-Rv0625c;Dbxref=GeneID:887967;Name=Rv0625c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0625c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 717153 717893 . - 0 ID=cds-NP_215139.1;Parent=gene-Rv0625c;Dbxref=Genbank:NP_215139.1,GeneID:887967;Name=NP_215139.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0625c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215139.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 718025 718285 . + . ID=gene-Rv0626;Dbxref=GeneID:887996;Name=vapB5;gbkey=Gene;gene=vapB5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0626
+NC_000962.3 RefSeq CDS 718025 718285 . + 0 ID=cds-NP_215140.1;Parent=gene-Rv0626;Dbxref=Genbank:NP_215140.1,GeneID:887996;Name=NP_215140.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0627 Cofactor: Mg2+;gbkey=CDS;gene=vapB5;locus_tag=Rv0626;product=antitoxin VapB5;protein_id=NP_215140.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 718282 718689 . + . ID=gene-Rv0627;Dbxref=GeneID:887991;Name=vapC5;gbkey=Gene;gene=vapC5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0627
+NC_000962.3 RefSeq CDS 718282 718689 . + 0 ID=cds-NP_215141.1;Parent=gene-Rv0627;Dbxref=Genbank:NP_215141.1,GeneID:887991;Name=NP_215141.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0626%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC5;locus_tag=Rv0627;product=ribonuclease VapC5;protein_id=NP_215141.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 718761 719912 . - . ID=gene-Rv0628c;Dbxref=GeneID:887986;Name=Rv0628c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0628c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 718761 719912 . - 0 ID=cds-NP_215142.1;Parent=gene-Rv0628c;Dbxref=Genbank:NP_215142.1,GeneID:887986;Name=NP_215142.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0628c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215142.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 720005 721732 . - . ID=gene-Rv0629c;Dbxref=GeneID:887999;Name=recD;gbkey=Gene;gene=recD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0629c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 720005 721732 . - 0 ID=cds-NP_215143.1;Parent=gene-Rv0629c;Dbxref=Genbank:NP_215143.1,GeneID:887999;Name=NP_215143.1;Note=exodeoxyribonuclease V alpha chain (exodeoxyribonuclease V polypeptide) Consists of three subunits%3B RECB|Rv0630c%2C RECC|Rv0631c and RECD.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=recD;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0629c;product=exonuclease V subunit alpha RecD;protein_id=NP_215143.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 721729 725013 . - . ID=gene-Rv0630c;Dbxref=GeneID:888004;Name=recB;gbkey=Gene;gene=recB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0630c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 721729 725013 . - 0 ID=cds-NP_215144.1;Parent=gene-Rv0630c;Dbxref=Genbank:NP_215144.1,GeneID:888004;Name=NP_215144.1;Note=exodeoxyribonuclease V beta chain(exodeoxyribonuclease V polypeptide) (chi-specific endonuclease). Consists of three subunits%3B RECB%2C RECC|Rv0631c and recd|Rv0629c.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=recB;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0630c;product=exonuclease V subunit beta RecB;protein_id=NP_215144.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 725013 728306 . - . ID=gene-Rv0631c;Dbxref=GeneID:888008;Name=recC;gbkey=Gene;gene=recC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0631c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 725013 728306 . - 0 ID=cds-NP_215145.1;Parent=gene-Rv0631c;Dbxref=Genbank:NP_215145.1,GeneID:888008;Name=NP_215145.1;Note=exodeoxyribonuclease V gamma chain(exodeoxyribonuclease V polypeptide). Consists of three subunits%3B RECB|Rv0630c%2CRECC and recd|Rv0629c.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=recC;locus_tag=Rv0631c;product=exonuclease V subunit gamma RecC;protein_id=NP_215145.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 728583 729278 . - . ID=gene-Rv0632c;Dbxref=GeneID:888015;Name=echA3;gbkey=Gene;gene=echA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0632c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 728583 729278 . - 0 ID=cds-NP_215146.1;Parent=gene-Rv0632c;Dbxref=Genbank:NP_215146.1,GeneID:888015;Name=NP_215146.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA3;locus_tag=Rv0632c;product=enoyl-CoA hydratase EchA3;protein_id=NP_215146.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 729327 730166 . - . ID=gene-Rv0633c;Dbxref=GeneID:888001;Name=Rv0633c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0633c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 729327 730166 . - 0 ID=cds-NP_215147.1;Parent=gene-Rv0633c;Dbxref=Genbank:NP_215147.1,GeneID:888001;Name=NP_215147.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0633c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215147.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 730320 731033 . - . ID=gene-Rv0634c;Dbxref=GeneID:888016;Name=Rv0634c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0634c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 730320 731033 . - 0 ID=cds-NP_215148.1;Parent=gene-Rv0634c;Dbxref=Genbank:NP_215148.1,GeneID:888016;Name=NP_215148.1;Note=hydroxyacylglutathione hydrolase (GLX II). Cofactor: binds two zinc ions.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0634c;product=glyoxalase II;protein_id=NP_215148.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 731113 731364 . + . ID=gene-Rv0634A;Dbxref=GeneID:3205041;Name=Rv0634A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0634A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 731113 731364 . + 0 ID=cds-YP_177629.1;Parent=gene-Rv0634A;Dbxref=Genbank:YP_177629.1,GeneID:3205041;Name=YP_177629.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0634A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177629.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 731494 731566 . + . ID=gene-Rvnt06;Dbxref=GeneID:2700463;Name=thrT;gbkey=Gene;gene=thrT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt06
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 731494 731566 . + . ID=rna-Rvnt06;Parent=gene-Rvnt06;Dbxref=GeneID:2700463;Note=thrT%2C tRNA-Thr%2C anticodon ggt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:731527..731529);codons=37;gbkey=tRNA;gene=thrT;locus_tag=Rvnt06;product=tRNA-Thr
+NC_000962.3 RefSeq exon 731494 731566 . + . ID=exon-Rvnt06-1;Parent=rna-Rvnt06;Dbxref=GeneID:2700463;Note=thrT%2C tRNA-Thr%2C anticodon ggt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:731527..731529);codons=37;gbkey=tRNA;gene=thrT;locus_tag=Rvnt06;product=tRNA-Thr
+NC_000962.3 RefSeq gene 731603 731676 . + . ID=gene-Rvnt07;Dbxref=GeneID:2700431;Name=metT;gbkey=Gene;gene=metT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt07
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 731603 731676 . + . ID=rna-Rvnt07;Parent=gene-Rvnt07;Dbxref=GeneID:2700431;Note=metT%2C tRNA-Met%2C anticodon cat%2C length %3D 74;anticodon=(pos:731637..731639);codons=35;gbkey=tRNA;gene=metT;locus_tag=Rvnt07;product=tRNA-Met
+NC_000962.3 RefSeq exon 731603 731676 . + . ID=exon-Rvnt07-1;Parent=rna-Rvnt07;Dbxref=GeneID:2700431;Note=metT%2C tRNA-Met%2C anticodon cat%2C length %3D 74;anticodon=(pos:731637..731639);codons=35;gbkey=tRNA;gene=metT;locus_tag=Rvnt07;product=tRNA-Met
+NC_000962.3 RefSeq gene 731712 731879 . + . ID=gene-Rv0634B;Dbxref=GeneID:3205042;Name=rpmG2;gbkey=Gene;gene=rpmG2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0634B
+NC_000962.3 RefSeq CDS 731712 731879 . + 0 ID=cds-YP_177630.1;Parent=gene-Rv0634B;Dbxref=Genbank:YP_177630.1,GeneID:3205042;Name=YP_177630.1;Note=rpmG2. Note that Mycobacterium tuberculosis has a second rpmG gene;gbkey=CDS;gene=rpmG2;locus_tag=Rv0634B;product=50S ribosomal protein L33;protein_id=YP_177630.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 731930 732406 . + . ID=gene-Rv0635;Dbxref=GeneID:888032;Name=hadA;gbkey=Gene;gene=hadA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0635
+NC_000962.3 RefSeq CDS 731930 732406 . + 0 ID=cds-NP_215149.1;Parent=gene-Rv0635;Dbxref=Genbank:NP_215149.1,GeneID:888032;Name=NP_215149.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hadA;locus_tag=Rv0635;product=(3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA;protein_id=NP_215149.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 732393 732821 . + . ID=gene-Rv0636;Dbxref=GeneID:888031;Name=hadB;gbkey=Gene;gene=hadB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0636
+NC_000962.3 RefSeq CDS 732393 732821 . + 0 ID=cds-NP_215150.1;Parent=gene-Rv0636;Dbxref=Genbank:NP_215150.1,GeneID:888031;Name=NP_215150.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hadB;locus_tag=Rv0636;product=(3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB;protein_id=NP_215150.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 732825 733325 . + . ID=gene-Rv0637;Dbxref=GeneID:888019;Name=hadC;gbkey=Gene;gene=hadC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0637
+NC_000962.3 RefSeq CDS 732825 733325 . + 0 ID=cds-NP_215151.1;Parent=gene-Rv0637;Dbxref=Genbank:NP_215151.1,GeneID:888019;Name=NP_215151.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hadC;locus_tag=Rv0637;product=(3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC;protein_id=NP_215151.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 733524 733596 . + . ID=gene-Rvnt08;Dbxref=GeneID:2700453;Name=trpT;gbkey=Gene;gene=trpT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt08
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 733524 733596 . + . ID=rna-Rvnt08;Parent=gene-Rvnt08;Dbxref=GeneID:2700453;Note=trpT%2C tRNA-Trp%2C anticodon cca%2C length %3D 73;anticodon=(pos:733557..733559);codons=15;gbkey=tRNA;gene=trpT;locus_tag=Rvnt08;product=tRNA-Trp
+NC_000962.3 RefSeq exon 733524 733596 . + . ID=exon-Rvnt08-1;Parent=rna-Rvnt08;Dbxref=GeneID:2700453;Note=trpT%2C tRNA-Trp%2C anticodon cca%2C length %3D 73;anticodon=(pos:733557..733559);codons=15;gbkey=tRNA;gene=trpT;locus_tag=Rvnt08;product=tRNA-Trp
+NC_000962.3 RefSeq gene 733737 734222 . + . ID=gene-Rv0638;Dbxref=GeneID:888042;Name=secE1;gbkey=Gene;gene=secE1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=secE;locus_tag=Rv0638
+NC_000962.3 RefSeq CDS 733737 734222 . + 0 ID=cds-YP_177743.1;Parent=gene-Rv0638;Dbxref=Genbank:YP_177743.1,GeneID:888042;Name=YP_177743.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=secE1;inference=protein motif:PROSITE:PS01067;locus_tag=Rv0638;product=preprotein translocase SecE;protein_id=YP_177743.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 734254 734970 . + . ID=gene-Rv0639;Dbxref=GeneID:888039;Name=nusG;gbkey=Gene;gene=nusG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0639
+NC_000962.3 RefSeq CDS 734254 734970 . + 0 ID=cds-NP_215153.1;Parent=gene-Rv0639;Dbxref=Genbank:NP_215153.1,GeneID:888039;Name=NP_215153.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nusG;inference=protein motif:PROSITE:PS01014;locus_tag=Rv0639;product=transcription termination/antitermination protein NusG;protein_id=NP_215153.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 735022 735450 . + . ID=gene-Rv0640;Dbxref=GeneID:888045;Name=rplK;gbkey=Gene;gene=rplK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0640
+NC_000962.3 RefSeq CDS 735022 735450 . + 0 ID=cds-NP_215154.1;Parent=gene-Rv0640;Dbxref=Genbank:NP_215154.1,GeneID:888045;Name=NP_215154.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplK;inference=protein motif:PROSITE:PS00359;locus_tag=Rv0640;product=50S ribosomal protein L11;protein_id=NP_215154.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 735517 736224 . + . ID=gene-Rv0641;Dbxref=GeneID:888043;Name=rplA;gbkey=Gene;gene=rplA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0641
+NC_000962.3 RefSeq CDS 735517 736224 . + 0 ID=cds-NP_215155.1;Parent=gene-Rv0641;Dbxref=Genbank:NP_215155.1,GeneID:888043;Name=NP_215155.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplA;locus_tag=Rv0641;product=50S ribosomal protein L1;protein_id=NP_215155.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 736298 737203 . - . ID=gene-Rv0642c;Dbxref=GeneID:888056;Name=mmaA4;gbkey=Gene;gene=mmaA4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0642c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 736298 737203 . - 0 ID=cds-NP_215156.1;Parent=gene-Rv0642c;Dbxref=Genbank:NP_215156.1,GeneID:888056;Name=NP_215156.1;Note=methyl mycolic acid synthase 4 (MMA4) (hydroxy mycolic acid synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18535659];gbkey=CDS;gene=mmaA4;locus_tag=Rv0642c;product=hydroxymycolate synthase MmaA4;protein_id=NP_215156.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 737268 738149 . - . ID=gene-Rv0643c;Dbxref=GeneID:888058;Name=mmaA3;gbkey=Gene;gene=mmaA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0643c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 737268 738149 . - 0 ID=cds-NP_215157.1;Parent=gene-Rv0643c;Dbxref=Genbank:NP_215157.1,GeneID:888058;Name=NP_215157.1;Note=methyl mycolic acid synthase 3 (MMA3) (hydroxy mycolic acid synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:10852869];gbkey=CDS;gene=mmaA3;locus_tag=Rv0643c;product=methoxy mycolic acid synthase MmaA3;protein_id=NP_215157.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 738297 739160 . - . ID=gene-Rv0644c;Dbxref=GeneID:888061;Name=mmaA2;gbkey=Gene;gene=mmaA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0644c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 738297 739160 . - 0 ID=cds-NP_215158.1;Parent=gene-Rv0644c;Dbxref=Genbank:NP_215158.1,GeneID:888061;Name=NP_215158.1;Note=methyl mycolic acid synthase 2 (MMA2) (hydroxy mycolic acid synthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mmaA2;locus_tag=Rv0644c;product=cyclopropane mycolic acid synthase CmaA;protein_id=NP_215158.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 739327 740187 . - . ID=gene-Rv0645c;Dbxref=GeneID:888060;Name=mmaA1;gbkey=Gene;gene=mmaA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0645c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 739327 740187 . - 0 ID=cds-NP_215159.1;Parent=gene-Rv0645c;Dbxref=Genbank:NP_215159.1,GeneID:888060;Name=NP_215159.1;Note=methyl mycolic acid synthase 1 (MMA1) (hydroxy mycolic acid synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:9092547];gbkey=CDS;gene=mmaA1;locus_tag=Rv0645c;product=mycolic acid methyltransferase MmaA1;protein_id=NP_215159.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 740234 741139 . - . ID=gene-Rv0646c;Dbxref=GeneID:888065;Name=lipG;gbkey=Gene;gene=lipG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0646c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 740234 741139 . - 0 ID=cds-NP_215160.1;Parent=gene-Rv0646c;Dbxref=Genbank:NP_215160.1,GeneID:888065;Name=NP_215160.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;gene=lipG;locus_tag=Rv0646c;product=lipase/esterase LipG;protein_id=NP_215160.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 741151 742617 . - . ID=gene-Rv0647c;Dbxref=GeneID:888070;Name=Rv0647c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0647c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 741151 742617 . - 0 ID=cds-NP_215161.1;Parent=gene-Rv0647c;Dbxref=Genbank:NP_215161.1,GeneID:888070;Name=NP_215161.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0647c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215161.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 742719 746366 . + . ID=gene-Rv0648;Dbxref=GeneID:888048;Name=Rv0648;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0648
+NC_000962.3 RefSeq CDS 742719 746366 . + 0 ID=cds-NP_215162.1;Parent=gene-Rv0648;Dbxref=Genbank:NP_215162.1,GeneID:888048;Name=NP_215162.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00659;locus_tag=Rv0648;product=alpha-mannosidase;protein_id=NP_215162.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 746363 747037 . + . ID=gene-Rv0649;Dbxref=GeneID:888079;Name=fabD2;gbkey=Gene;gene=fabD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0649
+NC_000962.3 RefSeq CDS 746363 747037 . + 0 ID=cds-YP_177744.1;Parent=gene-Rv0649;Dbxref=Genbank:YP_177744.1,GeneID:888079;Name=YP_177744.1;gbkey=CDS;gene=fabD2;locus_tag=Rv0649;product=malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase;protein_id=YP_177744.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 747037 747945 . + . ID=gene-Rv0650;Dbxref=GeneID:888082;Name=Rv0650;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0650
+NC_000962.3 RefSeq CDS 747037 747945 . + 0 ID=cds-NP_215164.1;Parent=gene-Rv0650;Dbxref=Genbank:NP_215164.1,GeneID:888082;Name=NP_215164.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01125;locus_tag=Rv0650;product=sugar kinase;protein_id=NP_215164.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 748276 748812 . + . ID=gene-Rv0651;Dbxref=GeneID:888049;Name=rplJ;gbkey=Gene;gene=rplJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0651
+NC_000962.3 RefSeq CDS 748276 748812 . + 0 ID=cds-NP_215165.1;Parent=gene-Rv0651;Dbxref=Genbank:NP_215165.1,GeneID:888049;Name=NP_215165.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplJ;locus_tag=Rv0651;product=50S ribosomal protein L10;protein_id=NP_215165.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 748849 749241 . + . ID=gene-Rv0652;Dbxref=GeneID:888078;Name=rplL;gbkey=Gene;gene=rplL;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=L7|L12;locus_tag=Rv0652
+NC_000962.3 RefSeq CDS 748849 749241 . + 0 ID=cds-NP_215166.1;Parent=gene-Rv0652;Dbxref=Genbank:NP_215166.1,GeneID:888078;Name=NP_215166.1;Note=alternate gene name: L7|L12;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rplL;locus_tag=Rv0652;product=50S ribosomal protein L7/L12;protein_id=NP_215166.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 749234 749929 . - . ID=gene-Rv0653c;Dbxref=GeneID:888087;Name=Rv0653c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0653c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 749234 749929 . - 0 ID=cds-NP_215167.1;Parent=gene-Rv0653c;Dbxref=Genbank:NP_215167.1,GeneID:888087;Name=NP_215167.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0653c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215167.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 750000 751505 . + . ID=gene-Rv0654;Dbxref=GeneID:888089;Name=Rv0654;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0654
+NC_000962.3 RefSeq CDS 750000 751505 . + 0 ID=cds-NP_215168.1;Parent=gene-Rv0654;Dbxref=Genbank:NP_215168.1,GeneID:888089;Name=NP_215168.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20929460];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0654;product=carotenoid cleavage oxygenase;protein_id=NP_215168.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 751517 752596 . + . ID=gene-Rv0655;Dbxref=GeneID:888081;Name=mkl;gbkey=Gene;gene=mkl;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0655
+NC_000962.3 RefSeq CDS 751517 752596 . + 0 ID=cds-NP_215169.1;Parent=gene-Rv0655;Dbxref=Genbank:NP_215169.1,GeneID:888081;Name=NP_215169.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mkl;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv0655;product=ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_215169.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 752984 753367 . - . ID=gene-Rv0656c;Dbxref=GeneID:888106;Name=vapC6;gbkey=Gene;gene=vapC6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0656c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 752984 753367 . - 0 ID=cds-NP_215170.1;Parent=gene-Rv0656c;Dbxref=Genbank:NP_215170.1,GeneID:888106;Name=NP_215170.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0657c%2Ccontains PIN domain . This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapC6;locus_tag=Rv0656c;product=ribonuclease VapC6;protein_id=NP_215170.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 753462 753617 . - . ID=gene-Rv0657c;Dbxref=GeneID:888077;Name=vapB6;gbkey=Gene;gene=vapB6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0657c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 753462 753617 . - 0 ID=cds-NP_215171.1;Parent=gene-Rv0657c;Dbxref=Genbank:NP_215171.1,GeneID:888077;Name=NP_215171.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0656c . This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapB6;locus_tag=Rv0657c;product=antitoxin VapB6;protein_id=NP_215171.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 753693 754409 . - . ID=gene-Rv0658c;Dbxref=GeneID:888102;Name=Rv0658c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0658c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 753693 754409 . - 0 ID=cds-NP_215172.1;Parent=gene-Rv0658c;Dbxref=Genbank:NP_215172.1,GeneID:888102;Name=NP_215172.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0658c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215172.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 754685 754993 . - . ID=gene-Rv0659c;Dbxref=GeneID:888134;Name=mazF2;gbkey=Gene;gene=mazF2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt4;locus_tag=Rv0659c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 754685 754993 . - 0 ID=cds-NP_215173.1;Parent=gene-Rv0659c;Dbxref=Genbank:NP_215173.1,GeneID:888134;Name=NP_215173.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0660c. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=mazF2;locus_tag=Rv0659c;product=toxin MazF2;protein_id=NP_215173.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 754980 755225 . - . ID=gene-Rv0660c;Dbxref=GeneID:888141;Name=mazE2;gbkey=Gene;gene=mazE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0660c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 754980 755225 . - 0 ID=cds-NP_215174.1;Parent=gene-Rv0660c;Dbxref=Genbank:NP_215174.1,GeneID:888141;Name=NP_215174.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0659c. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=mazE2;locus_tag=Rv0660c;product=antitoxin MazE2;protein_id=NP_215174.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 755335 755772 . - . ID=gene-Rv0661c;Dbxref=GeneID:888143;Name=vapC7;gbkey=Gene;gene=vapC7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0661c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 755335 755772 . - 0 ID=cds-NP_215175.1;Parent=gene-Rv0661c;Dbxref=Genbank:NP_215175.1,GeneID:888143;Name=NP_215175.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0662c%2Ccontains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapC7;locus_tag=Rv0661c;product=ribonuclease VapC7;protein_id=NP_215175.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 755769 756023 . - . ID=gene-Rv0662c;Dbxref=GeneID:888117;Name=vapB7;gbkey=Gene;gene=vapB7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0662c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 755769 756023 . - 0 ID=cds-NP_215176.2;Parent=gene-Rv0662c;Dbxref=Genbank:NP_215176.2,GeneID:888117;Name=NP_215176.2;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0661c . This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=vapB7;locus_tag=Rv0662c;product=antitoxin VapB7;protein_id=NP_215176.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 756137 758500 . + . ID=gene-Rv0663;Dbxref=GeneID:888144;Name=atsD;gbkey=Gene;gene=atsD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0663
+NC_000962.3 RefSeq CDS 756137 758500 . + 0 ID=cds-NP_215177.1;Parent=gene-Rv0663;Dbxref=Genbank:NP_215177.1,GeneID:888144;Name=NP_215177.1;Note=aryl-sulfate sulphohydrolase (arylsulphatase) Belongs to the sulfatase family. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=atsD;inference=protein motif:PROSITE:PS00523;locus_tag=Rv0663;product=arylsulfatase AtsD;protein_id=NP_215177.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 758532 758804 . + . ID=gene-Rv0664;Dbxref=GeneID:888146;Name=vapB8;gbkey=Gene;gene=vapB8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0664
+NC_000962.3 RefSeq CDS 758532 758804 . + 0 ID=cds-NP_215178.1;Parent=gene-Rv0664;Dbxref=Genbank:NP_215178.1,GeneID:888146;Name=NP_215178.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapB8;locus_tag=Rv0664;product=antitoxin VapB8;protein_id=NP_215178.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 758801 759139 . + . ID=gene-Rv0665;Dbxref=GeneID:888149;Name=vapC8;gbkey=Gene;gene=vapC8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0665
+NC_000962.3 RefSeq CDS 758801 759139 . + 0 ID=cds-NP_215179.1;Parent=gene-Rv0665;Dbxref=Genbank:NP_215179.1,GeneID:888149;Name=NP_215179.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0664%2Ccontains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapC8;locus_tag=Rv0665;product=ribonuclease VapC8;protein_id=NP_215179.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 759136 759309 . + . ID=gene-Rv0666;Dbxref=GeneID:888158;Name=Rv0666;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0666
+NC_000962.3 RefSeq CDS 759136 759309 . + 0 ID=cds-NP_215180.1;Parent=gene-Rv0666;Dbxref=Genbank:NP_215180.1,GeneID:888158;Name=NP_215180.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0666;product=membrane protein;protein_id=NP_215180.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 759807 763325 . + . ID=gene-Rv0667;Dbxref=GeneID:888164;Name=rpoB;gbkey=Gene;gene=rpoB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0667
+NC_000962.3 RefSeq CDS 759807 763325 . + 0 ID=cds-NP_215181.1;Parent=gene-Rv0667;Dbxref=Genbank:NP_215181.1,GeneID:888164;Name=NP_215181.1;Note=transcriptase beta chain (RNA polymerase beta subunit);experiment=DESCRIPTION: Mutation analysis[PMID:11146248];gbkey=CDS;gene=rpoB;locus_tag=Rv0667;product=DNA-directed RNA polymerase subunit beta;protein_id=NP_215181.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 763370 767320 . + . ID=gene-Rv0668;Dbxref=GeneID:888177;Name=rpoC;gbkey=Gene;gene=rpoC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0668
+NC_000962.3 RefSeq CDS 763370 767320 . + 0 ID=cds-NP_215182.1;Parent=gene-Rv0668;Dbxref=Genbank:NP_215182.1,GeneID:888177;Name=NP_215182.1;Note=RpoC (transcriptase beta' chain) (RNA polymerase beta' subunit);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpoC;locus_tag=Rv0668;product=DNA-directed RNA polymerase subunit beta';protein_id=NP_215182.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 767684 769597 . - . ID=gene-Rv0669c;Dbxref=GeneID:888181;Name=Rv0669c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0669c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 767684 769597 . - 0 ID=cds-NP_215183.1;Parent=gene-Rv0669c;Dbxref=Genbank:NP_215183.1,GeneID:888181;Name=NP_215183.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10593963];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0669c;product=neutral ceramidase;protein_id=NP_215183.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 769792 770550 . + . ID=gene-Rv0670;Dbxref=GeneID:888190;Name=end;gbkey=Gene;gene=end;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nfo;locus_tag=Rv0670
+NC_000962.3 RefSeq CDS 769792 770550 . + 0 ID=cds-NP_215184.1;Parent=gene-Rv0670;Dbxref=Genbank:NP_215184.1,GeneID:888190;Name=NP_215184.1;Note=End (endodeoxyribonuclease IV) (apurinase). Belongs to the AP endonucleases family 2. Cofactor: binds 3 zinc ions.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=end;inference=protein motif:PROSITE:PS00730;locus_tag=Rv0670;product=endonuclease IV;protein_id=NP_215184.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 770582 771424 . + . ID=gene-Rv0671;Dbxref=GeneID:888194;Name=lpqP;gbkey=Gene;gene=lpqP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0671
+NC_000962.3 RefSeq CDS 770582 771424 . + 0 ID=cds-NP_215185.1;Parent=gene-Rv0671;Dbxref=Genbank:NP_215185.1,GeneID:888194;Name=NP_215185.1;gbkey=CDS;gene=lpqP;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0671;product=lipoprotein LpqP;protein_id=NP_215185.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 771484 773112 . + . ID=gene-Rv0672;Dbxref=GeneID:888198;Name=fadE8;gbkey=Gene;gene=fadE8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0672
+NC_000962.3 RefSeq CDS 771484 773112 . + 0 ID=cds-NP_215186.1;Parent=gene-Rv0672;Dbxref=Genbank:NP_215186.1,GeneID:888198;Name=NP_215186.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=fadE8;inference=protein motif:PROSITE:PS00073;locus_tag=Rv0672;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE8;protein_id=NP_215186.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 773123 774061 . + . ID=gene-Rv0673;Dbxref=GeneID:888175;Name=echA4;gbkey=Gene;gene=echA4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0673
+NC_000962.3 RefSeq CDS 773123 774061 . + 0 ID=cds-NP_215187.1;Parent=gene-Rv0673;Dbxref=Genbank:NP_215187.1,GeneID:888175;Name=NP_215187.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA4;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0673;product=enoyl-CoA hydratase EchA4;protein_id=NP_215187.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 774064 774786 . + . ID=gene-Rv0674;Dbxref=GeneID:888203;Name=Rv0674;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0674
+NC_000962.3 RefSeq CDS 774064 774786 . + 0 ID=cds-NP_215188.1;Parent=gene-Rv0674;Dbxref=Genbank:NP_215188.1,GeneID:888203;Name=NP_215188.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0674;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215188.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 774783 775574 . + . ID=gene-Rv0675;Dbxref=GeneID:888222;Name=echA5;gbkey=Gene;gene=echA5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0675
+NC_000962.3 RefSeq CDS 774783 775574 . + 0 ID=cds-YP_177745.1;Parent=gene-Rv0675;Dbxref=Genbank:YP_177745.1,GeneID:888222;Name=YP_177745.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=echA5;inference=protein motif:PROSITE:PS00166;locus_tag=Rv0675;product=enoyl-CoA hydratase EchA5;protein_id=YP_177745.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 775586 778480 . - . ID=gene-Rv0676c;Dbxref=GeneID:888219;Name=mmpL5;gbkey=Gene;gene=mmpL5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0676c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 775586 778480 . - 0 ID=cds-NP_215190.1;Parent=gene-Rv0676c;Dbxref=Genbank:NP_215190.1,GeneID:888219;Name=NP_215190.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mmpL5;locus_tag=Rv0676c;product=transmembrane transport protein MmpL5;protein_id=NP_215190.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 778477 778905 . - . ID=gene-Rv0677c;Dbxref=GeneID:888233;Name=mmpS5;gbkey=Gene;gene=mmpS5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0677c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 778477 778905 . - 0 ID=cds-NP_215191.1;Parent=gene-Rv0677c;Dbxref=Genbank:NP_215191.1,GeneID:888233;Name=NP_215191.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpS5;locus_tag=Rv0677c;product=membrane protein MmpS5;protein_id=NP_215191.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 778990 779487 . + . ID=gene-Rv0678;Dbxref=GeneID:888235;Name=Rv0678;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0678
+NC_000962.3 RefSeq CDS 778990 779487 . + 0 ID=cds-NP_215192.1;Parent=gene-Rv0678;Dbxref=Genbank:NP_215192.1,GeneID:888235;Name=NP_215192.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0678;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215192.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 786149 786946 . + . ID=gene-Rv0686;Dbxref=GeneID:888271;Name=Rv0686;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0686
+NC_000962.3 RefSeq CDS 786149 786946 . + 0 ID=cds-NP_215200.1;Parent=gene-Rv0686;Dbxref=Genbank:NP_215200.1,GeneID:888271;Name=NP_215200.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0686;product=membrane protein;protein_id=NP_215200.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 787099 787926 . + . ID=gene-Rv0687;Dbxref=GeneID:888279;Name=Rv0687;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0687
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+NC_000962.3 RefSeq gene 787940 789160 . + . ID=gene-Rv0688;Dbxref=GeneID:888280;Name=Rv0688;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0688
+NC_000962.3 RefSeq CDS 787940 789160 . + 0 ID=cds-NP_215202.1;Parent=gene-Rv0688;Dbxref=Genbank:NP_215202.1,GeneID:888280;Name=NP_215202.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0688;product=ferredoxin reductase;protein_id=NP_215202.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 789157 789411 . - . ID=gene-Rv0689c;Dbxref=GeneID:888283;Name=Rv0689c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0689c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 789157 789411 . - 0 ID=cds-NP_215203.1;Parent=gene-Rv0689c;Dbxref=Genbank:NP_215203.1,GeneID:888283;Name=NP_215203.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:18629250];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0689c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215203.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 790024 791073 . - . ID=gene-Rv0690c;Dbxref=GeneID:888292;Name=Rv0690c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0690c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 790024 791073 . - 0 ID=cds-NP_215204.1;Parent=gene-Rv0690c;Dbxref=Genbank:NP_215204.1,GeneID:888292;Name=NP_215204.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0690c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215204.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 791070 791666 . - . ID=gene-Rv0691c;Dbxref=GeneID:888296;Name=Rv0691c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0691c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 791070 791666 . - 0 ID=cds-NP_215205.1;Parent=gene-Rv0691c;Dbxref=Genbank:NP_215205.1,GeneID:888296;Name=NP_215205.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0691c;product=mycofactocin biosynthesis transcriptional regulator MftR;protein_id=NP_215205.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 791757 791846 . + . ID=gene-Rv0691A;Dbxref=GeneID:14515851;Name=Rv0691A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0691A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 791757 791846 . + 0 ID=cds-YP_007409348.2;Parent=gene-Rv0691A;Dbxref=Genbank:YP_007409348.2,GeneID:14515851;Name=YP_007409348.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0691A;product=mycofactocin precursor;protein_id=YP_007409348.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 791831 792160 . + . ID=gene-Rv0692;Dbxref=GeneID:888285;Name=Rv0692;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0692
+NC_000962.3 RefSeq CDS 791831 792160 . + 0 ID=cds-NP_215206.1;Parent=gene-Rv0692;Dbxref=Genbank:NP_215206.1,GeneID:888285;Name=NP_215206.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0692;product=mycofactocin system protein MftB;protein_id=NP_215206.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 792157 793332 . + . ID=gene-Rv0693;Dbxref=GeneID:888302;Name=Rv0693;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0693
+NC_000962.3 RefSeq CDS 792157 793332 . + 0 ID=cds-NP_215207.1;Parent=gene-Rv0693;Dbxref=Genbank:NP_215207.1,GeneID:888302;Name=NP_215207.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0693;product=mycofactocin radical SAM maturase MftC;protein_id=NP_215207.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 793335 794525 . + . ID=gene-Rv0694;Dbxref=GeneID:888310;Name=Rv0694;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0694
+NC_000962.3 RefSeq CDS 793335 794525 . + 0 ID=cds-NP_215208.1;Parent=gene-Rv0694;Dbxref=Genbank:NP_215208.1,GeneID:888310;Name=NP_215208.1;Note=Belongs to the FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenases family.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0694;product=mycofactocin system heme/flavin oxidoreductase MftD;protein_id=NP_215208.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 794715 795470 . + . ID=gene-Rv0695;Dbxref=GeneID:888314;Name=Rv0695;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0695
+NC_000962.3 RefSeq CDS 794715 795470 . + 0 ID=cds-NP_215209.1;Parent=gene-Rv0695;Dbxref=Genbank:NP_215209.1,GeneID:888314;Name=NP_215209.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0695;product=mycofactocin system creatinine amidohydrolase family protein MftE;protein_id=NP_215209.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 795467 795518 . + . ID=id-NC_000962.3:795467..795518;Note=52 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 795519 796931 . + . ID=gene-Rv0696;Dbxref=GeneID:888307;Name=Rv0696;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0696
+NC_000962.3 RefSeq CDS 795519 796931 . + 0 ID=cds-NP_215210.1;Parent=gene-Rv0696;Dbxref=Genbank:NP_215210.1,GeneID:888307;Name=NP_215210.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0696;product=mycofactocin biosynthesis glycosyltransferase MftF;protein_id=NP_215210.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 796933 798372 . + . ID=gene-Rv0697;Dbxref=GeneID:888316;Name=Rv0697;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0697
+NC_000962.3 RefSeq CDS 796933 798372 . + 0 ID=cds-NP_215211.1;Parent=gene-Rv0697;Dbxref=Genbank:NP_215211.1,GeneID:888316;Name=NP_215211.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0697;product=dehydrogenase;protein_id=NP_215211.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 798833 799444 . + . ID=gene-Rv0698;Dbxref=GeneID:888327;Name=Rv0698;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0698
+NC_000962.3 RefSeq CDS 798833 799444 . + 0 ID=cds-NP_215212.1;Parent=gene-Rv0698;Dbxref=Genbank:NP_215212.1,GeneID:888327;Name=NP_215212.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0698;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215212.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 799629 799850 . + . ID=gene-Rv0699;Dbxref=GeneID:888335;Name=Rv0699;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0699
+NC_000962.3 RefSeq CDS 799629 799850 . + 0 ID=cds-NP_215213.1;Parent=gene-Rv0699;Dbxref=Genbank:NP_215213.1,GeneID:888335;Name=NP_215213.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0699;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215213.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 800487 800792 . + . ID=gene-Rv0700;Dbxref=GeneID:888331;Name=rpsJ;gbkey=Gene;gene=rpsJ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nusE;locus_tag=Rv0700
+NC_000962.3 RefSeq CDS 800487 800792 . + 0 ID=cds-NP_215214.1;Parent=gene-Rv0700;Dbxref=Genbank:NP_215214.1,GeneID:888331;Name=NP_215214.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsJ;inference=protein motif:PROSITE:PS00361;locus_tag=Rv0700;product=30S ribosomal protein S10;protein_id=NP_215214.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 800809 801462 . + . ID=gene-Rv0701;Dbxref=GeneID:888343;Name=rplC;gbkey=Gene;gene=rplC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0701
+NC_000962.3 RefSeq CDS 800809 801462 . + 0 ID=cds-NP_215215.1;Parent=gene-Rv0701;Dbxref=Genbank:NP_215215.1,GeneID:888343;Name=NP_215215.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rplC;inference=protein motif:PROSITE:PS00474;locus_tag=Rv0701;product=50S ribosomal protein L3;protein_id=NP_215215.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 801462 802133 . + . ID=gene-Rv0702;Dbxref=GeneID:888345;Name=rplD;gbkey=Gene;gene=rplD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0702
+NC_000962.3 RefSeq CDS 801462 802133 . + 0 ID=cds-NP_215216.1;Parent=gene-Rv0702;Dbxref=Genbank:NP_215216.1,GeneID:888345;Name=NP_215216.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplD;locus_tag=Rv0702;product=50S ribosomal protein L4;protein_id=NP_215216.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 802133 802435 . + . ID=gene-Rv0703;Dbxref=GeneID:888353;Name=rplW;gbkey=Gene;gene=rplW;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0703
+NC_000962.3 RefSeq CDS 802133 802435 . + 0 ID=cds-NP_215217.1;Parent=gene-Rv0703;Dbxref=Genbank:NP_215217.1,GeneID:888353;Name=NP_215217.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rplW;inference=protein motif:PROSITE:PS00050;locus_tag=Rv0703;product=50S ribosomal protein L23;protein_id=NP_215217.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 802429 802477 . + . ID=id-NC_000962.3:802429..802477;Note=49 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 802528 803370 . + . ID=gene-Rv0704;Dbxref=GeneID:888341;Name=rplB;gbkey=Gene;gene=rplB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0704
+NC_000962.3 RefSeq CDS 802528 803370 . + 0 ID=cds-NP_215218.1;Parent=gene-Rv0704;Dbxref=Genbank:NP_215218.1,GeneID:888341;Name=NP_215218.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rplB;inference=protein motif:PROSITE:PS00467;locus_tag=Rv0704;product=50S ribosomal protein L2;protein_id=NP_215218.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 803411 803692 . + . ID=gene-Rv0705;Dbxref=GeneID:888356;Name=rpsS;gbkey=Gene;gene=rpsS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0705
+NC_000962.3 RefSeq CDS 803411 803692 . + 0 ID=cds-NP_215219.1;Parent=gene-Rv0705;Dbxref=Genbank:NP_215219.1,GeneID:888356;Name=NP_215219.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsS;inference=protein motif:PROSITE:PS00323;locus_tag=Rv0705;product=30S ribosomal protein S19;protein_id=NP_215219.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 803689 804282 . + . ID=gene-Rv0706;Dbxref=GeneID:888359;Name=rplV;gbkey=Gene;gene=rplV;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0706
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+NC_000962.3 RefSeq gene 804282 805106 . + . ID=gene-Rv0707;Dbxref=GeneID:888357;Name=rpsC;gbkey=Gene;gene=rpsC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0707
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+NC_000962.3 RefSeq gene 812059 812622 . + . ID=gene-Rv0716;Dbxref=GeneID:888400;Name=rplE;gbkey=Gene;gene=rplE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0716
+NC_000962.3 RefSeq CDS 812059 812622 . + 0 ID=cds-NP_215230.1;Parent=gene-Rv0716;Dbxref=Genbank:NP_215230.1,GeneID:888400;Name=NP_215230.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplE;locus_tag=Rv0716;product=50S ribosomal protein L5;protein_id=NP_215230.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 812627 812812 . + . ID=gene-Rv0717;Dbxref=GeneID:888414;Name=rpsN1;gbkey=Gene;gene=rpsN1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rpsN;locus_tag=Rv0717
+NC_000962.3 RefSeq CDS 812627 812812 . + 0 ID=cds-YP_177747.1;Parent=gene-Rv0717;Dbxref=Genbank:YP_177747.1,GeneID:888414;Name=YP_177747.1;Note=type Z;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rpsN1;inference=protein motif:PROSITE:PS00527;locus_tag=Rv0717;product=30S ribosomal protein S14;protein_id=YP_177747.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 812835 812921 . + . ID=id-NC_000962.3:812835..812921;Note=87 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 812922 812975 . + . ID=id-NC_000962.3:812922..812975;Note=54 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 812976 813374 . + . ID=gene-Rv0718;Dbxref=GeneID:888424;Name=rpsH;gbkey=Gene;gene=rpsH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0718
+NC_000962.3 RefSeq CDS 812976 813374 . + 0 ID=cds-NP_215232.1;Parent=gene-Rv0718;Dbxref=Genbank:NP_215232.1,GeneID:888424;Name=NP_215232.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpsH;inference=protein motif:PROSITE:PS00053;locus_tag=Rv0718;product=30S ribosomal protein S8;protein_id=NP_215232.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 813398 813937 . + . ID=gene-Rv0719;Dbxref=GeneID:888433;Name=rplF;gbkey=Gene;gene=rplF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0719
+NC_000962.3 RefSeq CDS 813398 813937 . + 0 ID=cds-NP_215233.1;Parent=gene-Rv0719;Dbxref=Genbank:NP_215233.1,GeneID:888433;Name=NP_215233.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplF;inference=protein motif:PROSITE:PS00525;locus_tag=Rv0719;product=50S ribosomal protein L6;protein_id=NP_215233.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 813940 814308 . + . ID=gene-Rv0720;Dbxref=GeneID:888457;Name=rplR;gbkey=Gene;gene=rplR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0720
+NC_000962.3 RefSeq CDS 813940 814308 . + 0 ID=cds-NP_215234.1;Parent=gene-Rv0720;Dbxref=Genbank:NP_215234.1,GeneID:888457;Name=NP_215234.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rplR;locus_tag=Rv0720;product=50S ribosomal protein L18;protein_id=NP_215234.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 814328 814990 . + . ID=gene-Rv0721;Dbxref=GeneID:888465;Name=rpsE;gbkey=Gene;gene=rpsE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0721
+NC_000962.3 RefSeq CDS 814328 814990 . + 0 ID=cds-NP_215235.1;Parent=gene-Rv0721;Dbxref=Genbank:NP_215235.1,GeneID:888465;Name=NP_215235.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpsE;inference=protein motif:PROSITE:PS00589;locus_tag=Rv0721;product=30S ribosomal protein S5;protein_id=NP_215235.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 814993 815190 . + . ID=gene-Rv0722;Dbxref=GeneID:888505;Name=rpmD;gbkey=Gene;gene=rpmD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0722
+NC_000962.3 RefSeq CDS 814993 815190 . + 0 ID=cds-NP_215236.1;Parent=gene-Rv0722;Dbxref=Genbank:NP_215236.1,GeneID:888505;Name=NP_215236.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpmD;locus_tag=Rv0722;product=50S ribosomal protein L30;protein_id=NP_215236.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 815190 815630 . + . ID=gene-Rv0723;Dbxref=GeneID:888531;Name=rplO;gbkey=Gene;gene=rplO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0723
+NC_000962.3 RefSeq CDS 815190 815630 . + 0 ID=cds-NP_215237.1;Parent=gene-Rv0723;Dbxref=Genbank:NP_215237.1,GeneID:888531;Name=NP_215237.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplO;inference=protein motif:PROSITE:PS00475;locus_tag=Rv0723;product=50S ribosomal protein L15;protein_id=NP_215237.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 815663 817534 . + . ID=gene-Rv0724;Dbxref=GeneID:888535;Name=sppA;gbkey=Gene;gene=sppA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0724
+NC_000962.3 RefSeq CDS 815663 817534 . + 0 ID=cds-NP_215238.1;Parent=gene-Rv0724;Dbxref=Genbank:NP_215238.1,GeneID:888535;Name=NP_215238.1;Note=endopeptidase IV (signal peptide peptidase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sppA;locus_tag=Rv0724;product=protease IV SppA;protein_id=NP_215238.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 817539 818444 . - . ID=gene-Rv0725c;Dbxref=GeneID:888447;Name=Rv0725c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0725c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 817539 818444 . - 0 ID=cds-NP_215239.1;Parent=gene-Rv0725c;Dbxref=Genbank:NP_215239.1,GeneID:888447;Name=NP_215239.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0725c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215239.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 818537 819640 . - . ID=gene-Rv0726c;Dbxref=GeneID:888552;Name=Rv0726c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0726c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 818537 819640 . - 0 ID=cds-NP_215240.1;Parent=gene-Rv0726c;Dbxref=Genbank:NP_215240.1,GeneID:888552;Name=NP_215240.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0726c;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_215240.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 819843 820499 . - . ID=gene-Rv0727c;Dbxref=GeneID:888550;Name=fucA;gbkey=Gene;gene=fucA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0727c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 819843 820499 . - 0 ID=cds-NP_215241.1;Parent=gene-Rv0727c;Dbxref=Genbank:NP_215241.1,GeneID:888550;Name=NP_215241.1;Note=Belongs to the aldolase class II family%2C ARAD/FUCA subfamily. Cofactor: binds one zinc ion per molecule.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fucA;locus_tag=Rv0727c;product=L-fuculose phosphate aldolase FucA;protein_id=NP_215241.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 820496 821476 . - . ID=gene-Rv0728c;Dbxref=GeneID:888555;Name=serA2;gbkey=Gene;gene=serA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0728c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 820496 821476 . - 0 ID=cds-NP_215242.1;Parent=gene-Rv0728c;Dbxref=Genbank:NP_215242.1,GeneID:888555;Name=NP_215242.1;gbkey=CDS;gene=serA2;locus_tag=Rv0728c;product=D-3-phosphoglycerate dehydrogenase SerA;protein_id=NP_215242.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 821507 822853 . + . ID=gene-Rv0729;Dbxref=GeneID:888548;Name=xylB;gbkey=Gene;gene=xylB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0729
+NC_000962.3 RefSeq CDS 821507 822853 . + 0 ID=cds-NP_215243.1;Parent=gene-Rv0729;Dbxref=Genbank:NP_215243.1,GeneID:888548;Name=NP_215243.1;Note=xylulokinase) (xylulose kinase) Belongs to the fucokinase / gluconokinase / glycerokinase / xylulokinase family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=xylB;locus_tag=Rv0729;product=D-xylulose kinase XylB;protein_id=NP_215243.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 822866 823594 . + . ID=gene-Rv0730;Dbxref=GeneID:888558;Name=Rv0730;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0730
+NC_000962.3 RefSeq CDS 822866 823594 . + 0 ID=cds-NP_215244.1;Parent=gene-Rv0730;Dbxref=Genbank:NP_215244.1,GeneID:888558;Name=NP_215244.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0730;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_215244.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 823683 824639 . - . ID=gene-Rv0731c;Dbxref=GeneID:888556;Name=Rv0731c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0731c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 823683 824639 . - 0 ID=cds-NP_215245.1;Parent=gene-Rv0731c;Dbxref=Genbank:NP_215245.1,GeneID:888556;Name=NP_215245.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0731c;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_215245.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 824800 826125 . + . ID=gene-Rv0732;Dbxref=GeneID:888559;Name=secY;gbkey=Gene;gene=secY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0732
+NC_000962.3 RefSeq CDS 824800 826125 . + 0 ID=cds-NP_215246.1;Parent=gene-Rv0732;Dbxref=Genbank:NP_215246.1,GeneID:888559;Name=NP_215246.1;Note=Belongs to the SECE/SEC61-alpha family. Part of the prokaryotic protein translocation apparatus which comprise SECA|Rv3240c%2C SECD|Rv2587c%2C SECE|Rv0638%2C SECF|Rv2586c%2CSECG|Rv1440 and SECY.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=secY;inference=protein motif:PROSITE:PS00756;locus_tag=Rv0732;product=preprotein translocase SecY;protein_id=NP_215246.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 826122 826667 . + . ID=gene-Rv0733;Dbxref=GeneID:888567;Name=adk;gbkey=Gene;gene=adk;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0733
+NC_000962.3 RefSeq CDS 826122 826667 . + 0 ID=cds-NP_215247.1;Parent=gene-Rv0733;Dbxref=Genbank:NP_215247.1,GeneID:888567;Name=NP_215247.1;Note=ATP-AMP transphosphorylase;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:10398370];gbkey=CDS;gene=adk;inference=protein motif:PROSITE:PS00113;locus_tag=Rv0733;product=adenylate kinase;protein_id=NP_215247.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 826670 827470 . + . ID=gene-Rv0734;Dbxref=GeneID:888564;Name=mapA;gbkey=Gene;gene=mapA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=map;locus_tag=Rv0734
+NC_000962.3 RefSeq CDS 826670 827470 . + 0 ID=cds-YP_177748.1;Parent=gene-Rv0734;Dbxref=Genbank:YP_177748.1,GeneID:888564;Name=YP_177748.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:19688379];gbkey=CDS;gene=mapA;locus_tag=Rv0734;product=methionine aminopeptidase;protein_id=YP_177748.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 827543 828076 . + . ID=gene-Rv0735;Dbxref=GeneID:888609;Name=sigL;gbkey=Gene;gene=sigL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0735
+NC_000962.3 RefSeq CDS 827543 828076 . + 0 ID=cds-NP_215249.1;Parent=gene-Rv0735;Dbxref=Genbank:NP_215249.1,GeneID:888609;Name=NP_215249.1;Note=Belongs to the sigma-70 factor family%2C ECF subfamily.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16199577];gbkey=CDS;gene=sigL;inference=protein motif:PROSITE:PS01063;locus_tag=Rv0735;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigL;protein_id=NP_215249.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 828140 828892 . + . ID=gene-Rv0736;Dbxref=GeneID:888611;Name=rslA;gbkey=Gene;gene=rslA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0736
+NC_000962.3 RefSeq CDS 828140 828892 . + 0 ID=cds-NP_215250.1;Parent=gene-Rv0736;Dbxref=Genbank:NP_215250.1,GeneID:888611;Name=NP_215250.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16552079];gbkey=CDS;gene=rslA;locus_tag=Rv0736;product=anti-sigma-L factor RslA;protein_id=NP_215250.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 829207 829704 . + . ID=gene-Rv0737;Dbxref=GeneID:888619;Name=Rv0737;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0737
+NC_000962.3 RefSeq CDS 829207 829704 . + 0 ID=cds-NP_215251.1;Parent=gene-Rv0737;Dbxref=Genbank:NP_215251.1,GeneID:888619;Name=NP_215251.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0737;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215251.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 830062 830610 . + . ID=gene-Rv0738;Dbxref=GeneID:888620;Name=Rv0738;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0738
+NC_000962.3 RefSeq CDS 830062 830610 . + 0 ID=cds-NP_215252.1;Parent=gene-Rv0738;Dbxref=Genbank:NP_215252.1,GeneID:888620;Name=NP_215252.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0738;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215252.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 830855 831661 . + . ID=gene-Rv0739;Dbxref=GeneID:888622;Name=Rv0739;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0739
+NC_000962.3 RefSeq CDS 830855 831661 . + 0 ID=cds-NP_215253.1;Parent=gene-Rv0739;Dbxref=Genbank:NP_215253.1,GeneID:888622;Name=NP_215253.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0739;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215253.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 831776 832303 . + . ID=gene-Rv0740;Dbxref=GeneID:888638;Name=Rv0740;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0740
+NC_000962.3 RefSeq CDS 831776 832303 . + 0 ID=cds-NP_215254.1;Parent=gene-Rv0740;Dbxref=Genbank:NP_215254.1,GeneID:888638;Name=NP_215254.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0740;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215254.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 832352 832868 . + . ID=id-NC_000962.3:832352..832868;Note=IS1557'-1%2C len: 517 nt. Region similar to Insertion sequence IS1557 on MTCY373- (IS1557- 1st copy). This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1557'-1
+NC_000962.3 RefSeq gene 832981 833508 . + . ID=gene-Rv0742;Dbxref=GeneID:888645;Name=Rv0742;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0742
+NC_000962.3 RefSeq CDS 832981 833508 . + 0 ID=cds-YP_177749.1;Parent=gene-Rv0742;Dbxref=Genbank:YP_177749.1,GeneID:888645;Name=YP_177749.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0742;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177749.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 833886 834443 . - . ID=gene-Rv0743c;Dbxref=GeneID:888641;Name=Rv0743c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0743c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 833886 834443 . - 0 ID=cds-NP_215257.1;Parent=gene-Rv0743c;Dbxref=Genbank:NP_215257.1,GeneID:888641;Name=NP_215257.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0743c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215257.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 834440 834946 . - . ID=gene-Rv0744c;Dbxref=GeneID:888648;Name=Rv0744c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0744c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 834440 834946 . - 0 ID=cds-NP_215258.1;Parent=gene-Rv0744c;Dbxref=Genbank:NP_215258.1,GeneID:888648;Name=NP_215258.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0744c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215258.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 835154 835681 . + . ID=gene-Rv0745;Dbxref=GeneID:888595;Name=Rv0745;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0745
+NC_000962.3 RefSeq CDS 835154 835681 . + 0 ID=cds-NP_215259.1;Parent=gene-Rv0745;Dbxref=Genbank:NP_215259.1,GeneID:888595;Name=NP_215259.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0745;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215259.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 835701 838052 . + . ID=gene-Rv0746;Dbxref=GeneID:888664;Name=PE_PGRS9;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0746
+NC_000962.3 RefSeq CDS 835701 838052 . + 0 ID=cds-YP_177750.1;Parent=gene-Rv0746;Dbxref=Genbank:YP_177750.1,GeneID:888664;Name=YP_177750.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS9;locus_tag=Rv0746;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS9;protein_id=YP_177750.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 838451 840856 . + . ID=gene-Rv0747;Dbxref=GeneID:888662;Name=PE_PGRS10;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0747
+NC_000962.3 RefSeq CDS 838451 840856 . + 0 ID=cds-YP_177751.1;Parent=gene-Rv0747;Dbxref=Genbank:YP_177751.1,GeneID:888662;Name=YP_177751.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS10;inference=protein motif:PROSITE:PS00012;locus_tag=Rv0747;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS10;protein_id=YP_177751.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 840947 841204 . + . ID=gene-Rv0748;Dbxref=GeneID:888682;Name=vapB31;gbkey=Gene;gene=vapB31;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0748
+NC_000962.3 RefSeq CDS 840947 841204 . + 0 ID=cds-NP_215262.1;Parent=gene-Rv0748;Dbxref=Genbank:NP_215262.1,GeneID:888682;Name=NP_215262.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0749. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapB31;locus_tag=Rv0748;product=antitoxin VapB31;protein_id=NP_215262.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 841228 841656 . + . ID=gene-Rv0749;Dbxref=GeneID:888681;Name=vapC31;gbkey=Gene;gene=vapC31;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0749
+NC_000962.3 RefSeq CDS 841228 841656 . + 0 ID=cds-NP_215263.1;Parent=gene-Rv0749;Dbxref=Genbank:NP_215263.1,GeneID:888681;Name=NP_215263.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0748%2Ccontains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=vapC31;locus_tag=Rv0749;product=ribonuclease VapC31;protein_id=NP_215263.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 841737 841874 . - . ID=gene-Rv0749A;Dbxref=GeneID:3205052;Name=Rv0749A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0749A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 841737 841874 . - 0 ID=cds-YP_177632.1;Parent=gene-Rv0749A;Dbxref=Genbank:YP_177632.1,GeneID:3205052;Name=YP_177632.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0749A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177632.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 842033 842278 . + . ID=gene-Rv0750;Dbxref=GeneID:888688;Name=Rv0750;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0750
+NC_000962.3 RefSeq CDS 842033 842278 . + 0 ID=cds-NP_215264.1;Parent=gene-Rv0750;Dbxref=Genbank:NP_215264.1,GeneID:888688;Name=NP_215264.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0750;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215264.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 842347 843231 . - . ID=gene-Rv0751c;Dbxref=GeneID:888658;Name=mmsB;gbkey=Gene;gene=mmsB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0751c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 842347 843231 . - 0 ID=cds-NP_215265.1;Parent=gene-Rv0751c;Dbxref=Genbank:NP_215265.1,GeneID:888658;Name=NP_215265.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mmsB;inference=protein motif:PROSITE:PS00895;locus_tag=Rv0751c;product=3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase;protein_id=NP_215265.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 843242 844414 . - . ID=gene-Rv0752c;Dbxref=GeneID:888684;Name=fadE9;gbkey=Gene;gene=fadE9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0752c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 843242 844414 . - 0 ID=cds-NP_215266.1;Parent=gene-Rv0752c;Dbxref=Genbank:NP_215266.1,GeneID:888684;Name=NP_215266.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE9;inference=protein motif:PROSITE:PS00073;locus_tag=Rv0752c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE9;protein_id=NP_215266.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 844421 845953 . - . ID=gene-Rv0753c;Dbxref=GeneID:888707;Name=mmsA;gbkey=Gene;gene=mmsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0753c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 844421 845953 . - 0 ID=cds-NP_215267.1;Parent=gene-Rv0753c;Dbxref=Genbank:NP_215267.1,GeneID:888707;Name=NP_215267.1;Note=Belongs to the aldehyde dehydrogenases family.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mmsA;inference=protein motif:PROSITE:PS00070;locus_tag=Rv0753c;product=methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase;protein_id=NP_215267.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 846159 847913 . + . ID=gene-Rv0754;Dbxref=GeneID:888695;Name=PE_PGRS11;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0754
+NC_000962.3 RefSeq CDS 846159 847913 . + 0 ID=cds-YP_177752.1;Parent=gene-Rv0754;Dbxref=Genbank:YP_177752.1,GeneID:888695;Name=YP_177752.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS11;locus_tag=Rv0754;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS11;protein_id=YP_177752.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 848103 850040 . - . ID=gene-Rv0755c;Dbxref=GeneID:888708;Name=PPE12;gbkey=Gene;gene=PPE12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0755c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 848103 850040 . - 0 ID=cds-YP_177753.1;Parent=gene-Rv0755c;Dbxref=Genbank:YP_177753.1,GeneID:888708;Name=YP_177753.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE12;locus_tag=Rv0755c;product=PPE family protein PPE12;protein_id=YP_177753.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 850642 850713 . - . ID=gene-Rvnt09;Dbxref=GeneID:2700448;Name=thrV;gbkey=Gene;gene=thrV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt09
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 850642 850713 . - . ID=rna-Rvnt09;Parent=gene-Rvnt09;Dbxref=GeneID:2700448;Note=thrV%2C tRNA-Thr%2C anticodon tgt%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(850679..850681));codons=38;gbkey=tRNA;gene=thrV;locus_tag=Rvnt09;product=tRNA-Thr
+NC_000962.3 RefSeq exon 850642 850713 . - . ID=exon-Rvnt09-1;Parent=rna-Rvnt09;Dbxref=GeneID:2700448;Note=thrV%2C tRNA-Thr%2C anticodon tgt%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(850679..850681));codons=38;gbkey=tRNA;gene=thrV;locus_tag=Rvnt09;product=tRNA-Thr
+NC_000962.3 RefSeq gene 850741 851466 . - . ID=gene-Rv0756c;Dbxref=GeneID:888730;Name=Rv0756c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0756c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 850741 851466 . - 0 ID=cds-NP_215270.1;Parent=gene-Rv0756c;Dbxref=Genbank:NP_215270.1,GeneID:888730;Name=NP_215270.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0756c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215270.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 851608 852351 . + . ID=gene-Rv0757;Dbxref=GeneID:888772;Name=phoP;gbkey=Gene;gene=phoP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0757
+NC_000962.3 RefSeq CDS 851608 852351 . + 0 ID=cds-NP_215271.1;Parent=gene-Rv0757;Dbxref=Genbank:NP_215271.1,GeneID:888772;Name=NP_215271.1;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis[PMID:11454210];gbkey=CDS;gene=phoP;locus_tag=Rv0757;product=two component system response transcriptional positive regulator PhoP;protein_id=NP_215271.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 852396 853853 . + . ID=gene-Rv0758;Dbxref=GeneID:888775;Name=phoR;gbkey=Gene;gene=phoR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0758
+NC_000962.3 RefSeq CDS 852396 853853 . + 0 ID=cds-NP_215272.1;Parent=gene-Rv0758;Dbxref=Genbank:NP_215272.1,GeneID:888775;Name=NP_215272.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=phoR;locus_tag=Rv0758;product=two component system response sensor kinase PhoR;protein_id=NP_215272.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 853825 854157 . - . ID=gene-Rv0759c;Dbxref=GeneID:888776;Name=Rv0759c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0759c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 853825 854157 . - 0 ID=cds-NP_215273.3;Parent=gene-Rv0759c;Dbxref=Genbank:NP_215273.3,GeneID:888776;Name=NP_215273.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0759c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215273.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 854267 854686 . - . ID=gene-Rv0760c;Dbxref=GeneID:888784;Name=Rv0760c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0760c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 854699 855826 . - . ID=gene-Rv0761c;Dbxref=GeneID:888738;Name=adhB;gbkey=Gene;gene=adhB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0761c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 868407 869030 . + . ID=gene-Rv0775;Dbxref=GeneID:888899;Name=Rv0775;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0775
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+NC_000962.3 RefSeq gene 868984 869763 . - . ID=gene-Rv0776c;Dbxref=GeneID:888918;Name=Rv0776c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0776c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 871431 872675 . + . ID=gene-Rv0778;Dbxref=GeneID:888913;Name=cyp126;gbkey=Gene;gene=cyp126;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0778
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+NC_000962.3 RefSeq gene 872672 873292 . - . ID=gene-Rv0779c;Dbxref=GeneID:888941;Name=Rv0779c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0779c
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 873343 874236 . + 0 ID=cds-NP_215294.1;Parent=gene-Rv0780;Dbxref=Genbank:NP_215294.1,GeneID:888928;Name=NP_215294.1;Note=SAICAR synthetase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=purC;inference=protein motif:PROSITE:PS01058;locus_tag=Rv0780;product=phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;protein_id=NP_215294.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 878638 879324 . + . ID=gene-Rv0784;Dbxref=GeneID:885863;Name=Rv0784;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0784
+NC_000962.3 RefSeq CDS 878638 879324 . + 0 ID=cds-NP_215298.1;Parent=gene-Rv0784;Dbxref=Genbank:NP_215298.1,GeneID:885863;Name=NP_215298.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:18629250];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0784;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215298.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 879340 881040 . + . ID=gene-Rv0785;Dbxref=GeneID:885864;Name=Rv0785;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0785
+NC_000962.3 RefSeq CDS 879340 881040 . + 0 ID=cds-NP_215299.1;Parent=gene-Rv0785;Dbxref=Genbank:NP_215299.1,GeneID:885864;Name=NP_215299.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0785;product=KsdD-like steroid dehydrogenase;protein_id=NP_215299.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 881075 881713 . - . ID=gene-Rv0786c;Dbxref=GeneID:885615;Name=Rv0786c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0786c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 881075 881713 . - 0 ID=cds-NP_215300.2;Parent=gene-Rv0786c;Dbxref=Genbank:NP_215300.2,GeneID:885615;Name=NP_215300.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0786c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215300.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 881459 882418 . + . ID=gene-Rv0787;Dbxref=GeneID:885468;Name=Rv0787;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0787
+NC_000962.3 RefSeq CDS 881459 882418 . + 0 ID=cds-NP_215301.1;Parent=gene-Rv0787;Dbxref=Genbank:NP_215301.1,GeneID:885468;Name=NP_215301.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0787;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215301.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 882524 882763 . + . ID=gene-Rv0787A;Dbxref=GeneID:886264;Name=Rv0787A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0787A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 882524 882763 . + 0 ID=cds-YP_177755.1;Parent=gene-Rv0787A;Dbxref=Genbank:YP_177755.1,GeneID:886264;Name=YP_177755.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0787A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177755.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 882760 883434 . + . ID=gene-Rv0788;Dbxref=GeneID:885181;Name=purQ;gbkey=Gene;gene=purQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0788
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+NC_000962.3 RefSeq gene 883451 884050 . - . ID=gene-Rv0789c;Dbxref=GeneID:885153;Name=Rv0789c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0789c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 883451 884050 . - 0 ID=cds-NP_215304.1;Parent=gene-Rv0789c;Dbxref=Genbank:NP_215304.1,GeneID:885153;Name=NP_215304.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0789c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215304.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 884072 884800 . - . ID=gene-Rv0790c;Dbxref=GeneID:885253;Name=Rv0790c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0790c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 884072 884800 . - 0 ID=cds-NP_215305.1;Parent=gene-Rv0790c;Dbxref=Genbank:NP_215305.1,GeneID:885253;Name=NP_215305.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0790c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215305.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 884797 885840 . - . ID=gene-Rv0791c;Dbxref=GeneID:885273;Name=Rv0791c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0791c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 884797 885840 . - 0 ID=cds-NP_215306.1;Parent=gene-Rv0791c;Dbxref=Genbank:NP_215306.1,GeneID:885273;Name=NP_215306.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0791c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215306.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 885837 886646 . - . ID=gene-Rv0792c;Dbxref=GeneID:885142;Name=Rv0792c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0792c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 885837 886646 . - 0 ID=cds-NP_215307.1;Parent=gene-Rv0792c;Dbxref=Genbank:NP_215307.1,GeneID:885142;Name=NP_215307.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0792c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215307.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 886719 887024 . + . ID=gene-Rv0793;Dbxref=GeneID:885497;Name=Rv0793;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0793
+NC_000962.3 RefSeq CDS 886719 887024 . + 0 ID=cds-NP_215308.1;Parent=gene-Rv0793;Dbxref=Genbank:NP_215308.1,GeneID:885497;Name=NP_215308.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0793;product=monooxygenase;protein_id=NP_215308.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 887137 888636 . - . ID=gene-Rv0794c;Dbxref=GeneID:885076;Name=Rv0794c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=lpdB;locus_tag=Rv0794c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 887137 888636 . - 0 ID=cds-YP_177756.1;Parent=gene-Rv0794c;Dbxref=Genbank:YP_177756.1,GeneID:885076;Name=YP_177756.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0794c;product=oxidoreductase;protein_id=YP_177756.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 889017 889020 . + . ID=id-NC_000962.3:889017..889020;Note=4 bp direct repeat: GAGG%2C at the right end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 889021 890375 . + . ID=id-NC_000962.3:889021..890375;Note=IS6110-1%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-1
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 889021 889048 . + . ID=id-NC_000962.3:889021..889048;Note=28 bp inverted repeat at the left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 889072 890333 . + . ID=id-NC_000962.3:889072..890333;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Putative transposase for IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 890348 890375 . - . ID=id-NC_000962.3:890348..890375;Note=28 bp inverted repeat at the right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 890376 890379 . + . ID=id-NC_000962.3:890376..890379;Note=4 bp direct repeat: GAGG%2C at the left end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 890388 891482 . + . ID=gene-Rv0797;Dbxref=GeneID:885476;Name=Rv0797;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0797
+NC_000962.3 RefSeq CDS 890388 891482 . + 0 ID=cds-NP_215312.1;Parent=gene-Rv0797;Dbxref=Genbank:NP_215312.1,GeneID:885476;Name=NP_215312.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0797;product=insertion sequence element IS1547 transposase;protein_id=NP_215312.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 890388 891479 . + . ID=id-Rv0797;Dbxref=GeneID:885476;Note=IS1547-1%2C len: 1092 nt. Insertion sequence IS1547.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1547-1
+NC_000962.3 RefSeq gene 891472 892269 . - . ID=gene-Rv0798c;Dbxref=GeneID:885460;Name=cfp29;gbkey=Gene;gene=cfp29;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0798c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 891472 892269 . - 0 ID=cds-NP_215313.1;Parent=gene-Rv0798c;Dbxref=Genbank:NP_215313.1,GeneID:885460;Name=NP_215313.1;Note=Cfp29%2C 29 kDa antigen;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cfp29;locus_tag=Rv0798c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215313.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 892266 893273 . - . ID=gene-Rv0799c;Dbxref=GeneID:885388;Name=Rv0799c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0799c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 892266 893273 . - 0 ID=cds-NP_215314.1;Parent=gene-Rv0799c;Dbxref=Genbank:NP_215314.1,GeneID:885388;Name=NP_215314.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0799c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215314.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 893318 894619 . + . ID=gene-Rv0800;Dbxref=GeneID:885461;Name=pepC;gbkey=Gene;gene=pepC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0800
+NC_000962.3 RefSeq CDS 893318 894619 . + 0 ID=cds-NP_215315.1;Parent=gene-Rv0800;Dbxref=Genbank:NP_215315.1,GeneID:885461;Name=NP_215315.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pepC;locus_tag=Rv0800;product=M18 family aminopeptidase;protein_id=NP_215315.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 894631 894978 . + . ID=gene-Rv0801;Dbxref=GeneID:885376;Name=Rv0801;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0801
+NC_000962.3 RefSeq CDS 894631 894978 . + 0 ID=cds-NP_215316.1;Parent=gene-Rv0801;Dbxref=Genbank:NP_215316.1,GeneID:885376;Name=NP_215316.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0801;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215316.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 894972 895628 . - . ID=gene-Rv0802c;Dbxref=GeneID:885332;Name=Rv0802c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0802c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 894972 895628 . - 0 ID=cds-NP_215317.1;Parent=gene-Rv0802c;Dbxref=Genbank:NP_215317.1,GeneID:885332;Name=NP_215317.1;Note=GNAT (GCN5-like N-acetyltransferase) family;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0802c;product=succinyl-CoA transferase;protein_id=NP_215317.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 895820 898084 . + . ID=gene-Rv0803;Dbxref=GeneID:885358;Name=purL;gbkey=Gene;gene=purL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0803
+NC_000962.3 RefSeq CDS 895820 898084 . + 0 ID=cds-NP_215318.1;Parent=gene-Rv0803;Dbxref=Genbank:NP_215318.1,GeneID:885358;Name=NP_215318.1;Note=FGAM synthase II;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=purL;locus_tag=Rv0803;product=phosphoribosylformylglycinamidine synthase 2;protein_id=NP_215318.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 898081 898710 . + . ID=gene-Rv0804;Dbxref=GeneID:885330;Name=Rv0804;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0804
+NC_000962.3 RefSeq CDS 898081 898710 . + 0 ID=cds-NP_215319.1;Parent=gene-Rv0804;Dbxref=Genbank:NP_215319.1,GeneID:885330;Name=NP_215319.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01151;locus_tag=Rv0804;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215319.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 898831 899787 . + . ID=gene-Rv0805;Dbxref=GeneID:885326;Name=Rv0805;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0805
+NC_000962.3 RefSeq CDS 898831 899787 . + 0 ID=cds-NP_215320.1;Parent=gene-Rv0805;Dbxref=Genbank:NP_215320.1,GeneID:885326;Name=NP_215320.1;Note=Class III Cyclic nucleotide phosphodiesterase (cNMP PDE);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16313172];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0805;product=3'%2C5'-cyclic adenosine monophosphate phosphodiesterase CpdA;protein_id=NP_215320.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 899732 901330 . - . ID=gene-Rv0806c;Dbxref=GeneID:885243;Name=cpsY;gbkey=Gene;gene=cpsY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0806c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 899732 901330 . - 0 ID=cds-NP_215321.1;Parent=gene-Rv0806c;Dbxref=Genbank:NP_215321.1,GeneID:885243;Name=NP_215321.1;Note=galactowaldenase (UDP-galactose-4-epimerase) (uridine diphosphate galactose-4-epimerase) (uridine diphospho-galactose-4-epimerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cpsY;locus_tag=Rv0806c;product=exopolysaccharide phosphotransferase CpsY;protein_id=NP_215321.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 901635 902024 . + . ID=gene-Rv0807;Dbxref=GeneID:885272;Name=Rv0807;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0807
+NC_000962.3 RefSeq CDS 901635 902024 . + 0 ID=cds-NP_215322.1;Parent=gene-Rv0807;Dbxref=Genbank:NP_215322.1,GeneID:885272;Name=NP_215322.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0807;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215322.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 902111 903694 . + . ID=gene-Rv0808;Dbxref=GeneID:885085;Name=purF;gbkey=Gene;gene=purF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0808
+NC_000962.3 RefSeq CDS 902111 903694 . + 0 ID=cds-NP_215323.1;Parent=gene-Rv0808;Dbxref=Genbank:NP_215323.1,GeneID:885085;Name=NP_215323.1;Note=glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase (ATASE) (gpatase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=purF;inference=protein motif:PROSITE:PS00103;locus_tag=Rv0808;product=amidophosphoribosyltransferase;protein_id=NP_215323.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 903725 904819 . + . ID=gene-Rv0809;Dbxref=GeneID:885134;Name=purM;gbkey=Gene;gene=purM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0809
+NC_000962.3 RefSeq CDS 903725 904819 . + 0 ID=cds-NP_215324.1;Parent=gene-Rv0809;Dbxref=Genbank:NP_215324.1,GeneID:885134;Name=NP_215324.1;Note=AIRS (phosphoribosyl-aminoimidazole synthetase) (air synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=purM;locus_tag=Rv0809;product=phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase PurM;protein_id=NP_215324.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 904905 905087 . - . ID=gene-Rv0810c;Dbxref=GeneID:885410;Name=Rv0810c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0810c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 904905 905087 . - 0 ID=cds-NP_215325.1;Parent=gene-Rv0810c;Dbxref=Genbank:NP_215325.1,GeneID:885410;Name=NP_215325.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0810c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215325.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 905234 906340 . - . ID=gene-Rv0811c;Dbxref=GeneID:885401;Name=Rv0811c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0811c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 905234 906340 . - 0 ID=cds-NP_215326.1;Parent=gene-Rv0811c;Dbxref=Genbank:NP_215326.1,GeneID:885401;Name=NP_215326.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0811c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215326.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 906423 907292 . + . ID=gene-Rv0812;Dbxref=GeneID:885397;Name=Rv0812;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=pabC;locus_tag=Rv0812
+NC_000962.3 RefSeq CDS 906423 907292 . + 0 ID=cds-YP_177757.1;Parent=gene-Rv0812;Dbxref=Genbank:YP_177757.1,GeneID:885397;Name=YP_177757.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0812;product=4-amino-4-deoxychorismate lyase;protein_id=YP_177757.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 907338 908018 . - . ID=gene-Rv0813c;Dbxref=GeneID:885395;Name=Rv0813c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0813c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 907338 908018 . - 0 ID=cds-NP_215328.1;Parent=gene-Rv0813c;Dbxref=Genbank:NP_215328.1,GeneID:885395;Name=NP_215328.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0813c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215328.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 908181 908483 . - . ID=gene-Rv0814c;Dbxref=GeneID:885435;Name=Rv0814c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0814c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 908181 908483 . - 0 ID=cds-NP_215329.1;Parent=gene-Rv0814c;Dbxref=Genbank:NP_215329.1,GeneID:885435;Name=NP_215329.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0814c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215329.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 908485 909318 . - . ID=gene-Rv0815c;Dbxref=GeneID:885449;Name=cysA2;gbkey=Gene;gene=cysA2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=sseC4;locus_tag=Rv0815c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 908485 909318 . - 0 ID=cds-NP_215330.1;Parent=gene-Rv0815c;Dbxref=Genbank:NP_215330.1,GeneID:885449;Name=NP_215330.1;Note=rhodanese-like protein (thiosulfate cyanide transsulfurase) (thiosulfate thiotransferase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=cysA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00683;locus_tag=Rv0815c;product=thiosulfate sulfurtransferase CysA;protein_id=NP_215330.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 909611 910033 . - . ID=gene-Rv0816c;Dbxref=GeneID:885087;Name=thiX;gbkey=Gene;gene=thiX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0816c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 909611 910033 . - 0 ID=cds-NP_215331.1;Parent=gene-Rv0816c;Dbxref=Genbank:NP_215331.1,GeneID:885087;Name=NP_215331.1;gbkey=CDS;gene=thiX;locus_tag=Rv0816c;product=thioredoxin ThiX;protein_id=NP_215331.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 910030 910842 . - . ID=gene-Rv0817c;Dbxref=GeneID:885440;Name=Rv0817c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0817c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 910030 910842 . - 0 ID=cds-NP_215332.1;Parent=gene-Rv0817c;Dbxref=Genbank:NP_215332.1,GeneID:885440;Name=NP_215332.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0817c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215332.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 910972 911739 . + . ID=gene-Rv0818;Dbxref=GeneID:885144;Name=Rv0818;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0818
+NC_000962.3 RefSeq CDS 910972 911739 . + 0 ID=cds-NP_215333.1;Parent=gene-Rv0818;Dbxref=Genbank:NP_215333.1,GeneID:885144;Name=NP_215333.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0818;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215333.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 911736 912683 . + . ID=gene-Rv0819;Dbxref=GeneID:885251;Name=mshD;gbkey=Gene;gene=mshD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0819
+NC_000962.3 RefSeq CDS 911736 912683 . + 0 ID=cds-NP_215334.1;Parent=gene-Rv0819;Dbxref=Genbank:NP_215334.1,GeneID:885251;Name=NP_215334.1;Note=acetyltransferase involved in mycothiol synthesis;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:12375100];gbkey=CDS;gene=mshD;locus_tag=Rv0819;product=mycothiol acetyltransferase;protein_id=NP_215334.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 912726 913502 . + . ID=gene-Rv0820;Dbxref=GeneID:885136;Name=phoT;gbkey=Gene;gene=phoT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0820
+NC_000962.3 RefSeq CDS 912726 913502 . + 0 ID=cds-NP_215335.1;Parent=gene-Rv0820;Dbxref=Genbank:NP_215335.1,GeneID:885136;Name=NP_215335.1;gbkey=CDS;gene=phoT;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv0820;product=phosphate ABC transporter ATP-binding protein PhoT;protein_id=NP_215335.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 913558 914199 . - . ID=gene-Rv0821c;Dbxref=GeneID:885270;Name=phoY2;gbkey=Gene;gene=phoY2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0821c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 913558 914199 . - 0 ID=cds-NP_215336.1;Parent=gene-Rv0821c;Dbxref=Genbank:NP_215336.1,GeneID:885270;Name=NP_215336.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=phoY2;locus_tag=Rv0821c;product=phosphate-transport system transcriptional regulator PhoY2;protein_id=NP_215336.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 914257 916311 . - . ID=gene-Rv0822c;Dbxref=GeneID:885374;Name=Rv0822c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0822c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 914257 916311 . - 0 ID=cds-NP_215337.1;Parent=gene-Rv0822c;Dbxref=Genbank:NP_215337.1,GeneID:885374;Name=NP_215337.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00041;locus_tag=Rv0822c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215337.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 916477 917646 . - . ID=gene-Rv0823c;Dbxref=GeneID:885380;Name=Rv0823c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0823c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 916477 917646 . - 0 ID=cds-NP_215338.1;Parent=gene-Rv0823c;Dbxref=Genbank:NP_215338.1,GeneID:885380;Name=NP_215338.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01136;locus_tag=Rv0823c;product=tRNA-dihydrouridine synthase;protein_id=NP_215338.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 917734 918750 . - . ID=gene-Rv0824c;Dbxref=GeneID:885444;Name=desA1;gbkey=Gene;gene=desA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=des;locus_tag=Rv0824c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 917734 918750 . - 0 ID=cds-YP_177758.1;Parent=gene-Rv0824c;Dbxref=Genbank:YP_177758.1,GeneID:885444;Name=YP_177758.1;Note=acyl-[ACP] desaturase (stearoyl-ACP desaturase) (protein Des). Belongs to the fatty acid desaturase family. Cofactor: ferredoxin%2C ferredoxin NADPH reductase%2Cand NADPH.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=desA1;inference=protein motif:PROSITE:PS00225;locus_tag=Rv0824c;product=acyl-ACP desaturase DesA;protein_id=YP_177758.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 918264 918458 . + . ID=gene-RVnc0002;Dbxref=GeneID:14515884;Name=ASdes;gbkey=Gene;gene=ASdes;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0002
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 918264 918458 . + . ID=rna-RVnc0002;Parent=gene-RVnc0002;Dbxref=GeneID:14515884;Note=ASdes%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 918350 and 918365. Alternate 3'-ends at positions 918432 and 918412.;gbkey=ncRNA;gene=ASdes;locus_tag=RVnc0002;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 918264 918458 . + . ID=exon-RVnc0002-1;Parent=rna-RVnc0002;Dbxref=GeneID:14515884;Note=ASdes%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 918350 and 918365. Alternate 3'-ends at positions 918432 and 918412.;gbkey=ncRNA;gene=ASdes;locus_tag=RVnc0002;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 918912 919553 . - . ID=gene-Rv0825c;Dbxref=GeneID:885354;Name=Rv0825c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0825c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 918912 919553 . - 0 ID=cds-NP_215340.1;Parent=gene-Rv0825c;Dbxref=Genbank:NP_215340.1,GeneID:885354;Name=NP_215340.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0825c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215340.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 919634 920689 . + . ID=gene-Rv0826;Dbxref=GeneID:885360;Name=Rv0826;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0826
+NC_000962.3 RefSeq CDS 919634 920689 . + 0 ID=cds-NP_215341.1;Parent=gene-Rv0826;Dbxref=Genbank:NP_215341.1,GeneID:885360;Name=NP_215341.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0826;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215341.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 920741 921133 . - . ID=gene-Rv0827c;Dbxref=GeneID:885375;Name=kmtR;gbkey=Gene;gene=kmtR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0827c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 920741 921133 . - 0 ID=cds-NP_215342.1;Parent=gene-Rv0827c;Dbxref=Genbank:NP_215342.1,GeneID:885375;Name=NP_215342.1;Note=ArsR-SmtB family;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:17726022];gbkey=CDS;gene=kmtR;locus_tag=Rv0827c;product=HTH-type transcriptional regulator KmtR;protein_id=NP_215342.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 921191 921613 . - . ID=gene-Rv0828c;Dbxref=GeneID:885265;Name=Rv0828c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0828c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 921191 921613 . - 0 ID=cds-NP_215343.1;Parent=gene-Rv0828c;Dbxref=Genbank:NP_215343.1,GeneID:885265;Name=NP_215343.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00903;locus_tag=Rv0828c;product=deaminase;protein_id=NP_215343.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 921575 921862 . + . ID=id-NC_000962.3:921575..921862;Note=IS1605'%2C len: 288 nt. Insertion sequence IS1605'.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1605'
+NC_000962.3 RefSeq gene 921970 922875 . + . ID=gene-Rv0830;Dbxref=GeneID:885886;Name=Rv0830;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0830
+NC_000962.3 RefSeq CDS 921970 922875 . + 0 ID=cds-NP_215345.1;Parent=gene-Rv0830;Dbxref=Genbank:NP_215345.1,GeneID:885886;Name=NP_215345.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0830;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_215345.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 922894 923709 . - . ID=gene-Rv0831c;Dbxref=GeneID:885349;Name=Rv0831c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0831c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 922894 923709 . - 0 ID=cds-NP_215346.1;Parent=gene-Rv0831c;Dbxref=Genbank:NP_215346.1,GeneID:885349;Name=NP_215346.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0831c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215346.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 923803 923875 . - . ID=gene-Rvnt10;Dbxref=GeneID:2700435;Name=lysT;gbkey=Gene;gene=lysT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt10
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 923803 923875 . - . ID=rna-Rvnt10;Parent=gene-Rvnt10;Dbxref=GeneID:2700435;Note=lysT%2C tRNA-Lys%2C anticodon ttt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(923840..923842));codons=42;gbkey=tRNA;gene=lysT;locus_tag=Rvnt10;product=tRNA-Lys
+NC_000962.3 RefSeq exon 923803 923875 . - . ID=exon-Rvnt10-1;Parent=rna-Rvnt10;Dbxref=GeneID:2700435;Note=lysT%2C tRNA-Lys%2C anticodon ttt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(923840..923842));codons=42;gbkey=tRNA;gene=lysT;locus_tag=Rvnt10;product=tRNA-Lys
+NC_000962.3 RefSeq gene 923999 924072 . + . ID=gene-Rvnt11;Dbxref=GeneID:2700445;Name=gluT;gbkey=Gene;gene=gluT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt11
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 923999 924072 . + . ID=rna-Rvnt11;Parent=gene-Rvnt11;Dbxref=GeneID:2700445;Note=gluT%2C tRNA-Glu%2C anticodon ttc%2C length %3D 74;anticodon=(pos:924034..924036);codons=58;gbkey=tRNA;gene=gluT;locus_tag=Rvnt11;product=tRNA-Glu
+NC_000962.3 RefSeq exon 923999 924072 . + . ID=exon-Rvnt11-1;Parent=rna-Rvnt11;Dbxref=GeneID:2700445;Note=gluT%2C tRNA-Glu%2C anticodon ttc%2C length %3D 74;anticodon=(pos:924034..924036);codons=58;gbkey=tRNA;gene=gluT;locus_tag=Rvnt11;product=tRNA-Glu
+NC_000962.3 RefSeq gene 924110 924183 . + . ID=gene-Rvnt12;Dbxref=GeneID:2700454;Name=aspT;gbkey=Gene;gene=aspT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt12
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 924110 924183 . + . ID=rna-Rvnt12;Parent=gene-Rvnt12;Dbxref=GeneID:2700454;Note=aspT%2C tRNA-Asp%2C anticodon gtc%2C length %3D 74;anticodon=(pos:924144..924146);codons=57;gbkey=tRNA;gene=aspT;locus_tag=Rvnt12;product=tRNA-Asp
+NC_000962.3 RefSeq exon 924110 924183 . + . ID=exon-Rvnt12-1;Parent=rna-Rvnt12;Dbxref=GeneID:2700454;Note=aspT%2C tRNA-Asp%2C anticodon gtc%2C length %3D 74;anticodon=(pos:924144..924146);codons=57;gbkey=tRNA;gene=aspT;locus_tag=Rvnt12;product=tRNA-Asp
+NC_000962.3 RefSeq gene 924213 924286 . + . ID=gene-Rvnt13;Dbxref=GeneID:2700446;Name=pheU;gbkey=Gene;gene=pheU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt13
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 924213 924286 . + . ID=rna-Rvnt13;Parent=gene-Rvnt13;Dbxref=GeneID:2700446;Note=pheU%2C tRNA-Phe%2C anticodon gaa%2C length %3D 74;anticodon=(pos:924247..924249);codons=1;gbkey=tRNA;gene=pheU;locus_tag=Rvnt13;product=tRNA-Phe
+NC_000962.3 RefSeq exon 924213 924286 . + . ID=exon-Rvnt13-1;Parent=rna-Rvnt13;Dbxref=GeneID:2700446;Note=pheU%2C tRNA-Phe%2C anticodon gaa%2C length %3D 74;anticodon=(pos:924247..924249);codons=1;gbkey=tRNA;gene=pheU;locus_tag=Rvnt13;product=tRNA-Phe
+NC_000962.3 RefSeq gene 924951 925364 . + . ID=gene-Rv0832;Dbxref=GeneID:885236;Name=PE_PGRS12;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0832
+NC_000962.3 RefSeq CDS 924951 925364 . + 0 ID=cds-YP_177759.1;Parent=gene-Rv0832;Dbxref=Genbank:YP_177759.1,GeneID:885236;Name=YP_177759.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS12;locus_tag=Rv0832;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS12;protein_id=YP_177759.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 925361 927610 . + . ID=gene-Rv0833;Dbxref=GeneID:885391;Name=PE_PGRS13;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0833
+NC_000962.3 RefSeq CDS 925361 927610 . + 0 ID=cds-YP_177760.1;Parent=gene-Rv0833;Dbxref=Genbank:YP_177760.1,GeneID:885391;Name=YP_177760.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS13;locus_tag=Rv0833;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS13;protein_id=YP_177760.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 927837 930485 . - . ID=gene-Rv0834c;Dbxref=GeneID:885369;Name=PE_PGRS14;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS14;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0834c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 927837 930485 . - 0 ID=cds-YP_177761.1;Parent=gene-Rv0834c;Dbxref=Genbank:YP_177761.1,GeneID:885369;Name=YP_177761.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS14;locus_tag=Rv0834c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS14;protein_id=YP_177761.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 930953 931597 . + . ID=gene-Rv0835;Dbxref=GeneID:885883;Name=lpqQ;gbkey=Gene;gene=lpqQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0835
+NC_000962.3 RefSeq CDS 930953 931597 . + 0 ID=cds-NP_215350.1;Parent=gene-Rv0835;Dbxref=Genbank:NP_215350.1,GeneID:885883;Name=NP_215350.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lpqQ;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0835;product=lipoprotein LpqQ;protein_id=NP_215350.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 932279 932932 . - . ID=gene-Rv0836c;Dbxref=GeneID:885356;Name=Rv0836c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0836c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 932279 932932 . - 0 ID=cds-NP_215351.1;Parent=gene-Rv0836c;Dbxref=Genbank:NP_215351.1,GeneID:885356;Name=NP_215351.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0836c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215351.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 933003 934031 . - . ID=gene-Rv0837c;Dbxref=GeneID:885109;Name=Rv0837c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0837c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 933003 934031 . - 0 ID=cds-NP_215352.1;Parent=gene-Rv0837c;Dbxref=Genbank:NP_215352.1,GeneID:885109;Name=NP_215352.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0837c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215352.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 934720 935490 . + . ID=gene-Rv0838;Dbxref=GeneID:885417;Name=lpqR;gbkey=Gene;gene=lpqR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0838
+NC_000962.3 RefSeq CDS 934720 935490 . + 0 ID=cds-NP_215353.1;Parent=gene-Rv0838;Dbxref=Genbank:NP_215353.1,GeneID:885417;Name=NP_215353.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqR;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0838;product=lipoprotein LpqR;protein_id=NP_215353.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 935577 936389 . + . ID=gene-Rv0839;Dbxref=GeneID:885255;Name=Rv0839;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0839
+NC_000962.3 RefSeq CDS 935577 936389 . + 0 ID=cds-NP_215354.1;Parent=gene-Rv0839;Dbxref=Genbank:NP_215354.1,GeneID:885255;Name=NP_215354.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0839;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215354.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 936457 937317 . - . ID=gene-Rv0840c;Dbxref=GeneID:885611;Name=pip;gbkey=Gene;gene=pip;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0840c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 936457 937317 . - 0 ID=cds-NP_215355.1;Parent=gene-Rv0840c;Dbxref=Genbank:NP_215355.1,GeneID:885611;Name=NP_215355.1;Note=Pip (prolyl aminopeptidase) (pap). Belongs to peptidase family S33.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=pip;locus_tag=Rv0840c;product=proline iminopeptidase;protein_id=NP_215355.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 937593 937835 . + . ID=gene-Rv0841;Dbxref=GeneID:3205068;Name=Rv0841;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0841
+NC_000962.3 RefSeq CDS 937593 937835 . + 0 ID=cds-YP_177634.1;Parent=gene-Rv0841;Dbxref=Genbank:YP_177634.1,GeneID:3205068;Name=YP_177634.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0841;product=transmembrane protein;protein_id=YP_177634.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 938112 939404 . + . ID=gene-Rv0842;Dbxref=GeneID:885616;Name=Rv0842;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0842
+NC_000962.3 RefSeq CDS 938112 939404 . + 0 ID=cds-NP_215357.1;Parent=gene-Rv0842;Dbxref=Genbank:NP_215357.1,GeneID:885616;Name=NP_215357.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0842;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215357.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 953257 953730 . + 0 ID=cds-NP_215372.2;Parent=gene-Rv0857;Dbxref=Genbank:NP_215372.2,GeneID:885078;Name=NP_215372.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0857;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215372.2;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 955077 956288 . + . ID=gene-Rv0859;Dbxref=GeneID:885774;Name=Rv0859;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0859
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+NC_000962.3 RefSeq gene 956293 958455 . + . ID=gene-Rv0860;Dbxref=GeneID:885799;Name=fadB;gbkey=Gene;gene=fadB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0860
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 960279 960333 . - . ID=id-NC_000962.3:960279..960333;Note=55 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 960342 962612 . - . ID=gene-Rv0862c;Dbxref=GeneID:885413;Name=Rv0862c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0862c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 962599 962880 . + . ID=gene-Rv0863;Dbxref=GeneID:885423;Name=Rv0863;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0863
+NC_000962.3 RefSeq CDS 962680 962880 . + 0 ID=cds-NP_215378.2;Parent=gene-Rv0863;Dbxref=Genbank:NP_215378.2,GeneID:885423;Name=NP_215378.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0863;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215378.2;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 963390 963872 . + . ID=gene-Rv0865;Dbxref=GeneID:885348;Name=mog;gbkey=Gene;gene=mog;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0865
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 963869 964294 . + 0 ID=cds-NP_215381.1;Parent=gene-Rv0866;Dbxref=Genbank:NP_215381.1,GeneID:885431;Name=NP_215381.1;Note=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaE%3B molybdopterin converting factor large subunit (molybdopterin [MPT] converting factor%2C subunit 2);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=moaE2;locus_tag=Rv0866;product=molybdopterin synthase catalytic subunit 2;protein_id=NP_215381.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 964312 965535 . - . ID=gene-Rv0867c;Dbxref=GeneID:885749;Name=rpfA;gbkey=Gene;gene=rpfA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0867c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 964312 965535 . - 0 ID=cds-NP_215382.1;Parent=gene-Rv0867c;Dbxref=Genbank:NP_215382.1,GeneID:885749;Name=NP_215382.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15207486];gbkey=CDS;gene=rpfA;locus_tag=Rv0867c;product=resuscitation-promoting factor RpfA;protein_id=NP_215382.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 965983 966261 . - . ID=gene-Rv0868c;Dbxref=GeneID:885763;Name=moaD2;gbkey=Gene;gene=moaD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0868c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 965983 966261 . - 0 ID=cds-NP_215383.1;Parent=gene-Rv0868c;Dbxref=Genbank:NP_215383.1,GeneID:885763;Name=NP_215383.1;Note=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaD%3B molybdopterin converting factor small subunit (molybdopterin [MPT] converting factor%2C subunit 1);gbkey=CDS;gene=moaD2;locus_tag=Rv0868c;product=cyclic pyranopterin monophosphate synthase;protein_id=NP_215383.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 966265 967347 . - . ID=gene-Rv0869c;Dbxref=GeneID:885773;Name=moaA2;gbkey=Gene;gene=moaA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0869c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 966265 967347 . - 0 ID=cds-NP_215384.1;Parent=gene-Rv0869c;Dbxref=Genbank:NP_215384.1,GeneID:885773;Name=NP_215384.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=moaA2;locus_tag=Rv0869c;product=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaA;protein_id=NP_215384.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 967344 967733 . - . ID=gene-Rv0870c;Dbxref=GeneID:885709;Name=Rv0870c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0870c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 967344 967733 . - 0 ID=cds-NP_215385.1;Parent=gene-Rv0870c;Dbxref=Genbank:NP_215385.1,GeneID:885709;Name=NP_215385.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0870c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215385.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 967898 968305 . + . ID=gene-Rv0871;Dbxref=GeneID:885725;Name=cspB;gbkey=Gene;gene=cspB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0871
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+NC_000962.3 RefSeq gene 968424 970244 . - . ID=gene-Rv0872c;Dbxref=GeneID:885742;Name=PE_PGRS15;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS15;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0872c
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 970505 972457 . + 0 ID=cds-NP_215388.1;Parent=gene-Rv0873;Dbxref=Genbank:NP_215388.1,GeneID:885636;Name=NP_215388.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE10;locus_tag=Rv0873;product=acyl-CoA dehydrogenase;protein_id=NP_215388.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 972546 973706 . - 0 ID=cds-NP_215389.1;Parent=gene-Rv0874c;Dbxref=Genbank:NP_215389.1,GeneID:885658;Name=NP_215389.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0874c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215389.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 973806 974294 . - 0 ID=cds-NP_215390.1;Parent=gene-Rv0875c;Dbxref=Genbank:NP_215390.1,GeneID:885669;Name=NP_215390.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0875c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215390.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 974291 975937 . - . ID=gene-Rv0876c;Dbxref=GeneID:885562;Name=Rv0876c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0876c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 974291 975937 . - 0 ID=cds-NP_215391.1;Parent=gene-Rv0876c;Dbxref=Genbank:NP_215391.1,GeneID:885562;Name=NP_215391.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0876c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215391.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 976075 976863 . + . ID=gene-Rv0877;Dbxref=GeneID:885601;Name=Rv0877;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0877
+NC_000962.3 RefSeq CDS 976075 976863 . + 0 ID=cds-NP_215392.1;Parent=gene-Rv0877;Dbxref=Genbank:NP_215392.1,GeneID:885601;Name=NP_215392.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0877;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215392.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 976872 978203 . - . ID=gene-Rv0878c;Dbxref=GeneID:885617;Name=PPE13;gbkey=Gene;gene=PPE13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0878c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 978481 978756 . - . ID=gene-Rv0879c;Dbxref=GeneID:885095;Name=Rv0879c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0879c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 978481 978756 . - 0 ID=cds-NP_215394.1;Parent=gene-Rv0879c;Dbxref=Genbank:NP_215394.1,GeneID:885095;Name=NP_215394.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0879c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215394.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 978934 979365 . + . ID=gene-Rv0880;Dbxref=GeneID:885205;Name=Rv0880;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0880
+NC_000962.3 RefSeq CDS 978934 979365 . + 0 ID=cds-NP_215395.1;Parent=gene-Rv0880;Dbxref=Genbank:NP_215395.1,GeneID:885205;Name=NP_215395.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0880;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_215395.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 979362 980228 . + . ID=gene-Rv0881;Dbxref=GeneID:885121;Name=Rv0881;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0881
+NC_000962.3 RefSeq CDS 979362 980228 . + 0 ID=cds-NP_215396.1;Parent=gene-Rv0881;Dbxref=Genbank:NP_215396.1,GeneID:885121;Name=NP_215396.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0881;product=tRNA/rRNA methyltransferase;protein_id=NP_215396.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 980225 980509 . + . ID=gene-Rv0882;Dbxref=GeneID:885248;Name=Rv0882;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0882
+NC_000962.3 RefSeq CDS 980225 980509 . + 0 ID=cds-NP_215397.1;Parent=gene-Rv0882;Dbxref=Genbank:NP_215397.1,GeneID:885248;Name=NP_215397.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0882;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215397.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 980506 981267 . - . ID=gene-Rv0883c;Dbxref=GeneID:885139;Name=Rv0883c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0883c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 980506 981267 . - 0 ID=cds-NP_215398.1;Parent=gene-Rv0883c;Dbxref=Genbank:NP_215398.1,GeneID:885139;Name=NP_215398.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0883c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215398.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 981424 982554 . - . ID=gene-Rv0884c;Dbxref=GeneID:885140;Name=serC;gbkey=Gene;gene=serC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0884c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 981424 982554 . - 0 ID=cds-NP_215399.1;Parent=gene-Rv0884c;Dbxref=Genbank:NP_215399.1,GeneID:885140;Name=NP_215399.1;Note=Belongs to class-V of pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferases. Cofactor: pyridoxal phosphate.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=serC;locus_tag=Rv0884c;product=phosphoserine aminotransferase;protein_id=NP_215399.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 982762 983784 . + . ID=gene-Rv0885;Dbxref=GeneID:885285;Name=Rv0885;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0885
+NC_000962.3 RefSeq CDS 982762 983784 . + 0 ID=cds-NP_215400.1;Parent=gene-Rv0885;Dbxref=Genbank:NP_215400.1,GeneID:885285;Name=NP_215400.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0885;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215400.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 983803 985530 . + . ID=gene-Rv0886;Dbxref=GeneID:885195;Name=fprB;gbkey=Gene;gene=fprB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0886
+NC_000962.3 RefSeq CDS 983803 985530 . + 0 ID=cds-NP_215401.1;Parent=gene-Rv0886;Dbxref=Genbank:NP_215401.1,GeneID:885195;Name=NP_215401.1;Note=adrenodoxin reductase (AR) (ferredoxin-NADP(+) reductase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=fprB;inference=protein motif:PROSITE:PS00198;locus_tag=Rv0886;product=ferredoxin/ferredoxin--NADP reductase;protein_id=NP_215401.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 985513 985971 . - . ID=gene-Rv0887c;Dbxref=GeneID:885113;Name=Rv0887c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0887c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 985513 985971 . - 0 ID=cds-NP_215402.1;Parent=gene-Rv0887c;Dbxref=Genbank:NP_215402.1,GeneID:885113;Name=NP_215402.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0887c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215402.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 987233 988705 . + . ID=gene-Rv0888;Dbxref=GeneID:885210;Name=Rv0888;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0888
+NC_000962.3 RefSeq CDS 987233 988705 . + 0 ID=cds-NP_215403.1;Parent=gene-Rv0888;Dbxref=Genbank:NP_215403.1,GeneID:885210;Name=NP_215403.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0888;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215403.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 988740 989861 . - . ID=gene-Rv0889c;Dbxref=GeneID:885466;Name=citA;gbkey=Gene;gene=citA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gltA;locus_tag=Rv0889c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 988740 989861 . - 0 ID=cds-NP_215404.1;Parent=gene-Rv0889c;Dbxref=Genbank:NP_215404.1,GeneID:885466;Name=NP_215404.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=citA;inference=protein motif:PROSITE:PS00480;locus_tag=Rv0889c;product=citrate synthase 2;protein_id=NP_215404.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 989948 992596 . - . ID=gene-Rv0890c;Dbxref=GeneID:885227;Name=Rv0890c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0890c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 989948 992596 . - 0 ID=cds-NP_215405.1;Parent=gene-Rv0890c;Dbxref=Genbank:NP_215405.1,GeneID:885227;Name=NP_215405.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00622;locus_tag=Rv0890c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_215405.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 992598 993455 . - . ID=gene-Rv0891c;Dbxref=GeneID:885493;Name=Rv0891c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0891c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 992598 993455 . - 0 ID=cds-NP_215406.1;Parent=gene-Rv0891c;Dbxref=Genbank:NP_215406.1,GeneID:885493;Name=NP_215406.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0891c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215406.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 993853 995340 . + . ID=gene-Rv0892;Dbxref=GeneID:885225;Name=Rv0892;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0892
+NC_000962.3 RefSeq CDS 993853 995340 . + 0 ID=cds-NP_215407.1;Parent=gene-Rv0892;Dbxref=Genbank:NP_215407.1,GeneID:885225;Name=NP_215407.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0892;product=monooxygenase;protein_id=NP_215407.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 995318 996295 . - . ID=gene-Rv0893c;Dbxref=GeneID:885477;Name=Rv0893c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0893c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 995318 996295 . - 0 ID=cds-NP_215408.1;Parent=gene-Rv0893c;Dbxref=Genbank:NP_215408.1,GeneID:885477;Name=NP_215408.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0893c;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_215408.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 996524 997705 . + . ID=gene-Rv0894;Dbxref=GeneID:885199;Name=Rv0894;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0894
+NC_000962.3 RefSeq CDS 996524 997705 . + 0 ID=cds-NP_215409.1;Parent=gene-Rv0894;Dbxref=Genbank:NP_215409.1,GeneID:885199;Name=NP_215409.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0894;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215409.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 997782 999299 . + . ID=gene-Rv0895;Dbxref=GeneID:885481;Name=Rv0895;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0895
+NC_000962.3 RefSeq CDS 997782 999299 . + 0 ID=cds-NP_215410.1;Parent=gene-Rv0895;Dbxref=Genbank:NP_215410.1,GeneID:885481;Name=NP_215410.1;Note=triacylglycerol synthase%2C diacylglycerol acyltransferase This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15262939];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0895;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_215410.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 999472 1000767 . + . ID=gene-Rv0896;Dbxref=GeneID:885208;Name=gltA2;gbkey=Gene;gene=gltA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0896
+NC_000962.3 RefSeq CDS 999472 1000767 . + 0 ID=cds-NP_215411.1;Parent=gene-Rv0896;Dbxref=Genbank:NP_215411.1,GeneID:885208;Name=NP_215411.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gltA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00480;locus_tag=Rv0896;product=citrate synthase 1;protein_id=NP_215411.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1000808 1002415 . - . ID=gene-Rv0897c;Dbxref=GeneID:885641;Name=Rv0897c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0897c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1000808 1002415 . - 0 ID=cds-NP_215412.1;Parent=gene-Rv0897c;Dbxref=Genbank:NP_215412.1,GeneID:885641;Name=NP_215412.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0897c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215412.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1002441 1002704 . - . ID=gene-Rv0898c;Dbxref=GeneID:885206;Name=Rv0898c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0898c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1002441 1002704 . - 0 ID=cds-NP_215413.1;Parent=gene-Rv0898c;Dbxref=Genbank:NP_215413.1,GeneID:885206;Name=NP_215413.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0898c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215413.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1002812 1003792 . + . ID=gene-Rv0899;Dbxref=GeneID:885286;Name=arfA;gbkey=Gene;gene=arfA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ompA,ompATb;locus_tag=Rv0899
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1002812 1003792 . + 0 ID=cds-NP_215414.1;Parent=gene-Rv0899;Dbxref=Genbank:NP_215414.1,GeneID:885286;Name=NP_215414.1;Note=outer membrane protein OmpA%3B Pore-forming activity is pH-dependent.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:9657995];gbkey=CDS;gene=arfA;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv0899;product=peptidoglycan-binding protein ArfA;protein_id=NP_215414.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1003805 1003957 . + . ID=gene-Rv0900;Dbxref=GeneID:885179;Name=arfB;gbkey=Gene;gene=arfB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0900
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1003805 1003957 . + 0 ID=cds-NP_215415.1;Parent=gene-Rv0900;Dbxref=Genbank:NP_215415.1,GeneID:885179;Name=NP_215415.1;gbkey=CDS;gene=arfB;locus_tag=Rv0900;product=membrane protein;protein_id=NP_215415.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1003957 1004484 . + . ID=gene-Rv0901;Dbxref=GeneID:885203;Name=arfC;gbkey=Gene;gene=arfC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0901
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1003957 1004484 . + 0 ID=cds-NP_215416.1;Parent=gene-Rv0901;Dbxref=Genbank:NP_215416.1,GeneID:885203;Name=NP_215416.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=arfC;locus_tag=Rv0901;product=membrane protein;protein_id=NP_215416.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1008944 1010062 . + . ID=gene-Rv0906;Dbxref=GeneID:885150;Name=Rv0906;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0906
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1008944 1010062 . + 0 ID=cds-NP_215421.1;Parent=gene-Rv0906;Dbxref=Genbank:NP_215421.1,GeneID:885150;Name=NP_215421.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0906;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215421.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1010136 1011734 . + . ID=gene-Rv0907;Dbxref=GeneID:885146;Name=Rv0907;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0907
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1010136 1011734 . + 0 ID=cds-NP_215422.1;Parent=gene-Rv0907;Dbxref=Genbank:NP_215422.1,GeneID:885146;Name=NP_215422.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0907;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215422.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1011731 1014124 . + . ID=gene-Rv0908;Dbxref=GeneID:885657;Name=ctpE;gbkey=Gene;gene=ctpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0908
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1011731 1014124 . + 0 ID=cds-NP_215423.1;Parent=gene-Rv0908;Dbxref=Genbank:NP_215423.1,GeneID:885657;Name=NP_215423.1;Note=P-type;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=ctpE;inference=protein motif:PROSITE:PS00154;locus_tag=Rv0908;product=metal cation transporter ATPase E;protein_id=NP_215423.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1014681 1014860 . + . ID=gene-Rv0909;Dbxref=GeneID:885197;Name=Rv0909;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0909
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1014681 1014860 . + 0 ID=cds-NP_215424.1;Parent=gene-Rv0909;Dbxref=Genbank:NP_215424.1,GeneID:885197;Name=NP_215424.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0909;product=antitoxin;protein_id=NP_215424.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1014866 1015300 . + . ID=gene-Rv0910;Dbxref=GeneID:885137;Name=Rv0910;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0910
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1014866 1015300 . + 0 ID=cds-NP_215425.1;Parent=gene-Rv0910;Dbxref=Genbank:NP_215425.1,GeneID:885137;Name=NP_215425.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0910;product=toxin;protein_id=NP_215425.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1015398 1016171 . + . ID=gene-Rv0911;Dbxref=GeneID:885093;Name=Rv0911;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0911
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1015398 1016171 . + 0 ID=cds-NP_215426.1;Parent=gene-Rv0911;Dbxref=Genbank:NP_215426.1,GeneID:885093;Name=NP_215426.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0911;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215426.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1016236 1016685 . + . ID=gene-Rv0912;Dbxref=GeneID:885103;Name=Rv0912;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0912
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1016236 1016685 . + 0 ID=cds-NP_215427.1;Parent=gene-Rv0912;Dbxref=Genbank:NP_215427.1,GeneID:885103;Name=NP_215427.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0912;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215427.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1017217 1018725 . - . ID=gene-Rv0913c;Dbxref=GeneID:885042;Name=Rv0913c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0913c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1017217 1018725 . - 0 ID=cds-NP_215428.1;Parent=gene-Rv0913c;Dbxref=Genbank:NP_215428.1,GeneID:885042;Name=NP_215428.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0913c;product=dioxygenase;protein_id=NP_215428.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1018727 1019965 . - . ID=gene-Rv0914c;Dbxref=GeneID:885046;Name=Rv0914c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0914c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1018727 1019965 . - 0 ID=cds-NP_215429.1;Parent=gene-Rv0914c;Dbxref=Genbank:NP_215429.1,GeneID:885046;Name=NP_215429.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0914c;product=lipid carrier protein or keto acyl-CoA thiolase;protein_id=NP_215429.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1020058 1021329 . - . ID=gene-Rv0915c;Dbxref=GeneID:885069;Name=PPE14;gbkey=Gene;gene=PPE14;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=MTB41;locus_tag=Rv0915c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1020058 1021329 . - 0 ID=cds-YP_177765.1;Parent=gene-Rv0915c;Dbxref=Genbank:YP_177765.1,GeneID:885069;Name=YP_177765.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE14;inference=protein motif:PROSITE:PS00626;locus_tag=Rv0915c;product=PPE family protein PPE14;protein_id=YP_177765.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1021344 1021643 . - . ID=gene-Rv0916c;Dbxref=GeneID:885167;Name=PE7;gbkey=Gene;gene=PE7;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=MTB10;locus_tag=Rv0916c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1021344 1021643 . - 0 ID=cds-YP_177766.1;Parent=gene-Rv0916c;Dbxref=Genbank:YP_177766.1,GeneID:885167;Name=YP_177766.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE7;locus_tag=Rv0916c;product=PE family protein PE7;protein_id=YP_177766.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1022087 1023868 . + . ID=gene-Rv0917;Dbxref=GeneID:885172;Name=betP;gbkey=Gene;gene=betP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0917
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1022087 1023868 . + 0 ID=cds-NP_215432.1;Parent=gene-Rv0917;Dbxref=Genbank:NP_215432.1,GeneID:885172;Name=NP_215432.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=betP;locus_tag=Rv0917;product=glycine betaine transport integral membrane protein BetP;protein_id=NP_215432.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1024211 1024687 . + . ID=gene-Rv0918;Dbxref=GeneID:885198;Name=Rv0918;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0918
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1024211 1024687 . + 0 ID=cds-NP_215433.1;Parent=gene-Rv0918;Dbxref=Genbank:NP_215433.1,GeneID:885198;Name=NP_215433.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0918;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215433.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1024684 1025184 . + . ID=gene-Rv0919;Dbxref=GeneID:885221;Name=Rv0919;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0919
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1024684 1025184 . + 0 ID=cds-NP_215434.1;Parent=gene-Rv0919;Dbxref=Genbank:NP_215434.1,GeneID:885221;Name=NP_215434.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0919;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_215434.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1025321 1025393 . - . ID=gene-Rvnt14;Dbxref=GeneID:2700422;Name=argT;gbkey=Gene;gene=argT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt14
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1025321 1025393 . - . ID=rna-Rvnt14;Parent=gene-Rvnt14;Dbxref=GeneID:2700422;Note=argT%2C tRNA-Arg%2C anticodon cct%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(1025358..1025360));codons=47;gbkey=tRNA;gene=argT;locus_tag=Rvnt14;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq exon 1025321 1025393 . - . ID=exon-Rvnt14-1;Parent=rna-Rvnt14;Dbxref=GeneID:2700422;Note=argT%2C tRNA-Arg%2C anticodon cct%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(1025358..1025360));codons=47;gbkey=tRNA;gene=argT;locus_tag=Rvnt14;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1025458 1026893 . - . ID=id-NC_000962.3:1025458..1026893;Note=IS1554%2C len: 1436 nt. Putative Insertion sequence element bounded by 15 bp inverted repeats.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1554
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1025458 1025472 . + . ID=id-NC_000962.3:1025458..1025472;Note=15 bp inverted repeat%2C ATTCGGTGTAAGTGG%2C at the left end of IS1554 element;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1025497 1026816 . - . ID=gene-Rv0920c;Dbxref=GeneID:885549;Name=Rv0920c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0920c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1025497 1026816 . - 0 ID=cds-NP_215435.1;Parent=gene-Rv0920c;Dbxref=Genbank:NP_215435.1,GeneID:885549;Name=NP_215435.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01007;locus_tag=Rv0920c;product=transposase;protein_id=NP_215435.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1026879 1026893 . - . ID=id-NC_000962.3:1026879..1026893;Note=15 bp inverted repeat%2C ATTCGGTGTAAGTGG%2C at the right end of IS1554 element;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1027061 1029360 . + . ID=id-NC_000962.3:1027061..1029360;Note=IS1535%2C len: 2300 nt. Putative Insertion sequence element bounded by 16 bp inverted repeats.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1535
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1027061 1027076 . + . ID=id-NC_000962.3:1027061..1027076;Note=16 bp inverted repeat%2C TTGAGTGTGTTTTAGT%2C at the left end of IS element IS1535;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1027104 1027685 . + . ID=gene-Rv0921;Dbxref=GeneID:885557;Name=Rv0921;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0921
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1027104 1027685 . + 0 ID=cds-NP_215436.1;Parent=gene-Rv0921;Dbxref=Genbank:NP_215436.1,GeneID:885557;Name=NP_215436.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0921;product=resolvase;protein_id=NP_215436.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1027685 1029337 . + . ID=gene-Rv0922;Dbxref=GeneID:885564;Name=Rv0922;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0922
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1027685 1029337 . + 0 ID=cds-NP_215437.1;Parent=gene-Rv0922;Dbxref=Genbank:NP_215437.1,GeneID:885564;Name=NP_215437.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0922;product=transposase;protein_id=NP_215437.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1029345 1029360 . - . ID=id-NC_000962.3:1029345..1029360;Note=16 bp inverted repeat%2C TTGAGTGTGTTTTAGT%2C at the right end of IS element IS1535;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1029513 1030577 . - . ID=gene-Rv0923c;Dbxref=GeneID:885568;Name=Rv0923c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0923c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1029513 1030577 . - 0 ID=cds-NP_215438.1;Parent=gene-Rv0923c;Dbxref=Genbank:NP_215438.1,GeneID:885568;Name=NP_215438.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0923c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215438.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1030578 1031864 . - . ID=gene-Rv0924c;Dbxref=GeneID:885569;Name=mntH;gbkey=Gene;gene=mntH;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=Mramp,Nramp;locus_tag=Rv0924c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1030578 1031864 . - 0 ID=cds-YP_177767.1;Parent=gene-Rv0924c;Dbxref=Genbank:YP_177767.1,GeneID:885569;Name=YP_177767.1;Note=integral membrane protein%2C alternative gene name: Nramp%2C Mramp%2C H+-dependent divalent cation-transport integral membrane protein;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10477555];gbkey=CDS;gene=mntH;locus_tag=Rv0924c;product=divalent metal cation transporter MntH;protein_id=YP_177767.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1031896 1032633 . - . ID=gene-Rv0925c;Dbxref=GeneID:885570;Name=Rv0925c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0925c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1031896 1032633 . - 0 ID=cds-NP_215440.1;Parent=gene-Rv0925c;Dbxref=Genbank:NP_215440.1,GeneID:885570;Name=NP_215440.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0925c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215440.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1032710 1033786 . - . ID=gene-Rv0926c;Dbxref=GeneID:885387;Name=Rv0926c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0926c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1032710 1033786 . - 0 ID=cds-NP_215441.1;Parent=gene-Rv0926c;Dbxref=Genbank:NP_215441.1,GeneID:885387;Name=NP_215441.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0926c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215441.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1033840 1034631 . - . ID=gene-Rv0927c;Dbxref=GeneID:885571;Name=Rv0927c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0927c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1033840 1034631 . - 0 ID=cds-NP_215442.1;Parent=gene-Rv0927c;Dbxref=Genbank:NP_215442.1,GeneID:885571;Name=NP_215442.1;Note=short-chain type dehydrogenase/reductase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv0927c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215442.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1034903 1036015 . + . ID=gene-Rv0928;Dbxref=GeneID:885366;Name=pstS3;gbkey=Gene;gene=pstS3;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=phoS2;locus_tag=Rv0928
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1034903 1036015 . + 0 ID=cds-YP_177768.1;Parent=gene-Rv0928;Dbxref=Genbank:YP_177768.1,GeneID:885366;Name=YP_177768.1;Note=previously known as phoS2%2C phosphate-binding lipoprotein component of inorganic phosphate transport system;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pstS3;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0928;product=phosphate ABC transporter substrate-binding lipoprotein PstS;protein_id=YP_177768.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1036028 1037002 . + . ID=gene-Rv0929;Dbxref=GeneID:885585;Name=pstC2;gbkey=Gene;gene=pstC2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0929
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1036028 1037002 . + 0 ID=cds-NP_215444.1;Parent=gene-Rv0929;Dbxref=Genbank:NP_215444.1,GeneID:885585;Name=NP_215444.1;gbkey=CDS;gene=pstC2;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv0929;product=phosphate ABC transporter permease PstC;protein_id=NP_215444.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1036999 1037925 . + . ID=gene-Rv0930;Dbxref=GeneID:885589;Name=pstA1;gbkey=Gene;gene=pstA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0930
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1036999 1037925 . + 0 ID=cds-NP_215445.2;Parent=gene-Rv0930;Dbxref=Genbank:NP_215445.2,GeneID:885589;Name=NP_215445.2;gbkey=CDS;gene=pstA1;locus_tag=Rv0930;product=phosphate ABC transporter permease PstA;protein_id=NP_215445.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1037920 1039914 . - . ID=gene-Rv0931c;Dbxref=GeneID:885607;Name=pknD;gbkey=Gene;gene=pknD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mbk;locus_tag=Rv0931c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1037920 1039914 . - 0 ID=cds-NP_215446.1;Parent=gene-Rv0931c;Dbxref=Genbank:NP_215446.1,GeneID:885607;Name=NP_215446.1;Note=alternate gene name: mbk (protein kinase D) (STPK D). Belongs to the Ser/Thr family of protein kinases. Experimental studies show evidence of auto-phosphorylation on a serine residue. Appears to be co-transcribed with Rv0932c|pstS2.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pknD;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv0931c;product=serine/threonine-protein kinase PknD;protein_id=NP_215446.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1039936 1041048 . - . ID=gene-Rv0932c;Dbxref=GeneID:885613;Name=pstS2;gbkey=Gene;gene=pstS2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0932c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1039936 1041048 . - 0 ID=cds-YP_177769.1;Parent=gene-Rv0932c;Dbxref=Genbank:YP_177769.1,GeneID:885613;Name=YP_177769.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pstS2;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0932c;product=phosphate ABC transporter substrate-binding lipoprotein PstS;protein_id=YP_177769.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1041264 1042094 . + . ID=gene-Rv0933;Dbxref=GeneID:885653;Name=pstB;gbkey=Gene;gene=pstB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0933
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1041264 1042094 . + 0 ID=cds-NP_215448.1;Parent=gene-Rv0933;Dbxref=Genbank:NP_215448.1,GeneID:885653;Name=NP_215448.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:11567022];gbkey=CDS;gene=pstB;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv0933;product=phosphate ABC transporter ATP-binding protein PstB;protein_id=NP_215448.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1042115 1043239 . + . ID=gene-Rv0934;Dbxref=GeneID:885724;Name=pstS1;gbkey=Gene;gene=pstS1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=phoS,phoS1;locus_tag=Rv0934
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1042115 1043239 . + 0 ID=cds-YP_177770.1;Parent=gene-Rv0934;Dbxref=Genbank:YP_177770.1,GeneID:885724;Name=YP_177770.1;Note=previously known as phoS1 or phoS;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pstS1;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv0934;product=phosphate ABC transporter substrate-binding lipoprotein PstS;protein_id=YP_177770.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1043299 1044315 . + . ID=gene-Rv0935;Dbxref=GeneID:885644;Name=pstC1;gbkey=Gene;gene=pstC1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0935
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1043299 1044315 . + 0 ID=cds-YP_177771.1;Parent=gene-Rv0935;Dbxref=Genbank:YP_177771.1,GeneID:885644;Name=YP_177771.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pstC1;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv0935;product=phosphate ABC transporter permease PstC;protein_id=YP_177771.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1044317 1045222 . + . ID=gene-Rv0936;Dbxref=GeneID:885756;Name=pstA2;gbkey=Gene;gene=pstA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0936
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1044317 1045222 . + 0 ID=cds-NP_215451.1;Parent=gene-Rv0936;Dbxref=Genbank:NP_215451.1,GeneID:885756;Name=NP_215451.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pstA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv0936;product=phosphate ABC transporter permease PstA;protein_id=NP_215451.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1045199 1046020 . - . ID=gene-Rv0937c;Dbxref=GeneID:885050;Name=mku;gbkey=Gene;gene=mku;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0937c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1045199 1046020 . - 0 ID=cds-NP_215452.1;Parent=gene-Rv0937c;Dbxref=Genbank:NP_215452.1,GeneID:885050;Name=NP_215452.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15499016];gbkey=CDS;gene=mku;locus_tag=Rv0937c;product=non-homologous end joining protein Ku;protein_id=NP_215452.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1046136 1048415 . + . ID=gene-Rv0938;Dbxref=GeneID:885561;Name=ligD;gbkey=Gene;gene=ligD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0938
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1046136 1048415 . + 0 ID=cds-NP_215453.1;Parent=gene-Rv0938;Dbxref=Genbank:NP_215453.1,GeneID:885561;Name=NP_215453.1;Note=ATP dependent polydeoxyribonucleotide synthase (thermostable DNA ligase) (ATP dependent polynucleotide ligase) (sealase) (DNA repair enzyme) (DNA joinase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15499016];gbkey=CDS;gene=ligD;locus_tag=Rv0938;product=multifunctional non-homologous end joining DNA repair protein/ATP dependent DNA ligase LigD;protein_id=NP_215453.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1048412 1050346 . + . ID=gene-Rv0939;Dbxref=GeneID:885560;Name=Rv0939;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0939
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1048412 1050346 . + 0 ID=cds-NP_215454.1;Parent=gene-Rv0939;Dbxref=Genbank:NP_215454.1,GeneID:885560;Name=NP_215454.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0939;product=bifunctional 2-hydroxyhepta-2%2C4-diene-1%2C7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase;protein_id=NP_215454.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1050593 1051459 . - . ID=gene-Rv0940c;Dbxref=GeneID:885412;Name=Rv0940c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0940c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1050593 1051459 . - 0 ID=cds-NP_215455.1;Parent=gene-Rv0940c;Dbxref=Genbank:NP_215455.1,GeneID:885412;Name=NP_215455.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0940c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215455.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1051544 1052317 . - . ID=gene-Rv0941c;Dbxref=GeneID:885914;Name=Rv0941c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0941c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1051544 1052317 . - 0 ID=cds-NP_215456.1;Parent=gene-Rv0941c;Dbxref=Genbank:NP_215456.1,GeneID:885914;Name=NP_215456.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0941c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215456.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1052360 1052638 . + . ID=gene-Rv0942;Dbxref=GeneID:885913;Name=Rv0942;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0942
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1052360 1052638 . + 0 ID=cds-NP_215457.1;Parent=gene-Rv0942;Dbxref=Genbank:NP_215457.1,GeneID:885913;Name=NP_215457.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0942;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215457.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1052696 1053736 . - . ID=gene-Rv0943c;Dbxref=GeneID:885889;Name=Rv0943c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0943c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1052696 1053736 . - 0 ID=cds-NP_215458.1;Parent=gene-Rv0943c;Dbxref=Genbank:NP_215458.1,GeneID:885889;Name=NP_215458.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0943c;product=monooxygenase;protein_id=NP_215458.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1053765 1054241 . + . ID=gene-Rv0944;Dbxref=GeneID:885888;Name=Rv0944;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0944
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1053765 1054241 . + 0 ID=cds-NP_215459.1;Parent=gene-Rv0944;Dbxref=Genbank:NP_215459.1,GeneID:885888;Name=NP_215459.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20031487];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0944;product=formamidopyrimidine-DNA glycosylase;protein_id=NP_215459.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1054247 1055008 . + . ID=gene-Rv0945;Dbxref=GeneID:885629;Name=Rv0945;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0945
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1054247 1055008 . + 0 ID=cds-NP_215460.1;Parent=gene-Rv0945;Dbxref=Genbank:NP_215460.1,GeneID:885629;Name=NP_215460.1;Note=short-chain type dehydrogenase/reductase;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv0945;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215460.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1055024 1056685 . - . ID=gene-Rv0946c;Dbxref=GeneID:885533;Name=pgi;gbkey=Gene;gene=pgi;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0946c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1055024 1056685 . - 0 ID=cds-NP_215461.1;Parent=gene-Rv0946c;Dbxref=Genbank:NP_215461.1,GeneID:885533;Name=NP_215461.1;Note=GPI (phosphoglucose isomerase) (phosphohexose isomerase) (phi);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pgi;inference=protein motif:PROSITE:PS00765;locus_tag=Rv0946c;product=glucose-6-phosphate isomerase;protein_id=NP_215461.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 1057300 1057530 . - . ID=gene-Rv0947c;Dbxref=GeneID:885494;Name=Rv0947c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv0947c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 1057300 1057530 . - . ID=id-Rv0947c;Dbxref=GeneID:885494;Note=mycolyl transferase pseudogene;gbkey=misc_feature;locus_tag=Rv0947c;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 1057646 1057963 . - . ID=gene-Rv0948c;Dbxref=GeneID:885485;Name=Rv0948c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0948c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1057646 1057963 . - 0 ID=cds-NP_215463.1;Parent=gene-Rv0948c;Dbxref=Genbank:NP_215463.1,GeneID:885485;Name=NP_215463.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0948c;product=chorismate mutase;protein_id=NP_215463.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1058260 1060575 . + . ID=gene-Rv0949;Dbxref=GeneID:885442;Name=uvrD1;gbkey=Gene;gene=uvrD1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=uvrD;locus_tag=Rv0949
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1058260 1060575 . + 0 ID=cds-YP_177772.1;Parent=gene-Rv0949;Dbxref=Genbank:YP_177772.1,GeneID:885442;Name=YP_177772.1;Note=ATP dependent DNA helicase II;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=uvrD1;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0949;product=ATP-dependent DNA helicase UvrD;protein_id=YP_177772.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1060656 1061654 . - . ID=gene-Rv0950c;Dbxref=GeneID:885438;Name=Rv0950c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0950c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1060656 1061654 . - 0 ID=cds-NP_215465.1;Parent=gene-Rv0950c;Dbxref=Genbank:NP_215465.1,GeneID:885438;Name=NP_215465.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0950c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215465.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1061964 1063127 . + . ID=gene-Rv0951;Dbxref=GeneID:885434;Name=sucC;gbkey=Gene;gene=sucC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0951
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1061964 1063127 . + 0 ID=cds-NP_215466.1;Parent=gene-Rv0951;Dbxref=Genbank:NP_215466.1,GeneID:885434;Name=NP_215466.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=sucC;locus_tag=Rv0951;product=succinyl-CoA ligase subunit beta;protein_id=NP_215466.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1063140 1064051 . + . ID=gene-Rv0952;Dbxref=GeneID:885426;Name=sucD;gbkey=Gene;gene=sucD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0952
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1063140 1064051 . + 0 ID=cds-NP_215467.1;Parent=gene-Rv0952;Dbxref=Genbank:NP_215467.1,GeneID:885426;Name=NP_215467.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sucD;inference=protein motif:PROSITE:PS00399;locus_tag=Rv0952;product=succinyl-CoA ligase subunit alpha;protein_id=NP_215467.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1064114 1064962 . - . ID=gene-Rv0953c;Dbxref=GeneID:885419;Name=Rv0953c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0953c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1064114 1064962 . - 0 ID=cds-NP_215468.1;Parent=gene-Rv0953c;Dbxref=Genbank:NP_215468.1,GeneID:885419;Name=NP_215468.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00201;locus_tag=Rv0953c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215468.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1065127 1066038 . + . ID=gene-Rv0954;Dbxref=GeneID:885411;Name=Rv0954;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0954
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1065127 1066038 . + 0 ID=cds-NP_215469.1;Parent=gene-Rv0954;Dbxref=Genbank:NP_215469.1,GeneID:885411;Name=NP_215469.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0954;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215469.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1066078 1067445 . + . ID=gene-Rv0955;Dbxref=GeneID:885408;Name=Rv0955;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0955
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1066078 1067445 . + 0 ID=cds-NP_215470.1;Parent=gene-Rv0955;Dbxref=Genbank:NP_215470.1,GeneID:885408;Name=NP_215470.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0955;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215470.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1068205 1069776 . + 0 ID=cds-NP_215472.1;Parent=gene-Rv0957;Dbxref=Genbank:NP_215472.1,GeneID:885406;Name=NP_215472.1;Note=PurH%2C bifunctional purine biosynthesis protein including 5'-phosphoribosyl-5-aminoimidazole-4-carboxamide formyltransferase and inosine-monophosphate (imp) cyclohydrolase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=purH;locus_tag=Rv0957;product=bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/inosinemonophosphate cyclohydrolase;protein_id=NP_215472.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1069883 1071262 . + . ID=gene-Rv0958;Dbxref=GeneID:885405;Name=Rv0958;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0958
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1071255 1073273 . + . ID=gene-Rv0959;Dbxref=GeneID:885329;Name=Rv0959;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0959
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1071255 1073273 . + 0 ID=cds-NP_215474.1;Parent=gene-Rv0959;Dbxref=Genbank:NP_215474.1,GeneID:885329;Name=NP_215474.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0959;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215474.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1073327 1073548 . + . ID=gene-Rv0959A;Dbxref=GeneID:14515852;Name=vapB9;gbkey=Gene;gene=vapB9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0959A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1073327 1073548 . + 0 ID=cds-YP_007409620.1;Parent=gene-Rv0959A;Dbxref=Genbank:YP_007409620.1,GeneID:14515852;Name=YP_007409620.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0960;gbkey=CDS;gene=vapB9;locus_tag=Rv0959A;product=antitoxin VapB9;protein_id=YP_007409620.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1073545 1073928 . + . ID=gene-Rv0960;Dbxref=GeneID:885158;Name=vapC9;gbkey=Gene;gene=vapC9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0960
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1073545 1073928 . + 0 ID=cds-NP_215475.1;Parent=gene-Rv0960;Dbxref=Genbank:NP_215475.1,GeneID:885158;Name=NP_215475.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0959A%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC9;locus_tag=Rv0960;product=ribonuclease VapC9;protein_id=NP_215475.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1074074 1074421 . + . ID=gene-Rv0961;Dbxref=GeneID:885173;Name=Rv0961;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0961
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1074074 1074421 . + 0 ID=cds-NP_215476.1;Parent=gene-Rv0961;Dbxref=Genbank:NP_215476.1,GeneID:885173;Name=NP_215476.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0961;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215476.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1074440 1075114 . - . ID=gene-Rv0962c;Dbxref=GeneID:885177;Name=lprP;gbkey=Gene;gene=lprP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0962c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1074440 1075114 . - 0 ID=cds-NP_215477.1;Parent=gene-Rv0962c;Dbxref=Genbank:NP_215477.1,GeneID:885177;Name=NP_215477.1;gbkey=CDS;gene=lprP;locus_tag=Rv0962c;product=lipoprotein LprP;protein_id=NP_215477.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1075297 1076097 . - . ID=gene-Rv0963c;Dbxref=GeneID:885184;Name=Rv0963c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0963c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1075297 1076097 . - 0 ID=cds-NP_215478.1;Parent=gene-Rv0963c;Dbxref=Genbank:NP_215478.1,GeneID:885184;Name=NP_215478.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0963c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215478.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1076196 1076678 . - . ID=gene-Rv0964c;Dbxref=GeneID:885186;Name=Rv0964c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0964c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1076196 1076678 . - 0 ID=cds-NP_215479.1;Parent=gene-Rv0964c;Dbxref=Genbank:NP_215479.1,GeneID:885186;Name=NP_215479.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0964c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215479.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1076778 1077197 . - . ID=gene-Rv0965c;Dbxref=GeneID:885230;Name=Rv0965c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0965c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1076778 1077197 . - 0 ID=cds-NP_215480.1;Parent=gene-Rv0965c;Dbxref=Genbank:NP_215480.1,GeneID:885230;Name=NP_215480.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0965c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215480.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1077233 1077835 . - . ID=gene-Rv0966c;Dbxref=GeneID:885043;Name=Rv0966c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0966c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1077233 1077835 . - 0 ID=cds-NP_215481.2;Parent=gene-Rv0966c;Dbxref=Genbank:NP_215481.2,GeneID:885043;Name=NP_215481.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0966c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215481.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1077975 1078334 . + . ID=gene-Rv0967;Dbxref=GeneID:885312;Name=csoR;gbkey=Gene;gene=csoR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0967
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1077975 1078334 . + 0 ID=cds-NP_215482.1;Parent=gene-Rv0967;Dbxref=Genbank:NP_215482.1,GeneID:885312;Name=NP_215482.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:17143269];gbkey=CDS;gene=csoR;locus_tag=Rv0967;product=copper-sensing transcriptional repressor CsoR;protein_id=NP_215482.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1078391 1078687 . + . ID=gene-Rv0968;Dbxref=GeneID:885052;Name=Rv0968;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0968
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1078391 1078687 . + 0 ID=cds-NP_215483.1;Parent=gene-Rv0968;Dbxref=Genbank:NP_215483.1,GeneID:885052;Name=NP_215483.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0968;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215483.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1078743 1081055 . + . ID=gene-Rv0969;Dbxref=GeneID:885254;Name=ctpV;gbkey=Gene;gene=ctpV;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0969
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1078743 1081055 . + 0 ID=cds-NP_215484.3;Parent=gene-Rv0969;Dbxref=Genbank:NP_215484.3,GeneID:885254;Name=NP_215484.3;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:20624225];gbkey=CDS;gene=ctpV;inference=protein motif:PROSITE:PS00154;locus_tag=Rv0969;product=copper-exporting ATPase;protein_id=NP_215484.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1081052 1081684 . + . ID=gene-Rv0970;Dbxref=GeneID:885242;Name=Rv0970;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0970
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1081052 1081684 . + 0 ID=cds-NP_215485.1;Parent=gene-Rv0970;Dbxref=Genbank:NP_215485.1,GeneID:885242;Name=NP_215485.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0970;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215485.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1081775 1082584 . - . ID=gene-Rv0971c;Dbxref=GeneID:885308;Name=echA7;gbkey=Gene;gene=echA7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0971c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1081775 1082584 . - 0 ID=cds-NP_215486.1;Parent=gene-Rv0971c;Dbxref=Genbank:NP_215486.1,GeneID:885308;Name=NP_215486.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA7;locus_tag=Rv0971c;product=enoyl-CoA hydratase EchA7;protein_id=NP_215486.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1082584 1083750 . - . ID=gene-Rv0972c;Dbxref=GeneID:885237;Name=fadE12;gbkey=Gene;gene=fadE12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0972c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1082584 1083750 . - 0 ID=cds-NP_215487.1;Parent=gene-Rv0972c;Dbxref=Genbank:NP_215487.1,GeneID:885237;Name=NP_215487.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE12;locus_tag=Rv0972c;product=acyl-CoA dehydrogenase fadE12;protein_id=NP_215487.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1083747 1085750 . - . ID=gene-Rv0973c;Dbxref=GeneID:885922;Name=accA2;gbkey=Gene;gene=accA2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=bccA;locus_tag=Rv0973c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1083747 1085750 . - 0 ID=cds-NP_215488.1;Parent=gene-Rv0973c;Dbxref=Genbank:NP_215488.1,GeneID:885922;Name=NP_215488.1;Note=alternate gene name: bccA AccA2: biotin carboxylase + biotin carboxyl carrier protein (BCCP);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=accA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00867;locus_tag=Rv0973c;product=acetyl/propionyl-CoA carboxylase subuit alpha;protein_id=NP_215488.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1085756 1087345 . - . ID=gene-Rv0974c;Dbxref=GeneID:886064;Name=accD2;gbkey=Gene;gene=accD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0974c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1085756 1087345 . - 0 ID=cds-NP_215489.1;Parent=gene-Rv0974c;Dbxref=Genbank:NP_215489.1,GeneID:886064;Name=NP_215489.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=accD2;locus_tag=Rv0974c;product=acetyl-/propionyl-CoA carboxylase subunit beta;protein_id=NP_215489.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1087348 1088496 . - . ID=gene-Rv0975c;Dbxref=GeneID:885856;Name=fadE13;gbkey=Gene;gene=fadE13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0975c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1087348 1088496 . - 0 ID=cds-NP_215490.1;Parent=gene-Rv0975c;Dbxref=Genbank:NP_215490.1,GeneID:885856;Name=NP_215490.1;gbkey=CDS;gene=fadE13;inference=protein motif:PROSITE:PS00073;locus_tag=Rv0975c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE13;protein_id=NP_215490.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1088493 1090175 . - . ID=gene-Rv0976c;Dbxref=GeneID:885860;Name=Rv0976c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0976c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1088493 1090175 . - 0 ID=cds-NP_215491.1;Parent=gene-Rv0976c;Dbxref=Genbank:NP_215491.1,GeneID:885860;Name=NP_215491.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0976c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215491.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1090373 1093144 . + . ID=gene-Rv0977;Dbxref=GeneID:885264;Name=PE_PGRS16;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0977
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1090373 1093144 . + 0 ID=cds-YP_177773.1;Parent=gene-Rv0977;Dbxref=Genbank:YP_177773.1,GeneID:885264;Name=YP_177773.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS16;locus_tag=Rv0977;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS16;protein_id=YP_177773.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1093361 1094356 . - . ID=gene-Rv0978c;Dbxref=GeneID:885077;Name=PE_PGRS17;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS17;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0978c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1093361 1094356 . - 0 ID=cds-YP_177774.1;Parent=gene-Rv0978c;Dbxref=Genbank:YP_177774.1,GeneID:885077;Name=YP_177774.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS17;locus_tag=Rv0978c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS17;protein_id=YP_177774.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1094670 1094864 . - . ID=gene-Rv0979c;Dbxref=GeneID:885063;Name=Rv0979c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0979c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1094670 1094864 . - 0 ID=cds-NP_215494.2;Parent=gene-Rv0979c;Dbxref=Genbank:NP_215494.2,GeneID:885063;Name=NP_215494.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0979c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215494.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1094886 1095059 . + . ID=gene-Rv0979A;Dbxref=GeneID:3205057;Name=rpmF;gbkey=Gene;gene=rpmF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0979A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1094886 1095059 . + 0 ID=cds-YP_177635.1;Parent=gene-Rv0979A;Dbxref=Genbank:YP_177635.1,GeneID:3205057;Name=YP_177635.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpmF;locus_tag=Rv0979A;product=50S ribosomal protein L32;protein_id=YP_177635.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1095078 1096451 . - . ID=gene-Rv0980c;Dbxref=GeneID:885327;Name=PE_PGRS18;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS18;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0980c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1095078 1096451 . - 0 ID=cds-YP_177775.1;Parent=gene-Rv0980c;Dbxref=Genbank:YP_177775.1,GeneID:885327;Name=YP_177775.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS18;locus_tag=Rv0980c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS18;protein_id=YP_177775.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1096822 1097508 . + . ID=gene-Rv0981;Dbxref=GeneID:885038;Name=mprA;gbkey=Gene;gene=mprA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0981
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1096822 1097508 . + 0 ID=cds-NP_215496.2;Parent=gene-Rv0981;Dbxref=Genbank:NP_215496.2,GeneID:885038;Name=NP_215496.2;Note=mycobacterial persistence regulator whose expression is required for entrance into and maintenance of persistent infection. MprAB is involved in the regulation of genes in response to environmental stress;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:14638785];gbkey=CDS;gene=mprA;inference=protein motif:PROSITE:PS00217;locus_tag=Rv0981;product=two-component response regulator MrpA;protein_id=NP_215496.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1097508 1099022 . + . ID=gene-Rv0982;Dbxref=GeneID:885062;Name=mprB;gbkey=Gene;gene=mprB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0982
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1097508 1099022 . + 0 ID=cds-NP_215497.1;Parent=gene-Rv0982;Dbxref=Genbank:NP_215497.1,GeneID:885062;Name=NP_215497.1;Note=MprAB is involved in the regulation of genes in response to environmental stress;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:14638785];gbkey=CDS;gene=mprB;locus_tag=Rv0982;product=two component histidine-protein kinase/phosphatase MprB;protein_id=NP_215497.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1099066 1100460 . + . ID=gene-Rv0983;Dbxref=GeneID:885382;Name=pepD;gbkey=Gene;gene=pepD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtb32b;locus_tag=Rv0983
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1099066 1100460 . + 0 ID=cds-NP_215498.1;Parent=gene-Rv0983;Dbxref=Genbank:NP_215498.1,GeneID:885382;Name=NP_215498.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pepD;locus_tag=Rv0983;product=serine protease PepD;protein_id=NP_215498.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1100460 1101005 . + . ID=gene-Rv0984;Dbxref=GeneID:885378;Name=moaB2;gbkey=Gene;gene=moaB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0984
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1100460 1101005 . + 0 ID=cds-NP_215499.1;Parent=gene-Rv0984;Dbxref=Genbank:NP_215499.1,GeneID:885378;Name=NP_215499.1;Note=PHS (4-alpha-hydroxy-tetrahydropterin dehydratase) (pterin-4-a-carbinolamine dehydratase) (phenylalanine hydroxylase-stimulating protein) (PHS) (pterin carbinolamine dehydratase) (PCD);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=moaB2;locus_tag=Rv0984;product=pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase;protein_id=NP_215499.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1101025 1101480 . - . ID=gene-Rv0985c;Dbxref=GeneID:885368;Name=mscL;gbkey=Gene;gene=mscL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0985c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1101025 1101480 . - 0 ID=cds-NP_215500.1;Parent=gene-Rv0985c;Dbxref=Genbank:NP_215500.1,GeneID:885368;Name=NP_215500.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mscL;locus_tag=Rv0985c;product=large-conductance ion mechanosensitive channel;protein_id=NP_215500.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1101803 1102549 . + . ID=gene-Rv0986;Dbxref=GeneID:885364;Name=Rv0986;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0986
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1101803 1102549 . + 0 ID=cds-NP_215501.1;Parent=gene-Rv0986;Dbxref=Genbank:NP_215501.1,GeneID:885364;Name=NP_215501.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv0986;product=adhesion component ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_215501.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1102542 1105109 . + . ID=gene-Rv0987;Dbxref=GeneID:885363;Name=Rv0987;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0987
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1102542 1105109 . + 0 ID=cds-NP_215502.1;Parent=gene-Rv0987;Dbxref=Genbank:NP_215502.1,GeneID:885363;Name=NP_215502.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv0987;product=adhesion component ABC transporter permease;protein_id=NP_215502.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1105116 1106276 . + . ID=gene-Rv0988;Dbxref=GeneID:885353;Name=Rv0988;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0988
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1105116 1106276 . + 0 ID=cds-NP_215503.1;Parent=gene-Rv0988;Dbxref=Genbank:NP_215503.1,GeneID:885353;Name=NP_215503.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0988;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215503.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1106405 1107382 . - . ID=gene-Rv0989c;Dbxref=GeneID:885355;Name=grcC2;gbkey=Gene;gene=grcC2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0989c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1106405 1107382 . - 0 ID=cds-NP_215504.1;Parent=gene-Rv0989c;Dbxref=Genbank:NP_215504.1,GeneID:885355;Name=NP_215504.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=grcC2;locus_tag=Rv0989c;product=polyprenyl-diphosphate synthase GrcC;protein_id=NP_215504.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1107443 1108099 . - . ID=gene-Rv0990c;Dbxref=GeneID:885343;Name=Rv0990c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0990c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1107443 1108099 . - 0 ID=cds-NP_215505.1;Parent=gene-Rv0990c;Dbxref=Genbank:NP_215505.1,GeneID:885343;Name=NP_215505.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0990c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215505.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1108172 1108504 . - . ID=gene-Rv0991c;Dbxref=GeneID:885350;Name=Rv0991c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0991c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1108172 1108504 . - 0 ID=cds-NP_215506.1;Parent=gene-Rv0991c;Dbxref=Genbank:NP_215506.1,GeneID:885350;Name=NP_215506.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0991c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215506.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1108578 1109171 . - . ID=gene-Rv0992c;Dbxref=GeneID:885337;Name=Rv0992c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0992c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1108578 1109171 . - 0 ID=cds-NP_215507.1;Parent=gene-Rv0992c;Dbxref=Genbank:NP_215507.1,GeneID:885337;Name=NP_215507.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0992c;product=5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase;protein_id=NP_215507.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1109272 1110192 . + . ID=gene-Rv0993;Dbxref=GeneID:885341;Name=galU;gbkey=Gene;gene=galU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0993
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1109272 1110192 . + 0 ID=cds-NP_215508.1;Parent=gene-Rv0993;Dbxref=Genbank:NP_215508.1,GeneID:885341;Name=NP_215508.1;Note=UDP-glucose pyrophosphorylase (UDPGP) (alpha-D-glucosyl-1-phosphate uridylyltransferase) (uridine diphosphoglucose pyrophosphorylase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=galU;locus_tag=Rv0993;product=UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase;protein_id=NP_215508.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1110269 1111549 . + . ID=gene-Rv0994;Dbxref=GeneID:885404;Name=moeA1;gbkey=Gene;gene=moeA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moeA;locus_tag=Rv0994
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1110269 1111549 . + 0 ID=cds-YP_177776.1;Parent=gene-Rv0994;Dbxref=Genbank:YP_177776.1,GeneID:885404;Name=YP_177776.1;Note=molybdopterin biosynthesis protein MoeA;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=moeA1;locus_tag=Rv0994;product=molybdopterin molybdenumtransferase 1;protein_id=YP_177776.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1111612 1112223 . + . ID=gene-Rv0995;Dbxref=GeneID:885399;Name=rimJ;gbkey=Gene;gene=rimJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0995
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1111612 1112223 . + 0 ID=cds-NP_215510.1;Parent=gene-Rv0995;Dbxref=Genbank:NP_215510.1,GeneID:885399;Name=NP_215510.1;Note=acetylating enzyme for N-terminal of ribosomal protein S5;gbkey=CDS;gene=rimJ;locus_tag=Rv0995;product=ribosomal-protein-alanine acetyltransferase RimJ;protein_id=NP_215510.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1112384 1113460 . + . ID=gene-Rv0996;Dbxref=GeneID:885393;Name=Rv0996;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0996
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1112384 1113460 . + 0 ID=cds-NP_215511.1;Parent=gene-Rv0996;Dbxref=Genbank:NP_215511.1,GeneID:885393;Name=NP_215511.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0996;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215511.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1113511 1113583 . + . ID=gene-Rvnt15;Dbxref=GeneID:2700430;Name=alaV;gbkey=Gene;gene=alaV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt15
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1113511 1113583 . + . ID=rna-Rvnt15;Parent=gene-Rvnt15;Dbxref=GeneID:2700430;Note=alaV%2C tRNA-Ala%2C anticodon cgc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:1113544..1113546);codons=55;gbkey=tRNA;gene=alaV;locus_tag=Rvnt15;product=tRNA-Ala
+NC_000962.3 RefSeq exon 1113511 1113583 . + . ID=exon-Rvnt15-1;Parent=rna-Rvnt15;Dbxref=GeneID:2700430;Note=alaV%2C tRNA-Ala%2C anticodon cgc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:1113544..1113546);codons=55;gbkey=tRNA;gene=alaV;locus_tag=Rvnt15;product=tRNA-Ala
+NC_000962.3 RefSeq gene 1113861 1114112 . + . ID=gene-Rv0997a;Dbxref=GeneID:19394669;Name=Rv0997a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0997a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1113861 1114112 . + 0 ID=cds-YP_009030028.1;Parent=gene-Rv0997a;Dbxref=Genbank:YP_009030028.1,GeneID:19394669;Name=YP_009030028.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0997a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030028.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1114293 1114724 . + . ID=gene-Rv0997;Dbxref=GeneID:885386;Name=Rv0997;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0997
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1114293 1114724 . + 0 ID=cds-NP_215512.1;Parent=gene-Rv0997;Dbxref=Genbank:NP_215512.1,GeneID:885386;Name=NP_215512.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv0997;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215512.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1114748 1115749 . + . ID=gene-Rv0998;Dbxref=GeneID:885385;Name=Rv0998;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0998
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1114748 1115749 . + 0 ID=cds-NP_215513.1;Parent=gene-Rv0998;Dbxref=Genbank:NP_215513.1,GeneID:885385;Name=NP_215513.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00889;locus_tag=Rv0998;product=acetyltransferase Pat;protein_id=NP_215513.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1115767 1116525 . + . ID=gene-Rv0999;Dbxref=GeneID:886043;Name=Rv0999;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv0999
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1115767 1116525 . + 0 ID=cds-NP_215514.1;Parent=gene-Rv0999;Dbxref=Genbank:NP_215514.1,GeneID:886043;Name=NP_215514.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv0999;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215514.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1116531 1117148 . - . ID=gene-Rv1000c;Dbxref=GeneID:886266;Name=Rv1000c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1000c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1116531 1117148 . - 0 ID=cds-YP_177777.1;Parent=gene-Rv1000c;Dbxref=Genbank:YP_177777.1,GeneID:886266;Name=YP_177777.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1000c;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177777.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1117185 1118393 . + . ID=gene-Rv1001;Dbxref=GeneID:888313;Name=arcA;gbkey=Gene;gene=arcA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1001
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1117185 1118393 . + 0 ID=cds-NP_215517.1;Parent=gene-Rv1001;Dbxref=Genbank:NP_215517.1,GeneID:888313;Name=NP_215517.1;Note=adi (ad) (arginine dihydrolase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=arcA;locus_tag=Rv1001;product=arginine deiminase;protein_id=NP_215517.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1118428 1119939 . - . ID=gene-Rv1002c;Dbxref=GeneID:887882;Name=Rv1002c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1002c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1118428 1119939 . - 0 ID=cds-NP_215518.1;Parent=gene-Rv1002c;Dbxref=Genbank:NP_215518.1,GeneID:887882;Name=NP_215518.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1002c;product=dolichyl-phosphate-mannose--protein mannosyltransferase;protein_id=NP_215518.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1120022 1120879 . + . ID=gene-Rv1003;Dbxref=GeneID:887935;Name=Rv1003;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1003
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1120022 1120879 . + 0 ID=cds-NP_215519.1;Parent=gene-Rv1003;Dbxref=Genbank:NP_215519.1,GeneID:887935;Name=NP_215519.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1003;product=rRNA small subunit methyltransferase I;protein_id=NP_215519.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1120889 1122148 . - . ID=gene-Rv1004c;Dbxref=GeneID:886039;Name=Rv1004c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1004c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1120889 1122148 . - 0 ID=cds-NP_215520.1;Parent=gene-Rv1004c;Dbxref=Genbank:NP_215520.1,GeneID:886039;Name=NP_215520.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1004c;product=membrane protein;protein_id=NP_215520.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1122222 1123598 . - . ID=gene-Rv1005c;Dbxref=GeneID:888205;Name=Rv1005c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1005c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1122222 1123598 . - 0 ID=cds-NP_215521.1;Parent=gene-Rv1005c;Dbxref=Genbank:NP_215521.1,GeneID:888205;Name=NP_215521.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1005c;product=para-aminobenzoate synthase component I;protein_id=NP_215521.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1123714 1125417 . + . ID=gene-Rv1006;Dbxref=GeneID:888234;Name=Rv1006;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1006
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1123714 1125417 . + 0 ID=cds-NP_215522.1;Parent=gene-Rv1006;Dbxref=Genbank:NP_215522.1,GeneID:888234;Name=NP_215522.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1006;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215522.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1125444 1127003 . - . ID=gene-Rv1007c;Dbxref=GeneID:886050;Name=metS;gbkey=Gene;gene=metS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1007c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1125444 1127003 . - 0 ID=cds-NP_215523.1;Parent=gene-Rv1007c;Dbxref=Genbank:NP_215523.1,GeneID:886050;Name=NP_215523.1;Note=MetRS (methionyl-tRNA synthetase MetS) metS (MetG);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=metS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv1007c;product=methionine--tRNA ligase;protein_id=NP_215523.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1127089 1127883 . + . ID=gene-Rv1008;Dbxref=GeneID:886047;Name=tatD;gbkey=Gene;gene=tatD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=yjjV;locus_tag=Rv1008
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1127089 1127883 . + 0 ID=cds-NP_215524.1;Parent=gene-Rv1008;Dbxref=Genbank:NP_215524.1,GeneID:886047;Name=NP_215524.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=tatD;inference=protein motif:PROSITE:PS01137;locus_tag=Rv1008;product=deoxyribonuclease TatD;protein_id=NP_215524.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1128091 1129179 . + . ID=gene-Rv1009;Dbxref=GeneID:886048;Name=rpfB;gbkey=Gene;gene=rpfB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1009
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1128091 1129179 . + 0 ID=cds-NP_215525.1;Parent=gene-Rv1009;Dbxref=Genbank:NP_215525.1,GeneID:886048;Name=NP_215525.1;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis[PMID:14688133];gbkey=CDS;gene=rpfB;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1009;product=resuscitation-promoting factor RpfB;protein_id=NP_215525.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1129152 1130105 . + . ID=gene-Rv1010;Dbxref=GeneID:888792;Name=ksgA;gbkey=Gene;gene=ksgA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1010
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1129152 1130105 . + 0 ID=cds-NP_215526.1;Parent=gene-Rv1010;Dbxref=Genbank:NP_215526.1,GeneID:888792;Name=NP_215526.1;Note=dimethyladenosine transferase KsgA%3B S-adenosylmethionine-6-N'%2C N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase (16S rRNA dimethylase) (high level kasugamycin resistance protein KsgA) (kasugamycin dimethyltransferase);gbkey=CDS;gene=ksgA;inference=protein motif:PROSITE:PS01131;locus_tag=Rv1010;product=rRNA small subunit methyltransferase A;protein_id=NP_215526.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1130191 1131111 . + . ID=gene-Rv1011;Dbxref=GeneID:886034;Name=ispE;gbkey=Gene;gene=ispE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1011
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1130191 1131111 . + 0 ID=cds-NP_215527.1;Parent=gene-Rv1011;Dbxref=Genbank:NP_215527.1,GeneID:886034;Name=NP_215527.1;Note=CMK (4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol kinase). Belongs to the ISPE family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=ispE;locus_tag=Rv1011;product=4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase;protein_id=NP_215527.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1131128 1131421 . + . ID=gene-Rv1012;Dbxref=GeneID:886045;Name=Rv1012;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1012
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1131128 1131421 . + 0 ID=cds-NP_215528.1;Parent=gene-Rv1012;Dbxref=Genbank:NP_215528.1,GeneID:886045;Name=NP_215528.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1012;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215528.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1131625 1133259 . + . ID=gene-Rv1013;Dbxref=GeneID:886035;Name=pks16;gbkey=Gene;gene=pks16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1013
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1131625 1133259 . + 0 ID=cds-NP_215529.1;Parent=gene-Rv1013;Dbxref=Genbank:NP_215529.1,GeneID:886035;Name=NP_215529.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=pks16;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv1013;product=polyketide synthase;protein_id=NP_215529.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1133333 1133908 . - . ID=gene-Rv1014c;Dbxref=GeneID:886037;Name=pth;gbkey=Gene;gene=pth;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1014c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1133333 1133908 . - 0 ID=cds-NP_215530.1;Parent=gene-Rv1014c;Dbxref=Genbank:NP_215530.1,GeneID:886037;Name=NP_215530.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pth;locus_tag=Rv1014c;product=peptidyl-tRNA hydrolase;protein_id=NP_215530.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1133921 1134568 . - . ID=gene-Rv1015c;Dbxref=GeneID:885992;Name=rplY;gbkey=Gene;gene=rplY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1015c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1133921 1134568 . - 0 ID=cds-NP_215531.1;Parent=gene-Rv1015c;Dbxref=Genbank:NP_215531.1,GeneID:885992;Name=NP_215531.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplY;locus_tag=Rv1015c;product=50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc;protein_id=NP_215531.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1134785 1135465 . - . ID=gene-Rv1016c;Dbxref=GeneID:886066;Name=lpqT;gbkey=Gene;gene=lpqT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1016c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1134785 1135465 . - 0 ID=cds-NP_215532.1;Parent=gene-Rv1016c;Dbxref=Genbank:NP_215532.1,GeneID:886066;Name=NP_215532.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqT;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1016c;product=lipoprotein LpqT;protein_id=NP_215532.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1135501 1136481 . - . ID=gene-Rv1017c;Dbxref=GeneID:885993;Name=prsA;gbkey=Gene;gene=prsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1017c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1135501 1136481 . - 0 ID=cds-NP_215533.1;Parent=gene-Rv1017c;Dbxref=Genbank:NP_215533.1,GeneID:885993;Name=NP_215533.1;Note=phosphoribosyl pyrophosphate synthetase (PRPP synthetase). Belongs to the ribose-phosphate pyrophosphokinase family. Cofactor: both inorganic phosphate and magnesium ion are required for enzyme stability and activity (by similarity).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=prsA;inference=protein motif:PROSITE:PS00144;locus_tag=Rv1017c;product=ribose-phosphate pyrophosphokinase;protein_id=NP_215533.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1136573 1138060 . - . ID=gene-Rv1018c;Dbxref=GeneID:886069;Name=glmU;gbkey=Gene;gene=glmU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1018c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1136573 1138060 . - 0 ID=cds-NP_215534.1;Parent=gene-Rv1018c;Dbxref=Genbank:NP_215534.1,GeneID:886069;Name=NP_215534.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=glmU;locus_tag=Rv1018c;product=bifunctional UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase;protein_id=NP_215534.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1138076 1138147 . - . ID=gene-Rvnt16;Dbxref=GeneID:2700462;Name=glnT;gbkey=Gene;gene=glnT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt16
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1138076 1138147 . - . ID=rna-Rvnt16;Parent=gene-Rvnt16;Dbxref=GeneID:2700462;Note=glnT%2C tRNA-Gln%2C anticodon ttg%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(1138112..1138114));codons=26;gbkey=tRNA;gene=glnT;locus_tag=Rvnt16;product=tRNA-Gln
+NC_000962.3 RefSeq exon 1138076 1138147 . - . ID=exon-Rvnt16-1;Parent=rna-Rvnt16;Dbxref=GeneID:2700462;Note=glnT%2C tRNA-Gln%2C anticodon ttg%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(1138112..1138114));codons=26;gbkey=tRNA;gene=glnT;locus_tag=Rvnt16;product=tRNA-Gln
+NC_000962.3 RefSeq gene 1138315 1138908 . + . ID=gene-Rv1019;Dbxref=GeneID:886056;Name=Rv1019;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1019
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1138315 1138908 . + 0 ID=cds-NP_215535.1;Parent=gene-Rv1019;Dbxref=Genbank:NP_215535.1,GeneID:886056;Name=NP_215535.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1019;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215535.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1138967 1142671 . + . ID=gene-Rv1020;Dbxref=GeneID:886077;Name=mfd;gbkey=Gene;gene=mfd;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=trcF;locus_tag=Rv1020
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1138967 1142671 . + 0 ID=cds-NP_215536.1;Parent=gene-Rv1020;Dbxref=Genbank:NP_215536.1,GeneID:886077;Name=NP_215536.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mfd;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1020;product=transcription-repair coupling factor;protein_id=NP_215536.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1142671 1143648 . + . ID=gene-Rv1021;Dbxref=GeneID:886052;Name=Rv1021;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1021
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1142671 1143648 . + 0 ID=cds-NP_215537.1;Parent=gene-Rv1021;Dbxref=Genbank:NP_215537.1,GeneID:886052;Name=NP_215537.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20529853];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1021;product=nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase;protein_id=NP_215537.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1143736 1144467 . + . ID=gene-Rv1022;Dbxref=GeneID:886076;Name=lpqU;gbkey=Gene;gene=lpqU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1022
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1143736 1144467 . + 0 ID=cds-NP_215538.1;Parent=gene-Rv1022;Dbxref=Genbank:NP_215538.1,GeneID:886076;Name=NP_215538.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqU;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1022;product=lipoprotein LpqU;protein_id=NP_215538.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1144564 1145853 . + . ID=gene-Rv1023;Dbxref=GeneID:886062;Name=eno;gbkey=Gene;gene=eno;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1023
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1144564 1145853 . + 0 ID=cds-NP_215539.1;Parent=gene-Rv1023;Dbxref=Genbank:NP_215539.1,GeneID:886062;Name=NP_215539.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=eno;locus_tag=Rv1023;product=enolase;protein_id=NP_215539.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1145858 1146544 . + . ID=gene-Rv1024;Dbxref=GeneID:886059;Name=Rv1024;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1024
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1145858 1146544 . + 0 ID=cds-NP_215540.1;Parent=gene-Rv1024;Dbxref=Genbank:NP_215540.1,GeneID:886059;Name=NP_215540.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1024;product=membrane protein;protein_id=NP_215540.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1146561 1147028 . + . ID=gene-Rv1025;Dbxref=GeneID:886042;Name=Rv1025;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1025
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1146561 1147028 . + 0 ID=cds-NP_215541.1;Parent=gene-Rv1025;Dbxref=Genbank:NP_215541.1,GeneID:886042;Name=NP_215541.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1025;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215541.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1147019 1147978 . + . ID=gene-Rv1026;Dbxref=GeneID:886089;Name=Rv1026;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1026
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1147019 1147978 . + 0 ID=cds-NP_215542.1;Parent=gene-Rv1026;Dbxref=Genbank:NP_215542.1,GeneID:886089;Name=NP_215542.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1026;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215542.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1148427 1149107 . - . ID=gene-Rv1027c;Dbxref=GeneID:886046;Name=kdpE;gbkey=Gene;gene=kdpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1027c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1148427 1149107 . - 0 ID=cds-NP_215543.1;Parent=gene-Rv1027c;Dbxref=Genbank:NP_215543.1,GeneID:886046;Name=NP_215543.1;gbkey=CDS;gene=kdpE;locus_tag=Rv1027c;product=transcriptional regulator KdpE;protein_id=NP_215543.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1149104 1151686 . - . ID=gene-Rv1028c;Dbxref=GeneID:886084;Name=kdpD;gbkey=Gene;gene=kdpD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1028c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1149104 1151686 . - 0 ID=cds-NP_215544.1;Parent=gene-Rv1028c;Dbxref=Genbank:NP_215544.1,GeneID:886084;Name=NP_215544.1;Note=Belongs to universal stress protein family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=kdpD;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1028c;product=sensor protein KdpD;protein_id=NP_215544.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1151920 1152012 . + . ID=gene-Rv1028A;Dbxref=GeneID:3205056;Name=kdpF;gbkey=Gene;gene=kdpF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1028A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1151920 1152012 . + 0 ID=cds-YP_177636.1;Parent=gene-Rv1028A;Dbxref=Genbank:YP_177636.1,GeneID:3205056;Name=YP_177636.1;gbkey=CDS;gene=kdpF;locus_tag=Rv1028A;product=membrane protein KdpF;protein_id=YP_177636.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1152012 1153727 . + . ID=gene-Rv1029;Dbxref=GeneID:887414;Name=kdpA;gbkey=Gene;gene=kdpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1029
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1152012 1153727 . + 0 ID=cds-NP_215545.1;Parent=gene-Rv1029;Dbxref=Genbank:NP_215545.1,GeneID:887414;Name=NP_215545.1;Note=potassium-translocating ATPase a chain (ATP phosphohydrolase [potassium-transporting] a chain) (potassium binding and translocating subunit A);gbkey=CDS;gene=kdpA;locus_tag=Rv1029;product=potassium-transporting ATPase subunit A;protein_id=NP_215545.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1153724 1155853 . + . ID=gene-Rv1030;Dbxref=GeneID:887343;Name=kdpB;gbkey=Gene;gene=kdpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1030
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1153724 1155853 . + 0 ID=cds-NP_215546.1;Parent=gene-Rv1030;Dbxref=Genbank:NP_215546.1,GeneID:887343;Name=NP_215546.1;Note=potassium-translocating ATPase B chain (ATP phosphohydrolase [potassium-transporting] B chain) (potassium binding and translocating subunit B);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=kdpB;inference=protein motif:PROSITE:PS00154;locus_tag=Rv1030;product=potassium-transporting ATPase subunit B;protein_id=NP_215546.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1155853 1156422 . + . ID=gene-Rv1031;Dbxref=GeneID:886008;Name=kdpC;gbkey=Gene;gene=kdpC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1031
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1155853 1156422 . + 0 ID=cds-NP_215547.1;Parent=gene-Rv1031;Dbxref=Genbank:NP_215547.1,GeneID:886008;Name=NP_215547.1;Note=potassium-translocating ATPase C chain (ATP phosphohydrolase [potassium-transporting] C chain) (potassium binding and translocating subunit C);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=kdpC;locus_tag=Rv1031;product=potassium-transporting ATPase subunit C;protein_id=NP_215547.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1156426 1157955 . - . ID=gene-Rv1032c;Dbxref=GeneID:887790;Name=trcS;gbkey=Gene;gene=trcS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1032c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1156426 1157955 . - 0 ID=cds-NP_215548.1;Parent=gene-Rv1032c;Dbxref=Genbank:NP_215548.1,GeneID:887790;Name=NP_215548.1;Note=Note that in vitro autophosphorylation of TrcS requires the presence of Mn2+ or Ca2+ as a divalent cation cofactor and subsequent transphosphorylation of TrcR is evident in the presence of TrcS-phosphate and Ca2+.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10089160];gbkey=CDS;gene=trcS;locus_tag=Rv1032c;product=two component sensor histidine kinase TrcS;protein_id=NP_215548.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1157963 1158736 . - . ID=gene-Rv1033c;Dbxref=GeneID:887957;Name=trcR;gbkey=Gene;gene=trcR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1033c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1157963 1158736 . - 0 ID=cds-NP_215549.1;Parent=gene-Rv1033c;Dbxref=Genbank:NP_215549.1,GeneID:887957;Name=NP_215549.1;Note=Note that in vitro autophosphorylation of TrcS requires the presence of Mn2+or Ca2+as a divalent cation cofactor and subsequent transphosphorylation of TrcR is evident in the presence of TrcS-phosphate and Ca2+.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10089160];gbkey=CDS;gene=trcR;locus_tag=Rv1033c;product=two component transcriptional regulator TrcR;protein_id=NP_215549.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1158921 1160433 . - . ID=id-NC_000962.3:1158921..1160433;Note=IS1560-1%2C len: 1513 nt. Insertion sequence IS1560.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1560-1
+NC_000962.3 RefSeq gene 1160544 1160828 . - . ID=gene-Rv1037c;Dbxref=GeneID:888299;Name=esxI;gbkey=Gene;gene=esxI;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_1,Mtb9.9D;locus_tag=Rv1037c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1160544 1160828 . - 0 ID=cds-NP_215553.1;Parent=gene-Rv1037c;Dbxref=Genbank:NP_215553.1,GeneID:888299;Name=NP_215553.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=esxI;locus_tag=Rv1037c;product=ESAT-6 like protein EsxI;protein_id=NP_215553.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1160855 1161151 . - . ID=gene-Rv1038c;Dbxref=GeneID:888372;Name=esxJ;gbkey=Gene;gene=esxJ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_2,QILSS,TB11.0;locus_tag=Rv1038c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1160855 1161151 . - 0 ID=cds-NP_215554.1;Parent=gene-Rv1038c;Dbxref=Genbank:NP_215554.1,GeneID:888372;Name=NP_215554.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=esxJ;locus_tag=Rv1038c;product=ESAT-6 like protein EsxJ;protein_id=NP_215554.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1161297 1162472 . - . ID=gene-Rv1039c;Dbxref=GeneID:888477;Name=PPE15;gbkey=Gene;gene=PPE15;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1039c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1161297 1162472 . - 0 ID=cds-YP_177778.1;Parent=gene-Rv1039c;Dbxref=Genbank:YP_177778.1,GeneID:888477;Name=YP_177778.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE15;locus_tag=Rv1039c;product=PPE family protein PPE15;protein_id=YP_177778.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1162549 1163376 . - . ID=gene-Rv1040c;Dbxref=GeneID:888533;Name=PE8;gbkey=Gene;gene=PE8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1040c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1162549 1163376 . - 0 ID=cds-YP_177779.1;Parent=gene-Rv1040c;Dbxref=Genbank:YP_177779.1,GeneID:888533;Name=YP_177779.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE8;locus_tag=Rv1040c;product=PE family protein PE8;protein_id=YP_177779.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1164572 1165549 . - . ID=id-NC_000962.3:1164572..1165549;Note=IS-LIKE-1%2C len: 978 nt. Insertion sequence%2C ISLIKE%2Cregion. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS-LIKE-1
+NC_000962.3 RefSeq gene 1164572 1165435 . - . ID=gene-Rv1041c;Dbxref=GeneID:888546;Name=Rv1041c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1041c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1164572 1165435 . - 0 ID=cds-NP_215557.1;Parent=gene-Rv1041c;Dbxref=Genbank:NP_215557.1,GeneID:888546;Name=NP_215557.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1041c;product=IS2-like transposase;protein_id=NP_215557.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1164572 1164589 . + . ID=id-NC_000962.3:1164572..1164589;Note=18 bp inverted repeat at the left end of IS-LIKE element%2C CTAGGGCGTGTCTCCCAA. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1165092 1165499 . - . ID=gene-Rv1042c;Dbxref=GeneID:888607;Name=Rv1042c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1042c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1165092 1165499 . - 0 ID=cds-NP_215558.1;Parent=gene-Rv1042c;Dbxref=Genbank:NP_215558.1,GeneID:888607;Name=NP_215558.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1042c;product=IS2-like transposase;protein_id=NP_215558.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1165532 1165549 . - . ID=id-NC_000962.3:1165532..1165549;Note=18 bp inverted repeat at the right end of a IS-LIKE element%2C CTAGGGCGTGTCTCCCAA. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1165781 1166806 . - . ID=gene-Rv1043c;Dbxref=GeneID:888634;Name=Rv1043c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1043c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1165781 1166806 . - 0 ID=cds-NP_215559.1;Parent=gene-Rv1043c;Dbxref=Genbank:NP_215559.1,GeneID:888634;Name=NP_215559.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1043c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215559.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1167053 1167676 . + . ID=gene-Rv1044;Dbxref=GeneID:888712;Name=Rv1044;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1044
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1167053 1167676 . + 0 ID=cds-NP_215560.1;Parent=gene-Rv1044;Dbxref=Genbank:NP_215560.1,GeneID:888712;Name=NP_215560.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1044;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215560.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1167673 1168554 . + . ID=gene-Rv1045;Dbxref=GeneID:888783;Name=Rv1045;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1045
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1167673 1168554 . + 0 ID=cds-NP_215561.1;Parent=gene-Rv1045;Dbxref=Genbank:NP_215561.1,GeneID:888783;Name=NP_215561.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1045;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215561.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1169298 1170732 . + . ID=id-NC_000962.3:1169298..1170732;Note=IS1081-1%2C len: 1435 nt. Insertion sequence IS1081. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1081-1
+NC_000962.3 RefSeq gene 1169423 1170670 . + . ID=gene-Rv1047;Dbxref=GeneID:886060;Name=Rv1047;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1047
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1169423 1170670 . + 0 ID=cds-NP_215563.1;Parent=gene-Rv1047;Dbxref=Genbank:NP_215563.1,GeneID:886060;Name=NP_215563.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01007;locus_tag=Rv1047;product=transposase;protein_id=NP_215563.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1171038 1172153 . - . ID=gene-Rv1048c;Dbxref=GeneID:885295;Name=Rv1048c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1048c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1171038 1172153 . - 0 ID=cds-NP_215564.1;Parent=gene-Rv1048c;Dbxref=Genbank:NP_215564.1,GeneID:885295;Name=NP_215564.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1048c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215564.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1172386 1172832 . + . ID=gene-Rv1049;Dbxref=GeneID:886091;Name=Rv1049;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1049
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1172386 1172832 . + 0 ID=cds-NP_215565.1;Parent=gene-Rv1049;Dbxref=Genbank:NP_215565.1,GeneID:886091;Name=NP_215565.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1049;product=transcriptional repressor;protein_id=NP_215565.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1172881 1173786 . + . ID=gene-Rv1050;Dbxref=GeneID:887146;Name=Rv1050;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1050
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1172881 1173786 . + 0 ID=cds-NP_215566.1;Parent=gene-Rv1050;Dbxref=Genbank:NP_215566.1,GeneID:887146;Name=NP_215566.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1050;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215566.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1173945 1174700 . - . ID=gene-Rv1051c;Dbxref=GeneID:887142;Name=Rv1051c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1051c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1173945 1174700 . - 0 ID=cds-NP_215567.1;Parent=gene-Rv1051c;Dbxref=Genbank:NP_215567.1,GeneID:887142;Name=NP_215567.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1051c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215567.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 1175225 1175315 . + . ID=id-NC_000962.3:1175225..1175315;Note=mpr5%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C ~100 nt band detected by Northern blot.;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 1175723 1176112 . + . ID=gene-Rv1052;Dbxref=GeneID:888441;Name=Rv1052;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1052
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1175723 1176112 . + 0 ID=cds-NP_215568.1;Parent=gene-Rv1052;Dbxref=Genbank:NP_215568.1,GeneID:888441;Name=NP_215568.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1052;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215568.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1177396 1177469 . + . ID=gene-Rvnt17;Dbxref=GeneID:2700427;Name=leuX;gbkey=Gene;gene=leuX;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt17
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1177396 1177469 . + . ID=rna-Rvnt17;Parent=gene-Rvnt17;Dbxref=GeneID:2700427;Note=leuX%2C tRNA-Leu%2C anticodon taa%2C length %3D 74. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;anticodon=(pos:1177430..1177432);codons=2;gbkey=tRNA;gene=leuX;locus_tag=Rvnt17;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq exon 1177396 1177469 . + . ID=exon-Rvnt17-1;Parent=rna-Rvnt17;Dbxref=GeneID:2700427;Note=leuX%2C tRNA-Leu%2C anticodon taa%2C length %3D 74. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;anticodon=(pos:1177430..1177432);codons=2;gbkey=tRNA;gene=leuX;locus_tag=Rvnt17;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq gene 1177628 1178392 . + . ID=gene-Rv1056;Dbxref=GeneID:887147;Name=Rv1056;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1056
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1177628 1178392 . + 0 ID=cds-NP_215572.1;Parent=gene-Rv1056;Dbxref=Genbank:NP_215572.1,GeneID:887147;Name=NP_215572.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1056;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215572.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1179345 1179395 . + . ID=id-NC_000962.3:1179345..1179395;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1179396 1180577 . + . ID=gene-Rv1057;Dbxref=GeneID:887135;Name=Rv1057;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1057
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1179396 1180577 . + 0 ID=cds-NP_215573.1;Parent=gene-Rv1057;Dbxref=Genbank:NP_215573.1,GeneID:887135;Name=NP_215573.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1057;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215573.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1180684 1182315 . + . ID=gene-Rv1058;Dbxref=GeneID:887133;Name=fadD14;gbkey=Gene;gene=fadD14;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1058
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1180684 1182315 . + 0 ID=cds-NP_215574.1;Parent=gene-Rv1058;Dbxref=Genbank:NP_215574.1,GeneID:887133;Name=NP_215574.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=fadD14;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv1058;product=fatty-acid--CoA ligase FadD14;protein_id=NP_215574.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1182391 1183455 . + . ID=gene-Rv1059;Dbxref=GeneID:886015;Name=Rv1059;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1059
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1182391 1183455 . + 0 ID=cds-NP_215575.1;Parent=gene-Rv1059;Dbxref=Genbank:NP_215575.1,GeneID:886015;Name=NP_215575.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1059;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215575.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1183508 1183981 . + . ID=gene-Rv1060;Dbxref=GeneID:887130;Name=Rv1060;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1060
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1183508 1183981 . + 0 ID=cds-NP_215576.1;Parent=gene-Rv1060;Dbxref=Genbank:NP_215576.1,GeneID:887130;Name=NP_215576.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1060;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215576.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1184015 1184878 . + . ID=gene-Rv1061;Dbxref=GeneID:887136;Name=Rv1061;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1061
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1184015 1184878 . + 0 ID=cds-NP_215577.1;Parent=gene-Rv1061;Dbxref=Genbank:NP_215577.1,GeneID:887136;Name=NP_215577.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1061;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215577.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1184883 1185740 . + . ID=gene-Rv1062;Dbxref=GeneID:887129;Name=Rv1062;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1062
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1184883 1185740 . + 0 ID=cds-NP_215578.1;Parent=gene-Rv1062;Dbxref=Genbank:NP_215578.1,GeneID:887129;Name=NP_215578.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1062;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215578.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1185741 1186823 . - . ID=gene-Rv1063c;Dbxref=GeneID:887128;Name=Rv1063c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1063c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1190757 1192148 . - . ID=gene-Rv1068c;Dbxref=GeneID:887123;Name=PE_PGRS20;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS20;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1068c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1192510 1194273 . - . ID=gene-Rv1069c;Dbxref=GeneID:887120;Name=Rv1069c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1069c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1192510 1194273 . - 0 ID=cds-NP_215585.1;Parent=gene-Rv1069c;Dbxref=Genbank:NP_215585.1,GeneID:887120;Name=NP_215585.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1069c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215585.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1194270 1195043 . - . ID=gene-Rv1070c;Dbxref=GeneID:887117;Name=echA8;gbkey=Gene;gene=echA8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1070c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1195055 1196092 . - . ID=gene-Rv1071c;Dbxref=GeneID:887116;Name=echA9;gbkey=Gene;gene=echA9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1071c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1195055 1196092 . - 0 ID=cds-NP_215587.1;Parent=gene-Rv1071c;Dbxref=Genbank:NP_215587.1,GeneID:887116;Name=NP_215587.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA9;locus_tag=Rv1071c;product=enoyl-CoA hydratase EchA9;protein_id=NP_215587.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1196279 1197115 . + . ID=gene-Rv1072;Dbxref=GeneID:887114;Name=Rv1072;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1072
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1196279 1197115 . + 0 ID=cds-NP_215588.1;Parent=gene-Rv1072;Dbxref=Genbank:NP_215588.1,GeneID:887114;Name=NP_215588.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1072;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215588.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1197231 1198082 . + . ID=gene-Rv1073;Dbxref=GeneID:887132;Name=Rv1073;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1073
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1197231 1198082 . + 0 ID=cds-NP_215589.1;Parent=gene-Rv1073;Dbxref=Genbank:NP_215589.1,GeneID:887132;Name=NP_215589.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1073;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215589.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1198156 1199373 . - . ID=gene-Rv1074c;Dbxref=GeneID:887113;Name=fadA3;gbkey=Gene;gene=fadA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1074c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1198156 1199373 . - 0 ID=cds-NP_215590.1;Parent=gene-Rv1074c;Dbxref=Genbank:NP_215590.1,GeneID:887113;Name=NP_215590.1;Note=Belongs to the thiolase family.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadA3;inference=protein motif:PROSITE:PS00737;locus_tag=Rv1074c;product=beta-ketoacyl CoA thiolase FadA;protein_id=NP_215590.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1199426 1200370 . - . ID=gene-Rv1075c;Dbxref=GeneID:887110;Name=Rv1075c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1075c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1199426 1200370 . - 0 ID=cds-NP_215591.1;Parent=gene-Rv1075c;Dbxref=Genbank:NP_215591.1,GeneID:887110;Name=NP_215591.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1075c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215591.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1200767 1201660 . + . ID=gene-Rv1076;Dbxref=GeneID:887112;Name=lipU;gbkey=Gene;gene=lipU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1076
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1200767 1201660 . + 0 ID=cds-NP_215592.1;Parent=gene-Rv1076;Dbxref=Genbank:NP_215592.1,GeneID:887112;Name=NP_215592.1;gbkey=CDS;gene=lipU;locus_tag=Rv1076;product=lipase LipU;protein_id=NP_215592.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1201717 1203111 . + . ID=gene-Rv1077;Dbxref=GeneID:887108;Name=cbs;gbkey=Gene;gene=cbs;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cysM2;locus_tag=Rv1077
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1201717 1203111 . + 0 ID=cds-YP_177782.1;Parent=gene-Rv1077;Dbxref=Genbank:YP_177782.1,GeneID:887108;Name=YP_177782.1;Note=Cbs (serine sulfhydrase) (beta-thionase) (hemoprotein H-450);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cbs;inference=protein motif:PROSITE:PS00217;locus_tag=Rv1077;product=cystathionine beta-synthase;protein_id=YP_177782.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1203313 1204035 . + . ID=gene-Rv1078;Dbxref=GeneID:887111;Name=Rv1078;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1078
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1203313 1204035 . + 0 ID=cds-NP_215594.1;Parent=gene-Rv1078;Dbxref=Genbank:NP_215594.1,GeneID:887111;Name=NP_215594.1;Note=Proline-rich;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1078;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215594.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1204067 1205233 . + . ID=gene-Rv1079;Dbxref=GeneID:887103;Name=metB;gbkey=Gene;gene=metB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1079
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1204067 1205233 . + 0 ID=cds-NP_215595.1;Parent=gene-Rv1079;Dbxref=Genbank:NP_215595.1,GeneID:887103;Name=NP_215595.1;Note=CGS (O-succinylhomoserine [thiol]-lyase). Belongs to the trans-sulfuration enzymes family.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19428471];gbkey=CDS;gene=metB;inference=protein motif:PROSITE:PS00868;locus_tag=Rv1079;product=cystathionine gamma-synthase;protein_id=NP_215595.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1205304 1205798 . - . ID=gene-Rv1080c;Dbxref=GeneID:887115;Name=greA;gbkey=Gene;gene=greA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1080c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1205304 1205798 . - 0 ID=cds-NP_215596.1;Parent=gene-Rv1080c;Dbxref=Genbank:NP_215596.1,GeneID:887115;Name=NP_215596.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=greA;inference=protein motif:PROSITE:PS00830;locus_tag=Rv1080c;product=transcription elongation factor GreA;protein_id=NP_215596.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1205984 1206418 . - . ID=gene-Rv1081c;Dbxref=GeneID:887102;Name=Rv1081c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1081c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1205984 1206418 . - 0 ID=cds-NP_215597.1;Parent=gene-Rv1081c;Dbxref=Genbank:NP_215597.1,GeneID:887102;Name=NP_215597.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1081c;product=membrane protein;protein_id=NP_215597.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1206520 1207386 . + . ID=gene-Rv1082;Dbxref=GeneID:887101;Name=mca;gbkey=Gene;gene=mca;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1082
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1206520 1207386 . + 0 ID=cds-NP_215598.1;Parent=gene-Rv1082;Dbxref=Genbank:NP_215598.1,GeneID:887101;Name=NP_215598.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein characterization[PMID:10978158];gbkey=CDS;gene=mca;locus_tag=Rv1082;product=mycothiol S-conjugate amidase;protein_id=NP_215598.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1207383 1207649 . + . ID=gene-Rv1083;Dbxref=GeneID:887100;Name=Rv1083;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1083
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1207383 1207649 . + 0 ID=cds-NP_215599.1;Parent=gene-Rv1083;Dbxref=Genbank:NP_215599.1,GeneID:887100;Name=NP_215599.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1083;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215599.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1207636 1209657 . + . ID=gene-Rv1084;Dbxref=GeneID:887098;Name=Rv1084;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1084
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1207636 1209657 . + 0 ID=cds-NP_215600.1;Parent=gene-Rv1084;Dbxref=Genbank:NP_215600.1,GeneID:887098;Name=NP_215600.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1084;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215600.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1209756 1210484 . - . ID=gene-Rv1085c;Dbxref=GeneID:887107;Name=Rv1085c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1085c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1209756 1210484 . - 0 ID=cds-NP_215601.1;Parent=gene-Rv1085c;Dbxref=Genbank:NP_215601.1,GeneID:887107;Name=NP_215601.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1085c;product=hemolysin-like protein;protein_id=NP_215601.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1210595 1211383 . + . ID=gene-Rv1086;Dbxref=GeneID:887097;Name=Rv1086;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1086
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1210595 1211383 . + 0 ID=cds-NP_215602.1;Parent=gene-Rv1086;Dbxref=Genbank:NP_215602.1,GeneID:887097;Name=NP_215602.1;Note=Short (C15) chain Z-FPP synthase (Z-farnesyl diphosphate synthase) (Z-FPP synthetase) (Z-farnesyl diphosphate synthetase) (geranyltranstransferase) (farnesyl pyrophosphate synthetase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:10816587];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01066;locus_tag=Rv1086;product=(2Z%2C6E)-farnesyl diphosphate synthase;protein_id=NP_215602.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1211560 1213863 . + . ID=gene-Rv1087;Dbxref=GeneID:887094;Name=PE_PGRS21;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS21;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1087
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1211560 1213863 . + 0 ID=cds-YP_177783.1;Parent=gene-Rv1087;Dbxref=Genbank:YP_177783.1,GeneID:887094;Name=YP_177783.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS21;inference=protein motif:PROSITE:PS00583;locus_tag=Rv1087;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS21;protein_id=YP_177783.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1214513 1214947 . + . ID=gene-Rv1088;Dbxref=GeneID:887096;Name=PE9;gbkey=Gene;gene=PE9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1088
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1214513 1214947 . + 0 ID=cds-YP_177784.1;Parent=gene-Rv1088;Dbxref=Genbank:YP_177784.1,GeneID:887096;Name=YP_177784.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=PE9;locus_tag=Rv1088;product=PE family protein PE9;protein_id=YP_177784.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1215225 1215407 . + . ID=gene-Rv1088a;Dbxref=GeneID:19394670;Name=Rv1088a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1088a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1215225 1215407 . + 0 ID=cds-YP_009030029.1;Parent=gene-Rv1088a;Dbxref=Genbank:YP_009030029.1,GeneID:19394670;Name=YP_009030029.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1088a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030029.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1216469 1219030 . + . ID=gene-Rv1091;Dbxref=GeneID:885258;Name=PE_PGRS22;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1091
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1216469 1219030 . + 0 ID=cds-YP_177786.1;Parent=gene-Rv1091;Dbxref=Genbank:YP_177786.1,GeneID:885258;Name=YP_177786.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS22;locus_tag=Rv1091;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS22;protein_id=YP_177786.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1219248 1220186 . - . ID=gene-Rv1092c;Dbxref=GeneID:885120;Name=coaA;gbkey=Gene;gene=coaA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1092c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1219248 1220186 . - 0 ID=cds-NP_215608.1;Parent=gene-Rv1092c;Dbxref=Genbank:NP_215608.1,GeneID:885120;Name=NP_215608.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=coaA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1092c;product=pantothenate kinase;protein_id=NP_215608.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1220388 1220487 . - . ID=gene-RVnc0034;Dbxref=GeneID:14515882;Name=MTS0858;gbkey=Gene;gene=MTS0858;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0034
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1220388 1220487 . - . ID=rna-RVnc0034;Parent=gene-RVnc0034;Dbxref=GeneID:14515882;Note=MTS0858%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C ends not mapped%2C ~~100 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS0858;locus_tag=RVnc0034;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1220388 1220487 . - . ID=exon-RVnc0034-1;Parent=rna-RVnc0034;Dbxref=GeneID:14515882;Note=MTS0858%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C ends not mapped%2C ~~100 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS0858;locus_tag=RVnc0034;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1220574 1221854 . + . ID=gene-Rv1093;Dbxref=GeneID:885338;Name=glyA1;gbkey=Gene;gene=glyA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=glyA;locus_tag=Rv1093
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1220574 1221854 . + 0 ID=cds-YP_177787.3;Parent=gene-Rv1093;Dbxref=Genbank:YP_177787.3,GeneID:885338;Name=YP_177787.3;Note=Belongs to the ShmT family.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12913008];gbkey=CDS;gene=glyA1;locus_tag=Rv1093;product=serine hydroxymethyltransferase;protein_id=YP_177787.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1221959 1222786 . + . ID=gene-Rv1094;Dbxref=GeneID:885339;Name=desA2;gbkey=Gene;gene=desA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1094
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1221959 1222786 . + 0 ID=cds-NP_215610.1;Parent=gene-Rv1094;Dbxref=Genbank:NP_215610.1,GeneID:885339;Name=NP_215610.1;Note=acyl-[ACP] desaturase (stearoyl-ACP desaturase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=desA2;locus_tag=Rv1094;product=acyl-ACP desaturase DesA;protein_id=NP_215610.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1222997 1224298 . + . ID=gene-Rv1095;Dbxref=GeneID:885592;Name=phoH2;gbkey=Gene;gene=phoH2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1095
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1222997 1224298 . + 0 ID=cds-NP_215611.1;Parent=gene-Rv1095;Dbxref=Genbank:NP_215611.1,GeneID:885592;Name=NP_215611.1;Note=phoH-like protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=phoH2;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1095;product=phosphate starvation-inducible protein PsiH;protein_id=NP_215611.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1224385 1225260 . + . ID=gene-Rv1096;Dbxref=GeneID:885949;Name=Rv1096;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1096
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1224385 1225260 . + 0 ID=cds-NP_215612.1;Parent=gene-Rv1096;Dbxref=Genbank:NP_215612.1,GeneID:885949;Name=NP_215612.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1096;product=glycosyl hydrolase;protein_id=NP_215612.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1225263 1226144 . - . ID=gene-Rv1097c;Dbxref=GeneID:885962;Name=Rv1097c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1097c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1225263 1226144 . - 0 ID=cds-NP_215613.1;Parent=gene-Rv1097c;Dbxref=Genbank:NP_215613.1,GeneID:885962;Name=NP_215613.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1097c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215613.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1226141 1227565 . - . ID=gene-Rv1098c;Dbxref=GeneID:885651;Name=fum;gbkey=Gene;gene=fum;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1098c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1226141 1227565 . - 0 ID=cds-NP_215614.1;Parent=gene-Rv1098c;Dbxref=Genbank:NP_215614.1,GeneID:885651;Name=NP_215614.1;Note=fumarase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fum;inference=protein motif:PROSITE:PS00163;locus_tag=Rv1098c;product=fumarate hydratase;protein_id=NP_215614.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1227596 1228684 . - . ID=gene-Rv1099c;Dbxref=GeneID:885861;Name=glpX;gbkey=Gene;gene=glpX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1099c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1227596 1228684 . - 0 ID=cds-NP_215615.3;Parent=gene-Rv1099c;Dbxref=Genbank:NP_215615.3,GeneID:885861;Name=NP_215615.3;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15470127];gbkey=CDS;gene=glpX;locus_tag=Rv1099c;product=fructose 1%2C6-bisphosphatase;protein_id=NP_215615.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1228683 1229384 . + . ID=gene-Rv1100;Dbxref=GeneID:885852;Name=Rv1100;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1100
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1228683 1229384 . + 0 ID=cds-NP_215616.1;Parent=gene-Rv1100;Dbxref=Genbank:NP_215616.1,GeneID:885852;Name=NP_215616.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1100;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215616.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1229391 1230548 . - . ID=gene-Rv1101c;Dbxref=GeneID:885482;Name=Rv1101c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1101c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1229391 1230548 . - 0 ID=cds-NP_215617.1;Parent=gene-Rv1101c;Dbxref=Genbank:NP_215617.1,GeneID:885482;Name=NP_215617.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1101c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215617.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1230660 1230971 . - . ID=gene-Rv1102c;Dbxref=GeneID:886001;Name=mazF3;gbkey=Gene;gene=mazF3;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt6;locus_tag=Rv1102c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1230660 1230971 . - 0 ID=cds-NP_215618.1;Parent=gene-Rv1102c;Dbxref=Genbank:NP_215618.1,GeneID:886001;Name=NP_215618.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1103c;experiment=DESCRIPTION:Gene expression and protein characterization[20705052];gbkey=CDS;gene=mazF3;locus_tag=Rv1102c;product=mRNA interferase MazF3;protein_id=NP_215618.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1230971 1231291 . - . ID=gene-Rv1103c;Dbxref=GeneID:885941;Name=mazE3;gbkey=Gene;gene=mazE3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1103c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1230971 1231291 . - 0 ID=cds-NP_215619.1;Parent=gene-Rv1103c;Dbxref=Genbank:NP_215619.1,GeneID:885941;Name=NP_215619.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1102c;experiment=DESCRIPTION:Gene expression and protein characterization[19016878];gbkey=CDS;gene=mazE3;locus_tag=Rv1103c;product=antitoxin MazE3;protein_id=NP_215619.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1232844 1233956 . - . ID=gene-Rv1106c;Dbxref=GeneID:886004;Name=Rv1106c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1106c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1232844 1233956 . - 0 ID=cds-NP_215622.1;Parent=gene-Rv1106c;Dbxref=Genbank:NP_215622.1,GeneID:886004;Name=NP_215622.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:17630785];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1106c;product=3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta 5-->4-isomerase;protein_id=NP_215622.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1233966 1234223 . - . ID=gene-Rv1107c;Dbxref=GeneID:886005;Name=xseB;gbkey=Gene;gene=xseB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1107c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1233966 1234223 . - 0 ID=cds-NP_215623.1;Parent=gene-Rv1107c;Dbxref=Genbank:NP_215623.1,GeneID:886005;Name=NP_215623.1;gbkey=CDS;gene=xseB;locus_tag=Rv1107c;product=exodeoxyribonuclease VII small subunit;protein_id=NP_215623.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1234213 1235460 . - . ID=gene-Rv1108c;Dbxref=GeneID:885984;Name=xseA;gbkey=Gene;gene=xseA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1108c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1234213 1235460 . - 0 ID=cds-NP_215624.1;Parent=gene-Rv1108c;Dbxref=Genbank:NP_215624.1,GeneID:885984;Name=NP_215624.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=xseA;locus_tag=Rv1108c;product=exodeoxyribonuclease VII large subunit;protein_id=NP_215624.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1235457 1236095 . - . ID=gene-Rv1109c;Dbxref=GeneID:885828;Name=Rv1109c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1109c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1235457 1236095 . - 0 ID=cds-NP_215625.1;Parent=gene-Rv1109c;Dbxref=Genbank:NP_215625.1,GeneID:885828;Name=NP_215625.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1109c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215625.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1236185 1237192 . + . ID=gene-Rv1110;Dbxref=GeneID:885830;Name=lytB2;gbkey=Gene;gene=lytB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1110
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1236185 1237192 . + 0 ID=cds-YP_177788.1;Parent=gene-Rv1110;Dbxref=Genbank:YP_177788.1,GeneID:885830;Name=YP_177788.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lytB2;locus_tag=Rv1110;product=4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase;protein_id=YP_177788.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1237209 1238192 . - . ID=gene-Rv1111c;Dbxref=GeneID:885447;Name=Rv1111c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1111c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1237209 1238192 . - 0 ID=cds-NP_215627.2;Parent=gene-Rv1111c;Dbxref=Genbank:NP_215627.2,GeneID:885447;Name=NP_215627.2;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1111c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215627.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1238255 1239328 . + . ID=gene-Rv1112;Dbxref=GeneID:887151;Name=Rv1112;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1112
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1238255 1239328 . + 0 ID=cds-NP_215628.1;Parent=gene-Rv1112;Dbxref=Genbank:NP_215628.1,GeneID:887151;Name=NP_215628.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1112;product=GTP-binding protein;protein_id=NP_215628.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1239416 1239613 . + . ID=gene-Rv1113;Dbxref=GeneID:885450;Name=vapB32;gbkey=Gene;gene=vapB32;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1113
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1239416 1239613 . + 0 ID=cds-NP_215629.1;Parent=gene-Rv1113;Dbxref=Genbank:NP_215629.1,GeneID:885450;Name=NP_215629.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1114;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB32;locus_tag=Rv1113;product=antitoxin VapB32;protein_id=NP_215629.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1239610 1239984 . + . ID=gene-Rv1114;Dbxref=GeneID:885490;Name=vapC32;gbkey=Gene;gene=vapC32;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1114
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1239610 1239984 . + 0 ID=cds-NP_215630.1;Parent=gene-Rv1114;Dbxref=Genbank:NP_215630.1,GeneID:885490;Name=NP_215630.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1113%2Ccontains PIN domain;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=vapC32;locus_tag=Rv1114;product=ribonuclease VapC32;protein_id=NP_215630.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1240187 1240885 . + . ID=gene-Rv1115;Dbxref=GeneID:885951;Name=Rv1115;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1115
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1240187 1240885 . + 0 ID=cds-NP_215631.1;Parent=gene-Rv1115;Dbxref=Genbank:NP_215631.1,GeneID:885951;Name=NP_215631.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1115;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215631.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1241003 1241188 . + . ID=gene-Rv1116;Dbxref=GeneID:885969;Name=Rv1116;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1116
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1241003 1241188 . + 0 ID=cds-NP_215632.1;Parent=gene-Rv1116;Dbxref=Genbank:NP_215632.1,GeneID:885969;Name=NP_215632.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1116;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215632.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1241633 1241956 . + . ID=gene-Rv1117;Dbxref=GeneID:885847;Name=Rv1117;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1117
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1241633 1241956 . + 0 ID=cds-NP_215633.1;Parent=gene-Rv1117;Dbxref=Genbank:NP_215633.1,GeneID:885847;Name=NP_215633.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1117;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215633.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1241971 1242831 . - . ID=gene-Rv1118c;Dbxref=GeneID:888936;Name=Rv1118c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1118c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1241971 1242831 . - 0 ID=cds-NP_215634.1;Parent=gene-Rv1118c;Dbxref=Genbank:NP_215634.1,GeneID:888936;Name=NP_215634.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1118c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215634.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1242864 1243013 . - . ID=gene-Rv1119c;Dbxref=GeneID:885853;Name=Rv1119c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1119c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1242864 1243013 . - 0 ID=cds-NP_215635.1;Parent=gene-Rv1119c;Dbxref=Genbank:NP_215635.1,GeneID:885853;Name=NP_215635.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1119c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215635.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1243010 1243504 . - . ID=gene-Rv1120c;Dbxref=GeneID:885633;Name=Rv1120c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1120c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1243010 1243504 . - 0 ID=cds-NP_215636.1;Parent=gene-Rv1120c;Dbxref=Genbank:NP_215636.1,GeneID:885633;Name=NP_215636.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1120c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215636.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1243707 1245107 . + . ID=gene-Rv1121;Dbxref=GeneID:885817;Name=zwf1;gbkey=Gene;gene=zwf1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=zwf;locus_tag=Rv1121
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1243707 1245107 . + 0 ID=cds-YP_177789.1;Parent=gene-Rv1121;Dbxref=Genbank:YP_177789.1,GeneID:885817;Name=YP_177789.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=zwf1;locus_tag=Rv1121;product=glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase;protein_id=YP_177789.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1246144 1247052 . - . ID=gene-Rv1123c;Dbxref=GeneID:885965;Name=bpoB;gbkey=Gene;gene=bpoB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1123c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1246144 1247052 . - 0 ID=cds-NP_215639.1;Parent=gene-Rv1123c;Dbxref=Genbank:NP_215639.1,GeneID:885965;Name=NP_215639.1;Note=non-haem peroxidase;gbkey=CDS;gene=bpoB;inference=protein motif:PROSITE:PS00216;locus_tag=Rv1123c;product=peroxidase BpoB;protein_id=NP_215639.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1247127 1248077 . + . ID=gene-Rv1124;Dbxref=GeneID:886022;Name=ephC;gbkey=Gene;gene=ephC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1124
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1248082 1249326 . + . ID=gene-Rv1125;Dbxref=GeneID:886021;Name=Rv1125;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1125
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1248082 1249326 . + 0 ID=cds-NP_215641.1;Parent=gene-Rv1125;Dbxref=Genbank:NP_215641.1,GeneID:886021;Name=NP_215641.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1125;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215641.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1249330 1249935 . - . ID=gene-Rv1126c;Dbxref=GeneID:885845;Name=Rv1126c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1126c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1249330 1249935 . - 0 ID=cds-NP_215642.1;Parent=gene-Rv1126c;Dbxref=Genbank:NP_215642.1,GeneID:885845;Name=NP_215642.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1126c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215642.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1249932 1251404 . - . ID=gene-Rv1127c;Dbxref=GeneID:885956;Name=ppdK;gbkey=Gene;gene=ppdK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1127c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1249932 1251404 . - 0 ID=cds-NP_215643.1;Parent=gene-Rv1127c;Dbxref=Genbank:NP_215643.1,GeneID:885956;Name=NP_215643.1;gbkey=CDS;gene=ppdK;locus_tag=Rv1127c;product=pyruvate%2C phosphate dikinase PpdK;protein_id=NP_215643.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1251617 1252972 . - . ID=gene-Rv1128c;Dbxref=GeneID:885849;Name=Rv1128c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1128c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1251617 1252972 . - 0 ID=cds-NP_215644.1;Parent=gene-Rv1128c;Dbxref=Genbank:NP_215644.1,GeneID:885849;Name=NP_215644.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1128c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215644.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1251621 1252945 . + . ID=id-NC_000962.3:1251621..1252945;Note=REP-3%2C len: 1325 nt. REP22G8%2C member of REP13E12 family.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1253074 1254534 . - . ID=gene-Rv1129c;Dbxref=GeneID:885963;Name=Rv1129c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1129c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1253074 1254534 . - 0 ID=cds-NP_215645.1;Parent=gene-Rv1129c;Dbxref=Genbank:NP_215645.1,GeneID:885963;Name=NP_215645.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1129c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215645.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1254555 1256135 . + . ID=gene-Rv1130;Dbxref=GeneID:885843;Name=prpD;gbkey=Gene;gene=prpD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1130
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1254555 1256135 . + 0 ID=cds-NP_215646.1;Parent=gene-Rv1130;Dbxref=Genbank:NP_215646.1,GeneID:885843;Name=NP_215646.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=prpD;locus_tag=Rv1130;product=2-methylcitrate dehydratase;protein_id=NP_215646.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1256132 1257313 . + . ID=gene-Rv1131;Dbxref=GeneID:888949;Name=prpC;gbkey=Gene;gene=prpC;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gltA1;locus_tag=Rv1131
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1256132 1257313 . + 0 ID=cds-NP_215647.1;Parent=gene-Rv1131;Dbxref=Genbank:NP_215647.1,GeneID:888949;Name=NP_215647.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=prpC;inference=protein motif:PROSITE:PS00480;locus_tag=Rv1131;product=methylcitrate synthase PrpC;protein_id=NP_215647.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1257325 1259055 . + . ID=gene-Rv1132;Dbxref=GeneID:885824;Name=Rv1132;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1132
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1257325 1259055 . + 0 ID=cds-NP_215648.1;Parent=gene-Rv1132;Dbxref=Genbank:NP_215648.1,GeneID:885824;Name=NP_215648.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1132;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215648.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1259067 1261346 . - . ID=gene-Rv1133c;Dbxref=GeneID:888947;Name=metE;gbkey=Gene;gene=metE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1133c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1259067 1261346 . - 0 ID=cds-NP_215649.1;Parent=gene-Rv1133c;Dbxref=Genbank:NP_215649.1,GeneID:888947;Name=NP_215649.1;Note=methionine synthase%2C vitamin-B12 independent isozyme;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=metE;locus_tag=Rv1133c;product=5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase;protein_id=NP_215649.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1261922 1262158 . + . ID=gene-Rv1134;Dbxref=GeneID:885983;Name=Rv1134;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1134
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1261922 1262158 . + 0 ID=cds-NP_215650.1;Parent=gene-Rv1134;Dbxref=Genbank:NP_215650.1,GeneID:885983;Name=NP_215650.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1134;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215650.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1262272 1264128 . - . ID=gene-Rv1135c;Dbxref=GeneID:885131;Name=PPE16;gbkey=Gene;gene=PPE16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1135c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1262272 1264128 . - 0 ID=cds-YP_177790.1;Parent=gene-Rv1135c;Dbxref=Genbank:YP_177790.1,GeneID:885131;Name=YP_177790.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE16;locus_tag=Rv1135c;product=PPE family protein PPE16;protein_id=YP_177790.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1265034 1265438 . + . ID=gene-Rv1138a;Dbxref=GeneID:19394671;Name=Rv1138a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1138a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1265034 1265438 . + 0 ID=cds-YP_009030030.1;Parent=gene-Rv1138a;Dbxref=Genbank:YP_009030030.1,GeneID:19394671;Name=YP_009030030.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1138a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030030.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1265472 1266488 . - . ID=gene-Rv1138c;Dbxref=GeneID:885119;Name=Rv1138c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1138c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1265472 1266488 . - 0 ID=cds-NP_215654.1;Parent=gene-Rv1138c;Dbxref=Genbank:NP_215654.1,GeneID:885119;Name=NP_215654.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1138c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215654.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1266485 1266985 . - . ID=gene-Rv1139c;Dbxref=GeneID:885110;Name=Rv1139c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1139c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1266485 1266985 . - 0 ID=cds-NP_215655.1;Parent=gene-Rv1139c;Dbxref=Genbank:NP_215655.1,GeneID:885110;Name=NP_215655.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1139c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215655.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1267347 1268195 . + . ID=gene-Rv1140;Dbxref=GeneID:885117;Name=Rv1140;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1140
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1267347 1268195 . + 0 ID=cds-NP_215656.1;Parent=gene-Rv1140;Dbxref=Genbank:NP_215656.1,GeneID:885117;Name=NP_215656.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1140;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215656.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1268203 1269009 . - . ID=gene-Rv1141c;Dbxref=GeneID:886024;Name=echA11;gbkey=Gene;gene=echA11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1141c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1268203 1269009 . - 0 ID=cds-NP_215657.1;Parent=gene-Rv1141c;Dbxref=Genbank:NP_215657.1,GeneID:886024;Name=NP_215657.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=echA11;locus_tag=Rv1141c;product=enoyl-CoA hydratase EchA11;protein_id=NP_215657.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1269152 1269958 . - . ID=gene-Rv1142c;Dbxref=GeneID:885458;Name=echA10;gbkey=Gene;gene=echA10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1142c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1269152 1269958 . - 0 ID=cds-NP_215658.1;Parent=gene-Rv1142c;Dbxref=Genbank:NP_215658.1,GeneID:885458;Name=NP_215658.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=echA10;locus_tag=Rv1142c;product=enoyl-CoA hydratase EchA10;protein_id=NP_215658.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1270062 1271144 . + . ID=gene-Rv1143;Dbxref=GeneID:885067;Name=mcr;gbkey=Gene;gene=mcr;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1143
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1270062 1271144 . + 0 ID=cds-NP_215659.1;Parent=gene-Rv1143;Dbxref=Genbank:NP_215659.1,GeneID:885067;Name=NP_215659.1;Note=Mcr (2-methylacyl-CoA racemase) (2-arylpropionyl-CoA epimerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mcr;locus_tag=Rv1143;product=alpha-methylacyl-CoA racemase;protein_id=NP_215659.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1271156 1271908 . + . ID=gene-Rv1144;Dbxref=GeneID:885932;Name=Rv1144;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1144
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1271156 1271908 . + 0 ID=cds-NP_215660.1;Parent=gene-Rv1144;Dbxref=Genbank:NP_215660.1,GeneID:885932;Name=NP_215660.1;Note=short-chain type dehydrogenase/reductase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1144;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215660.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1272423 1273334 . + . ID=gene-Rv1145;Dbxref=GeneID:885798;Name=Rv1145;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1145
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1272423 1273334 . + 0 ID=cds-NP_215661.1;Parent=gene-Rv1145;Dbxref=Genbank:NP_215661.1,GeneID:885798;Name=NP_215661.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1145;product=transmembrane transport protein;protein_id=NP_215661.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1273355 1274767 . + . ID=gene-Rv1146;Dbxref=GeneID:885575;Name=Rv1146;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1146
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1273355 1274767 . + 0 ID=cds-NP_215662.1;Parent=gene-Rv1146;Dbxref=Genbank:NP_215662.1,GeneID:885575;Name=NP_215662.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1146;product=transmembrane transport protein;protein_id=NP_215662.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1274900 1275550 . + . ID=gene-Rv1147;Dbxref=GeneID:885471;Name=Rv1147;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1147
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1274900 1275550 . + 0 ID=cds-NP_215663.1;Parent=gene-Rv1147;Dbxref=Genbank:NP_215663.1,GeneID:885471;Name=NP_215663.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1147;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215663.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1276296 1277643 . + . ID=id-NC_000962.3:1276296..1277643;Note=REP-4%2C len: 1348 nt. REP165%2C member of REP13E12 family.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1276300 1277748 . - . ID=gene-Rv1148c;Dbxref=GeneID:885451;Name=Rv1148c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1148c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1276300 1277748 . - 0 ID=cds-NP_215664.1;Parent=gene-Rv1148c;Dbxref=Genbank:NP_215664.1,GeneID:885451;Name=NP_215664.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1148c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215664.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1277843 1278826 . + . ID=id-NC_000962.3:1277843..1278826;Note=IS-LIKE-2%2C len: 984 nt. Insertion sequence element IS-LIKE.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS-LIKE-2
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1277843 1277846 . + . ID=id-NC_000962.3:1277843..1277846;Note=4 bp direct repeat%2C CTAG%2C generated by IS element on insertion. Proposed by Mariani et al. 1993. J. Gen. Microbiol.%2C 139: 1767-1772. Note that as motif palindromic could be part of inverted repeat itself.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1277847 1277863 . + . ID=id-NC_000962.3:1277847..1277863;Note=17 bp Inverted repeat at the left end of putative IS-LIKE-2 element : GGCGTGTCTCCCAAATT. Proposed by Mariani et al. 1993. J. Gen. Microbiol. 139: 1767-1772.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1277893 1278300 . + . ID=gene-Rv1149;Dbxref=GeneID:885164;Name=Rv1149;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1149
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1277893 1278300 . + 0 ID=cds-NP_215665.1;Parent=gene-Rv1149;Dbxref=Genbank:NP_215665.1,GeneID:885164;Name=NP_215665.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1149;product=transposase;protein_id=NP_215665.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 1278269 1278820 . + . ID=gene-Rv1150;Dbxref=GeneID:886020;Name=Rv1150;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv1150;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 1278269 1278820 . + . ID=id-Rv1150;Dbxref=GeneID:886020;Note=Possible fragment of transposase (pseudogene). Identical to C-terminal part of S21394 transposase of putative Mycobacterium tuberculosis is element. The transposase described here may be made by a -1 frame shifting mechanism during translation that fuses Rv1149|MTCI65.16 and Rv1150|MTCI65.17. No evidence found to account for discrepancy with previously published sequence. Second copy is Rv1041c|MTCY10G2.08.;gbkey=misc_feature;locus_tag=Rv1150;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1278817 1278820 . + . ID=id-Rv1150-2;Dbxref=GeneID:886020;Note=4 bp direct repeat%2C CTAG generated by IS element on insertion. Proposed by Mariani et al. 1993. J. Gen. Microbiol. 139: 1767-1772. Note that as motif palindromic could be part of inverted repeat itself.;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1150
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1278800 1278816 . - . ID=id-NC_000962.3:1278800..1278816;Note=17 bp Inverted repeat at the right end of putative IS-LIKE-2 element :GGCGTGTCTCCCAATTT. Proposed by Mariani et al. 1993. J. Gen. Microbiol. 139: 1767-1772;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1278904 1279617 . - . ID=gene-Rv1151c;Dbxref=GeneID:886026;Name=Rv1151c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1151c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1278904 1279617 . - 0 ID=cds-NP_215667.1;Parent=gene-Rv1151c;Dbxref=Genbank:NP_215667.1,GeneID:886026;Name=NP_215667.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19747094];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1151c;product=NAD-dependent protein deacylase;protein_id=NP_215667.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1279655 1280020 . + . ID=gene-Rv1152;Dbxref=GeneID:885985;Name=Rv1152;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1152
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1279655 1280020 . + 0 ID=cds-NP_215668.1;Parent=gene-Rv1152;Dbxref=Genbank:NP_215668.1,GeneID:885985;Name=NP_215668.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1152;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215668.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1279998 1280846 . - . ID=gene-Rv1153c;Dbxref=GeneID:885994;Name=omt;gbkey=Gene;gene=omt;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1153c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1279998 1280846 . - 0 ID=cds-NP_215669.1;Parent=gene-Rv1153c;Dbxref=Genbank:NP_215669.1,GeneID:885994;Name=NP_215669.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=omt;locus_tag=Rv1153c;product=O-methyltransferase;protein_id=NP_215669.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1280843 1281484 . - . ID=gene-Rv1154c;Dbxref=GeneID:885991;Name=Rv1154c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1154c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1280843 1281484 . - 0 ID=cds-NP_215670.1;Parent=gene-Rv1154c;Dbxref=Genbank:NP_215670.1,GeneID:885991;Name=NP_215670.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1154c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215670.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1281429 1281872 . + . ID=gene-Rv1155;Dbxref=GeneID:885604;Name=Rv1155;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1155
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1281429 1281872 . + 0 ID=cds-NP_215671.1;Parent=gene-Rv1155;Dbxref=Genbank:NP_215671.1,GeneID:885604;Name=NP_215671.1;experiment=DESCRIPTION:Protein crystallography and characterization[PMID:16239726];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1155;product=pyridoxine/pyridoxamine 5'-phosphate oxidase;protein_id=NP_215671.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1282030 1282218 . + . ID=gene-Rv1155a;Dbxref=GeneID:19394672;Name=Rv1155a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1155a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1282030 1282218 . + 0 ID=cds-YP_009030031.1;Parent=gene-Rv1155a;Dbxref=Genbank:YP_009030031.1,GeneID:19394672;Name=YP_009030031.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1155a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030031.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1282306 1282893 . + . ID=gene-Rv1156;Dbxref=GeneID:885593;Name=Rv1156;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1156
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1282306 1282893 . + 0 ID=cds-NP_215672.1;Parent=gene-Rv1156;Dbxref=Genbank:NP_215672.1,GeneID:885593;Name=NP_215672.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1156;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215672.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1283056 1284171 . - . ID=gene-Rv1157c;Dbxref=GeneID:885878;Name=Rv1157c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1157c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1283056 1284171 . - 0 ID=cds-NP_215673.1;Parent=gene-Rv1157c;Dbxref=Genbank:NP_215673.1,GeneID:885878;Name=NP_215673.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1157c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215673.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1283693 1283815 . + . ID=gene-RVnc0012;Dbxref=GeneID:14515854;Name=mcr10;gbkey=Gene;gene=mcr10;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0012
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1283693 1283815 . + . ID=rna-RVnc0012;Parent=gene-RVnc0012;Dbxref=GeneID:14515854;Note=mcr10%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped%2C ~~118 nt band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=mcr10;locus_tag=RVnc0012;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1283693 1283815 . + . ID=exon-RVnc0012-1;Parent=rna-RVnc0012;Dbxref=GeneID:14515854;Note=mcr10%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped%2C ~~118 nt band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=mcr10;locus_tag=RVnc0012;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1284179 1284862 . - . ID=gene-Rv1158c;Dbxref=GeneID:888930;Name=Rv1158c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1158c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1284179 1284862 . - 0 ID=cds-NP_215674.1;Parent=gene-Rv1158c;Dbxref=Genbank:NP_215674.1,GeneID:888930;Name=NP_215674.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1158c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215674.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1284992 1286287 . + . ID=gene-Rv1159;Dbxref=GeneID:885899;Name=pimE;gbkey=Gene;gene=pimE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1159
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1284992 1286287 . + 0 ID=cds-NP_215675.1;Parent=gene-Rv1159;Dbxref=Genbank:NP_215675.1,GeneID:885899;Name=NP_215675.1;Note=Belongs to the GT-C superfamily of glycosyltransferases;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pimE;locus_tag=Rv1159;product=polyprenol-phosphate-mannose-dependent alpha-(1-2)-phosphatidylinositol pentamannoside mannosyltransferase;protein_id=NP_215675.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1286284 1286568 . - . ID=gene-Rv1159A;Dbxref=GeneID:3205109;Name=Rv1159A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1159A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1286284 1286568 . - 0 ID=cds-YP_177641.1;Parent=gene-Rv1159A;Dbxref=Genbank:YP_177641.1,GeneID:3205109;Name=YP_177641.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1159A;product=4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase;protein_id=YP_177641.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1286595 1287020 . + . ID=gene-Rv1160;Dbxref=GeneID:888485;Name=mutT2;gbkey=Gene;gene=mutT2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1160
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1286595 1287020 . + 0 ID=cds-NP_215676.1;Parent=gene-Rv1160;Dbxref=Genbank:NP_215676.1,GeneID:888485;Name=NP_215676.1;Note=mutator protein MutT%3B 7%2C8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase (8-oxo-dGTPase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16585780];gbkey=CDS;gene=mutT2;inference=protein motif:PROSITE:PS00893;locus_tag=Rv1160;product=8-oxo-dGTP diphosphatase;protein_id=NP_215676.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1287328 1291026 . + . ID=gene-Rv1161;Dbxref=GeneID:885573;Name=narG;gbkey=Gene;gene=narG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1161
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1287328 1291026 . + 0 ID=cds-NP_215677.1;Parent=gene-Rv1161;Dbxref=Genbank:NP_215677.1,GeneID:885573;Name=NP_215677.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=narG;inference=protein motif:PROSITE:PS00551;locus_tag=Rv1161;product=nitrate reductase subunit alpha;protein_id=NP_215677.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1291065 1292741 . + . ID=gene-Rv1162;Dbxref=GeneID:888265;Name=narH;gbkey=Gene;gene=narH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1162
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1291065 1292741 . + 0 ID=cds-NP_215678.1;Parent=gene-Rv1162;Dbxref=Genbank:NP_215678.1,GeneID:888265;Name=NP_215678.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=narH;inference=protein motif:PROSITE:PS00190;locus_tag=Rv1162;product=nitrate reductase subunit beta;protein_id=NP_215678.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1292798 1293403 . + . ID=gene-Rv1163;Dbxref=GeneID:885890;Name=narJ;gbkey=Gene;gene=narJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1163
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1292798 1293403 . + 0 ID=cds-NP_215679.1;Parent=gene-Rv1163;Dbxref=Genbank:NP_215679.1,GeneID:885890;Name=NP_215679.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=narJ;locus_tag=Rv1163;product=nitrate reductase subunit delta;protein_id=NP_215679.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1293406 1294146 . + . ID=gene-Rv1164;Dbxref=GeneID:888935;Name=narI;gbkey=Gene;gene=narI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1164
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1293406 1294146 . + 0 ID=cds-NP_215680.1;Parent=gene-Rv1164;Dbxref=Genbank:NP_215680.1,GeneID:888935;Name=NP_215680.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=narI;locus_tag=Rv1164;product=nitrate reductase subunit gamma;protein_id=NP_215680.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1294168 1296054 . + . ID=gene-Rv1165;Dbxref=GeneID:886038;Name=typA;gbkey=Gene;gene=typA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=bipA;locus_tag=Rv1165
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1294168 1296054 . + 0 ID=cds-NP_215681.1;Parent=gene-Rv1165;Dbxref=Genbank:NP_215681.1,GeneID:886038;Name=NP_215681.1;Note=tyrosine phosphorylated protein A (GTP-binding protein);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=typA;locus_tag=Rv1165;product=GTP-binding translation elongation factor;protein_id=NP_215681.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1296152 1298059 . + . ID=gene-Rv1166;Dbxref=GeneID:886036;Name=lpqW;gbkey=Gene;gene=lpqW;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1166
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1296152 1298059 . + 0 ID=cds-NP_215682.1;Parent=gene-Rv1166;Dbxref=Genbank:NP_215682.1,GeneID:886036;Name=NP_215682.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=lpqW;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1166;product=monoacyl phosphatidylinositol tetramannoside-binding protein LpqW;protein_id=NP_215682.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1298087 1298692 . - . ID=gene-Rv1167c;Dbxref=GeneID:888758;Name=Rv1167c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1167c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1298087 1298692 . - 0 ID=cds-NP_215683.1;Parent=gene-Rv1167c;Dbxref=Genbank:NP_215683.1,GeneID:888758;Name=NP_215683.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1167c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215683.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1298764 1299804 . - . ID=gene-Rv1168c;Dbxref=GeneID:885990;Name=PPE17;gbkey=Gene;gene=PPE17;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1168c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1298764 1299804 . - 0 ID=cds-YP_177791.1;Parent=gene-Rv1168c;Dbxref=Genbank:YP_177791.1,GeneID:885990;Name=YP_177791.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE17;locus_tag=Rv1168c;product=PPE family protein PPE17;protein_id=YP_177791.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1299822 1300124 . - . ID=gene-Rv1169c;Dbxref=GeneID:885930;Name=lipX;gbkey=Gene;gene=lipX;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=PE11;locus_tag=Rv1169c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1299822 1300124 . - 0 ID=cds-YP_177792.1;Parent=gene-Rv1169c;Dbxref=Genbank:YP_177792.1,GeneID:885930;Name=YP_177792.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lipX;locus_tag=Rv1169c;product=lipase LipX;protein_id=YP_177792.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1300304 1301215 . + . ID=gene-Rv1170;Dbxref=GeneID:885997;Name=mshB;gbkey=Gene;gene=mshB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1170
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1300304 1301215 . + 0 ID=cds-NP_215686.1;Parent=gene-Rv1170;Dbxref=Genbank:NP_215686.1,GeneID:885997;Name=NP_215686.1;Note=N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside deacetylase MshB%3B GlcNAc-Ins deacetylase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:11092856];gbkey=CDS;gene=mshB;locus_tag=Rv1170;product=1D-myo-inositol 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside deacetylase;protein_id=NP_215686.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1301307 1301747 . + . ID=gene-Rv1171;Dbxref=GeneID:885986;Name=Rv1171;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1171
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1301307 1301747 . + 0 ID=cds-NP_215687.2;Parent=gene-Rv1171;Dbxref=Genbank:NP_215687.2,GeneID:885986;Name=NP_215687.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1171;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215687.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1301755 1302681 . - . ID=gene-Rv1172c;Dbxref=GeneID:885988;Name=PE12;gbkey=Gene;gene=PE12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1172c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1301755 1302681 . - 0 ID=cds-YP_177793.1;Parent=gene-Rv1172c;Dbxref=Genbank:YP_177793.1,GeneID:885988;Name=YP_177793.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=PE12;locus_tag=Rv1172c;product=PE family protein PE12;protein_id=YP_177793.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1302931 1305501 . + . ID=gene-Rv1173;Dbxref=GeneID:886061;Name=fbiC;gbkey=Gene;gene=fbiC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1173
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1302931 1305501 . + 0 ID=cds-NP_215689.1;Parent=gene-Rv1173;Dbxref=Genbank:NP_215689.1,GeneID:886061;Name=NP_215689.1;Note=F420 biosynthesis protein FbiC;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fbiC;locus_tag=Rv1173;product=FO synthase;protein_id=NP_215689.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1305619 1305661 . + . ID=id-NC_000962.3:1305619..1305661;Note=62 bp direct repeat partial copy 3 (43/62 bp)%2CGGCCTAGCCCCGGCGACGATGCCGGGTCGCGGGATGGGGCCCG;gbkey=repeat_region
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1309364 1310452 . + . ID=gene-Rv1178;Dbxref=GeneID:886031;Name=Rv1178;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1178
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1309364 1310452 . + 0 ID=cds-NP_215694.1;Parent=gene-Rv1178;Dbxref=Genbank:NP_215694.1,GeneID:886031;Name=NP_215694.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00105;locus_tag=Rv1178;product=aminotransferase;protein_id=NP_215694.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1310480 1313299 . - . ID=gene-Rv1179c;Dbxref=GeneID:886083;Name=Rv1179c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1179c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1310480 1313299 . - 0 ID=cds-NP_215695.1;Parent=gene-Rv1179c;Dbxref=Genbank:NP_215695.1,GeneID:886083;Name=NP_215695.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1179c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215695.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1313725 1315191 . + . ID=gene-Rv1180;Dbxref=GeneID:886055;Name=pks3;gbkey=Gene;gene=pks3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1180
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1313725 1315191 . + 0 ID=cds-NP_215696.1;Parent=gene-Rv1180;Dbxref=Genbank:NP_215696.1,GeneID:886055;Name=NP_215696.1;Note=Rv1180/Rv1181 fusion has been called msl3. The two CDS's may represent separate modules of the polyketide synthase.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=pks3;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv1180;product=polyketide beta-ketoacyl synthase;protein_id=NP_215696.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1315234 1319982 . + . ID=gene-Rv1181;Dbxref=GeneID:886081;Name=pks4;gbkey=Gene;gene=pks4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1181
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1315234 1319982 . + 0 ID=cds-NP_215697.1;Parent=gene-Rv1181;Dbxref=Genbank:NP_215697.1,GeneID:886081;Name=NP_215697.1;Note=Rv1180/Rv1181 fusion has been called msl3. The two CDS's may represent separate modules of the polyketide synthase.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=pks4;locus_tag=Rv1181;product=polyketide beta-ketoacyl synthase;protein_id=NP_215697.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1320035 1321453 . + . ID=gene-Rv1182;Dbxref=GeneID:886072;Name=papA3;gbkey=Gene;gene=papA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1182
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1320035 1321453 . + 0 ID=cds-NP_215698.1;Parent=gene-Rv1182;Dbxref=Genbank:NP_215698.1,GeneID:886072;Name=NP_215698.1;Note=polyketide synthase associated protein PapA;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19276083];gbkey=CDS;gene=papA3;locus_tag=Rv1182;product=acyltransferase papA3;protein_id=NP_215698.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1321520 1324528 . + . ID=gene-Rv1183;Dbxref=GeneID:886068;Name=mmpL10;gbkey=Gene;gene=mmpL10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1183
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1321520 1324528 . + 0 ID=cds-NP_215699.1;Parent=gene-Rv1183;Dbxref=Genbank:NP_215699.1,GeneID:886068;Name=NP_215699.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpL10;locus_tag=Rv1183;product=transmembrane transport protein MmpL10;protein_id=NP_215699.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1324532 1325611 . - . ID=gene-Rv1184c;Dbxref=GeneID:886063;Name=Rv1184c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1184c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1324532 1325611 . - 0 ID=cds-NP_215700.1;Parent=gene-Rv1184c;Dbxref=Genbank:NP_215700.1,GeneID:886063;Name=NP_215700.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1184c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215700.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1325776 1327512 . - . ID=gene-Rv1185c;Dbxref=GeneID:886065;Name=fadD21;gbkey=Gene;gene=fadD21;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1185c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1325776 1327512 . - 0 ID=cds-NP_215701.1;Parent=gene-Rv1185c;Dbxref=Genbank:NP_215701.1,GeneID:886065;Name=NP_215701.1;Note=fatty-acid-AMP synthetase (fatty-acid-AMP synthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=fadD21;locus_tag=Rv1185c;product=fatty-acid--CoA ligase FadD21;protein_id=NP_215701.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1327689 1329305 . - . ID=gene-Rv1186c;Dbxref=GeneID:886057;Name=Rv1186c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1186c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1327689 1329305 . - 0 ID=cds-NP_215702.1;Parent=gene-Rv1186c;Dbxref=Genbank:NP_215702.1,GeneID:886057;Name=NP_215702.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1186c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215702.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1329390 1331021 . + . ID=gene-Rv1187;Dbxref=GeneID:886058;Name=rocA;gbkey=Gene;gene=rocA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1187
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1329390 1331021 . + 0 ID=cds-NP_215703.1;Parent=gene-Rv1187;Dbxref=Genbank:NP_215703.1,GeneID:886058;Name=NP_215703.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rocA;locus_tag=Rv1187;product=pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase RocA;protein_id=NP_215703.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1331021 1332010 . + . ID=gene-Rv1188;Dbxref=GeneID:886054;Name=Rv1188;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1188
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1331021 1332010 . + 0 ID=cds-NP_215704.1;Parent=gene-Rv1188;Dbxref=Genbank:NP_215704.1,GeneID:886054;Name=NP_215704.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1188;product=proline dehydrogenase;protein_id=NP_215704.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1332092 1332964 . + . ID=gene-Rv1189;Dbxref=GeneID:886079;Name=sigI;gbkey=Gene;gene=sigI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1189
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1332092 1332964 . + 0 ID=cds-NP_215705.1;Parent=gene-Rv1189;Dbxref=Genbank:NP_215705.1,GeneID:886079;Name=NP_215705.1;gbkey=CDS;gene=sigI;locus_tag=Rv1189;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigI;protein_id=NP_215705.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1332980 1333858 . + . ID=gene-Rv1190;Dbxref=GeneID:886049;Name=Rv1190;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1190
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1332980 1333858 . + 0 ID=cds-NP_215706.1;Parent=gene-Rv1190;Dbxref=Genbank:NP_215706.1,GeneID:886049;Name=NP_215706.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1190;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215706.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1333931 1334845 . + . ID=gene-Rv1191;Dbxref=GeneID:886041;Name=Rv1191;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1191
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1333931 1334845 . + 0 ID=cds-NP_215707.1;Parent=gene-Rv1191;Dbxref=Genbank:NP_215707.1,GeneID:886041;Name=NP_215707.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv1191;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215707.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1334927 1335754 . + . ID=gene-Rv1192;Dbxref=GeneID:886007;Name=Rv1192;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1192
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1334927 1335754 . + 0 ID=cds-NP_215708.1;Parent=gene-Rv1192;Dbxref=Genbank:NP_215708.1,GeneID:886007;Name=NP_215708.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv1192;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215708.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1335794 1337215 . + . ID=gene-Rv1193;Dbxref=GeneID:886074;Name=fadD36;gbkey=Gene;gene=fadD36;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1193
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1335794 1337215 . + 0 ID=cds-NP_215709.1;Parent=gene-Rv1193;Dbxref=Genbank:NP_215709.1,GeneID:886074;Name=NP_215709.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadD36;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv1193;product=fatty-acid--CoA ligase FadD36;protein_id=NP_215709.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1337248 1338513 . - . ID=gene-Rv1194c;Dbxref=GeneID:886040;Name=Rv1194c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1194c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1337248 1338513 . - 0 ID=cds-NP_215710.1;Parent=gene-Rv1194c;Dbxref=Genbank:NP_215710.1,GeneID:886040;Name=NP_215710.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1194c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215710.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1339003 1339302 . + . ID=gene-Rv1195;Dbxref=GeneID:886044;Name=PE13;gbkey=Gene;gene=PE13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1195
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1339003 1339302 . + 0 ID=cds-YP_177794.1;Parent=gene-Rv1195;Dbxref=Genbank:YP_177794.1,GeneID:886044;Name=YP_177794.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PE13;locus_tag=Rv1195;product=PE family protein PE13;protein_id=YP_177794.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1339349 1340524 . + . ID=gene-Rv1196;Dbxref=GeneID:886073;Name=PPE18;gbkey=Gene;gene=PPE18;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtb39a;locus_tag=Rv1196
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1339349 1340524 . + 0 ID=cds-YP_177795.1;Parent=gene-Rv1196;Dbxref=Genbank:YP_177795.1,GeneID:886073;Name=YP_177795.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PPE18;locus_tag=Rv1196;product=PPE family protein PPE18;protein_id=YP_177795.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 1340578 1340625 . + . ID=id-NC_000962.3:1340578..1340625;Note=ncrMT1234%2C fragment of putative small regulatory RNA (See Pelly et al.%2C 2012)%2C cloned from M. tuberculosis CDC1551%3B supported by RNA-seq in H37Rv (unpublished data).%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 1340659 1340955 . + . ID=gene-Rv1197;Dbxref=GeneID:886051;Name=esxK;gbkey=Gene;gene=esxK;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_3,QILSS,TB11.0;locus_tag=Rv1197
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1340659 1340955 . + 0 ID=cds-NP_215713.1;Parent=gene-Rv1197;Dbxref=Genbank:NP_215713.1,GeneID:886051;Name=NP_215713.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=esxK;locus_tag=Rv1197;product=ESAT-6 like protein EsxK;protein_id=NP_215713.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1341006 1341290 . + . ID=gene-Rv1198;Dbxref=GeneID:886090;Name=esxL;gbkey=Gene;gene=esxL;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_4,Mtb9.9C;locus_tag=Rv1198
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1341006 1341290 . + 0 ID=cds-NP_215714.1;Parent=gene-Rv1198;Dbxref=Genbank:NP_215714.1,GeneID:886090;Name=NP_215714.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=esxL;locus_tag=Rv1198;product=ESAT-6 like protein EsxL;protein_id=NP_215714.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1341358 1342605 . - . ID=gene-Rv1199c;Dbxref=GeneID:886092;Name=Rv1199c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1199c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1341358 1342605 . - 0 ID=cds-NP_215715.1;Parent=gene-Rv1199c;Dbxref=Genbank:NP_215715.1,GeneID:886092;Name=NP_215715.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01007;locus_tag=Rv1199c;product=insertion sequence element IS1081 transposase;protein_id=NP_215715.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1341361 1342789 . - . ID=id-NC_000962.3:1341361..1342789;Note=IS1081-2%2C len: 1429 nt. Insertion sequence IS1081.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1081-2
+NC_000962.3 RefSeq gene 1342942 1344219 . + . ID=gene-Rv1200;Dbxref=GeneID:886087;Name=Rv1200;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1200
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1351191 1352147 . + . ID=gene-Rv1207;Dbxref=GeneID:887447;Name=folP2;gbkey=Gene;gene=folP2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1207
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1352144 1353118 . + . ID=gene-Rv1208;Dbxref=GeneID:886085;Name=gpgS;gbkey=Gene;gene=gpgS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1208
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1353157 1353525 . + . ID=gene-Rv1209;Dbxref=GeneID:887600;Name=Rv1209;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1209
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1353157 1353525 . + 0 ID=cds-NP_215725.1;Parent=gene-Rv1209;Dbxref=Genbank:NP_215725.1,GeneID:887600;Name=NP_215725.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1209;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215725.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1353522 1354136 . + . ID=gene-Rv1210;Dbxref=GeneID:888035;Name=tagA;gbkey=Gene;gene=tagA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1210
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1353522 1354136 . + 0 ID=cds-NP_215726.1;Parent=gene-Rv1210;Dbxref=Genbank:NP_215726.1,GeneID:888035;Name=NP_215726.1;Note=tag I (3-methyladenine-DNA glycosylase I%2C constitutive) (DNA-3-methyladenine glycosidase I);gbkey=CDS;gene=tagA;locus_tag=Rv1210;product=DNA-3-methyladenine glycosylase I TagA;protein_id=NP_215726.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1354243 1354470 . + . ID=gene-Rv1211;Dbxref=GeneID:887990;Name=Rv1211;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1211
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1354243 1354470 . + 0 ID=cds-NP_215727.1;Parent=gene-Rv1211;Dbxref=Genbank:NP_215727.1,GeneID:887990;Name=NP_215727.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1211;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215727.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1354498 1355661 . - . ID=gene-Rv1212c;Dbxref=GeneID:887805;Name=glgA;gbkey=Gene;gene=glgA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1212c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1354498 1355661 . - 0 ID=cds-NP_215728.1;Parent=gene-Rv1212c;Dbxref=Genbank:NP_215728.1,GeneID:887805;Name=NP_215728.1;Note=glycosyl transferase GlgA;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18808383];gbkey=CDS;gene=glgA;locus_tag=Rv1212c;product=capsular glucan synthase;protein_id=NP_215728.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1355836 1357050 . + . ID=gene-Rv1213;Dbxref=GeneID:887933;Name=glgC;gbkey=Gene;gene=glgC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1213
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1355836 1357050 . + 0 ID=cds-NP_215729.1;Parent=gene-Rv1213;Dbxref=Genbank:NP_215729.1,GeneID:887933;Name=NP_215729.1;Note=ADP-glucose synthase (ADP-glucose pyrophosphorylase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18808383];gbkey=CDS;gene=glgC;locus_tag=Rv1213;product=glucose-1-phosphate adenylyltransferase;protein_id=NP_215729.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1357293 1357625 . - . ID=gene-Rv1214c;Dbxref=GeneID:888362;Name=PE14;gbkey=Gene;gene=PE14;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1214c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1357293 1357625 . - 0 ID=cds-YP_177797.1;Parent=gene-Rv1214c;Dbxref=Genbank:YP_177797.1,GeneID:888362;Name=YP_177797.1;Note=Member of the M. tuberculosis PE family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE14;locus_tag=Rv1214c;product=PE family protein PE14;protein_id=YP_177797.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1357759 1359444 . - . ID=gene-Rv1215c;Dbxref=GeneID:887684;Name=Rv1215c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1215c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1357759 1359444 . - 0 ID=cds-NP_215731.1;Parent=gene-Rv1215c;Dbxref=Genbank:NP_215731.1,GeneID:887684;Name=NP_215731.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1215c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215731.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1359472 1360146 . - . ID=gene-Rv1216c;Dbxref=GeneID:888125;Name=Rv1216c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1216c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1359472 1360146 . - 0 ID=cds-NP_215732.1;Parent=gene-Rv1216c;Dbxref=Genbank:NP_215732.1,GeneID:888125;Name=NP_215732.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1216c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215732.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1360155 1361801 . - . ID=gene-Rv1217c;Dbxref=GeneID:888401;Name=Rv1217c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1217c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1360155 1361801 . - 0 ID=cds-NP_215733.1;Parent=gene-Rv1217c;Dbxref=Genbank:NP_215733.1,GeneID:888401;Name=NP_215733.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1217c;product=tetronasin ABC transporter integral membrane protein;protein_id=NP_215733.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1361798 1362733 . - . ID=gene-Rv1218c;Dbxref=GeneID:888518;Name=Rv1218c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1218c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1361798 1362733 . - 0 ID=cds-NP_215734.1;Parent=gene-Rv1218c;Dbxref=Genbank:NP_215734.1,GeneID:888518;Name=NP_215734.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1218c;product=tetronasin ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_215734.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1362723 1363361 . - . ID=gene-Rv1219c;Dbxref=GeneID:888582;Name=Rv1219c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1219c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1362723 1363361 . - 0 ID=cds-NP_215735.1;Parent=gene-Rv1219c;Dbxref=Genbank:NP_215735.1,GeneID:888582;Name=NP_215735.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1219c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215735.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1363503 1364150 . - . ID=gene-Rv1220c;Dbxref=GeneID:888419;Name=Rv1220c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1220c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1363503 1364150 . - 0 ID=cds-NP_215736.1;Parent=gene-Rv1220c;Dbxref=Genbank:NP_215736.1,GeneID:888419;Name=NP_215736.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1220c;product=methyltransferase;protein_id=NP_215736.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1364413 1365186 . + . ID=gene-Rv1221;Dbxref=GeneID:888751;Name=sigE;gbkey=Gene;gene=sigE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1221
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1364413 1365186 . + 0 ID=cds-NP_215737.1;Parent=gene-Rv1221;Dbxref=Genbank:NP_215737.1,GeneID:888751;Name=NP_215737.1;Note=alternative sigma factor of extracytoplasmic function (ECF) family;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:11373121];gbkey=CDS;gene=sigE;locus_tag=Rv1221;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigE;protein_id=NP_215737.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 1365274 1365365 . + . ID=id-NC_000962.3:1365274..1365365;Note=mpr6%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C ~~118 nt band detected by Northern blot in M. bovis BCG Pasteur.;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 1365344 1365808 . + . ID=gene-Rv1222;Dbxref=GeneID:885196;Name=rseA;gbkey=Gene;gene=rseA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1222
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1365344 1365808 . + 0 ID=cds-NP_215738.1;Parent=gene-Rv1222;Dbxref=Genbank:NP_215738.1,GeneID:885196;Name=NP_215738.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20025669];gbkey=CDS;gene=rseA;locus_tag=Rv1222;product=anti-sigma E factor RseA;protein_id=NP_215738.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1365875 1367461 . + . ID=gene-Rv1223;Dbxref=GeneID:888912;Name=htrA;gbkey=Gene;gene=htrA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=degP;locus_tag=Rv1223
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1365875 1367461 . + 0 ID=cds-NP_215739.2;Parent=gene-Rv1223;Dbxref=Genbank:NP_215739.2,GeneID:888912;Name=NP_215739.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=htrA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1223;product=serine protease HtrA;protein_id=NP_215739.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1367463 1367858 . + . ID=gene-Rv1224;Dbxref=GeneID:887143;Name=tatB;gbkey=Gene;gene=tatB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1224
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1367463 1367858 . + 0 ID=cds-NP_215740.1;Parent=gene-Rv1224;Dbxref=Genbank:NP_215740.1,GeneID:887143;Name=NP_215740.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;gene=tatB;locus_tag=Rv1224;product=Sec-independent protein translocase protein TatB;protein_id=NP_215740.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1367891 1368721 . - . ID=gene-Rv1225c;Dbxref=GeneID:887148;Name=Rv1225c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1225c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1367891 1368721 . - 0 ID=cds-NP_215741.1;Parent=gene-Rv1225c;Dbxref=Genbank:NP_215741.1,GeneID:887148;Name=NP_215741.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1225c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215741.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1368832 1370295 . - . ID=gene-Rv1226c;Dbxref=GeneID:887144;Name=Rv1226c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1226c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1368832 1370295 . - 0 ID=cds-NP_215742.1;Parent=gene-Rv1226c;Dbxref=Genbank:NP_215742.1,GeneID:887144;Name=NP_215742.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1226c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215742.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1370292 1370825 . - . ID=gene-Rv1227c;Dbxref=GeneID:885872;Name=Rv1227c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1227c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1370292 1370825 . - 0 ID=cds-NP_215743.1;Parent=gene-Rv1227c;Dbxref=Genbank:NP_215743.1,GeneID:885872;Name=NP_215743.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1227c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_215743.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1370920 1371477 . + . ID=gene-Rv1228;Dbxref=GeneID:886013;Name=lpqX;gbkey=Gene;gene=lpqX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1228
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1370920 1371477 . + 0 ID=cds-NP_215744.1;Parent=gene-Rv1228;Dbxref=Genbank:NP_215744.1,GeneID:886013;Name=NP_215744.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lpqX;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1228;product=lipoprotein LpqX;protein_id=NP_215744.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1371529 1371702 . + . ID=gene-Rv1228a;Dbxref=GeneID:19394673;Name=Rv1228a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1228a
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1380684 1381865 . + . ID=gene-Rv1238;Dbxref=GeneID:887104;Name=sugC;gbkey=Gene;gene=sugC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1238
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1381942 1383042 . - . ID=gene-Rv1239c;Dbxref=GeneID:887106;Name=corA;gbkey=Gene;gene=corA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1239c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1381942 1383042 . - 0 ID=cds-NP_215755.1;Parent=gene-Rv1239c;Dbxref=Genbank:NP_215755.1,GeneID:887106;Name=NP_215755.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=corA;locus_tag=Rv1239c;product=magnesium and cobalt transport transmembrane protein CorA;protein_id=NP_215755.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1383213 1384202 . + . ID=gene-Rv1240;Dbxref=GeneID:887119;Name=mdh;gbkey=Gene;gene=mdh;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1240
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1384278 1384538 . + . ID=gene-Rv1241;Dbxref=GeneID:887118;Name=vapB33;gbkey=Gene;gene=vapB33;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1241
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1384535 1384966 . + . ID=gene-Rv1242;Dbxref=GeneID:887095;Name=vapC33;gbkey=Gene;gene=vapC33;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1242
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1384535 1384966 . + 0 ID=cds-NP_215758.1;Parent=gene-Rv1242;Dbxref=Genbank:NP_215758.1,GeneID:887095;Name=NP_215758.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1241%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC33;locus_tag=Rv1242;product=ribonuclease VapC33;protein_id=NP_215758.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1384989 1386677 . - . ID=gene-Rv1243c;Dbxref=GeneID:887109;Name=PE_PGRS23;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1243c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1384989 1386677 . - 0 ID=cds-YP_177798.1;Parent=gene-Rv1243c;Dbxref=Genbank:YP_177798.1,GeneID:887109;Name=YP_177798.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS23;locus_tag=Rv1243c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS23;protein_id=YP_177798.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1386857 1387717 . + . ID=gene-Rv1244;Dbxref=GeneID:887093;Name=lpqZ;gbkey=Gene;gene=lpqZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1244
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1386857 1387717 . + 0 ID=cds-NP_215760.1;Parent=gene-Rv1244;Dbxref=Genbank:NP_215760.1,GeneID:887093;Name=NP_215760.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqZ;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1244;product=lipoprotein LpqZ;protein_id=NP_215760.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1387798 1388628 . - . ID=gene-Rv1245c;Dbxref=GeneID:887091;Name=Rv1245c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1245c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1387798 1388628 . - 0 ID=cds-NP_215761.1;Parent=gene-Rv1245c;Dbxref=Genbank:NP_215761.1,GeneID:887091;Name=NP_215761.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1245c;product=short-chain type dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_215761.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1388685 1388978 . - . ID=gene-Rv1246c;Dbxref=GeneID:887099;Name=relE;gbkey=Gene;gene=relE;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=relE1;locus_tag=Rv1246c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1388685 1388978 . - 0 ID=cds-NP_215762.1;Parent=gene-Rv1246c;Dbxref=Genbank:NP_215762.1,GeneID:887099;Name=NP_215762.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1247c;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:19114484];gbkey=CDS;gene=relE;locus_tag=Rv1246c;product=toxin RelE;protein_id=NP_215762.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1388975 1389244 . - . ID=gene-Rv1247c;Dbxref=GeneID:887086;Name=relB;gbkey=Gene;gene=relB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=relB1;locus_tag=Rv1247c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1388975 1389244 . - 0 ID=cds-NP_215763.1;Parent=gene-Rv1247c;Dbxref=Genbank:NP_215763.1,GeneID:887086;Name=NP_215763.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1246c;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=relB;locus_tag=Rv1247c;product=antitoxin RelB;protein_id=NP_215763.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1389357 1393052 . - . ID=gene-Rv1248c;Dbxref=GeneID:887084;Name=Rv1248c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1248c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1389357 1393052 . - 0 ID=cds-NP_215764.2;Parent=gene-Rv1248c;Dbxref=Genbank:NP_215764.2,GeneID:887084;Name=NP_215764.2;Note=Multifunctional alpha-ketoglutarate metabolic enzyme. Cofactor: thiamine diphosphate.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1248c;product=multifunctional 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component /2-oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase;protein_id=NP_215764.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1393194 1393982 . - . ID=gene-Rv1249c;Dbxref=GeneID:887077;Name=Rv1249c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1249c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1393194 1393982 . - 0 ID=cds-NP_215765.1;Parent=gene-Rv1249c;Dbxref=Genbank:NP_215765.1,GeneID:887077;Name=NP_215765.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1249c;product=membrane protein;protein_id=NP_215765.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1394179 1395918 . + . ID=gene-Rv1250;Dbxref=GeneID:887073;Name=Rv1250;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1250
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1394179 1395918 . + 0 ID=cds-NP_215766.1;Parent=gene-Rv1250;Dbxref=Genbank:NP_215766.1,GeneID:887073;Name=NP_215766.1;Note=integral membrane protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1250;product=MFS-type drug transporter;protein_id=NP_215766.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1395821 1399240 . - . ID=gene-Rv1251c;Dbxref=GeneID:887080;Name=Rv1251c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1251c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1395821 1399240 . - 0 ID=cds-NP_215767.1;Parent=gene-Rv1251c;Dbxref=Genbank:NP_215767.1,GeneID:887080;Name=NP_215767.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1251c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215767.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1399296 1399904 . - . ID=gene-Rv1252c;Dbxref=GeneID:887064;Name=lprE;gbkey=Gene;gene=lprE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1252c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1399296 1399904 . - 0 ID=cds-NP_215768.1;Parent=gene-Rv1252c;Dbxref=Genbank:NP_215768.1,GeneID:887064;Name=NP_215768.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprE;locus_tag=Rv1252c;product=lipoprotein LprE;protein_id=NP_215768.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1399970 1401661 . + . ID=gene-Rv1253;Dbxref=GeneID:887069;Name=deaD;gbkey=Gene;gene=deaD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1253
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1399970 1401661 . + 0 ID=cds-NP_215769.1;Parent=gene-Rv1253;Dbxref=Genbank:NP_215769.1,GeneID:887069;Name=NP_215769.1;Note=cold-shock DeaD-box protein%3B DeaD (ATP-dependent RNA helicase dead homolog);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=deaD;inference=protein motif:PROSITE:PS00039;locus_tag=Rv1253;product=ATP-dependent RNA helicase DeaD;protein_id=NP_215769.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1401658 1402809 . + . ID=gene-Rv1254;Dbxref=GeneID:887076;Name=Rv1254;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1254
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1401658 1402809 . + 0 ID=cds-NP_215770.1;Parent=gene-Rv1254;Dbxref=Genbank:NP_215770.1,GeneID:887076;Name=NP_215770.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00881;locus_tag=Rv1254;product=acyltransferase;protein_id=NP_215770.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1402778 1403386 . - . ID=gene-Rv1255c;Dbxref=GeneID:887068;Name=Rv1255c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1255c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1402778 1403386 . - 0 ID=cds-NP_215771.1;Parent=gene-Rv1255c;Dbxref=Genbank:NP_215771.1,GeneID:887068;Name=NP_215771.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1255c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_215771.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1403386 1404603 . - . ID=gene-Rv1256c;Dbxref=GeneID:887059;Name=cyp130;gbkey=Gene;gene=cyp130;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1256c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1403386 1404603 . - 0 ID=cds-NP_215772.1;Parent=gene-Rv1256c;Dbxref=Genbank:NP_215772.1,GeneID:887059;Name=NP_215772.1;experiment=EXISTENCE:Protein crystalography[PMID:18089574];gbkey=CDS;gene=cyp130;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv1256c;product=cytochrome P450 Cyp130;protein_id=NP_215772.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1404717 1406084 . - . ID=gene-Rv1257c;Dbxref=GeneID:887063;Name=Rv1257c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1257c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1404717 1406084 . - 0 ID=cds-NP_215773.1;Parent=gene-Rv1257c;Dbxref=Genbank:NP_215773.1,GeneID:887063;Name=NP_215773.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1257c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215773.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1406081 1407340 . - . ID=gene-Rv1258c;Dbxref=GeneID:887056;Name=Rv1258c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1258c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1406081 1407340 . - 0 ID=cds-NP_215774.1;Parent=gene-Rv1258c;Dbxref=Genbank:NP_215774.1,GeneID:887056;Name=NP_215774.1;Note=integral membrane transport protein;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00216;locus_tag=Rv1258c;product=multidrug-efflux transporter;protein_id=NP_215774.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1407339 1408238 . + . ID=gene-Rv1259;Dbxref=GeneID:887047;Name=udgB;gbkey=Gene;gene=udgB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1259
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1407339 1408238 . + 0 ID=cds-NP_215775.1;Parent=gene-Rv1259;Dbxref=Genbank:NP_215775.1,GeneID:887047;Name=NP_215775.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=udgB;locus_tag=Rv1259;product=uracil DNA glycosylase;protein_id=NP_215775.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1408240 1409358 . + . ID=gene-Rv1260;Dbxref=GeneID:887044;Name=Rv1260;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1260
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1408240 1409358 . + 0 ID=cds-NP_215776.1;Parent=gene-Rv1260;Dbxref=Genbank:NP_215776.1,GeneID:887044;Name=NP_215776.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1260;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215776.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1409484 1409933 . - . ID=gene-Rv1261c;Dbxref=GeneID:887055;Name=Rv1261c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1261c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1409484 1409933 . - 0 ID=cds-NP_215777.1;Parent=gene-Rv1261c;Dbxref=Genbank:NP_215777.1,GeneID:887055;Name=NP_215777.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1261c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215777.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1409938 1410372 . - . ID=gene-Rv1262c;Dbxref=GeneID:887036;Name=Rv1262c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1262c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1409938 1410372 . - 0 ID=cds-NP_215778.1;Parent=gene-Rv1262c;Dbxref=Genbank:NP_215778.1,GeneID:887036;Name=NP_215778.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00892;locus_tag=Rv1262c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215778.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1410431 1411819 . + . ID=gene-Rv1263;Dbxref=GeneID:887041;Name=amiB2;gbkey=Gene;gene=amiB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1263
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1410431 1411819 . + 0 ID=cds-NP_215779.1;Parent=gene-Rv1263;Dbxref=Genbank:NP_215779.1,GeneID:887041;Name=NP_215779.1;Note=aminohydrolase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=amiB2;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1263;product=amidase AmiB;protein_id=NP_215779.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1411894 1413087 . + . ID=gene-Rv1264;Dbxref=GeneID:887035;Name=Rv1264;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1264
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1411894 1413087 . + 0 ID=cds-NP_215780.1;Parent=gene-Rv1264;Dbxref=Genbank:NP_215780.1,GeneID:887035;Name=NP_215780.1;Note=ATP pyrophosphate-lyase (adenylate cyclase)The N terminus seems to be a potential novel regulator of adenylyl cyclase activity (autoinhibitory domain). Belongs to the adenylyl cyclase class-4/guanylyl cyclase family.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:17005450];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1264;product=adenylyl cyclase;protein_id=NP_215780.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1413094 1413224 . - . ID=gene-RVnc0013;Dbxref=GeneID:14515855;Name=mcr11;gbkey=Gene;gene=mcr11;gene_biotype=ncRNA;gene_synonym=MTS0997;locus_tag=RVnc0013
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1413094 1413224 . - . ID=rna-RVnc0013;Parent=gene-RVnc0013;Dbxref=GeneID:14515855;Note=mcr11%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by RLM-RACE in M. tuberculosis H37Rv%2C 3'-end not mapped (See Arnvig et al.%2C 2011).;gbkey=ncRNA;gene=mcr11;locus_tag=RVnc0013;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1413094 1413224 . - . ID=exon-RVnc0013-1;Parent=rna-RVnc0013;Dbxref=GeneID:14515855;Note=mcr11%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by RLM-RACE in M. tuberculosis H37Rv%2C 3'-end not mapped (See Arnvig et al.%2C 2011).;gbkey=ncRNA;gene=mcr11;locus_tag=RVnc0013;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1413260 1413940 . + . ID=gene-Rv1265;Dbxref=GeneID:887058;Name=Rv1265;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1265
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1413260 1413940 . + 0 ID=cds-NP_215781.1;Parent=gene-Rv1265;Dbxref=Genbank:NP_215781.1,GeneID:887058;Name=NP_215781.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1265;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215781.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1413960 1415840 . - . ID=gene-Rv1266c;Dbxref=GeneID:887023;Name=pknH;gbkey=Gene;gene=pknH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1266c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1413960 1415840 . - 0 ID=cds-NP_215782.1;Parent=gene-Rv1266c;Dbxref=Genbank:NP_215782.1,GeneID:887023;Name=NP_215782.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:14690440];gbkey=CDS;gene=pknH;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv1266c;product=serine/threonine-protein kinase PknH;protein_id=NP_215782.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1416181 1417347 . - . ID=gene-Rv1267c;Dbxref=GeneID:887026;Name=embR;gbkey=Gene;gene=embR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1267c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1416181 1417347 . - 0 ID=cds-NP_215783.1;Parent=gene-Rv1267c;Dbxref=Genbank:NP_215783.1,GeneID:887026;Name=NP_215783.1;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:16585755];gbkey=CDS;gene=embR;locus_tag=Rv1267c;product=transcriptional regulator EmbR;protein_id=NP_215783.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1417658 1418356 . - . ID=gene-Rv1268c;Dbxref=GeneID:887033;Name=Rv1268c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1268c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1417658 1418356 . - 0 ID=cds-NP_215784.1;Parent=gene-Rv1268c;Dbxref=Genbank:NP_215784.1,GeneID:887033;Name=NP_215784.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1268c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215784.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1418579 1418953 . - . ID=gene-Rv1269c;Dbxref=GeneID:887039;Name=Rv1269c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1269c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1418579 1418953 . - 0 ID=cds-NP_215785.1;Parent=gene-Rv1269c;Dbxref=Genbank:NP_215785.1,GeneID:887039;Name=NP_215785.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1269c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215785.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1419014 1419748 . - . ID=gene-Rv1270c;Dbxref=GeneID:887017;Name=lprA;gbkey=Gene;gene=lprA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1270c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1419014 1419748 . - 0 ID=cds-NP_215786.1;Parent=gene-Rv1270c;Dbxref=Genbank:NP_215786.1,GeneID:887017;Name=NP_215786.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprA;locus_tag=Rv1270c;product=lipoprotein LprA;protein_id=NP_215786.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1419961 1420302 . - . ID=gene-Rv1271c;Dbxref=GeneID:887019;Name=Rv1271c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1271c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1419961 1420302 . - 0 ID=cds-NP_215787.1;Parent=gene-Rv1271c;Dbxref=Genbank:NP_215787.1,GeneID:887019;Name=NP_215787.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1271c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215787.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1420410 1422305 . - . ID=gene-Rv1272c;Dbxref=GeneID:887021;Name=Rv1272c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1272c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1420410 1422305 . - 0 ID=cds-NP_215788.1;Parent=gene-Rv1272c;Dbxref=Genbank:NP_215788.1,GeneID:887021;Name=NP_215788.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1272c;product=drug ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_215788.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1422302 1424050 . - . ID=gene-Rv1273c;Dbxref=GeneID:887025;Name=Rv1273c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1273c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1422302 1424050 . - 0 ID=cds-NP_215789.1;Parent=gene-Rv1273c;Dbxref=Genbank:NP_215789.1,GeneID:887025;Name=NP_215789.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1273c;product=drug ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_215789.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1424197 1424754 . + . ID=gene-Rv1274;Dbxref=GeneID:887011;Name=lprB;gbkey=Gene;gene=lprB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1274
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1424197 1424754 . + 0 ID=cds-NP_215790.1;Parent=gene-Rv1274;Dbxref=Genbank:NP_215790.1,GeneID:887011;Name=NP_215790.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprB;locus_tag=Rv1274;product=lipoprotein LprB;protein_id=NP_215790.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1424751 1425293 . + . ID=gene-Rv1275;Dbxref=GeneID:887014;Name=lprC;gbkey=Gene;gene=lprC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1275
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1424751 1425293 . + 0 ID=cds-NP_215791.1;Parent=gene-Rv1275;Dbxref=Genbank:NP_215791.1,GeneID:887014;Name=NP_215791.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprC;locus_tag=Rv1275;product=lipoprotein LprC;protein_id=NP_215791.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1425438 1425914 . - . ID=gene-Rv1276c;Dbxref=GeneID:887000;Name=Rv1276c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1276c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1425438 1425914 . - 0 ID=cds-NP_215792.1;Parent=gene-Rv1276c;Dbxref=Genbank:NP_215792.1,GeneID:887000;Name=NP_215792.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1276c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215792.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1426164 1427417 . + . ID=gene-Rv1277;Dbxref=GeneID:887001;Name=Rv1277;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1277
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1426164 1427417 . + 0 ID=cds-NP_215793.1;Parent=gene-Rv1277;Dbxref=Genbank:NP_215793.1,GeneID:887001;Name=NP_215793.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1277;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215793.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1427414 1430041 . + . ID=gene-Rv1278;Dbxref=GeneID:887005;Name=Rv1278;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1278
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1427414 1430041 . + 0 ID=cds-NP_215794.1;Parent=gene-Rv1278;Dbxref=Genbank:NP_215794.1,GeneID:887005;Name=NP_215794.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1278;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215794.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1430062 1431648 . + . ID=gene-Rv1279;Dbxref=GeneID:887002;Name=Rv1279;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1279
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1430062 1431648 . + 0 ID=cds-NP_215795.1;Parent=gene-Rv1279;Dbxref=Genbank:NP_215795.1,GeneID:887002;Name=NP_215795.1;Note=dehydrogenase FAD flavoprotein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00624;locus_tag=Rv1279;product=GMC-type oxidoreductase;protein_id=NP_215795.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1431665 1433440 . - . ID=gene-Rv1280c;Dbxref=GeneID:886985;Name=oppA;gbkey=Gene;gene=oppA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1280c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1431665 1433440 . - 0 ID=cds-NP_215796.1;Parent=gene-Rv1280c;Dbxref=Genbank:NP_215796.1,GeneID:886985;Name=NP_215796.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=oppA;locus_tag=Rv1280c;product=oligopeptide ABC transporter substrate-binding lipoprotein OppA;protein_id=NP_215796.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1433433 1435271 . - . ID=gene-Rv1281c;Dbxref=GeneID:886997;Name=oppD;gbkey=Gene;gene=oppD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1281c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1433433 1435271 . - 0 ID=cds-NP_215797.1;Parent=gene-Rv1281c;Dbxref=Genbank:NP_215797.1,GeneID:886997;Name=NP_215797.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=oppD;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1281c;product=oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD;protein_id=NP_215797.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1435268 1436143 . - . ID=gene-Rv1282c;Dbxref=GeneID:886980;Name=oppC;gbkey=Gene;gene=oppC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1282c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1435268 1436143 . - 0 ID=cds-NP_215798.1;Parent=gene-Rv1282c;Dbxref=Genbank:NP_215798.1,GeneID:886980;Name=NP_215798.1;gbkey=CDS;gene=oppC;locus_tag=Rv1282c;product=oligopeptide ABC transporter permease OppC;protein_id=NP_215798.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1436140 1437117 . - . ID=gene-Rv1283c;Dbxref=GeneID:886981;Name=oppB;gbkey=Gene;gene=oppB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1283c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1436140 1437117 . - 0 ID=cds-NP_215799.1;Parent=gene-Rv1283c;Dbxref=Genbank:NP_215799.1,GeneID:886981;Name=NP_215799.1;gbkey=CDS;gene=oppB;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv1283c;product=oligopeptide ABC transporter permease OppB;protein_id=NP_215799.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1437324 1437815 . + . ID=gene-Rv1284;Dbxref=GeneID:886987;Name=canA;gbkey=Gene;gene=canA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1284
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1437324 1437815 . + 0 ID=cds-NP_215800.1;Parent=gene-Rv1284;Dbxref=Genbank:NP_215800.1,GeneID:886987;Name=NP_215800.1;Note=CanA%2C Beta-carbonic anhydrase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=canA;locus_tag=Rv1284;product=beta-carbonic anhydrase;protein_id=NP_215800.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1437909 1438907 . + . ID=gene-Rv1285;Dbxref=GeneID:886979;Name=cysD;gbkey=Gene;gene=cysD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1285
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1437909 1438907 . + 0 ID=cds-NP_215801.1;Parent=gene-Rv1285;Dbxref=Genbank:NP_215801.1,GeneID:886979;Name=NP_215801.1;Note=Belongs to the PAPS reductase family. CYSD subfamily.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15184554];gbkey=CDS;gene=cysD;locus_tag=Rv1285;product=sulfate adenylyltransferase subunit 2;protein_id=NP_215801.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1438907 1440751 . + . ID=gene-Rv1286;Dbxref=GeneID:886978;Name=Rv1286;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1286
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1438907 1440751 . + 0 ID=cds-NP_215802.1;Parent=gene-Rv1286;Dbxref=Genbank:NP_215802.1,GeneID:886978;Name=NP_215802.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15184554];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00301;locus_tag=Rv1286;product=adenylyl-sulfate kinase;protein_id=NP_215802.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1440805 1441290 . + . ID=gene-Rv1287;Dbxref=GeneID:886998;Name=Rv1287;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1287
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1440805 1441290 . + 0 ID=cds-NP_215803.1;Parent=gene-Rv1287;Dbxref=Genbank:NP_215803.1,GeneID:886998;Name=NP_215803.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1287;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_215803.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1441348 1442718 . + . ID=gene-Rv1288;Dbxref=GeneID:886974;Name=Rv1288;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1288
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1441348 1442718 . + 0 ID=cds-NP_215804.1;Parent=gene-Rv1288;Dbxref=Genbank:NP_215804.1,GeneID:886974;Name=NP_215804.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1288;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215804.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1442767 1443399 . + . ID=gene-Rv1289;Dbxref=GeneID:886994;Name=Rv1289;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1289
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1442767 1443399 . + 0 ID=cds-NP_215805.1;Parent=gene-Rv1289;Dbxref=Genbank:NP_215805.1,GeneID:886994;Name=NP_215805.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1289;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215805.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1443482 1445047 . - . ID=gene-Rv1290c;Dbxref=GeneID:886971;Name=Rv1290c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1290c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1443482 1445047 . - 0 ID=cds-NP_215806.1;Parent=gene-Rv1290c;Dbxref=Genbank:NP_215806.1,GeneID:886971;Name=NP_215806.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1290c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215806.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1445058 1445372 . + . ID=gene-Rv1290A;Dbxref=GeneID:3205114;Name=Rv1290A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1290A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1445058 1445372 . + 0 ID=cds-YP_177642.1;Parent=gene-Rv1290A;Dbxref=Genbank:YP_177642.1,GeneID:3205114;Name=YP_177642.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1290A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177642.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1445499 1445834 . - . ID=gene-Rv1291c;Dbxref=GeneID:886975;Name=Rv1291c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1291c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1445499 1445834 . - 0 ID=cds-NP_215807.1;Parent=gene-Rv1291c;Dbxref=Genbank:NP_215807.1,GeneID:886975;Name=NP_215807.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1291c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215807.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1446193 1446265 . - . ID=gene-Rvnt18;Dbxref=GeneID:2700468;Name=argV;gbkey=Gene;gene=argV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt18
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1446193 1446265 . - . ID=rna-Rvnt18;Parent=gene-Rvnt18;Dbxref=GeneID:2700468;Note=argV%2C tRNA-Arg%2C anticodon ccg%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(1446230..1446232));codons=31;gbkey=tRNA;gene=argV;locus_tag=Rvnt18;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq exon 1446193 1446265 . - . ID=exon-Rvnt18-1;Parent=rna-Rvnt18;Dbxref=GeneID:2700468;Note=argV%2C tRNA-Arg%2C anticodon ccg%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(1446230..1446232));codons=31;gbkey=tRNA;gene=argV;locus_tag=Rvnt18;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq gene 1446379 1448031 . + . ID=gene-Rv1292;Dbxref=GeneID:886964;Name=argS;gbkey=Gene;gene=argS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1292
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1446379 1448031 . + 0 ID=cds-NP_215808.1;Parent=gene-Rv1292;Dbxref=Genbank:NP_215808.1,GeneID:886964;Name=NP_215808.1;Note=arginyl-tRNA synthetase ArgS (ARGRS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=argS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv1292;product=arginine--tRNA ligase;protein_id=NP_215808.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1448028 1449371 . + . ID=gene-Rv1293;Dbxref=GeneID:886960;Name=lysA;gbkey=Gene;gene=lysA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1293
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1448028 1449371 . + 0 ID=cds-NP_215809.1;Parent=gene-Rv1293;Dbxref=Genbank:NP_215809.1,GeneID:886960;Name=NP_215809.1;Note=DAP decarboxylase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=lysA;inference=protein motif:PROSITE:PS00879;locus_tag=Rv1293;product=diaminopimelate decarboxylase;protein_id=NP_215809.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1449375 1450700 . + . ID=gene-Rv1294;Dbxref=GeneID:886962;Name=thrA;gbkey=Gene;gene=thrA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1294
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1449375 1450700 . + 0 ID=cds-NP_215810.1;Parent=gene-Rv1294;Dbxref=Genbank:NP_215810.1,GeneID:886962;Name=NP_215810.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=thrA;inference=protein motif:PROSITE:PS01042;locus_tag=Rv1294;product=homoserine dehydrogenase;protein_id=NP_215810.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1450697 1451779 . + . ID=gene-Rv1295;Dbxref=GeneID:886957;Name=thrC;gbkey=Gene;gene=thrC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1295
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1450697 1451779 . + 0 ID=cds-NP_215811.1;Parent=gene-Rv1295;Dbxref=Genbank:NP_215811.1,GeneID:886957;Name=NP_215811.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=thrC;inference=protein motif:PROSITE:PS00165;locus_tag=Rv1295;product=threonine synthase;protein_id=NP_215811.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1451997 1452947 . + . ID=gene-Rv1296;Dbxref=GeneID:886958;Name=thrB;gbkey=Gene;gene=thrB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1296
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1451997 1452947 . + 0 ID=cds-NP_215812.1;Parent=gene-Rv1296;Dbxref=Genbank:NP_215812.1,GeneID:886958;Name=NP_215812.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=thrB;inference=protein motif:PROSITE:PS00639;locus_tag=Rv1296;product=homoserine kinase;protein_id=NP_215812.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1453204 1455012 . + . ID=gene-Rv1297;Dbxref=GeneID:886952;Name=rho;gbkey=Gene;gene=rho;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1297
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1453204 1455012 . + 0 ID=cds-NP_215813.1;Parent=gene-Rv1297;Dbxref=Genbank:NP_215813.1,GeneID:886952;Name=NP_215813.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rho;locus_tag=Rv1297;product=transcription termination factor Rho;protein_id=NP_215813.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1455163 1455405 . + . ID=gene-Rv1298;Dbxref=GeneID:886955;Name=rpmE;gbkey=Gene;gene=rpmE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1298
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1455163 1455405 . + 0 ID=cds-NP_215814.1;Parent=gene-Rv1298;Dbxref=Genbank:NP_215814.1,GeneID:886955;Name=NP_215814.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpmE;inference=protein motif:PROSITE:PS01143;locus_tag=Rv1298;product=50S ribosomal protein L31;protein_id=NP_215814.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1455495 1456568 . + . ID=gene-Rv1299;Dbxref=GeneID:886948;Name=prfA;gbkey=Gene;gene=prfA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1299
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1455495 1456568 . + 0 ID=cds-NP_215815.1;Parent=gene-Rv1299;Dbxref=Genbank:NP_215815.1,GeneID:886948;Name=NP_215815.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=prfA;inference=protein motif:PROSITE:PS00745;locus_tag=Rv1299;product=peptide chain release factor PrfA;protein_id=NP_215815.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1456565 1457542 . + . ID=gene-Rv1300;Dbxref=GeneID:886950;Name=hemK;gbkey=Gene;gene=hemK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1300
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1456565 1457542 . + 0 ID=cds-NP_215816.1;Parent=gene-Rv1300;Dbxref=Genbank:NP_215816.1,GeneID:886950;Name=NP_215816.1;gbkey=CDS;gene=hemK;locus_tag=Rv1300;product=release factor glutamine methyltransferase;protein_id=NP_215816.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1456585 1456627 . + . ID=id-Rv1300;Dbxref=GeneID:886950;Note=43 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region;gene=hemK;locus_tag=Rv1300
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1457453 1457504 . + . ID=id-Rv1300-2;Dbxref=GeneID:886950;Note=52 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region;gene=hemK;locus_tag=Rv1300
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1457505 1457557 . + . ID=id-NC_000962.3:1457505..1457557;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1457558 1458211 . + . ID=gene-Rv1301;Dbxref=GeneID:886970;Name=Rv1301;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1301
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1457558 1458211 . + 0 ID=cds-NP_215817.1;Parent=gene-Rv1301;Dbxref=Genbank:NP_215817.1,GeneID:886970;Name=NP_215817.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01147;locus_tag=Rv1301;product=threonylcarbamoyl-AMP synthase;protein_id=NP_215817.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1458295 1459509 . + . ID=gene-Rv1302;Dbxref=GeneID:886947;Name=rfe;gbkey=Gene;gene=rfe;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=wecA;locus_tag=Rv1302
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1458295 1459509 . + 0 ID=cds-NP_215818.1;Parent=gene-Rv1302;Dbxref=Genbank:NP_215818.1,GeneID:886947;Name=NP_215818.1;Note=UDP-GlcNAc transferase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:20637039];gbkey=CDS;gene=rfe;locus_tag=Rv1302;product=decaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase;protein_id=NP_215818.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1459766 1460251 . + . ID=gene-Rv1303;Dbxref=GeneID:886944;Name=Rv1303;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1303
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1459766 1460251 . + 0 ID=cds-NP_215819.1;Parent=gene-Rv1303;Dbxref=Genbank:NP_215819.1,GeneID:886944;Name=NP_215819.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1303;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215819.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1460244 1460996 . + . ID=gene-Rv1304;Dbxref=GeneID:886941;Name=atpB;gbkey=Gene;gene=atpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1304
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1460244 1460996 . + 0 ID=cds-NP_215820.1;Parent=gene-Rv1304;Dbxref=Genbank:NP_215820.1,GeneID:886941;Name=NP_215820.1;Note=AtpB%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=atpB;inference=protein motif:PROSITE:PS00449;locus_tag=Rv1304;product=ATP synthase subunit A;protein_id=NP_215820.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1461045 1461290 . + . ID=gene-Rv1305;Dbxref=GeneID:886937;Name=atpE;gbkey=Gene;gene=atpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1305
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1461045 1461290 . + 0 ID=cds-NP_215821.1;Parent=gene-Rv1305;Dbxref=Genbank:NP_215821.1,GeneID:886937;Name=NP_215821.1;Note=AtpE (lipid-binding protein) (dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;gbkey=CDS;gene=atpE;inference=protein motif:PROSITE:PS00605;locus_tag=Rv1305;product=ATP synthase subunit C;protein_id=NP_215821.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1461321 1461836 . + . ID=gene-Rv1306;Dbxref=GeneID:886939;Name=atpF;gbkey=Gene;gene=atpF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1306
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1461321 1461836 . + 0 ID=cds-NP_215822.1;Parent=gene-Rv1306;Dbxref=Genbank:NP_215822.1,GeneID:886939;Name=NP_215822.1;Note=AtpF%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=atpF;locus_tag=Rv1306;product=ATP synthase subunit B;protein_id=NP_215822.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1461843 1463183 . + . ID=gene-Rv1307;Dbxref=GeneID:886934;Name=atpH;gbkey=Gene;gene=atpH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1307
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1461843 1463183 . + 0 ID=cds-NP_215823.1;Parent=gene-Rv1307;Dbxref=Genbank:NP_215823.1,GeneID:886934;Name=NP_215823.1;Note=AtpH%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=atpH;locus_tag=Rv1307;product=ATP synthase subunit b/delta;protein_id=NP_215823.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1463228 1464877 . + . ID=gene-Rv1308;Dbxref=GeneID:886936;Name=atpA;gbkey=Gene;gene=atpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1308
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1463228 1464877 . + 0 ID=cds-NP_215824.1;Parent=gene-Rv1308;Dbxref=Genbank:NP_215824.1,GeneID:886936;Name=NP_215824.1;Note=AtpA%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=atpA;inference=protein motif:PROSITE:PS00152;locus_tag=Rv1308;product=ATP synthase subunit alpha;protein_id=NP_215824.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1464884 1465801 . + . ID=gene-Rv1309;Dbxref=GeneID:886929;Name=atpG;gbkey=Gene;gene=atpG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1309
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1464884 1465801 . + 0 ID=cds-NP_215825.1;Parent=gene-Rv1309;Dbxref=Genbank:NP_215825.1,GeneID:886929;Name=NP_215825.1;Note=AtpG%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=atpG;inference=protein motif:PROSITE:PS00153;locus_tag=Rv1309;product=ATP synthase subunit gamma;protein_id=NP_215825.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1465841 1467301 . + . ID=gene-Rv1310;Dbxref=GeneID:886932;Name=atpD;gbkey=Gene;gene=atpD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1310
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1465841 1467301 . + 0 ID=cds-NP_215826.1;Parent=gene-Rv1310;Dbxref=Genbank:NP_215826.1,GeneID:886932;Name=NP_215826.1;Note=AtpD%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=atpD;inference=protein motif:PROSITE:PS00152;locus_tag=Rv1310;product=ATP synthase subunit beta;protein_id=NP_215826.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1467315 1467680 . + . ID=gene-Rv1311;Dbxref=GeneID:886967;Name=atpC;gbkey=Gene;gene=atpC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1311
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1467315 1467680 . + 0 ID=cds-NP_215827.1;Parent=gene-Rv1311;Dbxref=Genbank:NP_215827.1,GeneID:886967;Name=NP_215827.1;Note=AtpC%2C F-type ATPases have 2 components%2C cf(1) - the catalytic core - and cf(0) - the membrane proton channel. cf(1) has five subunits: alpha(3)%2Cbeta(3)%2C gamma(1)%2C delta(1)%2C epsilon(1). cf(0) has three main subunits: A%2C B and C.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=atpC;locus_tag=Rv1311;product=ATP synthase subunit epsilon;protein_id=NP_215827.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1467688 1468131 . + . ID=gene-Rv1312;Dbxref=GeneID:886930;Name=Rv1312;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1312
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1467688 1468131 . + 0 ID=cds-NP_215828.1;Parent=gene-Rv1312;Dbxref=Genbank:NP_215828.1,GeneID:886930;Name=NP_215828.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1312;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215828.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1468143 1469651 . - . ID=id-NC_000962.3:1468143..1469651;Note=IS1557-2%2C len: 1509 nt. Insertion sequence IS1557.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1557-2
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1468143 1468161 . + . ID=id-NC_000962.3:1468143..1468161;Note=19 bp inverted repeat%2C GCAGACGCAAAAGCCCCCA%2C at the left end of IS1557;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1468171 1469505 . - . ID=gene-Rv1313c;Dbxref=GeneID:886922;Name=Rv1313c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1313c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1468171 1469505 . - 0 ID=cds-NP_215829.1;Parent=gene-Rv1313c;Dbxref=Genbank:NP_215829.1,GeneID:886922;Name=NP_215829.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1313c;product=insertion sequence element IS1557 transposase;protein_id=NP_215829.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1469633 1469651 . - . ID=id-NC_000962.3:1469633..1469651;Note=19 bp inverted repeat%2C GCAGACGCGAAAGCCCCCA%2C at the right end of IS1557. Single base difference at 3-end.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1469671 1470252 . - . ID=gene-Rv1314c;Dbxref=GeneID:886925;Name=Rv1314c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1314c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1469671 1470252 . - 0 ID=cds-NP_215830.1;Parent=gene-Rv1314c;Dbxref=Genbank:NP_215830.1,GeneID:886925;Name=NP_215830.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1314c;product=cob(I)yrinic acid a%2Cc-diamide adenosyltransferase;protein_id=NP_215830.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1470321 1471577 . + . ID=gene-Rv1315;Dbxref=GeneID:886921;Name=murA;gbkey=Gene;gene=murA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1315
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1470321 1471577 . + 0 ID=cds-NP_215831.1;Parent=gene-Rv1315;Dbxref=Genbank:NP_215831.1,GeneID:886921;Name=NP_215831.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=murA;locus_tag=Rv1315;product=UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase;protein_id=NP_215831.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1471619 1471742 . + . ID=gene-RVnc0021;Dbxref=GeneID:14515894;Name=mcr3;gbkey=Gene;gene=mcr3;gene_biotype=ncRNA;gene_synonym=mpr7;locus_tag=RVnc0021
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1471619 1471742 . + . ID=rna-RVnc0021;Parent=gene-RVnc0021;Dbxref=GeneID:14515894;Note=mcr3%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped.;gbkey=ncRNA;gene=mcr3;locus_tag=RVnc0021;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1471619 1471742 . + . ID=exon-RVnc0021-1;Parent=rna-RVnc0021;Dbxref=GeneID:14515894;Note=mcr3%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped.;gbkey=ncRNA;gene=mcr3;locus_tag=RVnc0021;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1471846 1473382 . + . ID=gene-Rvnr01;Dbxref=GeneID:2700429;Name=rrs;gbkey=Gene;gene=rrs;gene_biotype=rRNA;locus_tag=Rvnr01
+NC_000962.3 RefSeq rRNA 1471846 1473382 . + . ID=rna-Rvnr01;Parent=gene-Rvnr01;Dbxref=GeneID:2700429;Note=rrs%2C 16s rRNA gene (alternate gene name: rrnS).;gbkey=rRNA;gene=rrs;locus_tag=Rvnr01;product=16S ribosomal RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1471846 1473382 . + . ID=exon-Rvnr01-1;Parent=rna-Rvnr01;Dbxref=GeneID:2700429;Note=rrs%2C 16s rRNA gene (alternate gene name: rrnS).;gbkey=rRNA;gene=rrs;locus_tag=Rvnr01;product=16S ribosomal RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1473658 1476795 . + . ID=gene-Rvnr02;Dbxref=GeneID:2700466;Name=rrl;gbkey=Gene;gene=rrl;gene_biotype=rRNA;locus_tag=Rvnr02
+NC_000962.3 RefSeq rRNA 1473658 1476795 . + . ID=rna-Rvnr02;Parent=gene-Rvnr02;Dbxref=GeneID:2700466;Note=rrl%2C 23S rRNA gene (approximate coordinates).;gbkey=rRNA;gene=rrl;locus_tag=Rvnr02;product=23S ribosomal RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1473658 1476795 . + . ID=exon-Rvnr02-1;Parent=rna-Rvnr02;Dbxref=GeneID:2700466;Note=rrl%2C 23S rRNA gene (approximate coordinates).;gbkey=rRNA;gene=rrl;locus_tag=Rvnr02;product=23S ribosomal RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1476899 1477013 . + . ID=gene-Rvnr03;Dbxref=GeneID:2700459;Name=rrf;gbkey=Gene;gene=rrf;gene_biotype=rRNA;locus_tag=Rvnr03
+NC_000962.3 RefSeq rRNA 1476899 1477013 . + . ID=rna-Rvnr03;Parent=gene-Rvnr03;Dbxref=GeneID:2700459;Note=rrf%2C 5S rRNA gene. Identical to Em_ba:MT5SRR%2C D10035 M.tuberculosis 5S rRNA%2C len: 116.;gbkey=rRNA;gene=rrf;locus_tag=Rvnr03;product=5S ribosomal RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1476899 1477013 . + . ID=exon-Rvnr03-1;Parent=rna-Rvnr03;Dbxref=GeneID:2700459;Note=rrf%2C 5S rRNA gene. Identical to Em_ba:MT5SRR%2C D10035 M.tuberculosis 5S rRNA%2C len: 116.;gbkey=rRNA;gene=rrf;locus_tag=Rvnr03;product=5S ribosomal RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1477134 1477631 . - . ID=gene-Rv1316c;Dbxref=GeneID:886913;Name=ogt;gbkey=Gene;gene=ogt;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=adaB;locus_tag=Rv1316c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1477134 1477631 . - 0 ID=cds-NP_215832.1;Parent=gene-Rv1316c;Dbxref=Genbank:NP_215832.1,GeneID:886913;Name=NP_215832.1;Note=Ogt (6-O-methylguanine-DNA methyltransferase) (O-6-methylguanine-DNA-alkyltransferase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:21570366];gbkey=CDS;gene=ogt;inference=protein motif:PROSITE:PS00374;locus_tag=Rv1316c;product=methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase;protein_id=NP_215832.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1477628 1479118 . - . ID=gene-Rv1317c;Dbxref=GeneID:886916;Name=alkA;gbkey=Gene;gene=alkA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ada;locus_tag=Rv1317c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1477628 1479118 . - 0 ID=cds-NP_215833.1;Parent=gene-Rv1317c;Dbxref=Genbank:NP_215833.1,GeneID:886916;Name=NP_215833.1;Note=regulatory protein of adaptative response (methylphosphotriester-DNA--protein-cysteine S-methyltransferase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:21570366];gbkey=CDS;gene=alkA;inference=protein motif:PROSITE:PS00041;locus_tag=Rv1317c;product=bifunctional regulatory protein/DNA repair enzyme AlkA;protein_id=NP_215833.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1479199 1480824 . - . ID=gene-Rv1318c;Dbxref=GeneID:886910;Name=Rv1318c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1318c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1479199 1480824 . - 0 ID=cds-NP_215834.1;Parent=gene-Rv1318c;Dbxref=Genbank:NP_215834.1,GeneID:886910;Name=NP_215834.1;Note=ATP pyrophosphate-lyase (adenylyl cyclase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1318c;product=adenylate cyclase;protein_id=NP_215834.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1480894 1482501 . - . ID=gene-Rv1319c;Dbxref=GeneID:886911;Name=Rv1319c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1319c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1480894 1482501 . - 0 ID=cds-NP_215835.1;Parent=gene-Rv1319c;Dbxref=Genbank:NP_215835.1,GeneID:886911;Name=NP_215835.1;Note=ATP pyrophosphate-lyase (adenylyl cyclase);gbkey=CDS;locus_tag=Rv1319c;product=adenylate cyclase;protein_id=NP_215835.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1482514 1484217 . - . ID=gene-Rv1320c;Dbxref=GeneID:886906;Name=Rv1320c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1320c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1482514 1484217 . - 0 ID=cds-NP_215836.1;Parent=gene-Rv1320c;Dbxref=Genbank:NP_215836.1,GeneID:886906;Name=NP_215836.1;Note=ATP pyrophosphate-lyase (adenylyl cyclase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1320c;product=adenylate cyclase;protein_id=NP_215836.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1484279 1484959 . + . ID=gene-Rv1321;Dbxref=GeneID:886908;Name=Rv1321;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1321
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1484279 1484959 . + 0 ID=cds-NP_215837.1;Parent=gene-Rv1321;Dbxref=Genbank:NP_215837.1,GeneID:886908;Name=NP_215837.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1321;product=endonuclease NucS;protein_id=NP_215837.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1484982 1485278 . + . ID=gene-Rv1322;Dbxref=GeneID:886927;Name=Rv1322;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1322
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1484982 1485278 . + 0 ID=cds-NP_215838.1;Parent=gene-Rv1322;Dbxref=Genbank:NP_215838.1,GeneID:886927;Name=NP_215838.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1322;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215838.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1485313 1485771 . - . ID=gene-Rv1322A;Dbxref=GeneID:3205097;Name=Rv1322A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1322A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1485313 1485771 . - 0 ID=cds-YP_177643.1;Parent=gene-Rv1322A;Dbxref=Genbank:YP_177643.1,GeneID:3205097;Name=YP_177643.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1322A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177643.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1485862 1487031 . + . ID=gene-Rv1323;Dbxref=GeneID:886904;Name=fadA4;gbkey=Gene;gene=fadA4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1323
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1485862 1487031 . + 0 ID=cds-NP_215839.1;Parent=gene-Rv1323;Dbxref=Genbank:NP_215839.1,GeneID:886904;Name=NP_215839.1;Note=acetoacetyl-CoA thiolase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadA4;inference=protein motif:PROSITE:PS00737;locus_tag=Rv1323;product=acetyl-CoA acetyltransferase;protein_id=NP_215839.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1487161 1488075 . + . ID=gene-Rv1324;Dbxref=GeneID:886897;Name=Rv1324;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1324
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1487161 1488075 . + 0 ID=cds-NP_215840.1;Parent=gene-Rv1324;Dbxref=Genbank:NP_215840.1,GeneID:886897;Name=NP_215840.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00339;locus_tag=Rv1324;product=thioredoxin;protein_id=NP_215840.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1488154 1489965 . - . ID=gene-Rv1325c;Dbxref=GeneID:886899;Name=PE_PGRS24;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1325c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1488154 1489965 . - 0 ID=cds-YP_177799.1;Parent=gene-Rv1325c;Dbxref=Genbank:YP_177799.1,GeneID:886899;Name=YP_177799.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS24;locus_tag=Rv1325c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS24;protein_id=YP_177799.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1490117 1492312 . - . ID=gene-Rv1326c;Dbxref=GeneID:886893;Name=glgB;gbkey=Gene;gene=glgB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1326c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1490117 1492312 . - 0 ID=cds-NP_215842.1;Parent=gene-Rv1326c;Dbxref=Genbank:NP_215842.1,GeneID:886893;Name=NP_215842.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:17005418];gbkey=CDS;gene=glgB;locus_tag=Rv1326c;product=1%2C4-alpha-glucan branching protein;protein_id=NP_215842.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1492320 1494425 . - . ID=gene-Rv1327c;Dbxref=GeneID:886895;Name=glgE;gbkey=Gene;gene=glgE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1327c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1492320 1494425 . - 0 ID=cds-NP_215843.2;Parent=gene-Rv1327c;Dbxref=Genbank:NP_215843.2,GeneID:886895;Name=NP_215843.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glgE;locus_tag=Rv1327c;product=alpha-1%2C4-glucan:maltose-1-phosphate maltosyltransferase;protein_id=NP_215843.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1494564 1497155 . + . ID=gene-Rv1328;Dbxref=GeneID:886886;Name=glgP;gbkey=Gene;gene=glgP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1328
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1494564 1497155 . + 0 ID=cds-NP_215844.1;Parent=gene-Rv1328;Dbxref=Genbank:NP_215844.1,GeneID:886886;Name=NP_215844.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glgP;locus_tag=Rv1328;product=glycogen phosphorylase;protein_id=NP_215844.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1497195 1499189 . - . ID=gene-Rv1329c;Dbxref=GeneID:886889;Name=dinG;gbkey=Gene;gene=dinG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1329c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1497195 1499189 . - 0 ID=cds-NP_215845.1;Parent=gene-Rv1329c;Dbxref=Genbank:NP_215845.1,GeneID:886889;Name=NP_215845.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=dinG;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1329c;product=ATP-dependent helicase DinG;protein_id=NP_215845.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1499213 1500559 . - . ID=gene-Rv1330c;Dbxref=GeneID:886884;Name=pncB1;gbkey=Gene;gene=pncB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1330c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1499213 1500559 . - 0 ID=cds-NP_215846.2;Parent=gene-Rv1330c;Dbxref=Genbank:NP_215846.2,GeneID:886884;Name=NP_215846.2;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18490451];gbkey=CDS;gene=pncB1;locus_tag=Rv1330c;product=nicotinic acid phosphoribosyltransferase PncB1;protein_id=NP_215846.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1500661 1500966 . + . ID=gene-Rv1331;Dbxref=GeneID:886891;Name=Rv1331;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1331
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1500661 1500966 . + 0 ID=cds-NP_215847.1;Parent=gene-Rv1331;Dbxref=Genbank:NP_215847.1,GeneID:886891;Name=NP_215847.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1331;product=ATP-dependent Clp protease adapter protein ClpS;protein_id=NP_215847.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1500926 1501582 . + . ID=gene-Rv1332;Dbxref=GeneID:886901;Name=Rv1332;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1332
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1500926 1501582 . + 0 ID=cds-NP_215848.1;Parent=gene-Rv1332;Dbxref=Genbank:NP_215848.1,GeneID:886901;Name=NP_215848.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1332;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215848.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1501599 1502633 . + . ID=gene-Rv1333;Dbxref=GeneID:886882;Name=Rv1333;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1333
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1501599 1502633 . + 0 ID=cds-NP_215849.1;Parent=gene-Rv1333;Dbxref=Genbank:NP_215849.1,GeneID:886882;Name=NP_215849.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1333;product=hydrolase;protein_id=NP_215849.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1502641 1503081 . + . ID=gene-Rv1334;Dbxref=GeneID:886875;Name=mec;gbkey=Gene;gene=mec;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1334
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1502641 1503081 . + 0 ID=cds-NP_215850.1;Parent=gene-Rv1334;Dbxref=Genbank:NP_215850.1,GeneID:886875;Name=NP_215850.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16104727];gbkey=CDS;gene=mec;locus_tag=Rv1334;product=[CysO]-cysteine peptidase;protein_id=NP_215850.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1503103 1503384 . + . ID=gene-Rv1335;Dbxref=GeneID:886879;Name=cysO;gbkey=Gene;gene=cysO;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cfp10A;locus_tag=Rv1335
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1503103 1503384 . + 0 ID=cds-NP_215851.1;Parent=gene-Rv1335;Dbxref=Genbank:NP_215851.1,GeneID:886879;Name=NP_215851.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein characterization[PMID:16104727];gbkey=CDS;gene=cysO;locus_tag=Rv1335;product=sulfur carrier protein CysO;protein_id=NP_215851.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1503394 1504365 . + . ID=gene-Rv1336;Dbxref=GeneID:886867;Name=cysM;gbkey=Gene;gene=cysM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1336
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1503394 1504365 . + 0 ID=cds-NP_215852.1;Parent=gene-Rv1336;Dbxref=Genbank:NP_215852.1,GeneID:886867;Name=NP_215852.1;Note=cysteine synthase B%2C (CSASE B) (O-phosphoserine sulfhydrylase B) (O-phosphoserine (thiol)-lyase B);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cysM;inference=protein motif:PROSITE:PS00901;locus_tag=Rv1336;product=O-phosphoserine sulfhydrylase;protein_id=NP_215852.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1504356 1505078 . + . ID=gene-Rv1337;Dbxref=GeneID:886870;Name=Rv1337;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1337
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1504356 1505078 . + 0 ID=cds-NP_215853.1;Parent=gene-Rv1337;Dbxref=Genbank:NP_215853.1,GeneID:886870;Name=NP_215853.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1337;product=integral membrane protein;protein_id=NP_215853.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1505075 1505890 . + . ID=gene-Rv1338;Dbxref=GeneID:886866;Name=murI;gbkey=Gene;gene=murI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1338
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1505075 1505890 . + 0 ID=cds-NP_215854.1;Parent=gene-Rv1338;Dbxref=Genbank:NP_215854.1,GeneID:886866;Name=NP_215854.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=murI;inference=protein motif:PROSITE:PS00924;locus_tag=Rv1338;product=glutamate racemase;protein_id=NP_215854.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1505917 1506738 . + . ID=gene-Rv1339;Dbxref=GeneID:886972;Name=Rv1339;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1339
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1505917 1506738 . + 0 ID=cds-NP_215855.1;Parent=gene-Rv1339;Dbxref=Genbank:NP_215855.1,GeneID:886972;Name=NP_215855.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1339;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215855.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1506755 1507534 . + . ID=gene-Rv1340;Dbxref=GeneID:886864;Name=rphA;gbkey=Gene;gene=rphA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1340
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1506755 1507534 . + 0 ID=cds-NP_215856.1;Parent=gene-Rv1340;Dbxref=Genbank:NP_215856.1,GeneID:886864;Name=NP_215856.1;Note=RNase PH (tRNA nucleotidyltransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rphA;locus_tag=Rv1340;product=ribonuclease PH;protein_id=NP_215856.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1507531 1507581 . + . ID=id-NC_000962.3:1507531..1507581;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1507573 1508187 . + . ID=gene-Rv1341;Dbxref=GeneID:886861;Name=Rv1341;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1341
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1507573 1508187 . + 0 ID=cds-NP_215857.1;Parent=gene-Rv1341;Dbxref=Genbank:NP_215857.1,GeneID:886861;Name=NP_215857.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1341;product=non-canonical purine NTP pyrophosphatase;protein_id=NP_215857.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1508184 1508546 . - . ID=gene-Rv1342c;Dbxref=GeneID:886862;Name=Rv1342c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1342c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1508184 1508546 . - 0 ID=cds-YP_177800.1;Parent=gene-Rv1342c;Dbxref=Genbank:YP_177800.1,GeneID:886862;Name=YP_177800.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1342c;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177800.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1508543 1508923 . - . ID=gene-Rv1343c;Dbxref=GeneID:886852;Name=lprD;gbkey=Gene;gene=lprD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1343c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1508543 1508923 . - 0 ID=cds-NP_215859.1;Parent=gene-Rv1343c;Dbxref=Genbank:NP_215859.1,GeneID:886852;Name=NP_215859.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprD;locus_tag=Rv1343c;product=lipoprotein LprD;protein_id=NP_215859.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1508968 1509288 . + . ID=gene-Rv1344;Dbxref=GeneID:886848;Name=mbtL;gbkey=Gene;gene=mbtL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1344
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1508968 1509288 . + 0 ID=cds-NP_215860.1;Parent=gene-Rv1344;Dbxref=Genbank:NP_215860.1,GeneID:886848;Name=NP_215860.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=mbtL;locus_tag=Rv1344;product=acyl carrier protein MbtL;protein_id=NP_215860.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1509281 1510846 . + . ID=gene-Rv1345;Dbxref=GeneID:886855;Name=mbtM;gbkey=Gene;gene=mbtM;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=fadD33;locus_tag=Rv1345
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1509281 1510846 . + 0 ID=cds-NP_215861.1;Parent=gene-Rv1345;Dbxref=Genbank:NP_215861.1,GeneID:886855;Name=NP_215861.1;Note=fatty acyl-AMP ligase MbtM;gbkey=CDS;gene=mbtM;locus_tag=Rv1345;product=long-chain-fatty-acid--ACP ligase MbtM;protein_id=NP_215861.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1510846 1512006 . + . ID=gene-Rv1346;Dbxref=GeneID:886844;Name=mbtN;gbkey=Gene;gene=mbtN;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=fadE14;locus_tag=Rv1346
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1510846 1512006 . + 0 ID=cds-NP_215862.1;Parent=gene-Rv1346;Dbxref=Genbank:NP_215862.1,GeneID:886844;Name=NP_215862.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mbtN;locus_tag=Rv1346;product=acyl-[acyl-carrier-protein] dehydrogenase MbtN;protein_id=NP_215862.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1511973 1512605 . - . ID=gene-Rv1347c;Dbxref=GeneID:886846;Name=mbtK;gbkey=Gene;gene=mbtK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1347c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1511973 1512605 . - 0 ID=cds-NP_215863.1;Parent=gene-Rv1347c;Dbxref=Genbank:NP_215863.1,GeneID:886846;Name=NP_215863.1;experiment=EXISTENCE:Protein crystalography[PMID:15695811];gbkey=CDS;gene=mbtK;locus_tag=Rv1347c;product=lysine N-acetyltransferase MbtK;protein_id=NP_215863.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1512728 1512811 . + . ID=gene-Rvnt19;Dbxref=GeneID:2700424;Name=leuW;gbkey=Gene;gene=leuW;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt19
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1512728 1512811 . + . ID=rna-Rvnt19;Parent=gene-Rvnt19;Dbxref=GeneID:2700424;Note=leuW%2C tRNA-Leu%2C anticodon tag%2C length %3D 84;anticodon=(pos:1512762..1512764);codons=18;gbkey=tRNA;gene=leuW;locus_tag=Rvnt19;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq exon 1512728 1512811 . + . ID=exon-Rvnt19-1;Parent=rna-Rvnt19;Dbxref=GeneID:2700424;Note=leuW%2C tRNA-Leu%2C anticodon tag%2C length %3D 84;anticodon=(pos:1512762..1512764);codons=18;gbkey=tRNA;gene=leuW;locus_tag=Rvnt19;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq gene 1513047 1515626 . + . ID=gene-Rv1348;Dbxref=GeneID:886853;Name=irtA;gbkey=Gene;gene=irtA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1348
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1513047 1515626 . + 0 ID=cds-NP_215864.1;Parent=gene-Rv1348;Dbxref=Genbank:NP_215864.1,GeneID:886853;Name=NP_215864.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:19948799];gbkey=CDS;gene=irtA;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1348;product=iron ABC transporter ATP-binding protein/permease IrtA;protein_id=NP_215864.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1515623 1517362 . + . ID=gene-Rv1349;Dbxref=GeneID:886834;Name=irtB;gbkey=Gene;gene=irtB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1349
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1515623 1517362 . + 0 ID=cds-NP_215865.1;Parent=gene-Rv1349;Dbxref=Genbank:NP_215865.1,GeneID:886834;Name=NP_215865.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:19948799];gbkey=CDS;gene=irtB;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1349;product=iron ABC transporter ATP-binding protein/permease IrtB;protein_id=NP_215865.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1517491 1518234 . + . ID=gene-Rv1350;Dbxref=GeneID:886837;Name=fabG2;gbkey=Gene;gene=fabG2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1350
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1517491 1518234 . + 0 ID=cds-NP_215866.1;Parent=gene-Rv1350;Dbxref=Genbank:NP_215866.1,GeneID:886837;Name=NP_215866.1;Note=3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fabG2;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1350;product=3-oxoacyl-ACP reductase FabG;protein_id=NP_215866.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1518231 1518560 . + . ID=gene-Rv1351;Dbxref=GeneID:886831;Name=Rv1351;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1351
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1518231 1518560 . + 0 ID=cds-NP_215867.1;Parent=gene-Rv1351;Dbxref=Genbank:NP_215867.1,GeneID:886831;Name=NP_215867.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14595687];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1351;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215867.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1518763 1519134 . + . ID=gene-Rv1352;Dbxref=GeneID:886833;Name=Rv1352;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1352
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1518763 1519134 . + 0 ID=cds-NP_215868.1;Parent=gene-Rv1352;Dbxref=Genbank:NP_215868.1,GeneID:886833;Name=NP_215868.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1352;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215868.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1519200 1519985 . - . ID=gene-Rv1353c;Dbxref=GeneID:886827;Name=Rv1353c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1353c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1519200 1519985 . - 0 ID=cds-NP_215869.1;Parent=gene-Rv1353c;Dbxref=Genbank:NP_215869.1,GeneID:886827;Name=NP_215869.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1353c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_215869.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1520005 1521876 . - . ID=gene-Rv1354c;Dbxref=GeneID:886829;Name=Rv1354c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1354c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1520005 1521876 . - 0 ID=cds-NP_215870.1;Parent=gene-Rv1354c;Dbxref=Genbank:NP_215870.1,GeneID:886829;Name=NP_215870.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1354c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215870.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1521885 1524032 . - . ID=gene-Rv1355c;Dbxref=GeneID:886839;Name=moeY;gbkey=Gene;gene=moeY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1355c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1521885 1524032 . - 0 ID=cds-NP_215871.1;Parent=gene-Rv1355c;Dbxref=Genbank:NP_215871.1,GeneID:886839;Name=NP_215871.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=moeY;locus_tag=Rv1355c;product=molybdopterin biosynthesis protein MoeY;protein_id=NP_215871.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1524029 1524820 . - . ID=gene-Rv1356c;Dbxref=GeneID:886850;Name=Rv1356c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1356c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1524029 1524820 . - 0 ID=cds-NP_215872.1;Parent=gene-Rv1356c;Dbxref=Genbank:NP_215872.1,GeneID:886850;Name=NP_215872.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1356c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215872.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1525293 1526216 . - . ID=gene-Rv1357c;Dbxref=GeneID:886815;Name=Rv1357c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1357c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1525293 1526216 . - 0 ID=cds-NP_215873.1;Parent=gene-Rv1357c;Dbxref=Genbank:NP_215873.1,GeneID:886815;Name=NP_215873.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1357c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215873.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1526612 1530091 . + . ID=gene-Rv1358;Dbxref=GeneID:886817;Name=Rv1358;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1358
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1526612 1530091 . + 0 ID=cds-NP_215874.1;Parent=gene-Rv1358;Dbxref=Genbank:NP_215874.1,GeneID:886817;Name=NP_215874.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00622;locus_tag=Rv1358;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215874.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1530173 1530925 . + . ID=gene-Rv1359;Dbxref=GeneID:886841;Name=Rv1359;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1359
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1530173 1530925 . + 0 ID=cds-NP_215875.1;Parent=gene-Rv1359;Dbxref=Genbank:NP_215875.1,GeneID:886841;Name=NP_215875.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1359;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215875.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1531348 1532370 . + . ID=gene-Rv1360;Dbxref=GeneID:886813;Name=Rv1360;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1360
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1531348 1532370 . + 0 ID=cds-NP_215876.1;Parent=gene-Rv1360;Dbxref=Genbank:NP_215876.1,GeneID:886813;Name=NP_215876.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1360;product=oxidoreductase;protein_id=NP_215876.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1532443 1533633 . - . ID=gene-Rv1361c;Dbxref=GeneID:886819;Name=PPE19;gbkey=Gene;gene=PPE19;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtb39b;locus_tag=Rv1361c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1532443 1533633 . - 0 ID=cds-YP_177801.1;Parent=gene-Rv1361c;Dbxref=Genbank:YP_177801.1,GeneID:886819;Name=YP_177801.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE family of glycine-rich proteins. A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE19;inference=protein motif:PROSITE:PS00501;locus_tag=Rv1361c;product=PPE family protein PPE19;protein_id=YP_177801.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1533948 1534610 . - . ID=gene-Rv1362c;Dbxref=GeneID:886809;Name=Rv1362c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1362c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1533948 1534610 . - 0 ID=cds-NP_215878.1;Parent=gene-Rv1362c;Dbxref=Genbank:NP_215878.1,GeneID:886809;Name=NP_215878.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1362c;product=membrane protein;protein_id=NP_215878.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1534607 1535392 . - . ID=gene-Rv1363c;Dbxref=GeneID:886811;Name=Rv1363c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1363c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1534607 1535392 . - 0 ID=cds-NP_215879.1;Parent=gene-Rv1363c;Dbxref=Genbank:NP_215879.1,GeneID:886811;Name=NP_215879.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1363c;product=membrane protein;protein_id=NP_215879.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1535417 1535716 . - . ID=gene-RVnc0015;Dbxref=GeneID:14515856;Name=mcr15;gbkey=Gene;gene=mcr15;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0015
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1535417 1535716 . - . ID=rna-RVnc0015;Parent=gene-RVnc0015;Dbxref=GeneID:14515856;Note=mcr15%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped.;gbkey=ncRNA;gene=mcr15;locus_tag=RVnc0015;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1535417 1535716 . - . ID=exon-RVnc0015-1;Parent=rna-RVnc0015;Dbxref=GeneID:14515856;Note=mcr15%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped.;gbkey=ncRNA;gene=mcr15;locus_tag=RVnc0015;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1535683 1537644 . - . ID=gene-Rv1364c;Dbxref=GeneID:886802;Name=Rv1364c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1364c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1535683 1537644 . - 0 ID=cds-YP_177802.1;Parent=gene-Rv1364c;Dbxref=Genbank:YP_177802.1,GeneID:886802;Name=YP_177802.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1364c;product=sigma factor regulatory protein;protein_id=YP_177802.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1537783 1538169 . - . ID=gene-Rv1365c;Dbxref=GeneID:886794;Name=rsfA;gbkey=Gene;gene=rsfA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1365c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1537783 1538169 . - 0 ID=cds-NP_215881.1;Parent=gene-Rv1365c;Dbxref=Genbank:NP_215881.1,GeneID:886794;Name=NP_215881.1;Note=anti-sigma factor antagonist (regulator of sigma F A);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:12354223];gbkey=CDS;gene=rsfA;locus_tag=Rv1365c;product=anti-sigma-F factor antagonist RsfA;protein_id=NP_215881.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1538390 1539211 . + . ID=gene-Rv1366;Dbxref=GeneID:886805;Name=Rv1366;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1366
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1538390 1539211 . + 0 ID=cds-NP_215882.1;Parent=gene-Rv1366;Dbxref=Genbank:NP_215882.1,GeneID:886805;Name=NP_215882.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1366;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215882.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1539180 1539440 . + . ID=gene-Rv1366A;Dbxref=GeneID:14515857;Name=Rv1366A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1366A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1539180 1539440 . + 0 ID=cds-YP_004837053.2;Parent=gene-Rv1366A;Dbxref=Genbank:YP_004837053.2,GeneID:14515857;Name=YP_004837053.2;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1366A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_004837053.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1539512 1540645 . - . ID=gene-Rv1367c;Dbxref=GeneID:886793;Name=Rv1367c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1367c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1539512 1540645 . - 0 ID=cds-NP_215883.1;Parent=gene-Rv1367c;Dbxref=Genbank:NP_215883.1,GeneID:886793;Name=NP_215883.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1367c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215883.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1541020 1541805 . + . ID=gene-Rv1368;Dbxref=GeneID:886798;Name=lprF;gbkey=Gene;gene=lprF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1368
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1541020 1541805 . + 0 ID=cds-NP_215884.1;Parent=gene-Rv1368;Dbxref=Genbank:NP_215884.1,GeneID:886798;Name=NP_215884.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprF;locus_tag=Rv1368;product=lipoprotein LprF;protein_id=NP_215884.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1541949 1541951 . + . ID=id-NC_000962.3:1541949..1541951;Note=3 bp direct repeat%2C CGG%2C at 3' end of IS6110 target sequence;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1541952 1543306 . - . ID=id-NC_000962.3:1541952..1543306;Note=IS6110-2%2C len: 1355 nt. Almost identical to Insertion sequence IS986 element.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-2
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 1541994 1543255 . - . ID=id-NC_000962.3:1541994..1543255;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable transposase subunit for IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990);gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1543307 1543309 . + . ID=id-NC_000962.3:1543307..1543309;Note=3 bp direct repeat%2C CGG%2C at 5' end of IS6110 target sequence;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1543359 1544828 . + . ID=gene-Rv1371;Dbxref=GeneID:886800;Name=Rv1371;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1371
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1543359 1544828 . + 0 ID=cds-NP_215887.1;Parent=gene-Rv1371;Dbxref=Genbank:NP_215887.1,GeneID:886800;Name=NP_215887.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1371;product=membrane protein;protein_id=NP_215887.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1544825 1546006 . + . ID=gene-Rv1372;Dbxref=GeneID:886797;Name=Rv1372;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1372
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1544825 1546006 . + 0 ID=cds-YP_177803.1;Parent=gene-Rv1372;Dbxref=Genbank:YP_177803.1,GeneID:886797;Name=YP_177803.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:15286723];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1372;product=alpha-pyrone synthesis polyketide synthase-like protein;protein_id=YP_177803.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1546012 1546992 . + . ID=gene-Rv1373;Dbxref=GeneID:886781;Name=Rv1373;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1373
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1546012 1546992 . + 0 ID=cds-NP_215889.1;Parent=gene-Rv1373;Dbxref=Genbank:NP_215889.1,GeneID:886781;Name=NP_215889.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:11882713];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1373;product=glycolipid sulfotransferase;protein_id=NP_215889.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1547072 1547530 . - . ID=gene-Rv1374c;Dbxref=GeneID:886783;Name=Rv1374c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1374c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1547072 1547530 . - 0 ID=cds-NP_215890.2;Parent=gene-Rv1374c;Dbxref=Genbank:NP_215890.2,GeneID:886783;Name=NP_215890.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1374c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215890.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1547129 1547268 . + . ID=gene-RVnc0035;Dbxref=GeneID:14515858;Name=MTS1082;gbkey=Gene;gene=MTS1082;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0035
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1547129 1547268 . + . ID=rna-RVnc0035;Parent=gene-RVnc0035;Dbxref=GeneID:14515858;Note=MTS1082%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C ends not mapped%2C ~~150 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS1082;locus_tag=RVnc0035;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1547129 1547268 . + . ID=exon-RVnc0035-1;Parent=rna-RVnc0035;Dbxref=GeneID:14515858;Note=MTS1082%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C ends not mapped%2C ~~150 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS1082;locus_tag=RVnc0035;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1547832 1549151 . + . ID=gene-Rv1375;Dbxref=GeneID:886778;Name=Rv1375;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1375
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1547832 1549151 . + 0 ID=cds-NP_215891.1;Parent=gene-Rv1375;Dbxref=Genbank:NP_215891.1,GeneID:886778;Name=NP_215891.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1375;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215891.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1549148 1550641 . + . ID=gene-Rv1376;Dbxref=GeneID:886777;Name=Rv1376;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1376
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1549148 1550641 . + 0 ID=cds-NP_215892.1;Parent=gene-Rv1376;Dbxref=Genbank:NP_215892.1,GeneID:886777;Name=NP_215892.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1376;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215892.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1550579 1551217 . - . ID=gene-Rv1377c;Dbxref=GeneID:886775;Name=Rv1377c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1377c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1550579 1551217 . - 0 ID=cds-NP_215893.1;Parent=gene-Rv1377c;Dbxref=Genbank:NP_215893.1,GeneID:886775;Name=NP_215893.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1377c;product=transferase;protein_id=NP_215893.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1551228 1552655 . - . ID=gene-Rv1378c;Dbxref=GeneID:886773;Name=Rv1378c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1378c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1551228 1552655 . - 0 ID=cds-NP_215894.1;Parent=gene-Rv1378c;Dbxref=Genbank:NP_215894.1,GeneID:886773;Name=NP_215894.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1378c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215894.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1555477 1555974 . + . ID=gene-Rv1382;Dbxref=GeneID:886767;Name=Rv1382;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1382
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1555477 1555974 . + 0 ID=cds-NP_215898.1;Parent=gene-Rv1382;Dbxref=Genbank:NP_215898.1,GeneID:886767;Name=NP_215898.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1382;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215898.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1555971 1557101 . + . ID=gene-Rv1383;Dbxref=GeneID:886761;Name=carA;gbkey=Gene;gene=carA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1383
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1555971 1557101 . + 0 ID=cds-NP_215899.1;Parent=gene-Rv1383;Dbxref=Genbank:NP_215899.1,GeneID:886761;Name=NP_215899.1;Note=carbamoyl-phosphate synthetase glutamine chain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=carA;inference=protein motif:PROSITE:PS00442;locus_tag=Rv1383;product=carbamoyl-phosphate synthase small subunit;protein_id=NP_215899.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1557101 1560448 . + . ID=gene-Rv1384;Dbxref=GeneID:886253;Name=carB;gbkey=Gene;gene=carB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1384
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1557101 1560448 . + 0 ID=cds-YP_177804.1;Parent=gene-Rv1384;Dbxref=Genbank:YP_177804.1,GeneID:886253;Name=YP_177804.1;Note=carbamoyl-phosphate synthetase ammonia chain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=carB;inference=protein motif:PROSITE:PS00867;locus_tag=Rv1384;product=carbamoyl-phosphate synthase large subunit;protein_id=YP_177804.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1560445 1561269 . + . ID=gene-Rv1385;Dbxref=GeneID:886763;Name=pyrF;gbkey=Gene;gene=pyrF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1385
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1560445 1561269 . + 0 ID=cds-NP_215901.1;Parent=gene-Rv1385;Dbxref=Genbank:NP_215901.1,GeneID:886763;Name=NP_215901.1;Note=OMP decarboxylase (ompdecase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=pyrF;inference=protein motif:PROSITE:PS00156;locus_tag=Rv1385;product=orotidine 5'-phosphate decarboxylase;protein_id=NP_215901.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1561464 1561772 . + . ID=gene-Rv1386;Dbxref=GeneID:886757;Name=PE15;gbkey=Gene;gene=PE15;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1386
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1561464 1561772 . + 0 ID=cds-YP_177805.1;Parent=gene-Rv1386;Dbxref=Genbank:YP_177805.1,GeneID:886757;Name=YP_177805.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PE15;locus_tag=Rv1386;product=PE family protein PE15;protein_id=YP_177805.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1561769 1563388 . + . ID=gene-Rv1387;Dbxref=GeneID:886784;Name=PPE20;gbkey=Gene;gene=PPE20;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1387
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1561769 1563388 . + 0 ID=cds-YP_177806.1;Parent=gene-Rv1387;Dbxref=Genbank:YP_177806.1,GeneID:886784;Name=YP_177806.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PPE20;inference=protein motif:PROSITE:PS00343;locus_tag=Rv1387;product=PPE family protein PPE20;protein_id=YP_177806.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1563694 1564266 . + . ID=gene-Rv1388;Dbxref=GeneID:886751;Name=mihF;gbkey=Gene;gene=mihF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1388
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1563694 1564266 . + 0 ID=cds-NP_215904.1;Parent=gene-Rv1388;Dbxref=Genbank:NP_215904.1,GeneID:886751;Name=NP_215904.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mihF;inference=EXISTENCE: similar to sequence:UniProt:P96802;locus_tag=Rv1388;product=integration host factor MihF;protein_id=NP_215904.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1564401 1565027 . + . ID=gene-Rv1389;Dbxref=GeneID:886787;Name=gmk;gbkey=Gene;gene=gmk;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1389
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1564401 1565027 . + 0 ID=cds-NP_215905.1;Parent=gene-Rv1389;Dbxref=Genbank:NP_215905.1,GeneID:886787;Name=NP_215905.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gmk;inference=protein motif:PROSITE:PS00856;locus_tag=Rv1389;product=guanylate kinase;protein_id=NP_215905.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1565093 1565425 . + . ID=gene-Rv1390;Dbxref=GeneID:886754;Name=rpoZ;gbkey=Gene;gene=rpoZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1390
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1565093 1565425 . + 0 ID=cds-NP_215906.1;Parent=gene-Rv1390;Dbxref=Genbank:NP_215906.1,GeneID:886754;Name=NP_215906.1;Note=RpoZ (transcriptase omega chain) (RNA polymerase omega subunit);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpoZ;locus_tag=Rv1390;product=DNA-directed RNA polymerase subunit omega;protein_id=NP_215906.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1565441 1566697 . + . ID=gene-Rv1391;Dbxref=GeneID:886749;Name=dfp;gbkey=Gene;gene=dfp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1391
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1565441 1566697 . + 0 ID=cds-NP_215907.1;Parent=gene-Rv1391;Dbxref=Genbank:NP_215907.1,GeneID:886749;Name=NP_215907.1;Note=DNA/pantothenate metabolism flavoprotein%3B Coenzyme A biosynthesis;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=dfp;locus_tag=Rv1391;product=bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase;protein_id=NP_215907.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1566825 1568036 . + . ID=gene-Rv1392;Dbxref=GeneID:886741;Name=metK;gbkey=Gene;gene=metK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1392
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1566825 1568036 . + 0 ID=cds-NP_215908.1;Parent=gene-Rv1392;Dbxref=Genbank:NP_215908.1,GeneID:886741;Name=NP_215908.1;Note=mat (AdoMet synthetase) (methionine adenosyltransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=metK;inference=protein motif:PROSITE:PS00377;locus_tag=Rv1392;product=S-adenosylmethionine synthetase;protein_id=NP_215908.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1568109 1569587 . - . ID=gene-Rv1393c;Dbxref=GeneID:886743;Name=Rv1393c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1393c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1568109 1569587 . - 0 ID=cds-NP_215909.1;Parent=gene-Rv1393c;Dbxref=Genbank:NP_215909.1,GeneID:886743;Name=NP_215909.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1393c;product=monoxygenase;protein_id=NP_215909.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1569584 1570969 . - . ID=gene-Rv1394c;Dbxref=GeneID:886738;Name=cyp132;gbkey=Gene;gene=cyp132;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1394c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1569584 1570969 . - 0 ID=cds-YP_177807.1;Parent=gene-Rv1394c;Dbxref=Genbank:YP_177807.1,GeneID:886738;Name=YP_177807.1;gbkey=CDS;gene=cyp132;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv1394c;product=cytochrome P450 Cyp132;protein_id=YP_177807.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1571047 1572081 . + . ID=gene-Rv1395;Dbxref=GeneID:886251;Name=Rv1395;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1395
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1571047 1572081 . + 0 ID=cds-YP_177808.1;Parent=gene-Rv1395;Dbxref=Genbank:YP_177808.1,GeneID:886251;Name=YP_177808.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:12826660];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1395;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=YP_177808.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1572127 1573857 . - . ID=gene-Rv1396c;Dbxref=GeneID:886745;Name=PE_PGRS25;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS25;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1396c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1572127 1573857 . - 0 ID=cds-YP_177809.1;Parent=gene-Rv1396c;Dbxref=Genbank:YP_177809.1,GeneID:886745;Name=YP_177809.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS25;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1396c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS25;protein_id=YP_177809.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1574112 1574513 . - . ID=gene-Rv1397c;Dbxref=GeneID:886736;Name=vapC10;gbkey=Gene;gene=vapC10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1397c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1574112 1574513 . - 0 ID=cds-NP_215913.1;Parent=gene-Rv1397c;Dbxref=Genbank:NP_215913.1,GeneID:886736;Name=NP_215913.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1398c%2C contains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=vapC10;locus_tag=Rv1397c;product=ribonuclease VapC10;protein_id=NP_215913.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1574510 1574767 . - . ID=gene-Rv1398c;Dbxref=GeneID:886759;Name=vapB10;gbkey=Gene;gene=vapB10;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1398c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1574510 1574767 . - 0 ID=cds-NP_215914.1;Parent=gene-Rv1398c;Dbxref=Genbank:NP_215914.1,GeneID:886759;Name=NP_215914.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1397c. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB10;locus_tag=Rv1398c;product=antitoxin VapB10;protein_id=NP_215914.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1574850 1575809 . - . ID=gene-Rv1399c;Dbxref=GeneID:886731;Name=nlhH;gbkey=Gene;gene=nlhH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1399c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1574850 1575809 . - 0 ID=cds-NP_215915.1;Parent=gene-Rv1399c;Dbxref=Genbank:NP_215915.1,GeneID:886731;Name=NP_215915.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nlhH;locus_tag=Rv1399c;product=carboxylesterase NlhH;protein_id=NP_215915.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1575834 1576796 . - . ID=gene-Rv1400c;Dbxref=GeneID:886728;Name=lipI;gbkey=Gene;gene=lipI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1400c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1575834 1576796 . - 0 ID=cds-NP_215916.1;Parent=gene-Rv1400c;Dbxref=Genbank:NP_215916.1,GeneID:886728;Name=NP_215916.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=lipI;locus_tag=Rv1400c;product=lipase;protein_id=NP_215916.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1576930 1577532 . + . ID=gene-Rv1401;Dbxref=GeneID:886733;Name=Rv1401;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1401
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1576930 1577532 . + 0 ID=cds-NP_215917.1;Parent=gene-Rv1401;Dbxref=Genbank:NP_215917.1,GeneID:886733;Name=NP_215917.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1401;product=membrane protein;protein_id=NP_215917.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1577613 1579580 . + . ID=gene-Rv1402;Dbxref=GeneID:886716;Name=priA;gbkey=Gene;gene=priA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1402
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1577613 1579580 . + 0 ID=cds-NP_215918.1;Parent=gene-Rv1402;Dbxref=Genbank:NP_215918.1,GeneID:886716;Name=NP_215918.1;Note=PriA (replication factor Y);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=priA;locus_tag=Rv1402;product=primosomal protein N';protein_id=NP_215918.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1579598 1580422 . - . ID=gene-Rv1403c;Dbxref=GeneID:886717;Name=Rv1403c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1403c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1579598 1580422 . - 0 ID=cds-NP_215919.1;Parent=gene-Rv1403c;Dbxref=Genbank:NP_215919.1,GeneID:886717;Name=NP_215919.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1403c;product=methyltransferase;protein_id=NP_215919.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1580591 1581073 . + . ID=gene-Rv1404;Dbxref=GeneID:886712;Name=Rv1404;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1404
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1580591 1581073 . + 0 ID=cds-NP_215920.1;Parent=gene-Rv1404;Dbxref=Genbank:NP_215920.1,GeneID:886712;Name=NP_215920.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1404;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215920.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1581145 1581969 . - . ID=gene-Rv1405c;Dbxref=GeneID:886714;Name=Rv1405c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1405c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1581145 1581969 . - 0 ID=cds-NP_215921.1;Parent=gene-Rv1405c;Dbxref=Genbank:NP_215921.1,GeneID:886714;Name=NP_215921.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1405c;product=methyltransferase;protein_id=NP_215921.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1582166 1583104 . + . ID=gene-Rv1406;Dbxref=GeneID:886706;Name=fmt;gbkey=Gene;gene=fmt;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1406
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1582166 1583104 . + 0 ID=cds-NP_215922.1;Parent=gene-Rv1406;Dbxref=Genbank:NP_215922.1,GeneID:886706;Name=NP_215922.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=fmt;locus_tag=Rv1406;product=methionyl-tRNA formyltransferase;protein_id=NP_215922.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1583101 1584474 . + . ID=gene-Rv1407;Dbxref=GeneID:886720;Name=fmu;gbkey=Gene;gene=fmu;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1407
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1583101 1584474 . + 0 ID=cds-NP_215923.1;Parent=gene-Rv1407;Dbxref=Genbank:NP_215923.1,GeneID:886720;Name=NP_215923.1;Note=sun protein%3B Fmu protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fmu;locus_tag=Rv1407;product=16S rRNA m5C967 methyltransferase;protein_id=NP_215923.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1584499 1585197 . + . ID=gene-Rv1408;Dbxref=GeneID:886702;Name=rpe;gbkey=Gene;gene=rpe;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1408
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1584499 1585197 . + 0 ID=cds-NP_215924.1;Parent=gene-Rv1408;Dbxref=Genbank:NP_215924.1,GeneID:886702;Name=NP_215924.1;Note=Rpe (PPE) (R5P3E) (pentose-5-phosphate 3-epimerase);gbkey=CDS;gene=rpe;inference=protein motif:PROSITE:PS01086;locus_tag=Rv1408;product=ribulose-phosphate 3-epimerase;protein_id=NP_215924.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1585194 1586213 . + . ID=gene-Rv1409;Dbxref=GeneID:886721;Name=ribG;gbkey=Gene;gene=ribG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ribD;locus_tag=Rv1409
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1585194 1586213 . + 0 ID=cds-NP_215925.1;Parent=gene-Rv1409;Dbxref=Genbank:NP_215925.1,GeneID:886721;Name=NP_215925.1;Note=ribG (alternate gene name: ribD)%2C bifunctional riboflavin biosynthesis protein%2C including diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ribG;inference=protein motif:PROSITE:PS00903;locus_tag=Rv1409;product=bifunctional riboflavin biosynthesis diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase;protein_id=NP_215925.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1586210 1587766 . - . ID=gene-Rv1410c;Dbxref=GeneID:886709;Name=Rv1410c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=P55;locus_tag=Rv1410c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1586210 1587766 . - 0 ID=cds-NP_215926.1;Parent=gene-Rv1410c;Dbxref=Genbank:NP_215926.1,GeneID:886709;Name=NP_215926.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18156250];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00216;locus_tag=Rv1410c;product=aminoglycosides/tetracycline-transport integral membrane protein;protein_id=NP_215926.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1587772 1588482 . - . ID=gene-Rv1411c;Dbxref=GeneID:886700;Name=lprG;gbkey=Gene;gene=lprG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=P27;locus_tag=Rv1411c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1587772 1588482 . - 0 ID=cds-NP_215927.1;Parent=gene-Rv1411c;Dbxref=Genbank:NP_215927.1,GeneID:886700;Name=NP_215927.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18156250];gbkey=CDS;gene=lprG;locus_tag=Rv1411c;product=lipoprotein LprG;protein_id=NP_215927.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1588567 1589172 . + . ID=gene-Rv1412;Dbxref=GeneID:886690;Name=ribC;gbkey=Gene;gene=ribC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1412
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1588567 1589172 . + 0 ID=cds-NP_215928.1;Parent=gene-Rv1412;Dbxref=Genbank:NP_215928.1,GeneID:886690;Name=NP_215928.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ribC;inference=protein motif:PROSITE:PS00693;locus_tag=Rv1412;product=riboflavin synthase;protein_id=NP_215928.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1589386 1589901 . + . ID=gene-Rv1413;Dbxref=GeneID:886692;Name=Rv1413;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1413
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1589386 1589901 . + 0 ID=cds-NP_215929.1;Parent=gene-Rv1413;Dbxref=Genbank:NP_215929.1,GeneID:886692;Name=NP_215929.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1413;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215929.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1589891 1590292 . + . ID=gene-Rv1414;Dbxref=GeneID:886696;Name=Rv1414;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1414
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1589891 1590292 . + 0 ID=cds-NP_215930.1;Parent=gene-Rv1414;Dbxref=Genbank:NP_215930.1,GeneID:886696;Name=NP_215930.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1414;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215930.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1590397 1591674 . + . ID=gene-Rv1415;Dbxref=GeneID:886694;Name=ribA2;gbkey=Gene;gene=ribA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1415
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1590397 1591674 . + 0 ID=cds-NP_215931.1;Parent=gene-Rv1415;Dbxref=Genbank:NP_215931.1,GeneID:886694;Name=NP_215931.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=ribA2;locus_tag=Rv1415;product=bifunctional riboflavin biosynthesis GTP cyclohydrolase II/3%2C4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase;protein_id=NP_215931.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1591671 1592153 . + . ID=gene-Rv1416;Dbxref=GeneID:886681;Name=ribH;gbkey=Gene;gene=ribH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1416
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1591671 1592153 . + 0 ID=cds-NP_215932.2;Parent=gene-Rv1416;Dbxref=Genbank:NP_215932.2,GeneID:886681;Name=NP_215932.2;Note=RibH (6%2C7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase) (DMRL synthase) (lumazine synthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=ribH;locus_tag=Rv1416;product=6%2C7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase;protein_id=NP_215932.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1592150 1592614 . + . ID=gene-Rv1417;Dbxref=GeneID:886704;Name=Rv1417;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1417
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1592150 1592614 . + 0 ID=cds-NP_215933.1;Parent=gene-Rv1417;Dbxref=Genbank:NP_215933.1,GeneID:886704;Name=NP_215933.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1417;product=membrane protein;protein_id=NP_215933.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1592639 1593325 . + . ID=gene-Rv1418;Dbxref=GeneID:886687;Name=lprH;gbkey=Gene;gene=lprH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1418
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1592639 1593325 . + 0 ID=cds-NP_215934.1;Parent=gene-Rv1418;Dbxref=Genbank:NP_215934.1,GeneID:886687;Name=NP_215934.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lprH;locus_tag=Rv1418;product=lipoprotein LprH;protein_id=NP_215934.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1593505 1593978 . + . ID=gene-Rv1419;Dbxref=GeneID:886683;Name=Rv1419;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1419
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1593505 1593978 . + 0 ID=cds-NP_215935.1;Parent=gene-Rv1419;Dbxref=Genbank:NP_215935.1,GeneID:886683;Name=NP_215935.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1419;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215935.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1594042 1595982 . + . ID=gene-Rv1420;Dbxref=GeneID:886672;Name=uvrC;gbkey=Gene;gene=uvrC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1420
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1594042 1595982 . + 0 ID=cds-NP_215936.1;Parent=gene-Rv1420;Dbxref=Genbank:NP_215936.1,GeneID:886672;Name=NP_215936.1;Note=nuclease UvrC;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=uvrC;locus_tag=Rv1420;product=excinuclease ABC subunit UvrC;protein_id=NP_215936.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1595979 1596884 . + . ID=gene-Rv1421;Dbxref=GeneID:886676;Name=Rv1421;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1421
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1595979 1596884 . + 0 ID=cds-NP_215937.1;Parent=gene-Rv1421;Dbxref=Genbank:NP_215937.1,GeneID:886676;Name=NP_215937.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1421;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215937.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1596881 1597909 . + . ID=gene-Rv1422;Dbxref=GeneID:886670;Name=Rv1422;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1422
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1596881 1597909 . + 0 ID=cds-NP_215938.1;Parent=gene-Rv1422;Dbxref=Genbank:NP_215938.1,GeneID:886670;Name=NP_215938.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1422;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215938.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1597906 1598883 . + . ID=gene-Rv1423;Dbxref=GeneID:886674;Name=whiA;gbkey=Gene;gene=whiA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1423
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1597906 1598883 . + 0 ID=cds-NP_215939.1;Parent=gene-Rv1423;Dbxref=Genbank:NP_215939.1,GeneID:886674;Name=NP_215939.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=whiA;locus_tag=Rv1423;product=transcriptional regulator WhiA;protein_id=NP_215939.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1598893 1599654 . - . ID=gene-Rv1424c;Dbxref=GeneID:886685;Name=Rv1424c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1424c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1598893 1599654 . - 0 ID=cds-NP_215940.1;Parent=gene-Rv1424c;Dbxref=Genbank:NP_215940.1,GeneID:886685;Name=NP_215940.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv1424c;product=membrane protein;protein_id=NP_215940.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1599658 1601037 . + . ID=gene-Rv1425;Dbxref=GeneID:886668;Name=Rv1425;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1425
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1599658 1601037 . + 0 ID=cds-NP_215941.1;Parent=gene-Rv1425;Dbxref=Genbank:NP_215941.1,GeneID:886668;Name=NP_215941.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1425;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_215941.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1601059 1602321 . - . ID=gene-Rv1426c;Dbxref=GeneID:886660;Name=lipO;gbkey=Gene;gene=lipO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1426c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1601059 1602321 . - 0 ID=cds-NP_215942.1;Parent=gene-Rv1426c;Dbxref=Genbank:NP_215942.1,GeneID:886660;Name=NP_215942.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=lipO;locus_tag=Rv1426c;product=esterase LipO;protein_id=NP_215942.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1602321 1603928 . - . ID=gene-Rv1427c;Dbxref=GeneID:886679;Name=fadD12;gbkey=Gene;gene=fadD12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1427c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1602321 1603928 . - 0 ID=cds-NP_215943.1;Parent=gene-Rv1427c;Dbxref=Genbank:NP_215943.1,GeneID:886679;Name=NP_215943.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=fadD12;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv1427c;product=acyl-CoA synthetase;protein_id=NP_215943.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1603932 1604759 . - . ID=gene-Rv1428c;Dbxref=GeneID:886656;Name=Rv1428c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1428c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1603932 1604759 . - 0 ID=cds-NP_215944.1;Parent=gene-Rv1428c;Dbxref=Genbank:NP_215944.1,GeneID:886656;Name=NP_215944.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1428c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215944.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1604878 1606146 . + . ID=gene-Rv1429;Dbxref=GeneID:886658;Name=Rv1429;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1429
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1604878 1606146 . + 0 ID=cds-NP_215945.1;Parent=gene-Rv1429;Dbxref=Genbank:NP_215945.1,GeneID:886658;Name=NP_215945.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1429;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215945.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1606386 1607972 . + . ID=gene-Rv1430;Dbxref=GeneID:886652;Name=PE16;gbkey=Gene;gene=PE16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1430
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1606386 1607972 . + 0 ID=cds-YP_177810.1;Parent=gene-Rv1430;Dbxref=Genbank:YP_177810.1,GeneID:886652;Name=YP_177810.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family of proteins;gbkey=CDS;gene=PE16;locus_tag=Rv1430;product=PE family protein PE16;protein_id=YP_177810.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1608083 1609852 . + . ID=gene-Rv1431;Dbxref=GeneID:886662;Name=Rv1431;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1431
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1608083 1609852 . + 0 ID=cds-NP_215947.1;Parent=gene-Rv1431;Dbxref=Genbank:NP_215947.1,GeneID:886662;Name=NP_215947.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1431;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215947.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1609849 1611270 . + . ID=gene-Rv1432;Dbxref=GeneID:886643;Name=Rv1432;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1432
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1609849 1611270 . + 0 ID=cds-NP_215948.1;Parent=gene-Rv1432;Dbxref=Genbank:NP_215948.1,GeneID:886643;Name=NP_215948.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1432;product=dehydrogenase;protein_id=NP_215948.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1611434 1612249 . + . ID=gene-Rv1433;Dbxref=GeneID:886649;Name=Rv1433;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1433
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1611434 1612249 . + 0 ID=cds-NP_215949.1;Parent=gene-Rv1433;Dbxref=Genbank:NP_215949.1,GeneID:886649;Name=NP_215949.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1433;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215949.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1612256 1612393 . + . ID=gene-Rv1434;Dbxref=GeneID:886634;Name=Rv1434;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1434
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1612256 1612393 . + 0 ID=cds-NP_215950.1;Parent=gene-Rv1434;Dbxref=Genbank:NP_215950.1,GeneID:886634;Name=NP_215950.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1434;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215950.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1612342 1612950 . - . ID=gene-Rv1435c;Dbxref=GeneID:886653;Name=Rv1435c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1435c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1612342 1612950 . - 0 ID=cds-NP_215951.1;Parent=gene-Rv1435c;Dbxref=Genbank:NP_215951.1,GeneID:886653;Name=NP_215951.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1435c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215951.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1612600 1612620 . - . ID=id-Rv1435c-3;Dbxref=GeneID:886653;Note=21 bp imperfect direct repeat 3%2CGGCGCACCGGTACCAATCCCC;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1435c
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1612642 1612662 . - . ID=id-Rv1435c-5;Dbxref=GeneID:886653;Note=21 bp imperfect direct repeat 1%2CGGCGCACCGGTACCAATCCCT;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1435c
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1614329 1615567 . + 0 ID=cds-NP_215953.1;Parent=gene-Rv1437;Dbxref=Genbank:NP_215953.1,GeneID:886636;Name=NP_215953.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pgk;inference=protein motif:PROSITE:PS00111;locus_tag=Rv1437;product=phosphoglycerate kinase;protein_id=NP_215953.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1615564 1616349 . + 0 ID=cds-NP_215954.1;Parent=gene-Rv1438;Dbxref=Genbank:NP_215954.1,GeneID:886628;Name=NP_215954.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=tpi;inference=protein motif:PROSITE:PS00171;locus_tag=Rv1438;product=triosephosphate isomerase;protein_id=NP_215954.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1616961 1617386 . - . ID=gene-Rv1439c;Dbxref=GeneID:886630;Name=Rv1439c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1439c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1616961 1617386 . - 0 ID=cds-NP_215955.1;Parent=gene-Rv1439c;Dbxref=Genbank:NP_215955.1,GeneID:886630;Name=NP_215955.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1439c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215955.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1617837 1618070 . + . ID=gene-Rv1440;Dbxref=GeneID:886624;Name=secG;gbkey=Gene;gene=secG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1440
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1617837 1618070 . + 0 ID=cds-NP_215956.2;Parent=gene-Rv1440;Dbxref=Genbank:NP_215956.2,GeneID:886624;Name=NP_215956.2;gbkey=CDS;gene=secG;locus_tag=Rv1440;product=protein-export membrane protein SecG;protein_id=NP_215956.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1618209 1619684 . - . ID=gene-Rv1441c;Dbxref=GeneID:886626;Name=PE_PGRS26;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS26;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1441c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1618209 1619684 . - 0 ID=cds-YP_177811.1;Parent=gene-Rv1441c;Dbxref=Genbank:YP_177811.1,GeneID:886626;Name=YP_177811.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS26;locus_tag=Rv1441c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS26;protein_id=YP_177811.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1619791 1622091 . + . ID=gene-Rv1442;Dbxref=GeneID:886620;Name=bisC;gbkey=Gene;gene=bisC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1442
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1619791 1622091 . + 0 ID=cds-NP_215958.1;Parent=gene-Rv1442;Dbxref=Genbank:NP_215958.1,GeneID:886620;Name=NP_215958.1;Note=BDS reductase (BSO reductase);gbkey=CDS;gene=bisC;locus_tag=Rv1442;product=biotin sulfoxide reductase BisC;protein_id=NP_215958.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1622207 1622692 . - . ID=gene-Rv1443c;Dbxref=GeneID:886622;Name=Rv1443c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1443c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1622207 1622692 . - 0 ID=cds-NP_215959.1;Parent=gene-Rv1443c;Dbxref=Genbank:NP_215959.1,GeneID:886622;Name=NP_215959.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1443c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215959.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1623287 1623697 . - . ID=gene-Rv1444c;Dbxref=GeneID:886616;Name=Rv1444c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1444c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1623287 1623697 . - 0 ID=cds-NP_215960.1;Parent=gene-Rv1444c;Dbxref=Genbank:NP_215960.1,GeneID:886616;Name=NP_215960.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1444c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215960.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1623714 1624457 . - . ID=gene-Rv1445c;Dbxref=GeneID:886617;Name=devB;gbkey=Gene;gene=devB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1445c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1623714 1624457 . - 0 ID=cds-NP_215961.1;Parent=gene-Rv1445c;Dbxref=Genbank:NP_215961.1,GeneID:886617;Name=NP_215961.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=devB;locus_tag=Rv1445c;product=6-phosphogluconolactonase;protein_id=NP_215961.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1624454 1625365 . - . ID=gene-Rv1446c;Dbxref=GeneID:886612;Name=opcA;gbkey=Gene;gene=opcA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1446c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1624454 1625365 . - 0 ID=cds-NP_215962.1;Parent=gene-Rv1446c;Dbxref=Genbank:NP_215962.1,GeneID:886612;Name=NP_215962.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=opcA;locus_tag=Rv1446c;product=OXPP cycle protein OpcA;protein_id=NP_215962.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1625366 1625418 . - . ID=id-NC_000962.3:1625366..1625418;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1625418 1626962 . - . ID=gene-Rv1447c;Dbxref=GeneID:886614;Name=zwf2;gbkey=Gene;gene=zwf2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1447c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1625418 1626962 . - 0 ID=cds-NP_215963.1;Parent=gene-Rv1447c;Dbxref=Genbank:NP_215963.1,GeneID:886614;Name=NP_215963.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=zwf2;inference=protein motif:PROSITE:PS00069;locus_tag=Rv1447c;product=glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase;protein_id=NP_215963.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1626959 1628080 . - . ID=gene-Rv1448c;Dbxref=GeneID:886606;Name=tal;gbkey=Gene;gene=tal;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1448c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1626959 1628080 . - 0 ID=cds-NP_215964.1;Parent=gene-Rv1448c;Dbxref=Genbank:NP_215964.1,GeneID:886606;Name=NP_215964.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=tal;locus_tag=Rv1448c;product=transaldolase;protein_id=NP_215964.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1628097 1630199 . - . ID=gene-Rv1449c;Dbxref=GeneID:886638;Name=tkt;gbkey=Gene;gene=tkt;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1449c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1628097 1630199 . - 0 ID=cds-NP_215965.1;Parent=gene-Rv1449c;Dbxref=Genbank:NP_215965.1,GeneID:886638;Name=NP_215965.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=tkt;inference=protein motif:PROSITE:PS00801;locus_tag=Rv1449c;product=transketolase;protein_id=NP_215965.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1630638 1634627 . - . ID=gene-Rv1450c;Dbxref=GeneID:886605;Name=PE_PGRS27;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS27;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1450c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1630638 1634627 . - 0 ID=cds-YP_177812.1;Parent=gene-Rv1450c;Dbxref=Genbank:YP_177812.1,GeneID:886605;Name=YP_177812.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS27;locus_tag=Rv1450c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS27;protein_id=YP_177812.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1633531 1634790 . - . ID=id-NC_000962.3:1633531..1634790;Note=1260 bp imperfect direct repeat 2%2C first copy at 1637133..1638392;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1635029 1635955 . + . ID=gene-Rv1451;Dbxref=GeneID:886666;Name=Rv1451;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1451
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1635029 1635955 . + 0 ID=cds-NP_215967.1;Parent=gene-Rv1451;Dbxref=Genbank:NP_215967.1,GeneID:886666;Name=NP_215967.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1451;product=protoheme IX farnesyltransferase;protein_id=NP_215967.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1636004 1638229 . - . ID=gene-Rv1452c;Dbxref=GeneID:886595;Name=PE_PGRS28;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS28;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1452c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1636004 1638229 . - 0 ID=cds-YP_177813.1;Parent=gene-Rv1452c;Dbxref=Genbank:YP_177813.1,GeneID:886595;Name=YP_177813.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS28;locus_tag=Rv1452c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS28;protein_id=YP_177813.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1637133 1638392 . - . ID=id-NC_000962.3:1637133..1638392;Note=1260 bp imperfect direct repeat 1%2C second copy at 1633531..1634790;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1638381 1639646 . + . ID=gene-Rv1453;Dbxref=GeneID:886610;Name=Rv1453;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1453
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1638381 1639646 . + 0 ID=cds-NP_215969.2;Parent=gene-Rv1453;Dbxref=Genbank:NP_215969.2,GeneID:886610;Name=NP_215969.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1453;product=transcriptional activator protein;protein_id=NP_215969.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1639674 1640660 . - . ID=gene-Rv1454c;Dbxref=GeneID:886589;Name=qor;gbkey=Gene;gene=qor;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1454c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1639674 1640660 . - 0 ID=cds-NP_215970.1;Parent=gene-Rv1454c;Dbxref=Genbank:NP_215970.1,GeneID:886589;Name=NP_215970.1;Note=NADPH:quinone reductase (zeta-crystallin homolog protein);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=qor;inference=protein motif:PROSITE:PS01162;locus_tag=Rv1454c;product=quinone reductase;protein_id=NP_215970.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1640680 1641543 . + . ID=gene-Rv1455;Dbxref=GeneID:886597;Name=Rv1455;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1455
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1640680 1641543 . + 0 ID=cds-NP_215971.1;Parent=gene-Rv1455;Dbxref=Genbank:NP_215971.1,GeneID:886597;Name=NP_215971.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1455;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215971.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1641493 1642425 . - . ID=gene-Rv1456c;Dbxref=GeneID:886591;Name=Rv1456c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1456c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1641493 1642425 . - 0 ID=cds-NP_215972.1;Parent=gene-Rv1456c;Dbxref=Genbank:NP_215972.1,GeneID:886591;Name=NP_215972.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1456c;product=antibiotic ABC transporter permease;protein_id=NP_215972.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1642537 1643322 . - . ID=gene-Rv1457c;Dbxref=GeneID:886587;Name=Rv1457c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1457c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1642537 1643322 . - 0 ID=cds-NP_215973.1;Parent=gene-Rv1457c;Dbxref=Genbank:NP_215973.1,GeneID:886587;Name=NP_215973.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1457c;product=antibiotic ABC transporter permease;protein_id=NP_215973.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1643319 1644260 . - . ID=gene-Rv1458c;Dbxref=GeneID:886582;Name=Rv1458c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1458c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1643319 1644260 . - 0 ID=cds-NP_215974.1;Parent=gene-Rv1458c;Dbxref=Genbank:NP_215974.1,GeneID:886582;Name=NP_215974.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1458c;product=antibiotic ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_215974.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1644261 1644313 . - . ID=id-NC_000962.3:1644261..1644313;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1644314 1644364 . - . ID=id-NC_000962.3:1644314..1644364;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1644363 1646138 . - . ID=gene-Rv1459c;Dbxref=GeneID:886585;Name=Rv1459c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1459c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1644363 1646138 . - 0 ID=cds-NP_215975.1;Parent=gene-Rv1459c;Dbxref=Genbank:NP_215975.1,GeneID:886585;Name=NP_215975.1;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:18452585];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1459c;product=alpha-(1->6)-mannopyranosyltransferase;protein_id=NP_215975.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1646186 1646992 . + . ID=gene-Rv1460;Dbxref=GeneID:886573;Name=Rv1460;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1460
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1646186 1646992 . + 0 ID=cds-NP_215976.2;Parent=gene-Rv1460;Dbxref=Genbank:NP_215976.2,GeneID:886573;Name=NP_215976.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1460;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_215976.2;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1656963 1658936 . + . ID=gene-Rv1469;Dbxref=GeneID:886578;Name=ctpD;gbkey=Gene;gene=ctpD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1469
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1659370 1659741 . + . ID=gene-Rv1471;Dbxref=GeneID:886554;Name=trxB1;gbkey=Gene;gene=trxB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=trxB;locus_tag=Rv1471
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1659763 1660620 . + . ID=gene-Rv1472;Dbxref=GeneID:886547;Name=echA12;gbkey=Gene;gene=echA12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1472
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1660656 1662284 . + . ID=gene-Rv1473;Dbxref=GeneID:886549;Name=Rv1473;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1473
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1662381 1662572 . + . ID=gene-Rv1473A;Dbxref=GeneID:3205054;Name=Rv1473A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1473A
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1662641 1663204 . - . ID=gene-Rv1474c;Dbxref=GeneID:886543;Name=Rv1474c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1474c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1663215 1666046 . - . ID=gene-Rv1475c;Dbxref=GeneID:886545;Name=acn;gbkey=Gene;gene=acn;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1475c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1663215 1666046 . - 0 ID=cds-NP_215991.1;Parent=gene-Rv1475c;Dbxref=Genbank:NP_215991.1,GeneID:886545;Name=NP_215991.1;Note=Acn (citrate hydro-lyase) (aconitase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=acn;locus_tag=Rv1475c;product=iron-regulated aconitate hydratase;protein_id=NP_215991.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1666204 1666764 . + . ID=gene-Rv1476;Dbxref=GeneID:886539;Name=Rv1476;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1476
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1666204 1666764 . + 0 ID=cds-NP_215992.1;Parent=gene-Rv1476;Dbxref=Genbank:NP_215992.1,GeneID:886539;Name=NP_215992.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1476;product=membrane protein;protein_id=NP_215992.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1666990 1668408 . + . ID=gene-Rv1477;Dbxref=GeneID:886541;Name=ripA;gbkey=Gene;gene=ripA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1477
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1666990 1668408 . + 0 ID=cds-NP_215993.1;Parent=gene-Rv1477;Dbxref=Genbank:NP_215993.1,GeneID:886541;Name=NP_215993.1;Note=peptidoglycan hydrolase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:17919286];gbkey=CDS;gene=ripA;locus_tag=Rv1477;product=peptidoglycan endopeptidase RipA;protein_id=NP_215993.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1668419 1669144 . + . ID=gene-Rv1478;Dbxref=GeneID:886535;Name=Rv1478;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1478
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1668419 1669144 . + 0 ID=cds-NP_215994.1;Parent=gene-Rv1478;Dbxref=Genbank:NP_215994.1,GeneID:886535;Name=NP_215994.1;Note=invasion protein;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:21864539];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1478;product=peptidoglycan endopeptidase RipB;protein_id=NP_215994.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1669283 1670416 . + . ID=gene-Rv1479;Dbxref=GeneID:886537;Name=moxR1;gbkey=Gene;gene=moxR1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moxR;locus_tag=Rv1479
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1669283 1670416 . + 0 ID=cds-YP_177816.1;Parent=gene-Rv1479;Dbxref=Genbank:YP_177816.1,GeneID:886537;Name=YP_177816.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=moxR1;locus_tag=Rv1479;product=transcriptional regulator MoxR1;protein_id=YP_177816.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1670413 1671366 . + . ID=gene-Rv1480;Dbxref=GeneID:886531;Name=Rv1480;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1480
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1670413 1671366 . + 0 ID=cds-NP_215996.1;Parent=gene-Rv1480;Dbxref=Genbank:NP_215996.1,GeneID:886531;Name=NP_215996.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1480;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215996.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1671377 1672384 . + . ID=gene-Rv1481;Dbxref=GeneID:886533;Name=Rv1481;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1481
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1671377 1672384 . + 0 ID=cds-NP_215997.1;Parent=gene-Rv1481;Dbxref=Genbank:NP_215997.1,GeneID:886533;Name=NP_215997.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1481;product=membrane protein;protein_id=NP_215997.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1672457 1673299 . - . ID=gene-Rv1482c;Dbxref=GeneID:886526;Name=Rv1482c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1482c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1672457 1673299 . - 0 ID=cds-NP_215998.2;Parent=gene-Rv1482c;Dbxref=Genbank:NP_215998.2,GeneID:886526;Name=NP_215998.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1482c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_215998.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1673440 1674183 . + . ID=gene-Rv1483;Dbxref=GeneID:886551;Name=fabG1;gbkey=Gene;gene=fabG1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mabA;locus_tag=Rv1483
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1673440 1674183 . + 0 ID=cds-NP_215999.1;Parent=gene-Rv1483;Dbxref=Genbank:NP_215999.1,GeneID:886551;Name=NP_215999.1;Note=3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (mycolic acid biosynthesis a protein);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fabG1;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1483;product=3-oxoacyl-ACP reductase FabG;protein_id=NP_215999.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1674202 1675011 . + . ID=gene-Rv1484;Dbxref=GeneID:886523;Name=inhA;gbkey=Gene;gene=inhA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1484
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1674202 1675011 . + 0 ID=cds-NP_216000.1;Parent=gene-Rv1484;Dbxref=Genbank:NP_216000.1,GeneID:886523;Name=NP_216000.1;Note=NADH-dependent enoyl-ACP reductase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18552191];gbkey=CDS;gene=inhA;locus_tag=Rv1484;product=NADH-dependent enoyl-[ACP] reductase;protein_id=NP_216000.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1675017 1676051 . + . ID=gene-Rv1485;Dbxref=GeneID:886525;Name=hemZ;gbkey=Gene;gene=hemZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1485
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1675017 1676051 . + 0 ID=cds-NP_216001.1;Parent=gene-Rv1485;Dbxref=Genbank:NP_216001.1,GeneID:886525;Name=NP_216001.1;Note=protoheme ferro-lyase (heme synthetase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hemZ;locus_tag=Rv1485;product=ferrochelatase;protein_id=NP_216001.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1676017 1676883 . - . ID=gene-Rv1486c;Dbxref=GeneID:886519;Name=Rv1486c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1486c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1676017 1676883 . - 0 ID=cds-NP_216002.2;Parent=gene-Rv1486c;Dbxref=Genbank:NP_216002.2,GeneID:886519;Name=NP_216002.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1486c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216002.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1676941 1677375 . + . ID=gene-Rv1487;Dbxref=GeneID:886521;Name=Rv1487;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1487
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1676941 1677375 . + 0 ID=cds-NP_216003.1;Parent=gene-Rv1487;Dbxref=Genbank:NP_216003.1,GeneID:886521;Name=NP_216003.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1487;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216003.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1677397 1678542 . + . ID=gene-Rv1488;Dbxref=GeneID:886515;Name=Rv1488;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1488
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1677397 1678542 . + 0 ID=cds-NP_216004.1;Parent=gene-Rv1488;Dbxref=Genbank:NP_216004.1,GeneID:886515;Name=NP_216004.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1488;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216004.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1678552 1678908 . + . ID=gene-Rv1489;Dbxref=GeneID:3205064;Name=Rv1489;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1489
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1678552 1678908 . + 0 ID=cds-YP_177645.1;Parent=gene-Rv1489;Dbxref=Genbank:YP_177645.1,GeneID:3205064;Name=YP_177645.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1489;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177645.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1678942 1679172 . + . ID=gene-Rv1489A;Dbxref=GeneID:3205065;Name=Rv1489A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1489A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1678942 1679172 . + 0 ID=cds-YP_177646.1;Parent=gene-Rv1489A;Dbxref=Genbank:YP_177646.1,GeneID:3205065;Name=YP_177646.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1489A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177646.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1679322 1680629 . + . ID=gene-Rv1490;Dbxref=GeneID:886511;Name=Rv1490;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1490
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1679322 1680629 . + 0 ID=cds-NP_216006.1;Parent=gene-Rv1490;Dbxref=Genbank:NP_216006.1,GeneID:886511;Name=NP_216006.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1490;product=membrane protein;protein_id=NP_216006.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1681208 1681966 . - . ID=gene-Rv1491c;Dbxref=GeneID:886513;Name=Rv1491c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1491c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1681208 1681966 . - 0 ID=cds-NP_216007.1;Parent=gene-Rv1491c;Dbxref=Genbank:NP_216007.1,GeneID:886513;Name=NP_216007.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1491c;product=TVP38/TMEM64 family membrane protein;protein_id=NP_216007.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1682157 1684004 . + . ID=gene-Rv1492;Dbxref=GeneID:886507;Name=mutA;gbkey=Gene;gene=mutA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1492
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1682157 1684004 . + 0 ID=cds-NP_216008.1;Parent=gene-Rv1492;Dbxref=Genbank:NP_216008.1,GeneID:886507;Name=NP_216008.1;Note=Probable mutA%2CMethylmalonyl-CoA mutase small-subunit;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=mutA;inference=protein motif:PROSITE:PS00544;locus_tag=Rv1492;product=methylmalonyl-CoA mutase small subunit;protein_id=NP_216008.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1684005 1686257 . + . ID=gene-Rv1493;Dbxref=GeneID:886509;Name=mutB;gbkey=Gene;gene=mutB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1493
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1684005 1686257 . + 0 ID=cds-NP_216009.1;Parent=gene-Rv1493;Dbxref=Genbank:NP_216009.1,GeneID:886509;Name=NP_216009.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mutB;inference=protein motif:PROSITE:PS00544;locus_tag=Rv1493;product=methylmalonyl-CoA mutase large subunit;protein_id=NP_216009.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1686271 1686573 . + . ID=gene-Rv1494;Dbxref=GeneID:886502;Name=mazE4;gbkey=Gene;gene=mazE4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1494
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1686271 1686573 . + 0 ID=cds-NP_216010.1;Parent=gene-Rv1494;Dbxref=Genbank:NP_216010.1,GeneID:886502;Name=NP_216010.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1495;gbkey=CDS;gene=mazE4;locus_tag=Rv1494;product=antitoxin MazE4;protein_id=NP_216010.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1686570 1686887 . + . ID=gene-Rv1495;Dbxref=GeneID:886504;Name=mazF4;gbkey=Gene;gene=mazF4;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt7;locus_tag=Rv1495
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1686570 1686887 . + 0 ID=cds-NP_216011.1;Parent=gene-Rv1495;Dbxref=Genbank:NP_216011.1,GeneID:886504;Name=NP_216011.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1494;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:20724443];gbkey=CDS;gene=mazF4;locus_tag=Rv1495;product=mRNA interferase MazF4;protein_id=NP_216011.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1686884 1687888 . + . ID=gene-Rv1496;Dbxref=GeneID:886496;Name=Rv1496;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1496
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1686884 1687888 . + 0 ID=cds-NP_216012.1;Parent=gene-Rv1496;Dbxref=Genbank:NP_216012.1,GeneID:886496;Name=NP_216012.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1496;product=transport system kinase;protein_id=NP_216012.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1687941 1689230 . + . ID=gene-Rv1497;Dbxref=GeneID:886575;Name=lipL;gbkey=Gene;gene=lipL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1497
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1687941 1689230 . + 0 ID=cds-NP_216013.1;Parent=gene-Rv1497;Dbxref=Genbank:NP_216013.1,GeneID:886575;Name=NP_216013.1;gbkey=CDS;gene=lipL;locus_tag=Rv1497;product=esterase LipL;protein_id=NP_216013.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1689303 1689920 . - . ID=gene-Rv1498c;Dbxref=GeneID:886503;Name=Rv1498c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1498c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1689303 1689920 . - 0 ID=cds-NP_216014.1;Parent=gene-Rv1498c;Dbxref=Genbank:NP_216014.1,GeneID:886503;Name=NP_216014.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1498c;product=methyltransferase;protein_id=NP_216014.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1690134 1690346 . - . ID=gene-Rv1498A;Dbxref=GeneID:3205040;Name=Rv1498A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1498A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1690134 1690346 . - 0 ID=cds-YP_177647.1;Parent=gene-Rv1498A;Dbxref=Genbank:YP_177647.1,GeneID:3205040;Name=YP_177647.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1498A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177647.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1690407 1690805 . + . ID=gene-Rv1499;Dbxref=GeneID:886494;Name=Rv1499;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1499
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1690407 1690805 . + 0 ID=cds-NP_216015.2;Parent=gene-Rv1499;Dbxref=Genbank:NP_216015.2,GeneID:886494;Name=NP_216015.2;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1499;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216015.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1690850 1691878 . + . ID=gene-Rv1500;Dbxref=GeneID:886492;Name=Rv1500;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1500
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1690850 1691878 . + 0 ID=cds-NP_216016.1;Parent=gene-Rv1500;Dbxref=Genbank:NP_216016.1,GeneID:886492;Name=NP_216016.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18585090];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1500;product=glycosyltransferase;protein_id=NP_216016.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1691890 1692711 . + . ID=gene-Rv1501;Dbxref=GeneID:886499;Name=Rv1501;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1501
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1691890 1692711 . + 0 ID=cds-NP_216017.1;Parent=gene-Rv1501;Dbxref=Genbank:NP_216017.1,GeneID:886499;Name=NP_216017.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1501;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216017.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1692924 1693823 . + . ID=gene-Rv1502;Dbxref=GeneID:886486;Name=Rv1502;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1502
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1692924 1693823 . + 0 ID=cds-NP_216018.1;Parent=gene-Rv1502;Dbxref=Genbank:NP_216018.1,GeneID:886486;Name=NP_216018.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1502;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216018.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 1693996 1695144 . - . ID=gene-Rv1503c;Dbxref=GeneID:886488;Name=Rv1503c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv1503c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 1695281 1695946 . - . ID=gene-Rv1505c;Dbxref=GeneID:886483;Name=Rv1505c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1505c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1695281 1695946 . - 0 ID=cds-NP_216021.1;Parent=gene-Rv1505c;Dbxref=Genbank:NP_216021.1,GeneID:886483;Name=NP_216021.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1505c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216021.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1695943 1696443 . - . ID=gene-Rv1506c;Dbxref=GeneID:886479;Name=Rv1506c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1506c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1695943 1696443 . - 0 ID=cds-NP_216022.1;Parent=gene-Rv1506c;Dbxref=Genbank:NP_216022.1,GeneID:886479;Name=NP_216022.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1506c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216022.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1696727 1697422 . - . ID=gene-Rv1507c;Dbxref=GeneID:886477;Name=Rv1507c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1507c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1696727 1697422 . - 0 ID=cds-NP_216023.1;Parent=gene-Rv1507c;Dbxref=Genbank:NP_216023.1,GeneID:886477;Name=NP_216023.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1507c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216023.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1697356 1697859 . + . ID=gene-Rv1507A;Dbxref=GeneID:3205095;Name=Rv1507A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1507A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1697356 1697859 . + 0 ID=cds-YP_177648.1;Parent=gene-Rv1507A;Dbxref=Genbank:YP_177648.1,GeneID:3205095;Name=YP_177648.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1507A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177648.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1698095 1699894 . - . ID=gene-Rv1508c;Dbxref=GeneID:886078;Name=Rv1508c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1508c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1698095 1699894 . - 0 ID=cds-NP_216024.1;Parent=gene-Rv1508c;Dbxref=Genbank:NP_216024.1,GeneID:886078;Name=NP_216024.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1508c;product=membrane protein;protein_id=NP_216024.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1699866 1700228 . + . ID=gene-Rv1508A;Dbxref=GeneID:3205096;Name=Rv1508A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1508A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1699866 1700228 . + 0 ID=cds-YP_177649.1;Parent=gene-Rv1508A;Dbxref=Genbank:YP_177649.1,GeneID:3205096;Name=YP_177649.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1508A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177649.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1700212 1701093 . + . ID=gene-Rv1509;Dbxref=GeneID:886475;Name=Rv1509;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1509
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1700212 1701093 . + 0 ID=cds-NP_216025.1;Parent=gene-Rv1509;Dbxref=Genbank:NP_216025.1,GeneID:886475;Name=NP_216025.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1509;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216025.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1701295 1702593 . + . ID=gene-Rv1510;Dbxref=GeneID:886466;Name=Rv1510;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1510
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1701295 1702593 . + 0 ID=cds-NP_216026.1;Parent=gene-Rv1510;Dbxref=Genbank:NP_216026.1,GeneID:886466;Name=NP_216026.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1510;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216026.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1703074 1704096 . + . ID=gene-Rv1511;Dbxref=GeneID:886529;Name=gmdA;gbkey=Gene;gene=gmdA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1511
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1703074 1704096 . + 0 ID=cds-NP_216027.1;Parent=gene-Rv1511;Dbxref=Genbank:NP_216027.1,GeneID:886529;Name=NP_216027.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gmdA;locus_tag=Rv1511;product=GDP-D-mannose dehydratase GmdA;protein_id=NP_216027.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1704093 1705061 . + . ID=gene-Rv1512;Dbxref=GeneID:886461;Name=epiA;gbkey=Gene;gene=epiA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1512
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1704093 1705061 . + 0 ID=cds-NP_216028.1;Parent=gene-Rv1512;Dbxref=Genbank:NP_216028.1,GeneID:886461;Name=NP_216028.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=epiA;locus_tag=Rv1512;product=nucleotide-sugar epimerase EpiA;protein_id=NP_216028.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1705058 1705789 . + . ID=gene-Rv1513;Dbxref=GeneID:886464;Name=Rv1513;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1513
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1705058 1705789 . + 0 ID=cds-NP_216029.1;Parent=gene-Rv1513;Dbxref=Genbank:NP_216029.1,GeneID:886464;Name=NP_216029.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1513;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216029.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1705807 1706595 . - . ID=gene-Rv1514c;Dbxref=GeneID:886457;Name=Rv1514c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1514c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1705807 1706595 . - 0 ID=cds-NP_216030.1;Parent=gene-Rv1514c;Dbxref=Genbank:NP_216030.1,GeneID:886457;Name=NP_216030.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1514c;product=glycosyltransferase;protein_id=NP_216030.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1706630 1707526 . - . ID=gene-Rv1515c;Dbxref=GeneID:886459;Name=Rv1515c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1515c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1706630 1707526 . - 0 ID=cds-NP_216031.1;Parent=gene-Rv1515c;Dbxref=Genbank:NP_216031.1,GeneID:886459;Name=NP_216031.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1515c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216031.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1707529 1708539 . - . ID=gene-Rv1516c;Dbxref=GeneID:886455;Name=Rv1516c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1516c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1707529 1708539 . - 0 ID=cds-NP_216032.2;Parent=gene-Rv1516c;Dbxref=Genbank:NP_216032.2,GeneID:886455;Name=NP_216032.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1516c;product=sugar transferase;protein_id=NP_216032.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1708871 1709635 . + . ID=gene-Rv1517;Dbxref=GeneID:886467;Name=Rv1517;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1517
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1720780 1722060 . - . ID=gene-Rv1526c;Dbxref=GeneID:886434;Name=Rv1526c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1526c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1728953 1729450 . - . ID=gene-Rv1528c;Dbxref=GeneID:886028;Name=papA4;gbkey=Gene;gene=papA4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1528c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1729502 1731256 . + . ID=gene-Rv1529;Dbxref=GeneID:886432;Name=fadD24;gbkey=Gene;gene=fadD24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1529
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1732473 1733039 . + . ID=gene-Rv1531;Dbxref=GeneID:886437;Name=Rv1531;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1531
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1732473 1733039 . + 0 ID=cds-NP_216047.1;Parent=gene-Rv1531;Dbxref=Genbank:NP_216047.1,GeneID:886437;Name=NP_216047.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1531;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216047.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1733116 1733550 . - . ID=gene-Rv1532c;Dbxref=GeneID:886422;Name=Rv1532c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1532c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1733116 1733550 . - 0 ID=cds-NP_216048.1;Parent=gene-Rv1532c;Dbxref=Genbank:NP_216048.1,GeneID:886422;Name=NP_216048.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1532c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216048.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1733610 1734737 . + . ID=gene-Rv1533;Dbxref=GeneID:886424;Name=Rv1533;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1533
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1733610 1734737 . + 0 ID=cds-NP_216049.1;Parent=gene-Rv1533;Dbxref=Genbank:NP_216049.1,GeneID:886424;Name=NP_216049.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1533;product=monooxygenase;protein_id=NP_216049.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1734734 1735411 . + . ID=gene-Rv1534;Dbxref=GeneID:886420;Name=Rv1534;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1534
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1734734 1735411 . + 0 ID=cds-NP_216050.1;Parent=gene-Rv1534;Dbxref=Genbank:NP_216050.1,GeneID:886420;Name=NP_216050.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01081;locus_tag=Rv1534;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216050.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1735976 1736212 . + . ID=gene-Rv1535;Dbxref=GeneID:886429;Name=Rv1535;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1535
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1735976 1736212 . + 0 ID=cds-NP_216051.1;Parent=gene-Rv1535;Dbxref=Genbank:NP_216051.1,GeneID:886429;Name=NP_216051.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1535;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216051.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1736519 1739644 . + 0 ID=cds-NP_216052.1;Parent=gene-Rv1536;Dbxref=Genbank:NP_216052.1,GeneID:886412;Name=NP_216052.1;Note=Isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ileS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv1536;product=isoleucine--tRNA ligase;protein_id=NP_216052.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1739856 1741247 . + . ID=gene-Rv1537;Dbxref=GeneID:886414;Name=dinX;gbkey=Gene;gene=dinX;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dinB1;locus_tag=Rv1537
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1739856 1741247 . + 0 ID=cds-NP_216053.3;Parent=gene-Rv1537;Dbxref=Genbank:NP_216053.3,GeneID:886414;Name=NP_216053.3;Note=pol IV 1 (DNA nucleotidyltransferase (DNA-directed));experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=dinX;locus_tag=Rv1537;product=DNA polymerase IV;protein_id=NP_216053.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1741212 1742192 . - . ID=gene-Rv1538c;Dbxref=GeneID:886410;Name=ansA;gbkey=Gene;gene=ansA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1538c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1741212 1742192 . - 0 ID=cds-NP_216054.1;Parent=gene-Rv1538c;Dbxref=Genbank:NP_216054.1,GeneID:886410;Name=NP_216054.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ansA;inference=protein motif:PROSITE:PS00917;locus_tag=Rv1538c;product=L-aparaginase;protein_id=NP_216054.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1742244 1742852 . + . ID=gene-Rv1539;Dbxref=GeneID:886408;Name=lspA;gbkey=Gene;gene=lspA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1539
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1742244 1742852 . + 0 ID=cds-NP_216055.1;Parent=gene-Rv1539;Dbxref=Genbank:NP_216055.1,GeneID:886408;Name=NP_216055.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=lspA;locus_tag=Rv1539;product=lipoprotein signal peptidase;protein_id=NP_216055.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1742845 1743771 . + . ID=gene-Rv1540;Dbxref=GeneID:886404;Name=Rv1540;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1540
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1742845 1743771 . + 0 ID=cds-NP_216056.1;Parent=gene-Rv1540;Dbxref=Genbank:NP_216056.1,GeneID:886404;Name=NP_216056.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01129;locus_tag=Rv1540;product=RNA pseudouridine synthase;protein_id=NP_216056.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1743778 1744371 . - . ID=gene-Rv1541c;Dbxref=GeneID:886406;Name=lprI;gbkey=Gene;gene=lprI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1541c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1743778 1744371 . - 0 ID=cds-NP_216057.1;Parent=gene-Rv1541c;Dbxref=Genbank:NP_216057.1,GeneID:886406;Name=NP_216057.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=lprI;locus_tag=Rv1541c;product=lipoprotein LprI;protein_id=NP_216057.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1744426 1744836 . - . ID=gene-Rv1542c;Dbxref=GeneID:886402;Name=glbN;gbkey=Gene;gene=glbN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1542c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1744426 1744836 . - 0 ID=cds-NP_216058.1;Parent=gene-Rv1542c;Dbxref=Genbank:NP_216058.1,GeneID:886402;Name=NP_216058.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:10636862];gbkey=CDS;gene=glbN;locus_tag=Rv1542c;product=hemoglobin GlbN;protein_id=NP_216058.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1745064 1746089 . + . ID=gene-Rv1543;Dbxref=GeneID:886400;Name=Rv1543;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1543
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1745064 1746089 . + 0 ID=cds-NP_216059.1;Parent=gene-Rv1543;Dbxref=Genbank:NP_216059.1,GeneID:886400;Name=NP_216059.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1543;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216059.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1746094 1746897 . + . ID=gene-Rv1544;Dbxref=GeneID:886417;Name=Rv1544;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1544
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1746094 1746897 . + 0 ID=cds-NP_216060.1;Parent=gene-Rv1544;Dbxref=Genbank:NP_216060.1,GeneID:886417;Name=NP_216060.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1544;product=ketoacyl reductase;protein_id=NP_216060.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1746919 1747146 . + . ID=gene-Rv1545;Dbxref=GeneID:886398;Name=Rv1545;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1545
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1746919 1747146 . + 0 ID=cds-NP_216061.1;Parent=gene-Rv1545;Dbxref=Genbank:NP_216061.1,GeneID:886398;Name=NP_216061.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1545;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216061.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1747195 1747626 . + . ID=gene-Rv1546;Dbxref=GeneID:886394;Name=Rv1546;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1546
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1747195 1747626 . + 0 ID=cds-NP_216062.1;Parent=gene-Rv1546;Dbxref=Genbank:NP_216062.1,GeneID:886394;Name=NP_216062.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1546;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216062.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1747694 1751248 . + . ID=gene-Rv1547;Dbxref=GeneID:886392;Name=dnaE1;gbkey=Gene;gene=dnaE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1547
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1747694 1751248 . + 0 ID=cds-NP_216063.1;Parent=gene-Rv1547;Dbxref=Genbank:NP_216063.1,GeneID:886392;Name=NP_216063.1;Note=DnaE1 (DNA nucleotidyltransferase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=dnaE1;locus_tag=Rv1547;product=DNA polymerase III subunit alpha;protein_id=NP_216063.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1751297 1753333 . - . ID=gene-Rv1548c;Dbxref=GeneID:886384;Name=PPE21;gbkey=Gene;gene=PPE21;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1548c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1751297 1753333 . - 0 ID=cds-YP_177817.1;Parent=gene-Rv1548c;Dbxref=Genbank:YP_177817.1,GeneID:886384;Name=YP_177817.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE21;locus_tag=Rv1548c;product=PPE family protein PPE21;protein_id=YP_177817.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1753716 1755431 . + . ID=gene-Rv1550;Dbxref=GeneID:886380;Name=fadD11;gbkey=Gene;gene=fadD11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1550
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1753716 1755431 . + 0 ID=cds-NP_216066.1;Parent=gene-Rv1550;Dbxref=Genbank:NP_216066.1,GeneID:886380;Name=NP_216066.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fadD11;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv1550;product=fatty-acid--CoA ligase FadD11;protein_id=NP_216066.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1755445 1757310 . + . ID=gene-Rv1551;Dbxref=GeneID:886382;Name=plsB1;gbkey=Gene;gene=plsB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1551
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1755445 1757310 . + 0 ID=cds-NP_216067.1;Parent=gene-Rv1551;Dbxref=Genbank:NP_216067.1,GeneID:886382;Name=NP_216067.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=plsB1;locus_tag=Rv1551;product=acyltransferase PlsB;protein_id=NP_216067.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1757681 1759432 . + . ID=gene-Rv1552;Dbxref=GeneID:886376;Name=frdA;gbkey=Gene;gene=frdA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1552
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1757681 1759432 . + 0 ID=cds-NP_216068.1;Parent=gene-Rv1552;Dbxref=Genbank:NP_216068.1,GeneID:886376;Name=NP_216068.1;Note=fumarate dehydrogenase (fumaric hydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=frdA;inference=protein motif:PROSITE:PS00504;locus_tag=Rv1552;product=fumarate reductase flavoprotein subunit;protein_id=NP_216068.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1759435 1760178 . + . ID=gene-Rv1553;Dbxref=GeneID:886378;Name=frdB;gbkey=Gene;gene=frdB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1553
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1759435 1760178 . + 0 ID=cds-NP_216069.1;Parent=gene-Rv1553;Dbxref=Genbank:NP_216069.1,GeneID:886378;Name=NP_216069.1;Note=fumarate dehydrogenase (fumaric hydrogenase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=frdB;inference=protein motif:PROSITE:PS00198;locus_tag=Rv1553;product=fumarate reductase iron-sulfur subunit;protein_id=NP_216069.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1760175 1760555 . + . ID=gene-Rv1554;Dbxref=GeneID:886371;Name=frdC;gbkey=Gene;gene=frdC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1554
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1760175 1760555 . + 0 ID=cds-NP_216070.1;Parent=gene-Rv1554;Dbxref=Genbank:NP_216070.1,GeneID:886371;Name=NP_216070.1;Note=fumarate dehydrogenase (fumaric hydrogenase);gbkey=CDS;gene=frdC;locus_tag=Rv1554;product=fumarate reductase membrane anchor subunit;protein_id=NP_216070.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1760552 1760929 . + . ID=gene-Rv1555;Dbxref=GeneID:886389;Name=frdD;gbkey=Gene;gene=frdD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1555
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1760552 1760929 . + 0 ID=cds-NP_216071.1;Parent=gene-Rv1555;Dbxref=Genbank:NP_216071.1,GeneID:886389;Name=NP_216071.1;Note=fumarate dehydrogenase (fumaric hydrogenase);gbkey=CDS;gene=frdD;locus_tag=Rv1555;product=fumarate reductase membrane anchor subunit;protein_id=NP_216071.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1760997 1761605 . + . ID=gene-Rv1556;Dbxref=GeneID:886367;Name=Rv1556;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1556
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1760997 1761605 . + 0 ID=cds-NP_216072.1;Parent=gene-Rv1556;Dbxref=Genbank:NP_216072.1,GeneID:886367;Name=NP_216072.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1556;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_216072.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1761744 1762937 . + . ID=gene-Rv1557;Dbxref=GeneID:886033;Name=mmpL6;gbkey=Gene;gene=mmpL6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1557
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1761744 1762937 . + 0 ID=cds-NP_216073.1;Parent=gene-Rv1557;Dbxref=Genbank:NP_216073.1,GeneID:886033;Name=NP_216073.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mmpL6;locus_tag=Rv1557;product=transmembrane transport protein MmpL6;protein_id=NP_216073.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1762947 1763393 . + . ID=gene-Rv1558;Dbxref=GeneID:886363;Name=Rv1558;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1558
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1762947 1763393 . + 0 ID=cds-NP_216074.1;Parent=gene-Rv1558;Dbxref=Genbank:NP_216074.1,GeneID:886363;Name=NP_216074.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1558;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216074.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1763428 1764717 . + . ID=gene-Rv1559;Dbxref=GeneID:886365;Name=ilvA;gbkey=Gene;gene=ilvA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1559
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1763428 1764717 . + 0 ID=cds-NP_216075.1;Parent=gene-Rv1559;Dbxref=Genbank:NP_216075.1,GeneID:886365;Name=NP_216075.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ilvA;inference=protein motif:PROSITE:PS00165;locus_tag=Rv1559;product=threonine dehydratase IlvA;protein_id=NP_216075.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1764755 1764973 . + . ID=gene-Rv1560;Dbxref=GeneID:886359;Name=vapB11;gbkey=Gene;gene=vapB11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1560
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1764755 1764973 . + 0 ID=cds-NP_216076.1;Parent=gene-Rv1560;Dbxref=Genbank:NP_216076.1,GeneID:886359;Name=NP_216076.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1561;gbkey=CDS;gene=vapB11;locus_tag=Rv1560;product=antitoxin VapB11;protein_id=NP_216076.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1764979 1765383 . + . ID=gene-Rv1561;Dbxref=GeneID:886361;Name=vapC11;gbkey=Gene;gene=vapC11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1561
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1764979 1765383 . + 0 ID=cds-NP_216077.1;Parent=gene-Rv1561;Dbxref=Genbank:NP_216077.1,GeneID:886361;Name=NP_216077.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1560%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC11;locus_tag=Rv1561;product=ribonuclease VapC11;protein_id=NP_216077.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1765400 1767142 . - . ID=gene-Rv1562c;Dbxref=GeneID:886355;Name=treZ;gbkey=Gene;gene=treZ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=glgZ;locus_tag=Rv1562c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1765400 1767142 . - 0 ID=cds-YP_177819.1;Parent=gene-Rv1562c;Dbxref=Genbank:YP_177819.1,GeneID:886355;Name=YP_177819.1;Note=previously called glgZ;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:10658666];gbkey=CDS;gene=treZ;locus_tag=Rv1562c;product=malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase;protein_id=YP_177819.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1767135 1769432 . - . ID=gene-Rv1563c;Dbxref=GeneID:886357;Name=treY;gbkey=Gene;gene=treY;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=glgY;locus_tag=Rv1563c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1767135 1769432 . - 0 ID=cds-YP_177820.1;Parent=gene-Rv1563c;Dbxref=Genbank:YP_177820.1,GeneID:886357;Name=YP_177820.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=treY;locus_tag=Rv1563c;product=maltooligosyl trehalose synthase;protein_id=YP_177820.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1769436 1771601 . - . ID=gene-Rv1564c;Dbxref=GeneID:886353;Name=treX;gbkey=Gene;gene=treX;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=glgX;locus_tag=Rv1564c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1769436 1771601 . - 0 ID=cds-YP_177821.1;Parent=gene-Rv1564c;Dbxref=Genbank:YP_177821.1,GeneID:886353;Name=YP_177821.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=treX;locus_tag=Rv1564c;product=maltooligosyl trehalose synthase;protein_id=YP_177821.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1771640 1773829 . - . ID=gene-Rv1565c;Dbxref=GeneID:886351;Name=Rv1565c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1565c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1771640 1773829 . - 0 ID=cds-NP_216081.1;Parent=gene-Rv1565c;Dbxref=Genbank:NP_216081.1,GeneID:886351;Name=NP_216081.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1565c;product=acyltransferase;protein_id=NP_216081.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1773928 1774620 . - . ID=gene-Rv1566c;Dbxref=GeneID:886347;Name=Rv1566c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1566c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1773928 1774620 . - 0 ID=cds-NP_216082.1;Parent=gene-Rv1566c;Dbxref=Genbank:NP_216082.1,GeneID:886347;Name=NP_216082.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1566c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216082.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1774860 1775144 . - . ID=gene-Rv1567c;Dbxref=GeneID:886349;Name=Rv1567c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1567c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1774860 1775144 . - 0 ID=cds-NP_216083.1;Parent=gene-Rv1567c;Dbxref=Genbank:NP_216083.1,GeneID:886349;Name=NP_216083.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1567c;product=membrane protein;protein_id=NP_216083.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1775392 1776705 . + . ID=gene-Rv1568;Dbxref=GeneID:886343;Name=bioA;gbkey=Gene;gene=bioA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1568
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1775392 1776705 . + 0 ID=cds-NP_216084.1;Parent=gene-Rv1568;Dbxref=Genbank:NP_216084.1,GeneID:886343;Name=NP_216084.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=bioA;inference=protein motif:PROSITE:PS00600;locus_tag=Rv1568;product=adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase BioA;protein_id=NP_216084.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1776702 1777862 . + . ID=gene-Rv1569;Dbxref=GeneID:886345;Name=bioF1;gbkey=Gene;gene=bioF1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1569
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1776702 1777862 . + 0 ID=cds-YP_177822.1;Parent=gene-Rv1569;Dbxref=Genbank:YP_177822.1,GeneID:886345;Name=YP_177822.1;Note=AONS (8-amino-7-ketopelargonate synthase) (7-keto-8-amino-pelargonic acid synthetase) (7-KAP synthetase) (L-alanine--pimelyl CoA ligase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=bioF1;inference=protein motif:PROSITE:PS00599;locus_tag=Rv1569;product=8-amino-7-oxononanoate synthase;protein_id=YP_177822.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1777859 1778539 . + . ID=gene-Rv1570;Dbxref=GeneID:886338;Name=bioD;gbkey=Gene;gene=bioD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1570
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1777859 1778539 . + 0 ID=cds-NP_216086.1;Parent=gene-Rv1570;Dbxref=Genbank:NP_216086.1,GeneID:886338;Name=NP_216086.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=bioD;locus_tag=Rv1570;product=ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioD;protein_id=NP_216086.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1778539 1779048 . + . ID=gene-Rv1571;Dbxref=GeneID:886341;Name=Rv1571;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1571
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1778539 1779048 . + 0 ID=cds-NP_216087.1;Parent=gene-Rv1571;Dbxref=Genbank:NP_216087.1,GeneID:886341;Name=NP_216087.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1571;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216087.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1779266 1779277 . - . ID=id-NC_000962.3:1779266..1779277;Note=12 bp direct repeat 1%2C ccacggccaacc%2C flanking phage-like element%2C second site at 1788514..1788525. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1779314 1779724 . + . ID=gene-Rv1573;Dbxref=GeneID:886337;Name=Rv1573;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1573
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1779314 1779724 . + 0 ID=cds-NP_216089.1;Parent=gene-Rv1573;Dbxref=Genbank:NP_216089.1,GeneID:886337;Name=NP_216089.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1573;product=phage protein;protein_id=NP_216089.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1779930 1780241 . + . ID=gene-Rv1574;Dbxref=GeneID:886331;Name=Rv1574;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1574
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1779930 1780241 . + 0 ID=cds-NP_216090.1;Parent=gene-Rv1574;Dbxref=Genbank:NP_216090.1,GeneID:886331;Name=NP_216090.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1574;product=phage protein;protein_id=NP_216090.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1779959 1780047 . - . ID=id-NC_000962.3:1779959..1780047;Note=89 bp direct repeat 2%2C first copy at 1780485..1780573%2CGGGTTGCGTTGTCGATTCGTTTGAGCCGCCGGTAGGTGCCGGCGGAGATGCCGAGGGCTG CGCCGATAGCAGTGTCTGTTTTCGTCGAA. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1780199 1780699 . + . ID=gene-Rv1575;Dbxref=GeneID:886335;Name=Rv1575;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1575
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1780199 1780699 . + 0 ID=cds-NP_216091.2;Parent=gene-Rv1575;Dbxref=Genbank:NP_216091.2,GeneID:886335;Name=NP_216091.2;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1575;product=phage protein;protein_id=NP_216091.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1780485 1780573 . - . ID=id-NC_000962.3:1780485..1780573;Note=89 bp direct repeat 1%2C second copy at 1779959..1780047%2CGGGTTGCGTTGTCGATTCGTTTGAGCCGCCGGTAGGTGCCGGCGGAGATGCCGAGGGCTG CGCCGATAGCAGTGTCTGTTTTCGTCGAA. Many repeats%2C both direct and inverted%2C in this region. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1780643 1782064 . - . ID=gene-Rv1576c;Dbxref=GeneID:886327;Name=Rv1576c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1576c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1780643 1782064 . - 0 ID=cds-NP_216092.1;Parent=gene-Rv1576c;Dbxref=Genbank:NP_216092.1,GeneID:886327;Name=NP_216092.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1576c;product=phage capsid protein;protein_id=NP_216092.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1782072 1782584 . - . ID=gene-Rv1577c;Dbxref=GeneID:886329;Name=Rv1577c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1577c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1782072 1782584 . - 0 ID=cds-NP_216093.1;Parent=gene-Rv1577c;Dbxref=Genbank:NP_216093.1,GeneID:886329;Name=NP_216093.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1577c;product=phage prohead protease;protein_id=NP_216093.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1782758 1783228 . - . ID=gene-Rv1578c;Dbxref=GeneID:886322;Name=Rv1578c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1578c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1782758 1783228 . - 0 ID=cds-NP_216094.1;Parent=gene-Rv1578c;Dbxref=Genbank:NP_216094.1,GeneID:886322;Name=NP_216094.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00221;locus_tag=Rv1578c;product=phage protein;protein_id=NP_216094.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1783309 1783623 . - . ID=gene-Rv1579c;Dbxref=GeneID:886369;Name=Rv1579c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1579c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1783309 1783623 . - 0 ID=cds-NP_216095.1;Parent=gene-Rv1579c;Dbxref=Genbank:NP_216095.1,GeneID:886369;Name=NP_216095.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1579c;product=phage protein;protein_id=NP_216095.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1783620 1783892 . - . ID=gene-Rv1580c;Dbxref=GeneID:886313;Name=Rv1580c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1580c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1783620 1783892 . - 0 ID=cds-NP_216096.1;Parent=gene-Rv1580c;Dbxref=Genbank:NP_216096.1,GeneID:886313;Name=NP_216096.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1580c;product=phage protein;protein_id=NP_216096.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1783906 1784301 . - . ID=gene-Rv1581c;Dbxref=GeneID:886318;Name=Rv1581c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1581c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1783906 1784301 . - 0 ID=cds-NP_216097.1;Parent=gene-Rv1581c;Dbxref=Genbank:NP_216097.1,GeneID:886318;Name=NP_216097.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1581c;product=phage protein;protein_id=NP_216097.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1784497 1785912 . - . ID=gene-Rv1582c;Dbxref=GeneID:886311;Name=Rv1582c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1582c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1784497 1785912 . - 0 ID=cds-NP_216098.1;Parent=gene-Rv1582c;Dbxref=Genbank:NP_216098.1,GeneID:886311;Name=NP_216098.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1582c;product=phage protein;protein_id=NP_216098.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1785912 1786310 . - . ID=gene-Rv1583c;Dbxref=GeneID:886315;Name=Rv1583c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1583c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1785912 1786310 . - 0 ID=cds-NP_216099.1;Parent=gene-Rv1583c;Dbxref=Genbank:NP_216099.1,GeneID:886315;Name=NP_216099.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1583c;product=phage protein;protein_id=NP_216099.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1786307 1786528 . - . ID=gene-Rv1584c;Dbxref=GeneID:886307;Name=Rv1584c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1584c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1786307 1786528 . - 0 ID=cds-NP_216100.1;Parent=gene-Rv1584c;Dbxref=Genbank:NP_216100.1,GeneID:886307;Name=NP_216100.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1584c;product=phage protein;protein_id=NP_216100.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1786584 1787099 . - . ID=gene-Rv1585c;Dbxref=GeneID:886309;Name=Rv1585c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1585c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1786584 1787099 . - 0 ID=cds-NP_216101.1;Parent=gene-Rv1585c;Dbxref=Genbank:NP_216101.1,GeneID:886309;Name=NP_216101.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1585c;product=phage protein;protein_id=NP_216101.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1787096 1788505 . - . ID=gene-Rv1586c;Dbxref=GeneID:886305;Name=Rv1586c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1586c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1787096 1788505 . - 0 ID=cds-NP_216102.1;Parent=gene-Rv1586c;Dbxref=Genbank:NP_216102.1,GeneID:886305;Name=NP_216102.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1586c;product=phage integrase;protein_id=NP_216102.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1788162 1789163 . - . ID=gene-Rv1587c;Dbxref=GeneID:886303;Name=Rv1587c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1587c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1788162 1789163 . - 0 ID=cds-NP_216103.2;Parent=gene-Rv1587c;Dbxref=Genbank:NP_216103.2,GeneID:886303;Name=NP_216103.2;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1587c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216103.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1788514 1788525 . - . ID=id-Rv1587c;Dbxref=GeneID:886303;Note=12 bp direct repeat 2%2C ccacggccaacc%2C flanking phage-like element%2C first site at 1779266..1779277. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1587c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1788514 1789811 . - . ID=id-NC_000962.3:1788514..1789811;Note=REP-5%2C len: 1298 nt. REP336%2C member of REP13E12 family. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1789168 1789836 . - . ID=gene-Rv1588c;Dbxref=GeneID:886325;Name=Rv1588c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1588c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1789168 1789836 . - 0 ID=cds-NP_216104.1;Parent=gene-Rv1588c;Dbxref=Genbank:NP_216104.1,GeneID:886325;Name=NP_216104.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1588c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216104.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1790284 1791333 . + . ID=gene-Rv1589;Dbxref=GeneID:886301;Name=bioB;gbkey=Gene;gene=bioB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1589
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1790284 1791333 . + 0 ID=cds-NP_216105.1;Parent=gene-Rv1589;Dbxref=Genbank:NP_216105.1,GeneID:886301;Name=NP_216105.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=bioB;locus_tag=Rv1589;product=biotin synthetase;protein_id=NP_216105.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1791334 1791573 . + . ID=gene-Rv1590;Dbxref=GeneID:886292;Name=Rv1590;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1590
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1791334 1791573 . + 0 ID=cds-NP_216106.1;Parent=gene-Rv1590;Dbxref=Genbank:NP_216106.1,GeneID:886292;Name=NP_216106.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1590;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216106.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1791570 1792235 . + . ID=gene-Rv1591;Dbxref=GeneID:886295;Name=Rv1591;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1591
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1791570 1792235 . + 0 ID=cds-NP_216107.1;Parent=gene-Rv1591;Dbxref=Genbank:NP_216107.1,GeneID:886295;Name=NP_216107.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1591;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216107.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1792400 1793740 . - . ID=gene-Rv1592c;Dbxref=GeneID:886287;Name=Rv1592c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1592c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1792400 1793740 . - 0 ID=cds-NP_216108.1;Parent=gene-Rv1592c;Dbxref=Genbank:NP_216108.1,GeneID:886287;Name=NP_216108.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1592c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216108.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1793997 1794707 . - . ID=gene-Rv1593c;Dbxref=GeneID:886289;Name=Rv1593c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1593c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1793997 1794707 . - 0 ID=cds-NP_216109.1;Parent=gene-Rv1593c;Dbxref=Genbank:NP_216109.1,GeneID:886289;Name=NP_216109.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1593c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216109.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1794756 1795805 . + . ID=gene-Rv1594;Dbxref=GeneID:886283;Name=nadA;gbkey=Gene;gene=nadA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1594
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1794756 1795805 . + 0 ID=cds-NP_216110.1;Parent=gene-Rv1594;Dbxref=Genbank:NP_216110.1,GeneID:886283;Name=NP_216110.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nadA;locus_tag=Rv1594;product=quinolinate synthetase A;protein_id=NP_216110.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1795805 1797388 . + . ID=gene-Rv1595;Dbxref=GeneID:886285;Name=nadB;gbkey=Gene;gene=nadB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1595
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1795805 1797388 . + 0 ID=cds-NP_216111.1;Parent=gene-Rv1595;Dbxref=Genbank:NP_216111.1,GeneID:886285;Name=NP_216111.1;gbkey=CDS;gene=nadB;locus_tag=Rv1595;product=L-aspartate oxidase;protein_id=NP_216111.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1797388 1798245 . + . ID=gene-Rv1596;Dbxref=GeneID:886281;Name=nadC;gbkey=Gene;gene=nadC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1596
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1797388 1798245 . + 0 ID=cds-NP_216112.1;Parent=gene-Rv1596;Dbxref=Genbank:NP_216112.1,GeneID:886281;Name=NP_216112.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nadC;locus_tag=Rv1596;product=nicotinate-nucleotide pyrophosphatase;protein_id=NP_216112.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1798294 1799052 . + . ID=gene-Rv1597;Dbxref=GeneID:886297;Name=Rv1597;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1597
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1798294 1799052 . + 0 ID=cds-NP_216113.1;Parent=gene-Rv1597;Dbxref=Genbank:NP_216113.1,GeneID:886297;Name=NP_216113.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1597;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216113.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1799073 1799483 . - . ID=gene-Rv1598c;Dbxref=GeneID:886324;Name=Rv1598c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1598c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1799073 1799483 . - 0 ID=cds-NP_216114.1;Parent=gene-Rv1598c;Dbxref=Genbank:NP_216114.1,GeneID:886324;Name=NP_216114.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1598c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216114.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1799583 1800899 . + . ID=gene-Rv1599;Dbxref=GeneID:886277;Name=hisD;gbkey=Gene;gene=hisD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1599
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1799583 1800899 . + 0 ID=cds-NP_216115.1;Parent=gene-Rv1599;Dbxref=Genbank:NP_216115.1,GeneID:886277;Name=NP_216115.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hisD;inference=protein motif:PROSITE:PS00611;locus_tag=Rv1599;product=histidinol dehydrogenase;protein_id=NP_216115.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1800896 1802038 . + . ID=gene-Rv1600;Dbxref=GeneID:886298;Name=hisC1;gbkey=Gene;gene=hisC1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=hisC;locus_tag=Rv1600
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1800896 1802038 . + 0 ID=cds-YP_177823.1;Parent=gene-Rv1600;Dbxref=Genbank:YP_177823.1,GeneID:886298;Name=YP_177823.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hisC1;inference=protein motif:PROSITE:PS00599;locus_tag=Rv1600;product=histidinol-phosphate aminotransferase;protein_id=YP_177823.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1802035 1802667 . + . ID=gene-Rv1601;Dbxref=GeneID:886274;Name=hisB;gbkey=Gene;gene=hisB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1601
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1802035 1802667 . + 0 ID=cds-NP_216117.1;Parent=gene-Rv1601;Dbxref=Genbank:NP_216117.1,GeneID:886274;Name=NP_216117.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hisB;locus_tag=Rv1601;product=imidazole glycerol-phosphate dehydratase;protein_id=NP_216117.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1802664 1803284 . + . ID=gene-Rv1602;Dbxref=GeneID:885529;Name=hisH;gbkey=Gene;gene=hisH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1602
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1802664 1803284 . + 0 ID=cds-NP_216118.1;Parent=gene-Rv1602;Dbxref=Genbank:NP_216118.1,GeneID:885529;Name=NP_216118.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hisH;inference=protein motif:PROSITE:PS00442;locus_tag=Rv1602;product=imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH;protein_id=NP_216118.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1809443 1810150 . + . ID=gene-Rv1610;Dbxref=GeneID:885293;Name=Rv1610;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1610
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1810240 1811058 . + . ID=gene-Rv1611;Dbxref=GeneID:885294;Name=trpC;gbkey=Gene;gene=trpC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1611
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1811127 1812359 . + . ID=gene-Rv1612;Dbxref=GeneID:885297;Name=trpB;gbkey=Gene;gene=trpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1612
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1812359 1813171 . + . ID=gene-Rv1613;Dbxref=GeneID:885291;Name=trpA;gbkey=Gene;gene=trpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1613
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1813171 1814577 . + . ID=gene-Rv1614;Dbxref=GeneID:885292;Name=lgt;gbkey=Gene;gene=lgt;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1614
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1813171 1814577 . + 0 ID=cds-NP_216130.1;Parent=gene-Rv1614;Dbxref=Genbank:NP_216130.1,GeneID:885292;Name=NP_216130.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lgt;locus_tag=Rv1614;product=prolipoprotein diacylglyceryl transferase;protein_id=NP_216130.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1815253 1815693 . + . ID=gene-Rv1615;Dbxref=GeneID:885499;Name=Rv1615;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1615
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1815253 1815693 . + 0 ID=cds-NP_216131.1;Parent=gene-Rv1615;Dbxref=Genbank:NP_216131.1,GeneID:885499;Name=NP_216131.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1615;product=membrane protein;protein_id=NP_216131.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1815683 1816081 . + . ID=gene-Rv1616;Dbxref=GeneID:885498;Name=Rv1616;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1616
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1815683 1816081 . + 0 ID=cds-NP_216132.1;Parent=gene-Rv1616;Dbxref=Genbank:NP_216132.1,GeneID:885498;Name=NP_216132.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00202;locus_tag=Rv1616;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216132.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1816189 1817607 . + . ID=gene-Rv1617;Dbxref=GeneID:885501;Name=pykA;gbkey=Gene;gene=pykA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1617
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1816189 1817607 . + 0 ID=cds-NP_216133.1;Parent=gene-Rv1617;Dbxref=Genbank:NP_216133.1,GeneID:885501;Name=NP_216133.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20520732];gbkey=CDS;gene=pykA;locus_tag=Rv1617;product=pyruvate kinase;protein_id=NP_216133.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1817615 1818517 . + . ID=gene-Rv1618;Dbxref=GeneID:885500;Name=tesB1;gbkey=Gene;gene=tesB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1618
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1817615 1818517 . + 0 ID=cds-NP_216134.1;Parent=gene-Rv1618;Dbxref=Genbank:NP_216134.1,GeneID:885500;Name=NP_216134.1;gbkey=CDS;gene=tesB1;locus_tag=Rv1618;product=acyl-CoA thioesterase II;protein_id=NP_216134.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1818575 1820029 . + . ID=gene-Rv1619;Dbxref=GeneID:885509;Name=Rv1619;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1619
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1818575 1820029 . + 0 ID=cds-NP_216135.1;Parent=gene-Rv1619;Dbxref=Genbank:NP_216135.1,GeneID:885509;Name=NP_216135.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1619;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216135.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1819963 1821693 . - . ID=gene-Rv1620c;Dbxref=GeneID:885503;Name=cydC;gbkey=Gene;gene=cydC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1620c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1819963 1821693 . - 0 ID=cds-NP_216136.1;Parent=gene-Rv1620c;Dbxref=Genbank:NP_216136.1,GeneID:885503;Name=NP_216136.1;Note=transmembrane ATP-binding protein ABC transporter involved in transport of component linked with the assembly of cytochrome;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cydC;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1620c;product=cytochrome biosyntheisis ABC transporter ATP-binding protein/permease CydC;protein_id=NP_216136.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1821690 1823273 . - . ID=gene-Rv1621c;Dbxref=GeneID:885512;Name=cydD;gbkey=Gene;gene=cydD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1621c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1821690 1823273 . - 0 ID=cds-NP_216137.1;Parent=gene-Rv1621c;Dbxref=Genbank:NP_216137.1,GeneID:885512;Name=NP_216137.1;Note=transmembrane ATP-binding protein ABC transporter involved in transport of component linked with the assembly of cytochrome;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cydD;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1621c;product=cytochrome biosyntheisis ABC transporter ATP-binding protein/permease CydD;protein_id=NP_216137.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1823360 1824400 . - . ID=gene-Rv1622c;Dbxref=GeneID:885510;Name=cydB;gbkey=Gene;gene=cydB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1622c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1823360 1824400 . - 0 ID=cds-NP_216138.1;Parent=gene-Rv1622c;Dbxref=Genbank:NP_216138.1,GeneID:885510;Name=NP_216138.1;Note=cytochrome BD-I oxidase subunit II;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cydB;locus_tag=Rv1622c;product=cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II CydB;protein_id=NP_216138.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1824430 1825887 . - . ID=gene-Rv1623c;Dbxref=GeneID:885446;Name=cydA;gbkey=Gene;gene=cydA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=appC;locus_tag=Rv1623c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1824430 1825887 . - 0 ID=cds-YP_177824.1;Parent=gene-Rv1623c;Dbxref=Genbank:YP_177824.1,GeneID:885446;Name=YP_177824.1;Note=cytochrome BD-I oxidase subunit I;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=cydA;locus_tag=Rv1623c;product=cytochrome D ubiquinol oxidase subunit I CydA;protein_id=YP_177824.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1825998 1826585 . - . ID=gene-Rv1624c;Dbxref=GeneID:885135;Name=Rv1624c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1624c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1825998 1826585 . - 0 ID=cds-NP_216140.1;Parent=gene-Rv1624c;Dbxref=Genbank:NP_216140.1,GeneID:885135;Name=NP_216140.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1624c;product=membrane protein;protein_id=NP_216140.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1826614 1827945 . - . ID=gene-Rv1625c;Dbxref=GeneID:888538;Name=cya;gbkey=Gene;gene=cya;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1625c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1826614 1827945 . - 0 ID=cds-NP_216141.2;Parent=gene-Rv1625c;Dbxref=Genbank:NP_216141.2,GeneID:888538;Name=NP_216141.2;Note=Cya (ATP pyrophosphate-lyase) (adenylate cyclase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:11447108];gbkey=CDS;gene=cya;locus_tag=Rv1625c;product=adenylate cyclase;protein_id=NP_216141.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1828015 1828088 . - . ID=gene-Rvnt20;Dbxref=GeneID:2700456;Name=leuV;gbkey=Gene;gene=leuV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt20
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1828015 1828088 . - . ID=rna-Rvnt20;Parent=gene-Rvnt20;Dbxref=GeneID:2700456;Note=leuV%2C tRNA-Leu%2C anticodon caa%2C length %3D 74;anticodon=(pos:complement(1828052..1828054));codons=3;gbkey=tRNA;gene=leuV;locus_tag=Rvnt20;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq exon 1828015 1828088 . - . ID=exon-Rvnt20-1;Parent=rna-Rvnt20;Dbxref=GeneID:2700456;Note=leuV%2C tRNA-Leu%2C anticodon caa%2C length %3D 74;anticodon=(pos:complement(1828052..1828054));codons=3;gbkey=tRNA;gene=leuV;locus_tag=Rvnt20;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq gene 1828180 1828797 . + . ID=gene-Rv1626;Dbxref=GeneID:885080;Name=Rv1626;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1626
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1828180 1828797 . + 0 ID=cds-NP_216142.1;Parent=gene-Rv1626;Dbxref=Genbank:NP_216142.1,GeneID:885080;Name=NP_216142.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1626;product=two-component system transcriptional regulator;protein_id=NP_216142.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1828865 1830073 . - . ID=gene-Rv1627c;Dbxref=GeneID:885064;Name=Rv1627c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1627c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1828865 1830073 . - 0 ID=cds-NP_216143.1;Parent=gene-Rv1627c;Dbxref=Genbank:NP_216143.1,GeneID:885064;Name=NP_216143.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1627c;product=nonspecific lipid-transfer protein;protein_id=NP_216143.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1830070 1830561 . - . ID=gene-Rv1628c;Dbxref=GeneID:885289;Name=Rv1628c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1628c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1830070 1830561 . - 0 ID=cds-NP_216144.1;Parent=gene-Rv1628c;Dbxref=Genbank:NP_216144.1,GeneID:885289;Name=NP_216144.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1628c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216144.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1830074 1830125 . - . ID=id-Rv1628c;Dbxref=GeneID:885289;Note=52 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1628c
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1830665 1833379 . + 0 ID=cds-NP_216145.1;Parent=gene-Rv1629;Dbxref=Genbank:NP_216145.1,GeneID:885074;Name=NP_216145.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=polA;inference=protein motif:PROSITE:PS00447;locus_tag=Rv1629;product=DNA polymerase I;protein_id=NP_216145.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1853606 1854388 . + . ID=gene-Rv1644;Dbxref=GeneID:885163;Name=tsnR;gbkey=Gene;gene=tsnR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1644
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1854399 1855454 . - . ID=gene-Rv1645c;Dbxref=GeneID:885287;Name=Rv1645c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1645c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1855764 1856696 . + . ID=gene-Rv1646;Dbxref=GeneID:885486;Name=PE17;gbkey=Gene;gene=PE17;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1646
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1856774 1857724 . + . ID=gene-Rv1647;Dbxref=GeneID:885432;Name=Rv1647;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1647
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1857731 1858537 . + . ID=gene-Rv1648;Dbxref=GeneID:885065;Name=Rv1648;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1648
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1857731 1858537 . + 0 ID=cds-NP_216164.1;Parent=gene-Rv1648;Dbxref=Genbank:NP_216164.1,GeneID:885065;Name=NP_216164.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1648;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216164.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1858733 1859758 . + 0 ID=cds-NP_216165.3;Parent=gene-Rv1649;Dbxref=Genbank:NP_216165.3,GeneID:885105;Name=NP_216165.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=pheS;inference=protein motif:PROSITE:PS00179;locus_tag=Rv1649;product=phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha;protein_id=NP_216165.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1859758 1862253 . + . ID=gene-Rv1650;Dbxref=GeneID:885283;Name=pheT;gbkey=Gene;gene=pheT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1650
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1862347 1865382 . - . ID=gene-Rv1651c;Dbxref=GeneID:885174;Name=PE_PGRS30;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS30;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1651c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1862347 1865382 . - 0 ID=cds-YP_177826.1;Parent=gene-Rv1651c;Dbxref=Genbank:YP_177826.1,GeneID:885174;Name=YP_177826.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS30;locus_tag=Rv1651c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS30;protein_id=YP_177826.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1865576 1866634 . + . ID=gene-Rv1652;Dbxref=GeneID:885278;Name=argC;gbkey=Gene;gene=argC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1652
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1865576 1866634 . + 0 ID=cds-NP_216168.1;Parent=gene-Rv1652;Dbxref=Genbank:NP_216168.1,GeneID:885278;Name=NP_216168.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=argC;locus_tag=Rv1652;product=N-acetyl-gamma-glutamyl-phoshate reductase;protein_id=NP_216168.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1866631 1867845 . + . ID=gene-Rv1653;Dbxref=GeneID:885125;Name=argJ;gbkey=Gene;gene=argJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1653
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1866631 1867845 . + 0 ID=cds-NP_216169.1;Parent=gene-Rv1653;Dbxref=Genbank:NP_216169.1,GeneID:885125;Name=NP_216169.1;Note=Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ [Includes: Glutamate N-acetyltransferase (Ornithine acetyltransferase) (OATase) (Ornithine transacetylase)%3B Amino-acid acetyltransferase ~~(N-acetylglutamate synthase) (AGSase)];experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20184895];gbkey=CDS;gene=argJ;locus_tag=Rv1653;product=bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase;protein_id=NP_216169.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1867842 1868726 . + . ID=gene-Rv1654;Dbxref=GeneID:888076;Name=argB;gbkey=Gene;gene=argB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1654
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1867842 1868726 . + 0 ID=cds-NP_216170.1;Parent=gene-Rv1654;Dbxref=Genbank:NP_216170.1,GeneID:888076;Name=NP_216170.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=argB;locus_tag=Rv1654;product=acetylglutamate kinase;protein_id=NP_216170.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1868723 1869925 . + . ID=gene-Rv1655;Dbxref=GeneID:885187;Name=argD;gbkey=Gene;gene=argD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1655
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+NC_000962.3 RefSeq gene 1869922 1870845 . + . ID=gene-Rv1656;Dbxref=GeneID:885462;Name=argF;gbkey=Gene;gene=argF;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=OTC;locus_tag=Rv1656
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 1886512 1888020 . + 0 ID=cds-NP_216179.1;Parent=gene-Rv1663;Dbxref=Genbank:NP_216179.1,GeneID:885523;Name=NP_216179.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=pks17;inference=protein motif:PROSITE:PS00012;locus_tag=Rv1663;product=polyketide synthase;protein_id=NP_216179.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1888026 1891079 . + . ID=gene-Rv1664;Dbxref=GeneID:885519;Name=pks9;gbkey=Gene;gene=pks9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1664
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1888026 1891079 . + 0 ID=cds-NP_216180.1;Parent=gene-Rv1664;Dbxref=Genbank:NP_216180.1,GeneID:885519;Name=NP_216180.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=pks9;inference=protein motif:PROSITE:PS00012;locus_tag=Rv1664;product=polyketide synthase;protein_id=NP_216180.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1891226 1892287 . + . ID=gene-Rv1665;Dbxref=GeneID:885525;Name=pks11;gbkey=Gene;gene=pks11;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1665
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1891226 1892287 . + 0 ID=cds-NP_216181.1;Parent=gene-Rv1665;Dbxref=Genbank:NP_216181.1,GeneID:885525;Name=NP_216181.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pks11;locus_tag=Rv1665;product=chalcone synthase;protein_id=NP_216181.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1892270 1893562 . - . ID=gene-Rv1666c;Dbxref=GeneID:885528;Name=cyp139;gbkey=Gene;gene=cyp139;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1666c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1892270 1893562 . - 0 ID=cds-NP_216182.1;Parent=gene-Rv1666c;Dbxref=Genbank:NP_216182.1,GeneID:885528;Name=NP_216182.1;gbkey=CDS;gene=cyp139;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv1666c;product=cytochrome P450 Cyp139;protein_id=NP_216182.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 1893577 1895342 . - . ID=gene-Rv1667c;Dbxref=GeneID:885518;Name=Rv1667c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv1667c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 1895725 1896087 . + . ID=gene-Rv1669;Dbxref=GeneID:885701;Name=Rv1669;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1669
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1895725 1896087 . + 0 ID=cds-NP_216185.1;Parent=gene-Rv1669;Dbxref=Genbank:NP_216185.1,GeneID:885701;Name=NP_216185.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1669;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216185.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1896120 1896467 . + . ID=gene-Rv1670;Dbxref=GeneID:885702;Name=Rv1670;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1670
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1896120 1896467 . + 0 ID=cds-NP_216186.1;Parent=gene-Rv1670;Dbxref=Genbank:NP_216186.1,GeneID:885702;Name=NP_216186.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1670;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216186.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1896475 1896867 . + . ID=gene-Rv1671;Dbxref=GeneID:885698;Name=Rv1671;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1671
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1896475 1896867 . + 0 ID=cds-NP_216187.1;Parent=gene-Rv1671;Dbxref=Genbank:NP_216187.1,GeneID:885698;Name=NP_216187.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1671;product=membrane protein;protein_id=NP_216187.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1896876 1898207 . - . ID=gene-Rv1672c;Dbxref=GeneID:885700;Name=Rv1672c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1672c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1896876 1898207 . - 0 ID=cds-NP_216188.1;Parent=gene-Rv1672c;Dbxref=Genbank:NP_216188.1,GeneID:885700;Name=NP_216188.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1672c;product=integral membrane transport protein;protein_id=NP_216188.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1898300 1899232 . - . ID=gene-Rv1673c;Dbxref=GeneID:885695;Name=Rv1673c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1673c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1898300 1899232 . - 0 ID=cds-NP_216189.1;Parent=gene-Rv1673c;Dbxref=Genbank:NP_216189.1,GeneID:885695;Name=NP_216189.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1673c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216189.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1899260 1899916 . - . ID=gene-Rv1674c;Dbxref=GeneID:885696;Name=Rv1674c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1674c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1899260 1899916 . - 0 ID=cds-NP_216190.1;Parent=gene-Rv1674c;Dbxref=Genbank:NP_216190.1,GeneID:885696;Name=NP_216190.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00380;locus_tag=Rv1674c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216190.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1900241 1900975 . - . ID=gene-Rv1675c;Dbxref=GeneID:885693;Name=cmr;gbkey=Gene;gene=cmr;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1675c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1900241 1900975 . - 0 ID=cds-NP_216191.1;Parent=gene-Rv1675c;Dbxref=Genbank:NP_216191.1,GeneID:885693;Name=NP_216191.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cmr;locus_tag=Rv1675c;product=HTH-type transcriptional regulator Cmr;protein_id=NP_216191.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1901047 1901751 . + . ID=gene-Rv1676;Dbxref=GeneID:885694;Name=Rv1676;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1676
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1901047 1901751 . + 0 ID=cds-NP_216192.1;Parent=gene-Rv1676;Dbxref=Genbank:NP_216192.1,GeneID:885694;Name=NP_216192.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1676;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216192.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1901748 1902296 . + . ID=gene-Rv1677;Dbxref=GeneID:885690;Name=dsbF;gbkey=Gene;gene=dsbF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1677
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1901748 1902296 . + 0 ID=cds-NP_216193.1;Parent=gene-Rv1677;Dbxref=Genbank:NP_216193.1,GeneID:885690;Name=NP_216193.1;gbkey=CDS;gene=dsbF;inference=protein motif:PROSITE:PS00194;locus_tag=Rv1677;product=lipoprotein DsbF;protein_id=NP_216193.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1902397 1903299 . + . ID=gene-Rv1678;Dbxref=GeneID:885691;Name=Rv1678;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1678
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1902397 1903299 . + 0 ID=cds-NP_216194.1;Parent=gene-Rv1678;Dbxref=Genbank:NP_216194.1,GeneID:885691;Name=NP_216194.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1678;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216194.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1903299 1904420 . + . ID=gene-Rv1679;Dbxref=GeneID:885688;Name=fadE16;gbkey=Gene;gene=fadE16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1679
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1903299 1904420 . + 0 ID=cds-NP_216195.1;Parent=gene-Rv1679;Dbxref=Genbank:NP_216195.1,GeneID:885688;Name=NP_216195.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE16;locus_tag=Rv1679;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE16;protein_id=NP_216195.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1904429 1905253 . + . ID=gene-Rv1680;Dbxref=GeneID:885689;Name=Rv1680;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1680
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1904429 1905253 . + 0 ID=cds-NP_216196.1;Parent=gene-Rv1680;Dbxref=Genbank:NP_216196.1,GeneID:885689;Name=NP_216196.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1680;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216196.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1905250 1906242 . + . ID=gene-Rv1681;Dbxref=GeneID:885683;Name=moeX;gbkey=Gene;gene=moeX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1681
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1905250 1906242 . + 0 ID=cds-NP_216197.1;Parent=gene-Rv1681;Dbxref=Genbank:NP_216197.1,GeneID:885683;Name=NP_216197.1;gbkey=CDS;gene=moeX;locus_tag=Rv1681;product=molybdopterin biosynthesis protein MoeX;protein_id=NP_216197.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1906403 1907320 . + . ID=gene-Rv1682;Dbxref=GeneID:885686;Name=Rv1682;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1682
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1906403 1907320 . + 0 ID=cds-NP_216198.1;Parent=gene-Rv1682;Dbxref=Genbank:NP_216198.1,GeneID:885686;Name=NP_216198.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1682;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216198.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1907460 1907515 . + . ID=id-NC_000962.3:1907460..1907515;Note=56 bp direct repeat 1%2CAGTCGGGTGACGATGCGGGCCGGTGTGGTCCGAGGAGGAGCCCGACAATTTAAGCT;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1907516 1907571 . + . ID=id-NC_000962.3:1907516..1907571;Note=56 bp direct repeat 2%2CAGTCGGGTGACGATGCGGGCCGGTGTGGTCCGAGGAGGAGCCCGACAATTTAAGCT;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1907594 1910593 . + . ID=gene-Rv1683;Dbxref=GeneID:885687;Name=Rv1683;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1683
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1907594 1910593 . + 0 ID=cds-NP_216199.1;Parent=gene-Rv1683;Dbxref=Genbank:NP_216199.1,GeneID:885687;Name=NP_216199.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv1683;product=bifunctional long-chain acyl-CoA synthase/lipase;protein_id=NP_216199.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1910586 1910810 . + . ID=gene-Rv1684;Dbxref=GeneID:885680;Name=Rv1684;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1684
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1910586 1910810 . + 0 ID=cds-NP_216200.1;Parent=gene-Rv1684;Dbxref=Genbank:NP_216200.1,GeneID:885680;Name=NP_216200.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14595687];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1684;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216200.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1910776 1911399 . - . ID=gene-Rv1685c;Dbxref=GeneID:885682;Name=Rv1685c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1685c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1910776 1911399 . - 0 ID=cds-NP_216201.1;Parent=gene-Rv1685c;Dbxref=Genbank:NP_216201.1,GeneID:885682;Name=NP_216201.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1685c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216201.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1911401 1912081 . - . ID=gene-Rv1686c;Dbxref=GeneID:885672;Name=Rv1686c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1686c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1911401 1912081 . - 0 ID=cds-NP_216202.1;Parent=gene-Rv1686c;Dbxref=Genbank:NP_216202.1,GeneID:885672;Name=NP_216202.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1686c;product=ABC transporter permease;protein_id=NP_216202.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1912153 1912920 . - . ID=gene-Rv1687c;Dbxref=GeneID:885678;Name=Rv1687c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1687c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1912153 1912920 . - 0 ID=cds-NP_216203.1;Parent=gene-Rv1687c;Dbxref=Genbank:NP_216203.1,GeneID:885678;Name=NP_216203.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1687c;product=ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_216203.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1912979 1913590 . + . ID=gene-Rv1688;Dbxref=GeneID:885679;Name=mpg;gbkey=Gene;gene=mpg;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1688
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1912979 1913590 . + 0 ID=cds-NP_216204.1;Parent=gene-Rv1688;Dbxref=Genbank:NP_216204.1,GeneID:885679;Name=NP_216204.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mpg;locus_tag=Rv1688;product=3-methyladenine DNA glycosylase;protein_id=NP_216204.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1913602 1914876 . + . ID=gene-Rv1689;Dbxref=GeneID:885668;Name=tyrS;gbkey=Gene;gene=tyrS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1689
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1913602 1914876 . + 0 ID=cds-NP_216205.1;Parent=gene-Rv1689;Dbxref=Genbank:NP_216205.1,GeneID:885668;Name=NP_216205.1;Note=tyrosyl-tRNA synthase TyrS;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=tyrS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv1689;product=tyrosine--tRNA ligase;protein_id=NP_216205.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1914962 1915190 . - . ID=gene-RVnc0010;Dbxref=GeneID:14515900;Name=G2;gbkey=Gene;gene=G2;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0010
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1914962 1915190 . - . ID=rna-RVnc0010;Parent=gene-RVnc0010;Dbxref=GeneID:14515900;Note=G2%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-end at position 1915028. Alternate 3'-end at position 1914977.;gbkey=ncRNA;gene=G2;locus_tag=RVnc0010;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1914962 1915190 . - . ID=exon-RVnc0010-1;Parent=rna-RVnc0010;Dbxref=GeneID:14515900;Note=G2%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-end at position 1915028. Alternate 3'-end at position 1914977.;gbkey=ncRNA;gene=G2;locus_tag=RVnc0010;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1915527 1915910 . + . ID=gene-Rv1690;Dbxref=GeneID:885670;Name=lprJ;gbkey=Gene;gene=lprJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1690
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1915527 1915910 . + 0 ID=cds-NP_216206.1;Parent=gene-Rv1690;Dbxref=Genbank:NP_216206.1,GeneID:885670;Name=NP_216206.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lprJ;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1690;product=lipoprotein LprJ;protein_id=NP_216206.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1915949 1916701 . + . ID=gene-Rv1691;Dbxref=GeneID:885665;Name=Rv1691;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1691
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1915949 1916701 . + 0 ID=cds-NP_216207.1;Parent=gene-Rv1691;Dbxref=Genbank:NP_216207.1,GeneID:885665;Name=NP_216207.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1691;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216207.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1916698 1917759 . + . ID=gene-Rv1692;Dbxref=GeneID:885241;Name=Rv1692;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1692
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1916698 1917759 . + 0 ID=cds-NP_216208.1;Parent=gene-Rv1692;Dbxref=Genbank:NP_216208.1,GeneID:885241;Name=NP_216208.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1692;product=phosphatase;protein_id=NP_216208.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1917756 1917932 . + . ID=gene-Rv1693;Dbxref=GeneID:885662;Name=Rv1693;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1693
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1917756 1917932 . + 0 ID=cds-NP_216209.1;Parent=gene-Rv1693;Dbxref=Genbank:NP_216209.1,GeneID:885662;Name=NP_216209.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1693;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216209.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1917940 1918746 . + . ID=gene-Rv1694;Dbxref=GeneID:885396;Name=tlyA;gbkey=Gene;gene=tlyA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1694
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1917940 1918746 . + 0 ID=cds-NP_216210.1;Parent=gene-Rv1694;Dbxref=Genbank:NP_216210.1,GeneID:885396;Name=NP_216210.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15673735];gbkey=CDS;gene=tlyA;locus_tag=Rv1694;product=16S/23S rRNA (cytidine-2'-O)-methyltransferase TlyA;protein_id=NP_216210.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1918746 1919669 . + . ID=gene-Rv1695;Dbxref=GeneID:885660;Name=ppnK;gbkey=Gene;gene=ppnK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1695
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1918746 1919669 . + 0 ID=cds-NP_216211.1;Parent=gene-Rv1695;Dbxref=Genbank:NP_216211.1,GeneID:885660;Name=NP_216211.1;Note=poly(P)/ATP NAD kinase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:11006082];gbkey=CDS;gene=ppnK;locus_tag=Rv1695;product=inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase;protein_id=NP_216211.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1919683 1921446 . + . ID=gene-Rv1696;Dbxref=GeneID:885805;Name=recN;gbkey=Gene;gene=recN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1696
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1919683 1921446 . + 0 ID=cds-NP_216212.1;Parent=gene-Rv1696;Dbxref=Genbank:NP_216212.1,GeneID:885805;Name=NP_216212.1;Note=recombination protein N;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=recN;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1696;product=DNA repair protein RecN;protein_id=NP_216212.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1921542 1922723 . + . ID=gene-Rv1697;Dbxref=GeneID:885045;Name=Rv1697;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1697
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1921542 1922723 . + 0 ID=cds-NP_216213.1;Parent=gene-Rv1697;Dbxref=Genbank:NP_216213.1,GeneID:885045;Name=NP_216213.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1697;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216213.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1922745 1923689 . + . ID=gene-Rv1698;Dbxref=GeneID:885047;Name=mctB;gbkey=Gene;gene=mctB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1698
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1922745 1923689 . + 0 ID=cds-NP_216214.1;Parent=gene-Rv1698;Dbxref=Genbank:NP_216214.1,GeneID:885047;Name=NP_216214.1;Note=mycobacterial copper transport protein B essential for Cu resistance and maintenance of low intracellular Cu levels A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis[PMID:21205886];gbkey=CDS;gene=mctB;locus_tag=Rv1698;product=copper transporter MctB;protein_id=NP_216214.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1923829 1925589 . + . ID=gene-Rv1699;Dbxref=GeneID:885048;Name=pyrG;gbkey=Gene;gene=pyrG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1699
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1923829 1925589 . + 0 ID=cds-NP_216215.1;Parent=gene-Rv1699;Dbxref=Genbank:NP_216215.1,GeneID:885048;Name=NP_216215.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pyrG;inference=protein motif:PROSITE:PS00442;locus_tag=Rv1699;product=CTP synthase;protein_id=NP_216215.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1925582 1926205 . + . ID=gene-Rv1700;Dbxref=GeneID:885049;Name=Rv1700;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1700
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1925582 1926205 . + 0 ID=cds-NP_216216.1;Parent=gene-Rv1700;Dbxref=Genbank:NP_216216.1,GeneID:885049;Name=NP_216216.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1700;product=NUDIX hydrolase;protein_id=NP_216216.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1926202 1927137 . + . ID=gene-Rv1701;Dbxref=GeneID:885055;Name=Rv1701;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1701
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1926202 1927137 . + 0 ID=cds-NP_216217.1;Parent=gene-Rv1701;Dbxref=Genbank:NP_216217.1,GeneID:885055;Name=NP_216217.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1701;product=tyrosine recombinase XerD;protein_id=NP_216217.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1927211 1928575 . - . ID=gene-Rv1702c;Dbxref=GeneID:885061;Name=Rv1702c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1702c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1927211 1928575 . - 0 ID=cds-NP_216218.1;Parent=gene-Rv1702c;Dbxref=Genbank:NP_216218.1,GeneID:885061;Name=NP_216218.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1702c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216218.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1927218 1928589 . + . ID=id-NC_000962.3:1927218..1928589;Note=REP-6%2C len: 1372 nt. REPI125%2C member of REP13E12 family.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1929131 1929880 . - . ID=gene-Rv1703c;Dbxref=GeneID:885066;Name=Rv1703c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1703c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1929131 1929880 . - 0 ID=cds-NP_216219.4;Parent=gene-Rv1703c;Dbxref=Genbank:NP_216219.4,GeneID:885066;Name=NP_216219.4;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1703c;product=methyltransferase;protein_id=NP_216219.4;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1929786 1931456 . - . ID=gene-Rv1704c;Dbxref=GeneID:888812;Name=cycA;gbkey=Gene;gene=cycA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1704c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1929786 1931456 . - 0 ID=cds-NP_216220.1;Parent=gene-Rv1704c;Dbxref=Genbank:NP_216220.1,GeneID:888812;Name=NP_216220.1;Note=Probable cycA%2CD-serine/D-alanine/glycine transporte;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cycA;inference=protein motif:PROSITE:PS00218;locus_tag=Rv1704c;product=D-serine/alanine/glycine transporter protein CycA;protein_id=NP_216220.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1931497 1932654 . - . ID=gene-Rv1705c;Dbxref=GeneID:885068;Name=PPE22;gbkey=Gene;gene=PPE22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1705c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1931497 1932654 . - 0 ID=cds-YP_177827.1;Parent=gene-Rv1705c;Dbxref=Genbank:YP_177827.1,GeneID:885068;Name=YP_177827.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE22;locus_tag=Rv1705c;product=PPE family protein PPE22;protein_id=YP_177827.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1932694 1933878 . - . ID=gene-Rv1706c;Dbxref=GeneID:885070;Name=PPE23;gbkey=Gene;gene=PPE23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1706c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1932694 1933878 . - 0 ID=cds-YP_177828.1;Parent=gene-Rv1706c;Dbxref=Genbank:YP_177828.1,GeneID:885070;Name=YP_177828.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE23;locus_tag=Rv1706c;product=PPE family protein PPE23;protein_id=YP_177828.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1934482 1934649 . - . ID=gene-Rv1706A;Dbxref=GeneID:3205102;Name=Rv1706A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1706A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1934482 1934649 . - 0 ID=cds-YP_177651.1;Parent=gene-Rv1706A;Dbxref=Genbank:YP_177651.1,GeneID:3205102;Name=YP_177651.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1706A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177651.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1934882 1936342 . + . ID=gene-Rv1707;Dbxref=GeneID:885073;Name=Rv1707;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1707
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1934882 1936342 . + 0 ID=cds-NP_216223.1;Parent=gene-Rv1707;Dbxref=Genbank:NP_216223.1,GeneID:885073;Name=NP_216223.1;Note=Probable transmembrane protein%2C possibly involved in transport of sulfate;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1707;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216223.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1936360 1937316 . + . ID=gene-Rv1708;Dbxref=GeneID:885082;Name=Rv1708;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1708
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1936360 1937316 . + 0 ID=cds-NP_216224.1;Parent=gene-Rv1708;Dbxref=Genbank:NP_216224.1,GeneID:885082;Name=NP_216224.1;Note=Putative initiation inhibitor protein%2C a soj-related protein probably involved in cell process;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1708;product=initiation inhibitor protein;protein_id=NP_216224.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1937313 1938149 . + . ID=gene-Rv1709;Dbxref=GeneID:885083;Name=scpA;gbkey=Gene;gene=scpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1709
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1937313 1938149 . + 0 ID=cds-NP_216225.1;Parent=gene-Rv1709;Dbxref=Genbank:NP_216225.1,GeneID:885083;Name=NP_216225.1;Note=Possible scpA%2Csegregation and condensation protein;gbkey=CDS;gene=scpA;locus_tag=Rv1709;product=segregation and condensation protein ScpA;protein_id=NP_216225.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1938093 1938145 . + . ID=id-Rv1709;Dbxref=GeneID:885083;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region;gene=scpA;locus_tag=Rv1709
+NC_000962.3 RefSeq gene 1938146 1938841 . + . ID=gene-Rv1710;Dbxref=GeneID:885116;Name=scpB;gbkey=Gene;gene=scpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1710
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1938146 1938841 . + 0 ID=cds-NP_216226.1;Parent=gene-Rv1710;Dbxref=Genbank:NP_216226.1,GeneID:885116;Name=NP_216226.1;Note=Possible scpB%2Csegregation and condensation protein;gbkey=CDS;gene=scpB;locus_tag=Rv1710;product=segregation and condensation protein ScpB;protein_id=NP_216226.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1938838 1939602 . + . ID=gene-Rv1711;Dbxref=GeneID:885122;Name=Rv1711;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1711
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1938838 1939602 . + 0 ID=cds-NP_216227.1;Parent=gene-Rv1711;Dbxref=Genbank:NP_216227.1,GeneID:885122;Name=NP_216227.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01149;locus_tag=Rv1711;product=RNA pseudouridine synthase;protein_id=NP_216227.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1939599 1940291 . + . ID=gene-Rv1712;Dbxref=GeneID:885157;Name=cmk;gbkey=Gene;gene=cmk;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1712
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1939599 1940291 . + 0 ID=cds-NP_216228.1;Parent=gene-Rv1712;Dbxref=Genbank:NP_216228.1,GeneID:885157;Name=NP_216228.1;Note=Cmk (CMP kinase) (cytidine monophosphate kinase) (ck). Belongs to the cytidylate kinase family%2Csubfamily 1.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19181797];gbkey=CDS;gene=cmk;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1712;product=cytidylate kinase;protein_id=NP_216228.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1940288 1941679 . + . ID=gene-Rv1713;Dbxref=GeneID:885086;Name=engA;gbkey=Gene;gene=engA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1713
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1940288 1941679 . + 0 ID=cds-NP_216229.1;Parent=gene-Rv1713;Dbxref=Genbank:NP_216229.1,GeneID:885086;Name=NP_216229.1;Note=Belongs to the era/TRME family of GTP-binding proteins.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=engA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1713;product=GTPase Der;protein_id=NP_216229.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1941853 1942665 . + . ID=gene-Rv1714;Dbxref=GeneID:885159;Name=Rv1714;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1714
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1941853 1942665 . + 0 ID=cds-NP_216230.1;Parent=gene-Rv1714;Dbxref=Genbank:NP_216230.1,GeneID:885159;Name=NP_216230.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1714;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216230.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1942659 1943573 . + . ID=gene-Rv1715;Dbxref=GeneID:885160;Name=fadB3;gbkey=Gene;gene=fadB3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1715
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1942659 1943573 . + 0 ID=cds-YP_177829.1;Parent=gene-Rv1715;Dbxref=Genbank:YP_177829.1,GeneID:885160;Name=YP_177829.1;Note=3 (beta-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase) (BHBD);gbkey=CDS;gene=fadB3;locus_tag=Rv1715;product=3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase FadB;protein_id=YP_177829.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1943576 1944406 . + . ID=gene-Rv1716;Dbxref=GeneID:885162;Name=Rv1716;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1716
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1943576 1944406 . + 0 ID=cds-NP_216232.1;Parent=gene-Rv1716;Dbxref=Genbank:NP_216232.1,GeneID:885162;Name=NP_216232.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1716;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216232.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1944406 1944756 . + . ID=gene-Rv1717;Dbxref=GeneID:885166;Name=Rv1717;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1717
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1944406 1944756 . + 0 ID=cds-NP_216233.1;Parent=gene-Rv1717;Dbxref=Genbank:NP_216233.1,GeneID:885166;Name=NP_216233.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1717;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216233.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1944756 1944808 . + . ID=id-NC_000962.3:1944756..1944808;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1944809 1945627 . + . ID=gene-Rv1718;Dbxref=GeneID:885169;Name=Rv1718;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1718
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1944809 1945627 . + 0 ID=cds-NP_216234.1;Parent=gene-Rv1718;Dbxref=Genbank:NP_216234.1,GeneID:885169;Name=NP_216234.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1718;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216234.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1945641 1946420 . + . ID=gene-Rv1719;Dbxref=GeneID:885170;Name=Rv1719;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1719
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1945641 1946420 . + 0 ID=cds-NP_216235.1;Parent=gene-Rv1719;Dbxref=Genbank:NP_216235.1,GeneID:885170;Name=NP_216235.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1719;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216235.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1946613 1946686 . + . ID=gene-Rvnt21;Dbxref=GeneID:2700455;Name=proT;gbkey=Gene;gene=proT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt21
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 1946613 1946686 . + . ID=rna-Rvnt21;Parent=gene-Rvnt21;Dbxref=GeneID:2700455;Note=proT%2C tRNA-Pro%2C anticodon ggg%2C length %3D 74;anticodon=(pos:1946647..1946649);codons=21;gbkey=tRNA;gene=proT;locus_tag=Rvnt21;product=tRNA-Pro
+NC_000962.3 RefSeq exon 1946613 1946686 . + . ID=exon-Rvnt21-1;Parent=rna-Rvnt21;Dbxref=GeneID:2700455;Note=proT%2C tRNA-Pro%2C anticodon ggg%2C length %3D 74;anticodon=(pos:1946647..1946649);codons=21;gbkey=tRNA;gene=proT;locus_tag=Rvnt21;product=tRNA-Pro
+NC_000962.3 RefSeq gene 1947030 1947419 . - . ID=gene-Rv1720c;Dbxref=GeneID:885180;Name=vapC12;gbkey=Gene;gene=vapC12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1720c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1947030 1947419 . - 0 ID=cds-NP_216236.1;Parent=gene-Rv1720c;Dbxref=Genbank:NP_216236.1,GeneID:885180;Name=NP_216236.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1721c%2C contains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC12;locus_tag=Rv1720c;product=ribonuclease VapC12;protein_id=NP_216236.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1947416 1947643 . - . ID=gene-Rv1721c;Dbxref=GeneID:885182;Name=vapB12;gbkey=Gene;gene=vapB12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1721c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1947416 1947643 . - 0 ID=cds-NP_216237.2;Parent=gene-Rv1721c;Dbxref=Genbank:NP_216237.2,GeneID:885182;Name=NP_216237.2;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1720c;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapB12;locus_tag=Rv1721c;product=antitoxin VapB12;protein_id=NP_216237.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1947861 1949345 . + . ID=gene-Rv1722;Dbxref=GeneID:885183;Name=Rv1722;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1722
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1947861 1949345 . + 0 ID=cds-NP_216238.1;Parent=gene-Rv1722;Dbxref=Genbank:NP_216238.1,GeneID:885183;Name=NP_216238.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1722;product=carboxylase;protein_id=NP_216238.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1949342 1950589 . + . ID=gene-Rv1723;Dbxref=GeneID:885185;Name=Rv1723;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1723
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1949342 1950589 . + 0 ID=cds-NP_216239.1;Parent=gene-Rv1723;Dbxref=Genbank:NP_216239.1,GeneID:885185;Name=NP_216239.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1723;product=hydrolase;protein_id=NP_216239.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1950632 1951051 . - . ID=gene-Rv1724c;Dbxref=GeneID:885189;Name=Rv1724c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1724c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1950632 1951051 . - 0 ID=cds-NP_216240.1;Parent=gene-Rv1724c;Dbxref=Genbank:NP_216240.1,GeneID:885189;Name=NP_216240.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1724c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216240.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1951041 1951751 . - . ID=gene-Rv1725c;Dbxref=GeneID:885191;Name=Rv1725c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1725c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1951041 1951751 . - 0 ID=cds-NP_216241.1;Parent=gene-Rv1725c;Dbxref=Genbank:NP_216241.1,GeneID:885191;Name=NP_216241.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1725c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216241.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1951852 1953237 . + . ID=gene-Rv1726;Dbxref=GeneID:885192;Name=Rv1726;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1726
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1951852 1953237 . + 0 ID=cds-NP_216242.1;Parent=gene-Rv1726;Dbxref=Genbank:NP_216242.1,GeneID:885192;Name=NP_216242.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1726;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216242.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1952291 1952503 . - . ID=gene-RVnc0047;Dbxref=GeneID:14515859;Name=AS1726;gbkey=Gene;gene=AS1726;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0047
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1952291 1952503 . - . ID=rna-RVnc0047;Parent=gene-RVnc0047;Dbxref=GeneID:14515859;Note=AS1726%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 1952400%2C1952375%2C 1952367%2C and 1952351.;gbkey=ncRNA;gene=AS1726;locus_tag=RVnc0047;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1952291 1952503 . - . ID=exon-RVnc0047-1;Parent=rna-RVnc0047;Dbxref=GeneID:14515859;Note=AS1726%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 1952400%2C1952375%2C 1952367%2C and 1952351.;gbkey=ncRNA;gene=AS1726;locus_tag=RVnc0047;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1953270 1953839 . + . ID=gene-Rv1727;Dbxref=GeneID:887422;Name=Rv1727;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1727
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1953270 1953839 . + 0 ID=cds-NP_216243.1;Parent=gene-Rv1727;Dbxref=Genbank:NP_216243.1,GeneID:887422;Name=NP_216243.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1727;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216243.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1953864 1954634 . - . ID=gene-Rv1728c;Dbxref=GeneID:885193;Name=Rv1728c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1728c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1953864 1954634 . - 0 ID=cds-NP_216244.1;Parent=gene-Rv1728c;Dbxref=Genbank:NP_216244.1,GeneID:885193;Name=NP_216244.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1728c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216244.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1954631 1955569 . - . ID=gene-Rv1729c;Dbxref=GeneID:885194;Name=Rv1729c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1729c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1954631 1955569 . - 0 ID=cds-NP_216245.1;Parent=gene-Rv1729c;Dbxref=Genbank:NP_216245.1,GeneID:885194;Name=NP_216245.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1729c;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_216245.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1955692 1957245 . - . ID=gene-Rv1730c;Dbxref=GeneID:885202;Name=Rv1730c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1730c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1955692 1957245 . - 0 ID=cds-NP_216246.1;Parent=gene-Rv1730c;Dbxref=Genbank:NP_216246.1,GeneID:885202;Name=NP_216246.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1730c;product=penicillin-binding protein;protein_id=NP_216246.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1957677 1959233 . + . ID=gene-Rv1731;Dbxref=GeneID:885204;Name=gabD2;gbkey=Gene;gene=gabD2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gabD1;locus_tag=Rv1731
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1957677 1959233 . + 0 ID=cds-NP_214748.2;Parent=gene-Rv1731;Dbxref=Genbank:NP_214748.2,GeneID:885204;Name=NP_214748.2;Note=NADP+ dependent. Belongs to the aldehyde dehydrogenases family.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gabD2;inference=protein motif:PROSITE:PS00687;locus_tag=Rv1731;product=succinate-semialdehyde dehydrogenase;protein_id=NP_214748.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1959243 1959791 . - . ID=gene-Rv1732c;Dbxref=GeneID:885211;Name=Rv1732c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1732c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1959243 1959791 . - 0 ID=cds-NP_216248.1;Parent=gene-Rv1732c;Dbxref=Genbank:NP_216248.1,GeneID:885211;Name=NP_216248.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1732c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216248.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1959855 1960487 . - . ID=gene-Rv1733c;Dbxref=GeneID:885214;Name=Rv1733c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1733c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1959855 1960487 . - 0 ID=cds-NP_216249.1;Parent=gene-Rv1733c;Dbxref=Genbank:NP_216249.1,GeneID:885214;Name=NP_216249.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1733c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216249.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1960667 1960783 . + . ID=gene-RVnc0036;Dbxref=GeneID:14515860;Name=MTS1338;gbkey=Gene;gene=MTS1338;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0036
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 1960667 1960783 . + . ID=rna-RVnc0036;Parent=gene-RVnc0036;Dbxref=GeneID:14515860;Note=MTS1338%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C 5'-end mapped by RLM-RACE%2C alternate 5'-end at position 1960601%2C ~~100 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS1338;locus_tag=RVnc0036;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 1960667 1960783 . + . ID=exon-RVnc0036-1;Parent=rna-RVnc0036;Dbxref=GeneID:14515860;Note=MTS1338%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C 5'-end mapped by RLM-RACE%2C alternate 5'-end at position 1960601%2C ~~100 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS1338;locus_tag=RVnc0036;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 1960774 1961016 . - . ID=gene-Rv1734c;Dbxref=GeneID:885212;Name=Rv1734c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1734c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1960774 1961016 . - 0 ID=cds-NP_216250.1;Parent=gene-Rv1734c;Dbxref=Genbank:NP_216250.1,GeneID:885212;Name=NP_216250.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1734c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216250.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1961291 1961788 . - . ID=gene-Rv1735c;Dbxref=GeneID:885216;Name=Rv1735c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1735c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1961291 1961788 . - 0 ID=cds-NP_216251.1;Parent=gene-Rv1735c;Dbxref=Genbank:NP_216251.1,GeneID:885216;Name=NP_216251.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1735c;product=membrane protein;protein_id=NP_216251.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1961887 1962129 . - . ID=gene-Rv1735a;Dbxref=GeneID:19394674;Name=Rv1735a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1735a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1961887 1962129 . - 0 ID=cds-YP_009030033.1;Parent=gene-Rv1735a;Dbxref=Genbank:YP_009030033.1,GeneID:19394674;Name=YP_009030033.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1735a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030033.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1962228 1964186 . - . ID=gene-Rv1736c;Dbxref=GeneID:885213;Name=narX;gbkey=Gene;gene=narX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1736c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1962228 1964186 . - 0 ID=cds-NP_216252.1;Parent=gene-Rv1736c;Dbxref=Genbank:NP_216252.1,GeneID:885213;Name=NP_216252.1;Note=Contains three domains: N-terminus respiratory nitrate reductase 1 alpha chain. Central region respiratory nitrate reductase (delta chain)%2C C-terminus respiratory nitrate reductase (gamma chain);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=narX;inference=protein motif:PROSITE:PS00551;locus_tag=Rv1736c;product=nitrate reductase-like protein NarX;protein_id=NP_216252.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1964183 1965370 . - . ID=gene-Rv1737c;Dbxref=GeneID:885231;Name=narK2;gbkey=Gene;gene=narK2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1737c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1964183 1965370 . - 0 ID=cds-NP_216253.1;Parent=gene-Rv1737c;Dbxref=Genbank:NP_216253.1,GeneID:885231;Name=NP_216253.1;Note=nitrate/nitrite-transport integral membrane protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=narK2;locus_tag=Rv1737c;product=nitrate/nitrite transporter;protein_id=NP_216253.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1965657 1965941 . + . ID=gene-Rv1738;Dbxref=GeneID:885215;Name=Rv1738;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1738
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1965657 1965941 . + 0 ID=cds-NP_216254.1;Parent=gene-Rv1738;Dbxref=Genbank:NP_216254.1,GeneID:885215;Name=NP_216254.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1738;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216254.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1965955 1967637 . - . ID=gene-Rv1739c;Dbxref=GeneID:887208;Name=Rv1739c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1739c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1965955 1967637 . - 0 ID=cds-NP_216255.1;Parent=gene-Rv1739c;Dbxref=Genbank:NP_216255.1,GeneID:887208;Name=NP_216255.1;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:18255326];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1739c;product=sulfate ABC transporter permease;protein_id=NP_216255.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1967705 1967917 . + . ID=gene-Rv1740;Dbxref=GeneID:885226;Name=vapB34;gbkey=Gene;gene=vapB34;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1740
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1967705 1967917 . + 0 ID=cds-NP_216256.1;Parent=gene-Rv1740;Dbxref=Genbank:NP_216256.1,GeneID:885226;Name=NP_216256.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1741;gbkey=CDS;gene=vapB34;locus_tag=Rv1740;product=antitoxin VapB34;protein_id=NP_216256.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1967917 1968165 . + . ID=gene-Rv1741;Dbxref=GeneID:887165;Name=vapC34;gbkey=Gene;gene=vapC34;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1741
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1967917 1968165 . + 0 ID=cds-NP_216257.1;Parent=gene-Rv1741;Dbxref=Genbank:NP_216257.1,GeneID:887165;Name=NP_216257.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1740%2C contains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC34;locus_tag=Rv1741;product=ribonuclease VapC34;protein_id=NP_216257.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1968173 1968910 . + . ID=gene-Rv1742;Dbxref=GeneID:885234;Name=Rv1742;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1742
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1968173 1968910 . + 0 ID=cds-NP_216258.1;Parent=gene-Rv1742;Dbxref=Genbank:NP_216258.1,GeneID:885234;Name=NP_216258.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1742;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216258.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1969004 1970704 . + . ID=gene-Rv1743;Dbxref=GeneID:885284;Name=pknE;gbkey=Gene;gene=pknE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1743
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1969004 1970704 . + 0 ID=cds-NP_216259.1;Parent=gene-Rv1743;Dbxref=Genbank:NP_216259.1,GeneID:885284;Name=NP_216259.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:12927792];gbkey=CDS;gene=pknE;inference=protein motif:PROSITE:PS00107;locus_tag=Rv1743;product=serine/threonine-protein kinase PknE;protein_id=NP_216259.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1970989 1971390 . - . ID=gene-Rv1744c;Dbxref=GeneID:885235;Name=Rv1744c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1744c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1970989 1971390 . - 0 ID=cds-NP_216260.1;Parent=gene-Rv1744c;Dbxref=Genbank:NP_216260.1,GeneID:885235;Name=NP_216260.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1744c;product=membrane protein;protein_id=NP_216260.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1971380 1971991 . - . ID=gene-Rv1745c;Dbxref=GeneID:885309;Name=idi;gbkey=Gene;gene=idi;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1745c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1971380 1971991 . - 0 ID=cds-NP_216261.1;Parent=gene-Rv1745c;Dbxref=Genbank:NP_216261.1,GeneID:885309;Name=NP_216261.1;Note=Idi (IPP isomerase) (isopentenyl pyrophosphate isomerase);gbkey=CDS;gene=idi;locus_tag=Rv1745c;product=isopentenyl-diphosphate delta-isomerase;protein_id=NP_216261.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1972138 1973568 . + . ID=gene-Rv1746;Dbxref=GeneID:885275;Name=pknF;gbkey=Gene;gene=pknF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1746
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1972138 1973568 . + 0 ID=cds-NP_216262.1;Parent=gene-Rv1746;Dbxref=Genbank:NP_216262.1,GeneID:885275;Name=NP_216262.1;Note=protein kinase F (STPK F)%3B Experimental studies show evidence of auto-phosphorylation. Start site chosen by homology%2C may extend further upstream.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pknF;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv1746;product=serine/threonine-protein kinase PknF;protein_id=NP_216262.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1973630 1976227 . + . ID=gene-Rv1747;Dbxref=GeneID:885311;Name=Rv1747;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1747
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1973630 1976227 . + 0 ID=cds-NP_216263.1;Parent=gene-Rv1747;Dbxref=Genbank:NP_216263.1,GeneID:885311;Name=NP_216263.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1747;product=ABC transporter ATP-binding protein/permease;protein_id=NP_216263.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1976600 1977331 . + . ID=gene-Rv1748;Dbxref=GeneID:885288;Name=Rv1748;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1748
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1976600 1977331 . + 0 ID=cds-NP_216264.1;Parent=gene-Rv1748;Dbxref=Genbank:NP_216264.1,GeneID:885288;Name=NP_216264.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1748;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216264.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1977328 1977885 . - . ID=gene-Rv1749c;Dbxref=GeneID:885322;Name=Rv1749c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1749c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1977328 1977885 . - 0 ID=cds-NP_216265.1;Parent=gene-Rv1749c;Dbxref=Genbank:NP_216265.1,GeneID:885322;Name=NP_216265.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1749c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216265.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1977969 1979567 . - . ID=gene-Rv1750c;Dbxref=GeneID:885310;Name=fadD1;gbkey=Gene;gene=fadD1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1750c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1977969 1979567 . - 0 ID=cds-NP_216266.1;Parent=gene-Rv1750c;Dbxref=Genbank:NP_216266.1,GeneID:885310;Name=NP_216266.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=fadD1;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv1750c;product=fatty-acid--CoA ligase FadD1;protein_id=NP_216266.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1979621 1981003 . + . ID=gene-Rv1751;Dbxref=GeneID:885489;Name=Rv1751;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1751
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1979621 1981003 . + 0 ID=cds-NP_216267.1;Parent=gene-Rv1751;Dbxref=Genbank:NP_216267.1,GeneID:885489;Name=NP_216267.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00075;locus_tag=Rv1751;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216267.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1981130 1981579 . + . ID=gene-Rv1752;Dbxref=GeneID:885313;Name=Rv1752;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1752
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1981130 1981579 . + 0 ID=cds-NP_216268.1;Parent=gene-Rv1752;Dbxref=Genbank:NP_216268.1,GeneID:885313;Name=NP_216268.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1752;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216268.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1981614 1984775 . - . ID=gene-Rv1753c;Dbxref=GeneID:885544;Name=PPE24;gbkey=Gene;gene=PPE24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1981614 1984775 . - 0 ID=cds-YP_177830.1;Parent=gene-Rv1753c;Dbxref=Genbank:YP_177830.1,GeneID:885544;Name=YP_177830.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c;product=PPE family protein PPE24;protein_id=YP_177830.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1982887 1982964 . - . ID=id-Rv1753c;Dbxref=GeneID:885544;Note=78 bp imperfect direct repeat 6%2CCGGCGCCTTCAGCCTGCCCGGGTTGACGTTGCCGTCGTTGAACATCCCGGCCGCCACCACACCCGCCAACATCACCGT;gbkey=repeat_region;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1982965 1983042 . - . ID=id-Rv1753c-2;Dbxref=GeneID:885544;Note=78 bp imperfect direct repeat 5%2CCGGCGCCTTCAGCCTGCCCGGGTTGACGTTGCCGTCGTTGAACATCCCGGCCGCCACCACACCAGCCAACATCACCGT;gbkey=repeat_region;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1983043 1983120 . - . ID=id-Rv1753c-3;Dbxref=GeneID:885544;Note=78 bp imperfect direct repeat 4%2CCGGCGCCTTCAGCCTGCCCGGGTTGACGTTGCCGTCGTTGAACATCCCGGCCGCCACCACACCAGCCAACATCACCGT;gbkey=repeat_region;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1983121 1983198 . - . ID=id-Rv1753c-4;Dbxref=GeneID:885544;Note=78 bp imperfect direct repeat 3%2CGGGTGCCTTCAGCCTGCCCGGGTTGACGTTGCCGTCGTTGAACATCCCGGCCGCCACCACACCAGCCAACATCACCGT;gbkey=repeat_region;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1983199 1983276 . - . ID=id-Rv1753c-5;Dbxref=GeneID:885544;Note=78 bp imperfect direct repeat 2%2CCGGCGCCTTCAGCCTGCCCGGGTTGACGTTGCCGTCGTTGAACATCCCGGCCGCCACCACACCAGCCAACATCACCGT;gbkey=repeat_region;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1983277 1983354 . - . ID=id-Rv1753c-6;Dbxref=GeneID:885544;Note=78 bp imperfect direct repeat 1%2CTCCCGCCTTCAGTCTGCCGGCAATAACGCTGCCGTCGCTGAACATCCCGGCCGCCACCACACCGGCCAACATCACCGT;gbkey=repeat_region;gene=PPE24;locus_tag=Rv1753c
+NC_000962.3 RefSeq gene 1984979 1986670 . - . ID=gene-Rv1754c;Dbxref=GeneID:885467;Name=Rv1754c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1754c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1984979 1986670 . - 0 ID=cds-NP_216270.1;Parent=gene-Rv1754c;Dbxref=Genbank:NP_216270.1,GeneID:885467;Name=NP_216270.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1754c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216270.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1987703 1989057 . - . ID=id-NC_000962.3:1987703..1989057;Note=IS6110-3%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-3
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1987703 1987730 . + . ID=id-NC_000962.3:1987703..1987730;Note=28 bp inverted repeat at the left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1989030 1989057 . - . ID=id-NC_000962.3:1989030..1989057;Note=28 bp inverted repeat at the right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1989042 1989566 . + . ID=gene-Rv1758;Dbxref=GeneID:885552;Name=cut1;gbkey=Gene;gene=cut1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clp5,culp5;locus_tag=Rv1758
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1989042 1989566 . + 0 ID=cds-NP_216274.1;Parent=gene-Rv1758;Dbxref=Genbank:NP_216274.1,GeneID:885552;Name=NP_216274.1;Note=Probable cut1%2Cserine esterase%2C cutinase family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=cut1;locus_tag=Rv1758;product=cutinase;protein_id=NP_216274.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1989833 1992577 . - . ID=gene-Rv1759c;Dbxref=GeneID:885325;Name=wag22;gbkey=Gene;gene=wag22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1759c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1989833 1992577 . - 0 ID=cds-YP_177831.1;Parent=gene-Rv1759c;Dbxref=Genbank:YP_177831.1,GeneID:885325;Name=YP_177831.1;Note=Wag22%2Cantigen member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=wag22;locus_tag=Rv1759c;product=PE-PGRS family protein Wag22;protein_id=YP_177831.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1993153 1994661 . + . ID=gene-Rv1760;Dbxref=GeneID:885556;Name=Rv1760;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1760
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1993153 1994661 . + 0 ID=cds-NP_216276.1;Parent=gene-Rv1760;Dbxref=Genbank:NP_216276.1,GeneID:885556;Name=NP_216276.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15262939];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1760;product=diacylglycerol acyltransferase;protein_id=NP_216276.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1994671 1995054 . - . ID=gene-Rv1761c;Dbxref=GeneID:885436;Name=Rv1761c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1761c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1994671 1995054 . - 0 ID=cds-NP_216277.1;Parent=gene-Rv1761c;Dbxref=Genbank:NP_216277.1,GeneID:885436;Name=NP_216277.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1761c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216277.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 1995054 1995842 . - . ID=gene-Rv1762c;Dbxref=GeneID:885373;Name=Rv1762c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1762c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1995054 1995842 . - 0 ID=cds-NP_216278.1;Parent=gene-Rv1762c;Dbxref=Genbank:NP_216278.1,GeneID:885373;Name=NP_216278.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1762c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216278.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1996101 1997455 . + . ID=id-NC_000962.3:1996101..1997455;Note=IS6110-4%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-4
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1996101 1996128 . + . ID=id-NC_000962.3:1996101..1996128;Note=28 bp inverted repeat at the left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1997418 1998515 . - . ID=gene-Rv1765c;Dbxref=GeneID:885256;Name=Rv1765c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1765c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1997418 1998515 . - 0 ID=cds-NP_216281.1;Parent=gene-Rv1765c;Dbxref=Genbank:NP_216281.1,GeneID:885256;Name=NP_216281.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1765c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216281.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1997428 1997455 . - . ID=id-Rv1765c;Dbxref=GeneID:885256;Note=28 bp inverted repeat at the right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1765c
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 1998584 1999813 . - . ID=id-NC_000962.3:1998584..1999813;Note=ISB9'%2C len: 1230 nt. Insertion sequence ISB9%2C nearly identical to EM_BA:MTU78639. Note that this sequence shows several differences to EM_BA: MTU78639%2C and the transposase ORFs are extensively frameshifted. Our sequence has been checked and is thought to be correct%3B the sequence in EM_BA:MTU78639 is from a different isolate of Mycobacterium tuberculosis.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:ISB9'
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1998584 1998597 . + . ID=id-NC_000962.3:1998584..1998597;Note=14 bp Inverted repeat at the left end of ISB9'%2CATCACCCCGCAAAG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 1999737 2000006 . + . ID=gene-Rv1766;Dbxref=GeneID:885427;Name=Rv1766;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1766
+NC_000962.3 RefSeq CDS 1999737 2000006 . + 0 ID=cds-NP_216282.2;Parent=gene-Rv1766;Dbxref=Genbank:NP_216282.2,GeneID:885427;Name=NP_216282.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1766;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216282.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 1999800 1999813 . - . ID=id-NC_000962.3:1999800..1999813;Note=14 bp Inverted repeat at the right end of ISB9%2CATCACCCCGGCAAG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2000074 2000433 . + . ID=gene-Rv1767;Dbxref=GeneID:885443;Name=Rv1767;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1767
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2000074 2000433 . + 0 ID=cds-NP_216283.1;Parent=gene-Rv1767;Dbxref=Genbank:NP_216283.1,GeneID:885443;Name=NP_216283.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1767;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216283.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2000614 2002470 . + . ID=gene-Rv1768;Dbxref=GeneID:885429;Name=PE_PGRS31;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS31;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1768
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2000614 2002470 . + 0 ID=cds-YP_177832.1;Parent=gene-Rv1768;Dbxref=Genbank:YP_177832.1,GeneID:885429;Name=YP_177832.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS31;locus_tag=Rv1768;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS31;protein_id=YP_177832.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2002626 2003870 . + . ID=gene-Rv1769;Dbxref=GeneID:885420;Name=Rv1769;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1769
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2002626 2003870 . + 0 ID=cds-NP_216285.1;Parent=gene-Rv1769;Dbxref=Genbank:NP_216285.1,GeneID:885420;Name=NP_216285.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1769;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216285.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2003878 2005164 . + . ID=gene-Rv1770;Dbxref=GeneID:885415;Name=Rv1770;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1770
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2003878 2005164 . + 0 ID=cds-NP_216286.1;Parent=gene-Rv1770;Dbxref=Genbank:NP_216286.1,GeneID:885415;Name=NP_216286.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1770;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216286.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2005161 2006447 . + . ID=gene-Rv1771;Dbxref=GeneID:885441;Name=Rv1771;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1771
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2005161 2006447 . + 0 ID=cds-NP_216287.1;Parent=gene-Rv1771;Dbxref=Genbank:NP_216287.1,GeneID:885441;Name=NP_216287.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16956367];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00862;locus_tag=Rv1771;product=L-gulono-1%2C4-lactone dehydrogenase;protein_id=NP_216287.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2006636 2006947 . + . ID=gene-Rv1772;Dbxref=GeneID:885920;Name=Rv1772;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1772
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2006636 2006947 . + 0 ID=cds-NP_216288.1;Parent=gene-Rv1772;Dbxref=Genbank:NP_216288.1,GeneID:885920;Name=NP_216288.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1772;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216288.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2007020 2007766 . - . ID=gene-Rv1773c;Dbxref=GeneID:885342;Name=Rv1773c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1773c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2007020 2007766 . - 0 ID=cds-NP_216289.1;Parent=gene-Rv1773c;Dbxref=Genbank:NP_216289.1,GeneID:885342;Name=NP_216289.1;Note=Probable transcriptional regulator belonging to IclR family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1773c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216289.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2007832 2009172 . + . ID=gene-Rv1774;Dbxref=GeneID:885367;Name=Rv1774;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1774
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2007832 2009172 . + 0 ID=cds-NP_216290.1;Parent=gene-Rv1774;Dbxref=Genbank:NP_216290.1,GeneID:885367;Name=NP_216290.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00862;locus_tag=Rv1774;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216290.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2009172 2009990 . + . ID=gene-Rv1775;Dbxref=GeneID:885842;Name=Rv1775;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1775
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2009172 2009990 . + 0 ID=cds-NP_216291.1;Parent=gene-Rv1775;Dbxref=Genbank:NP_216291.1,GeneID:885842;Name=NP_216291.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1775;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216291.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2009995 2010555 . - . ID=gene-Rv1776c;Dbxref=GeneID:885821;Name=Rv1776c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1776c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2009995 2010555 . - 0 ID=cds-NP_216292.1;Parent=gene-Rv1776c;Dbxref=Genbank:NP_216292.1,GeneID:885821;Name=NP_216292.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1776c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216292.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2010656 2011960 . + . ID=gene-Rv1777;Dbxref=GeneID:885839;Name=cyp144;gbkey=Gene;gene=cyp144;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1777
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2010656 2011960 . + 0 ID=cds-NP_216293.1;Parent=gene-Rv1777;Dbxref=Genbank:NP_216293.1,GeneID:885839;Name=NP_216293.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20621636];gbkey=CDS;gene=cyp144;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv1777;product=cytochrome P450 Cyp144;protein_id=NP_216293.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2012081 2012530 . - . ID=gene-Rv1778c;Dbxref=GeneID:885424;Name=Rv1778c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1778c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2012081 2012530 . - 0 ID=cds-NP_216294.1;Parent=gene-Rv1778c;Dbxref=Genbank:NP_216294.1,GeneID:885424;Name=NP_216294.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1778c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216294.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2012686 2014479 . - . ID=gene-Rv1779c;Dbxref=GeneID:885829;Name=Rv1779c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1779c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2012686 2014479 . - 0 ID=cds-NP_216295.1;Parent=gene-Rv1779c;Dbxref=Genbank:NP_216295.1,GeneID:885829;Name=NP_216295.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1779c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216295.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2014699 2015262 . + . ID=gene-Rv1780;Dbxref=GeneID:885851;Name=Rv1780;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1780
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2014699 2015262 . + 0 ID=cds-NP_216296.1;Parent=gene-Rv1780;Dbxref=Genbank:NP_216296.1,GeneID:885851;Name=NP_216296.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1780;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216296.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2015302 2017476 . - . ID=gene-Rv1781c;Dbxref=GeneID:885854;Name=malQ;gbkey=Gene;gene=malQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1781c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2015302 2017476 . - 0 ID=cds-NP_216297.1;Parent=gene-Rv1781c;Dbxref=Genbank:NP_216297.1,GeneID:885854;Name=NP_216297.1;Note=amylomaltase (disproportionating enzyme) (D-enzyme);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=malQ;locus_tag=Rv1781c;product=4-alpha-glucanotransferase;protein_id=NP_216297.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2017740 2019260 . + . ID=gene-Rv1782;Dbxref=GeneID:885347;Name=eccB5;gbkey=Gene;gene=eccB5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1782
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2017740 2019260 . + 0 ID=cds-NP_216298.1;Parent=gene-Rv1782;Dbxref=Genbank:NP_216298.1,GeneID:885347;Name=NP_216298.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccB5;locus_tag=Rv1782;product=ESX-5 type VII secretion system protein EccB5;protein_id=NP_216298.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2019257 2023432 . + . ID=gene-Rv1783;Dbxref=GeneID:885898;Name=eccC5;gbkey=Gene;gene=eccC5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1783
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2019257 2023432 . + 0 ID=cds-YP_007410461.1;Parent=gene-Rv1783;Dbxref=Genbank:YP_007410461.1,GeneID:885898;Name=YP_007410461.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccC5;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1783;product=ESX-5 type VII secretion system protein EccC5;protein_id=YP_007410461.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2023447 2024628 . - . ID=gene-Rv1785c;Dbxref=GeneID:885907;Name=cyp143;gbkey=Gene;gene=cyp143;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1785c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2023447 2024628 . - 0 ID=cds-NP_216301.1;Parent=gene-Rv1785c;Dbxref=Genbank:NP_216301.1,GeneID:885907;Name=NP_216301.1;gbkey=CDS;gene=cyp143;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv1785c;product=cytochrome P450 Cyp143;protein_id=NP_216301.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2024828 2025031 . + . ID=gene-Rv1786;Dbxref=GeneID:885846;Name=Rv1786;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1786
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2024828 2025031 . + 0 ID=cds-NP_216302.1;Parent=gene-Rv1786;Dbxref=Genbank:NP_216302.1,GeneID:885846;Name=NP_216302.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1786;product=ferredoxin;protein_id=NP_216302.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2025301 2026398 . + . ID=gene-Rv1787;Dbxref=GeneID:885827;Name=PPE25;gbkey=Gene;gene=PPE25;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1787
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2025301 2026398 . + 0 ID=cds-YP_177833.1;Parent=gene-Rv1787;Dbxref=Genbank:YP_177833.1,GeneID:885827;Name=YP_177833.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE25;locus_tag=Rv1787;product=PPE family protein PPE25;protein_id=YP_177833.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2026477 2026776 . + . ID=gene-Rv1788;Dbxref=GeneID:885895;Name=PE18;gbkey=Gene;gene=PE18;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1788
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2026477 2026776 . + 0 ID=cds-YP_177834.1;Parent=gene-Rv1788;Dbxref=Genbank:YP_177834.1,GeneID:885895;Name=YP_177834.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE18;locus_tag=Rv1788;product=PE family protein PE18;protein_id=YP_177834.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2026790 2027971 . + . ID=gene-Rv1789;Dbxref=GeneID:885333;Name=PPE26;gbkey=Gene;gene=PPE26;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1789
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2026790 2027971 . + 0 ID=cds-YP_177835.1;Parent=gene-Rv1789;Dbxref=Genbank:YP_177835.1,GeneID:885333;Name=YP_177835.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PPE26;locus_tag=Rv1789;product=PPE family protein PPE26;protein_id=YP_177835.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2028425 2029477 . + . ID=gene-Rv1790;Dbxref=GeneID:885859;Name=PPE27;gbkey=Gene;gene=PPE27;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1790
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2028425 2029477 . + 0 ID=cds-YP_177836.1;Parent=gene-Rv1790;Dbxref=Genbank:YP_177836.1,GeneID:885859;Name=YP_177836.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE27;locus_tag=Rv1790;product=PPE family protein PPE27;protein_id=YP_177836.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2029904 2030203 . + . ID=gene-Rv1791;Dbxref=GeneID:885445;Name=PE19;gbkey=Gene;gene=PE19;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1791
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2029904 2030203 . + 0 ID=cds-YP_177837.1;Parent=gene-Rv1791;Dbxref=Genbank:YP_177837.1,GeneID:885445;Name=YP_177837.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE19;locus_tag=Rv1791;product=PE family protein PE19;protein_id=YP_177837.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2030347 2030643 . + . ID=gene-Rv1792;Dbxref=GeneID:886252;Name=esxM;gbkey=Gene;gene=esxM;gene_biotype=pseudogene;gene_synonym=QILSS,TB11.0;locus_tag=Rv1792;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2030694 2030978 . + . ID=gene-Rv1793;Dbxref=GeneID:885448;Name=esxN;gbkey=Gene;gene=esxN;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_5,Mtb9.9A;locus_tag=Rv1793
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2030694 2030978 . + 0 ID=cds-YP_177838.1;Parent=gene-Rv1793;Dbxref=Genbank:YP_177838.1,GeneID:885448;Name=YP_177838.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=esxN;locus_tag=Rv1793;product=ESAT-6 like protein EsxN;protein_id=YP_177838.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2031066 2031968 . + . ID=gene-Rv1794;Dbxref=GeneID:885881;Name=Rv1794;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1794
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2031066 2031968 . + 0 ID=cds-NP_216310.1;Parent=gene-Rv1794;Dbxref=Genbank:NP_216310.1,GeneID:885881;Name=NP_216310.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1794;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216310.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2032240 2033751 . + . ID=gene-Rv1795;Dbxref=GeneID:885628;Name=eccD5;gbkey=Gene;gene=eccD5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1795
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2042001 2043272 . + . ID=gene-Rv1801;Dbxref=GeneID:885491;Name=PPE29;gbkey=Gene;gene=PPE29;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1801
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2043384 2044775 . + . ID=gene-Rv1802;Dbxref=GeneID:885542;Name=PPE30;gbkey=Gene;gene=PPE30;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1802
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2044923 2046842 . - . ID=gene-Rv1803c;Dbxref=GeneID:885730;Name=PE_PGRS32;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS32;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1803c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2047023 2047349 . - . ID=gene-Rv1804c;Dbxref=GeneID:885588;Name=Rv1804c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1804c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2047687 2048034 . - . ID=gene-Rv1805c;Dbxref=GeneID:885470;Name=Rv1805c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1805c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2048072 2048371 . + . ID=gene-Rv1806;Dbxref=GeneID:885537;Name=PE20;gbkey=Gene;gene=PE20;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1806
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2048072 2048371 . + 0 ID=cds-YP_177843.1;Parent=gene-Rv1806;Dbxref=Genbank:YP_177843.1,GeneID:885537;Name=YP_177843.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=PE20;locus_tag=Rv1806;product=PE family protein PE20;protein_id=YP_177843.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2049921 2051150 . + . ID=gene-Rv1808;Dbxref=GeneID:885590;Name=PPE32;gbkey=Gene;gene=PPE32;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1808
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2049921 2051150 . + 0 ID=cds-YP_177844.1;Parent=gene-Rv1808;Dbxref=Genbank:YP_177844.1,GeneID:885590;Name=YP_177844.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PPE32;inference=protein motif:PROSITE:PS00343;locus_tag=Rv1808;product=PPE family protein PPE32;protein_id=YP_177844.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2051282 2052688 . + . ID=gene-Rv1809;Dbxref=GeneID:885555;Name=PPE33;gbkey=Gene;gene=PPE33;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1809
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2051282 2052688 . + 0 ID=cds-YP_177845.1;Parent=gene-Rv1809;Dbxref=Genbank:YP_177845.1,GeneID:885555;Name=YP_177845.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PPE33;locus_tag=Rv1809;product=PPE family protein PPE33;protein_id=YP_177845.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2052933 2053289 . + . ID=gene-Rv1810;Dbxref=GeneID:885591;Name=Rv1810;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1810
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2052933 2053289 . + 0 ID=cds-NP_216326.1;Parent=gene-Rv1810;Dbxref=Genbank:NP_216326.1,GeneID:885591;Name=NP_216326.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1810;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216326.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2053443 2054147 . + . ID=gene-Rv1811;Dbxref=GeneID:885439;Name=mgtC;gbkey=Gene;gene=mgtC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1811
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2053443 2054147 . + 0 ID=cds-NP_216327.1;Parent=gene-Rv1811;Dbxref=Genbank:NP_216327.1,GeneID:885439;Name=NP_216327.1;gbkey=CDS;gene=mgtC;locus_tag=Rv1811;product=Mg2+ transport P-type ATPase MgtC;protein_id=NP_216327.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2054157 2055359 . - . ID=gene-Rv1812c;Dbxref=GeneID:885487;Name=Rv1812c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1812c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2054157 2055359 . - 0 ID=cds-NP_216328.1;Parent=gene-Rv1812c;Dbxref=Genbank:NP_216328.1,GeneID:885487;Name=NP_216328.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1812c;product=dehydrogenase;protein_id=NP_216328.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2055681 2056112 . - . ID=gene-Rv1813c;Dbxref=GeneID:885546;Name=Rv1813c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1813c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2055681 2056112 . - 0 ID=cds-NP_216329.1;Parent=gene-Rv1813c;Dbxref=Genbank:NP_216329.1,GeneID:885546;Name=NP_216329.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1813c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216329.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2056521 2057423 . + . ID=gene-Rv1814;Dbxref=GeneID:885880;Name=erg3;gbkey=Gene;gene=erg3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1814
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2056521 2057423 . + 0 ID=cds-NP_216330.1;Parent=gene-Rv1814;Dbxref=Genbank:NP_216330.1,GeneID:885880;Name=NP_216330.1;Note=Erg3 (sterol-C5-desaturase);gbkey=CDS;gene=erg3;locus_tag=Rv1814;product=membrane-bound C-5 sterol desaturase;protein_id=NP_216330.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2057528 2058193 . + . ID=gene-Rv1815;Dbxref=GeneID:885430;Name=Rv1815;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1815
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2057528 2058193 . + 0 ID=cds-NP_216331.1;Parent=gene-Rv1815;Dbxref=Genbank:NP_216331.1,GeneID:885430;Name=NP_216331.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1815;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216331.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2058256 2058960 . + . ID=gene-Rv1816;Dbxref=GeneID:885340;Name=Rv1816;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1816
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2058256 2058960 . + 0 ID=cds-NP_216332.1;Parent=gene-Rv1816;Dbxref=Genbank:NP_216332.1,GeneID:885340;Name=NP_216332.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1816;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_216332.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2059441 2059498 . + . ID=id-NC_000962.3:2059441..2059498;Note=58 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2059518 2059575 . + . ID=id-NC_000962.3:2059518..2059575;Note=58 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2059595 2061058 . + . ID=gene-Rv1817;Dbxref=GeneID:885548;Name=Rv1817;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1817
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2059595 2061058 . + 0 ID=cds-NP_216333.1;Parent=gene-Rv1817;Dbxref=Genbank:NP_216333.1,GeneID:885548;Name=NP_216333.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1817;product=flavoprotein;protein_id=NP_216333.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2061178 2062674 . - . ID=gene-Rv1818c;Dbxref=GeneID:885551;Name=PE_PGRS33;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS33;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1818c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2061178 2062674 . - 0 ID=cds-YP_177846.1;Parent=gene-Rv1818c;Dbxref=Genbank:YP_177846.1,GeneID:885551;Name=YP_177846.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS33;inference=protein motif:PROSITE:PS00583;locus_tag=Rv1818c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS33;protein_id=YP_177846.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2062809 2064728 . - . ID=gene-Rv1819c;Dbxref=GeneID:885539;Name=bacA;gbkey=Gene;gene=bacA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1819c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2062809 2064728 . - 0 ID=cds-NP_216335.1;Parent=gene-Rv1819c;Dbxref=Genbank:NP_216335.1,GeneID:885539;Name=NP_216335.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:23407640];gbkey=CDS;gene=bacA;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1819c;product=vitamin B12 transport ATP-binding protein BacA;protein_id=NP_216335.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2064799 2066442 . + . ID=gene-Rv1820;Dbxref=GeneID:885738;Name=ilvG;gbkey=Gene;gene=ilvG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1820
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2064799 2066442 . + 0 ID=cds-NP_216336.1;Parent=gene-Rv1820;Dbxref=Genbank:NP_216336.1,GeneID:885738;Name=NP_216336.1;Note=acetohydroxy-acid synthase(ALS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ilvG;inference=protein motif:PROSITE:PS00187;locus_tag=Rv1820;product=acetolactate synthase large subunit IlvG;protein_id=NP_216336.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2066457 2068883 . + . ID=gene-Rv1821;Dbxref=GeneID:885594;Name=secA2;gbkey=Gene;gene=secA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1821
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2066457 2068883 . + 0 ID=cds-NP_216337.1;Parent=gene-Rv1821;Dbxref=Genbank:NP_216337.1,GeneID:885594;Name=NP_216337.1;Note=component of secretion apparatus;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis[PMID:11713254];gbkey=CDS;gene=secA2;locus_tag=Rv1821;product=accessory Sec system translocase SecA2;protein_id=NP_216337.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2069080 2069709 . + . ID=gene-Rv1822;Dbxref=GeneID:885126;Name=pgsA2;gbkey=Gene;gene=pgsA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1822
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2069080 2069709 . + 0 ID=cds-NP_216338.1;Parent=gene-Rv1822;Dbxref=Genbank:NP_216338.1,GeneID:885126;Name=NP_216338.1;Note=2 (PGP synthase) (phosphatidylglycerophosphate synthase) (3-phosphatidyl-1'-glycerol-3'phosphate synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10889206];gbkey=CDS;gene=pgsA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00379;locus_tag=Rv1822;product=CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase;protein_id=NP_216338.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2069702 2070625 . + . ID=gene-Rv1823;Dbxref=GeneID:885547;Name=Rv1823;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1823
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2074841 2075518 . + . ID=gene-Rv1830;Dbxref=GeneID:885740;Name=Rv1830;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1830
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2075571 2075828 . + . ID=gene-Rv1831;Dbxref=GeneID:885718;Name=Rv1831;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1831
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2075877 2078702 . + . ID=gene-Rv1832;Dbxref=GeneID:885716;Name=gcvB;gbkey=Gene;gene=gcvB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1832
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2075877 2078702 . + 0 ID=cds-NP_216348.1;Parent=gene-Rv1832;Dbxref=Genbank:NP_216348.1,GeneID:885716;Name=NP_216348.1;Note=glycine decarboxylase (glycine cleavage system P-protein)%2Cglycine dehydrogenase [decarboxylating]. The glycine cleavage system is composed of four proteins: P%2C T%2C L%2C and H;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gcvB;locus_tag=Rv1832;product=glycine dehydrogenase;protein_id=NP_216348.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2078929 2079789 . - . ID=gene-Rv1833c;Dbxref=GeneID:885737;Name=Rv1833c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1833c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2079830 2080696 . + . ID=gene-Rv1834;Dbxref=GeneID:888761;Name=lipZ;gbkey=Gene;gene=lipZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1834
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2080701 2082587 . - . ID=gene-Rv1835c;Dbxref=GeneID:885877;Name=Rv1835c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1835c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2082603 2084636 . - . ID=gene-Rv1836c;Dbxref=GeneID:885707;Name=Rv1836c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1836c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2082603 2084636 . - 0 ID=cds-NP_216352.1;Parent=gene-Rv1836c;Dbxref=Genbank:NP_216352.1,GeneID:885707;Name=NP_216352.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00036;locus_tag=Rv1836c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216352.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2087257 2087652 . - . ID=gene-Rv1838c;Dbxref=GeneID:885744;Name=vapC13;gbkey=Gene;gene=vapC13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1838c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2087257 2087652 . - 0 ID=cds-NP_216354.1;Parent=gene-Rv1838c;Dbxref=Genbank:NP_216354.1,GeneID:885744;Name=NP_216354.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1839c%2C contains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC13;locus_tag=Rv1838c;product=ribonuclease VapC13;protein_id=NP_216354.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2087649 2087912 . - . ID=gene-Rv1839c;Dbxref=GeneID:885750;Name=vapB13;gbkey=Gene;gene=vapB13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1839c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2087649 2087912 . - 0 ID=cds-NP_216355.1;Parent=gene-Rv1839c;Dbxref=Genbank:NP_216355.1,GeneID:885750;Name=NP_216355.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1838c;gbkey=CDS;gene=vapB13;locus_tag=Rv1839c;product=antitoxin VapB13;protein_id=NP_216355.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2087971 2089518 . - . ID=gene-Rv1840c;Dbxref=GeneID:885753;Name=PE_PGRS34;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS34;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1840c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2087971 2089518 . - 0 ID=cds-YP_177847.1;Parent=gene-Rv1840c;Dbxref=Genbank:YP_177847.1,GeneID:885753;Name=YP_177847.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS34;locus_tag=Rv1840c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS34;protein_id=YP_177847.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2089681 2090718 . - . ID=gene-Rv1841c;Dbxref=GeneID:885656;Name=Rv1841c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1841c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2089681 2090718 . - 0 ID=cds-NP_216357.1;Parent=gene-Rv1841c;Dbxref=Genbank:NP_216357.1,GeneID:885656;Name=NP_216357.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1841c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216357.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2090718 2092085 . - . ID=gene-Rv1842c;Dbxref=GeneID:885739;Name=Rv1842c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1842c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2090718 2092085 . - 0 ID=cds-NP_216358.1;Parent=gene-Rv1842c;Dbxref=Genbank:NP_216358.1,GeneID:885739;Name=NP_216358.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1842c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216358.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2092259 2093698 . - . ID=gene-Rv1843c;Dbxref=GeneID:885714;Name=guaB1;gbkey=Gene;gene=guaB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1843c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2092259 2093698 . - 0 ID=cds-NP_216359.1;Parent=gene-Rv1843c;Dbxref=Genbank:NP_216359.1,GeneID:885714;Name=NP_216359.1;Note=imp dehydrogenase (IMPDH) (IMPD);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=guaB1;locus_tag=Rv1843c;product=inosine-5'-monophosphate dehydrogenase;protein_id=NP_216359.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2093731 2095188 . - 0 ID=cds-YP_177848.1;Parent=gene-Rv1844c;Dbxref=Genbank:YP_177848.1,GeneID:885755;Name=YP_177848.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=gnd1;locus_tag=Rv1844c;product=6-phosphogluconate dehydrogenase;protein_id=YP_177848.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2095218 2096168 . - . ID=gene-Rv1845c;Dbxref=GeneID:885370;Name=blaR;gbkey=Gene;gene=blaR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1845c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2095218 2096168 . - 0 ID=cds-NP_216361.1;Parent=gene-Rv1845c;Dbxref=Genbank:NP_216361.1,GeneID:885370;Name=NP_216361.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=blaR;locus_tag=Rv1845c;product=sensor-transducer protein BlaR;protein_id=NP_216361.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2096183 2096599 . - 0 ID=cds-NP_216362.1;Parent=gene-Rv1846c;Dbxref=Genbank:NP_216362.1,GeneID:885747;Name=NP_216362.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19154333];gbkey=CDS;gene=blaI;locus_tag=Rv1846c;product=transcriptional repressor BlaI;protein_id=NP_216362.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2096877 2097299 . + . ID=gene-Rv1847;Dbxref=GeneID:885734;Name=Rv1847;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1847
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2096877 2097299 . + 0 ID=cds-NP_216363.1;Parent=gene-Rv1847;Dbxref=Genbank:NP_216363.1,GeneID:885734;Name=NP_216363.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1847;product=esterase;protein_id=NP_216363.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2097348 2097650 . + . ID=gene-Rv1848;Dbxref=GeneID:885414;Name=ureA;gbkey=Gene;gene=ureA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1848
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2097348 2097650 . + 0 ID=cds-NP_216364.1;Parent=gene-Rv1848;Dbxref=Genbank:NP_216364.1,GeneID:885414;Name=NP_216364.1;Note=UreA (urea amidohydrolase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ureA;locus_tag=Rv1848;product=urease subunit gamma;protein_id=NP_216364.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2097647 2097961 . + . ID=gene-Rv1849;Dbxref=GeneID:885710;Name=ureB;gbkey=Gene;gene=ureB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1849
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2097647 2097961 . + 0 ID=cds-NP_216365.1;Parent=gene-Rv1849;Dbxref=Genbank:NP_216365.1,GeneID:885710;Name=NP_216365.1;Note=UreB%2C (urea amidohydrolase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:7559354];gbkey=CDS;gene=ureB;locus_tag=Rv1849;product=urease subunit beta;protein_id=NP_216365.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2097961 2099694 . + . ID=gene-Rv1850;Dbxref=GeneID:885359;Name=ureC;gbkey=Gene;gene=ureC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1850
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2097961 2099694 . + 0 ID=cds-NP_216366.1;Parent=gene-Rv1850;Dbxref=Genbank:NP_216366.1,GeneID:885359;Name=NP_216366.1;Note=UreC (urea amidohydrolase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:7559354];gbkey=CDS;gene=ureC;inference=protein motif:PROSITE:PS00145;locus_tag=Rv1850;product=urease subunit alpha;protein_id=NP_216366.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2099694 2100329 . + . ID=gene-Rv1851;Dbxref=GeneID:885532;Name=ureF;gbkey=Gene;gene=ureF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1851
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2099694 2100329 . + 0 ID=cds-NP_216367.1;Parent=gene-Rv1851;Dbxref=Genbank:NP_216367.1,GeneID:885532;Name=NP_216367.1;gbkey=CDS;gene=ureF;locus_tag=Rv1851;product=urease accessory protein UreF;protein_id=NP_216367.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2100340 2101014 . + . ID=gene-Rv1852;Dbxref=GeneID:885729;Name=ureG;gbkey=Gene;gene=ureG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1852
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2100340 2101014 . + 0 ID=cds-NP_216368.1;Parent=gene-Rv1852;Dbxref=Genbank:NP_216368.1,GeneID:885729;Name=NP_216368.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:17309280];gbkey=CDS;gene=ureG;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1852;product=urease accessory protein UreG;protein_id=NP_216368.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2101022 2101648 . + . ID=gene-Rv1853;Dbxref=GeneID:885705;Name=ureD;gbkey=Gene;gene=ureD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1853
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2101651 2103042 . - . ID=gene-Rv1854c;Dbxref=GeneID:885746;Name=ndh;gbkey=Gene;gene=ndh;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1854c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2103184 2104107 . - . ID=gene-Rv1855c;Dbxref=GeneID:885736;Name=Rv1855c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1855c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2103184 2104107 . - 0 ID=cds-NP_216371.1;Parent=gene-Rv1855c;Dbxref=Genbank:NP_216371.1,GeneID:885736;Name=NP_216371.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00217;locus_tag=Rv1855c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216371.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2104146 2104823 . - . ID=gene-Rv1856c;Dbxref=GeneID:885708;Name=Rv1856c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1856c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2104146 2104823 . - 0 ID=cds-NP_216372.1;Parent=gene-Rv1856c;Dbxref=Genbank:NP_216372.1,GeneID:885708;Name=NP_216372.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1856c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216372.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2104985 2105770 . + . ID=gene-Rv1857;Dbxref=GeneID:885655;Name=modA;gbkey=Gene;gene=modA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1857
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2104985 2105770 . + 0 ID=cds-NP_216373.1;Parent=gene-Rv1857;Dbxref=Genbank:NP_216373.1,GeneID:885655;Name=NP_216373.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=modA;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1857;product=molybdate ABC transporter substrate-binding lipoprotein ModA;protein_id=NP_216373.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2105773 2106567 . + . ID=gene-Rv1858;Dbxref=GeneID:885723;Name=modB;gbkey=Gene;gene=modB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1858
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2105773 2106567 . + 0 ID=cds-NP_216374.1;Parent=gene-Rv1858;Dbxref=Genbank:NP_216374.1,GeneID:885723;Name=NP_216374.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=modB;locus_tag=Rv1858;product=molybdenum ABC transporter permease ModB;protein_id=NP_216374.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2106574 2107683 . + . ID=gene-Rv1859;Dbxref=GeneID:885731;Name=modC;gbkey=Gene;gene=modC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1859
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2106574 2107683 . + 0 ID=cds-NP_216375.1;Parent=gene-Rv1859;Dbxref=Genbank:NP_216375.1,GeneID:885731;Name=NP_216375.1;gbkey=CDS;gene=modC;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv1859;product=molybdenum ABC transporter ATP-binding protein ModC;protein_id=NP_216375.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2107736 2108713 . + . ID=gene-Rv1860;Dbxref=GeneID:885896;Name=apa;gbkey=Gene;gene=apa;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=modD,mpt32;locus_tag=Rv1860
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2107736 2108713 . + 0 ID=cds-YP_177849.1;Parent=gene-Rv1860;Dbxref=Genbank:YP_177849.1,GeneID:885896;Name=YP_177849.1;Note=fibronectin attachment protein (immunogenic protein MPT32) (antigen MPT-32) (45-kDa glycoprotein) (45/47 kDa antigen) Known to be glycosylated fibronectin-binding protein (see some citations). Changes in the mannosylation pattern of this protein affect its ability to stimulate T-lymphocyte response. Major immunodominant antigen that has potential as a vaccine against tuberculosis. APA-ELISA could be used in diagnosis.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:11282194];gbkey=CDS;gene=apa;locus_tag=Rv1860;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177849.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2109165 2109470 . + . ID=gene-Rv1861;Dbxref=GeneID:885741;Name=Rv1861;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1861
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2109165 2109470 . + 0 ID=cds-NP_216377.1;Parent=gene-Rv1861;Dbxref=Genbank:NP_216377.1,GeneID:885741;Name=NP_216377.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv1861;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216377.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2109544 2110584 . + . ID=gene-Rv1862;Dbxref=GeneID:885652;Name=adhA;gbkey=Gene;gene=adhA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1862
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2109544 2110584 . + 0 ID=cds-NP_216378.1;Parent=gene-Rv1862;Dbxref=Genbank:NP_216378.1,GeneID:885652;Name=NP_216378.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=adhA;inference=protein motif:PROSITE:PS00059;locus_tag=Rv1862;product=alcohol dehydrogenase A;protein_id=NP_216378.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2110591 2111361 . - . ID=gene-Rv1863c;Dbxref=GeneID:885722;Name=Rv1863c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1863c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2110591 2111361 . - 0 ID=cds-NP_216379.1;Parent=gene-Rv1863c;Dbxref=Genbank:NP_216379.1,GeneID:885722;Name=NP_216379.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1863c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216379.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2111354 2112109 . - . ID=gene-Rv1864c;Dbxref=GeneID:885800;Name=Rv1864c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1864c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2111354 2112109 . - 0 ID=cds-NP_216380.1;Parent=gene-Rv1864c;Dbxref=Genbank:NP_216380.1,GeneID:885800;Name=NP_216380.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1864c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216380.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2112106 2112966 . - . ID=gene-Rv1865c;Dbxref=GeneID:885806;Name=Rv1865c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1865c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2112106 2112966 . - 0 ID=cds-NP_216381.1;Parent=gene-Rv1865c;Dbxref=Genbank:NP_216381.1,GeneID:885806;Name=NP_216381.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1865c;product=short-chain type dehydrogenase;protein_id=NP_216381.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2113140 2115476 . + . ID=gene-Rv1866;Dbxref=GeneID:885733;Name=Rv1866;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1866
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2113140 2115476 . + 0 ID=cds-NP_216382.3;Parent=gene-Rv1866;Dbxref=Genbank:NP_216382.3,GeneID:885733;Name=NP_216382.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1866;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216382.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2115764 2117248 . + . ID=gene-Rv1867;Dbxref=GeneID:885704;Name=Rv1867;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1867
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2115764 2117248 . + 0 ID=cds-NP_216383.1;Parent=gene-Rv1867;Dbxref=Genbank:NP_216383.1,GeneID:885704;Name=NP_216383.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1867;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216383.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2117347 2119446 . + . ID=gene-Rv1868;Dbxref=GeneID:885757;Name=Rv1868;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1868
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2117347 2119446 . + 0 ID=cds-NP_216384.1;Parent=gene-Rv1868;Dbxref=Genbank:NP_216384.1,GeneID:885757;Name=NP_216384.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1868;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216384.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2119460 2120695 . - . ID=gene-Rv1869c;Dbxref=GeneID:885796;Name=Rv1869c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1869c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2119460 2120695 . - 0 ID=cds-NP_216385.1;Parent=gene-Rv1869c;Dbxref=Genbank:NP_216385.1,GeneID:885796;Name=NP_216385.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1869c;product=reductase;protein_id=NP_216385.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2120795 2121430 . - . ID=gene-Rv1870c;Dbxref=GeneID:885797;Name=Rv1870c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1870c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2120795 2121430 . - 0 ID=cds-NP_216386.1;Parent=gene-Rv1870c;Dbxref=Genbank:NP_216386.1,GeneID:885797;Name=NP_216386.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:16000731];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1870c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216386.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2121495 2121884 . - . ID=gene-Rv1871c;Dbxref=GeneID:885804;Name=Rv1871c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1871c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2121495 2121884 . - 0 ID=cds-NP_216387.1;Parent=gene-Rv1871c;Dbxref=Genbank:NP_216387.1,GeneID:885804;Name=NP_216387.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1871c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216387.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2121907 2123151 . - . ID=gene-Rv1872c;Dbxref=GeneID:885754;Name=lldD2;gbkey=Gene;gene=lldD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1872c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2121907 2123151 . - 0 ID=cds-NP_216388.1;Parent=gene-Rv1872c;Dbxref=Genbank:NP_216388.1,GeneID:885754;Name=NP_216388.1;Note=Belongs to the FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenases family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lldD2;inference=protein motif:PROSITE:PS00557;locus_tag=Rv1872c;product=L-lactate dehydrogenase;protein_id=NP_216388.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2123174 2123611 . + . ID=gene-Rv1873;Dbxref=GeneID:885789;Name=Rv1873;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1873
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2123174 2123611 . + 0 ID=cds-NP_216389.1;Parent=gene-Rv1873;Dbxref=Genbank:NP_216389.1,GeneID:885789;Name=NP_216389.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1873;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216389.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2123684 2124370 . + . ID=gene-Rv1874;Dbxref=GeneID:885748;Name=Rv1874;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1874
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2123684 2124370 . + 0 ID=cds-NP_216390.3;Parent=gene-Rv1874;Dbxref=Genbank:NP_216390.3,GeneID:885748;Name=NP_216390.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1874;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216390.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2124381 2124824 . + . ID=gene-Rv1875;Dbxref=GeneID:885793;Name=Rv1875;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1875
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2124381 2124824 . + 0 ID=cds-NP_216391.1;Parent=gene-Rv1875;Dbxref=Genbank:NP_216391.1,GeneID:885793;Name=NP_216391.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1875;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216391.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2125340 2125819 . + . ID=gene-Rv1876;Dbxref=GeneID:885767;Name=bfrA;gbkey=Gene;gene=bfrA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=bfr;locus_tag=Rv1876
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2125340 2125819 . + 0 ID=cds-NP_216392.1;Parent=gene-Rv1876;Dbxref=Genbank:NP_216392.1,GeneID:885767;Name=NP_216392.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=bfrA;locus_tag=Rv1876;product=bacterioferritin BfrA;protein_id=NP_216392.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2125904 2127967 . + . ID=gene-Rv1877;Dbxref=GeneID:885654;Name=Rv1877;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1877
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2125904 2127967 . + 0 ID=cds-NP_216393.1;Parent=gene-Rv1877;Dbxref=Genbank:NP_216393.1,GeneID:885654;Name=NP_216393.1;Note=integral membrane protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00217;locus_tag=Rv1877;product=MFS-type transporter;protein_id=NP_216393.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2128022 2129374 . + . ID=gene-Rv1878;Dbxref=GeneID:885761;Name=glnA3;gbkey=Gene;gene=glnA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1878
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2128022 2129374 . + 0 ID=cds-NP_216394.1;Parent=gene-Rv1878;Dbxref=Genbank:NP_216394.1,GeneID:885761;Name=NP_216394.1;Note=glutamine synthetase class I;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=glnA3;locus_tag=Rv1878;product=glutamine synthetase GlnA;protein_id=NP_216394.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2129377 2130513 . + . ID=gene-Rv1879;Dbxref=GeneID:885650;Name=Rv1879;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1879
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2129377 2130513 . + 0 ID=cds-NP_216395.1;Parent=gene-Rv1879;Dbxref=Genbank:NP_216395.1,GeneID:885650;Name=NP_216395.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1879;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216395.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2130541 2131857 . - . ID=gene-Rv1880c;Dbxref=GeneID:885758;Name=cyp140;gbkey=Gene;gene=cyp140;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1880c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2130541 2131857 . - 0 ID=cds-NP_216396.3;Parent=gene-Rv1880c;Dbxref=Genbank:NP_216396.3,GeneID:885758;Name=NP_216396.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cyp140;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv1880c;product=cytochrome P450 Cyp140;protein_id=NP_216396.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2131907 2132329 . - . ID=gene-Rv1881c;Dbxref=GeneID:885762;Name=lppE;gbkey=Gene;gene=lppE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1881c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2131907 2132329 . - 0 ID=cds-NP_216397.1;Parent=gene-Rv1881c;Dbxref=Genbank:NP_216397.1,GeneID:885762;Name=NP_216397.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppE;locus_tag=Rv1881c;product=lipoprotein LppE;protein_id=NP_216397.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2132370 2133203 . - . ID=gene-Rv1882c;Dbxref=GeneID:885782;Name=Rv1882c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1882c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2132370 2133203 . - 0 ID=cds-NP_216398.1;Parent=gene-Rv1882c;Dbxref=Genbank:NP_216398.1,GeneID:885782;Name=NP_216398.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1882c;product=short-chain type dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_216398.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2133231 2133692 . - . ID=gene-Rv1883c;Dbxref=GeneID:885484;Name=Rv1883c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1883c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2133231 2133692 . - 0 ID=cds-NP_216399.1;Parent=gene-Rv1883c;Dbxref=Genbank:NP_216399.1,GeneID:885484;Name=NP_216399.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1883c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216399.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2133731 2134261 . - . ID=gene-Rv1884c;Dbxref=GeneID:885759;Name=rpfC;gbkey=Gene;gene=rpfC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1884c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2133731 2134261 . - 0 ID=cds-NP_216400.1;Parent=gene-Rv1884c;Dbxref=Genbank:NP_216400.1,GeneID:885759;Name=NP_216400.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18186793];gbkey=CDS;gene=rpfC;locus_tag=Rv1884c;product=resuscitation-promoting factor RpfC;protein_id=NP_216400.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2134273 2134872 . - . ID=gene-Rv1885c;Dbxref=GeneID:885772;Name=Rv1885c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=*MtCM;locus_tag=Rv1885c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2134273 2134872 . - 0 ID=cds-NP_216401.1;Parent=gene-Rv1885c;Dbxref=Genbank:NP_216401.1,GeneID:885772;Name=NP_216401.1;Note=chorismate mutase%2C AroQ class%3B secreted%2C possible role in host-pathogen interactions;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15654876];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1885c;product=chorismate mutase;protein_id=NP_216401.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2134890 2135867 . - . ID=gene-Rv1886c;Dbxref=GeneID:885785;Name=fbpB;gbkey=Gene;gene=fbpB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=85B,mpt59;locus_tag=Rv1886c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2134890 2135867 . - 0 ID=cds-NP_216402.1;Parent=gene-Rv1886c;Dbxref=Genbank:NP_216402.1,GeneID:885785;Name=NP_216402.1;Note=FbpB Secreted antigen 85-B FbpB (85B) (antigen 85 complex B) (mycolyl transferase 85B) (fibronectin-binding protein B) (extracellular alpha-antigen)%3B binds fibronectin facilitating attachment to host cells%3B also involved in maintaining cell wall integrity through the transfer of mycolyic acids;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:12010501];gbkey=CDS;gene=fbpB;locus_tag=Rv1886c;product=diacylglycerol acyltransferase/mycolyltransferase Ag85B;protein_id=NP_216402.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2136258 2137400 . + . ID=gene-Rv1887;Dbxref=GeneID:885247;Name=Rv1887;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1887
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2136258 2137400 . + 0 ID=cds-NP_216403.1;Parent=gene-Rv1887;Dbxref=Genbank:NP_216403.1,GeneID:885247;Name=NP_216403.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00639;locus_tag=Rv1887;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216403.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2137370 2138079 . + . ID=gene-Rv1887a;Dbxref=GeneID:19394675;Name=Rv1887a;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv1887a;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2138174 2138617 . - . ID=gene-Rv1888A;Dbxref=GeneID:3205115;Name=Rv1888A;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv1888A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2139076 2139687 . - . ID=gene-Rv1890c;Dbxref=GeneID:885786;Name=Rv1890c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1890c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2139076 2139687 . - 0 ID=cds-NP_216406.1;Parent=gene-Rv1890c;Dbxref=Genbank:NP_216406.1,GeneID:885786;Name=NP_216406.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1890c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216406.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2139419 2139656 . + . ID=gene-RVnc0001;Dbxref=GeneID:14515861;Name=AS1890;gbkey=Gene;gene=AS1890;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0001
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 2139419 2139656 . + . ID=rna-RVnc0001;Parent=gene-RVnc0001;Dbxref=GeneID:14515861;Note=AS1890%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 2139466%2C2139548%2C 2139594.;gbkey=ncRNA;gene=AS1890;locus_tag=RVnc0001;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 2139419 2139656 . + . ID=exon-RVnc0001-1;Parent=rna-RVnc0001;Dbxref=GeneID:14515861;Note=AS1890%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 2139466%2C2139548%2C 2139594.;gbkey=ncRNA;gene=AS1890;locus_tag=RVnc0001;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 2139741 2140148 . + . ID=gene-Rv1891;Dbxref=GeneID:885094;Name=Rv1891;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1891
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2139741 2140148 . + 0 ID=cds-NP_216407.1;Parent=gene-Rv1891;Dbxref=Genbank:NP_216407.1,GeneID:885094;Name=NP_216407.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1891;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216407.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2140165 2140476 . + . ID=gene-Rv1892;Dbxref=GeneID:885090;Name=Rv1892;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1892
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2140165 2140476 . + 0 ID=cds-NP_216408.1;Parent=gene-Rv1892;Dbxref=Genbank:NP_216408.1,GeneID:885090;Name=NP_216408.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1892;product=membrane protein;protein_id=NP_216408.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2140486 2140704 . + . ID=gene-Rv1893;Dbxref=GeneID:885269;Name=Rv1893;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1893
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2140486 2140704 . + 0 ID=cds-NP_216409.1;Parent=gene-Rv1893;Dbxref=Genbank:NP_216409.1,GeneID:885269;Name=NP_216409.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1893;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216409.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2140739 2141869 . - . ID=gene-Rv1894c;Dbxref=GeneID:885081;Name=Rv1894c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1894c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2140739 2141869 . - 0 ID=cds-NP_216410.1;Parent=gene-Rv1894c;Dbxref=Genbank:NP_216410.1,GeneID:885081;Name=NP_216410.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1894c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216410.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2142521 2143675 . + . ID=gene-Rv1895;Dbxref=GeneID:885148;Name=Rv1895;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1895
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2142521 2143675 . + 0 ID=cds-NP_216411.1;Parent=gene-Rv1895;Dbxref=Genbank:NP_216411.1,GeneID:885148;Name=NP_216411.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1895;product=zinc-binding alcohol dehydrogenase;protein_id=NP_216411.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2143535 2144446 . - . ID=gene-Rv1896c;Dbxref=GeneID:885915;Name=Rv1896c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1896c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2143535 2144446 . - 0 ID=cds-NP_216412.1;Parent=gene-Rv1896c;Dbxref=Genbank:NP_216412.1,GeneID:885915;Name=NP_216412.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1896c;product=S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_216412.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2144451 2144882 . - . ID=gene-Rv1897c;Dbxref=GeneID:885893;Name=Rv1897c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1897c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2144451 2144882 . - 0 ID=cds-NP_216413.1;Parent=gene-Rv1897c;Dbxref=Genbank:NP_216413.1,GeneID:885893;Name=NP_216413.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1897c;product=D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase;protein_id=NP_216413.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2144940 2145248 . + . ID=gene-Rv1898;Dbxref=GeneID:885089;Name=Rv1898;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1898
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2144940 2145248 . + 0 ID=cds-NP_216414.1;Parent=gene-Rv1898;Dbxref=Genbank:NP_216414.1,GeneID:885089;Name=NP_216414.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1898;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216414.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2145214 2146245 . - . ID=gene-Rv1899c;Dbxref=GeneID:885138;Name=lppD;gbkey=Gene;gene=lppD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1899c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2145214 2146245 . - 0 ID=cds-NP_216415.1;Parent=gene-Rv1899c;Dbxref=Genbank:NP_216415.1,GeneID:885138;Name=NP_216415.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=lppD;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1899c;product=lipoprotein LppD;protein_id=NP_216415.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2146245 2147633 . - . ID=gene-Rv1900c;Dbxref=GeneID:885151;Name=lipJ;gbkey=Gene;gene=lipJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1900c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2146245 2147633 . - 0 ID=cds-NP_216416.1;Parent=gene-Rv1900c;Dbxref=Genbank:NP_216416.1,GeneID:885151;Name=NP_216416.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lipJ;locus_tag=Rv1900c;product=lignin peroxidase LipJ;protein_id=NP_216416.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2147662 2148954 . + . ID=gene-Rv1901;Dbxref=GeneID:885149;Name=cinA;gbkey=Gene;gene=cinA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1901
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2147662 2148954 . + 0 ID=cds-NP_216417.1;Parent=gene-Rv1901;Dbxref=Genbank:NP_216417.1,GeneID:885149;Name=NP_216417.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cinA;locus_tag=Rv1901;product=competence damage-inducible protein CinA;protein_id=NP_216417.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2149006 2150274 . - . ID=gene-Rv1902c;Dbxref=GeneID:885057;Name=nanT;gbkey=Gene;gene=nanT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1902c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2149006 2150274 . - 0 ID=cds-NP_216418.1;Parent=gene-Rv1902c;Dbxref=Genbank:NP_216418.1,GeneID:885057;Name=NP_216418.1;gbkey=CDS;gene=nanT;inference=protein motif:PROSITE:PS00217;locus_tag=Rv1902c;product=sialic acid-transport integral membrane protein NanT;protein_id=NP_216418.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2150364 2150768 . + . ID=gene-Rv1903;Dbxref=GeneID:885643;Name=Rv1903;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1903
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2150364 2150768 . + 0 ID=cds-NP_216419.1;Parent=gene-Rv1903;Dbxref=Genbank:NP_216419.1,GeneID:885643;Name=NP_216419.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1903;product=membrane protein;protein_id=NP_216419.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2150954 2151385 . + . ID=gene-Rv1904;Dbxref=GeneID:885281;Name=Rv1904;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1904
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2150954 2151385 . + 0 ID=cds-NP_216420.1;Parent=gene-Rv1904;Dbxref=Genbank:NP_216420.1,GeneID:885281;Name=NP_216420.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1904;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216420.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2151433 2152395 . - . ID=gene-Rv1905c;Dbxref=GeneID:885504;Name=aao;gbkey=Gene;gene=aao;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1905c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2151433 2152395 . - 0 ID=cds-NP_216421.1;Parent=gene-Rv1905c;Dbxref=Genbank:NP_216421.1,GeneID:885504;Name=NP_216421.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=aao;locus_tag=Rv1905c;product=D-amino acid oxidase;protein_id=NP_216421.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2152425 2152895 . - . ID=gene-Rv1906c;Dbxref=GeneID:885514;Name=Rv1906c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1906c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2152425 2152895 . - 0 ID=cds-NP_216422.1;Parent=gene-Rv1906c;Dbxref=Genbank:NP_216422.1,GeneID:885514;Name=NP_216422.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1906c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216422.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2153235 2153882 . - . ID=gene-Rv1907c;Dbxref=GeneID:885402;Name=Rv1907c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1907c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2153235 2153882 . - 0 ID=cds-NP_216423.1;Parent=gene-Rv1907c;Dbxref=Genbank:NP_216423.1,GeneID:885402;Name=NP_216423.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1907c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216423.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2153889 2156111 . - . ID=gene-Rv1908c;Dbxref=GeneID:885638;Name=katG;gbkey=Gene;gene=katG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1908c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2153889 2156111 . - 0 ID=cds-NP_216424.1;Parent=gene-Rv1908c;Dbxref=Genbank:NP_216424.1,GeneID:885638;Name=NP_216424.1;Note=KatG%2Ccatalase-peroxidase-peroxynitritase T. Belongs to the peroxidase family. Bacterial peroxidase/catalase subfamily. KATG transcription seems to be regulated by FURA|Rv1909c product. The catalase-peroxidase activity is associated with the amino-terminal domain but no definite function has been assigned to the carboxy-terminal domain.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=katG;inference=protein motif:PROSITE:PS00436;locus_tag=Rv1908c;product=catalase-peroxidase;protein_id=NP_216424.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2156149 2156592 . - . ID=gene-Rv1909c;Dbxref=GeneID:885400;Name=furA;gbkey=Gene;gene=furA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1909c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2156149 2156592 . - 0 ID=cds-NP_216425.2;Parent=gene-Rv1909c;Dbxref=Genbank:NP_216425.2,GeneID:885400;Name=NP_216425.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=furA;locus_tag=Rv1909c;product=ferric uptake regulation protein FurA;protein_id=NP_216425.2;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2183866 2184957 . - 0 ID=cds-NP_216449.1;Parent=gene-Rv1933c;Dbxref=Genbank:NP_216449.1,GeneID:885394;Name=NP_216449.1;gbkey=CDS;gene=fadE18;locus_tag=Rv1933c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE18;protein_id=NP_216449.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2184959 2186188 . - 0 ID=cds-NP_216450.1;Parent=gene-Rv1934c;Dbxref=Genbank:NP_216450.1,GeneID:885379;Name=NP_216450.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fadE17;locus_tag=Rv1934c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE17;protein_id=NP_216450.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2186203 2187159 . - . ID=gene-Rv1935c;Dbxref=GeneID:885240;Name=echA13;gbkey=Gene;gene=echA13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1935c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2186203 2187159 . - 0 ID=cds-NP_216451.1;Parent=gene-Rv1935c;Dbxref=Genbank:NP_216451.1,GeneID:885240;Name=NP_216451.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=echA13;locus_tag=Rv1935c;product=enoyl-CoA hydratase EchA13;protein_id=NP_216451.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2187384 2188493 . + . ID=gene-Rv1936;Dbxref=GeneID:885882;Name=Rv1936;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1936
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2187384 2188493 . + 0 ID=cds-NP_216452.1;Parent=gene-Rv1936;Dbxref=Genbank:NP_216452.1,GeneID:885882;Name=NP_216452.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1936;product=monooxygenase;protein_id=NP_216452.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2188496 2191015 . + . ID=gene-Rv1937;Dbxref=GeneID:885433;Name=Rv1937;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1937
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2188496 2191015 . + 0 ID=cds-NP_216453.1;Parent=gene-Rv1937;Dbxref=Genbank:NP_216453.1,GeneID:885433;Name=NP_216453.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00197;locus_tag=Rv1937;product=oxygenase;protein_id=NP_216453.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2191027 2192097 . + . ID=gene-Rv1938;Dbxref=GeneID:885392;Name=ephB;gbkey=Gene;gene=ephB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1938
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2191027 2192097 . + 0 ID=cds-NP_216454.1;Parent=gene-Rv1938;Dbxref=Genbank:NP_216454.1,GeneID:885392;Name=NP_216454.1;Note=epoxide hydratase;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:18585390];gbkey=CDS;gene=ephB;locus_tag=Rv1938;product=epoxide hydrolase EphB;protein_id=NP_216454.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2192094 2192609 . + . ID=gene-Rv1939;Dbxref=GeneID:885488;Name=Rv1939;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1939
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2192094 2192609 . + 0 ID=cds-NP_216455.1;Parent=gene-Rv1939;Dbxref=Genbank:NP_216455.1,GeneID:885488;Name=NP_216455.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1939;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216455.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2192606 2193667 . + . ID=gene-Rv1940;Dbxref=GeneID:885621;Name=ribA1;gbkey=Gene;gene=ribA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ribA;locus_tag=Rv1940
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2192606 2193667 . + 0 ID=cds-YP_177851.1;Parent=gene-Rv1940;Dbxref=Genbank:YP_177851.1,GeneID:885621;Name=YP_177851.1;Note=GTP cyclohydrolase II;gbkey=CDS;gene=ribA1;locus_tag=Rv1940;product=riboflavin biosynthesis protein RibA;protein_id=YP_177851.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2193664 2194434 . + . ID=gene-Rv1941;Dbxref=GeneID:885622;Name=Rv1941;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1941
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2193664 2194434 . + 0 ID=cds-NP_216457.1;Parent=gene-Rv1941;Dbxref=Genbank:NP_216457.1,GeneID:885622;Name=NP_216457.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv1941;product=short-chain type dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_216457.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2194644 2194973 . - . ID=gene-Rv1942c;Dbxref=GeneID:885606;Name=mazF5;gbkey=Gene;gene=mazF5;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt5;locus_tag=Rv1942c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2194644 2194973 . - 0 ID=cds-NP_216458.1;Parent=gene-Rv1942c;Dbxref=Genbank:NP_216458.1,GeneID:885606;Name=NP_216458.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1943c;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mazF5;locus_tag=Rv1942c;product=toxin MazF5;protein_id=NP_216458.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2194970 2195347 . - . ID=gene-Rv1943c;Dbxref=GeneID:885605;Name=mazE5;gbkey=Gene;gene=mazE5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1943c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2194970 2195347 . - 0 ID=cds-NP_216459.1;Parent=gene-Rv1943c;Dbxref=Genbank:NP_216459.1,GeneID:885605;Name=NP_216459.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1942;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mazE5;locus_tag=Rv1943c;product=antitoxin MazE5;protein_id=NP_216459.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2195344 2195934 . - . ID=gene-Rv1944c;Dbxref=GeneID:885884;Name=Rv1944c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1944c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2195344 2195934 . - 0 ID=cds-NP_216460.1;Parent=gene-Rv1944c;Dbxref=Genbank:NP_216460.1,GeneID:885884;Name=NP_216460.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1944c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216460.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2195989 2197353 . + . ID=gene-Rv1945;Dbxref=GeneID:885980;Name=Rv1945;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1945
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2195989 2197353 . + 0 ID=cds-NP_216461.1;Parent=gene-Rv1945;Dbxref=Genbank:NP_216461.1,GeneID:885980;Name=NP_216461.1;Note=Member of Mycobacterium tuberculosis REP13E12 repeat family.;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1945;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216461.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2195989 2197350 . + . ID=id-Rv1945;Dbxref=GeneID:885980;Note=REP-7%2C len: 1362 nt. REP09F9%2C member of the REP13E12 family. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv1945
+NC_000962.3 RefSeq gene 2197508 2197960 . - . ID=gene-Rv1946c;Dbxref=GeneID:885979;Name=lppG;gbkey=Gene;gene=lppG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1946c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2197508 2197960 . - 0 ID=cds-NP_216462.1;Parent=gene-Rv1946c;Dbxref=Genbank:NP_216462.1,GeneID:885979;Name=NP_216462.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=lppG;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv1946c;product=lipoprotein;protein_id=NP_216462.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2198024 2198425 . + . ID=gene-Rv1947;Dbxref=GeneID:885976;Name=Rv1947;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1947
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2198024 2198425 . + 0 ID=cds-NP_216463.1;Parent=gene-Rv1947;Dbxref=Genbank:NP_216463.1,GeneID:885976;Name=NP_216463.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1947;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216463.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2198714 2199064 . - . ID=gene-Rv1948c;Dbxref=GeneID:885975;Name=Rv1948c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1948c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2198714 2199064 . - 0 ID=cds-NP_216464.1;Parent=gene-Rv1948c;Dbxref=Genbank:NP_216464.1,GeneID:885975;Name=NP_216464.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1948c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216464.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2199998 2200189 . - . ID=gene-Rv1950c;Dbxref=GeneID:885973;Name=Rv1950c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1950c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2199998 2200189 . - 0 ID=cds-NP_216466.1;Parent=gene-Rv1950c;Dbxref=Genbank:NP_216466.1,GeneID:885973;Name=NP_216466.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1950c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216466.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2200190 2200486 . - . ID=gene-Rv1951c;Dbxref=GeneID:885972;Name=Rv1951c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1951c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2200190 2200486 . - 0 ID=cds-NP_216467.1;Parent=gene-Rv1951c;Dbxref=Genbank:NP_216467.1,GeneID:885972;Name=NP_216467.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1951c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216467.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2200726 2200941 . + . ID=gene-Rv1952;Dbxref=GeneID:885971;Name=vapB14;gbkey=Gene;gene=vapB14;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1952
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2200726 2200941 . + 0 ID=cds-NP_216468.1;Parent=gene-Rv1952;Dbxref=Genbank:NP_216468.1,GeneID:885971;Name=NP_216468.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1953;gbkey=CDS;gene=vapB14;locus_tag=Rv1952;product=antitoxin VapB14;protein_id=NP_216468.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2200938 2201249 . + . ID=gene-Rv1953;Dbxref=GeneID:885970;Name=vapC14;gbkey=Gene;gene=vapC14;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1953
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2200938 2201249 . + 0 ID=cds-NP_216469.1;Parent=gene-Rv1953;Dbxref=Genbank:NP_216469.1,GeneID:885970;Name=NP_216469.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1952%2C contains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC14;locus_tag=Rv1953;product=ribonuclease VapC14;protein_id=NP_216469.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2201223 2201744 . - . ID=gene-Rv1954c;Dbxref=GeneID:885967;Name=Rv1954c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1954c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2201223 2201744 . - 0 ID=cds-NP_216470.1;Parent=gene-Rv1954c;Dbxref=Genbank:NP_216470.1,GeneID:885967;Name=NP_216470.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1954c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216470.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2201719 2202096 . + . ID=gene-Rv1955;Dbxref=GeneID:885966;Name=higB;gbkey=Gene;gene=higB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1955
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2201719 2202096 . + 0 ID=cds-NP_216471.2;Parent=gene-Rv1955;Dbxref=Genbank:NP_216471.2,GeneID:885966;Name=NP_216471.2;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1956. Upon expression in E. coli has been shown to function as an antitoxin against Rv1956 (PubMed: 19016878)%3B It is not clear if these conflicting results are due to expression in a heterologous system%3B In various publications%2C both gene names higA and higB have been assigned to both Rv1955 and Rv1956%3B we have chosen to call Rv1955 higB after consulting the authors.;gbkey=CDS;gene=higB;locus_tag=Rv1955;product=toxin HigB;protein_id=NP_216471.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2202138 2202587 . + . ID=gene-Rv1956;Dbxref=GeneID:885964;Name=higA;gbkey=Gene;gene=higA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1956
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2202138 2202587 . + 0 ID=cds-NP_216472.1;Parent=gene-Rv1956;Dbxref=Genbank:NP_216472.1,GeneID:885964;Name=NP_216472.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1955. Upon expression in E.coli Rv1956 has been shown to function as a toxin inhibiting cell growth and colony formation that is neutralized by coexpression with Rv1955 (PubMed: 19016878)%3B It is not clear if these conflicting results are due to expression in a heterologous system. The gene names higA and higB have been assigned to both Rv1955 and Rv1956%3B we have chosen to call Rv1956 higA after consulting the authors.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=higA;locus_tag=Rv1956;product=antitoxin HigA;protein_id=NP_216472.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2202584 2203129 . + . ID=gene-Rv1957;Dbxref=GeneID:885961;Name=Rv1957;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1957
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2202584 2203129 . + 0 ID=cds-NP_216473.1;Parent=gene-Rv1957;Dbxref=Genbank:NP_216473.1,GeneID:885961;Name=NP_216473.1;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:21536872];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1957;product=SecB-like chaperone;protein_id=NP_216473.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2203018 2203632 . - . ID=gene-Rv1958c;Dbxref=GeneID:885960;Name=Rv1958c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1958c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2203018 2203632 . - 0 ID=cds-NP_216474.1;Parent=gene-Rv1958c;Dbxref=Genbank:NP_216474.1,GeneID:885960;Name=NP_216474.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1958c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216474.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2203681 2203977 . - . ID=gene-Rv1959c;Dbxref=GeneID:885958;Name=parE1;gbkey=Gene;gene=parE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1959c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2203681 2203977 . - 0 ID=cds-NP_216475.1;Parent=gene-Rv1959c;Dbxref=Genbank:NP_216475.1,GeneID:885958;Name=NP_216475.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1960c;gbkey=CDS;gene=parE1;locus_tag=Rv1959c;product=toxin ParE1;protein_id=NP_216475.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2203974 2204225 . - . ID=gene-Rv1960c;Dbxref=GeneID:885957;Name=parD1;gbkey=Gene;gene=parD1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1960c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2203974 2204225 . - 0 ID=cds-NP_216476.1;Parent=gene-Rv1960c;Dbxref=Genbank:NP_216476.1,GeneID:885957;Name=NP_216476.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1959c;gbkey=CDS;gene=parD1;locus_tag=Rv1960c;product=antitoxin ParD1;protein_id=NP_216476.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2204212 2204706 . + . ID=gene-Rv1961;Dbxref=GeneID:885954;Name=Rv1961;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1961
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2204212 2204706 . + 0 ID=cds-NP_216477.1;Parent=gene-Rv1961;Dbxref=Genbank:NP_216477.1,GeneID:885954;Name=NP_216477.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1961;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216477.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2204866 2205273 . - . ID=gene-Rv1962c;Dbxref=GeneID:885952;Name=vapC35;gbkey=Gene;gene=vapC35;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1962c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2204866 2205273 . - 0 ID=cds-NP_216478.1;Parent=gene-Rv1962c;Dbxref=Genbank:NP_216478.1,GeneID:885952;Name=NP_216478.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1962A%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC35;locus_tag=Rv1962c;product=ribonuclease VapC35;protein_id=NP_216478.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2205277 2205549 . - . ID=gene-Rv1962A;Dbxref=GeneID:14515903;Name=vapB35;gbkey=Gene;gene=vapB35;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1962A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2205277 2205549 . - 0 ID=cds-YP_007410641.1;Parent=gene-Rv1962A;Dbxref=Genbank:YP_007410641.1,GeneID:14515903;Name=YP_007410641.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1962c;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapB35;locus_tag=Rv1962A;product=antitoxin VapB35;protein_id=YP_007410641.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2205582 2206802 . - . ID=gene-Rv1963c;Dbxref=GeneID:885950;Name=mce3R;gbkey=Gene;gene=mce3R;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1963c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2214123 2215256 . + . ID=gene-Rv1970;Dbxref=GeneID:885939;Name=lprM;gbkey=Gene;gene=lprM;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mce3E;locus_tag=Rv1970
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2215257 2216570 . + . ID=gene-Rv1971;Dbxref=GeneID:885938;Name=mce3F;gbkey=Gene;gene=mce3F;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1971
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2215257 2216570 . + 0 ID=cds-NP_216487.1;Parent=gene-Rv1971;Dbxref=Genbank:NP_216487.1,GeneID:885938;Name=NP_216487.1;Note=belongs to 24-membered Mycobacterium tuberculosis Mce protein family;gbkey=CDS;gene=mce3F;locus_tag=Rv1971;product=Mce family protein Mce3F;protein_id=NP_216487.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2216592 2217167 . + . ID=gene-Rv1972;Dbxref=GeneID:885937;Name=Rv1972;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1972
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2216592 2217167 . + 0 ID=cds-NP_216488.1;Parent=gene-Rv1972;Dbxref=Genbank:NP_216488.1,GeneID:885937;Name=NP_216488.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1972;product=Mce associated membrane protein;protein_id=NP_216488.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2217164 2217646 . + . ID=gene-Rv1973;Dbxref=GeneID:885936;Name=Rv1973;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1973
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2217164 2217646 . + 0 ID=cds-NP_216489.1;Parent=gene-Rv1973;Dbxref=Genbank:NP_216489.1,GeneID:885936;Name=NP_216489.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1973;product=Mce associated membrane protein;protein_id=NP_216489.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2217659 2218036 . + . ID=gene-Rv1974;Dbxref=GeneID:885935;Name=Rv1974;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1974
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2217659 2218036 . + 0 ID=cds-NP_216490.1;Parent=gene-Rv1974;Dbxref=Genbank:NP_216490.1,GeneID:885935;Name=NP_216490.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1974;product=membrane protein;protein_id=NP_216490.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2218052 2218717 . + . ID=gene-Rv1975;Dbxref=GeneID:885934;Name=Rv1975;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1975
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2218052 2218717 . + 0 ID=cds-NP_216491.1;Parent=gene-Rv1975;Dbxref=Genbank:NP_216491.1,GeneID:885934;Name=NP_216491.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1975;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216491.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2218844 2219251 . - . ID=gene-Rv1976c;Dbxref=GeneID:885933;Name=Rv1976c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1976c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2218844 2219251 . - 0 ID=cds-NP_216492.1;Parent=gene-Rv1976c;Dbxref=Genbank:NP_216492.1,GeneID:885933;Name=NP_216492.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1976c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216492.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2219754 2220800 . + . ID=gene-Rv1977;Dbxref=GeneID:885931;Name=Rv1977;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1977
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2219754 2220800 . + 0 ID=cds-NP_216493.1;Parent=gene-Rv1977;Dbxref=Genbank:NP_216493.1,GeneID:885931;Name=NP_216493.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv1977;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216493.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2220908 2221756 . + . ID=gene-Rv1978;Dbxref=GeneID:885928;Name=Rv1978;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1978
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2220908 2221756 . + 0 ID=cds-NP_216494.1;Parent=gene-Rv1978;Dbxref=Genbank:NP_216494.1,GeneID:885928;Name=NP_216494.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1978;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216494.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2221719 2223164 . - . ID=gene-Rv1979c;Dbxref=GeneID:885819;Name=Rv1979c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1979c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2221719 2223164 . - 0 ID=cds-NP_216495.2;Parent=gene-Rv1979c;Dbxref=Genbank:NP_216495.2,GeneID:885819;Name=NP_216495.2;Note=APC family possibly involved in transport of amino acid;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00599;locus_tag=Rv1979c;product=permease;protein_id=NP_216495.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2223343 2224029 . - . ID=gene-Rv1980c;Dbxref=GeneID:885925;Name=mpt64;gbkey=Gene;gene=mpt64;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mpb64;locus_tag=Rv1980c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2223343 2224029 . - 0 ID=cds-NP_216496.1;Parent=gene-Rv1980c;Dbxref=Genbank:NP_216496.1,GeneID:885925;Name=NP_216496.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mpt64;locus_tag=Rv1980c;product=immunogenic protein Mpt64;protein_id=NP_216496.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2224220 2225188 . - . ID=gene-Rv1981c;Dbxref=GeneID:885923;Name=nrdF1;gbkey=Gene;gene=nrdF1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nrdF;locus_tag=Rv1981c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2224220 2225188 . - 0 ID=cds-YP_177853.1;Parent=gene-Rv1981c;Dbxref=Genbank:YP_177853.1,GeneID:885923;Name=YP_177853.1;Note=ribonucleotide reductase small subunit (R2F protein);experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:9335290];gbkey=CDS;gene=nrdF1;inference=protein motif:PROSITE:PS00368;locus_tag=Rv1981c;product=ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta NrdF1;protein_id=YP_177853.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2225413 2225832 . - . ID=gene-Rv1982c;Dbxref=GeneID:885816;Name=vapC36;gbkey=Gene;gene=vapC36;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1982c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2225413 2225832 . - 0 ID=cds-NP_216498.1;Parent=gene-Rv1982c;Dbxref=Genbank:NP_216498.1,GeneID:885816;Name=NP_216498.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1982A%2Ccontains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC36;locus_tag=Rv1982c;product=ribonuclease VapC36;protein_id=NP_216498.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2225841 2226101 . - . ID=gene-Rv1982A;Dbxref=GeneID:11117810;Name=vapB36;gbkey=Gene;gene=vapB36;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1982A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2225841 2226101 . - 0 ID=cds-YP_004837054.1;Parent=gene-Rv1982A;Dbxref=Genbank:YP_004837054.1,GeneID:11117810;Name=YP_004837054.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1982c;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapB36;locus_tag=Rv1982A;product=antitoxin VapB36;protein_id=YP_004837054.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2226244 2227920 . + . ID=gene-Rv1983;Dbxref=GeneID:885921;Name=PE_PGRS35;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS35;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1983
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2226244 2227920 . + 0 ID=cds-YP_177854.1;Parent=gene-Rv1983;Dbxref=Genbank:YP_177854.1,GeneID:885921;Name=YP_177854.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS35;inference=protein motif:PROSITE:PS00141;locus_tag=Rv1983;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS35;protein_id=YP_177854.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2227908 2228561 . - . ID=gene-Rv1984c;Dbxref=GeneID:885813;Name=cfp21;gbkey=Gene;gene=cfp21;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clp1,culp1;locus_tag=Rv1984c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2227908 2228561 . - 0 ID=cds-NP_216500.1;Parent=gene-Rv1984c;Dbxref=Genbank:NP_216500.1,GeneID:885813;Name=NP_216500.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cfp21;inference=protein motif:PROSITE:PS00155;locus_tag=Rv1984c;product=cutinase;protein_id=NP_216500.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2228676 2228906 . + . ID=gene-RV1984a;Dbxref=GeneID:19394676;Name=RV1984a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=RV1984a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2228676 2228906 . + 0 ID=cds-YP_009030034.1;Parent=gene-RV1984a;Dbxref=Genbank:YP_009030034.1,GeneID:19394676;Name=YP_009030034.1;gbkey=CDS;locus_tag=RV1984a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030034.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2228991 2229902 . - . ID=gene-Rv1985c;Dbxref=GeneID:885818;Name=Rv1985c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1985c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2228991 2229902 . - 0 ID=cds-NP_216501.1;Parent=gene-Rv1985c;Dbxref=Genbank:NP_216501.1,GeneID:885818;Name=NP_216501.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv1985c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_216501.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2230011 2230610 . + . ID=gene-Rv1986;Dbxref=GeneID:885635;Name=Rv1986;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1986
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2230011 2230610 . + 0 ID=cds-NP_216502.1;Parent=gene-Rv1986;Dbxref=Genbank:NP_216502.1,GeneID:885635;Name=NP_216502.1;Note=integral membrane protein;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1986;product=amino acid transporter;protein_id=NP_216502.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2231026 2231454 . + . ID=gene-Rv1987;Dbxref=GeneID:885815;Name=Rv1987;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1987
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2231026 2231454 . + 0 ID=cds-NP_216503.1;Parent=gene-Rv1987;Dbxref=Genbank:NP_216503.1,GeneID:885815;Name=NP_216503.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1987;product=chitinase;protein_id=NP_216503.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2231680 2232219 . + . ID=gene-Rv1988;Dbxref=GeneID:885632;Name=erm(37);gbkey=Gene;gene=erm(37);gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1988
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2231680 2232219 . + 0 ID=cds-NP_216504.1;Parent=gene-Rv1988;Dbxref=Genbank:NP_216504.1,GeneID:885632;Name=NP_216504.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=erm(37);inference=protein motif:PROSITE:PS00092;locus_tag=Rv1988;product=23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(37);protein_id=NP_216504.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2232739 2233299 . - . ID=gene-Rv1989c;Dbxref=GeneID:885810;Name=Rv1989c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1989c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2232739 2233299 . - 0 ID=cds-NP_216505.1;Parent=gene-Rv1989c;Dbxref=Genbank:NP_216505.1,GeneID:885810;Name=NP_216505.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1989c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216505.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2233296 2233637 . - . ID=gene-Rv1990c;Dbxref=GeneID:885422;Name=Rv1990c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1990c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2233296 2233637 . - 0 ID=cds-NP_216506.1;Parent=gene-Rv1990c;Dbxref=Genbank:NP_216506.1,GeneID:885422;Name=NP_216506.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1990c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216506.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2234305 2234649 . - . ID=gene-Rv1991c;Dbxref=GeneID:885634;Name=mazF6;gbkey=Gene;gene=mazF6;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt3;locus_tag=Rv1991c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2234305 2234649 . - 0 ID=cds-NP_216507.1;Parent=gene-Rv1991c;Dbxref=Genbank:NP_216507.1,GeneID:885634;Name=NP_216507.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1991A. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:1762303];gbkey=CDS;gene=mazF6;locus_tag=Rv1991c;product=mRNA interferase MazF6;protein_id=NP_216507.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2234643 2234891 . - . ID=gene-Rv1991A;Dbxref=GeneID:14515890;Name=mazE6;gbkey=Gene;gene=mazE6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1991A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2234643 2234891 . - 0 ID=cds-YP_007410673.1;Parent=gene-Rv1991A;Dbxref=Genbank:YP_007410673.1,GeneID:14515890;Name=YP_007410673.1;Note=MazE6%2C antitoxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv1991c.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:1762303];gbkey=CDS;gene=mazE6;locus_tag=Rv1991A;product=antitoxin MazE6;protein_id=YP_007410673.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2234991 2237306 . - . ID=gene-Rv1992c;Dbxref=GeneID:888914;Name=ctpG;gbkey=Gene;gene=ctpG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cmtA;locus_tag=Rv1992c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2237303 2237575 . - . ID=gene-Rv1993c;Dbxref=GeneID:885631;Name=Rv1993c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1993c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2237303 2237575 . - 0 ID=cds-NP_216509.1;Parent=gene-Rv1993c;Dbxref=Genbank:NP_216509.1,GeneID:885631;Name=NP_216509.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1993c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216509.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2237628 2237984 . - . ID=gene-Rv1994c;Dbxref=GeneID:888889;Name=cmtR;gbkey=Gene;gene=cmtR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1994c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2237628 2237984 . - 0 ID=cds-NP_216510.1;Parent=gene-Rv1994c;Dbxref=Genbank:NP_216510.1,GeneID:888889;Name=NP_216510.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12939264];gbkey=CDS;gene=cmtR;locus_tag=Rv1994c;product=HTH-type transcriptional regulator CmtR;protein_id=NP_216510.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2238141 2238908 . + . ID=gene-Rv1995;Dbxref=GeneID:888917;Name=Rv1995;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1995
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2238141 2238908 . + 0 ID=cds-NP_216511.1;Parent=gene-Rv1995;Dbxref=Genbank:NP_216511.1,GeneID:888917;Name=NP_216511.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1995;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216511.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2239004 2239957 . + . ID=gene-Rv1996;Dbxref=GeneID:888863;Name=Rv1996;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1996
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2239004 2239957 . + 0 ID=cds-NP_216512.1;Parent=gene-Rv1996;Dbxref=Genbank:NP_216512.1,GeneID:888863;Name=NP_216512.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1996;product=universal stress protein;protein_id=NP_216512.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2240159 2242876 . + . ID=gene-Rv1997;Dbxref=GeneID:888867;Name=ctpF;gbkey=Gene;gene=ctpF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1997
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2240159 2242876 . + 0 ID=cds-NP_216513.1;Parent=gene-Rv1997;Dbxref=Genbank:NP_216513.1,GeneID:888867;Name=NP_216513.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=ctpF;inference=protein motif:PROSITE:PS00154;locus_tag=Rv1997;product=cation transporter ATPase F;protein_id=NP_216513.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2242945 2243721 . - . ID=gene-Rv1998c;Dbxref=GeneID:888853;Name=Rv1998c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1998c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2242945 2243721 . - 0 ID=cds-NP_216514.1;Parent=gene-Rv1998c;Dbxref=Genbank:NP_216514.1,GeneID:888853;Name=NP_216514.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv1998c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216514.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2243816 2245138 . - . ID=gene-Rv1999c;Dbxref=GeneID:888881;Name=Rv1999c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv1999c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2243816 2245138 . - 0 ID=cds-NP_216515.1;Parent=gene-Rv1999c;Dbxref=Genbank:NP_216515.1,GeneID:888881;Name=NP_216515.1;Note=integral membrane protein;gbkey=CDS;locus_tag=Rv1999c;product=transporter;protein_id=NP_216515.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2245209 2246822 . + . ID=gene-Rv2000;Dbxref=GeneID:888864;Name=Rv2000;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2000
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2245209 2246822 . + 0 ID=cds-NP_216516.1;Parent=gene-Rv2000;Dbxref=Genbank:NP_216516.1,GeneID:888864;Name=NP_216516.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2000;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216516.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2246832 2247584 . + . ID=gene-Rv2001;Dbxref=GeneID:888880;Name=Rv2001;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2001
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2246832 2247584 . + 0 ID=cds-NP_216517.1;Parent=gene-Rv2001;Dbxref=Genbank:NP_216517.1,GeneID:888880;Name=NP_216517.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2001;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216517.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2247660 2248442 . + . ID=gene-Rv2002;Dbxref=GeneID:888857;Name=fabG3;gbkey=Gene;gene=fabG3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2002
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2247660 2248442 . + 0 ID=cds-NP_216518.1;Parent=gene-Rv2002;Dbxref=Genbank:NP_216518.1,GeneID:888857;Name=NP_216518.1;Note=cortisone reductase ((R)-20-hydroxysteroid dehydrogenase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12524453];gbkey=CDS;gene=fabG3;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv2002;product=3-alpha(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase;protein_id=NP_216518.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2248563 2249420 . - . ID=gene-Rv2003c;Dbxref=GeneID:888818;Name=Rv2003c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2003c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2248563 2249420 . - 0 ID=cds-NP_216519.1;Parent=gene-Rv2003c;Dbxref=Genbank:NP_216519.1,GeneID:888818;Name=NP_216519.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2003c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216519.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2249478 2250974 . - . ID=gene-Rv2004c;Dbxref=GeneID:888817;Name=Rv2004c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2004c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2249478 2250974 . - 0 ID=cds-NP_216520.1;Parent=gene-Rv2004c;Dbxref=Genbank:NP_216520.1,GeneID:888817;Name=NP_216520.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2004c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216520.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2250996 2251883 . - . ID=gene-Rv2005c;Dbxref=GeneID:888831;Name=Rv2005c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2005c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2250996 2251883 . - 0 ID=cds-NP_216521.1;Parent=gene-Rv2005c;Dbxref=Genbank:NP_216521.1,GeneID:888831;Name=NP_216521.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2005c;product=universal stress protein;protein_id=NP_216521.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2252002 2255985 . + . ID=gene-Rv2006;Dbxref=GeneID:888943;Name=otsB1;gbkey=Gene;gene=otsB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=otsB;locus_tag=Rv2006
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2252002 2255985 . + 0 ID=cds-YP_177855.1;Parent=gene-Rv2006;Dbxref=Genbank:YP_177855.1,GeneID:888943;Name=YP_177855.1;Note=trehalose-phosphatase (TPP);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=otsB1;inference=protein motif:PROSITE:PS00148;locus_tag=Rv2006;product=trehalose-6-phosphate phosphatase OtsB;protein_id=YP_177855.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2256084 2256428 . - . ID=gene-Rv2007c;Dbxref=GeneID:888887;Name=fdxA;gbkey=Gene;gene=fdxA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2007c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2256084 2256428 . - 0 ID=cds-NP_216523.1;Parent=gene-Rv2007c;Dbxref=Genbank:NP_216523.1,GeneID:888887;Name=NP_216523.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fdxA;locus_tag=Rv2007c;product=ferredoxin;protein_id=NP_216523.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2256617 2257942 . - . ID=gene-Rv2008c;Dbxref=GeneID:888813;Name=Rv2008c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2008c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2256617 2257942 . - 0 ID=cds-NP_216524.1;Parent=gene-Rv2008c;Dbxref=Genbank:NP_216524.1,GeneID:888813;Name=NP_216524.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00501;locus_tag=Rv2008c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216524.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2258030 2258272 . + . ID=gene-Rv2009;Dbxref=GeneID:888925;Name=vapB15;gbkey=Gene;gene=vapB15;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2009
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2258030 2258272 . + 0 ID=cds-NP_216525.1;Parent=gene-Rv2009;Dbxref=Genbank:NP_216525.1,GeneID:888925;Name=NP_216525.1;Note=VapB15%2C antitoxin%2Cpart of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2010;gbkey=CDS;gene=vapB15;locus_tag=Rv2009;product=antitoxin VapB15;protein_id=NP_216525.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2258273 2258671 . + . ID=gene-Rv2010;Dbxref=GeneID:888933;Name=vapC15;gbkey=Gene;gene=vapC15;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2010
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2258273 2258671 . + 0 ID=cds-NP_216526.1;Parent=gene-Rv2010;Dbxref=Genbank:NP_216526.1,GeneID:888933;Name=NP_216526.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2009%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC15;locus_tag=Rv2010;product=ribonuclease VapC15;protein_id=NP_216526.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2258854 2259285 . - . ID=gene-Rv2011c;Dbxref=GeneID:888922;Name=Rv2011c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2011c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2258854 2259285 . - 0 ID=cds-NP_216527.1;Parent=gene-Rv2011c;Dbxref=Genbank:NP_216527.1,GeneID:888922;Name=NP_216527.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2011c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216527.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2259326 2259820 . + . ID=gene-Rv2012;Dbxref=GeneID:888927;Name=Rv2012;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2012
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2259326 2259820 . + 0 ID=cds-NP_216528.1;Parent=gene-Rv2012;Dbxref=Genbank:NP_216528.1,GeneID:888927;Name=NP_216528.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2012;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216528.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2260443 2261670 . + . ID=id-NC_000962.3:2260443..2261670;Note=IS1607%2C len: 1228 nt. Vestigial Insertion sequence element%2C IS1607.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1607
+NC_000962.3 RefSeq gene 2261816 2263072 . - . ID=gene-Rv2015c;Dbxref=GeneID:888378;Name=Rv2015c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2015c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2261816 2263072 . - 0 ID=cds-NP_216531.1;Parent=gene-Rv2015c;Dbxref=Genbank:NP_216531.1,GeneID:888378;Name=NP_216531.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14595687];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2015c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216531.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2263426 2264001 . + . ID=gene-Rv2016;Dbxref=GeneID:888630;Name=Rv2016;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2016
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2263426 2264001 . + 0 ID=cds-NP_216532.1;Parent=gene-Rv2016;Dbxref=Genbank:NP_216532.1,GeneID:888630;Name=NP_216532.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2016;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216532.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2263998 2265038 . + . ID=gene-Rv2017;Dbxref=GeneID:888435;Name=Rv2017;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2017
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2263998 2265038 . + 0 ID=cds-NP_216533.1;Parent=gene-Rv2017;Dbxref=Genbank:NP_216533.1,GeneID:888435;Name=NP_216533.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv2017;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216533.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2265280 2265999 . + . ID=gene-Rv2018;Dbxref=GeneID:887560;Name=Rv2018;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2018
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2265280 2265999 . + 0 ID=cds-NP_216534.1;Parent=gene-Rv2018;Dbxref=Genbank:NP_216534.1,GeneID:887560;Name=NP_216534.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2018;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216534.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2265989 2266405 . + . ID=gene-Rv2019;Dbxref=GeneID:887665;Name=Rv2019;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2019
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2265989 2266405 . + 0 ID=cds-NP_216535.1;Parent=gene-Rv2019;Dbxref=Genbank:NP_216535.1,GeneID:887665;Name=NP_216535.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2019;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216535.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2266805 2267110 . - . ID=gene-Rv2021c;Dbxref=GeneID:888092;Name=Rv2021c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2021c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2266805 2267110 . - 0 ID=cds-NP_216537.1;Parent=gene-Rv2021c;Dbxref=Genbank:NP_216537.1,GeneID:888092;Name=NP_216537.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2021c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216537.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2267119 2267724 . - . ID=gene-Rv2022c;Dbxref=GeneID:888129;Name=Rv2022c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2022c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2267119 2267724 . - 0 ID=cds-NP_216538.1;Parent=gene-Rv2022c;Dbxref=Genbank:NP_216538.1,GeneID:888129;Name=NP_216538.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2022c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216538.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2267749 2268108 . - . ID=gene-Rv2023c;Dbxref=GeneID:887444;Name=Rv2023c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2023c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2267749 2268108 . - 0 ID=cds-NP_216539.1;Parent=gene-Rv2023c;Dbxref=Genbank:NP_216539.1,GeneID:887444;Name=NP_216539.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2023c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216539.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2268268 2268726 . - . ID=gene-Rv2023A;Dbxref=GeneID:3205050;Name=Rv2023A;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2023A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2268268 2268726 . - . ID=id-Rv2023A;Dbxref=PSEUDO:CCP44796.1,GeneID:3205050;Note=Hypothetical unknown protein (pseudogene)%2C Note that a deletion of DNA (RvD1 region) in Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv resulted in a truncated CDS comparatively to Mycobacterium bovis or Mycobacterium tuberculosis strain CDC1551 genomes (see citations below).;gbkey=misc_feature;locus_tag=Rv2023A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2268693 2270240 . - . ID=gene-Rv2024c;Dbxref=GeneID:888351;Name=Rv2024c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2024c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2268693 2270240 . - 0 ID=cds-NP_216540.1;Parent=gene-Rv2024c;Dbxref=Genbank:NP_216540.1,GeneID:888351;Name=NP_216540.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2024c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216540.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2270750 2271748 . - . ID=gene-Rv2025c;Dbxref=GeneID:888782;Name=Rv2025c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2025c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2270750 2271748 . - 0 ID=cds-NP_216541.1;Parent=gene-Rv2025c;Dbxref=Genbank:NP_216541.1,GeneID:888782;Name=NP_216541.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:17726022];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2025c;product=cation efflux system protein;protein_id=NP_216541.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2271863 2272747 . - . ID=gene-Rv2026c;Dbxref=GeneID:887460;Name=Rv2026c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2026c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2271863 2272747 . - 0 ID=cds-NP_216542.1;Parent=gene-Rv2026c;Dbxref=Genbank:NP_216542.1,GeneID:887460;Name=NP_216542.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2026c;product=universal stress protein;protein_id=NP_216542.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2272787 2274508 . - . ID=gene-Rv2027c;Dbxref=GeneID:888471;Name=dosT;gbkey=Gene;gene=dosT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2027c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2272787 2274508 . - 0 ID=cds-NP_216543.1;Parent=gene-Rv2027c;Dbxref=Genbank:NP_216543.1,GeneID:888471;Name=NP_216543.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15033981];gbkey=CDS;gene=dosT;locus_tag=Rv2027c;product=two component sensor histidine kinase DosT;protein_id=NP_216543.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2274569 2275408 . - . ID=gene-Rv2028c;Dbxref=GeneID:888494;Name=Rv2028c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2028c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2274569 2275408 . - 0 ID=cds-NP_216544.1;Parent=gene-Rv2028c;Dbxref=Genbank:NP_216544.1,GeneID:888494;Name=NP_216544.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2028c;product=universal stress protein;protein_id=NP_216544.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2275405 2276424 . - . ID=gene-Rv2029c;Dbxref=GeneID:887491;Name=pfkB;gbkey=Gene;gene=pfkB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2029c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2275405 2276424 . - 0 ID=cds-NP_216545.1;Parent=gene-Rv2029c;Dbxref=Genbank:NP_216545.1,GeneID:887491;Name=NP_216545.1;Note=phosphohexokinase (phosphofructokinase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pfkB;inference=protein motif:PROSITE:PS00583;locus_tag=Rv2029c;product=6-phosphofructokinase PfkB;protein_id=NP_216545.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2276441 2278486 . - . ID=gene-Rv2030c;Dbxref=GeneID:887536;Name=Rv2030c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2030c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2276441 2278486 . - 0 ID=cds-NP_216546.1;Parent=gene-Rv2030c;Dbxref=Genbank:NP_216546.1,GeneID:887536;Name=NP_216546.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2030c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216546.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2278498 2278932 . - . ID=gene-Rv2031c;Dbxref=GeneID:887579;Name=hspX;gbkey=Gene;gene=hspX;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=acr;locus_tag=Rv2031c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2278498 2278932 . - 0 ID=cds-NP_216547.1;Parent=gene-Rv2031c;Dbxref=Genbank:NP_216547.1,GeneID:887579;Name=NP_216547.1;Note=heat shock protein HspX%3B alpha-crystallin homolog (14 kDa antigen) (HSP16.3);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hspX;locus_tag=Rv2031c;product=alpha-crystallin;protein_id=NP_216547.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2279129 2280124 . + . ID=gene-Rv2032;Dbxref=GeneID:887582;Name=acg;gbkey=Gene;gene=acg;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2032
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2279129 2280124 . + 0 ID=cds-NP_216548.1;Parent=gene-Rv2032;Dbxref=Genbank:NP_216548.1,GeneID:887582;Name=NP_216548.1;Note=acr-coregulated gene;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=acg;locus_tag=Rv2032;product=NAD(P)H nitroreductase;protein_id=NP_216548.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2280240 2281082 . - . ID=gene-Rv2033c;Dbxref=GeneID:887972;Name=Rv2033c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2033c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2280240 2281082 . - 0 ID=cds-NP_216549.1;Parent=gene-Rv2033c;Dbxref=Genbank:NP_216549.1,GeneID:887972;Name=NP_216549.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2033c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216549.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2281294 2281617 . + . ID=gene-Rv2034;Dbxref=GeneID:887859;Name=Rv2034;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2034
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2281294 2281617 . + 0 ID=cds-NP_216550.1;Parent=gene-Rv2034;Dbxref=Genbank:NP_216550.1,GeneID:887859;Name=NP_216550.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2034;product=ArsR family HTH-type transcriptional repressor;protein_id=NP_216550.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2281614 2282102 . + . ID=gene-Rv2035;Dbxref=GeneID:887445;Name=Rv2035;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2035
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2281614 2282102 . + 0 ID=cds-NP_216551.1;Parent=gene-Rv2035;Dbxref=Genbank:NP_216551.1,GeneID:887445;Name=NP_216551.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2035;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216551.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2282099 2282740 . + . ID=gene-Rv2036;Dbxref=GeneID:887433;Name=Rv2036;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2036
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2282099 2282740 . + 0 ID=cds-NP_216552.1;Parent=gene-Rv2036;Dbxref=Genbank:NP_216552.1,GeneID:887433;Name=NP_216552.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2036;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216552.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2282747 2283721 . - . ID=gene-Rv2037c;Dbxref=GeneID:888021;Name=Rv2037c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2037c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2282747 2283721 . - 0 ID=cds-NP_216553.1;Parent=gene-Rv2037c;Dbxref=Genbank:NP_216553.1,GeneID:888021;Name=NP_216553.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2037c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216553.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2283723 2284796 . - . ID=gene-Rv2038c;Dbxref=GeneID:887998;Name=Rv2038c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2038c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2283723 2284796 . - 0 ID=cds-NP_216554.1;Parent=gene-Rv2038c;Dbxref=Genbank:NP_216554.1,GeneID:887998;Name=NP_216554.1;Note=Probable sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter. Contains PS00211 ABC transporters family signature and PS00017 ATP/GTP-binding site motif A (P-loop).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv2038c;product=sugar ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_216554.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2284799 2285641 . - . ID=gene-Rv2039c;Dbxref=GeneID:887729;Name=Rv2039c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2039c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2284799 2285641 . - 0 ID=cds-NP_216555.1;Parent=gene-Rv2039c;Dbxref=Genbank:NP_216555.1,GeneID:887729;Name=NP_216555.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv2039c;product=sugar ABC transporter permease;protein_id=NP_216555.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2285628 2286530 . - . ID=gene-Rv2040c;Dbxref=GeneID:887893;Name=Rv2040c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2040c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2285628 2286530 . - 0 ID=cds-NP_216556.1;Parent=gene-Rv2040c;Dbxref=Genbank:NP_216556.1,GeneID:887893;Name=NP_216556.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv2040c;product=sugar ABC transporter permease;protein_id=NP_216556.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2286527 2287846 . - . ID=gene-Rv2041c;Dbxref=GeneID:887474;Name=Rv2041c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2041c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2286527 2287846 . - 0 ID=cds-NP_216557.1;Parent=gene-Rv2041c;Dbxref=Genbank:NP_216557.1,GeneID:887474;Name=NP_216557.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2041c;product=sugar ABC transporter substrate-binding lipoprotein;protein_id=NP_216557.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2287884 2288681 . - . ID=gene-Rv2042c;Dbxref=GeneID:887497;Name=Rv2042c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2042c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2287884 2288681 . - 0 ID=cds-NP_216558.1;Parent=gene-Rv2042c;Dbxref=Genbank:NP_216558.1,GeneID:887497;Name=NP_216558.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2042c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216558.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2288681 2289241 . - . ID=gene-Rv2043c;Dbxref=GeneID:888260;Name=pncA;gbkey=Gene;gene=pncA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2043c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2288681 2289241 . - 0 ID=cds-NP_216559.1;Parent=gene-Rv2043c;Dbxref=Genbank:NP_216559.1,GeneID:888260;Name=NP_216559.1;Note=involved in susceptibility or resistance to antituberculous drug pyrazinamide.;experiment=DESCRIPTION:Mutation analysis[PMID:11171040];gbkey=CDS;gene=pncA;locus_tag=Rv2043c;product=pyrazinamidase/nicotinamidase PncA;protein_id=NP_216559.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2289282 2289599 . - . ID=gene-Rv2044c;Dbxref=GeneID:888243;Name=Rv2044c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2044c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2289282 2289599 . - 0 ID=cds-NP_216560.1;Parent=gene-Rv2044c;Dbxref=Genbank:NP_216560.1,GeneID:888243;Name=NP_216560.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2044c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216560.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2289685 2291220 . - . ID=gene-Rv2045c;Dbxref=GeneID:888358;Name=lipT;gbkey=Gene;gene=lipT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2045c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2289685 2291220 . - 0 ID=cds-NP_216561.1;Parent=gene-Rv2045c;Dbxref=Genbank:NP_216561.1,GeneID:888358;Name=NP_216561.1;gbkey=CDS;gene=lipT;inference=protein motif:PROSITE:PS00941;locus_tag=Rv2045c;product=carboxylesterase LipT;protein_id=NP_216561.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2291269 2291925 . + . ID=gene-Rv2046;Dbxref=GeneID:888308;Name=lppI;gbkey=Gene;gene=lppI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2046
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2291269 2291925 . + 0 ID=cds-NP_216562.1;Parent=gene-Rv2046;Dbxref=Genbank:NP_216562.1,GeneID:888308;Name=NP_216562.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppI;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2046;product=lipoprotein LppI;protein_id=NP_216562.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2291962 2294526 . - . ID=gene-Rv2047c;Dbxref=GeneID:888529;Name=Rv2047c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2047c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2291962 2294526 . - 0 ID=cds-NP_216563.1;Parent=gene-Rv2047c;Dbxref=Genbank:NP_216563.1,GeneID:888529;Name=NP_216563.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2047c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216563.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2294531 2306986 . - . ID=gene-Rv2048c;Dbxref=GeneID:888350;Name=pks12;gbkey=Gene;gene=pks12;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2048c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2294531 2306986 . - 0 ID=cds-NP_216564.2;Parent=gene-Rv2048c;Dbxref=Genbank:NP_216564.2,GeneID:888350;Name=NP_216564.2;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pks12;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2048c;product=polyketide synthase;protein_id=NP_216564.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2299745 2299886 . + . ID=gene-RVnc0003;Dbxref=GeneID:14515896;Name=ASpks;gbkey=Gene;gene=ASpks;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0003
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 2299745 2299886 . + . ID=rna-RVnc0003;Parent=gene-RVnc0003;Dbxref=GeneID:14515896;Note=ASpks%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 2299785 and 2299796. Alternate 3'-end at position 2299873. This sequence is repeated in pks12|Rv2048c at position 2305814-2305955.;gbkey=ncRNA;gene=ASpks;locus_tag=RVnc0003;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 2299745 2299886 . + . ID=exon-RVnc0003-1;Parent=rna-RVnc0003;Dbxref=GeneID:14515896;Note=ASpks%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009). Alternate 5'-ends at positions 2299785 and 2299796. Alternate 3'-end at position 2299873. This sequence is repeated in pks12|Rv2048c at position 2305814-2305955.;gbkey=ncRNA;gene=ASpks;locus_tag=RVnc0003;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 2307293 2307517 . - . ID=gene-Rv2049c;Dbxref=GeneID:888593;Name=Rv2049c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2049c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2307293 2307517 . - 0 ID=cds-NP_216565.1;Parent=gene-Rv2049c;Dbxref=Genbank:NP_216565.1,GeneID:888593;Name=NP_216565.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2049c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216565.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2307821 2308156 . + . ID=gene-Rv2050;Dbxref=GeneID:888598;Name=Rv2050;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2050
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2307821 2308156 . + 0 ID=cds-NP_216566.1;Parent=gene-Rv2050;Dbxref=Genbank:NP_216566.1,GeneID:888598;Name=NP_216566.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:22570422];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2050;product=RNA polymerase-binding protein RbpA;protein_id=NP_216566.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2308131 2310755 . - . ID=gene-Rv2051c;Dbxref=GeneID:887402;Name=ppm1;gbkey=Gene;gene=ppm1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2051c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2308131 2310755 . - 0 ID=cds-NP_216567.1;Parent=gene-Rv2051c;Dbxref=Genbank:NP_216567.1,GeneID:887402;Name=NP_216567.1;Note=Transfers mannose from GDP-Mannose to all endogenous polyprenol-phosphates in Mycobacterium tuberculosis;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:11931640];gbkey=CDS;gene=ppm1;locus_tag=Rv2051c;product=polyprenol-monophosphomannose synthase;protein_id=NP_216567.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2310913 2312517 . - . ID=gene-Rv2052c;Dbxref=GeneID:888608;Name=Rv2052c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2052c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2310913 2312517 . - 0 ID=cds-NP_216568.1;Parent=gene-Rv2052c;Dbxref=Genbank:NP_216568.1,GeneID:888608;Name=NP_216568.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2052c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216568.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2312522 2313049 . - . ID=gene-Rv2053c;Dbxref=GeneID:888768;Name=fxsA;gbkey=Gene;gene=fxsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2053c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2312522 2313049 . - 0 ID=cds-NP_216569.1;Parent=gene-Rv2053c;Dbxref=Genbank:NP_216569.1,GeneID:888768;Name=NP_216569.1;gbkey=CDS;gene=fxsA;locus_tag=Rv2053c;product=transmembrane protein FxsA;protein_id=NP_216569.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2313125 2313838 . + . ID=gene-Rv2054;Dbxref=GeneID:888722;Name=Rv2054;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2054
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2313125 2313838 . + 0 ID=cds-NP_216570.1;Parent=gene-Rv2054;Dbxref=Genbank:NP_216570.1,GeneID:888722;Name=NP_216570.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2054;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216570.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2314087 2314353 . - . ID=gene-Rv2055c;Dbxref=GeneID:887817;Name=rpsR2;gbkey=Gene;gene=rpsR2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2055c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2314087 2314353 . - 0 ID=cds-NP_216571.1;Parent=gene-Rv2055c;Dbxref=Genbank:NP_216571.1,GeneID:887817;Name=NP_216571.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rpsR2;locus_tag=Rv2055c;product=30S ribosomal protein S18;protein_id=NP_216571.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2314354 2314659 . - . ID=gene-Rv2056c;Dbxref=GeneID:887819;Name=rpsN2;gbkey=Gene;gene=rpsN2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2056c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2314354 2314659 . - 0 ID=cds-NP_216572.1;Parent=gene-Rv2056c;Dbxref=Genbank:NP_216572.1,GeneID:887819;Name=NP_216572.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=rpsN2;locus_tag=Rv2056c;product=30S ribosomal protein S14;protein_id=NP_216572.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2314661 2314825 . - . ID=gene-Rv2057c;Dbxref=GeneID:887807;Name=rpmG1;gbkey=Gene;gene=rpmG1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rpmG;locus_tag=Rv2057c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2314661 2314825 . - 0 ID=cds-YP_177856.1;Parent=gene-Rv2057c;Dbxref=Genbank:YP_177856.1,GeneID:887807;Name=YP_177856.1;gbkey=CDS;gene=rpmG1;locus_tag=Rv2057c;product=50S ribosomal protein L33;protein_id=YP_177856.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2314825 2315061 . - . ID=gene-Rv2058c;Dbxref=GeneID:887801;Name=rpmB2;gbkey=Gene;gene=rpmB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2058c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2314825 2315061 . - 0 ID=cds-NP_216574.1;Parent=gene-Rv2058c;Dbxref=Genbank:NP_216574.1,GeneID:887801;Name=NP_216574.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15952732];gbkey=CDS;gene=rpmB2;locus_tag=Rv2058c;product=50S ribosomal protein L28;protein_id=NP_216574.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2315174 2316709 . + . ID=gene-Rv2059;Dbxref=GeneID:888402;Name=Rv2059;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2059
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2315174 2316709 . + 0 ID=cds-NP_216575.1;Parent=gene-Rv2059;Dbxref=Genbank:NP_216575.1,GeneID:888402;Name=NP_216575.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2059;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216575.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2316279 2316680 . + . ID=gene-Rv2060;Dbxref=GeneID:888388;Name=Rv2060;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2060
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2316279 2316680 . + 0 ID=cds-NP_216576.1;Parent=gene-Rv2060;Dbxref=Genbank:NP_216576.1,GeneID:888388;Name=NP_216576.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2060;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216576.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2316681 2317085 . - . ID=gene-Rv2061c;Dbxref=GeneID:888246;Name=Rv2061c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2061c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2316681 2317085 . - 0 ID=cds-NP_216577.1;Parent=gene-Rv2061c;Dbxref=Genbank:NP_216577.1,GeneID:888246;Name=NP_216577.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2061c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216577.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2317169 2320753 . - . ID=gene-Rv2062c;Dbxref=GeneID:888252;Name=cobN;gbkey=Gene;gene=cobN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2062c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2317169 2320753 . - 0 ID=cds-NP_216578.1;Parent=gene-Rv2062c;Dbxref=Genbank:NP_216578.1,GeneID:888252;Name=NP_216578.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cobN;locus_tag=Rv2062c;product=cobalamin biosynthesis protein CobN;protein_id=NP_216578.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2320831 2321064 . + . ID=gene-Rv2063;Dbxref=GeneID:3205116;Name=mazE7;gbkey=Gene;gene=mazE7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2063
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2320831 2321064 . + 0 ID=cds-YP_177657.1;Parent=gene-Rv2063;Dbxref=Genbank:YP_177657.1,GeneID:3205116;Name=YP_177657.1;Note=MazE7%2C antitoxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2063A;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mazE7;locus_tag=Rv2063;product=antitoxin MazE7;protein_id=YP_177657.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2321057 2321467 . + . ID=gene-Rv2063A;Dbxref=GeneID:14515888;Name=mazF7;gbkey=Gene;gene=mazF7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2063A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2321057 2321467 . + 0 ID=cds-YP_004837055.2;Parent=gene-Rv2063A;Dbxref=Genbank:YP_004837055.2,GeneID:14515888;Name=YP_004837055.2;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2063;gbkey=CDS;gene=mazF7;locus_tag=Rv2063A;product=mRNA interferase MazF7;protein_id=YP_004837055.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2321451 2322542 . + . ID=gene-Rv2064;Dbxref=GeneID:888140;Name=cobG;gbkey=Gene;gene=cobG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2064
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2321451 2322542 . + 0 ID=cds-NP_216580.1;Parent=gene-Rv2064;Dbxref=Genbank:NP_216580.1,GeneID:888140;Name=NP_216580.1;Note=cobalamin biosynthesis protein.;gbkey=CDS;gene=cobG;inference=protein motif:PROSITE:PS01156;locus_tag=Rv2064;product=precorrin-3B synthase;protein_id=NP_216580.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2322552 2323178 . + . ID=gene-Rv2065;Dbxref=GeneID:888464;Name=cobH;gbkey=Gene;gene=cobH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2065
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2322552 2323178 . + 0 ID=cds-NP_216581.1;Parent=gene-Rv2065;Dbxref=Genbank:NP_216581.1,GeneID:888464;Name=NP_216581.1;Note=precorrin isomerase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cobH;locus_tag=Rv2065;product=precorrin-8X methylmutase;protein_id=NP_216581.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2323175 2324701 . + . ID=gene-Rv2066;Dbxref=GeneID:888483;Name=cobIJ;gbkey=Gene;gene=cobIJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2066
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2323175 2324701 . + 0 ID=cds-NP_216582.1;Parent=gene-Rv2066;Dbxref=Genbank:NP_216582.1,GeneID:888483;Name=NP_216582.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cobIJ;locus_tag=Rv2066;product=bifunctional S-adenosyl-L-methionine-precorrin-2 methyl transferase/precorrin-3 methylase;protein_id=NP_216582.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2324647 2325870 . - . ID=gene-Rv2067c;Dbxref=GeneID:888752;Name=Rv2067c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2067c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2324647 2325870 . - 0 ID=cds-NP_216583.1;Parent=gene-Rv2067c;Dbxref=Genbank:NP_216583.1,GeneID:888752;Name=NP_216583.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2067c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216583.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2325886 2326809 . - . ID=gene-Rv2068c;Dbxref=GeneID:888742;Name=blaC;gbkey=Gene;gene=blaC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2068c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2325886 2326809 . - 0 ID=cds-NP_216584.1;Parent=gene-Rv2068c;Dbxref=Genbank:NP_216584.1,GeneID:888742;Name=NP_216584.1;Note=class A;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:18217931];gbkey=CDS;gene=blaC;inference=protein motif:PROSITE:PS00146;locus_tag=Rv2068c;product=beta-lactamase;protein_id=NP_216584.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2326944 2327501 . + . ID=gene-Rv2069;Dbxref=GeneID:888723;Name=sigC;gbkey=Gene;gene=sigC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2069
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2326944 2327501 . + 0 ID=cds-NP_216585.1;Parent=gene-Rv2069;Dbxref=Genbank:NP_216585.1,GeneID:888723;Name=NP_216585.1;Note=ECF subfamily;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16735723];gbkey=CDS;gene=sigC;locus_tag=Rv2069;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigC;protein_id=NP_216585.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2327491 2328225 . - . ID=gene-Rv2070c;Dbxref=GeneID:887566;Name=cobK;gbkey=Gene;gene=cobK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2070c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2327491 2328225 . - 0 ID=cds-NP_216586.1;Parent=gene-Rv2070c;Dbxref=Genbank:NP_216586.1,GeneID:887566;Name=NP_216586.1;gbkey=CDS;gene=cobK;locus_tag=Rv2070c;product=precorrin-6A reductase;protein_id=NP_216586.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2328222 2328977 . - . ID=gene-Rv2071c;Dbxref=GeneID:888521;Name=cobM;gbkey=Gene;gene=cobM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2071c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2328222 2328977 . - 0 ID=cds-NP_216587.1;Parent=gene-Rv2071c;Dbxref=Genbank:NP_216587.1,GeneID:888521;Name=NP_216587.1;Note=precorrin-3 methylase;gbkey=CDS;gene=cobM;inference=protein motif:PROSITE:PS00840;locus_tag=Rv2071c;product=precorrin-4 C(11)-methyltransferase;protein_id=NP_216587.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2328974 2330146 . - . ID=gene-Rv2072c;Dbxref=GeneID:888321;Name=cobL;gbkey=Gene;gene=cobL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2072c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2328974 2330146 . - 0 ID=cds-NP_216588.1;Parent=gene-Rv2072c;Dbxref=Genbank:NP_216588.1,GeneID:888321;Name=NP_216588.1;Note=decarboxylating;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cobL;locus_tag=Rv2072c;product=precorrin-6Y C(5%2C15)-methyltransferase;protein_id=NP_216588.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2330147 2330225 . - . ID=id-NC_000962.3:2330147..2330225;Note=79 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2330214 2330963 . - . ID=gene-Rv2073c;Dbxref=GeneID:887267;Name=Rv2073c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2073c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2330214 2330963 . - 0 ID=cds-NP_216589.1;Parent=gene-Rv2073c;Dbxref=Genbank:NP_216589.1,GeneID:887267;Name=NP_216589.1;Note=short chain dehydrogenase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2073c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216589.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2330993 2331406 . + . ID=gene-Rv2074;Dbxref=GeneID:888523;Name=Rv2074;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2074
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2330993 2331406 . + 0 ID=cds-NP_216590.1;Parent=gene-Rv2074;Dbxref=Genbank:NP_216590.1,GeneID:888523;Name=NP_216590.1;Note=PNP/PMP oxidase (pyridoxinephosphate oxidase) (PNPOX) (pyridoxine 5'-phosphate oxidase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2074;product=pyridoxamine 5'-phosphate oxidase;protein_id=NP_216590.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2331416 2332879 . - . ID=gene-Rv2075c;Dbxref=GeneID:888771;Name=Rv2075c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2075c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2331416 2332879 . - 0 ID=cds-NP_216591.1;Parent=gene-Rv2075c;Dbxref=Genbank:NP_216591.1,GeneID:888771;Name=NP_216591.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2075c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216591.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2333037 2333288 . - . ID=gene-Rv2076c;Dbxref=GeneID:887296;Name=Rv2076c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2076c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2333037 2333288 . - 0 ID=cds-NP_216592.1;Parent=gene-Rv2076c;Dbxref=Genbank:NP_216592.1,GeneID:887296;Name=NP_216592.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2076c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216592.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2333323 2334294 . - . ID=gene-Rv2077c;Dbxref=GeneID:887785;Name=Rv2077c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2077c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2333323 2334294 . - 0 ID=cds-NP_216593.1;Parent=gene-Rv2077c;Dbxref=Genbank:NP_216593.1,GeneID:887785;Name=NP_216593.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2077c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216593.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2334295 2334594 . - . ID=gene-Rv2077A;Dbxref=GeneID:3205060;Name=Rv2077A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2077A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2334295 2334594 . - 0 ID=cds-YP_177658.1;Parent=gene-Rv2077A;Dbxref=Genbank:YP_177658.1,GeneID:3205060;Name=YP_177658.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2077A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177658.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2335059 2335373 . + . ID=gene-Rv2078;Dbxref=GeneID:888071;Name=Rv2078;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2078
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2335059 2335373 . + 0 ID=cds-NP_216594.1;Parent=gene-Rv2078;Dbxref=Genbank:NP_216594.1,GeneID:888071;Name=NP_216594.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2078;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216594.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2335355 2337325 . + . ID=gene-Rv2079;Dbxref=GeneID:887333;Name=Rv2079;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2079
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2335355 2337325 . + 0 ID=cds-NP_216595.1;Parent=gene-Rv2079;Dbxref=Genbank:NP_216595.1,GeneID:887333;Name=NP_216595.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv2079;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216595.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2337306 2337869 . + . ID=gene-Rv2080;Dbxref=GeneID:887351;Name=lppJ;gbkey=Gene;gene=lppJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2080
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2337306 2337869 . + 0 ID=cds-NP_216596.1;Parent=gene-Rv2080;Dbxref=Genbank:NP_216596.1,GeneID:887351;Name=NP_216596.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppJ;locus_tag=Rv2080;product=lipoprotein LppJ;protein_id=NP_216596.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2338065 2338505 . - . ID=gene-Rv2081c;Dbxref=GeneID:887348;Name=Rv2081c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2081c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2338065 2338505 . - 0 ID=cds-NP_216597.1;Parent=gene-Rv2081c;Dbxref=Genbank:NP_216597.1,GeneID:887348;Name=NP_216597.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2081c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216597.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2338709 2340874 . + . ID=gene-Rv2082;Dbxref=GeneID:887795;Name=Rv2082;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2082
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2338709 2340874 . + 0 ID=cds-NP_216598.1;Parent=gene-Rv2082;Dbxref=Genbank:NP_216598.1,GeneID:887795;Name=NP_216598.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2082;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216598.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2340871 2341815 . + . ID=gene-Rv2083;Dbxref=GeneID:887281;Name=Rv2083;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2083
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2340871 2341815 . + 0 ID=cds-NP_216599.1;Parent=gene-Rv2083;Dbxref=Genbank:NP_216599.1,GeneID:887281;Name=NP_216599.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2083;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216599.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2341808 2342944 . + . ID=gene-Rv2084;Dbxref=GeneID:887350;Name=Rv2084;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2084
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2341808 2342944 . + 0 ID=cds-NP_216600.1;Parent=gene-Rv2084;Dbxref=Genbank:NP_216600.1,GeneID:887350;Name=NP_216600.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2084;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216600.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2342942 2344410 . + . ID=id-NC_000962.3:2342942..2344410;Note=IS1556%2C len: 1469 nt. Possible Insertion sequence-like region. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1556
+NC_000962.3 RefSeq gene 2343027 2343332 . + . ID=gene-Rv2085;Dbxref=GeneID:888138;Name=Rv2085;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2085
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2343027 2343332 . + 0 ID=cds-NP_216601.1;Parent=gene-Rv2085;Dbxref=Genbank:NP_216601.1,GeneID:888138;Name=NP_216601.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2085;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216601.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2343311 2343916 . + . ID=gene-Rv2086;Dbxref=GeneID:888128;Name=Rv2086;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2086
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2343311 2343916 . + 0 ID=cds-NP_216602.2;Parent=gene-Rv2086;Dbxref=Genbank:NP_216602.2,GeneID:888128;Name=NP_216602.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2086;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216602.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2344411 2346180 . + . ID=gene-Rv2088;Dbxref=GeneID:888322;Name=pknJ;gbkey=Gene;gene=pknJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2088
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2344411 2346180 . + 0 ID=cds-NP_216604.1;Parent=gene-Rv2088;Dbxref=Genbank:NP_216604.1,GeneID:888322;Name=NP_216604.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187). Cofactor: requires divalent cations for activity.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20185505];gbkey=CDS;gene=pknJ;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv2088;product=transmembrane serine/threonine-protein kinase PknJ;protein_id=NP_216604.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2346197 2347324 . - . ID=gene-Rv2089c;Dbxref=GeneID:887719;Name=pepE;gbkey=Gene;gene=pepE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2089c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2346197 2347324 . - 0 ID=cds-NP_216605.1;Parent=gene-Rv2089c;Dbxref=Genbank:NP_216605.1,GeneID:887719;Name=NP_216605.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=pepE;inference=protein motif:PROSITE:PS00491;locus_tag=Rv2089c;product=dipeptidase PepE;protein_id=NP_216605.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2347373 2348554 . + . ID=gene-Rv2090;Dbxref=GeneID:887924;Name=Rv2090;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2090
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2347373 2348554 . + 0 ID=cds-NP_216606.1;Parent=gene-Rv2090;Dbxref=Genbank:NP_216606.1,GeneID:887924;Name=NP_216606.1;Note=Belongs to family a of DNA polymerases.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2090;product=5'-3' exonuclease;protein_id=NP_216606.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2348558 2349292 . - . ID=gene-Rv2091c;Dbxref=GeneID:887469;Name=Rv2091c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2091c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2348558 2349292 . - 0 ID=cds-NP_216607.1;Parent=gene-Rv2091c;Dbxref=Genbank:NP_216607.1,GeneID:887469;Name=NP_216607.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2091c;product=membrane protein;protein_id=NP_216607.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2349334 2352054 . - . ID=gene-Rv2092c;Dbxref=GeneID:887736;Name=helY;gbkey=Gene;gene=helY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2092c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2349334 2352054 . - 0 ID=cds-NP_216608.1;Parent=gene-Rv2092c;Dbxref=Genbank:NP_216608.1,GeneID:887736;Name=NP_216608.1;Note=Belongs to the SKI2 subfamily of helicases.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=helY;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv2092c;product=ATP-dependent DNA helicase HelY;protein_id=NP_216608.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2352103 2353029 . - . ID=gene-Rv2093c;Dbxref=GeneID:888068;Name=tatC;gbkey=Gene;gene=tatC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2093c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2352103 2353029 . - 0 ID=cds-NP_216609.1;Parent=gene-Rv2093c;Dbxref=Genbank:NP_216609.1,GeneID:888068;Name=NP_216609.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=tatC;locus_tag=Rv2093c;product=Sec-independent protein translocase transmembrane protein TatC;protein_id=NP_216609.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2353046 2353297 . - . ID=gene-Rv2094c;Dbxref=GeneID:888086;Name=tatA;gbkey=Gene;gene=tatA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2094c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2353046 2353297 . - 0 ID=cds-NP_216610.1;Parent=gene-Rv2094c;Dbxref=Genbank:NP_216610.1,GeneID:888086;Name=NP_216610.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=tatA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2094c;product=Sec-independent protein translocase membrane-bound protein TatA;protein_id=NP_216610.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2353365 2354315 . - . ID=gene-Rv2095c;Dbxref=GeneID:888403;Name=pafC;gbkey=Gene;gene=pafC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2095c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2353365 2354315 . - 0 ID=cds-NP_216611.1;Parent=gene-Rv2095c;Dbxref=Genbank:NP_216611.1,GeneID:888403;Name=NP_216611.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:17277063];gbkey=CDS;gene=pafC;locus_tag=Rv2095c;product=proteasome accessory factor C;protein_id=NP_216611.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2354312 2355310 . - . ID=gene-Rv2096c;Dbxref=GeneID:888436;Name=pafB;gbkey=Gene;gene=pafB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2096c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2354312 2355310 . - 0 ID=cds-NP_216612.1;Parent=gene-Rv2096c;Dbxref=Genbank:NP_216612.1,GeneID:888436;Name=NP_216612.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:17277063];gbkey=CDS;gene=pafB;locus_tag=Rv2096c;product=proteasome accessory factor B;protein_id=NP_216612.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2355319 2356677 . - . ID=gene-Rv2097c;Dbxref=GeneID:888460;Name=pafA;gbkey=Gene;gene=pafA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=paf;locus_tag=Rv2097c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2355319 2356677 . - 0 ID=cds-NP_216613.1;Parent=gene-Rv2097c;Dbxref=Genbank:NP_216613.1,GeneID:888460;Name=NP_216613.1;Note=Belongs to the carboxylate amine/ammonia ligase family.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:17277063];gbkey=CDS;gene=pafA;locus_tag=Rv2097c;product=proteasome accessory factor PafA;protein_id=NP_216613.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2356729 2358033 . - . ID=gene-Rv2098c;Dbxref=GeneID:888312;Name=PE_PGRS36;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS36;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2098c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2356729 2358033 . - . ID=id-Rv2098c;Dbxref=GeneID:888312;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=misc_feature;gene=PE_PGRS36;locus_tag=Rv2098c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2358033 2358206 . - . ID=gene-Rv2099c;Dbxref=GeneID:887413;Name=PE21;gbkey=Gene;gene=PE21;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2099c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2358033 2358206 . - . ID=id-Rv2099c;Dbxref=GeneID:887413;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=misc_feature;gene=PE21;locus_tag=Rv2099c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2358389 2360041 . + . ID=gene-Rv2100;Dbxref=GeneID:888454;Name=Rv2100;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2100
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2358389 2360041 . + 0 ID=cds-NP_216616.1;Parent=gene-Rv2100;Dbxref=Genbank:NP_216616.1,GeneID:888454;Name=NP_216616.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2100;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216616.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2360240 2363281 . + . ID=gene-Rv2101;Dbxref=GeneID:888635;Name=helZ;gbkey=Gene;gene=helZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2101
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2360240 2363281 . + 0 ID=cds-NP_216617.2;Parent=gene-Rv2101;Dbxref=Genbank:NP_216617.2,GeneID:888635;Name=NP_216617.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=helZ;locus_tag=Rv2101;product=helicase HelZ;protein_id=NP_216617.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2363391 2364107 . + . ID=gene-Rv2102;Dbxref=GeneID:888639;Name=Rv2102;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2102
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2363391 2364107 . + 0 ID=cds-NP_216618.1;Parent=gene-Rv2102;Dbxref=Genbank:NP_216618.1,GeneID:888639;Name=NP_216618.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2102;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216618.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2364086 2364520 . - . ID=gene-Rv2103c;Dbxref=GeneID:888003;Name=vapC37;gbkey=Gene;gene=vapC37;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2103c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2364086 2364520 . - 0 ID=cds-NP_216619.1;Parent=gene-Rv2103c;Dbxref=Genbank:NP_216619.1,GeneID:888003;Name=NP_216619.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2104c%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC37;locus_tag=Rv2103c;product=ribonuclease VapC37;protein_id=NP_216619.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2364527 2364781 . - . ID=gene-Rv2104c;Dbxref=GeneID:888014;Name=vapB37;gbkey=Gene;gene=vapB37;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2104c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2364527 2364781 . - 0 ID=cds-NP_216620.1;Parent=gene-Rv2104c;Dbxref=Genbank:NP_216620.1,GeneID:888014;Name=NP_216620.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2103c;gbkey=CDS;gene=vapB37;locus_tag=Rv2104c;product=antitoxin VapB37;protein_id=NP_216620.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2364797 2365054 . - . ID=gene-Rv2104a;Dbxref=GeneID:19394677;Name=Rv2104a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2104a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2364797 2365054 . - 0 ID=cds-YP_009030035.1;Parent=gene-Rv2104a;Dbxref=Genbank:YP_009030035.1,GeneID:19394677;Name=YP_009030035.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2104a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030035.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2365414 2366768 . + . ID=id-NC_000962.3:2365414..2366768;Note=IS6110-5%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-5
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2365414 2365441 . + . ID=id-NC_000962.3:2365414..2365441;Note=28bp inverted repeat at the left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2366741 2366768 . - . ID=id-NC_000962.3:2366741..2366768;Note=28bp inverted repeat at the right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2367359 2367655 . + . ID=gene-Rv2107;Dbxref=GeneID:887811;Name=PE22;gbkey=Gene;gene=PE22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2107
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2367359 2367655 . + 0 ID=cds-YP_177858.1;Parent=gene-Rv2107;Dbxref=Genbank:YP_177858.1,GeneID:887811;Name=YP_177858.1;Note=Member of mycobacterial PE family. A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;gene=PE22;locus_tag=Rv2107;product=PE family protein PE22;protein_id=YP_177858.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2367711 2368442 . + . ID=gene-Rv2108;Dbxref=GeneID:887814;Name=PPE36;gbkey=Gene;gene=PPE36;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2108
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2367711 2368442 . + 0 ID=cds-YP_177859.1;Parent=gene-Rv2108;Dbxref=Genbank:YP_177859.1,GeneID:887814;Name=YP_177859.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PPE36;locus_tag=Rv2108;product=PPE family protein PPE36;protein_id=YP_177859.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2368983 2369729 . - . ID=gene-Rv2109c;Dbxref=GeneID:887538;Name=prcA;gbkey=Gene;gene=prcA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2109c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2368983 2369729 . - 0 ID=cds-NP_216625.1;Parent=gene-Rv2109c;Dbxref=Genbank:NP_216625.1,GeneID:887538;Name=NP_216625.1;Note=assembles with beta subunit PrcB;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=prcA;locus_tag=Rv2109c;product=proteasome subunit alpha;protein_id=NP_216625.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2369726 2370601 . - . ID=gene-Rv2110c;Dbxref=GeneID:887508;Name=prcB;gbkey=Gene;gene=prcB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2110c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2369726 2370601 . - 0 ID=cds-NP_216626.1;Parent=gene-Rv2110c;Dbxref=Genbank:NP_216626.1,GeneID:887508;Name=NP_216626.1;Note=assembles with alpha subunit PrcA;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:16468985];gbkey=CDS;gene=prcB;locus_tag=Rv2110c;product=proteasome subunit beta;protein_id=NP_216626.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2370598 2370792 . - . ID=gene-Rv2111c;Dbxref=GeneID:888788;Name=pup;gbkey=Gene;gene=pup;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2111c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2370598 2370792 . - 0 ID=cds-NP_216627.1;Parent=gene-Rv2111c;Dbxref=Genbank:NP_216627.1,GeneID:888788;Name=NP_216627.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18832610];gbkey=CDS;gene=pup;locus_tag=Rv2111c;product=ubiquitin-like protein Pup;protein_id=NP_216627.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2370905 2372569 . - . ID=gene-Rv2112c;Dbxref=GeneID:888290;Name=dop;gbkey=Gene;gene=dop;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2112c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2370905 2372569 . - 0 ID=cds-NP_216628.1;Parent=gene-Rv2112c;Dbxref=Genbank:NP_216628.1,GeneID:888290;Name=NP_216628.1;Note=Cofactor: ATP;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:20705495];gbkey=CDS;gene=dop;locus_tag=Rv2112c;product=pup deamidase/depupylase;protein_id=NP_216628.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2372437 2372492 . + . ID=id-NC_000962.3:2372437..2372492;Note=56 bp direct repeat 1%2CGCCCGCCGACGATGCGGGCCGCGCAGCGGGCCGCTGAGGAGGCGGGCATCAAGCAA;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2372494 2372549 . + . ID=id-NC_000962.3:2372494..2372549;Note=56 bp direct repeat 2%2CGCCCGCCGACGATGCGGGCCGCGCAGCGGGCCGCTGAGGAGGCGGGCATCAAGCAA;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2372630 2373823 . + . ID=gene-Rv2113;Dbxref=GeneID:887731;Name=Rv2113;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2113
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2372630 2373823 . + 0 ID=cds-NP_216629.1;Parent=gene-Rv2113;Dbxref=Genbank:NP_216629.1,GeneID:887731;Name=NP_216629.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2113;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216629.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2373834 2374457 . + . ID=gene-Rv2114;Dbxref=GeneID:887803;Name=Rv2114;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2114
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2373834 2374457 . + 0 ID=cds-NP_216630.1;Parent=gene-Rv2114;Dbxref=Genbank:NP_216630.1,GeneID:887803;Name=NP_216630.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2114;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216630.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2374461 2376290 . - . ID=gene-Rv2115c;Dbxref=GeneID:887297;Name=mpa;gbkey=Gene;gene=mpa;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2115c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2374461 2376290 . - 0 ID=cds-NP_216631.1;Parent=gene-Rv2115c;Dbxref=Genbank:NP_216631.1,GeneID:887297;Name=NP_216631.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15659170];gbkey=CDS;gene=mpa;inference=protein motif:PROSITE:PS00674;locus_tag=Rv2115c;product=proteasome-associated ATPase;protein_id=NP_216631.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2376571 2377140 . + . ID=gene-Rv2116;Dbxref=GeneID:886029;Name=lppK;gbkey=Gene;gene=lppK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2116
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2376571 2377140 . + 0 ID=cds-NP_216632.1;Parent=gene-Rv2116;Dbxref=Genbank:NP_216632.1,GeneID:886029;Name=NP_216632.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppK;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2116;product=lipoprotein LppK;protein_id=NP_216632.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2377148 2377441 . + . ID=gene-Rv2117;Dbxref=GeneID:887685;Name=Rv2117;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2117
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2377148 2377441 . + 0 ID=cds-NP_216633.1;Parent=gene-Rv2117;Dbxref=Genbank:NP_216633.1,GeneID:887685;Name=NP_216633.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2117;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216633.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2377470 2378312 . - . ID=gene-Rv2118c;Dbxref=GeneID:887374;Name=Rv2118c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2118c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2377470 2378312 . - 0 ID=cds-NP_216634.1;Parent=gene-Rv2118c;Dbxref=Genbank:NP_216634.1,GeneID:887374;Name=NP_216634.1;Note=S-adenosyl-l-methionine-dependent RNA methyltransferase. The larger catalytic C-terminal domain binds the cofactor S-adenosyl-l-methionine (AdoMet) and is involved in the transfer of methyl group from AdoMet to the substrate.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:14960715];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2118c;product=tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase;protein_id=NP_216634.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2378386 2379222 . + . ID=gene-Rv2119;Dbxref=GeneID:888413;Name=Rv2119;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2119
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2378386 2379222 . + 0 ID=cds-NP_216635.1;Parent=gene-Rv2119;Dbxref=Genbank:NP_216635.1,GeneID:888413;Name=NP_216635.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2119;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216635.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2379245 2379727 . - . ID=gene-Rv2120c;Dbxref=GeneID:887821;Name=Rv2120c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2120c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2379245 2379727 . - 0 ID=cds-NP_216636.1;Parent=gene-Rv2120c;Dbxref=Genbank:NP_216636.1,GeneID:887821;Name=NP_216636.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2120c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216636.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2379806 2380660 . - . ID=gene-Rv2121c;Dbxref=GeneID:888689;Name=hisG;gbkey=Gene;gene=hisG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2121c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2379806 2380660 . - 0 ID=cds-NP_216637.1;Parent=gene-Rv2121c;Dbxref=Genbank:NP_216637.1,GeneID:888689;Name=NP_216637.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12511575];gbkey=CDS;gene=hisG;locus_tag=Rv2121c;product=ATP phosphoribosyltransferase;protein_id=NP_216637.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2380663 2380944 . - . ID=gene-Rv2122c;Dbxref=GeneID:888671;Name=hisE;gbkey=Gene;gene=hisE;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=irg1;locus_tag=Rv2122c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2380663 2380944 . - 0 ID=cds-YP_177860.1;Parent=gene-Rv2122c;Dbxref=Genbank:YP_177860.1,GeneID:888671;Name=YP_177860.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:18560150];gbkey=CDS;gene=hisE;locus_tag=Rv2122c;product=phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase;protein_id=YP_177860.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2381071 2382492 . + . ID=gene-Rv2123;Dbxref=GeneID:888710;Name=PPE37;gbkey=Gene;gene=PPE37;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=irg2;locus_tag=Rv2123
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2381071 2382492 . + 0 ID=cds-YP_177861.1;Parent=gene-Rv2123;Dbxref=Genbank:YP_177861.1,GeneID:888710;Name=YP_177861.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE37;locus_tag=Rv2123;product=PPE family protein PPE37;protein_id=YP_177861.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2382489 2386067 . - . ID=gene-Rv2124c;Dbxref=GeneID:888711;Name=metH;gbkey=Gene;gene=metH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2124c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2382489 2386067 . - 0 ID=cds-NP_216640.1;Parent=gene-Rv2124c;Dbxref=Genbank:NP_216640.1,GeneID:888711;Name=NP_216640.1;Note=MetH%2C 5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase MetH;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=metH;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv2124c;product=methionine synthase;protein_id=NP_216640.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2386293 2387171 . + . ID=gene-Rv2125;Dbxref=GeneID:887798;Name=Rv2125;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2125
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2386293 2387171 . + 0 ID=cds-NP_216641.1;Parent=gene-Rv2125;Dbxref=Genbank:NP_216641.1,GeneID:887798;Name=NP_216641.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2125;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216641.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2387202 2387972 . - . ID=gene-Rv2126c;Dbxref=GeneID:887791;Name=PE_PGRS37;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS37;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2126c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2387202 2387972 . - 0 ID=cds-YP_177862.1;Parent=gene-Rv2126c;Dbxref=Genbank:YP_177862.1,GeneID:887791;Name=YP_177862.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS37;locus_tag=Rv2126c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS37;protein_id=YP_177862.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2388616 2390085 . + . ID=gene-Rv2127;Dbxref=GeneID:887715;Name=ansP1;gbkey=Gene;gene=ansP1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2127
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2388616 2390085 . + 0 ID=cds-YP_177863.1;Parent=gene-Rv2127;Dbxref=Genbank:YP_177863.1,GeneID:887715;Name=YP_177863.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ansP1;inference=protein motif:PROSITE:PS00218;locus_tag=Rv2127;product=L-asparagine permease;protein_id=YP_177863.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2390085 2390288 . + . ID=gene-Rv2128;Dbxref=GeneID:887764;Name=Rv2128;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2128
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2390085 2390288 . + 0 ID=cds-NP_216644.1;Parent=gene-Rv2128;Dbxref=Genbank:NP_216644.1,GeneID:887764;Name=NP_216644.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2128;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216644.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2390308 2391189 . - . ID=gene-Rv2129c;Dbxref=GeneID:887841;Name=Rv2129c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2129c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2390308 2391189 . - 0 ID=cds-NP_216645.1;Parent=gene-Rv2129c;Dbxref=Genbank:NP_216645.1,GeneID:887841;Name=NP_216645.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2129c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216645.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2391215 2392459 . - . ID=gene-Rv2130c;Dbxref=GeneID:887492;Name=mshC;gbkey=Gene;gene=mshC;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cysS2;locus_tag=Rv2130c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2391215 2392459 . - 0 ID=cds-NP_216646.1;Parent=gene-Rv2130c;Dbxref=Genbank:NP_216646.1,GeneID:887492;Name=NP_216646.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mshC;locus_tag=Rv2130c;product=cysteine:1D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy--D-glucopyranoside ligase;protein_id=NP_216646.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2399798 2400328 . - . ID=gene-Rv2140c;Dbxref=GeneID:888118;Name=TB18.6;gbkey=Gene;gene=TB18.6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2140c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2400376 2401722 . - . ID=gene-Rv2141c;Dbxref=GeneID:887384;Name=Rv2141c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2141c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2400376 2401722 . - 0 ID=cds-YP_177864.1;Parent=gene-Rv2141c;Dbxref=Genbank:YP_177864.1,GeneID:887384;Name=YP_177864.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00758;locus_tag=Rv2141c;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177864.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2401987 2402072 . + . ID=gene-Rvnt22;Dbxref=GeneID:2700467;Name=leuU;gbkey=Gene;gene=leuU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt22
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+NC_000962.3 RefSeq exon 2401987 2402072 . + . ID=exon-Rvnt22-1;Parent=rna-Rvnt22;Dbxref=GeneID:2700467;Note=leuU%2C tRNA-Leu%2C anticodon gag%2C length %3D 86;anticodon=(pos:2402020..2402022);codons=17;gbkey=tRNA;gene=leuU;locus_tag=Rvnt22;product=tRNA-Leu
+NC_000962.3 RefSeq gene 2402193 2402510 . - . ID=gene-Rv2142c;Dbxref=GeneID:888770;Name=parE2;gbkey=Gene;gene=parE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2142c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2402193 2402510 . - 0 ID=cds-NP_216658.1;Parent=gene-Rv2142c;Dbxref=Genbank:NP_216658.1,GeneID:888770;Name=NP_216658.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2142A;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=parE2;locus_tag=Rv2142c;product=toxin ParE2;protein_id=NP_216658.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2402507 2402722 . - . ID=gene-Rv2142A;Dbxref=GeneID:14515895;Name=parD2;gbkey=Gene;gene=parD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2142A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2402507 2402722 . - 0 ID=cds-YP_007410825.1;Parent=gene-Rv2142A;Dbxref=Genbank:YP_007410825.1,GeneID:14515895;Name=YP_007410825.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2142c;gbkey=CDS;gene=parD2;locus_tag=Rv2142A;product=antitoxin ParD2;protein_id=YP_007410825.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2402977 2404035 . + . ID=gene-Rv2143;Dbxref=GeneID:887406;Name=Rv2143;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2143
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2402977 2404035 . + 0 ID=cds-NP_216659.1;Parent=gene-Rv2143;Dbxref=Genbank:NP_216659.1,GeneID:887406;Name=NP_216659.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2143;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216659.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2404165 2404521 . - . ID=gene-Rv2144c;Dbxref=GeneID:888202;Name=Rv2144c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2144c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2405666 2405956 . - . ID=gene-Rv2146c;Dbxref=GeneID:888759;Name=Rv2146c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2146c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2406118 2406843 . - . ID=gene-Rv2147c;Dbxref=GeneID:887394;Name=Rv2147c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2147c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2406118 2406843 . - 0 ID=cds-NP_216663.1;Parent=gene-Rv2147c;Dbxref=Genbank:NP_216663.1,GeneID:887394;Name=NP_216663.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2147c;product=cell division protein SepF;protein_id=NP_216663.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2406840 2407616 . - . ID=gene-Rv2148c;Dbxref=GeneID:888127;Name=Rv2148c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2148c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2407622 2408374 . - . ID=gene-Rv2149c;Dbxref=GeneID:888121;Name=yfiH;gbkey=Gene;gene=yfiH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2149c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2407622 2408374 . - 0 ID=cds-NP_216665.1;Parent=gene-Rv2149c;Dbxref=Genbank:NP_216665.1,GeneID:888121;Name=NP_216665.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=yfiH;locus_tag=Rv2149c;product=laccase domain-containing protein;protein_id=NP_216665.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2408385 2409524 . - . ID=gene-Rv2150c;Dbxref=GeneID:888369;Name=ftsZ;gbkey=Gene;gene=ftsZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2150c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2408385 2409524 . - 0 ID=cds-NP_216666.1;Parent=gene-Rv2150c;Dbxref=Genbank:NP_216666.1,GeneID:888369;Name=NP_216666.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ftsZ;inference=protein motif:PROSITE:PS01135;locus_tag=Rv2150c;product=cell division protein FtsZ;protein_id=NP_216666.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2409697 2410641 . - . ID=gene-Rv2151c;Dbxref=GeneID:888367;Name=ftsQ;gbkey=Gene;gene=ftsQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2151c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2409697 2410641 . - 0 ID=cds-NP_216667.1;Parent=gene-Rv2151c;Dbxref=Genbank:NP_216667.1,GeneID:888367;Name=NP_216667.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ftsQ;locus_tag=Rv2151c;product=cell division protein FtsQ;protein_id=NP_216667.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2410638 2412122 . - . ID=gene-Rv2152c;Dbxref=GeneID:887983;Name=murC;gbkey=Gene;gene=murC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2152c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2410638 2412122 . - 0 ID=cds-NP_216668.1;Parent=gene-Rv2152c;Dbxref=Genbank:NP_216668.1,GeneID:887983;Name=NP_216668.1;gbkey=CDS;gene=murC;locus_tag=Rv2152c;product=UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase;protein_id=NP_216668.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2412119 2413351 . - . ID=gene-Rv2153c;Dbxref=GeneID:888036;Name=murG;gbkey=Gene;gene=murG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2153c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2412119 2413351 . - 0 ID=cds-NP_216669.1;Parent=gene-Rv2153c;Dbxref=Genbank:NP_216669.1,GeneID:888036;Name=NP_216669.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=murG;locus_tag=Rv2153c;product=UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl-(pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol-N-acetylglucosamine transferase;protein_id=NP_216669.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2413348 2414922 . - . ID=gene-Rv2154c;Dbxref=GeneID:887916;Name=ftsW;gbkey=Gene;gene=ftsW;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2154c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2413348 2414922 . - 0 ID=cds-NP_216670.1;Parent=gene-Rv2154c;Dbxref=Genbank:NP_216670.1,GeneID:887916;Name=NP_216670.1;gbkey=CDS;gene=ftsW;locus_tag=Rv2154c;product=lipid II flippase FtsW;protein_id=NP_216670.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2414934 2416394 . - . ID=gene-Rv2155c;Dbxref=GeneID:888000;Name=murD;gbkey=Gene;gene=murD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2155c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2414934 2416394 . - 0 ID=cds-NP_216671.3;Parent=gene-Rv2155c;Dbxref=Genbank:NP_216671.3,GeneID:888000;Name=NP_216671.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=murD;inference=protein motif:PROSITE:PS01011;locus_tag=Rv2155c;product=UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase;protein_id=NP_216671.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2416396 2417475 . - . ID=gene-Rv2156c;Dbxref=GeneID:888098;Name=murX;gbkey=Gene;gene=murX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2156c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2416396 2417475 . - 0 ID=cds-NP_216672.1;Parent=gene-Rv2156c;Dbxref=Genbank:NP_216672.1,GeneID:888098;Name=NP_216672.1;gbkey=CDS;gene=murX;locus_tag=Rv2156c;product=phospho-N-acetylmuramoyl-pentappeptidetransferase;protein_id=NP_216672.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2417472 2419004 . - . ID=gene-Rv2157c;Dbxref=GeneID:887826;Name=murF;gbkey=Gene;gene=murF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2157c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2417472 2419004 . - 0 ID=cds-NP_216673.1;Parent=gene-Rv2157c;Dbxref=Genbank:NP_216673.1,GeneID:887826;Name=NP_216673.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=murF;locus_tag=Rv2157c;product=UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D-alanine ligase;protein_id=NP_216673.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2419001 2420608 . - . ID=gene-Rv2158c;Dbxref=GeneID:887252;Name=murE;gbkey=Gene;gene=murE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2158c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2419001 2420608 . - 0 ID=cds-NP_216674.1;Parent=gene-Rv2158c;Dbxref=Genbank:NP_216674.1,GeneID:887252;Name=NP_216674.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=murE;locus_tag=Rv2158c;product=UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2%2C6-diaminopimelate ligase;protein_id=NP_216674.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2420631 2421665 . - . ID=gene-Rv2159c;Dbxref=GeneID:887236;Name=Rv2159c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2159c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2420631 2421665 . - 0 ID=cds-NP_216675.1;Parent=gene-Rv2159c;Dbxref=Genbank:NP_216675.1,GeneID:887236;Name=NP_216675.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2159c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216675.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2421662 2422278 . - . ID=gene-Rv2160c;Dbxref=GeneID:886254;Name=Rv2160c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2160c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2422271 2423137 . - . ID=gene-Rv2161c;Dbxref=GeneID:887978;Name=Rv2161c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2161c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2422271 2423137 . - 0 ID=cds-NP_216677.1;Parent=gene-Rv2161c;Dbxref=Genbank:NP_216677.1,GeneID:887978;Name=NP_216677.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2161c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216677.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2423240 2424838 . - . ID=gene-Rv2162c;Dbxref=GeneID:887300;Name=PE_PGRS38;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS38;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2162c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2423240 2424838 . - 0 ID=cds-YP_177865.1;Parent=gene-Rv2162c;Dbxref=Genbank:YP_177865.1,GeneID:887300;Name=YP_177865.1;Note=Member of M. tuberculosis PE_PGRS family. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS38;locus_tag=Rv2162c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS38;protein_id=YP_177865.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2425048 2427087 . - . ID=gene-Rv2163c;Dbxref=GeneID:887949;Name=pbpB;gbkey=Gene;gene=pbpB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ftsI;locus_tag=Rv2163c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2425048 2427087 . - 0 ID=cds-NP_216679.1;Parent=gene-Rv2163c;Dbxref=Genbank:NP_216679.1,GeneID:887949;Name=NP_216679.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=pbpB;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2163c;product=penicillin-binding membrane protein PbpB;protein_id=NP_216679.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2427084 2428238 . - . ID=gene-Rv2164c;Dbxref=GeneID:887217;Name=Rv2164c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2164c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2427084 2428238 . - 0 ID=cds-NP_216680.1;Parent=gene-Rv2164c;Dbxref=Genbank:NP_216680.1,GeneID:887217;Name=NP_216680.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2164c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216680.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2428235 2429425 . - . ID=gene-Rv2165c;Dbxref=GeneID:888462;Name=Rv2165c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2165c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2428235 2429425 . - 0 ID=cds-NP_216681.4;Parent=gene-Rv2165c;Dbxref=Genbank:NP_216681.4,GeneID:888462;Name=NP_216681.4;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2165c;product=rRNA small subunit methyltransferase H;protein_id=NP_216681.4;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2429427 2429858 . - . ID=gene-Rv2166c;Dbxref=GeneID:888261;Name=Rv2166c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2166c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2429427 2429858 . - 0 ID=cds-NP_216682.1;Parent=gene-Rv2166c;Dbxref=Genbank:NP_216682.1,GeneID:888261;Name=NP_216682.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2166c;product=transcriptional regulator MraZ;protein_id=NP_216682.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2430117 2431471 . - . ID=id-NC_000962.3:2430117..2431471;Note=IS6110-6%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-6
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2430117 2430144 . - . ID=id-NC_000962.3:2430117..2430144;Note=28 bp Inverted repeat at the left end of IS6110%3B GAGTCTCCGGACTCACCGGGGCGGTTCA;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2431444 2431471 . - . ID=id-NC_000962.3:2431444..2431471;Note=28 bp Inverted repeat at the right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2431565 2431969 . - . ID=gene-Rv2169c;Dbxref=GeneID:888257;Name=Rv2169c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2169c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2431565 2431969 . - 0 ID=cds-NP_216685.1;Parent=gene-Rv2169c;Dbxref=Genbank:NP_216685.1,GeneID:888257;Name=NP_216685.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2169c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216685.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2432235 2432855 . + . ID=gene-Rv2170;Dbxref=GeneID:888170;Name=Rv2170;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2170
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2432235 2432855 . + 0 ID=cds-NP_216686.1;Parent=gene-Rv2170;Dbxref=Genbank:NP_216686.1,GeneID:888170;Name=NP_216686.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2170;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_216686.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2432951 2433634 . + . ID=gene-Rv2171;Dbxref=GeneID:887522;Name=lppM;gbkey=Gene;gene=lppM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2171
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2432951 2433634 . + 0 ID=cds-NP_216687.1;Parent=gene-Rv2171;Dbxref=Genbank:NP_216687.1,GeneID:887522;Name=NP_216687.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppM;inference=protein motif:PROSITE:PS00225;locus_tag=Rv2171;product=lipoprotein LppM;protein_id=NP_216687.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2433631 2434536 . - . ID=gene-Rv2172c;Dbxref=GeneID:888147;Name=Rv2172c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2172c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2433631 2434536 . - 0 ID=cds-NP_216688.1;Parent=gene-Rv2172c;Dbxref=Genbank:NP_216688.1,GeneID:888147;Name=NP_216688.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2172c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216688.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2434847 2435905 . + . ID=gene-Rv2173;Dbxref=GeneID:888334;Name=idsA2;gbkey=Gene;gene=idsA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2173
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2434847 2435905 . + 0 ID=cds-NP_216689.1;Parent=gene-Rv2173;Dbxref=Genbank:NP_216689.1,GeneID:888334;Name=NP_216689.1;Note=ggppsase (GGPP synthetase) (geranylgeranyl diphosphate synthase);gbkey=CDS;gene=idsA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00723;locus_tag=Rv2173;product=geranylgeranyl pyrophosphate synthetase IdsA;protein_id=NP_216689.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2435909 2437459 . + . ID=gene-Rv2174;Dbxref=GeneID:887528;Name=mptA;gbkey=Gene;gene=mptA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2174
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2435909 2437459 . + 0 ID=cds-NP_216690.1;Parent=gene-Rv2174;Dbxref=Genbank:NP_216690.1,GeneID:887528;Name=NP_216690.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17714444];gbkey=CDS;gene=mptA;locus_tag=Rv2174;product=alpha(1->6)-mannopyranosyltransferase A;protein_id=NP_216690.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2437446 2437886 . - . ID=gene-Rv2175c;Dbxref=GeneID:887852;Name=Rv2175c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2175c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2437446 2437886 . - 0 ID=cds-NP_216691.1;Parent=gene-Rv2175c;Dbxref=Genbank:NP_216691.1,GeneID:887852;Name=NP_216691.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19457863];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2175c;product=DNA-binding protein;protein_id=NP_216691.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2437823 2437866 . - . ID=id-Rv2175c;Dbxref=GeneID:887852;Note=mcr5%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C cloned from M. bovis BCG Pasteur%3B ends not mapped%2C ~~82 nt band detected by Northern blot.%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature;locus_tag=Rv2175c
+NC_000962.3 RefSeq gene 2437941 2439140 . + . ID=gene-Rv2176;Dbxref=GeneID:888340;Name=pknL;gbkey=Gene;gene=pknL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2176
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2437941 2439140 . + 0 ID=cds-NP_216692.1;Parent=gene-Rv2176;Dbxref=Genbank:NP_216692.1,GeneID:888340;Name=NP_216692.1;Note=protein kinase L (STPK L);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:18175374];gbkey=CDS;gene=pknL;inference=protein motif:PROSITE:PS00108;locus_tag=Rv2176;product=serine/threonine-protein kinase PknL;protein_id=NP_216692.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2439145 2439948 . - . ID=id-NC_000962.3:2439145..2439948;Note=IS1558-1%2C len: 804 nt. Insertion sequence IS1558%2Cnearly identical to complement of region 24105 24908 in EM_BA:MTCY428 Z81451 Mycobacterium tuberculosis cosmid Y428.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1558-1
+NC_000962.3 RefSeq gene 2439282 2439947 . - . ID=gene-Rv2177c;Dbxref=GeneID:888326;Name=Rv2177c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2177c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2439282 2439947 . - 0 ID=cds-NP_216693.1;Parent=gene-Rv2177c;Dbxref=Genbank:NP_216693.1,GeneID:888326;Name=NP_216693.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2177c;product=transposase;protein_id=NP_216693.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2440332 2441720 . - . ID=gene-Rv2178c;Dbxref=GeneID:888309;Name=aroG;gbkey=Gene;gene=aroG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2178c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2440332 2441720 . - 0 ID=cds-NP_216694.1;Parent=gene-Rv2178c;Dbxref=Genbank:NP_216694.1,GeneID:888309;Name=NP_216694.1;Note=DAHP synthetase%2C phenylalanine-repressible;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=aroG;locus_tag=Rv2178c;product=phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase AroG;protein_id=NP_216694.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2441811 2442317 . - . ID=gene-Rv2179c;Dbxref=GeneID:887927;Name=Rv2179c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2179c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2441811 2442317 . - 0 ID=cds-NP_216695.1;Parent=gene-Rv2179c;Dbxref=Genbank:NP_216695.1,GeneID:887927;Name=NP_216695.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:24311791];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2179c;product=3'-5' exoribonuclease;protein_id=NP_216695.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2442327 2443214 . - . ID=gene-Rv2180c;Dbxref=GeneID:887954;Name=Rv2180c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2180c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2442327 2443214 . - 0 ID=cds-NP_216696.1;Parent=gene-Rv2180c;Dbxref=Genbank:NP_216696.1,GeneID:887954;Name=NP_216696.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2180c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216696.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2443302 2444585 . + . ID=gene-Rv2181;Dbxref=GeneID:888269;Name=Rv2181;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2181
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2443302 2444585 . + 0 ID=cds-NP_216697.1;Parent=gene-Rv2181;Dbxref=Genbank:NP_216697.1,GeneID:888269;Name=NP_216697.1;Note=Polyprenol-phosphate-mannose-dependent;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:16945913];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2181;product=alpha-(1-2)-phosphatidylinositol mannoside mannosyltransferase;protein_id=NP_216697.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2444586 2445329 . - . ID=gene-Rv2182c;Dbxref=GeneID:888625;Name=Rv2182c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2182c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2444586 2445329 . - 0 ID=cds-NP_216698.1;Parent=gene-Rv2182c;Dbxref=Genbank:NP_216698.1,GeneID:888625;Name=NP_216698.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2182c;product=1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase;protein_id=NP_216698.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2445415 2445810 . - . ID=gene-Rv2183c;Dbxref=GeneID:887650;Name=Rv2183c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2183c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2445415 2445810 . - 0 ID=cds-NP_216699.1;Parent=gene-Rv2183c;Dbxref=Genbank:NP_216699.1,GeneID:887650;Name=NP_216699.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2183c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216699.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2445807 2446946 . - . ID=gene-Rv2184c;Dbxref=GeneID:888152;Name=Rv2184c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2184c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2445807 2446946 . - 0 ID=cds-NP_216700.1;Parent=gene-Rv2184c;Dbxref=Genbank:NP_216700.1,GeneID:888152;Name=NP_216700.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2184c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216700.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2451247 2452020 . - . ID=gene-Rv2189c;Dbxref=GeneID:887575;Name=Rv2189c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2189c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2452115 2453272 . - . ID=gene-Rv2190c;Dbxref=GeneID:888670;Name=Rv2190c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2190c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2453819 2455756 . + . ID=gene-Rv2191;Dbxref=GeneID:887265;Name=Rv2191;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2191
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2455631 2456743 . - . ID=gene-Rv2192c;Dbxref=GeneID:887681;Name=trpD;gbkey=Gene;gene=trpD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2192c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2456901 2457512 . + . ID=gene-Rv2193;Dbxref=GeneID:887425;Name=ctaE;gbkey=Gene;gene=ctaE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2193
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2456901 2457512 . + 0 ID=cds-NP_216709.1;Parent=gene-Rv2193;Dbxref=Genbank:NP_216709.1,GeneID:887425;Name=NP_216709.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ctaE;locus_tag=Rv2193;product=cytochrome C oxidase subunit III;protein_id=NP_216709.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2457553 2458395 . + . ID=gene-Rv2194;Dbxref=GeneID:888737;Name=qcrC;gbkey=Gene;gene=qcrC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2194
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2457553 2458395 . + 0 ID=cds-NP_216710.1;Parent=gene-Rv2194;Dbxref=Genbank:NP_216710.1,GeneID:888737;Name=NP_216710.1;Note=Ubiquinol-cytochrome C reductase cytochrome C subunit;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=qcrC;locus_tag=Rv2194;product=ubiquinol-cytochrome C reductase cytochrome subunit C;protein_id=NP_216710.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2458392 2459681 . + . ID=gene-Rv2195;Dbxref=GeneID:888420;Name=qcrA;gbkey=Gene;gene=qcrA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2195
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2458392 2459681 . + 0 ID=cds-NP_216711.1;Parent=gene-Rv2195;Dbxref=Genbank:NP_216711.1,GeneID:888420;Name=NP_216711.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=qcrA;locus_tag=Rv2195;product=ubiquinol-cytochrome C reductase rieske iron-sulfur subunit;protein_id=NP_216711.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2458392 2458449 . + . ID=id-Rv2195;Dbxref=GeneID:888420;Note=58 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II I. Overlaps Rv2195 suggesting alternative GTG start at 2458 468 may be used;gbkey=repeat_region;gene=qcrA;locus_tag=Rv2195
+NC_000962.3 RefSeq gene 2459678 2461327 . + . ID=gene-Rv2196;Dbxref=GeneID:887400;Name=qcrB;gbkey=Gene;gene=qcrB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2196
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2459678 2461327 . + 0 ID=cds-NP_216712.1;Parent=gene-Rv2196;Dbxref=Genbank:NP_216712.1,GeneID:887400;Name=NP_216712.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=qcrB;locus_tag=Rv2196;product=ubiquinol-cytochrome C reductase cytochrome subunit B;protein_id=NP_216712.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2461504 2462148 . - . ID=gene-Rv2197c;Dbxref=GeneID:887213;Name=Rv2197c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2197c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2461504 2462148 . - 0 ID=cds-NP_216713.1;Parent=gene-Rv2197c;Dbxref=Genbank:NP_216713.1,GeneID:887213;Name=NP_216713.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2197c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216713.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2462148 2463047 . - . ID=gene-Rv2198c;Dbxref=GeneID:887471;Name=mmpS3;gbkey=Gene;gene=mmpS3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2198c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2462148 2463047 . - 0 ID=cds-NP_216714.1;Parent=gene-Rv2198c;Dbxref=Genbank:NP_216714.1,GeneID:887471;Name=NP_216714.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mmpS3;locus_tag=Rv2198c;product=membrane protein MmpS3;protein_id=NP_216714.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2463233 2463652 . - . ID=gene-Rv2199c;Dbxref=GeneID:888692;Name=Rv2199c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2199c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2463233 2463652 . - 0 ID=cds-NP_216715.1;Parent=gene-Rv2199c;Dbxref=Genbank:NP_216715.1,GeneID:888692;Name=NP_216715.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2199c;product=cytochrome c oxidase polypeptide 4;protein_id=NP_216715.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2463660 2464751 . - . ID=gene-Rv2200c;Dbxref=GeneID:888799;Name=ctaC;gbkey=Gene;gene=ctaC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2200c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2463660 2464751 . - 0 ID=cds-NP_216716.1;Parent=gene-Rv2200c;Dbxref=Genbank:NP_216716.1,GeneID:888799;Name=NP_216716.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ctaC;locus_tag=Rv2200c;product=cytochrome C oxidase subunit II;protein_id=NP_216716.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2464997 2466955 . + . ID=gene-Rv2201;Dbxref=GeneID:888472;Name=asnB;gbkey=Gene;gene=asnB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2201
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2464997 2466955 . + 0 ID=cds-NP_216717.1;Parent=gene-Rv2201;Dbxref=Genbank:NP_216717.1,GeneID:888472;Name=NP_216717.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=asnB;locus_tag=Rv2201;product=asparagine synthetase;protein_id=NP_216717.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2467053 2468027 . - . ID=gene-Rv2202c;Dbxref=GeneID:888551;Name=adoK;gbkey=Gene;gene=adoK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2202c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2467053 2468027 . - 0 ID=cds-NP_216718.1;Parent=gene-Rv2202c;Dbxref=Genbank:NP_216718.1,GeneID:888551;Name=NP_216718.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=adoK;locus_tag=Rv2202c;product=adenosine kinase;protein_id=NP_216718.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2468231 2468923 . + . ID=gene-Rv2203;Dbxref=GeneID:888318;Name=Rv2203;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2203
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2468231 2468923 . + 0 ID=cds-NP_216719.1;Parent=gene-Rv2203;Dbxref=Genbank:NP_216719.1,GeneID:888318;Name=NP_216719.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2203;product=membrane protein;protein_id=NP_216719.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2468931 2469287 . - . ID=gene-Rv2204c;Dbxref=GeneID:888428;Name=Rv2204c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2204c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2468931 2469287 . - 0 ID=cds-NP_216720.1;Parent=gene-Rv2204c;Dbxref=Genbank:NP_216720.1,GeneID:888428;Name=NP_216720.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2204c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216720.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2469387 2470463 . - . ID=gene-Rv2205c;Dbxref=GeneID:887277;Name=Rv2205c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2205c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2469387 2470463 . - 0 ID=cds-NP_216721.2;Parent=gene-Rv2205c;Dbxref=Genbank:NP_216721.2,GeneID:887277;Name=NP_216721.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2205c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216721.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2470622 2471332 . + . ID=gene-Rv2206;Dbxref=GeneID:888107;Name=Rv2206;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2206
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2470622 2471332 . + 0 ID=cds-NP_216722.2;Parent=gene-Rv2206;Dbxref=Genbank:NP_216722.2,GeneID:888107;Name=NP_216722.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2206;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216722.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2471411 2472496 . + . ID=gene-Rv2207;Dbxref=GeneID:887781;Name=cobT;gbkey=Gene;gene=cobT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2207
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2471411 2472496 . + 0 ID=cds-NP_216723.1;Parent=gene-Rv2207;Dbxref=Genbank:NP_216723.1,GeneID:887781;Name=NP_216723.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cobT;locus_tag=Rv2207;product=nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazol phosphoribosyltransferase;protein_id=NP_216723.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2472493 2473242 . + . ID=gene-Rv2208;Dbxref=GeneID:887572;Name=cobS;gbkey=Gene;gene=cobS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2208
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2472493 2473242 . + 0 ID=cds-NP_216724.1;Parent=gene-Rv2208;Dbxref=Genbank:NP_216724.1,GeneID:887572;Name=NP_216724.1;gbkey=CDS;gene=cobS;locus_tag=Rv2208;product=adenosylcobinamide-GDP ribazoletransferase;protein_id=NP_216724.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2473400 2474938 . + . ID=gene-Rv2209;Dbxref=GeneID:887230;Name=Rv2209;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2209
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2473400 2474938 . + 0 ID=cds-NP_216725.1;Parent=gene-Rv2209;Dbxref=Genbank:NP_216725.1,GeneID:887230;Name=NP_216725.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2209;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216725.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2474864 2475970 . - . ID=gene-Rv2210c;Dbxref=GeneID:888352;Name=ilvE;gbkey=Gene;gene=ilvE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2210c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2474864 2475970 . - 0 ID=cds-NP_216726.1;Parent=gene-Rv2210c;Dbxref=Genbank:NP_216726.1,GeneID:888352;Name=NP_216726.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ilvE;locus_tag=Rv2210c;product=branched-chain amino acid aminotransferase;protein_id=NP_216726.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2476042 2477181 . - . ID=gene-Rv2211c;Dbxref=GeneID:887233;Name=gcvT;gbkey=Gene;gene=gcvT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2211c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2476042 2477181 . - 0 ID=cds-NP_216727.1;Parent=gene-Rv2211c;Dbxref=Genbank:NP_216727.1,GeneID:887233;Name=NP_216727.1;Note=glycine cleavage system T protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gcvT;locus_tag=Rv2211c;product=aminomethyltransferase;protein_id=NP_216727.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2477190 2478326 . + . ID=gene-Rv2212;Dbxref=GeneID:887979;Name=Rv2212;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2212
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2477190 2478326 . + 0 ID=cds-NP_216728.1;Parent=gene-Rv2212;Dbxref=Genbank:NP_216728.1,GeneID:887979;Name=NP_216728.1;Note=ATP pyrophosphate-lyase%2C adenylate cyclase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2212;product=adenylyl cyclase;protein_id=NP_216728.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2478338 2479885 . + . ID=gene-Rv2213;Dbxref=GeneID:888105;Name=pepB;gbkey=Gene;gene=pepB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2213
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2484584 2485276 . + 0 ID=cds-NP_216733.1;Parent=gene-Rv2217;Dbxref=Genbank:NP_216733.1,GeneID:887626;Name=NP_216733.1;Note=lipoate biosynthesis protein LipB;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16735476];gbkey=CDS;gene=lipB;locus_tag=Rv2217;product=octanoyltransferase;protein_id=NP_216733.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2485273 2486208 . + . ID=gene-Rv2218;Dbxref=GeneID:887922;Name=lipA;gbkey=Gene;gene=lipA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2218
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2485273 2486208 . + 0 ID=cds-NP_216734.1;Parent=gene-Rv2218;Dbxref=Genbank:NP_216734.1,GeneID:887922;Name=NP_216734.1;gbkey=CDS;gene=lipA;locus_tag=Rv2218;product=lipoyl synthase;protein_id=NP_216734.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2486235 2486987 . + . ID=gene-Rv2219;Dbxref=GeneID:888380;Name=Rv2219;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2219
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2486235 2486987 . + 0 ID=cds-NP_216735.1;Parent=gene-Rv2219;Dbxref=Genbank:NP_216735.1,GeneID:888380;Name=NP_216735.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2219;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216735.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2486994 2487416 . - . ID=gene-Rv2219A;Dbxref=GeneID:3205099;Name=Rv2219A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2219A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2486994 2487416 . - 0 ID=cds-YP_177661.1;Parent=gene-Rv2219A;Dbxref=Genbank:YP_177661.1,GeneID:3205099;Name=YP_177661.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2219A;product=membrane protein;protein_id=YP_177661.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2487615 2489051 . + . ID=gene-Rv2220;Dbxref=GeneID:888383;Name=glnA1;gbkey=Gene;gene=glnA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=glnA;locus_tag=Rv2220
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2487615 2489051 . + 0 ID=cds-NP_216736.1;Parent=gene-Rv2220;Dbxref=Genbank:NP_216736.1,GeneID:888383;Name=NP_216736.1;Note=glnA1%2C glutamine synthetase class I;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=glnA1;inference=protein motif:PROSITE:PS00182;locus_tag=Rv2220;product=glutamine synthetase;protein_id=NP_216736.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2489369 2492353 . - . ID=gene-Rv2221c;Dbxref=GeneID:887995;Name=glnE;gbkey=Gene;gene=glnE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2221c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2489369 2492353 . - 0 ID=cds-NP_216737.1;Parent=gene-Rv2221c;Dbxref=Genbank:NP_216737.1,GeneID:887995;Name=NP_216737.1;Note=glutamine-synthetase adenylyltransferase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=glnE;locus_tag=Rv2221c;product=[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase;protein_id=NP_216737.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2492402 2493742 . - . ID=gene-Rv2222c;Dbxref=GeneID:888238;Name=glnA2;gbkey=Gene;gene=glnA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2222c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2492402 2493742 . - 0 ID=cds-NP_216738.1;Parent=gene-Rv2222c;Dbxref=Genbank:NP_216738.1,GeneID:888238;Name=NP_216738.1;Note=glnA2%2Cglutamine synthetase class II;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=glnA2;locus_tag=Rv2222c;product=glutamine synthetase;protein_id=NP_216738.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2493801 2493818 . + . ID=id-NC_000962.3:2493801..2493818;Note=18 bp inverted repeat between 3' end of MTCY427.04c and 5' end of MTCY427.03c;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2493837 2495399 . - . ID=gene-Rv2223c;Dbxref=GeneID:888093;Name=Rv2223c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2223c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2493837 2495399 . - 0 ID=cds-NP_216739.1;Parent=gene-Rv2223c;Dbxref=Genbank:NP_216739.1,GeneID:888093;Name=NP_216739.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:17428787];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv2223c;product=carboxylesterase B;protein_id=NP_216739.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2495461 2497023 . - . ID=gene-Rv2224c;Dbxref=GeneID:887857;Name=caeA;gbkey=Gene;gene=caeA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2224c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2495461 2497023 . - 0 ID=cds-NP_216740.1;Parent=gene-Rv2224c;Dbxref=Genbank:NP_216740.1,GeneID:887857;Name=NP_216740.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:17428787];gbkey=CDS;gene=caeA;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv2224c;product=carboxylesterase A;protein_id=NP_216740.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2497225 2497446 . - . ID=gene-Rv2224d;Dbxref=GeneID:19394678;Name=Rv2224d;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2224d
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2497225 2497446 . - 0 ID=cds-YP_009030036.1;Parent=gene-Rv2224d;Dbxref=Genbank:YP_009030036.1,GeneID:19394678;Name=YP_009030036.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2224d;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030036.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2497742 2498587 . + . ID=gene-Rv2225;Dbxref=GeneID:887440;Name=panB;gbkey=Gene;gene=panB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2225
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2497742 2498587 . + 0 ID=cds-NP_216741.1;Parent=gene-Rv2225;Dbxref=Genbank:NP_216741.1,GeneID:887440;Name=NP_216741.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12515554];gbkey=CDS;gene=panB;locus_tag=Rv2225;product=3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase;protein_id=NP_216741.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2498832 2500373 . + . ID=gene-Rv2226;Dbxref=GeneID:888513;Name=Rv2226;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2226
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2498832 2500373 . + 0 ID=cds-NP_216742.1;Parent=gene-Rv2226;Dbxref=Genbank:NP_216742.1,GeneID:888513;Name=NP_216742.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2226;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216742.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2500445 2500751 . - . ID=gene-Rvns01;Dbxref=GeneID:2700434;Name=rnpB;gbkey=Gene;gene=rnpB;gene_biotype=misc_RNA;locus_tag=Rvns01
+NC_000962.3 RefSeq transcript 2500445 2500751 . - . ID=rna-Rvns01;Parent=gene-Rvns01;Dbxref=GeneID:2700434;Note=rnpB%2C rna component of RNase P.;gbkey=misc_RNA;gene=rnpB;locus_tag=Rvns01;product=Ribonuclease P RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 2500445 2500751 . - . ID=exon-Rvns01-1;Parent=rna-Rvns01;Dbxref=GeneID:2700434;Note=rnpB%2C rna component of RNase P.;gbkey=misc_RNA;gene=rnpB;locus_tag=Rvns01;product=Ribonuclease P RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 2500931 2501632 . + . ID=gene-Rv2227;Dbxref=GeneID:888581;Name=Rv2227;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2227
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2500931 2501632 . + 0 ID=cds-NP_216743.1;Parent=gene-Rv2227;Dbxref=Genbank:NP_216743.1,GeneID:888581;Name=NP_216743.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2227;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216743.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2501644 2502738 . - . ID=gene-Rv2228c;Dbxref=GeneID:888108;Name=Rv2228c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2228c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2501644 2502738 . - 0 ID=cds-NP_216744.1;Parent=gene-Rv2228c;Dbxref=Genbank:NP_216744.1,GeneID:888108;Name=NP_216744.1;Note=Multifunctional protein with RNase H%2C alpha-ribazole phosphatase%2C and acid phosphatase activities.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2228c;product=multifunctional RNASE H/alpha-ribazole phosphatase/acid phosphatase;protein_id=NP_216744.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2502735 2503472 . - . ID=gene-Rv2229c;Dbxref=GeneID:888264;Name=Rv2229c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2229c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2502735 2503472 . - 0 ID=cds-NP_216745.1;Parent=gene-Rv2229c;Dbxref=Genbank:NP_216745.1,GeneID:888264;Name=NP_216745.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2229c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216745.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2503469 2504608 . - . ID=gene-Rv2230c;Dbxref=GeneID:888231;Name=Rv2230c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2230c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2503469 2504608 . - 0 ID=cds-NP_216746.1;Parent=gene-Rv2230c;Dbxref=Genbank:NP_216746.1,GeneID:888231;Name=NP_216746.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2230c;product=GTP cyclohydrolase;protein_id=NP_216746.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2504605 2505699 . - . ID=gene-Rv2231c;Dbxref=GeneID:888337;Name=cobC;gbkey=Gene;gene=cobC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2231c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2504605 2505699 . - 0 ID=cds-NP_216747.1;Parent=gene-Rv2231c;Dbxref=Genbank:NP_216747.1,GeneID:888337;Name=NP_216747.1;gbkey=CDS;gene=cobC;inference=protein motif:PROSITE:PS00105;locus_tag=Rv2231c;product=aminotransferase;protein_id=NP_216747.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2505736 2506161 . - . ID=gene-Rv2231A;Dbxref=GeneID:14515883;Name=vapC16;gbkey=Gene;gene=vapC16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2231A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2505736 2506161 . - 0 ID=cds-YP_007410917.1;Parent=gene-Rv2231A;Dbxref=Genbank:YP_007410917.1,GeneID:14515883;Name=YP_007410917.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2231B;gbkey=CDS;gene=vapC16;locus_tag=Rv2231A;product=ribonuclease VapC16;protein_id=YP_007410917.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2506207 2506383 . - . ID=gene-Rv2231B;Dbxref=GeneID:14515901;Name=vapB16;gbkey=Gene;gene=vapB16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2231B
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2506207 2506383 . - 0 ID=cds-YP_007410918.1;Parent=gene-Rv2231B;Dbxref=Genbank:YP_007410918.1,GeneID:14515901;Name=YP_007410918.1;Note=antitoxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2231A;gbkey=CDS;gene=vapB16;locus_tag=Rv2231B;product=antitoxin VapB16;protein_id=YP_007410918.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2506278 2507153 . + . ID=gene-Rv2232;Dbxref=GeneID:887597;Name=ptkA;gbkey=Gene;gene=ptkA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2232
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2506278 2507153 . + 0 ID=cds-NP_216748.2;Parent=gene-Rv2232;Dbxref=Genbank:NP_216748.2,GeneID:887597;Name=NP_216748.2;gbkey=CDS;gene=ptkA;locus_tag=Rv2232;product=protein tyrosine kinase transcriptional regulator PtkA;protein_id=NP_216748.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2507146 2507637 . + . ID=gene-Rv2234;Dbxref=GeneID:887373;Name=ptpA;gbkey=Gene;gene=ptpA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=MPtpA;locus_tag=Rv2234
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2507146 2507637 . + 0 ID=cds-NP_216750.1;Parent=gene-Rv2234;Dbxref=Genbank:NP_216750.1,GeneID:887373;Name=NP_216750.1;Note=phosphotyrosine protein phosphatase (PTPase) (LMW phosphatase)%2C low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ptpA;locus_tag=Rv2234;product=protein-tyrosine-phosphatase;protein_id=NP_216750.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2507637 2508452 . + . ID=gene-Rv2235;Dbxref=GeneID:887606;Name=Rv2235;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2235
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2507637 2508452 . + 0 ID=cds-NP_216751.1;Parent=gene-Rv2235;Dbxref=Genbank:NP_216751.1,GeneID:887606;Name=NP_216751.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2235;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216751.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2508434 2509375 . - . ID=gene-Rv2236c;Dbxref=GeneID:887513;Name=cobD;gbkey=Gene;gene=cobD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2236c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2508434 2509375 . - 0 ID=cds-NP_216752.1;Parent=gene-Rv2236c;Dbxref=Genbank:NP_216752.1,GeneID:887513;Name=NP_216752.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cobD;locus_tag=Rv2236c;product=cobalamin biosynthesis transmembrane protein CobD;protein_id=NP_216752.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2509489 2510256 . + . ID=gene-Rv2237;Dbxref=GeneID:887840;Name=Rv2237;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2237
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2509489 2510256 . + 0 ID=cds-NP_216753.1;Parent=gene-Rv2237;Dbxref=Genbank:NP_216753.1,GeneID:887840;Name=NP_216753.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2237;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216753.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2510351 2510587 . - . ID=gene-Rv2237A;Dbxref=GeneID:14515864;Name=Rv2237A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2237A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2510351 2510587 . - 0 ID=cds-YP_004837056.2;Parent=gene-Rv2237A;Dbxref=Genbank:YP_004837056.2,GeneID:14515864;Name=YP_004837056.2;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2237A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_004837056.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2510598 2510669 . - . ID=gene-Rvnt23;Dbxref=GeneID:2700452;Name=valV;gbkey=Gene;gene=valV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt23
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2510598 2510669 . - . ID=rna-Rvnt23;Parent=gene-Rvnt23;Dbxref=GeneID:2700452;Note=valV%2C tRNA-Val%2C anticodon tac%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(2510635..2510637));codons=50;gbkey=tRNA;gene=valV;locus_tag=Rvnt23;product=tRNA-Val
+NC_000962.3 RefSeq exon 2510598 2510669 . - . ID=exon-Rvnt23-1;Parent=rna-Rvnt23;Dbxref=GeneID:2700452;Note=valV%2C tRNA-Val%2C anticodon tac%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(2510635..2510637));codons=50;gbkey=tRNA;gene=valV;locus_tag=Rvnt23;product=tRNA-Val
+NC_000962.3 RefSeq gene 2510715 2511176 . - . ID=gene-Rv2238c;Dbxref=GeneID:887871;Name=ahpE;gbkey=Gene;gene=ahpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2238c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2510715 2511176 . - 0 ID=cds-NP_216754.1;Parent=gene-Rv2238c;Dbxref=Genbank:NP_216754.1,GeneID:887871;Name=NP_216754.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ahpE;locus_tag=Rv2238c;product=peroxiredoxin;protein_id=NP_216754.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2511176 2511652 . - . ID=gene-Rv2239c;Dbxref=GeneID:888451;Name=Rv2239c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2239c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2511176 2511652 . - 0 ID=cds-NP_216755.1;Parent=gene-Rv2239c;Dbxref=Genbank:NP_216755.1,GeneID:888451;Name=NP_216755.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2239c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216755.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2511690 2512280 . - . ID=gene-Rv2240c;Dbxref=GeneID:888600;Name=Rv2240c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2240c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2511690 2512280 . - 0 ID=cds-NP_216756.2;Parent=gene-Rv2240c;Dbxref=Genbank:NP_216756.2,GeneID:888600;Name=NP_216756.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2240c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216756.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2512539 2515244 . + . ID=gene-Rv2241;Dbxref=GeneID:887246;Name=aceE;gbkey=Gene;gene=aceE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2241
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2512539 2515244 . + 0 ID=cds-NP_216757.3;Parent=gene-Rv2241;Dbxref=Genbank:NP_216757.3,GeneID:887246;Name=NP_216757.3;Note=pyruvate decarboxylase (pyruvate dehydrogenase) (pyruvic dehydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=aceE;locus_tag=Rv2241;product=pyruvate dehydrogenase E1 component;protein_id=NP_216757.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2515304 2516548 . + . ID=gene-Rv2242;Dbxref=GeneID:888624;Name=Rv2242;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2242
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2515304 2516548 . + 0 ID=cds-NP_216758.1;Parent=gene-Rv2242;Dbxref=Genbank:NP_216758.1,GeneID:888624;Name=NP_216758.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2242;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216758.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2516787 2517695 . + . ID=gene-Rv2243;Dbxref=GeneID:888769;Name=fabD;gbkey=Gene;gene=fabD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtFabD;locus_tag=Rv2243
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2516787 2517695 . + 0 ID=cds-NP_216759.1;Parent=gene-Rv2243;Dbxref=Genbank:NP_216759.1,GeneID:888769;Name=NP_216759.1;Note=malonyl CoA:ACPM acyltransferase (MCT);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:11373295];gbkey=CDS;gene=fabD;locus_tag=Rv2243;product=malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase;protein_id=NP_216759.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2517032 2517134 . - . ID=gene-RVnc0018;Dbxref=GeneID:14515885;Name=mcr16;gbkey=Gene;gene=mcr16;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0018
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 2517032 2517134 . - . ID=rna-RVnc0018;Parent=gene-RVnc0018;Dbxref=GeneID:14515885;Note=mcr16%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C ~~100 nt band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=mcr16;locus_tag=RVnc0018;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 2517032 2517134 . - . ID=exon-RVnc0018-1;Parent=rna-RVnc0018;Dbxref=GeneID:14515885;Note=mcr16%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C ~~100 nt band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=mcr16;locus_tag=RVnc0018;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 2517771 2518118 . + . ID=gene-Rv2244;Dbxref=GeneID:888272;Name=acpM;gbkey=Gene;gene=acpM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2244
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2517771 2518118 . + 0 ID=cds-NP_216760.1;Parent=gene-Rv2244;Dbxref=Genbank:NP_216760.1,GeneID:888272;Name=NP_216760.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=acpM;locus_tag=Rv2244;product=meromycolate extension acyl carrier protein;protein_id=NP_216760.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2518115 2519365 . + . ID=gene-Rv2245;Dbxref=GeneID:887269;Name=kasA;gbkey=Gene;gene=kasA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2245
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2518115 2519365 . + 0 ID=cds-NP_216761.1;Parent=gene-Rv2245;Dbxref=Genbank:NP_216761.1,GeneID:887269;Name=NP_216761.1;Note=beta-ketoacyl-ACP synthase (KAS I)%3B belongs to the fas-II system%2C which utilizes primarily palmitoyl-ACP rather than short-chain acyl-ACP primers.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:11600501];gbkey=CDS;gene=kasA;locus_tag=Rv2245;product=3-oxoacyl-ACP synthase 1;protein_id=NP_216761.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2519396 2520712 . + . ID=gene-Rv2246;Dbxref=GeneID:887539;Name=kasB;gbkey=Gene;gene=kasB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2246
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2519396 2520712 . + 0 ID=cds-NP_216762.1;Parent=gene-Rv2246;Dbxref=Genbank:NP_216762.1,GeneID:887539;Name=NP_216762.1;Note=beta-ketoacyl-ACP synthase (KAS I);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:11600501];gbkey=CDS;gene=kasB;locus_tag=Rv2246;product=3-oxoacyl-ACP synthase 2;protein_id=NP_216762.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2520743 2522164 . + . ID=gene-Rv2247;Dbxref=GeneID:887671;Name=accD6;gbkey=Gene;gene=accD6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2247
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2520743 2522164 . + 0 ID=cds-NP_216763.1;Parent=gene-Rv2247;Dbxref=Genbank:NP_216763.1,GeneID:887671;Name=NP_216763.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=accD6;locus_tag=Rv2247;product=acetyl-/propionyl-CoA carboxylase subunit beta;protein_id=NP_216763.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2522173 2522230 . + . ID=id-NC_000962.3:2522173..2522230;Note=58 bp inverted repeat near 3'end of MTCY427.28;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2522360 2523175 . + . ID=gene-Rv2248;Dbxref=GeneID:888603;Name=Rv2248;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2248
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2522360 2523175 . + 0 ID=cds-NP_216764.1;Parent=gene-Rv2248;Dbxref=Genbank:NP_216764.1,GeneID:888603;Name=NP_216764.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2248;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216764.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2523184 2523236 . + . ID=id-NC_000962.3:2523184..2523236;Note=53 bp inverted repeat between 3' ends of MTCY427.29 and MT CY427.31c;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2523241 2524791 . - . ID=gene-Rv2249c;Dbxref=GeneID:887276;Name=glpD1;gbkey=Gene;gene=glpD1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2249c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2523241 2524791 . - 0 ID=cds-NP_216765.1;Parent=gene-Rv2249c;Dbxref=Genbank:NP_216765.1,GeneID:887276;Name=NP_216765.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glpD1;locus_tag=Rv2249c;product=glycerol-3-phosphate dehydrogenase;protein_id=NP_216765.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2524785 2525354 . - . ID=gene-Rv2250c;Dbxref=GeneID:888018;Name=Rv2250c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2250c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2524785 2525354 . - 0 ID=cds-NP_216766.2;Parent=gene-Rv2250c;Dbxref=Genbank:NP_216766.2,GeneID:888018;Name=NP_216766.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2250c;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_216766.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2525565 2526992 . + . ID=gene-Rv2251;Dbxref=GeneID:888706;Name=Rv2251;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2251
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2525565 2526992 . + 0 ID=cds-NP_216767.1;Parent=gene-Rv2251;Dbxref=Genbank:NP_216767.1,GeneID:888706;Name=NP_216767.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2251;product=flavoprotein;protein_id=NP_216767.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2526989 2527918 . + . ID=gene-Rv2252;Dbxref=GeneID:888429;Name=Rv2252;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2252
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2526989 2527918 . + 0 ID=cds-NP_216768.1;Parent=gene-Rv2252;Dbxref=Genbank:NP_216768.1,GeneID:888429;Name=NP_216768.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:16689792];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2252;product=diacylglycerol kinase;protein_id=NP_216768.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2527984 2528487 . + . ID=gene-Rv2253;Dbxref=GeneID:888287;Name=Rv2253;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2253
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2527984 2528487 . + 0 ID=cds-NP_216769.1;Parent=gene-Rv2253;Dbxref=Genbank:NP_216769.1,GeneID:888287;Name=NP_216769.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2253;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216769.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2528520 2528975 . - . ID=gene-Rv2254c;Dbxref=GeneID:887182;Name=Rv2254c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2254c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2528520 2528975 . - 0 ID=cds-NP_216770.1;Parent=gene-Rv2254c;Dbxref=Genbank:NP_216770.1,GeneID:887182;Name=NP_216770.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2254c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216770.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2528980 2529174 . - . ID=gene-Rv2256a;Dbxref=GeneID:885526;Name=Rv2256a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2256a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2528980 2529174 . - 0 ID=cds-YP_009030037.1;Parent=gene-Rv2256a;Dbxref=Genbank:YP_009030037.1,GeneID:885526;Name=YP_009030037.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2256a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030037.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2529341 2529874 . - . ID=gene-Rv2256c;Dbxref=GeneID:885865;Name=Rv2256c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2256c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2529341 2529874 . - 0 ID=cds-NP_216772.1;Parent=gene-Rv2256c;Dbxref=Genbank:NP_216772.1,GeneID:885865;Name=NP_216772.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2256c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216772.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2530004 2530822 . - . ID=gene-Rv2257c;Dbxref=GeneID:888069;Name=Rv2257c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2257c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2530004 2530822 . - 0 ID=cds-NP_216773.1;Parent=gene-Rv2257c;Dbxref=Genbank:NP_216773.1,GeneID:888069;Name=NP_216773.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2257c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216773.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2530836 2531897 . - . ID=gene-Rv2258c;Dbxref=GeneID:888755;Name=Rv2258c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2258c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2530836 2531897 . - 0 ID=cds-NP_216774.1;Parent=gene-Rv2258c;Dbxref=Genbank:NP_216774.1,GeneID:888755;Name=NP_216774.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2258c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_216774.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2531898 2531950 . - . ID=id-NC_000962.3:2531898..2531950;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2531951 2532003 . - . ID=id-NC_000962.3:2531951..2532003;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2532004 2532056 . - . ID=id-NC_000962.3:2532004..2532056;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2532057 2532109 . - . ID=id-NC_000962.3:2532057..2532109;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2532110 2532162 . - . ID=id-NC_000962.3:2532110..2532162;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2532163 2532212 . - . ID=id-NC_000962.3:2532163..2532212;Note=50 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2532245 2533330 . + . ID=gene-Rv2259;Dbxref=GeneID:887215;Name=mscR;gbkey=Gene;gene=mscR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2259
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2532245 2533330 . + 0 ID=cds-NP_216775.1;Parent=gene-Rv2259;Dbxref=Genbank:NP_216775.1,GeneID:887215;Name=NP_216775.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mscR;inference=protein motif:PROSITE:PS00059;locus_tag=Rv2259;product=S-nitrosomycothiol reductase MscR;protein_id=NP_216775.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2533330 2533965 . + . ID=gene-Rv2260;Dbxref=GeneID:888490;Name=Rv2260;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2260
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2533330 2533965 . + 0 ID=cds-NP_216776.1;Parent=gene-Rv2260;Dbxref=Genbank:NP_216776.1,GeneID:888490;Name=NP_216776.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2260;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216776.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2534042 2535552 . - . ID=gene-Rv2261c;Dbxref=GeneID:887455;Name=Rv2261c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2261c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2535641 2536594 . + . ID=gene-Rv2263;Dbxref=GeneID:887788;Name=Rv2263;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2263
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2535641 2536594 . + 0 ID=cds-NP_216779.1;Parent=gene-Rv2263;Dbxref=Genbank:NP_216779.1,GeneID:887788;Name=NP_216779.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2263;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216779.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2536572 2538350 . - . ID=gene-Rv2264c;Dbxref=GeneID:888040;Name=Rv2264c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2264c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2536572 2538350 . - 0 ID=cds-NP_216780.1;Parent=gene-Rv2264c;Dbxref=Genbank:NP_216780.1,GeneID:888040;Name=NP_216780.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00343;locus_tag=Rv2264c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216780.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2538700 2539929 . + . ID=gene-Rv2265;Dbxref=GeneID:887976;Name=Rv2265;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2265
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2538700 2539929 . + 0 ID=cds-NP_216781.1;Parent=gene-Rv2265;Dbxref=Genbank:NP_216781.1,GeneID:887976;Name=NP_216781.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2265;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216781.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2540104 2541390 . + . ID=gene-Rv2266;Dbxref=GeneID:887763;Name=cyp124;gbkey=Gene;gene=cyp124;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2266
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2540104 2541390 . + 0 ID=cds-NP_216782.1;Parent=gene-Rv2266;Dbxref=Genbank:NP_216782.1,GeneID:887763;Name=NP_216782.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cyp124;locus_tag=Rv2266;product=cytochrome P450 Cyp124;protein_id=NP_216782.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2541644 2542810 . - . ID=gene-Rv2267c;Dbxref=GeneID:888487;Name=Rv2267c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2267c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2541644 2542810 . - 0 ID=cds-NP_216783.1;Parent=gene-Rv2267c;Dbxref=Genbank:NP_216783.1,GeneID:888487;Name=NP_216783.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2267c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216783.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2542807 2544276 . - . ID=gene-Rv2268c;Dbxref=GeneID:888025;Name=cyp128;gbkey=Gene;gene=cyp128;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2268c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2542807 2544276 . - 0 ID=cds-NP_216784.1;Parent=gene-Rv2268c;Dbxref=Genbank:NP_216784.1,GeneID:888025;Name=NP_216784.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=cyp128;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv2268c;product=cytochrome P450 Cyp128;protein_id=NP_216784.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2544289 2544621 . - . ID=gene-Rv2269c;Dbxref=GeneID:887623;Name=Rv2269c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2269c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2544289 2544621 . - 0 ID=cds-NP_216785.1;Parent=gene-Rv2269c;Dbxref=Genbank:NP_216785.1,GeneID:887623;Name=NP_216785.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2269c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216785.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2544698 2545225 . + . ID=gene-Rv2270;Dbxref=GeneID:887448;Name=lppN;gbkey=Gene;gene=lppN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2270
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2544698 2545225 . + 0 ID=cds-NP_216786.1;Parent=gene-Rv2270;Dbxref=Genbank:NP_216786.1,GeneID:887448;Name=NP_216786.1;gbkey=CDS;gene=lppN;locus_tag=Rv2270;product=lipoprotein LppN;protein_id=NP_216786.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2545332 2545631 . + . ID=gene-Rv2271;Dbxref=GeneID:887223;Name=Rv2271;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2271
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2545332 2545631 . + 0 ID=cds-NP_216787.1;Parent=gene-Rv2271;Dbxref=Genbank:NP_216787.1,GeneID:887223;Name=NP_216787.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2271;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216787.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2545737 2546105 . + . ID=gene-Rv2272;Dbxref=GeneID:887459;Name=Rv2272;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2272
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2545737 2546105 . + 0 ID=cds-NP_216788.1;Parent=gene-Rv2272;Dbxref=Genbank:NP_216788.1,GeneID:887459;Name=NP_216788.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2272;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216788.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2546102 2546431 . + . ID=gene-Rv2273;Dbxref=GeneID:888440;Name=Rv2273;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2273
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2546102 2546431 . + 0 ID=cds-NP_216789.1;Parent=gene-Rv2273;Dbxref=Genbank:NP_216789.1,GeneID:888440;Name=NP_216789.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2273;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216789.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2546488 2546805 . - . ID=gene-Rv2274c;Dbxref=GeneID:888067;Name=mazF8;gbkey=Gene;gene=mazF8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2274c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2546488 2546805 . - 0 ID=cds-NP_216790.1;Parent=gene-Rv2274c;Dbxref=Genbank:NP_216790.1,GeneID:888067;Name=NP_216790.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2274c;gbkey=CDS;gene=mazF8;locus_tag=Rv2274c;product=toxin MazF8;protein_id=NP_216790.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2546839 2547087 . - . ID=gene-Rv2274A;Dbxref=GeneID:14515891;Name=mazE8;gbkey=Gene;gene=mazE8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2274A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2546839 2547087 . - 0 ID=cds-YP_007410963.1;Parent=gene-Rv2274A;Dbxref=Genbank:YP_007410963.1,GeneID:14515891;Name=YP_007410963.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2274c;gbkey=CDS;gene=mazE8;locus_tag=Rv2274A;product=antitoxin MazE8;protein_id=YP_007410963.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2546883 2547752 . + . ID=gene-Rv2275;Dbxref=GeneID:888355;Name=Rv2275;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2275
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2546883 2547752 . + 0 ID=cds-NP_216791.1;Parent=gene-Rv2275;Dbxref=Genbank:NP_216791.1,GeneID:888355;Name=NP_216791.1;Note=Rv2275%2C (MTCY339.35c);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20852636];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2275;product=cyclo(L-tyrosyl-L-tyrosyl) synthase;protein_id=NP_216791.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2547749 2548939 . + . ID=gene-Rv2276;Dbxref=GeneID:888373;Name=cyp121;gbkey=Gene;gene=cyp121;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2276
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2547749 2548939 . + 0 ID=cds-NP_216792.1;Parent=gene-Rv2276;Dbxref=Genbank:NP_216792.1,GeneID:888373;Name=NP_216792.1;Note=mycocyclosin synthase%3B catalyzes the formation of mycocyclosin from cyclotyrosine;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19416919];gbkey=CDS;gene=cyp121;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv2276;product=cytochrome P450 Cyp121;protein_id=NP_216792.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2549124 2550029 . - . ID=gene-Rv2277c;Dbxref=GeneID:888498;Name=Rv2277c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2277c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2549124 2550029 . - 0 ID=cds-NP_216793.1;Parent=gene-Rv2277c;Dbxref=Genbank:NP_216793.1,GeneID:888498;Name=NP_216793.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2277c;product=glycerolphosphodiesterase;protein_id=NP_216793.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2550011 2550013 . + . ID=id-NC_000962.3:2550011..2550013;Note=3 bp direct repeat%2C ccg%2C flanking IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2550014 2551368 . + . ID=id-NC_000962.3:2550014..2551368;Note=IS6110-7%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-7
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2550014 2550041 . + . ID=id-NC_000962.3:2550014..2550041;Note=28 bp inverted repeat at the left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2550065 2551326 . + . ID=id-NC_000962.3:2550065..2551326;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable IS6110 transposase. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990);gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2551341 2551368 . + . ID=id-NC_000962.3:2551341..2551368;Note=28 bp inverted repeat at the right end of IS6110%2CGAGTCTCCGGACTCACCGGGGCGGTTCA;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2551369 2551371 . + . ID=id-NC_000962.3:2551369..2551371;Note=3 bp direct repeat%2C ccg%2C flanking IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2551560 2552939 . + . ID=gene-Rv2280;Dbxref=GeneID:887601;Name=Rv2280;gbkey=Gene;gene_biotype=other;locus_tag=Rv2280
+NC_000962.3 RefSeq gene 2553173 2554831 . + . ID=gene-Rv2281;Dbxref=GeneID:887257;Name=pitB;gbkey=Gene;gene=pitB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2281
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2553173 2554831 . + 0 ID=cds-NP_216797.1;Parent=gene-Rv2281;Dbxref=Genbank:NP_216797.1,GeneID:887257;Name=NP_216797.1;gbkey=CDS;gene=pitB;locus_tag=Rv2281;product=phosphate permease;protein_id=NP_216797.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2554938 2555876 . - . ID=gene-Rv2282c;Dbxref=GeneID:887253;Name=Rv2282c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2282c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2554938 2555876 . - 0 ID=cds-NP_216798.1;Parent=gene-Rv2282c;Dbxref=Genbank:NP_216798.1,GeneID:887253;Name=NP_216798.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv2282c;product=LysR family HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_216798.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2555941 2556135 . + . ID=gene-Rv2283;Dbxref=GeneID:887644;Name=Rv2283;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2283
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2555941 2556135 . + 0 ID=cds-NP_216799.1;Parent=gene-Rv2283;Dbxref=Genbank:NP_216799.1,GeneID:887644;Name=NP_216799.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2283;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216799.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2556145 2557440 . + . ID=gene-Rv2284;Dbxref=GeneID:887794;Name=lipM;gbkey=Gene;gene=lipM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2284
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2556145 2557440 . + 0 ID=cds-NP_216800.1;Parent=gene-Rv2284;Dbxref=Genbank:NP_216800.1,GeneID:887794;Name=NP_216800.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lipM;locus_tag=Rv2284;product=esterase LipM;protein_id=NP_216800.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2557473 2558810 . + . ID=gene-Rv2285;Dbxref=GeneID:888632;Name=Rv2285;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2285
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2557473 2558810 . + 0 ID=cds-NP_216801.1;Parent=gene-Rv2285;Dbxref=Genbank:NP_216801.1,GeneID:888632;Name=NP_216801.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2285;product=diacylglycerol acyltransferase;protein_id=NP_216801.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2558877 2559569 . - . ID=gene-Rv2286c;Dbxref=GeneID:887395;Name=Rv2286c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2286c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2558877 2559569 . - 0 ID=cds-NP_216802.1;Parent=gene-Rv2286c;Dbxref=Genbank:NP_216802.1,GeneID:887395;Name=NP_216802.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2286c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216802.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2559703 2561331 . + . ID=gene-Rv2287;Dbxref=GeneID:887570;Name=yjcE;gbkey=Gene;gene=yjcE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2287
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2559703 2561331 . + 0 ID=cds-NP_216803.1;Parent=gene-Rv2287;Dbxref=Genbank:NP_216803.1,GeneID:887570;Name=NP_216803.1;Note=integral membrane transport protein;gbkey=CDS;gene=yjcE;locus_tag=Rv2287;product=Na(+)/H(+) transporter;protein_id=NP_216803.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2561328 2561705 . + . ID=gene-Rv2288;Dbxref=GeneID:887702;Name=Rv2288;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2288
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2561328 2561705 . + 0 ID=cds-NP_216804.1;Parent=gene-Rv2288;Dbxref=Genbank:NP_216804.1,GeneID:887702;Name=NP_216804.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2288;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216804.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2561675 2562457 . + . ID=gene-Rv2289;Dbxref=GeneID:887342;Name=cdh;gbkey=Gene;gene=cdh;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2289
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2561675 2562457 . + 0 ID=cds-NP_216805.1;Parent=gene-Rv2289;Dbxref=Genbank:NP_216805.1,GeneID:887342;Name=NP_216805.1;Note=Cdh (CDP-diacylglycerol diphosphatase) (CDP-diacylglycerol phosphatidylhydrolase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cdh;locus_tag=Rv2289;product=CDP-diacylglycerol pyrophosphatase;protein_id=NP_216805.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2562599 2563114 . + . ID=gene-Rv2290;Dbxref=GeneID:887203;Name=lppO;gbkey=Gene;gene=lppO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2290
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2562599 2563114 . + 0 ID=cds-NP_216806.1;Parent=gene-Rv2290;Dbxref=Genbank:NP_216806.1,GeneID:887203;Name=NP_216806.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lppO;locus_tag=Rv2290;product=lipoprotein LppO;protein_id=NP_216806.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2563174 2564028 . + 0 ID=cds-NP_216807.1;Parent=gene-Rv2291;Dbxref=Genbank:NP_216807.1,GeneID:887174;Name=NP_216807.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=sseB;locus_tag=Rv2291;product=thiosulfate sulfurtransferase SseB;protein_id=NP_216807.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 2564029 2564253 . - 0 ID=cds-NP_216808.1;Parent=gene-Rv2292c;Dbxref=Genbank:NP_216808.1,GeneID:888805;Name=NP_216808.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2292c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216808.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2564292 2565032 . - . ID=gene-Rv2293c;Dbxref=GeneID:887283;Name=Rv2293c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2293c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2564292 2565032 . - 0 ID=cds-NP_216809.1;Parent=gene-Rv2293c;Dbxref=Genbank:NP_216809.1,GeneID:887283;Name=NP_216809.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2293c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216809.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2565327 2566550 . + . ID=gene-Rv2294;Dbxref=GeneID:885868;Name=Rv2294;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2294
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2565327 2566550 . + 0 ID=cds-NP_216810.1;Parent=gene-Rv2294;Dbxref=Genbank:NP_216810.1,GeneID:885868;Name=NP_216810.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2294;product=cystathionine beta-lyase;protein_id=NP_216810.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2566772 2567410 . + . ID=gene-Rv2295;Dbxref=GeneID:888540;Name=Rv2295;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2295
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2566772 2567410 . + 0 ID=cds-NP_216811.1;Parent=gene-Rv2295;Dbxref=Genbank:NP_216811.1,GeneID:888540;Name=NP_216811.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2295;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216811.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2567504 2568406 . + . ID=gene-Rv2296;Dbxref=GeneID:887796;Name=Rv2296;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2296
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2567504 2568406 . + 0 ID=cds-NP_216812.1;Parent=gene-Rv2296;Dbxref=Genbank:NP_216812.1,GeneID:887796;Name=NP_216812.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2296;product=haloalkane dehalogenase;protein_id=NP_216812.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2568438 2568890 . + . ID=gene-Rv2297;Dbxref=GeneID:887789;Name=Rv2297;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2297
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2568438 2568890 . + 0 ID=cds-NP_216813.1;Parent=gene-Rv2297;Dbxref=Genbank:NP_216813.1,GeneID:887789;Name=NP_216813.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00343;locus_tag=Rv2297;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216813.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2569082 2570053 . + . ID=gene-Rv2298;Dbxref=GeneID:887344;Name=Rv2298;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2298
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2569082 2570053 . + 0 ID=cds-NP_216814.1;Parent=gene-Rv2298;Dbxref=Genbank:NP_216814.1,GeneID:887344;Name=NP_216814.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2298;product=oxidoreductase;protein_id=NP_216814.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2570059 2572002 . - . ID=gene-Rv2299c;Dbxref=GeneID:887501;Name=htpG;gbkey=Gene;gene=htpG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2299c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2570059 2572002 . - 0 ID=cds-NP_216815.1;Parent=gene-Rv2299c;Dbxref=Genbank:NP_216815.1,GeneID:887501;Name=NP_216815.1;Note=heat shock protein (HSP90 family protein) (high temperature protein G);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=htpG;locus_tag=Rv2299c;product=chaperone protein HtpG;protein_id=NP_216815.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2572076 2573008 . - . ID=gene-Rv2300c;Dbxref=GeneID:887880;Name=Rv2300c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2300c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2572076 2573008 . - 0 ID=cds-NP_216816.1;Parent=gene-Rv2300c;Dbxref=Genbank:NP_216816.1,GeneID:887880;Name=NP_216816.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2300c;product=metallo-hydrolase;protein_id=NP_216816.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2573015 2573707 . + . ID=gene-Rv2301;Dbxref=GeneID:885371;Name=cut2;gbkey=Gene;gene=cut2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cfp25,clp2,culp2;locus_tag=Rv2301
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2573015 2573707 . + 0 ID=cds-NP_216817.2;Parent=gene-Rv2301;Dbxref=Genbank:NP_216817.2,GeneID:885371;Name=NP_216817.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cut2;inference=protein motif:PROSITE:PS00095;locus_tag=Rv2301;product=cutinase;protein_id=NP_216817.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2573813 2574055 . + . ID=gene-Rv2302;Dbxref=GeneID:885154;Name=Rv2302;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2302
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2573813 2574055 . + 0 ID=cds-NP_216818.1;Parent=gene-Rv2302;Dbxref=Genbank:NP_216818.1,GeneID:885154;Name=NP_216818.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2302;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216818.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2574096 2575019 . - . ID=gene-Rv2303c;Dbxref=GeneID:885282;Name=Rv2303c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2303c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2574096 2575019 . - 0 ID=cds-NP_216819.1;Parent=gene-Rv2303c;Dbxref=Genbank:NP_216819.1,GeneID:885282;Name=NP_216819.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2303c;product=antibiotic-resistance protein;protein_id=NP_216819.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2575016 2575225 . - . ID=gene-Rv2304c;Dbxref=GeneID:885102;Name=Rv2304c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2304c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2575016 2575225 . - 0 ID=cds-NP_216820.1;Parent=gene-Rv2304c;Dbxref=Genbank:NP_216820.1,GeneID:885102;Name=NP_216820.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2304c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216820.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2575809 2577098 . + . ID=gene-Rv2305;Dbxref=GeneID:885752;Name=Rv2305;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2305
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2575809 2577098 . + 0 ID=cds-NP_216821.1;Parent=gene-Rv2305;Dbxref=Genbank:NP_216821.1,GeneID:885752;Name=NP_216821.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2305;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216821.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2577108 2577922 . + . ID=gene-Rv2306A;Dbxref=GeneID:3205062;Name=Rv2306A;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2306A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2577851 2578696 . - . ID=gene-Rv2307c;Dbxref=GeneID:885277;Name=Rv2307c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2307c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2577851 2578696 . - 0 ID=cds-NP_216823.1;Parent=gene-Rv2307c;Dbxref=Genbank:NP_216823.1,GeneID:885277;Name=NP_216823.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2307c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216823.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2579228 2579419 . - . ID=gene-Rv2307A;Dbxref=GeneID:3205073;Name=Rv2307A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2307A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2579228 2579419 . - 0 ID=cds-YP_177665.1;Parent=gene-Rv2307A;Dbxref=Genbank:YP_177665.1,GeneID:3205073;Name=YP_177665.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2307A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177665.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2579504 2579935 . - . ID=gene-Rv2307B;Dbxref=GeneID:3205074;Name=Rv2307B;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2307B
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2579504 2579935 . - 0 ID=cds-YP_177666.1;Parent=gene-Rv2307B;Dbxref=Genbank:YP_177666.1,GeneID:3205074;Name=YP_177666.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2307B;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177666.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2580028 2580210 . - . ID=gene-Rv2307D;Dbxref=GeneID:3205075;Name=Rv2307D;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2307D
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2580028 2580210 . - 0 ID=cds-YP_177667.1;Parent=gene-Rv2307D;Dbxref=Genbank:YP_177667.1,GeneID:3205075;Name=YP_177667.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2307D;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177667.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2580419 2581135 . + . ID=gene-Rv2308;Dbxref=GeneID:885290;Name=Rv2308;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2308
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2580419 2581135 . + 0 ID=cds-NP_216824.1;Parent=gene-Rv2308;Dbxref=Genbank:NP_216824.1,GeneID:885290;Name=NP_216824.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2308;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216824.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2581145 2581477 . + . ID=gene-Rv2308a;Dbxref=GeneID:19394679;Name=Rv2308a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2308a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2581145 2581477 . + 0 ID=cds-YP_009030038.1;Parent=gene-Rv2308a;Dbxref=Genbank:YP_009030038.1,GeneID:19394679;Name=YP_009030038.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2308a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030038.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2581764 2581837 . - . ID=gene-Rvnt24;Dbxref=GeneID:2700432;Name=metV;gbkey=Gene;gene=metV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt24
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2581764 2581837 . - . ID=rna-Rvnt24;Parent=gene-Rvnt24;Dbxref=GeneID:2700432;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;anticodon=(pos:complement(2581801..2581803));codons=35;gbkey=tRNA;gene=metV;locus_tag=Rvnt24;product=tRNA-Met
+NC_000962.3 RefSeq exon 2581764 2581837 . - . ID=exon-Rvnt24-1;Parent=rna-Rvnt24;Dbxref=GeneID:2700432;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;anticodon=(pos:complement(2581801..2581803));codons=35;gbkey=tRNA;gene=metV;locus_tag=Rvnt24;product=tRNA-Met
+NC_000962.3 RefSeq gene 2583045 2583332 . + . ID=gene-Rv2309A;Dbxref=GeneID:3205076;Name=Rv2309A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2309A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2583045 2583332 . + 0 ID=cds-YP_177668.1;Parent=gene-Rv2309A;Dbxref=Genbank:YP_177668.1,GeneID:3205076;Name=YP_177668.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2309A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177668.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2583435 2583779 . + . ID=gene-Rv2310;Dbxref=GeneID:885175;Name=Rv2310;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2310
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2583435 2583779 . + 0 ID=cds-NP_216826.1;Parent=gene-Rv2310;Dbxref=Genbank:NP_216826.1,GeneID:885175;Name=NP_216826.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2310;product=excisionase;protein_id=NP_216826.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2583884 2584408 . + . ID=gene-Rv2311;Dbxref=GeneID:885168;Name=Rv2311;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2311
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2583884 2584408 . + 0 ID=cds-NP_216827.1;Parent=gene-Rv2311;Dbxref=Genbank:NP_216827.1,GeneID:885168;Name=NP_216827.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2311;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216827.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2584486 2584755 . + . ID=gene-Rv2312;Dbxref=GeneID:885152;Name=Rv2312;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2312
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2584486 2584755 . + 0 ID=cds-NP_216828.1;Parent=gene-Rv2312;Dbxref=Genbank:NP_216828.1,GeneID:885152;Name=NP_216828.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2312;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216828.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2585052 2585906 . - . ID=gene-Rv2313c;Dbxref=GeneID:885268;Name=Rv2313c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2313c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2585052 2585906 . - 0 ID=cds-NP_216829.1;Parent=gene-Rv2313c;Dbxref=Genbank:NP_216829.1,GeneID:885268;Name=NP_216829.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2313c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216829.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2585917 2587290 . - . ID=gene-Rv2314c;Dbxref=GeneID:885130;Name=Rv2314c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2314c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2585917 2587290 . - 0 ID=cds-NP_216830.1;Parent=gene-Rv2314c;Dbxref=Genbank:NP_216830.1,GeneID:885130;Name=NP_216830.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2314c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216830.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2589697 2590521 . + . ID=gene-Rv2317;Dbxref=GeneID:885101;Name=uspB;gbkey=Gene;gene=uspB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2317
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2590518 2591840 . + . ID=gene-Rv2318;Dbxref=GeneID:885143;Name=uspC;gbkey=Gene;gene=uspC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2318
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2590518 2591840 . + 0 ID=cds-NP_216834.1;Parent=gene-Rv2318;Dbxref=Genbank:NP_216834.1,GeneID:885143;Name=NP_216834.1;gbkey=CDS;gene=uspC;locus_tag=Rv2318;product=sugar ABC transporter substrate-binding lipoprotein UspC;protein_id=NP_216834.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2591848 2592726 . - . ID=gene-Rv2319c;Dbxref=GeneID:885171;Name=Rv2319c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2319c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2592723 2594153 . - . ID=gene-Rv2320c;Dbxref=GeneID:885084;Name=rocE;gbkey=Gene;gene=rocE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2320c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2592723 2594153 . - 0 ID=cds-NP_216836.1;Parent=gene-Rv2320c;Dbxref=Genbank:NP_216836.1,GeneID:885084;Name=NP_216836.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rocE;locus_tag=Rv2320c;product=cationic amino acid transporter permease RocE;protein_id=NP_216836.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2595361 2596269 . - . ID=gene-Rv2323c;Dbxref=GeneID:885480;Name=Rv2323c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2323c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2595361 2596269 . - 0 ID=cds-NP_216839.1;Parent=gene-Rv2323c;Dbxref=Genbank:NP_216839.1,GeneID:885480;Name=NP_216839.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2323c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216839.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2596334 2596780 . + . ID=gene-Rv2324;Dbxref=GeneID:885060;Name=Rv2324;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2324
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2596334 2596780 . + 0 ID=cds-NP_216840.1;Parent=gene-Rv2324;Dbxref=Genbank:NP_216840.1,GeneID:885060;Name=NP_216840.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2324;product=AsnC family transcriptional regulator;protein_id=NP_216840.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2597009 2597857 . - . ID=gene-Rv2325c;Dbxref=GeneID:886271;Name=Rv2325c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2325c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2597009 2597857 . - 0 ID=cds-NP_216841.1;Parent=gene-Rv2325c;Dbxref=Genbank:NP_216841.1,GeneID:886271;Name=NP_216841.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2325c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216841.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2597854 2599947 . - . ID=gene-Rv2326c;Dbxref=GeneID:888184;Name=Rv2326c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2326c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2597854 2599947 . - 0 ID=cds-NP_216842.1;Parent=gene-Rv2326c;Dbxref=Genbank:NP_216842.1,GeneID:888184;Name=NP_216842.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv2326c;product=ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_216842.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2599988 2600479 . + . ID=gene-Rv2327;Dbxref=GeneID:888124;Name=Rv2327;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2327
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2599988 2600479 . + 0 ID=cds-NP_216843.1;Parent=gene-Rv2327;Dbxref=Genbank:NP_216843.1,GeneID:888124;Name=NP_216843.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2327;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216843.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2600731 2601879 . + . ID=gene-Rv2328;Dbxref=GeneID:888111;Name=PE23;gbkey=Gene;gene=PE23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2328
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2600731 2601879 . + 0 ID=cds-YP_177867.1;Parent=gene-Rv2328;Dbxref=Genbank:YP_177867.1,GeneID:888111;Name=YP_177867.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE23;locus_tag=Rv2328;product=PE family protein PE23;protein_id=YP_177867.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2601914 2603461 . - . ID=gene-Rv2329c;Dbxref=GeneID:888116;Name=narK1;gbkey=Gene;gene=narK1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2329c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2601914 2603461 . - 0 ID=cds-NP_216845.1;Parent=gene-Rv2329c;Dbxref=Genbank:NP_216845.1,GeneID:888116;Name=NP_216845.1;Note=nitrite facilitator 1;gbkey=CDS;gene=narK1;locus_tag=Rv2329c;product=nitrate/nitrite transporter;protein_id=NP_216845.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2603695 2604222 . - . ID=gene-Rv2330c;Dbxref=GeneID:888072;Name=lppP;gbkey=Gene;gene=lppP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2330c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2603695 2604222 . - 0 ID=cds-NP_216846.1;Parent=gene-Rv2330c;Dbxref=Genbank:NP_216846.1,GeneID:888072;Name=NP_216846.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppP;locus_tag=Rv2330c;product=lipoprotein LppP;protein_id=NP_216846.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2604297 2604683 . + . ID=gene-Rv2331;Dbxref=GeneID:888099;Name=Rv2331;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2331
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2604297 2604683 . + 0 ID=cds-NP_216847.1;Parent=gene-Rv2331;Dbxref=Genbank:NP_216847.1,GeneID:888099;Name=NP_216847.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2331;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216847.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2604740 2605078 . + . ID=gene-Rv2331A;Dbxref=GeneID:3205048;Name=Rv2331A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2331A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2604740 2605078 . + 0 ID=cds-YP_177669.1;Parent=gene-Rv2331A;Dbxref=Genbank:YP_177669.1,GeneID:3205048;Name=YP_177669.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2331A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177669.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2605108 2606754 . + . ID=gene-Rv2332;Dbxref=GeneID:887962;Name=mez;gbkey=Gene;gene=mez;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2332
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2605108 2606754 . + 0 ID=cds-NP_216848.2;Parent=gene-Rv2332;Dbxref=Genbank:NP_216848.2,GeneID:887962;Name=NP_216848.2;Note=[NAD] dependent%3B Mez (malic enzyme) (NAD-malic enzyme) (malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)) (pyruvic-malic carboxylase) (NAD-me);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mez;locus_tag=Rv2332;product=malate oxidoreductase;protein_id=NP_216848.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2606708 2608321 . - . ID=gene-Rv2333c;Dbxref=GeneID:887274;Name=stp;gbkey=Gene;gene=stp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2333c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2606708 2608321 . - 0 ID=cds-NP_216849.1;Parent=gene-Rv2333c;Dbxref=Genbank:NP_216849.1,GeneID:887274;Name=NP_216849.1;Note=Spectinomycin tetracycline efflux pump;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17242035];gbkey=CDS;gene=stp;locus_tag=Rv2333c;product=multidrug resistance protein;protein_id=NP_216849.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2608796 2609728 . + . ID=gene-Rv2334;Dbxref=GeneID:886016;Name=cysK1;gbkey=Gene;gene=cysK1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cysK;locus_tag=Rv2334
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2608796 2609728 . + 0 ID=cds-YP_177868.1;Parent=gene-Rv2334;Dbxref=Genbank:YP_177868.1,GeneID:886016;Name=YP_177868.1;Note=cysteine synthase CysK (O-acetylserine (thiol)-lyase A) (CSASE A);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cysK1;inference=protein motif:PROSITE:PS00901;locus_tag=Rv2334;product=O-acetylserine sulfhydrylase;protein_id=YP_177868.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2609732 2610421 . + . ID=gene-Rv2335;Dbxref=GeneID:886012;Name=cysE;gbkey=Gene;gene=cysE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2335
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2609732 2610421 . + 0 ID=cds-NP_216851.1;Parent=gene-Rv2335;Dbxref=Genbank:NP_216851.1,GeneID:886012;Name=NP_216851.1;gbkey=CDS;gene=cysE;inference=protein motif:PROSITE:PS00101;locus_tag=Rv2335;product=serine acetyltransferase;protein_id=NP_216851.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2610837 2611805 . + . ID=gene-Rv2336;Dbxref=GeneID:888958;Name=Rv2336;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2336
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2610837 2611805 . + 0 ID=cds-NP_216852.1;Parent=gene-Rv2336;Dbxref=Genbank:NP_216852.1,GeneID:888958;Name=NP_216852.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2336;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216852.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2611869 2612987 . - . ID=gene-Rv2337c;Dbxref=GeneID:885123;Name=Rv2337c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2337c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2611869 2612987 . - 0 ID=cds-NP_216853.1;Parent=gene-Rv2337c;Dbxref=Genbank:NP_216853.1,GeneID:885123;Name=NP_216853.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2337c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216853.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2613107 2614063 . - . ID=gene-Rv2338c;Dbxref=GeneID:886018;Name=moeW;gbkey=Gene;gene=moeW;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2338c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2613107 2614063 . - 0 ID=cds-NP_216854.1;Parent=gene-Rv2338c;Dbxref=Genbank:NP_216854.1,GeneID:886018;Name=NP_216854.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=moeW;locus_tag=Rv2338c;product=molybdopterin biosynthesis protein MoeW;protein_id=NP_216854.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2614693 2617581 . + . ID=gene-Rv2339;Dbxref=GeneID:888966;Name=mmpL9;gbkey=Gene;gene=mmpL9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2339
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2614693 2617581 . + 0 ID=cds-NP_216855.1;Parent=gene-Rv2339;Dbxref=Genbank:NP_216855.1,GeneID:888966;Name=NP_216855.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mmpL9;locus_tag=Rv2339;product=transmembrane transport protein MmpL9;protein_id=NP_216855.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2617667 2618908 . - . ID=gene-Rv2340c;Dbxref=GeneID:888961;Name=PE_PGRS39;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS39;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2340c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2617667 2618908 . - 0 ID=cds-YP_177869.1;Parent=gene-Rv2340c;Dbxref=Genbank:YP_177869.1,GeneID:888961;Name=YP_177869.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS39;locus_tag=Rv2340c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS39;protein_id=YP_177869.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2619407 2619479 . - . ID=gene-Rvnt25;Dbxref=GeneID:2700449;Name=asnT;gbkey=Gene;gene=asnT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt25
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2619407 2619479 . - . ID=rna-Rvnt25;Parent=gene-Rvnt25;Dbxref=GeneID:2700449;Note=asnT%2C tRNA-Asn%2C anticodon gtt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(2619444..2619446));codons=41;gbkey=tRNA;gene=asnT;locus_tag=Rvnt25;product=tRNA-Asn
+NC_000962.3 RefSeq exon 2619407 2619479 . - . ID=exon-Rvnt25-1;Parent=rna-Rvnt25;Dbxref=GeneID:2700449;Note=asnT%2C tRNA-Asn%2C anticodon gtt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(2619444..2619446));codons=41;gbkey=tRNA;gene=asnT;locus_tag=Rvnt25;product=tRNA-Asn
+NC_000962.3 RefSeq gene 2619597 2620016 . + . ID=gene-Rv2341;Dbxref=GeneID:886275;Name=lppQ;gbkey=Gene;gene=lppQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2341
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2619597 2620016 . + 0 ID=cds-NP_216857.1;Parent=gene-Rv2341;Dbxref=Genbank:NP_216857.1,GeneID:886275;Name=NP_216857.1;gbkey=CDS;gene=lppQ;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2341;product=lipoprotein LppQ;protein_id=NP_216857.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2620272 2620529 . + . ID=gene-Rv2342;Dbxref=GeneID:888951;Name=Rv2342;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2342
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2620272 2620529 . + 0 ID=cds-NP_216858.1;Parent=gene-Rv2342;Dbxref=Genbank:NP_216858.1,GeneID:888951;Name=NP_216858.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2342;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216858.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2620533 2622452 . - . ID=gene-Rv2343c;Dbxref=GeneID:885996;Name=dnaG;gbkey=Gene;gene=dnaG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2343c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2620533 2622452 . - 0 ID=cds-NP_216859.1;Parent=gene-Rv2343c;Dbxref=Genbank:NP_216859.1,GeneID:885996;Name=NP_216859.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=dnaG;locus_tag=Rv2343c;product=DNA primase;protein_id=NP_216859.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2622457 2623752 . - . ID=gene-Rv2344c;Dbxref=GeneID:885421;Name=dgt;gbkey=Gene;gene=dgt;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2344c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2622457 2623752 . - 0 ID=cds-NP_216860.1;Parent=gene-Rv2344c;Dbxref=Genbank:NP_216860.1,GeneID:885421;Name=NP_216860.1;Note=Dgt (dGTPase) (dGTP triphosphohydrolase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=dgt;locus_tag=Rv2344c;product=deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase;protein_id=NP_216860.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2623821 2625803 . + . ID=gene-Rv2345;Dbxref=GeneID:888960;Name=Rv2345;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2345
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2623821 2625803 . + 0 ID=cds-NP_216861.1;Parent=gene-Rv2345;Dbxref=Genbank:NP_216861.1,GeneID:888960;Name=NP_216861.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2345;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216861.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2625888 2626172 . - . ID=gene-Rv2346c;Dbxref=GeneID:888956;Name=esxO;gbkey=Gene;gene=esxO;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_6,Mtb9.9E;locus_tag=Rv2346c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2625888 2626172 . - 0 ID=cds-NP_216862.1;Parent=gene-Rv2346c;Dbxref=Genbank:NP_216862.1,GeneID:888956;Name=NP_216862.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=esxO;locus_tag=Rv2346c;product=ESAT-6 like protein EsxO;protein_id=NP_216862.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2626223 2626519 . - . ID=gene-Rv2347c;Dbxref=GeneID:886002;Name=esxP;gbkey=Gene;gene=esxP;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_7,QILSS;locus_tag=Rv2347c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2626223 2626519 . - 0 ID=cds-NP_216863.1;Parent=gene-Rv2347c;Dbxref=Genbank:NP_216863.1,GeneID:886002;Name=NP_216863.1;Note=ESAT-6 like protein 7;gbkey=CDS;gene=esxP;locus_tag=Rv2347c;product=ESAT-6 like protein EsxP;protein_id=NP_216863.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2626654 2626980 . - . ID=gene-Rv2348c;Dbxref=GeneID:886006;Name=Rv2348c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2348c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2626654 2626980 . - 0 ID=cds-NP_216864.1;Parent=gene-Rv2348c;Dbxref=Genbank:NP_216864.1,GeneID:886006;Name=NP_216864.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2348c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216864.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2627172 2628698 . - . ID=gene-Rv2349c;Dbxref=GeneID:886000;Name=plcC;gbkey=Gene;gene=plcC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2349c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2627172 2628698 . - 0 ID=cds-NP_216865.1;Parent=gene-Rv2349c;Dbxref=Genbank:NP_216865.1,GeneID:886000;Name=NP_216865.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=plcC;locus_tag=Rv2349c;product=phospholipase C;protein_id=NP_216865.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2628781 2630319 . - . ID=gene-Rv2350c;Dbxref=GeneID:885999;Name=plcB;gbkey=Gene;gene=plcB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mpcB;locus_tag=Rv2350c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2628781 2630319 . - 0 ID=cds-NP_216866.1;Parent=gene-Rv2350c;Dbxref=Genbank:NP_216866.1,GeneID:885999;Name=NP_216866.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:8757862];gbkey=CDS;gene=plcB;locus_tag=Rv2350c;product=membrane-associated phospholipase B;protein_id=NP_216866.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2630537 2632075 . - . ID=gene-Rv2351c;Dbxref=GeneID:885995;Name=plcA;gbkey=Gene;gene=plcA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mpcA;locus_tag=Rv2351c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2630537 2632075 . - 0 ID=cds-NP_216867.1;Parent=gene-Rv2351c;Dbxref=Genbank:NP_216867.1,GeneID:885995;Name=NP_216867.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:8757862];gbkey=CDS;gene=plcA;locus_tag=Rv2351c;product=membrane-associated phospholipase A;protein_id=NP_216867.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2632923 2634098 . - . ID=gene-Rv2352c;Dbxref=GeneID:888959;Name=PPE38;gbkey=Gene;gene=PPE38;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2352c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2632923 2634098 . - 0 ID=cds-YP_177870.1;Parent=gene-Rv2352c;Dbxref=Genbank:YP_177870.1,GeneID:888959;Name=YP_177870.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=PPE38;locus_tag=Rv2352c;product=PPE family protein PPE38;protein_id=YP_177870.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2634528 2635592 . - . ID=gene-Rv2353c;Dbxref=GeneID:886003;Name=PPE39;gbkey=Gene;gene=PPE39;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2353c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2634528 2635592 . - 0 ID=cds-YP_177871.1;Parent=gene-Rv2353c;Dbxref=Genbank:YP_177871.1,GeneID:886003;Name=YP_177871.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE39;locus_tag=Rv2353c;product=PPE family protein PPE39;protein_id=YP_177871.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2635577 2636931 . + . ID=id-NC_000962.3:2635577..2636931;Note=IS6110-8%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110 element that appears to have inserted in 5'-end of MTCY98.031c but is not flanked by expected 3 bp direct repeats of target sequence.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-8
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2635577 2635604 . + . ID=id-NC_000962.3:2635577..2635604;Note=28 bp Inverted repeat%2C TGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC%2Cat the left end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2635628 2636889 . + . ID=id-NC_000962.3:2635628..2636889;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable IS6110 transposase. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2636904 2636931 . - . ID=id-NC_000962.3:2636904..2636931;Note=28 bp Inverted repeat%2C TGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC%2Cat the right end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2639673 2641064 . - . ID=gene-Rv2357c;Dbxref=GeneID:888962;Name=glyS;gbkey=Gene;gene=glyS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2357c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2639673 2641064 . - 0 ID=cds-NP_216873.1;Parent=gene-Rv2357c;Dbxref=Genbank:NP_216873.1,GeneID:888962;Name=NP_216873.1;Note=glycyl-tRNA synthetase. Belongs to class-II aminoacyl-tRNA synthetase family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glyS;inference=protein motif:PROSITE:PS00179;locus_tag=Rv2357c;product=glycine--tRNA ligase;protein_id=NP_216873.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2641246 2641653 . + . ID=gene-Rv2358;Dbxref=GeneID:888965;Name=smtB;gbkey=Gene;gene=smtB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2358
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2641246 2641653 . + 0 ID=cds-NP_216874.1;Parent=gene-Rv2358;Dbxref=Genbank:NP_216874.1,GeneID:888965;Name=NP_216874.1;Note=ArsR family;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=smtB;locus_tag=Rv2358;product=HTH-type transcriptional regulator SmtB;protein_id=NP_216874.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2641650 2642042 . + . ID=gene-Rv2359;Dbxref=GeneID:886009;Name=zur;gbkey=Gene;gene=zur;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=furB;locus_tag=Rv2359
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2641650 2642042 . + 0 ID=cds-NP_216875.1;Parent=gene-Rv2359;Dbxref=Genbank:NP_216875.1,GeneID:886009;Name=NP_216875.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17098899];gbkey=CDS;gene=zur;locus_tag=Rv2359;product=zinc uptake regulation protein;protein_id=NP_216875.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2642150 2642578 . - . ID=gene-Rv2360c;Dbxref=GeneID:888952;Name=Rv2360c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2360c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2642150 2642578 . - 0 ID=cds-NP_216876.1;Parent=gene-Rv2360c;Dbxref=Genbank:NP_216876.1,GeneID:888952;Name=NP_216876.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2360c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216876.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2642578 2643468 . - . ID=gene-Rv2361c;Dbxref=GeneID:888964;Name=Rv2361c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=uppS;locus_tag=Rv2361c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2642578 2643468 . - 0 ID=cds-NP_216877.1;Parent=gene-Rv2361c;Dbxref=Genbank:NP_216877.1,GeneID:888964;Name=NP_216877.1;Note=Long (C50) chain (Z-decaprenyl diphosphate synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:10816587];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01066;locus_tag=Rv2361c;product=decaprenyl diphosphate synthase;protein_id=NP_216877.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2643461 2644258 . - . ID=gene-Rv2362c;Dbxref=GeneID:888954;Name=recO;gbkey=Gene;gene=recO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2362c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2643461 2644258 . - 0 ID=cds-NP_216878.1;Parent=gene-Rv2362c;Dbxref=Genbank:NP_216878.1,GeneID:888954;Name=NP_216878.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=recO;locus_tag=Rv2362c;product=DNA repair protein RecO;protein_id=NP_216878.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2644320 2645774 . + . ID=gene-Rv2363;Dbxref=GeneID:888955;Name=amiA2;gbkey=Gene;gene=amiA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2363
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2644320 2645774 . + 0 ID=cds-NP_216879.1;Parent=gene-Rv2363;Dbxref=Genbank:NP_216879.1,GeneID:888955;Name=NP_216879.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=amiA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00571;locus_tag=Rv2363;product=amidase;protein_id=NP_216879.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2645771 2646673 . - . ID=gene-Rv2364c;Dbxref=GeneID:886027;Name=era;gbkey=Gene;gene=era;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=bex;locus_tag=Rv2364c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2645771 2646673 . - 0 ID=cds-YP_177873.1;Parent=gene-Rv2364c;Dbxref=Genbank:YP_177873.1,GeneID:886027;Name=YP_177873.1;Note=GTP-binding protein Era;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=era;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2364c;product=GTPase Era;protein_id=YP_177873.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2646747 2647088 . - . ID=gene-Rv2365c;Dbxref=GeneID:885259;Name=Rv2365c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2365c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2646747 2647088 . - 0 ID=cds-NP_216881.1;Parent=gene-Rv2365c;Dbxref=Genbank:NP_216881.1,GeneID:885259;Name=NP_216881.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2365c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216881.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2647060 2648367 . - . ID=gene-Rv2366c;Dbxref=GeneID:885987;Name=Rv2366c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2366c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2647060 2648367 . - 0 ID=cds-NP_216882.1;Parent=gene-Rv2366c;Dbxref=Genbank:NP_216882.1,GeneID:885987;Name=NP_216882.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2366c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216882.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2648364 2648912 . - . ID=gene-Rv2367c;Dbxref=GeneID:885989;Name=Rv2367c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2367c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2648364 2648912 . - 0 ID=cds-NP_216883.1;Parent=gene-Rv2367c;Dbxref=Genbank:NP_216883.1,GeneID:885989;Name=NP_216883.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2367c;product=endoribonuclease;protein_id=NP_216883.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2648916 2649974 . - . ID=gene-Rv2368c;Dbxref=GeneID:885998;Name=phoH1;gbkey=Gene;gene=phoH1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=phoH;locus_tag=Rv2368c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2648916 2649974 . - 0 ID=cds-YP_177874.1;Parent=gene-Rv2368c;Dbxref=Genbank:YP_177874.1,GeneID:885998;Name=YP_177874.1;Note=phosphate starvation-induced protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=phoH1;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2368c;product=phosphate starvation-inducible protein PhoH;protein_id=YP_177874.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2649946 2650248 . - . ID=gene-Rv2369c;Dbxref=GeneID:885811;Name=Rv2369c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2369c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2649946 2650248 . - 0 ID=cds-NP_216885.1;Parent=gene-Rv2369c;Dbxref=Genbank:NP_216885.1,GeneID:885811;Name=NP_216885.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2369c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216885.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2650245 2651558 . - . ID=gene-Rv2370c;Dbxref=GeneID:886017;Name=Rv2370c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2370c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2650245 2651558 . - 0 ID=cds-NP_216886.1;Parent=gene-Rv2370c;Dbxref=Genbank:NP_216886.1,GeneID:886017;Name=NP_216886.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2370c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216886.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2651753 2651938 . + . ID=gene-Rv2371;Dbxref=GeneID:885141;Name=PE_PGRS40;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS40;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2371
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2651753 2651938 . + 0 ID=cds-YP_177875.1;Parent=gene-Rv2371;Dbxref=Genbank:YP_177875.1,GeneID:885141;Name=YP_177875.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS40;locus_tag=Rv2371;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS40;protein_id=YP_177875.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2652037 2652825 . - . ID=gene-Rv2372c;Dbxref=GeneID:885926;Name=Rv2372c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2372c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2652037 2652825 . - 0 ID=cds-NP_216888.1;Parent=gene-Rv2372c;Dbxref=Genbank:NP_216888.1,GeneID:885926;Name=NP_216888.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2372c;product=rRNA small subunit methyltransferase E;protein_id=NP_216888.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2657700 2662085 . - . ID=gene-Rv2379c;Dbxref=GeneID:885874;Name=mbtF;gbkey=Gene;gene=mbtF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2379c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2662067 2667115 . - . ID=gene-Rv2380c;Dbxref=GeneID:885822;Name=mbtE;gbkey=Gene;gene=mbtE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2380c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2662067 2667115 . - 0 ID=cds-NP_216896.3;Parent=gene-Rv2380c;Dbxref=Genbank:NP_216896.3,GeneID:885822;Name=NP_216896.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=mbtE;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv2380c;product=peptide synthetase;protein_id=NP_216896.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2667255 2670269 . - . ID=gene-Rv2381c;Dbxref=GeneID:885850;Name=mbtD;gbkey=Gene;gene=mbtD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2381c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2667255 2670269 . - 0 ID=cds-NP_216897.1;Parent=gene-Rv2381c;Dbxref=Genbank:NP_216897.1,GeneID:885850;Name=NP_216897.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mbtD;inference=protein motif:PROSITE:PS00012;locus_tag=Rv2381c;product=polyketide synthetase;protein_id=NP_216897.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2670269 2671603 . - . ID=gene-Rv2382c;Dbxref=GeneID:885908;Name=mbtC;gbkey=Gene;gene=mbtC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2382c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2670269 2671603 . - 0 ID=cds-NP_216898.1;Parent=gene-Rv2382c;Dbxref=Genbank:NP_216898.1,GeneID:885908;Name=NP_216898.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mbtC;locus_tag=Rv2382c;product=polyketide synthetase;protein_id=NP_216898.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2671593 2675837 . - . ID=gene-Rv2383c;Dbxref=GeneID:885838;Name=mbtB;gbkey=Gene;gene=mbtB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2383c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2671593 2675837 . - 0 ID=cds-NP_216899.1;Parent=gene-Rv2383c;Dbxref=Genbank:NP_216899.1,GeneID:885838;Name=NP_216899.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mbtB;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv2383c;product=phenyloxazoline synthase;protein_id=NP_216899.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2675936 2677633 . + . ID=gene-Rv2384;Dbxref=GeneID:885833;Name=mbtA;gbkey=Gene;gene=mbtA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2384
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2675936 2677633 . + 0 ID=cds-NP_216900.1;Parent=gene-Rv2384;Dbxref=Genbank:NP_216900.1,GeneID:885833;Name=NP_216900.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mbtA;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv2384;product=2%2C3-dihydroxybenzoate-AMP ligase;protein_id=NP_216900.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2677729 2678649 . + . ID=gene-Rv2385;Dbxref=GeneID:885927;Name=mbtJ;gbkey=Gene;gene=mbtJ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=lipK;locus_tag=Rv2385
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2677729 2678649 . + 0 ID=cds-YP_177876.1;Parent=gene-Rv2385;Dbxref=Genbank:YP_177876.1,GeneID:885927;Name=YP_177876.1;gbkey=CDS;gene=mbtJ;locus_tag=Rv2385;product=acetyl hydrolase;protein_id=YP_177876.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2678653 2680005 . - . ID=gene-Rv2386c;Dbxref=GeneID:885823;Name=mbtI;gbkey=Gene;gene=mbtI;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=trpE2;locus_tag=Rv2386c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2678653 2680005 . - 0 ID=cds-YP_177877.1;Parent=gene-Rv2386c;Dbxref=Genbank:YP_177877.1,GeneID:885823;Name=YP_177877.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16923875];gbkey=CDS;gene=mbtI;locus_tag=Rv2386c;product=salicylate synthase;protein_id=YP_177877.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2680458 2680667 . + . ID=gene-Rv2386a;Dbxref=GeneID:19394680;Name=Rv2386a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2386a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2680458 2680667 . + 0 ID=cds-YP_009030039.1;Parent=gene-Rv2386a;Dbxref=Genbank:YP_009030039.1,GeneID:19394680;Name=YP_009030039.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2386a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030039.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2680765 2682018 . + . ID=gene-Rv2387;Dbxref=GeneID:885302;Name=Rv2387;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2387
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2680765 2682018 . + 0 ID=cds-NP_216903.1;Parent=gene-Rv2387;Dbxref=Genbank:NP_216903.1,GeneID:885302;Name=NP_216903.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00213;locus_tag=Rv2387;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216903.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2682015 2683142 . - . ID=gene-Rv2388c;Dbxref=GeneID:885300;Name=hemN;gbkey=Gene;gene=hemN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2388c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2682015 2683142 . - 0 ID=cds-NP_216904.1;Parent=gene-Rv2388c;Dbxref=Genbank:NP_216904.1,GeneID:885300;Name=NP_216904.1;Note=coproporphyrinogenase (coprogen oxidase);gbkey=CDS;gene=hemN;locus_tag=Rv2388c;product=oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase;protein_id=NP_216904.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2683248 2683712 . - . ID=gene-Rv2389c;Dbxref=GeneID:885246;Name=rpfD;gbkey=Gene;gene=rpfD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2389c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2683248 2683712 . - 0 ID=cds-NP_216905.1;Parent=gene-Rv2389c;Dbxref=Genbank:NP_216905.1,GeneID:885246;Name=NP_216905.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15207486];gbkey=CDS;gene=rpfD;locus_tag=Rv2389c;product=resuscitation-promoting factor RpfD;protein_id=NP_216905.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2683709 2684266 . - . ID=gene-Rv2390c;Dbxref=GeneID:885866;Name=Rv2390c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2390c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2683709 2684266 . - 0 ID=cds-NP_216906.1;Parent=gene-Rv2390c;Dbxref=Genbank:NP_216906.1,GeneID:885866;Name=NP_216906.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2390c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216906.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2684679 2686370 . + . ID=gene-Rv2391;Dbxref=GeneID:885472;Name=sirA;gbkey=Gene;gene=sirA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2391
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2684679 2686370 . + 0 ID=cds-NP_216907.1;Parent=gene-Rv2391;Dbxref=Genbank:NP_216907.1,GeneID:885472;Name=NP_216907.1;Note=ferredoxin-dependent;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15917234];gbkey=CDS;gene=sirA;locus_tag=Rv2391;product=sulfite reductase;protein_id=NP_216907.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2686367 2687131 . + . ID=gene-Rv2392;Dbxref=GeneID:885250;Name=cysH;gbkey=Gene;gene=cysH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2392
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2686367 2687131 . + 0 ID=cds-NP_216908.1;Parent=gene-Rv2392;Dbxref=Genbank:NP_216908.1,GeneID:885250;Name=NP_216908.1;Note=PAPS reductase%2C thioredoxin DEP%2C (padops reductase) (3'-phosphoadenylylsulfate reductase) (PAPS sulfotransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cysH;locus_tag=Rv2392;product=phosphoadenosine phosphosulfate reductase;protein_id=NP_216908.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2687128 2687973 . + . ID=gene-Rv2393;Dbxref=GeneID:885508;Name=che1;gbkey=Gene;gene=che1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2393
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2687128 2687973 . + 0 ID=cds-NP_216909.1;Parent=gene-Rv2393;Dbxref=Genbank:NP_216909.1,GeneID:885508;Name=NP_216909.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=che1;locus_tag=Rv2393;product=ferrochelatase;protein_id=NP_216909.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2687128 2687179 . + . ID=id-Rv2393;Dbxref=GeneID:885508;Note=52 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region;gene=che1;locus_tag=Rv2393
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2687180 2687257 . + . ID=id-Rv2393-2;Dbxref=GeneID:885508;Note=78 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I;gbkey=repeat_region;gene=che1;locus_tag=Rv2393
+NC_000962.3 RefSeq gene 2688010 2689941 . + . ID=gene-Rv2394;Dbxref=GeneID:885867;Name=ggtB;gbkey=Gene;gene=ggtB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2394
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2688010 2689941 . + 0 ID=cds-NP_216910.1;Parent=gene-Rv2394;Dbxref=Genbank:NP_216910.1,GeneID:885867;Name=NP_216910.1;Note=gamma-glutamyltransferase (glutamyl transpeptidase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ggtB;locus_tag=Rv2394;product=gamma-glutamyltranspeptidase precursor GgtB;protein_id=NP_216910.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2690072 2692075 . + . ID=gene-Rv2395;Dbxref=GeneID:885303;Name=Rv2395;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2395
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2690072 2692075 . + 0 ID=cds-NP_216911.1;Parent=gene-Rv2395;Dbxref=Genbank:NP_216911.1,GeneID:885303;Name=NP_216911.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2395;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216911.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2692172 2692521 . + . ID=gene-RVnc0024;Dbxref=GeneID:14515865;Name=mcr7;gbkey=Gene;gene=mcr7;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0024
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 2692172 2692521 . + . ID=rna-RVnc0024;Parent=gene-RVnc0024;Dbxref=GeneID:14515865;Note=mcr7%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped.;gbkey=ncRNA;gene=mcr7;locus_tag=RVnc0024;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 2692172 2692521 . + . ID=exon-RVnc0024-1;Parent=rna-RVnc0024;Dbxref=GeneID:14515865;Note=mcr7%2C putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010). 5'-end mapped by 5'RLM-RACE in M. bovis BGC Pasteur%2C 3'-end not mapped.;gbkey=ncRNA;gene=mcr7;locus_tag=RVnc0024;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 2692224 2692439 . + . ID=gene-Rv2395A;Dbxref=GeneID:14515893;Name=aprA;gbkey=Gene;gene=aprA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2395A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2692224 2692439 . + 0 ID=cds-YP_007411091.1;Parent=gene-Rv2395A;Dbxref=Genbank:YP_007411091.1,GeneID:14515893;Name=YP_007411091.1;Note=restricted to M. tuberculosis complex. Note completely overlapped by sRNA mcr7.;gbkey=CDS;gene=aprA;inference=DESCRIPTION: similar to sequence:INSD:AAK46761.1;locus_tag=Rv2395A;product=acid and phagosome regulated protein AprA;protein_id=YP_007411091.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2692551 2692715 . + . ID=gene-Rv2395B;Dbxref=GeneID:14515879;Name=aprB;gbkey=Gene;gene=aprB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2395B
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2692551 2692715 . + 0 ID=cds-YP_007411092.1;Parent=gene-Rv2395B;Dbxref=Genbank:YP_007411092.1,GeneID:14515879;Name=YP_007411092.1;Note=restricted to M. tuberculosis complex.;gbkey=CDS;gene=aprB;inference=DESCRIPTION: similar to AA sequence:INSD:AAK46762.1;locus_tag=Rv2395B;product=acid and phagosome regulated protein AprB;protein_id=YP_007411092.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2692799 2693884 . + . ID=gene-Rv2396;Dbxref=GeneID:885517;Name=PE_PGRS41;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS41;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=aprC;locus_tag=Rv2396
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2696644 2697714 . - . ID=gene-Rv2400c;Dbxref=GeneID:885299;Name=subI;gbkey=Gene;gene=subI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2400c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2697728 2698057 . + . ID=gene-Rv2401;Dbxref=GeneID:885664;Name=Rv2401;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2401
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2697728 2698057 . + 0 ID=cds-NP_216917.2;Parent=gene-Rv2401;Dbxref=Genbank:NP_216917.2,GeneID:885664;Name=NP_216917.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2401;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216917.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2698042 2698245 . - . ID=gene-Rv2401A;Dbxref=GeneID:3205070;Name=Rv2401A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2401A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2698042 2698245 . - 0 ID=cds-YP_177670.1;Parent=gene-Rv2401A;Dbxref=Genbank:YP_177670.1,GeneID:3205070;Name=YP_177670.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2401A;product=membrane protein;protein_id=YP_177670.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2698529 2700457 . + . ID=gene-Rv2402;Dbxref=GeneID:885661;Name=Rv2402;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2402
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2698529 2700457 . + 0 ID=cds-NP_216918.3;Parent=gene-Rv2402;Dbxref=Genbank:NP_216918.3,GeneID:885661;Name=NP_216918.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2402;product=trehalase;protein_id=NP_216918.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2700535 2701290 . - . ID=gene-Rv2403c;Dbxref=GeneID:885513;Name=lppR;gbkey=Gene;gene=lppR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2403c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2700535 2701290 . - 0 ID=cds-NP_216919.1;Parent=gene-Rv2403c;Dbxref=Genbank:NP_216919.1,GeneID:885513;Name=NP_216919.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lppR;locus_tag=Rv2403c;product=lipoprotein LppR;protein_id=NP_216919.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2701287 2703248 . - . ID=gene-Rv2404c;Dbxref=GeneID:885475;Name=lepA;gbkey=Gene;gene=lepA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2404c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2701287 2703248 . - 0 ID=cds-NP_216920.1;Parent=gene-Rv2404c;Dbxref=Genbank:NP_216920.1,GeneID:885475;Name=NP_216920.1;Note=GTP-binding elongation factor;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lepA;inference=protein motif:PROSITE:PS00301;locus_tag=Rv2404c;product=GTP-binding protein LepA;protein_id=NP_216920.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2703269 2703838 . + . ID=gene-Rv2405;Dbxref=GeneID:885507;Name=Rv2405;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2405
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2703269 2703838 . + 0 ID=cds-NP_216921.1;Parent=gene-Rv2405;Dbxref=Genbank:NP_216921.1,GeneID:885507;Name=NP_216921.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2405;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216921.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2704009 2704437 . - . ID=gene-Rv2406c;Dbxref=GeneID:885156;Name=Rv2406c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2406c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2704009 2704437 . - 0 ID=cds-NP_216922.1;Parent=gene-Rv2406c;Dbxref=Genbank:NP_216922.1,GeneID:885156;Name=NP_216922.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2406c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216922.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2704697 2705518 . + . ID=gene-Rv2407;Dbxref=GeneID:885684;Name=Rv2407;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2407
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2704697 2705518 . + 0 ID=cds-NP_216923.1;Parent=gene-Rv2407;Dbxref=Genbank:NP_216923.1,GeneID:885684;Name=NP_216923.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2407;product=ribonuclease Z;protein_id=NP_216923.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2705762 2706736 . + . ID=gene-Rv2408;Dbxref=GeneID:885511;Name=PE24;gbkey=Gene;gene=PE24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2408
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2705762 2706736 . + 0 ID=cds-YP_177880.2;Parent=gene-Rv2408;Dbxref=Genbank:YP_177880.2,GeneID:885511;Name=YP_177880.2;Note=a member of PE family;gbkey=CDS;gene=PE24;locus_tag=Rv2408;product=PE family protein PE24;protein_id=YP_177880.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2706494 2707333 . - . ID=gene-Rv2409c;Dbxref=GeneID:885674;Name=Rv2409c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2409c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2706494 2707333 . - 0 ID=cds-NP_216925.1;Parent=gene-Rv2409c;Dbxref=Genbank:NP_216925.1,GeneID:885674;Name=NP_216925.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2409c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216925.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2707333 2708310 . - . ID=gene-Rv2410c;Dbxref=GeneID:885257;Name=Rv2410c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2410c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2707333 2708310 . - 0 ID=cds-NP_216926.1;Parent=gene-Rv2410c;Dbxref=Genbank:NP_216926.1,GeneID:885257;Name=NP_216926.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2410c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216926.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2708310 2709965 . - . ID=gene-Rv2411c;Dbxref=GeneID:885681;Name=Rv2411c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2411c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2708310 2709965 . - 0 ID=cds-NP_216927.1;Parent=gene-Rv2411c;Dbxref=Genbank:NP_216927.1,GeneID:885681;Name=NP_216927.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2411c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216927.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2710075 2710335 . + . ID=gene-Rv2412;Dbxref=GeneID:885676;Name=rpsT;gbkey=Gene;gene=rpsT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2412
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2710075 2710335 . + 0 ID=cds-NP_216928.1;Parent=gene-Rv2412;Dbxref=Genbank:NP_216928.1,GeneID:885676;Name=NP_216928.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsT;locus_tag=Rv2412;product=30S ribosomal protein S20;protein_id=NP_216928.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2710351 2711301 . - . ID=gene-Rv2413c;Dbxref=GeneID:885666;Name=Rv2413c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2413c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2710351 2711301 . - 0 ID=cds-NP_216929.3;Parent=gene-Rv2413c;Dbxref=Genbank:NP_216929.3,GeneID:885666;Name=NP_216929.3;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2413c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216929.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2711332 2712876 . - . ID=gene-Rv2414c;Dbxref=GeneID:885667;Name=Rv2414c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2414c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2711332 2712876 . - 0 ID=cds-NP_216930.1;Parent=gene-Rv2414c;Dbxref=Genbank:NP_216930.1,GeneID:885667;Name=NP_216930.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2414c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216930.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2712891 2713784 . - . ID=gene-Rv2415c;Dbxref=GeneID:885697;Name=Rv2415c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2415c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2712891 2713784 . - 0 ID=cds-NP_216931.1;Parent=gene-Rv2415c;Dbxref=Genbank:NP_216931.1,GeneID:885697;Name=NP_216931.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2415c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216931.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2714124 2715332 . - . ID=gene-Rv2416c;Dbxref=GeneID:885903;Name=eis;gbkey=Gene;gene=eis;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2416c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2714124 2715332 . - 0 ID=cds-NP_216932.2;Parent=gene-Rv2416c;Dbxref=Genbank:NP_216932.2,GeneID:885903;Name=NP_216932.2;Note=Eis%2CGCN5-like N-acetyltransferase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17259625];gbkey=CDS;gene=eis;locus_tag=Rv2416c;product=enhanced intracellular survival protein;protein_id=NP_216932.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2715472 2716314 . - . ID=gene-Rv2417c;Dbxref=GeneID:885692;Name=Rv2417c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2417c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2715472 2716314 . - 0 ID=cds-NP_216933.1;Parent=gene-Rv2417c;Dbxref=Genbank:NP_216933.1,GeneID:885692;Name=NP_216933.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2417c;product=DegV domain-containing protein;protein_id=NP_216933.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2716315 2716391 . - . ID=id-NC_000962.3:2716315..2716391;Note=77 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2716395 2717138 . - . ID=gene-Rv2418c;Dbxref=GeneID:885304;Name=Rv2418c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2418c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2716395 2717138 . - 0 ID=cds-NP_216934.1;Parent=gene-Rv2418c;Dbxref=Genbank:NP_216934.1,GeneID:885304;Name=NP_216934.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2418c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216934.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2717128 2717799 . - . ID=gene-Rv2419c;Dbxref=GeneID:885727;Name=gpgP;gbkey=Gene;gene=gpgP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2419c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2717128 2717799 . - 0 ID=cds-NP_216935.1;Parent=gene-Rv2419c;Dbxref=Genbank:NP_216935.1,GeneID:885727;Name=NP_216935.1;Note=gpgP%2C glucosyl-3-phosphoglycerate phosphatase. Contains PS00175 Phosphoglycerate mutase family phosphohistidine signature. Belongs to the phosphoglycerate mutase family. Enzyme activity inhibited by Co2+ and Cu2+.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:22355692];gbkey=CDS;gene=gpgP;inference=protein motif:PROSITE:PS00175;locus_tag=Rv2419c;product=glucosyl-3-phosphoglycerate phosphatase;protein_id=NP_216935.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2717796 2718176 . - . ID=gene-Rv2420c;Dbxref=GeneID:885677;Name=Rv2420c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2420c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2717796 2718176 . - 0 ID=cds-NP_216936.1;Parent=gene-Rv2420c;Dbxref=Genbank:NP_216936.1,GeneID:885677;Name=NP_216936.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2420c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216936.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2718173 2718808 . - . ID=gene-Rv2421c;Dbxref=GeneID:885457;Name=nadD;gbkey=Gene;gene=nadD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2421c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2718173 2718808 . - 0 ID=cds-NP_216937.1;Parent=gene-Rv2421c;Dbxref=Genbank:NP_216937.1,GeneID:885457;Name=NP_216937.1;Note=deamido-NAD(+) pyrophosphorylase (deamido-NAD(+) diphosphorylase) (nicotinate mononucleotide adenylyltransferase) (NAMN adenylyltransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=nadD;locus_tag=Rv2421c;product=nicotinate-nucleotide adenylyltransferase;protein_id=NP_216937.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2719083 2719355 . + . ID=gene-Rv2422;Dbxref=GeneID:885531;Name=Rv2422;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2422
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2719083 2719355 . + 0 ID=cds-NP_216938.1;Parent=gene-Rv2422;Dbxref=Genbank:NP_216938.1,GeneID:885531;Name=NP_216938.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2422;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216938.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2719597 2720643 . + . ID=gene-Rv2423;Dbxref=GeneID:885516;Name=Rv2423;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2423
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2719597 2720643 . + 0 ID=cds-NP_216939.1;Parent=gene-Rv2423;Dbxref=Genbank:NP_216939.1,GeneID:885516;Name=NP_216939.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2423;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216939.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2720644 2720656 . + . ID=id-NC_000962.3:2720644..2720656;Note=13 bp inverted repeat%2C GCAGTCG(C)AAAAG%2C at the left end of IS1558;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2720776 2721777 . - . ID=gene-Rv2424c;Dbxref=GeneID:885699;Name=Rv2424c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2424c
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+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2720779 2721777 . - . ID=id-Rv2424c;Dbxref=GeneID:885699;Note=IS1558-2%2C len: 999 nt. Insertion sequence IS1558.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1558-2
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2721844 2721856 . - . ID=id-NC_000962.3:2721844..2721856;Note=13 bp inverted repeat%2C GCAGTCG(T)AAAAG%2C at the right end of IS1558;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2721866 2723308 . - . ID=gene-Rv2425c;Dbxref=GeneID:885673;Name=Rv2425c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2425c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2723308 2724183 . - . ID=gene-Rv2426c;Dbxref=GeneID:885909;Name=Rv2426c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2426c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2724230 2725477 . - . ID=gene-Rv2427c;Dbxref=GeneID:885536;Name=proA;gbkey=Gene;gene=proA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2427c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2724230 2725477 . - 0 ID=cds-NP_216943.1;Parent=gene-Rv2427c;Dbxref=Genbank:NP_216943.1,GeneID:885536;Name=NP_216943.1;Note=GPR (glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase) (glutamyl-gamma-semialdehyde dehydrogenase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=proA;locus_tag=Rv2427c;product=gamma-glutamyl phosphate reductase;protein_id=NP_216943.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2725571 2726087 . - . ID=gene-Rv2427A;Dbxref=GeneID:3205094;Name=oxyR';gbkey=Gene;gene=oxyR';gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2427A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2725571 2726087 . - . ID=id-Rv2427A;Dbxref=GeneID:3205094;Note=Rv2427A%2C Pseudogene oxyR'%2C inactivated by multiple mutations%3B identical to sequence in u16243 (see Deretic et al.%2C 1995).;gbkey=misc_feature;gene=oxyR';locus_tag=Rv2427A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 2726193 2726780 . + . ID=gene-Rv2428;Dbxref=GeneID:885717;Name=ahpC;gbkey=Gene;gene=ahpC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2428
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2726193 2726780 . + 0 ID=cds-NP_216944.1;Parent=gene-Rv2428;Dbxref=Genbank:NP_216944.1,GeneID:885717;Name=NP_216944.1;Note=alkyl hydroperoxidase C;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ahpC;locus_tag=Rv2428;product=alkyl hydroperoxide reductase subunit AhpC;protein_id=NP_216944.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2726806 2727339 . + . ID=gene-Rv2429;Dbxref=GeneID:885959;Name=ahpD;gbkey=Gene;gene=ahpD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2429
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2726806 2727339 . + 0 ID=cds-NP_216945.1;Parent=gene-Rv2429;Dbxref=Genbank:NP_216945.1,GeneID:885959;Name=NP_216945.1;Note=alkyl hydroperoxidase D;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:10766746];gbkey=CDS;gene=ahpD;locus_tag=Rv2429;product=alkyl hydroperoxide reductase AphD;protein_id=NP_216945.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2727336 2727920 . - . ID=gene-Rv2430c;Dbxref=GeneID:885945;Name=PPE41;gbkey=Gene;gene=PPE41;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2430c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2727336 2727920 . - 0 ID=cds-YP_177881.1;Parent=gene-Rv2430c;Dbxref=Genbank:YP_177881.1,GeneID:885945;Name=YP_177881.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=PPE41;locus_tag=Rv2430c;product=PPE family protein PPE41;protein_id=YP_177881.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2727967 2728266 . - . ID=gene-Rv2431c;Dbxref=GeneID:885703;Name=PE25;gbkey=Gene;gene=PE25;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2431c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2727967 2728266 . - 0 ID=cds-YP_177882.1;Parent=gene-Rv2431c;Dbxref=Genbank:YP_177882.1,GeneID:885703;Name=YP_177882.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=PE25;locus_tag=Rv2431c;product=PE family protein PE25;protein_id=YP_177882.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2728437 2728847 . - . ID=gene-Rv2432c;Dbxref=GeneID:885075;Name=Rv2432c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2432c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2728437 2728847 . - 0 ID=cds-NP_216948.1;Parent=gene-Rv2432c;Dbxref=Genbank:NP_216948.1,GeneID:885075;Name=NP_216948.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2432c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216948.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2728844 2729134 . - . ID=gene-Rv2433c;Dbxref=GeneID:885579;Name=Rv2433c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2433c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2728844 2729134 . - 0 ID=cds-NP_216949.1;Parent=gene-Rv2433c;Dbxref=Genbank:NP_216949.1,GeneID:885579;Name=NP_216949.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2433c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216949.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2729115 2730560 . - . ID=gene-Rv2434c;Dbxref=GeneID:885885;Name=Rv2434c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2434c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2729115 2730560 . - 0 ID=cds-NP_216950.1;Parent=gene-Rv2434c;Dbxref=Genbank:NP_216950.1,GeneID:885885;Name=NP_216950.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2434c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216950.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2730557 2732749 . - . ID=gene-Rv2435c;Dbxref=GeneID:885891;Name=Rv2435c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2435c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2730557 2732749 . - 0 ID=cds-NP_216951.1;Parent=gene-Rv2435c;Dbxref=Genbank:NP_216951.1,GeneID:885891;Name=NP_216951.1;Note=adenylyl- or guanylyl-cyclase;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2435c;product=cyclase;protein_id=NP_216951.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2733230 2734144 . + . ID=gene-Rv2436;Dbxref=GeneID:885671;Name=rbsK;gbkey=Gene;gene=rbsK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2436
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2733230 2734144 . + 0 ID=cds-NP_216952.1;Parent=gene-Rv2436;Dbxref=Genbank:NP_216952.1,GeneID:885671;Name=NP_216952.1;Note=Belongs to the PFKB family of carbohydrate kinases.;gbkey=CDS;gene=rbsK;inference=protein motif:PROSITE:PS00583;locus_tag=Rv2436;product=ribokinase RbsK;protein_id=NP_216952.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2734376 2734795 . + . ID=gene-Rv2437;Dbxref=GeneID:885906;Name=Rv2437;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2437
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2734376 2734795 . + 0 ID=cds-NP_216953.1;Parent=gene-Rv2437;Dbxref=Genbank:NP_216953.1,GeneID:885906;Name=NP_216953.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2437;product=transmembrane protein;protein_id=NP_216953.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2734792 2736831 . - . ID=gene-Rv2438c;Dbxref=GeneID:885808;Name=nadE;gbkey=Gene;gene=nadE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2438c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2734792 2736831 . - 0 ID=cds-NP_216954.2;Parent=gene-Rv2438c;Dbxref=Genbank:NP_216954.2,GeneID:885808;Name=NP_216954.2;Note=NAD(+) synthase [glutamine-hydrolysing];experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nadE;inference=protein motif:PROSITE:PS00591;locus_tag=Rv2438c;product=glutamine-dependent NAD(+) synthetase;protein_id=NP_216954.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2736709 2736987 . + . ID=gene-Rv2438A;Dbxref=GeneID:3205071;Name=Rv2438A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2438A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2736709 2736987 . + 0 ID=cds-YP_177671.1;Parent=gene-Rv2438A;Dbxref=Genbank:YP_177671.1,GeneID:3205071;Name=YP_177671.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2438A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177671.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2737117 2738247 . - . ID=gene-Rv2439c;Dbxref=GeneID:885266;Name=proB;gbkey=Gene;gene=proB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2439c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2737117 2738247 . - 0 ID=cds-NP_216955.1;Parent=gene-Rv2439c;Dbxref=Genbank:NP_216955.1,GeneID:885266;Name=NP_216955.1;Note=gamma-glutamyl kinase (GK);gbkey=CDS;gene=proB;inference=protein motif:PROSITE:PS00902;locus_tag=Rv2439c;product=glutamate 5-kinase protein;protein_id=NP_216955.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2738247 2739686 . - . ID=gene-Rv2440c;Dbxref=GeneID:885900;Name=obg;gbkey=Gene;gene=obg;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2440c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2738247 2739686 . - 0 ID=cds-NP_216956.1;Parent=gene-Rv2440c;Dbxref=Genbank:NP_216956.1,GeneID:885900;Name=NP_216956.1;Note=GTP1/Obg family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=obg;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2440c;product=GTPase Obg;protein_id=NP_216956.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2739772 2740032 . - . ID=gene-Rv2441c;Dbxref=GeneID:885919;Name=rpmA;gbkey=Gene;gene=rpmA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2441c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2739772 2740032 . - 0 ID=cds-NP_216957.1;Parent=gene-Rv2441c;Dbxref=Genbank:NP_216957.1,GeneID:885919;Name=NP_216957.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpmA;inference=protein motif:PROSITE:PS00831;locus_tag=Rv2441c;product=50S ribosomal protein L27;protein_id=NP_216957.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2740047 2740361 . - . ID=gene-Rv2442c;Dbxref=GeneID:885715;Name=rplU;gbkey=Gene;gene=rplU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2442c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2740047 2740361 . - 0 ID=cds-NP_216958.1;Parent=gene-Rv2442c;Dbxref=Genbank:NP_216958.1,GeneID:885715;Name=NP_216958.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplU;locus_tag=Rv2442c;product=50S ribosomal protein L21;protein_id=NP_216958.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2740709 2742184 . + . ID=gene-Rv2443;Dbxref=GeneID:885745;Name=dctA;gbkey=Gene;gene=dctA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2443
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2740709 2742184 . + 0 ID=cds-NP_216959.1;Parent=gene-Rv2443;Dbxref=Genbank:NP_216959.1,GeneID:885745;Name=NP_216959.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=dctA;locus_tag=Rv2443;product=C4-dicarboxylate-transport transmembrane protein DctA;protein_id=NP_216959.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2742123 2744984 . - . ID=gene-Rv2444c;Dbxref=GeneID:885911;Name=rne;gbkey=Gene;gene=rne;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2444c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2742123 2744984 . - 0 ID=cds-NP_216960.1;Parent=gene-Rv2444c;Dbxref=Genbank:NP_216960.1,GeneID:885911;Name=NP_216960.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rne;locus_tag=Rv2444c;product=ribonuclease E;protein_id=NP_216960.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2745314 2745724 . - . ID=gene-Rv2445c;Dbxref=GeneID:885905;Name=ndkA;gbkey=Gene;gene=ndkA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ndk;locus_tag=Rv2445c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2745314 2745724 . - 0 ID=cds-NP_216961.1;Parent=gene-Rv2445c;Dbxref=Genbank:NP_216961.1,GeneID:885905;Name=NP_216961.1;Note=NDK (NDP kinase) (nucleoside-2-P kinase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ndkA;locus_tag=Rv2445c;product=nucleoside diphosphate kinase;protein_id=NP_216961.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2745767 2746138 . - . ID=gene-Rv2446c;Dbxref=GeneID:885916;Name=Rv2446c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2446c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2745767 2746138 . - 0 ID=cds-NP_216962.1;Parent=gene-Rv2446c;Dbxref=Genbank:NP_216962.1,GeneID:885916;Name=NP_216962.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2446c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_216962.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2746135 2747598 . - . ID=gene-Rv2447c;Dbxref=GeneID:885902;Name=folC;gbkey=Gene;gene=folC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2447c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2746135 2747598 . - 0 ID=cds-NP_216963.1;Parent=gene-Rv2447c;Dbxref=Genbank:NP_216963.1,GeneID:885902;Name=NP_216963.1;Note=folylpoly-gamma-glutamate synthetase (FPGS);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=folC;inference=protein motif:PROSITE:PS01012;locus_tag=Rv2447c;product=folylpolyglutamate synthase FolC;protein_id=NP_216963.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2747595 2750225 . - . ID=gene-Rv2448c;Dbxref=GeneID:885892;Name=valS;gbkey=Gene;gene=valS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2448c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2747595 2750225 . - 0 ID=cds-NP_216964.1;Parent=gene-Rv2448c;Dbxref=Genbank:NP_216964.1,GeneID:885892;Name=NP_216964.1;Note=valyl-tRNA synthase protein ValS (valyl-tRNA synthetase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=valS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv2448c;product=valine--tRNA ligase;protein_id=NP_216964.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2750313 2751572 . - . ID=gene-Rv2449c;Dbxref=GeneID:885894;Name=Rv2449c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2449c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2750313 2751572 . - 0 ID=cds-NP_216965.1;Parent=gene-Rv2449c;Dbxref=Genbank:NP_216965.1,GeneID:885894;Name=NP_216965.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2449c;product=trans-acting enoyl reductase;protein_id=NP_216965.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2751662 2752180 . - . ID=gene-Rv2450c;Dbxref=GeneID:885760;Name=rpfE;gbkey=Gene;gene=rpfE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2450c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2751662 2752180 . - 0 ID=cds-NP_216966.1;Parent=gene-Rv2450c;Dbxref=Genbank:NP_216966.1,GeneID:885760;Name=NP_216966.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15207486];gbkey=CDS;gene=rpfE;locus_tag=Rv2450c;product=resuscitation-promoting factor RpfE;protein_id=NP_216966.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2753018 2753623 . - . ID=gene-Rv2453c;Dbxref=GeneID:885904;Name=mobA;gbkey=Gene;gene=mobA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2453c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2753625 2754746 . - . ID=gene-Rv2454c;Dbxref=GeneID:887435;Name=Rv2454c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2454c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2753625 2754746 . - 0 ID=cds-NP_216970.1;Parent=gene-Rv2454c;Dbxref=Genbank:NP_216970.1,GeneID:887435;Name=NP_216970.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:19936047];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2454c;product=2-oxoglutarate oxidoreductase subunit KorB;protein_id=NP_216970.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2754743 2756704 . - . ID=gene-Rv2455c;Dbxref=GeneID:887370;Name=Rv2455c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2455c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2754743 2756704 . - 0 ID=cds-NP_216971.1;Parent=gene-Rv2455c;Dbxref=Genbank:NP_216971.1,GeneID:887370;Name=NP_216971.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2455c;product=2-oxoglutarate oxidoreductase subunit KorA;protein_id=NP_216971.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2756936 2758192 . - . ID=gene-Rv2456c;Dbxref=GeneID:887340;Name=Rv2456c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2456c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2756936 2758192 . - 0 ID=cds-NP_216972.1;Parent=gene-Rv2456c;Dbxref=Genbank:NP_216972.1,GeneID:887340;Name=NP_216972.1;Note=integral membrane transport protein;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00216;locus_tag=Rv2456c;product=MFS-type transporter;protein_id=NP_216972.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2758208 2759488 . - . ID=gene-Rv2457c;Dbxref=GeneID:888167;Name=clpX;gbkey=Gene;gene=clpX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2457c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2758208 2759488 . - 0 ID=cds-NP_216973.1;Parent=gene-Rv2457c;Dbxref=Genbank:NP_216973.1,GeneID:888167;Name=NP_216973.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=clpX;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2457c;product=ATP-dependent CLP protease ATP-binding subunit ClpX;protein_id=NP_216973.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2759779 2760687 . + . ID=gene-Rv2458;Dbxref=GeneID:885871;Name=mmuM;gbkey=Gene;gene=mmuM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2458
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2759779 2760687 . + 0 ID=cds-NP_216974.1;Parent=gene-Rv2458;Dbxref=Genbank:NP_216974.1,GeneID:885871;Name=NP_216974.1;Note=S-methylmethionine:homocysteine methyltransferase (cysteine methyltransferase);gbkey=CDS;gene=mmuM;locus_tag=Rv2458;product=homocysteine S-methyltransferase MmuM;protein_id=NP_216974.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2760854 2762380 . + . ID=gene-Rv2459;Dbxref=GeneID:888191;Name=Rv2459;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2459
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2760854 2762380 . + 0 ID=cds-NP_216975.1;Parent=gene-Rv2459;Dbxref=Genbank:NP_216975.1,GeneID:888191;Name=NP_216975.1;Note=integral membrane transport protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2459;product=MFS-type transporter;protein_id=NP_216975.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2762531 2763175 . - . ID=gene-Rv2460c;Dbxref=GeneID:888174;Name=clpP2;gbkey=Gene;gene=clpP2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2460c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2762531 2763175 . - 0 ID=cds-NP_216976.1;Parent=gene-Rv2460c;Dbxref=Genbank:NP_216976.1,GeneID:888174;Name=NP_216976.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=clpP2;inference=protein motif:PROSITE:PS00381;locus_tag=Rv2460c;product=ATP-dependent CLP protease proteolytic subunit 2;protein_id=NP_216976.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2762762 2763061 . + . ID=id-NC_000962.3:2762762..2763061;Note=300 bp direct repeat copy 1;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2763172 2763774 . - . ID=gene-Rv2461c;Dbxref=GeneID:888176;Name=clpP1;gbkey=Gene;gene=clpP1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clp;locus_tag=Rv2461c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2763172 2763774 . - 0 ID=cds-YP_177883.1;Parent=gene-Rv2461c;Dbxref=Genbank:YP_177883.1,GeneID:888176;Name=YP_177883.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=clpP1;locus_tag=Rv2461c;product=ATP-dependent CLP protease proteolytic subunit 1;protein_id=YP_177883.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2763397 2763696 . + . ID=id-NC_000962.3:2763397..2763696;Note=300 bp direct repeat copy 2;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2763891 2765291 . - . ID=gene-Rv2462c;Dbxref=GeneID:888615;Name=tig;gbkey=Gene;gene=tig;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2462c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2763891 2765291 . - 0 ID=cds-NP_216978.1;Parent=gene-Rv2462c;Dbxref=Genbank:NP_216978.1,GeneID:888615;Name=NP_216978.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=tig;locus_tag=Rv2462c;product=trigger factor;protein_id=NP_216978.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2765331 2765404 . - . ID=gene-Rvnt26;Dbxref=GeneID:2700470;Name=proU;gbkey=Gene;gene=proU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt26
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2765331 2765404 . - . ID=rna-Rvnt26;Parent=gene-Rvnt26;Dbxref=GeneID:2700470;Note=proU%2C tRNA-Pro%3B anticodon tgg%2C length %3D 74;anticodon=(pos:complement(2765368..2765370));codons=22;gbkey=tRNA;gene=proU;locus_tag=Rvnt26;product=tRNA-Pro
+NC_000962.3 RefSeq exon 2765331 2765404 . - . ID=exon-Rvnt26-1;Parent=rna-Rvnt26;Dbxref=GeneID:2700470;Note=proU%2C tRNA-Pro%3B anticodon tgg%2C length %3D 74;anticodon=(pos:complement(2765368..2765370));codons=22;gbkey=tRNA;gene=proU;locus_tag=Rvnt26;product=tRNA-Pro
+NC_000962.3 RefSeq gene 2765541 2765611 . + . ID=gene-Rvnt27;Dbxref=GeneID:2700450;Name=glyV;gbkey=Gene;gene=glyV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt27
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2765541 2765611 . + . ID=rna-Rvnt27;Parent=gene-Rvnt27;Dbxref=GeneID:2700450;Note=glyV%2C tRNA-Gly%3B anticodon tcc%2C length %3D 71;anticodon=(pos:2765573..2765575);codons=62;gbkey=tRNA;gene=glyV;locus_tag=Rvnt27;product=tRNA-Gly
+NC_000962.3 RefSeq exon 2765541 2765611 . + . ID=exon-Rvnt27-1;Parent=rna-Rvnt27;Dbxref=GeneID:2700450;Note=glyV%2C tRNA-Gly%3B anticodon tcc%2C length %3D 71;anticodon=(pos:2765573..2765575);codons=62;gbkey=tRNA;gene=glyV;locus_tag=Rvnt27;product=tRNA-Gly
+NC_000962.3 RefSeq gene 2765655 2766839 . + . ID=gene-Rv2463;Dbxref=GeneID:888572;Name=lipP;gbkey=Gene;gene=lipP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2463
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2765655 2766839 . + 0 ID=cds-NP_216979.1;Parent=gene-Rv2463;Dbxref=Genbank:NP_216979.1,GeneID:888572;Name=NP_216979.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=lipP;locus_tag=Rv2463;product=esterase/lipase LipP;protein_id=NP_216979.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2766859 2767665 . - . ID=gene-Rv2464c;Dbxref=GeneID:888500;Name=Rv2464c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2464c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2766859 2767665 . - 0 ID=cds-NP_216980.1;Parent=gene-Rv2464c;Dbxref=Genbank:NP_216980.1,GeneID:888500;Name=NP_216980.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2464c;product=DNA glycosylase;protein_id=NP_216980.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2767671 2768159 . - . ID=gene-Rv2465c;Dbxref=GeneID:887225;Name=rpiB;gbkey=Gene;gene=rpiB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2465c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2767671 2768159 . - 0 ID=cds-YP_177884.1;Parent=gene-Rv2465c;Dbxref=Genbank:YP_177884.1,GeneID:887225;Name=YP_177884.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:14687575];gbkey=CDS;gene=rpiB;locus_tag=Rv2465c;product=ribose-5-phosphate isomerase B;protein_id=YP_177884.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2768261 2768884 . - . ID=gene-Rv2466c;Dbxref=GeneID:888214;Name=Rv2466c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2466c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2768261 2768884 . - 0 ID=cds-NP_216982.1;Parent=gene-Rv2466c;Dbxref=Genbank:NP_216982.1,GeneID:888214;Name=NP_216982.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00195;locus_tag=Rv2466c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216982.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2768986 2771571 . + . ID=gene-Rv2467;Dbxref=GeneID:887403;Name=pepN;gbkey=Gene;gene=pepN;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=pepD;locus_tag=Rv2467
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2768986 2771571 . + 0 ID=cds-YP_177885.1;Parent=gene-Rv2467;Dbxref=Genbank:YP_177885.1,GeneID:887403;Name=YP_177885.1;Note=Lysyl aminopeptidase (LYS-AP) (alanine aminopeptidase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pepN;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv2467;product=aminopeptidase PepN;protein_id=YP_177885.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2771644 2772147 . - . ID=gene-Rv2468c;Dbxref=GeneID:887767;Name=Rv2468c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2468c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2771644 2772147 . - 0 ID=cds-NP_216984.1;Parent=gene-Rv2468c;Dbxref=Genbank:NP_216984.1,GeneID:887767;Name=NP_216984.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2468c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216984.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2772098 2772331 . - . ID=gene-Rv2468A;Dbxref=GeneID:14515866;Name=Rv2468A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2468A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2772098 2772331 . - 0 ID=cds-YP_007411168.1;Parent=gene-Rv2468A;Dbxref=Genbank:YP_007411168.1,GeneID:14515866;Name=YP_007411168.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2468A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007411168.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2772367 2773035 . - . ID=gene-Rv2469c;Dbxref=GeneID:888591;Name=Rv2469c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2469c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2772367 2773035 . - 0 ID=cds-NP_216985.1;Parent=gene-Rv2469c;Dbxref=Genbank:NP_216985.1,GeneID:888591;Name=NP_216985.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2469c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216985.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2773178 2773564 . + . ID=gene-Rv2470;Dbxref=GeneID:887743;Name=glbO;gbkey=Gene;gene=glbO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2470
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2773178 2773564 . + 0 ID=cds-NP_216986.1;Parent=gene-Rv2470;Dbxref=Genbank:NP_216986.1,GeneID:887743;Name=NP_216986.1;Note=oxygen-binding protein;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:11796724];gbkey=CDS;gene=glbO;locus_tag=Rv2470;product=hemoglobin GlbO;protein_id=NP_216986.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2773564 2775204 . + . ID=gene-Rv2471;Dbxref=GeneID:887393;Name=aglA;gbkey=Gene;gene=aglA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2471
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2773564 2775204 . + 0 ID=cds-NP_216987.1;Parent=gene-Rv2471;Dbxref=Genbank:NP_216987.1,GeneID:887393;Name=NP_216987.1;Note=maltase (glucoinvertase) (glucosidosucrase) (maltase-glucoamylase) (lysosomal alpha-glucosidase) (acid maltase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=aglA;locus_tag=Rv2471;product=alpha-glucosidase AglA;protein_id=NP_216987.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2775272 2775565 . + . ID=gene-Rv2472;Dbxref=GeneID:887255;Name=Rv2472;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2472
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2775272 2775565 . + 0 ID=cds-NP_216988.1;Parent=gene-Rv2472;Dbxref=Genbank:NP_216988.1,GeneID:887255;Name=NP_216988.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2472;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216988.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2775568 2776284 . + . ID=gene-Rv2473;Dbxref=GeneID:888163;Name=Rv2473;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2473
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2775568 2776284 . + 0 ID=cds-NP_216989.1;Parent=gene-Rv2473;Dbxref=Genbank:NP_216989.1,GeneID:888163;Name=NP_216989.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2473;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216989.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2776316 2776969 . - . ID=gene-Rv2474c;Dbxref=GeneID:888606;Name=Rv2474c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2474c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2776316 2776969 . - 0 ID=cds-NP_216990.1;Parent=gene-Rv2474c;Dbxref=Genbank:NP_216990.1,GeneID:888606;Name=NP_216990.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2474c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216990.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2776975 2777391 . - . ID=gene-Rv2475c;Dbxref=GeneID:887793;Name=Rv2475c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2475c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2776975 2777391 . - 0 ID=cds-NP_216991.1;Parent=gene-Rv2475c;Dbxref=Genbank:NP_216991.1,GeneID:887793;Name=NP_216991.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2475c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216991.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2777388 2782262 . - . ID=gene-Rv2476c;Dbxref=GeneID:887437;Name=gdh;gbkey=Gene;gene=gdh;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2476c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2777388 2782262 . - 0 ID=cds-NP_216992.1;Parent=gene-Rv2476c;Dbxref=Genbank:NP_216992.1,GeneID:887437;Name=NP_216992.1;Note=Gdh (NAD-Gdh) (NAD-dependent glutamic dehydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gdh;locus_tag=Rv2476c;product=NAD-dependent glutamate dehydrogenase;protein_id=NP_216992.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2782366 2784042 . - . ID=gene-Rv2477c;Dbxref=GeneID:887757;Name=Rv2477c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2477c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2782366 2784042 . - 0 ID=cds-NP_216993.1;Parent=gene-Rv2477c;Dbxref=Genbank:NP_216993.1,GeneID:887757;Name=NP_216993.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv2477c;product=macrolide ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_216993.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2784123 2784608 . - . ID=gene-Rv2478c;Dbxref=GeneID:887304;Name=Rv2478c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2478c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2784123 2784608 . - 0 ID=cds-NP_216994.1;Parent=gene-Rv2478c;Dbxref=Genbank:NP_216994.1,GeneID:887304;Name=NP_216994.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2478c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216994.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2784614 2785970 . - . ID=id-NC_000962.3:2784614..2785970;Note=IS6110-9%2C len: 1357 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-9
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2784614 2784642 . + . ID=id-NC_000962.3:2784614..2784642;Note=29 bp Inverted repeat at the left end of IS6110%2CGTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2784657 2785592 . - . ID=id-NC_000962.3:2784657..2785592;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable transposase for IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2785942 2785970 . - . ID=id-NC_000962.3:2785942..2785970;Note=29 bp Inverted repeat at the right end of IS6110%2CGTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2786575 2786898 . - . ID=gene-Rv2481c;Dbxref=GeneID:887462;Name=Rv2481c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2481c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2786575 2786898 . - 0 ID=cds-NP_216997.1;Parent=gene-Rv2481c;Dbxref=Genbank:NP_216997.1,GeneID:887462;Name=NP_216997.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2481c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_216997.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2786914 2789283 . - . ID=gene-Rv2482c;Dbxref=GeneID:887848;Name=plsB2;gbkey=Gene;gene=plsB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2482c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2786914 2789283 . - 0 ID=cds-NP_216998.1;Parent=gene-Rv2482c;Dbxref=Genbank:NP_216998.1,GeneID:887848;Name=NP_216998.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=plsB2;locus_tag=Rv2482c;product=glycerol-3-phosphate acyltransferase;protein_id=NP_216998.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2789280 2791022 . - . ID=gene-Rv2483c;Dbxref=GeneID:887744;Name=plsC;gbkey=Gene;gene=plsC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2483c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2789280 2791022 . - 0 ID=cds-NP_216999.1;Parent=gene-Rv2483c;Dbxref=Genbank:NP_216999.1,GeneID:887744;Name=NP_216999.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=plsC;locus_tag=Rv2483c;product=bifunctional L-3-phosphoserine phosphatase/1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase;protein_id=NP_216999.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2791019 2792494 . - . ID=gene-Rv2484c;Dbxref=GeneID:888623;Name=Rv2484c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2484c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2791019 2792494 . - 0 ID=cds-NP_217000.1;Parent=gene-Rv2484c;Dbxref=Genbank:NP_217000.1,GeneID:888623;Name=NP_217000.1;Note=triacylglycerol synthase%3B A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2484c;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_217000.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2792723 2793988 . - . ID=gene-Rv2485c;Dbxref=GeneID:887876;Name=lipQ;gbkey=Gene;gene=lipQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2485c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2792723 2793988 . - 0 ID=cds-NP_217001.1;Parent=gene-Rv2485c;Dbxref=Genbank:NP_217001.1,GeneID:887876;Name=NP_217001.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=lipQ;locus_tag=Rv2485c;product=carboxylesterase LipQ;protein_id=NP_217001.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2794176 2794249 . + . ID=gene-Rvnt28;Dbxref=GeneID:2700423;Name=argW;gbkey=Gene;gene=argW;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt28
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2794176 2794249 . + . ID=rna-Rvnt28;Parent=gene-Rvnt28;Dbxref=GeneID:2700423;Note=argW%2C tRNA-Arg%3B anticodon tct%2C length %3D 74;anticodon=(pos:2794210..2794212);codons=46;gbkey=tRNA;gene=argW;locus_tag=Rvnt28;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq exon 2794176 2794249 . + . ID=exon-Rvnt28-1;Parent=rna-Rvnt28;Dbxref=GeneID:2700423;Note=argW%2C tRNA-Arg%3B anticodon tct%2C length %3D 74;anticodon=(pos:2794210..2794212);codons=46;gbkey=tRNA;gene=argW;locus_tag=Rvnt28;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq gene 2794350 2795120 . + . ID=gene-Rv2486;Dbxref=GeneID:887894;Name=echA14;gbkey=Gene;gene=echA14;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2486
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2794350 2795120 . + 0 ID=cds-NP_217002.1;Parent=gene-Rv2486;Dbxref=Genbank:NP_217002.1,GeneID:887894;Name=NP_217002.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=echA14;inference=protein motif:PROSITE:PS00166;locus_tag=Rv2486;product=enoyl-CoA hydratase EchA14;protein_id=NP_217002.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2795301 2797385 . - . ID=gene-Rv2487c;Dbxref=GeneID:887909;Name=PE_PGRS42;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS42;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2487c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2795301 2797385 . - 0 ID=cds-YP_177886.1;Parent=gene-Rv2487c;Dbxref=Genbank:YP_177886.1,GeneID:887909;Name=YP_177886.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS42;locus_tag=Rv2487c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS42;protein_id=YP_177886.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2797467 2800880 . - . ID=gene-Rv2488c;Dbxref=GeneID:887997;Name=Rv2488c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2488c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2797467 2800880 . - 0 ID=cds-NP_217004.1;Parent=gene-Rv2488c;Dbxref=Genbank:NP_217004.1,GeneID:887997;Name=NP_217004.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00622;locus_tag=Rv2488c;product=LuxR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217004.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2800671 2800918 . + . ID=id-NC_000962.3:2800671..2800918;Note=248 bp direct repeat 2;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2800846 2801145 . - . ID=gene-Rv2489c;Dbxref=GeneID:888937;Name=Rv2489c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2489c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2800846 2801145 . - 0 ID=cds-NP_217005.1;Parent=gene-Rv2489c;Dbxref=Genbank:NP_217005.1,GeneID:888937;Name=NP_217005.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2489c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217005.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2801254 2806236 . - . ID=gene-Rv2490c;Dbxref=GeneID:887941;Name=PE_PGRS43;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS43;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2490c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2801254 2806236 . - 0 ID=cds-YP_177887.1;Parent=gene-Rv2490c;Dbxref=Genbank:YP_177887.1,GeneID:887941;Name=YP_177887.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS43;locus_tag=Rv2490c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS43;protein_id=YP_177887.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2806323 2806529 . - . ID=gene-Rv2490a;Dbxref=GeneID:19394681;Name=Rv2490a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2490a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2806323 2806529 . - 0 ID=cds-YP_009030040.1;Parent=gene-Rv2490a;Dbxref=Genbank:YP_009030040.1,GeneID:19394681;Name=YP_009030040.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2490a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030040.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2806368 2806625 . + . ID=id-NC_000962.3:2806368..2806625;Note=258 bp direct repeat 2. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2806665 2807288 . + . ID=gene-Rv2491;Dbxref=GeneID:887780;Name=Rv2491;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2491
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2806665 2807288 . + 0 ID=cds-NP_217007.1;Parent=gene-Rv2491;Dbxref=Genbank:NP_217007.1,GeneID:887780;Name=NP_217007.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2491;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217007.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2807278 2808030 . + . ID=gene-Rv2492;Dbxref=GeneID:887436;Name=Rv2492;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2492
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2807278 2808030 . + 0 ID=cds-NP_217008.1;Parent=gene-Rv2492;Dbxref=Genbank:NP_217008.1,GeneID:887436;Name=NP_217008.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2492;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217008.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2808083 2808304 . + . ID=gene-Rv2493;Dbxref=GeneID:887480;Name=vapB38;gbkey=Gene;gene=vapB38;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2493
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2808083 2808304 . + 0 ID=cds-NP_217009.1;Parent=gene-Rv2493;Dbxref=Genbank:NP_217009.1,GeneID:887480;Name=NP_217009.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2494. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB38;locus_tag=Rv2493;product=antitoxin VapB38;protein_id=NP_217009.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2808310 2808735 . + . ID=gene-Rv2494;Dbxref=GeneID:887700;Name=vapC38;gbkey=Gene;gene=vapC38;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2494
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2808310 2808735 . + 0 ID=cds-NP_217010.1;Parent=gene-Rv2494;Dbxref=Genbank:NP_217010.1,GeneID:887700;Name=NP_217010.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2493%2Ccontains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC38;locus_tag=Rv2494;product=ribonuclease VapC38;protein_id=NP_217010.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2808758 2809939 . - . ID=gene-Rv2495c;Dbxref=GeneID:888237;Name=bkdC;gbkey=Gene;gene=bkdC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2495c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2808758 2809939 . - 0 ID=cds-NP_217011.1;Parent=gene-Rv2495c;Dbxref=Genbank:NP_217011.1,GeneID:888237;Name=NP_217011.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=bkdC;locus_tag=Rv2495c;product=branched-chain keto acid dehydrogenase E2 component;protein_id=NP_217011.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2809936 2810982 . - . ID=gene-Rv2496c;Dbxref=GeneID:888571;Name=bkdB;gbkey=Gene;gene=bkdB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2496c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2809936 2810982 . - 0 ID=cds-NP_217012.1;Parent=gene-Rv2496c;Dbxref=Genbank:NP_217012.1,GeneID:888571;Name=NP_217012.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=bkdB;locus_tag=Rv2496c;product=3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta;protein_id=NP_217012.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2810993 2812096 . - . ID=gene-Rv2497c;Dbxref=GeneID:888583;Name=bkdA;gbkey=Gene;gene=bkdA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2497c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2810993 2812096 . - 0 ID=cds-NP_217013.1;Parent=gene-Rv2497c;Dbxref=Genbank:NP_217013.1,GeneID:888583;Name=NP_217013.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=bkdA;locus_tag=Rv2497c;product=3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit alpha;protein_id=NP_217013.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2812355 2813176 . - . ID=gene-Rv2498c;Dbxref=GeneID:887466;Name=citE;gbkey=Gene;gene=citE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2498c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2812355 2813176 . - 0 ID=cds-NP_217014.1;Parent=gene-Rv2498c;Dbxref=Genbank:NP_217014.1,GeneID:887466;Name=NP_217014.1;Note=citrase (citratase) (citritase) (citridesmolase) (citrase aldolase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=citE;locus_tag=Rv2498c;product=citrate (pro-3S)-lyase subunit beta;protein_id=NP_217014.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2813173 2813730 . - . ID=gene-Rv2499c;Dbxref=GeneID:888584;Name=Rv2499c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2499c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2813173 2813730 . - 0 ID=cds-NP_217015.1;Parent=gene-Rv2499c;Dbxref=Genbank:NP_217015.1,GeneID:888584;Name=NP_217015.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2499c;product=oxidase regulatory-like protein;protein_id=NP_217015.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2813727 2814911 . - . ID=gene-Rv2500c;Dbxref=GeneID:888541;Name=fadE19;gbkey=Gene;gene=fadE19;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mmgC;locus_tag=Rv2500c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2813727 2814911 . - 0 ID=cds-NP_217016.1;Parent=gene-Rv2500c;Dbxref=Genbank:NP_217016.1,GeneID:888541;Name=NP_217016.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE19;inference=protein motif:PROSITE:PS00073;locus_tag=Rv2500c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE19;protein_id=NP_217016.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2814916 2816880 . - . ID=gene-Rv2501c;Dbxref=GeneID:887309;Name=accA1;gbkey=Gene;gene=accA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=bccA;locus_tag=Rv2501c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2814916 2816880 . - 0 ID=cds-NP_217017.1;Parent=gene-Rv2501c;Dbxref=Genbank:NP_217017.1,GeneID:887309;Name=NP_217017.1;Note=AccA1: biotin carboxylase + biotin carboxyl carrier protein (BCCP);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=accA1;inference=protein motif:PROSITE:PS00867;locus_tag=Rv2501c;product=acetyl/propionyl-CoA carboxylase subuit alpha;protein_id=NP_217017.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2816885 2818474 . - . ID=gene-Rv2502c;Dbxref=GeneID:887168;Name=accD1;gbkey=Gene;gene=accD1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2502c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2816885 2818474 . - 0 ID=cds-NP_217018.1;Parent=gene-Rv2502c;Dbxref=Genbank:NP_217018.1,GeneID:887168;Name=NP_217018.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=accD1;locus_tag=Rv2502c;product=acetyl-/propionyl-CoA carboxylase subunit beta;protein_id=NP_217018.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2818471 2819127 . - . ID=gene-Rv2503c;Dbxref=GeneID:888502;Name=scoB;gbkey=Gene;gene=scoB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2503c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2818471 2819127 . - 0 ID=cds-NP_217019.1;Parent=gene-Rv2503c;Dbxref=Genbank:NP_217019.1,GeneID:888502;Name=NP_217019.1;Note=ScoB (3-oxo-acid:CoA transferase) (OXCT B) (succinyl CoA:3-oxoacid CoA-transferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=scoB;locus_tag=Rv2503c;product=succinyl-CoA:3-ketoacid-CoA transferase subunit B;protein_id=NP_217019.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2819124 2819870 . - . ID=gene-Rv2504c;Dbxref=GeneID:888503;Name=scoA;gbkey=Gene;gene=scoA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2504c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2819124 2819870 . - 0 ID=cds-NP_217020.1;Parent=gene-Rv2504c;Dbxref=Genbank:NP_217020.1,GeneID:888503;Name=NP_217020.1;Note=ScoA (3-oxo acid:CoA transferase) (OXCT A) (succinyl-CoA:3-oxoacid-CoAtransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=scoA;locus_tag=Rv2504c;product=succinyl-CoA:3-ketoacid-CoA transferase subunit A;protein_id=NP_217020.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2819953 2821596 . - . ID=gene-Rv2505c;Dbxref=GeneID:887774;Name=fadD35;gbkey=Gene;gene=fadD35;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2505c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2819953 2821596 . - 0 ID=cds-NP_217021.1;Parent=gene-Rv2505c;Dbxref=Genbank:NP_217021.1,GeneID:887774;Name=NP_217021.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=fadD35;locus_tag=Rv2505c;product=fatty-acid--CoA ligase FadD35;protein_id=NP_217021.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2821712 2822359 . + . ID=gene-Rv2506;Dbxref=GeneID:888516;Name=Rv2506;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2506
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2821712 2822359 . + 0 ID=cds-NP_217022.1;Parent=gene-Rv2506;Dbxref=Genbank:NP_217022.1,GeneID:888516;Name=NP_217022.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2506;product=TetR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217022.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2822438 2823259 . + . ID=gene-Rv2507;Dbxref=GeneID:888244;Name=Rv2507;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2507
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2822438 2823259 . + 0 ID=cds-NP_217023.1;Parent=gene-Rv2507;Dbxref=Genbank:NP_217023.1,GeneID:888244;Name=NP_217023.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2507;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217023.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2823256 2824593 . - . ID=gene-Rv2508c;Dbxref=GeneID:888527;Name=Rv2508c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2508c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2823256 2824593 . - 0 ID=cds-NP_217024.1;Parent=gene-Rv2508c;Dbxref=Genbank:NP_217024.1,GeneID:888527;Name=NP_217024.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2508c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217024.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2824678 2825484 . + . ID=gene-Rv2509;Dbxref=GeneID:888526;Name=Rv2509;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2509
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2824678 2825484 . + 0 ID=cds-NP_217025.1;Parent=gene-Rv2509;Dbxref=Genbank:NP_217025.1,GeneID:888526;Name=NP_217025.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv2509;product=short-chain type dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_217025.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2825488 2827089 . - . ID=gene-Rv2510c;Dbxref=GeneID:888613;Name=Rv2510c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2510c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2825488 2827089 . - 0 ID=cds-NP_217026.1;Parent=gene-Rv2510c;Dbxref=Genbank:NP_217026.1,GeneID:888613;Name=NP_217026.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2510c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217026.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2827157 2827804 . + . ID=gene-Rv2511;Dbxref=GeneID:888633;Name=orn;gbkey=Gene;gene=orn;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2511
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2827157 2827804 . + 0 ID=cds-NP_217027.1;Parent=gene-Rv2511;Dbxref=Genbank:NP_217027.1,GeneID:888633;Name=NP_217027.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=orn;locus_tag=Rv2511;product=oligoribonuclease;protein_id=NP_217027.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2827854 2827926 . + . ID=gene-Rvnt29;Dbxref=GeneID:2700451;Name=hisT;gbkey=Gene;gene=hisT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt29
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2827854 2827926 . + . ID=rna-Rvnt29;Parent=gene-Rvnt29;Dbxref=GeneID:2700451;Note=hisT%2C tRNA-His%2C anticodon gtg%2C length %3D 73;anticodon=(pos:2827887..2827889);codons=25;gbkey=tRNA;gene=hisT;locus_tag=Rvnt29;product=tRNA-His
+NC_000962.3 RefSeq exon 2827854 2827926 . + . ID=exon-Rvnt29-1;Parent=rna-Rvnt29;Dbxref=GeneID:2700451;Note=hisT%2C tRNA-His%2C anticodon gtg%2C length %3D 73;anticodon=(pos:2827887..2827889);codons=25;gbkey=tRNA;gene=hisT;locus_tag=Rvnt29;product=tRNA-His
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2828489 2829938 . - . ID=id-NC_000962.3:2828489..2829938;Note=IS1081-3%2C len: 1450 nt. Insertion sequence IS1081.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1081-3
+NC_000962.3 RefSeq gene 2828556 2829803 . - . ID=gene-Rv2512c;Dbxref=GeneID:888515;Name=Rv2512c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2512c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2828556 2829803 . - 0 ID=cds-NP_217028.1;Parent=gene-Rv2512c;Dbxref=Genbank:NP_217028.1,GeneID:888515;Name=NP_217028.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01007;locus_tag=Rv2512c;product=insertion sequence element IS1081 transposase;protein_id=NP_217028.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2829954 2830139 . + . ID=gene-Rv2512a;Dbxref=GeneID:19394682;Name=Rv2512a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2512a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2829954 2830139 . + 0 ID=cds-YP_009030041.1;Parent=gene-Rv2512a;Dbxref=Genbank:YP_009030041.1,GeneID:19394682;Name=YP_009030041.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2512a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030041.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2830161 2830583 . + . ID=gene-Rv2513;Dbxref=GeneID:887808;Name=Rv2513;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2513
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2830161 2830583 . + 0 ID=cds-NP_217029.1;Parent=gene-Rv2513;Dbxref=Genbank:NP_217029.1,GeneID:887808;Name=NP_217029.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2513;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217029.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2830877 2831338 . - . ID=gene-Rv2514c;Dbxref=GeneID:887878;Name=Rv2514c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2514c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2830877 2831338 . - 0 ID=cds-NP_217030.1;Parent=gene-Rv2514c;Dbxref=Genbank:NP_217030.1,GeneID:887878;Name=NP_217030.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2514c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217030.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2831344 2832591 . - . ID=gene-Rv2515c;Dbxref=GeneID:887812;Name=Rv2515c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2515c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2831344 2832591 . - 0 ID=cds-NP_217031.1;Parent=gene-Rv2515c;Dbxref=Genbank:NP_217031.1,GeneID:887812;Name=NP_217031.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv2515c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217031.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2832710 2833513 . - . ID=gene-Rv2516c;Dbxref=GeneID:887186;Name=Rv2516c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2516c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2832710 2833513 . - 0 ID=cds-NP_217032.2;Parent=gene-Rv2516c;Dbxref=Genbank:NP_217032.2,GeneID:887186;Name=NP_217032.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2516c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217032.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2833510 2833761 . - . ID=gene-Rv2517c;Dbxref=GeneID:887673;Name=Rv2517c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2517c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2833510 2833761 . - 0 ID=cds-NP_217033.1;Parent=gene-Rv2517c;Dbxref=Genbank:NP_217033.1,GeneID:887673;Name=NP_217033.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2517c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217033.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2834109 2835335 . - . ID=gene-Rv2518c;Dbxref=GeneID:888160;Name=ldtB;gbkey=Gene;gene=ldtB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2518c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2834109 2835335 . - 0 ID=cds-NP_217034.1;Parent=gene-Rv2518c;Dbxref=Genbank:NP_217034.1,GeneID:888160;Name=NP_217034.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ldtB;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2518c;product=L%2CD-transpeptidase LdtB;protein_id=NP_217034.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2835494 2835566 . + . ID=gene-Rvnt30;Dbxref=GeneID:2700436;Name=lysU;gbkey=Gene;gene=lysU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt30
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2835494 2835566 . + . ID=rna-Rvnt30;Parent=gene-Rvnt30;Dbxref=GeneID:2700436;Note=lysU%2C tRNA-Lys%2C anticodon ctt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:2835527..2835529);codons=43;gbkey=tRNA;gene=lysU;locus_tag=Rvnt30;product=tRNA-Lys
+NC_000962.3 RefSeq exon 2835494 2835566 . + . ID=exon-Rvnt30-1;Parent=rna-Rvnt30;Dbxref=GeneID:2700436;Note=lysU%2C tRNA-Lys%2C anticodon ctt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:2835527..2835529);codons=43;gbkey=tRNA;gene=lysU;locus_tag=Rvnt30;product=tRNA-Lys
+NC_000962.3 RefSeq gene 2835785 2837263 . + . ID=gene-Rv2519;Dbxref=GeneID:888172;Name=PE26;gbkey=Gene;gene=PE26;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2519
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2835785 2837263 . + 0 ID=cds-YP_177888.1;Parent=gene-Rv2519;Dbxref=Genbank:YP_177888.1,GeneID:888172;Name=YP_177888.1;Note=PE26%2C Member of the M. tuberculosis PE family;gbkey=CDS;gene=PE26;locus_tag=Rv2519;product=PE family protein PE26;protein_id=YP_177888.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2837388 2837615 . - . ID=gene-Rv2520c;Dbxref=GeneID:887804;Name=Rv2520c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2520c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2837388 2837615 . - 0 ID=cds-NP_217036.1;Parent=gene-Rv2520c;Dbxref=Genbank:NP_217036.1,GeneID:887804;Name=NP_217036.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2520c;product=membrane protein;protein_id=NP_217036.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2837684 2838157 . + . ID=gene-Rv2521;Dbxref=GeneID:887694;Name=bcp;gbkey=Gene;gene=bcp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2521
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2837684 2838157 . + 0 ID=cds-NP_217037.1;Parent=gene-Rv2521;Dbxref=Genbank:NP_217037.1,GeneID:887694;Name=NP_217037.1;Note=bacterioferritin comigratory protein;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=bcp;locus_tag=Rv2521;product=peroxiredoxin;protein_id=NP_217037.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2838129 2839541 . - . ID=gene-Rv2522c;Dbxref=GeneID:887375;Name=Rv2522c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2522c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2838129 2839541 . - 0 ID=cds-NP_217038.1;Parent=gene-Rv2522c;Dbxref=Genbank:NP_217038.1,GeneID:887375;Name=NP_217038.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2522c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217038.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2839538 2839930 . - . ID=gene-Rv2523c;Dbxref=GeneID:888626;Name=acpS;gbkey=Gene;gene=acpS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2523c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2839538 2839930 . - 0 ID=cds-NP_217039.1;Parent=gene-Rv2523c;Dbxref=Genbank:NP_217039.1,GeneID:888626;Name=NP_217039.1;Note=holo-ACP synthase (CoA:APO-[ACP]pantetheinephosphotransferase) (CoA:APO-ACPpantetheinephosphotransferase);gbkey=CDS;gene=acpS;locus_tag=Rv2523c;product=holo-ACP synthase;protein_id=NP_217039.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2840123 2849332 . - . ID=gene-Rv2524c;Dbxref=GeneID:887704;Name=fas;gbkey=Gene;gene=fas;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2524c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2854938 2857781 . - . ID=gene-Rv2531c;Dbxref=GeneID:887216;Name=Rv2531c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=adi;locus_tag=Rv2531c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2857853 2858254 . - . ID=gene-Rv2532c;Dbxref=GeneID:887152;Name=Rv2532c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2532c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2858254 2858724 . - . ID=gene-Rv2533c;Dbxref=GeneID:887359;Name=nusB;gbkey=Gene;gene=nusB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2533c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2858727 2859290 . - . ID=gene-Rv2534c;Dbxref=GeneID:888437;Name=efp;gbkey=Gene;gene=efp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2534c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2858727 2859290 . - 0 ID=cds-NP_217050.1;Parent=gene-Rv2534c;Dbxref=Genbank:NP_217050.1,GeneID:888437;Name=NP_217050.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=efp;locus_tag=Rv2534c;product=elongation factor P;protein_id=NP_217050.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2859300 2860418 . - . ID=gene-Rv2535c;Dbxref=GeneID:888409;Name=pepQ;gbkey=Gene;gene=pepQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2535c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2859300 2860418 . - 0 ID=cds-NP_217051.1;Parent=gene-Rv2535c;Dbxref=Genbank:NP_217051.1,GeneID:888409;Name=NP_217051.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pepQ;locus_tag=Rv2535c;product=cytoplasmic peptidase PepQ;protein_id=NP_217051.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2860452 2861144 . + . ID=gene-Rv2536;Dbxref=GeneID:888386;Name=Rv2536;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2536
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2860452 2861144 . + 0 ID=cds-NP_217052.1;Parent=gene-Rv2536;Dbxref=Genbank:NP_217052.1,GeneID:888386;Name=NP_217052.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2536;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217052.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2861148 2861591 . - . ID=gene-Rv2537c;Dbxref=GeneID:888397;Name=aroD;gbkey=Gene;gene=aroD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=aroQ;locus_tag=Rv2537c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2861148 2861591 . - 0 ID=cds-NP_217053.1;Parent=gene-Rv2537c;Dbxref=Genbank:NP_217053.1,GeneID:888397;Name=NP_217053.1;Note=AROQ (3-dehydroquinase) (type II dhqase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=aroD;inference=protein motif:PROSITE:PS01029;locus_tag=Rv2537c;product=3-dehydroquinate dehydratase;protein_id=NP_217053.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2861588 2862676 . - . ID=gene-Rv2538c;Dbxref=GeneID:888392;Name=aroB;gbkey=Gene;gene=aroB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2538c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2861588 2862676 . - 0 ID=cds-NP_217054.1;Parent=gene-Rv2538c;Dbxref=Genbank:NP_217054.1,GeneID:888392;Name=NP_217054.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:17586643];gbkey=CDS;gene=aroB;locus_tag=Rv2538c;product=3-dehydroquinate synthase;protein_id=NP_217054.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2862673 2863203 . - . ID=gene-Rv2539c;Dbxref=GeneID:887434;Name=aroK;gbkey=Gene;gene=aroK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2539c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2862673 2863203 . - 0 ID=cds-NP_217055.1;Parent=gene-Rv2539c;Dbxref=Genbank:NP_217055.1,GeneID:887434;Name=NP_217055.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:11483005];gbkey=CDS;gene=aroK;inference=protein motif:PROSITE:PS01128;locus_tag=Rv2539c;product=shikimate kinase;protein_id=NP_217055.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2863207 2864412 . - . ID=gene-Rv2540c;Dbxref=GeneID:887379;Name=aroF;gbkey=Gene;gene=aroF;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=aroC;locus_tag=Rv2540c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2863207 2864412 . - 0 ID=cds-NP_217056.1;Parent=gene-Rv2540c;Dbxref=Genbank:NP_217056.1,GeneID:887379;Name=NP_217056.1;Note=5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate phospholyase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=aroF;inference=protein motif:PROSITE:PS00788;locus_tag=Rv2540c;product=chorismate synthase;protein_id=NP_217056.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2864427 2864834 . + . ID=gene-Rv2541;Dbxref=GeneID:887831;Name=Rv2541;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2541
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2864427 2864834 . + 0 ID=cds-NP_217057.1;Parent=gene-Rv2541;Dbxref=Genbank:NP_217057.1,GeneID:887831;Name=NP_217057.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2541;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217057.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2865130 2866341 . + . ID=gene-Rv2542;Dbxref=GeneID:887261;Name=Rv2542;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2542
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2865130 2866341 . + 0 ID=cds-NP_217058.1;Parent=gene-Rv2542;Dbxref=Genbank:NP_217058.1,GeneID:887261;Name=NP_217058.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2542;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217058.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2866468 2867127 . + . ID=gene-Rv2543;Dbxref=GeneID:888052;Name=lppA;gbkey=Gene;gene=lppA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2543
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2866468 2867127 . + 0 ID=cds-NP_217059.1;Parent=gene-Rv2543;Dbxref=Genbank:NP_217059.1,GeneID:888052;Name=NP_217059.1;gbkey=CDS;gene=lppA;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2543;product=lipoprotein LppA;protein_id=NP_217059.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2867124 2867786 . + . ID=gene-Rv2544;Dbxref=GeneID:888054;Name=lppB;gbkey=Gene;gene=lppB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2544
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2867124 2867786 . + 0 ID=cds-NP_217060.1;Parent=gene-Rv2544;Dbxref=Genbank:NP_217060.1,GeneID:888054;Name=NP_217060.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=lppB;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv2544;product=lipoprotein LppB;protein_id=NP_217060.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2867783 2868061 . + . ID=gene-Rv2545;Dbxref=GeneID:888038;Name=vapB18;gbkey=Gene;gene=vapB18;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2545
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2867783 2868061 . + 0 ID=cds-NP_217061.1;Parent=gene-Rv2545;Dbxref=Genbank:NP_217061.1,GeneID:888038;Name=NP_217061.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2546;gbkey=CDS;gene=vapB18;locus_tag=Rv2545;product=antitoxin VapB18;protein_id=NP_217061.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2868154 2868567 . + . ID=gene-Rv2546;Dbxref=GeneID:887365;Name=vapC18;gbkey=Gene;gene=vapC18;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2546
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2868154 2868567 . + 0 ID=cds-NP_217062.1;Parent=gene-Rv2546;Dbxref=Genbank:NP_217062.1,GeneID:887365;Name=NP_217062.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2545%2Ccontains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC18;locus_tag=Rv2546;product=ribonuclease VapC18;protein_id=NP_217062.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2868606 2868863 . + . ID=gene-Rv2547;Dbxref=GeneID:888452;Name=vapB19;gbkey=Gene;gene=vapB19;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2547
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2868606 2868863 . + 0 ID=cds-NP_217063.1;Parent=gene-Rv2547;Dbxref=Genbank:NP_217063.1,GeneID:888452;Name=NP_217063.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2548;gbkey=CDS;gene=vapB19;locus_tag=Rv2547;product=antitoxin VapB19;protein_id=NP_217063.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2868860 2869237 . + . ID=gene-Rv2548;Dbxref=GeneID:888412;Name=vapC19;gbkey=Gene;gene=vapC19;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2548
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2868860 2869237 . + 0 ID=cds-NP_217064.1;Parent=gene-Rv2548;Dbxref=Genbank:NP_217064.1,GeneID:888412;Name=NP_217064.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2547;gbkey=CDS;gene=vapC19;locus_tag=Rv2548;product=ribonuclease VapC19;protein_id=NP_217064.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2869253 2869627 . - . ID=gene-Rv2548A;Dbxref=GeneID:11117811;Name=Rv2548A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2548A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2869253 2869627 . - 0 ID=cds-YP_004837057.1;Parent=gene-Rv2548A;Dbxref=Genbank:YP_004837057.1,GeneID:11117811;Name=YP_004837057.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2548A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_004837057.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2869727 2870122 . - . ID=gene-Rv2549c;Dbxref=GeneID:887193;Name=vapC20;gbkey=Gene;gene=vapC20;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2549c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2869727 2870122 . - 0 ID=cds-NP_217065.1;Parent=gene-Rv2549c;Dbxref=Genbank:NP_217065.1,GeneID:887193;Name=NP_217065.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2550c%2Ccontains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC20;locus_tag=Rv2549c;product=ribonuclease VapC20;protein_id=NP_217065.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2870119 2870364 . - . ID=gene-Rv2550c;Dbxref=GeneID:887353;Name=vapB20;gbkey=Gene;gene=vapB20;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2550c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2870119 2870364 . - 0 ID=cds-NP_217066.1;Parent=gene-Rv2550c;Dbxref=Genbank:NP_217066.1,GeneID:887353;Name=NP_217066.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2549c;gbkey=CDS;gene=vapB20;locus_tag=Rv2550c;product=antitoxin VapB20;protein_id=NP_217066.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2870775 2871194 . - . ID=gene-Rv2551c;Dbxref=GeneID:887855;Name=Rv2551c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2551c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2870775 2871194 . - 0 ID=cds-NP_217067.1;Parent=gene-Rv2551c;Dbxref=Genbank:NP_217067.1,GeneID:887855;Name=NP_217067.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2551c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217067.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2871206 2872015 . - . ID=gene-Rv2552c;Dbxref=GeneID:887330;Name=aroE;gbkey=Gene;gene=aroE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2552c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2871206 2872015 . - 0 ID=cds-NP_217068.1;Parent=gene-Rv2552c;Dbxref=Genbank:NP_217068.1,GeneID:887330;Name=NP_217068.1;Note=5-dehydroshikimate reductase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=aroE;locus_tag=Rv2552c;product=shikimate 5-dehydrogenase;protein_id=NP_217068.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2872012 2873265 . - . ID=gene-Rv2553c;Dbxref=GeneID:888228;Name=Rv2553c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2553c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2872012 2873265 . - 0 ID=cds-NP_217069.1;Parent=gene-Rv2553c;Dbxref=Genbank:NP_217069.1,GeneID:888228;Name=NP_217069.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2553c;product=membrane protein;protein_id=NP_217069.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2873258 2873770 . - . ID=gene-Rv2554c;Dbxref=GeneID:887490;Name=Rv2554c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2554c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2873258 2873770 . - 0 ID=cds-NP_217070.1;Parent=gene-Rv2554c;Dbxref=Genbank:NP_217070.1,GeneID:887490;Name=NP_217070.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2554c;product=Holliday junction resolvase;protein_id=NP_217070.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2873771 2876485 . - . ID=gene-Rv2555c;Dbxref=GeneID:887726;Name=alaS;gbkey=Gene;gene=alaS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2555c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2873771 2876485 . - 0 ID=cds-NP_217071.1;Parent=gene-Rv2555c;Dbxref=Genbank:NP_217071.1,GeneID:887726;Name=NP_217071.1;Note=Probable alaS%2C alanyl-tRNA synthetase%2C (alanine translase) (ALARS);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=alaS;locus_tag=Rv2555c;product=alanine--tRNA ligase;protein_id=NP_217071.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2876576 2876965 . - . ID=gene-Rv2556c;Dbxref=GeneID:887451;Name=Rv2556c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2556c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2876576 2876965 . - 0 ID=cds-NP_217072.1;Parent=gene-Rv2556c;Dbxref=Genbank:NP_217072.1,GeneID:887451;Name=NP_217072.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2556c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217072.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2877072 2877746 . + . ID=gene-Rv2557;Dbxref=GeneID:887865;Name=Rv2557;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2557
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2877072 2877746 . + 0 ID=cds-NP_217073.1;Parent=gene-Rv2557;Dbxref=Genbank:NP_217073.1,GeneID:887865;Name=NP_217073.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2557;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217073.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2877831 2878541 . + . ID=gene-Rv2558;Dbxref=GeneID:887298;Name=Rv2558;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2558
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2877831 2878541 . + 0 ID=cds-NP_217074.1;Parent=gene-Rv2558;Dbxref=Genbank:NP_217074.1,GeneID:887298;Name=NP_217074.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2558;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217074.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2878571 2879929 . - . ID=gene-Rv2559c;Dbxref=GeneID:887368;Name=Rv2559c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2559c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2878571 2879929 . - 0 ID=cds-NP_217075.1;Parent=gene-Rv2559c;Dbxref=Genbank:NP_217075.1,GeneID:887368;Name=NP_217075.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2559c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217075.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2880075 2881052 . + . ID=gene-Rv2560;Dbxref=GeneID:887363;Name=Rv2560;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2560
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2880075 2881052 . + 0 ID=cds-NP_217076.1;Parent=gene-Rv2560;Dbxref=Genbank:NP_217076.1,GeneID:887363;Name=NP_217076.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2560;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217076.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2881252 2881320 . + . ID=id-NC_000962.3:2881252..2881320;Note=mpr11%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C 82-100 nt band detected by Northern blot in M. bovis BCG Pasteur.%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 2881409 2882147 . + . ID=gene-Rv2561;Dbxref=GeneID:887164;Name=Rv2561;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv2561;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2882185 2882276 . + . ID=id-NC_000962.3:2882185..2882276;Note=mpr12%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C ~~118 nt band detected by Northern blot in M. bovis BCG Pasteur.%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 2882290 2883339 . + . ID=gene-Rv2563;Dbxref=GeneID:887516;Name=Rv2563;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2563
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2882290 2883339 . + 0 ID=cds-NP_217079.1;Parent=gene-Rv2563;Dbxref=Genbank:NP_217079.1,GeneID:887516;Name=NP_217079.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2563;product=glutamine ABC transporter permease;protein_id=NP_217079.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2883342 2884334 . + . ID=gene-Rv2564;Dbxref=GeneID:887898;Name=glnQ;gbkey=Gene;gene=glnQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2564
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2883342 2884334 . + 0 ID=cds-NP_217080.1;Parent=gene-Rv2564;Dbxref=Genbank:NP_217080.1,GeneID:887898;Name=NP_217080.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glnQ;inference=protein motif:PROSITE:PS00889;locus_tag=Rv2564;product=glutamine ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_217080.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2884611 2886362 . + . ID=gene-Rv2565;Dbxref=GeneID:887288;Name=Rv2565;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2565
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2884611 2886362 . + 0 ID=cds-NP_217081.1;Parent=gene-Rv2565;Dbxref=Genbank:NP_217081.1,GeneID:887288;Name=NP_217081.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2565;product=NTE family protein;protein_id=NP_217081.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2886373 2889795 . + . ID=gene-Rv2566;Dbxref=GeneID:887737;Name=Rv2566;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2566
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2886373 2889795 . + 0 ID=cds-NP_217082.1;Parent=gene-Rv2566;Dbxref=Genbank:NP_217082.1,GeneID:887737;Name=NP_217082.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2566;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217082.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2889795 2892449 . + . ID=gene-Rv2567;Dbxref=GeneID:888578;Name=Rv2567;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2567
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2889795 2892449 . + 0 ID=cds-NP_217083.1;Parent=gene-Rv2567;Dbxref=Genbank:NP_217083.1,GeneID:888578;Name=NP_217083.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2567;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217083.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2892446 2893471 . - . ID=gene-Rv2568c;Dbxref=GeneID:887249;Name=Rv2568c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2568c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2892446 2893471 . - 0 ID=cds-NP_217084.1;Parent=gene-Rv2568c;Dbxref=Genbank:NP_217084.1,GeneID:887249;Name=NP_217084.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2568c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217084.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2893464 2894408 . - . ID=gene-Rv2569c;Dbxref=GeneID:887783;Name=Rv2569c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2569c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2893464 2894408 . - 0 ID=cds-NP_217085.1;Parent=gene-Rv2569c;Dbxref=Genbank:NP_217085.1,GeneID:887783;Name=NP_217085.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2569c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217085.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2894512 2894901 . + . ID=gene-Rv2570;Dbxref=GeneID:887377;Name=Rv2570;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2570
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2894512 2894901 . + 0 ID=cds-NP_217086.1;Parent=gene-Rv2570;Dbxref=Genbank:NP_217086.1,GeneID:887377;Name=NP_217086.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2570;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217086.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2894893 2895960 . - . ID=gene-Rv2571c;Dbxref=GeneID:887382;Name=Rv2571c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2571c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2894893 2895960 . - 0 ID=cds-NP_217087.1;Parent=gene-Rv2571c;Dbxref=Genbank:NP_217087.1,GeneID:887382;Name=NP_217087.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2571c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217087.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2896013 2897803 . - . ID=gene-Rv2572c;Dbxref=GeneID:888532;Name=aspS;gbkey=Gene;gene=aspS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2572c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2896013 2897803 . - 0 ID=cds-NP_217088.1;Parent=gene-Rv2572c;Dbxref=Genbank:NP_217088.1,GeneID:888532;Name=NP_217088.1;Note=Probable aspS%2C aspartyl-tRNA synthetase (ASPRS) (aspartic acid translase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=aspS;inference=protein motif:PROSITE:PS00179;locus_tag=Rv2572c;product=aspartate--tRNA ligase;protein_id=NP_217088.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2898043 2898783 . + . ID=gene-Rv2573;Dbxref=GeneID:888188;Name=Rv2573;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2573
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2898043 2898783 . + 0 ID=cds-NP_217089.3;Parent=gene-Rv2573;Dbxref=Genbank:NP_217089.3,GeneID:888188;Name=NP_217089.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2573;product=2-dehydropantoate 2-reductase;protein_id=NP_217089.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2898806 2899309 . + . ID=gene-Rv2574;Dbxref=GeneID:887232;Name=Rv2574;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2574
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2898806 2899309 . + 0 ID=cds-NP_217090.1;Parent=gene-Rv2574;Dbxref=Genbank:NP_217090.1,GeneID:887232;Name=NP_217090.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2574;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217090.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2899339 2900220 . + . ID=gene-Rv2575;Dbxref=GeneID:888178;Name=Rv2575;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2575
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2899339 2900220 . + 0 ID=cds-NP_217091.1;Parent=gene-Rv2575;Dbxref=Genbank:NP_217091.1,GeneID:888178;Name=NP_217091.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv2575;product=membrane protein;protein_id=NP_217091.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2900226 2900690 . - . ID=gene-Rv2576c;Dbxref=GeneID:887251;Name=Rv2576c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2576c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2900226 2900690 . - 0 ID=cds-NP_217092.1;Parent=gene-Rv2576c;Dbxref=Genbank:NP_217092.1,GeneID:887251;Name=NP_217092.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2576c;product=membrane protein;protein_id=NP_217092.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2900918 2902507 . + . ID=gene-Rv2577;Dbxref=GeneID:888207;Name=Rv2577;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2577
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2900918 2902507 . + 0 ID=cds-NP_217093.1;Parent=gene-Rv2577;Dbxref=Genbank:NP_217093.1,GeneID:888207;Name=NP_217093.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2577;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217093.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2902509 2903531 . - . ID=gene-Rv2578c;Dbxref=GeneID:887427;Name=Rv2578c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2578c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2902509 2903531 . - 0 ID=cds-NP_217094.1;Parent=gene-Rv2578c;Dbxref=Genbank:NP_217094.1,GeneID:887427;Name=NP_217094.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2578c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217094.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2903639 2904541 . + . ID=gene-Rv2579;Dbxref=GeneID:888599;Name=dhaA;gbkey=Gene;gene=dhaA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=linB;locus_tag=Rv2579
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2903639 2904541 . + 0 ID=cds-YP_177890.1;Parent=gene-Rv2579;Dbxref=Genbank:YP_177890.1,GeneID:888599;Name=YP_177890.1;Note=1-chlorohexane halidohydrolase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=dhaA;locus_tag=Rv2579;product=haloalkane dehalogenase;protein_id=YP_177890.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2904821 2906092 . - . ID=gene-Rv2580c;Dbxref=GeneID:887479;Name=hisS;gbkey=Gene;gene=hisS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2580c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2904821 2906092 . - 0 ID=cds-NP_217096.1;Parent=gene-Rv2580c;Dbxref=Genbank:NP_217096.1,GeneID:887479;Name=NP_217096.1;Note=Probable hisS%2C histidyl-tRNA synthetase (HISRS) (histidine--translase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hisS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2580c;product=histidine--tRNA ligase;protein_id=NP_217096.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2906089 2906763 . - . ID=gene-Rv2581c;Dbxref=GeneID:888217;Name=Rv2581c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2581c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2925492 2925737 . + . ID=gene-Rv2595;Dbxref=GeneID:887682;Name=vapB40;gbkey=Gene;gene=vapB40;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2595
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2925734 2926138 . + . ID=gene-Rv2596;Dbxref=GeneID:888218;Name=vapC40;gbkey=Gene;gene=vapC40;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2596
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2925734 2926138 . + 0 ID=cds-NP_217112.1;Parent=gene-Rv2596;Dbxref=Genbank:NP_217112.1,GeneID:888218;Name=NP_217112.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2595%2Ccontains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC40;locus_tag=Rv2596;product=ribonuclease VapC40;protein_id=NP_217112.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2926355 2926975 . + . ID=gene-Rv2597;Dbxref=GeneID:887679;Name=Rv2597;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2597
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2926355 2926975 . + 0 ID=cds-NP_217113.1;Parent=gene-Rv2597;Dbxref=Genbank:NP_217113.1,GeneID:887679;Name=NP_217113.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2597;product=membrane protein;protein_id=NP_217113.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2926986 2927480 . + . ID=gene-Rv2598;Dbxref=GeneID:887689;Name=Rv2598;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2598
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2926986 2927480 . + 0 ID=cds-NP_217114.1;Parent=gene-Rv2598;Dbxref=Genbank:NP_217114.1,GeneID:887689;Name=NP_217114.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2598;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217114.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2927477 2927908 . + . ID=gene-Rv2599;Dbxref=GeneID:887832;Name=Rv2599;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2599
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2927477 2927908 . + 0 ID=cds-NP_217115.1;Parent=gene-Rv2599;Dbxref=Genbank:NP_217115.1,GeneID:887832;Name=NP_217115.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00626;locus_tag=Rv2599;product=membrane protein;protein_id=NP_217115.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2927990 2928391 . + . ID=gene-Rv2600;Dbxref=GeneID:887869;Name=Rv2600;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2600
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2927990 2928391 . + 0 ID=cds-NP_217116.1;Parent=gene-Rv2600;Dbxref=Genbank:NP_217116.1,GeneID:887869;Name=NP_217116.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2600;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217116.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2928388 2929959 . + . ID=gene-Rv2601;Dbxref=GeneID:887676;Name=speE;gbkey=Gene;gene=speE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2601
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2930070 2930357 . + . ID=gene-Rv2601A;Dbxref=GeneID:3205108;Name=vapB41;gbkey=Gene;gene=vapB41;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2601A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2930070 2930357 . + 0 ID=cds-YP_177673.1;Parent=gene-Rv2601A;Dbxref=Genbank:YP_177673.1,GeneID:3205108;Name=YP_177673.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2602;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB41;locus_tag=Rv2601A;product=antitoxin VapB41;protein_id=YP_177673.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2930344 2930784 . + . ID=gene-Rv2602;Dbxref=GeneID:888186;Name=vapC41;gbkey=Gene;gene=vapC41;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2602
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2930344 2930784 . + 0 ID=cds-NP_217118.1;Parent=gene-Rv2602;Dbxref=Genbank:NP_217118.1,GeneID:888186;Name=NP_217118.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2601A%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC41;locus_tag=Rv2602;product=ribonuclease VapC41;protein_id=NP_217118.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2930805 2931560 . - . ID=gene-Rv2603c;Dbxref=GeneID:887369;Name=Rv2603c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2603c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2930805 2931560 . - 0 ID=cds-NP_217119.1;Parent=gene-Rv2603c;Dbxref=Genbank:NP_217119.1,GeneID:887369;Name=NP_217119.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2603c;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_217119.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2931693 2932289 . - . ID=gene-Rv2604c;Dbxref=GeneID:887371;Name=snoP;gbkey=Gene;gene=snoP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2604c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2931693 2932289 . - 0 ID=cds-NP_217120.1;Parent=gene-Rv2604c;Dbxref=Genbank:NP_217120.1,GeneID:887371;Name=NP_217120.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=snoP;locus_tag=Rv2604c;product=glutamine amidotransferase SnoP;protein_id=NP_217120.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2932297 2933142 . - . ID=gene-Rv2605c;Dbxref=GeneID:887588;Name=tesB2;gbkey=Gene;gene=tesB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2605c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2932297 2933142 . - 0 ID=cds-NP_217121.1;Parent=gene-Rv2605c;Dbxref=Genbank:NP_217121.1,GeneID:887588;Name=NP_217121.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=tesB2;locus_tag=Rv2605c;product=acyl-CoA thioesterase II;protein_id=NP_217121.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2933171 2934070 . - . ID=gene-Rv2606c;Dbxref=GeneID:888592;Name=snzP;gbkey=Gene;gene=snzP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2606c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2933171 2934070 . - 0 ID=cds-NP_217122.1;Parent=gene-Rv2606c;Dbxref=Genbank:NP_217122.1,GeneID:888592;Name=NP_217122.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=snzP;locus_tag=Rv2606c;product=pyridoxine biosynthesis protein;protein_id=NP_217122.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2934198 2934872 . + . ID=gene-Rv2607;Dbxref=GeneID:888155;Name=pdxH;gbkey=Gene;gene=pdxH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2607
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2935046 2936788 . + . ID=gene-Rv2608;Dbxref=GeneID:888204;Name=PPE42;gbkey=Gene;gene=PPE42;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2608
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2943376 2943603 . + . ID=gene-Rv2614A;Dbxref=GeneID:3205055;Name=Rv2614A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2614A
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2945330 2945830 . + . ID=gene-Rv2616;Dbxref=GeneID:887289;Name=Rv2616;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2616
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2945847 2946287 . - . ID=gene-Rv2617c;Dbxref=GeneID:888610;Name=Rv2617c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2617c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2946434 2947111 . + . ID=gene-Rv2618;Dbxref=GeneID:887690;Name=Rv2618;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2618
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2946434 2947111 . + 0 ID=cds-NP_217134.1;Parent=gene-Rv2618;Dbxref=Genbank:NP_217134.1,GeneID:887690;Name=NP_217134.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2618;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217134.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2947096 2947449 . - . ID=gene-Rv2619c;Dbxref=GeneID:888601;Name=Rv2619c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2619c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2947462 2947887 . - . ID=gene-Rv2620c;Dbxref=GeneID:888497;Name=Rv2620c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2620c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2947462 2947887 . - 0 ID=cds-NP_217136.1;Parent=gene-Rv2620c;Dbxref=Genbank:NP_217136.1,GeneID:888497;Name=NP_217136.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2620c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217136.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2947884 2948558 . - . ID=gene-Rv2621c;Dbxref=GeneID:888565;Name=Rv2621c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2621c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2948636 2949457 . + . ID=gene-Rv2622;Dbxref=GeneID:887825;Name=Rv2622;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2622
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2948636 2949457 . + 0 ID=cds-NP_217138.1;Parent=gene-Rv2622;Dbxref=Genbank:NP_217138.1,GeneID:887825;Name=NP_217138.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2622;product=methyltransferase;protein_id=NP_217138.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2949593 2950486 . + . ID=gene-Rv2623;Dbxref=GeneID:887442;Name=TB31.7;gbkey=Gene;gene=TB31.7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2623
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2949593 2950486 . + 0 ID=cds-NP_217139.1;Parent=gene-Rv2623;Dbxref=Genbank:NP_217139.1,GeneID:887442;Name=NP_217139.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=TB31.7;locus_tag=Rv2623;product=universal stress protein;protein_id=NP_217139.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2950489 2951307 . - . ID=gene-Rv2624c;Dbxref=GeneID:888939;Name=Rv2624c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2624c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 2951322 2952503 . - . ID=gene-Rv2625c;Dbxref=GeneID:887692;Name=Rv2625c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2625c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2951322 2952503 . - 0 ID=cds-NP_217141.1;Parent=gene-Rv2625c;Dbxref=Genbank:NP_217141.1,GeneID:887692;Name=NP_217141.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15952732];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv2625c;product=zinc metalloprotease Rip3;protein_id=NP_217141.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2952562 2952993 . - . ID=gene-Rv2626c;Dbxref=GeneID:888576;Name=hrp1;gbkey=Gene;gene=hrp1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2626c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2952562 2952993 . - 0 ID=cds-NP_217142.1;Parent=gene-Rv2626c;Dbxref=Genbank:NP_217142.1,GeneID:888576;Name=NP_217142.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hrp1;locus_tag=Rv2626c;product=hypoxic response protein;protein_id=NP_217142.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2953507 2954748 . - . ID=gene-Rv2627c;Dbxref=GeneID:888568;Name=Rv2627c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2627c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2953507 2954748 . - 0 ID=cds-NP_217143.1;Parent=gene-Rv2627c;Dbxref=Genbank:NP_217143.1,GeneID:888568;Name=NP_217143.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2627c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217143.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2955058 2955420 . + . ID=gene-Rv2628;Dbxref=GeneID:888566;Name=Rv2628;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2628
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2955058 2955420 . + 0 ID=cds-NP_217144.1;Parent=gene-Rv2628;Dbxref=Genbank:NP_217144.1,GeneID:888566;Name=NP_217144.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2628;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217144.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2955767 2956891 . + . ID=gene-Rv2629;Dbxref=GeneID:888588;Name=Rv2629;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2629
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2955767 2956891 . + 0 ID=cds-NP_217145.1;Parent=gene-Rv2629;Dbxref=Genbank:NP_217145.1,GeneID:888588;Name=NP_217145.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2629;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217145.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2956893 2957432 . + . ID=gene-Rv2630;Dbxref=GeneID:887426;Name=Rv2630;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2630
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2956893 2957432 . + 0 ID=cds-NP_217146.1;Parent=gene-Rv2630;Dbxref=Genbank:NP_217146.1,GeneID:887426;Name=NP_217146.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2630;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217146.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2957572 2958870 . + . ID=gene-Rv2631;Dbxref=GeneID:887431;Name=Rv2631;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2631
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2957572 2958870 . + 0 ID=cds-NP_217147.2;Parent=gene-Rv2631;Dbxref=Genbank:NP_217147.2,GeneID:887431;Name=NP_217147.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2631;product=RNA-splicing ligase RtcB;protein_id=NP_217147.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2958909 2959190 . - . ID=gene-Rv2632c;Dbxref=GeneID:887231;Name=Rv2632c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2632c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2958909 2959190 . - 0 ID=cds-NP_217148.1;Parent=gene-Rv2632c;Dbxref=Genbank:NP_217148.1,GeneID:887231;Name=NP_217148.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2632c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217148.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2959335 2959820 . - . ID=gene-Rv2633c;Dbxref=GeneID:888597;Name=Rv2633c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2633c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2959335 2959820 . - 0 ID=cds-NP_217149.1;Parent=gene-Rv2633c;Dbxref=Genbank:NP_217149.1,GeneID:888597;Name=NP_217149.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2633c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217149.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2960105 2962441 . - . ID=gene-Rv2634c;Dbxref=GeneID:888573;Name=PE_PGRS46;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS46;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2634c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2960105 2962441 . - 0 ID=cds-YP_177896.1;Parent=gene-Rv2634c;Dbxref=Genbank:YP_177896.1,GeneID:888573;Name=YP_177896.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS46;locus_tag=Rv2634c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS46;protein_id=YP_177896.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2962470 2962712 . + . ID=gene-Rv2635;Dbxref=GeneID:887813;Name=Rv2635;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2635
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2962470 2962712 . + 0 ID=cds-NP_217151.1;Parent=gene-Rv2635;Dbxref=Genbank:NP_217151.1,GeneID:887813;Name=NP_217151.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2635;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217151.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2962713 2963390 . + . ID=gene-Rv2636;Dbxref=GeneID:888196;Name=Rv2636;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2636
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2962713 2963390 . + 0 ID=cds-NP_217152.1;Parent=gene-Rv2636;Dbxref=Genbank:NP_217152.1,GeneID:888196;Name=NP_217152.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2636;product=O-phosphotransferase;protein_id=NP_217152.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2963586 2964242 . + . ID=gene-Rv2637;Dbxref=GeneID:888616;Name=dedA;gbkey=Gene;gene=dedA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2637
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2963586 2964242 . + 0 ID=cds-NP_217153.1;Parent=gene-Rv2637;Dbxref=Genbank:NP_217153.1,GeneID:888616;Name=NP_217153.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=dedA;locus_tag=Rv2637;product=transmembrane protein DedA;protein_id=NP_217153.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2964405 2964851 . + . ID=gene-Rv2638;Dbxref=GeneID:888156;Name=Rv2638;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2638
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2964405 2964851 . + 0 ID=cds-NP_217154.1;Parent=gene-Rv2638;Dbxref=Genbank:NP_217154.1,GeneID:888156;Name=NP_217154.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2638;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217154.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2965026 2965358 . - . ID=gene-Rv2639c;Dbxref=GeneID:887428;Name=Rv2639c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2639c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2965026 2965358 . - 0 ID=cds-NP_217155.1;Parent=gene-Rv2639c;Dbxref=Genbank:NP_217155.1,GeneID:887428;Name=NP_217155.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2639c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217155.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2965478 2965837 . - . ID=gene-Rv2640c;Dbxref=GeneID:888594;Name=Rv2640c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2640c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2965478 2965837 . - 0 ID=cds-NP_217156.1;Parent=gene-Rv2640c;Dbxref=Genbank:NP_217156.1,GeneID:888594;Name=NP_217156.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2640c;product=ArsR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217156.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2965939 2966397 . + . ID=gene-Rv2641;Dbxref=GeneID:888629;Name=cadI;gbkey=Gene;gene=cadI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2641
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2965939 2966397 . + 0 ID=cds-NP_217157.1;Parent=gene-Rv2641;Dbxref=Genbank:NP_217157.1,GeneID:888629;Name=NP_217157.1;experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:11425467];gbkey=CDS;gene=cadI;locus_tag=Rv2641;product=cadmium inducible protein CadI;protein_id=NP_217157.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2966533 2966913 . + . ID=gene-Rv2642;Dbxref=GeneID:887703;Name=Rv2642;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2642
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2966533 2966913 . + 0 ID=cds-NP_217158.1;Parent=gene-Rv2642;Dbxref=Genbank:NP_217158.1,GeneID:887703;Name=NP_217158.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00846;locus_tag=Rv2642;product=ArsR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217158.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2966910 2968406 . + . ID=gene-Rv2643;Dbxref=GeneID:887674;Name=arsC;gbkey=Gene;gene=arsC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2643
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2966910 2968406 . + 0 ID=cds-NP_217159.1;Parent=gene-Rv2643;Dbxref=Genbank:NP_217159.1,GeneID:887674;Name=NP_217159.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=arsC;locus_tag=Rv2643;product=arsenic-transport integral membrane protein ArsC;protein_id=NP_217159.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2968533 2968850 . - . ID=gene-Rv2644c;Dbxref=GeneID:887366;Name=Rv2644c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2644c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2968533 2968850 . - 0 ID=cds-NP_217160.1;Parent=gene-Rv2644c;Dbxref=Genbank:NP_217160.1,GeneID:887366;Name=NP_217160.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2644c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217160.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2969497 2969568 . - . ID=gene-Rvnt31;Dbxref=GeneID:2700447;Name=valT;gbkey=Gene;gene=valT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt31
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2969497 2969568 . - . ID=rna-Rvnt31;Parent=gene-Rvnt31;Dbxref=GeneID:2700447;Note=valT%2C tRNA-Val%2C anticodon cac%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(2969534..2969536));codons=51;gbkey=tRNA;gene=valT;locus_tag=Rvnt31;product=tRNA-Val
+NC_000962.3 RefSeq exon 2969497 2969568 . - . ID=exon-Rvnt31-1;Parent=rna-Rvnt31;Dbxref=GeneID:2700447;Note=valT%2C tRNA-Val%2C anticodon cac%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(2969534..2969536));codons=51;gbkey=tRNA;gene=valT;locus_tag=Rvnt31;product=tRNA-Val
+NC_000962.3 RefSeq gene 2969753 2969825 . + . ID=gene-Rvnt32;Dbxref=GeneID:2700439;Name=glyT;gbkey=Gene;gene=glyT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt32
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2969753 2969825 . + . ID=rna-Rvnt32;Parent=gene-Rvnt32;Dbxref=GeneID:2700439;Note=glyT%2C tRNA-Gly%2C anticodon gcc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:2969786..2969788);codons=61;gbkey=tRNA;gene=glyT;locus_tag=Rvnt32;product=tRNA-Gly
+NC_000962.3 RefSeq exon 2969753 2969825 . + . ID=exon-Rvnt32-1;Parent=rna-Rvnt32;Dbxref=GeneID:2700439;Note=glyT%2C tRNA-Gly%2C anticodon gcc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:2969786..2969788);codons=61;gbkey=tRNA;gene=glyT;locus_tag=Rvnt32;product=tRNA-Gly
+NC_000962.3 RefSeq gene 2969855 2969925 . + . ID=gene-Rvnt33;Dbxref=GeneID:2700440;Name=cysU;gbkey=Gene;gene=cysU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt33
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2969855 2969925 . + . ID=rna-Rvnt33;Parent=gene-Rvnt33;Dbxref=GeneID:2700440;Note=cysU%2C tRNA-Cys%2C anticodon gca%2C length %3D 71;anticodon=(pos:2969887..2969889);codons=13;gbkey=tRNA;gene=cysU;locus_tag=Rvnt33;product=tRNA-Cys
+NC_000962.3 RefSeq exon 2969855 2969925 . + . ID=exon-Rvnt33-1;Parent=rna-Rvnt33;Dbxref=GeneID:2700440;Note=cysU%2C tRNA-Cys%2C anticodon gca%2C length %3D 71;anticodon=(pos:2969887..2969889);codons=13;gbkey=tRNA;gene=cysU;locus_tag=Rvnt33;product=tRNA-Cys
+NC_000962.3 RefSeq gene 2969942 2970013 . + . ID=gene-Rvnt34;Dbxref=GeneID:2700437;Name=valU;gbkey=Gene;gene=valU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt34
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 2969942 2970013 . + . ID=rna-Rvnt34;Parent=gene-Rvnt34;Dbxref=GeneID:2700437;Note=valU%2C tRNA-Val%2C anticodon gac%2C length %3D 72;anticodon=(pos:2969974..2969976);codons=49;gbkey=tRNA;gene=valU;locus_tag=Rvnt34;product=tRNA-Val
+NC_000962.3 RefSeq exon 2969942 2970013 . + . ID=exon-Rvnt34-1;Parent=rna-Rvnt34;Dbxref=GeneID:2700437;Note=valU%2C tRNA-Val%2C anticodon gac%2C length %3D 72;anticodon=(pos:2969974..2969976);codons=49;gbkey=tRNA;gene=valU;locus_tag=Rvnt34;product=tRNA-Val
+NC_000962.3 RefSeq gene 2970123 2970554 . + . ID=gene-Rv2645;Dbxref=GeneID:887799;Name=Rv2645;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2645
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2970123 2970554 . + 0 ID=cds-NP_217161.1;Parent=gene-Rv2645;Dbxref=Genbank:NP_217161.1,GeneID:887799;Name=NP_217161.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2645;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217161.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2970551 2971549 . + . ID=gene-Rv2646;Dbxref=GeneID:887706;Name=Rv2646;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2646
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2970551 2971549 . + 0 ID=cds-NP_217162.1;Parent=gene-Rv2646;Dbxref=Genbank:NP_217162.1,GeneID:887706;Name=NP_217162.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2646;product=integrase;protein_id=NP_217162.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2971563 2972027 . + . ID=gene-Rv2647;Dbxref=GeneID:885870;Name=Rv2647;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2647
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2971563 2972027 . + 0 ID=cds-NP_217163.2;Parent=gene-Rv2647;Dbxref=Genbank:NP_217163.2,GeneID:885870;Name=NP_217163.2;Note=Rv2647%2C (MTCY441.17);gbkey=CDS;locus_tag=Rv2647;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217163.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2972106 2972108 . + . ID=id-NC_000962.3:2972106..2972108;Note=3 bp direct repeat: TCG at 5'-end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2972109 2973463 . + . ID=id-NC_000962.3:2972109..2973463;Note=IS6110-10%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-10
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2972109 2972136 . + . ID=id-NC_000962.3:2972109..2972136;Note=28 bp inverted repeat: TGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC at the left end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 2972160 2973421 . + . ID=id-NC_000962.3:2972160..2973421;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable transposase for IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2973436 2973463 . - . ID=id-NC_000962.3:2973436..2973463;Note=28 bp inverted repeat%2C TGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC%2Cat the right end of IS6110.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2973464 2973466 . + . ID=id-NC_000962.3:2973464..2973466;Note=3 bp direct repeat: TCG at 3'-end of IS6110;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2973795 2975234 . - . ID=gene-Rv2650c;Dbxref=GeneID:887478;Name=Rv2650c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2650c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2973795 2975234 . - 0 ID=cds-NP_217166.1;Parent=gene-Rv2650c;Dbxref=Genbank:NP_217166.1,GeneID:887478;Name=NP_217166.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2650c;product=prophage protein;protein_id=NP_217166.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2975242 2975775 . - . ID=gene-Rv2651c;Dbxref=GeneID:887837;Name=Rv2651c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2651c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2975242 2975775 . - 0 ID=cds-NP_217167.1;Parent=gene-Rv2651c;Dbxref=Genbank:NP_217167.1,GeneID:887837;Name=NP_217167.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2651c;product=prophage protease;protein_id=NP_217167.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2975928 2976554 . - . ID=gene-Rv2652c;Dbxref=GeneID:888577;Name=Rv2652c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2652c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2975928 2976554 . - 0 ID=cds-NP_217168.1;Parent=gene-Rv2652c;Dbxref=Genbank:NP_217168.1,GeneID:888577;Name=NP_217168.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2652c;product=prophage protein;protein_id=NP_217168.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2976586 2976909 . - . ID=gene-Rv2653c;Dbxref=GeneID:887367;Name=Rv2653c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2653c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2976586 2976909 . - 0 ID=cds-NP_217169.1;Parent=gene-Rv2653c;Dbxref=Genbank:NP_217169.1,GeneID:887367;Name=NP_217169.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2653c;product=toxin;protein_id=NP_217169.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2976989 2977234 . - . ID=gene-Rv2654c;Dbxref=GeneID:888154;Name=Rv2654c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2654c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2976989 2977234 . - 0 ID=cds-NP_217170.1;Parent=gene-Rv2654c;Dbxref=Genbank:NP_217170.1,GeneID:888154;Name=NP_217170.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2654c;product=antitoxin;protein_id=NP_217170.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2977231 2978658 . - . ID=gene-Rv2655c;Dbxref=GeneID:887388;Name=Rv2655c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2655c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2977231 2978658 . - 0 ID=cds-NP_217171.1;Parent=gene-Rv2655c;Dbxref=Genbank:NP_217171.1,GeneID:887388;Name=NP_217171.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2655c;product=prophage protein;protein_id=NP_217171.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2978660 2979052 . - . ID=gene-Rv2656c;Dbxref=GeneID:888179;Name=Rv2656c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2656c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2978660 2979052 . - 0 ID=cds-NP_217172.1;Parent=gene-Rv2656c;Dbxref=Genbank:NP_217172.1,GeneID:888179;Name=NP_217172.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2656c;product=prophage protein;protein_id=NP_217172.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2979049 2979309 . - . ID=gene-Rv2657c;Dbxref=GeneID:887399;Name=Rv2657c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2657c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2979049 2979309 . - 0 ID=cds-NP_217173.1;Parent=gene-Rv2657c;Dbxref=Genbank:NP_217173.1,GeneID:887399;Name=NP_217173.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2657c;product=prophage protein;protein_id=NP_217173.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2979326 2979688 . - . ID=gene-Rv2658c;Dbxref=GeneID:888562;Name=Rv2658c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2658c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2979326 2979688 . - 0 ID=cds-NP_217174.1;Parent=gene-Rv2658c;Dbxref=Genbank:NP_217174.1,GeneID:888562;Name=NP_217174.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2658c;product=prophage protein;protein_id=NP_217174.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2979691 2980818 . - . ID=gene-Rv2659c;Dbxref=GeneID:885098;Name=Rv2659c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2659c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2979691 2980818 . - 0 ID=cds-NP_217175.1;Parent=gene-Rv2659c;Dbxref=Genbank:NP_217175.1,GeneID:885098;Name=NP_217175.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2659c;product=prophage integrase;protein_id=NP_217175.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2980963 2981190 . - . ID=gene-Rv2660c;Dbxref=GeneID:887222;Name=Rv2660c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2660c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2980963 2981190 . - 0 ID=cds-NP_217176.1;Parent=gene-Rv2660c;Dbxref=Genbank:NP_217176.1,GeneID:887222;Name=NP_217176.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2660c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217176.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2981187 2981576 . - . ID=gene-Rv2661c;Dbxref=GeneID:888545;Name=Rv2661c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2661c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2981187 2981576 . - 0 ID=cds-NP_217177.1;Parent=gene-Rv2661c;Dbxref=Genbank:NP_217177.1,GeneID:888545;Name=NP_217177.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2661c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217177.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2981482 2981754 . + . ID=gene-Rv2662;Dbxref=GeneID:888589;Name=Rv2662;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2662
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2981482 2981754 . + 0 ID=cds-NP_217178.1;Parent=gene-Rv2662;Dbxref=Genbank:NP_217178.1,GeneID:888589;Name=NP_217178.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2662;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217178.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2981853 2982086 . + . ID=gene-Rv2663;Dbxref=GeneID:888561;Name=Rv2663;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2663
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2981853 2982086 . + 0 ID=cds-NP_217179.1;Parent=gene-Rv2663;Dbxref=Genbank:NP_217179.1,GeneID:888561;Name=NP_217179.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2663;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217179.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2982097 2982351 . + . ID=gene-Rv2664;Dbxref=GeneID:888501;Name=Rv2664;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2664
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2982097 2982351 . + 0 ID=cds-NP_217180.1;Parent=gene-Rv2664;Dbxref=Genbank:NP_217180.1,GeneID:888501;Name=NP_217180.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2664;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217180.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2982699 2982980 . + . ID=gene-Rv2665;Dbxref=GeneID:887748;Name=Rv2665;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2665
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2982699 2982980 . + 0 ID=cds-NP_217181.1;Parent=gene-Rv2665;Dbxref=Genbank:NP_217181.1,GeneID:887748;Name=NP_217181.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2665;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217181.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 2982946 2983854 . + . ID=id-NC_000962.3:2982946..2983854;Note=IS1081'-4%2C len: 909 nt. Defective Insertion sequence IS1081 element%3B truncated at 3'-end.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1081'-4
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2983019 2983033 . + . ID=id-NC_000962.3:2983019..2983033;Note=15 bp Inverted repeat at the left end of IS1081:TCGCGTGATCCTTCG%2C right end copy is missing;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2983896 2984654 . + . ID=gene-Rv2667;Dbxref=GeneID:887415;Name=clpC2;gbkey=Gene;gene=clpC2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clpX';locus_tag=Rv2667
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2983896 2984654 . + 0 ID=cds-YP_177897.1;Parent=gene-Rv2667;Dbxref=Genbank:YP_177897.1,GeneID:887415;Name=YP_177897.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=clpC2;locus_tag=Rv2667;product=ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpC;protein_id=YP_177897.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2984733 2985254 . + . ID=gene-Rv2668;Dbxref=GeneID:887993;Name=Rv2668;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2668
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2984733 2985254 . + 0 ID=cds-NP_217184.1;Parent=gene-Rv2668;Dbxref=Genbank:NP_217184.1,GeneID:887993;Name=NP_217184.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2668;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217184.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2985283 2985753 . + . ID=gene-Rv2669;Dbxref=GeneID:887699;Name=Rv2669;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2669
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2985283 2985753 . + 0 ID=cds-NP_217185.1;Parent=gene-Rv2669;Dbxref=Genbank:NP_217185.1,GeneID:887699;Name=NP_217185.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2669;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_217185.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2985731 2986840 . - . ID=gene-Rv2670c;Dbxref=GeneID:887407;Name=Rv2670c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2670c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2985731 2986840 . - 0 ID=cds-NP_217186.1;Parent=gene-Rv2670c;Dbxref=Genbank:NP_217186.1,GeneID:887407;Name=NP_217186.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2670c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217186.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2986839 2987615 . + . ID=gene-Rv2671;Dbxref=GeneID:887389;Name=ribD;gbkey=Gene;gene=ribD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ribG;locus_tag=Rv2671
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2986839 2987615 . + 0 ID=cds-NP_217187.1;Parent=gene-Rv2671;Dbxref=Genbank:NP_217187.1,GeneID:887389;Name=NP_217187.1;Note=ribD (alternate gene name: ribG)%2C bifunctional riboflavin biosynthesis protein;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=ribD;locus_tag=Rv2671;product=bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase;protein_id=NP_217187.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2987682 2989268 . + . ID=gene-Rv2672;Dbxref=GeneID:887398;Name=Rv2672;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2672
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2987682 2989268 . + 0 ID=cds-NP_217188.1;Parent=gene-Rv2672;Dbxref=Genbank:NP_217188.1,GeneID:887398;Name=NP_217188.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2672;product=protease;protein_id=NP_217188.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2989291 2990592 . + . ID=gene-Rv2673;Dbxref=GeneID:887396;Name=aftC;gbkey=Gene;gene=aftC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2673
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2989291 2990592 . + 0 ID=cds-NP_217189.1;Parent=gene-Rv2673;Dbxref=Genbank:NP_217189.1,GeneID:887396;Name=NP_217189.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:18627460];gbkey=CDS;gene=aftC;locus_tag=Rv2673;product=alpha-(1->3)-arabinofuranosyltransferase;protein_id=NP_217189.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2990706 2991116 . + . ID=gene-Rv2674;Dbxref=GeneID:886019;Name=msrB;gbkey=Gene;gene=msrB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2674
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2990706 2991116 . + 0 ID=cds-NP_217190.1;Parent=gene-Rv2674;Dbxref=Genbank:NP_217190.1,GeneID:886019;Name=NP_217190.1;Note=protein-methionine-R-oxide reductase (peptide met(O) reductase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:19040639];gbkey=CDS;gene=msrB;locus_tag=Rv2674;product=peptide methionine sulfoxide reductase MsrB;protein_id=NP_217190.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2991184 2991936 . - . ID=gene-Rv2675c;Dbxref=GeneID:887760;Name=Rv2675c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2675c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2991184 2991936 . - 0 ID=cds-NP_217191.1;Parent=gene-Rv2675c;Dbxref=Genbank:NP_217191.1,GeneID:887760;Name=NP_217191.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2675c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217191.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2991933 2992628 . - . ID=gene-Rv2676c;Dbxref=GeneID:887718;Name=Rv2676c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2676c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2991933 2992628 . - 0 ID=cds-NP_217192.1;Parent=gene-Rv2676c;Dbxref=Genbank:NP_217192.1,GeneID:887718;Name=NP_217192.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2676c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217192.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2992634 2993992 . - . ID=gene-Rv2677c;Dbxref=GeneID:887711;Name=hemY;gbkey=Gene;gene=hemY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2677c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2992634 2993992 . - 0 ID=cds-YP_177675.1;Parent=gene-Rv2677c;Dbxref=Genbank:YP_177675.1,GeneID:887711;Name=YP_177675.1;Note=protoporphyrinogen-IX oxidase (protoporphyrinogenase) (PPO);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hemY;locus_tag=Rv2677c;product=protoporphyrinogen oxidase;protein_id=YP_177675.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2993989 2995062 . - . ID=gene-Rv2678c;Dbxref=GeneID:888934;Name=hemE;gbkey=Gene;gene=hemE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2678c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2993989 2995062 . - 0 ID=cds-NP_217194.1;Parent=gene-Rv2678c;Dbxref=Genbank:NP_217194.1,GeneID:888934;Name=NP_217194.1;Note=uroporphyrinogen III decarboxylase (URO-D) (UPD);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hemE;inference=protein motif:PROSITE:PS00907;locus_tag=Rv2678c;product=uroporphyrinogen decarboxylase;protein_id=NP_217194.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2995115 2995945 . + . ID=gene-Rv2679;Dbxref=GeneID:887693;Name=echA15;gbkey=Gene;gene=echA15;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2679
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2995115 2995945 . + 0 ID=cds-NP_217195.1;Parent=gene-Rv2679;Dbxref=Genbank:NP_217195.1,GeneID:887693;Name=NP_217195.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA15;inference=protein motif:PROSITE:PS00166;locus_tag=Rv2679;product=enoyl-CoA hydratase EchA15;protein_id=NP_217195.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2996003 2996053 . + . ID=id-NC_000962.3:2996003..2996053;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2996054 2996104 . + . ID=id-NC_000962.3:2996054..2996104;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 2996105 2996737 . + . ID=gene-Rv2680;Dbxref=GeneID:887734;Name=Rv2680;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2680
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2996105 2996737 . + 0 ID=cds-NP_217196.1;Parent=gene-Rv2680;Dbxref=Genbank:NP_217196.1,GeneID:887734;Name=NP_217196.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2680;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217196.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 2996105 2996155 . + . ID=id-Rv2680;Dbxref=GeneID:887734;Note=51 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv2680
+NC_000962.3 RefSeq gene 2996739 2998055 . + . ID=gene-Rv2681;Dbxref=GeneID:887708;Name=Rv2681;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2681
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2996739 2998055 . + 0 ID=cds-NP_217197.1;Parent=gene-Rv2681;Dbxref=Genbank:NP_217197.1,GeneID:887708;Name=NP_217197.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2681;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217197.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 2998052 2999968 . - . ID=gene-Rv2682c;Dbxref=GeneID:887461;Name=dxs1;gbkey=Gene;gene=dxs1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dxs;locus_tag=Rv2682c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 2998052 2999968 . - 0 ID=cds-YP_177898.1;Parent=gene-Rv2682c;Dbxref=Genbank:YP_177898.1,GeneID:887461;Name=YP_177898.1;Note=Dxs1 (1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase) (DXP synthase) (DXPS);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=dxs1;locus_tag=Rv2682c;product=1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase;protein_id=YP_177898.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3000112 3000609 . + . ID=gene-Rv2683;Dbxref=GeneID:887207;Name=Rv2683;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2683
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3000112 3000609 . + 0 ID=cds-NP_217199.1;Parent=gene-Rv2683;Dbxref=Genbank:NP_217199.1,GeneID:887207;Name=NP_217199.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2683;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217199.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3000614 3001903 . + . ID=gene-Rv2684;Dbxref=GeneID:888366;Name=arsA;gbkey=Gene;gene=arsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2684
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3000614 3001903 . + 0 ID=cds-NP_217200.1;Parent=gene-Rv2684;Dbxref=Genbank:NP_217200.1,GeneID:888366;Name=NP_217200.1;gbkey=CDS;gene=arsA;locus_tag=Rv2684;product=arsenic-transport integral membrane protein ArsA;protein_id=NP_217200.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3001983 3003269 . + . ID=gene-Rv2685;Dbxref=GeneID:888150;Name=arsB1;gbkey=Gene;gene=arsB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=arsB;locus_tag=Rv2685
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3001983 3003269 . + 0 ID=cds-YP_177899.1;Parent=gene-Rv2685;Dbxref=Genbank:YP_177899.1,GeneID:888150;Name=YP_177899.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=arsB1;locus_tag=Rv2685;product=arsenic-transport integral membrane protein ArsB;protein_id=YP_177899.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3003280 3004038 . - . ID=gene-Rv2686c;Dbxref=GeneID:888360;Name=Rv2686c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2686c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3003280 3004038 . - 0 ID=cds-NP_217202.1;Parent=gene-Rv2686c;Dbxref=Genbank:NP_217202.1,GeneID:888360;Name=NP_217202.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15273144];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2686c;product=antibiotic ABC transporter permease;protein_id=NP_217202.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3004035 3004748 . - . ID=gene-Rv2687c;Dbxref=GeneID:888446;Name=Rv2687c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2687c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3004035 3004748 . - 0 ID=cds-NP_217203.1;Parent=gene-Rv2687c;Dbxref=Genbank:NP_217203.1,GeneID:888446;Name=NP_217203.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15273144];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00041;locus_tag=Rv2687c;product=antibiotic ABC transporter permease;protein_id=NP_217203.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3004745 3005650 . - . ID=gene-Rv2688c;Dbxref=GeneID:888463;Name=Rv2688c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2688c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3004745 3005650 . - 0 ID=cds-NP_217204.1;Parent=gene-Rv2688c;Dbxref=Genbank:NP_217204.1,GeneID:888463;Name=NP_217204.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:15273144];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2688c;product=antibiotic ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_217204.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3022461 3023432 . + . ID=gene-Rv2710;Dbxref=GeneID:888580;Name=sigB;gbkey=Gene;gene=sigB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mysB;locus_tag=Rv2710
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3023565 3024257 . + . ID=gene-Rv2711;Dbxref=GeneID:888590;Name=ideR;gbkey=Gene;gene=ideR;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dtxR;locus_tag=Rv2711
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3023565 3024257 . + 0 ID=cds-NP_217227.1;Parent=gene-Rv2711;Dbxref=Genbank:NP_217227.1,GeneID:888590;Name=NP_217227.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ideR;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv2711;product=iron-dependent repressor and activator IdeR;protein_id=NP_217227.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3024270 3025328 . - . ID=gene-Rv2712c;Dbxref=GeneID:888586;Name=Rv2712c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2712c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3025441 3026847 . + . ID=gene-Rv2713;Dbxref=GeneID:887355;Name=sthA;gbkey=Gene;gene=sthA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2713
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3027065 3028039 . + . ID=gene-Rv2714;Dbxref=GeneID:887653;Name=Rv2714;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2714
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3028098 3029123 . + . ID=gene-Rv2715;Dbxref=GeneID:887974;Name=Rv2715;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2715
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3029867 3030361 . - . ID=gene-Rv2717c;Dbxref=GeneID:887284;Name=Rv2717c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2717c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3037427 3038914 . - . ID=gene-Rv2725c;Dbxref=GeneID:888241;Name=hflX;gbkey=Gene;gene=hflX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2725c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3038931 3039800 . - . ID=gene-Rv2726c;Dbxref=GeneID:888614;Name=dapF;gbkey=Gene;gene=dapF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2726c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3038931 3039800 . - 0 ID=cds-NP_217242.1;Parent=gene-Rv2726c;Dbxref=Genbank:NP_217242.1,GeneID:888614;Name=NP_217242.1;Note=DAP epimerase;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:18269631];gbkey=CDS;gene=dapF;locus_tag=Rv2726c;product=diaminopimelate epimerase;protein_id=NP_217242.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3039825 3040769 . - . ID=gene-Rv2727c;Dbxref=GeneID:887242;Name=miaA;gbkey=Gene;gene=miaA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2727c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3040766 3041461 . - . ID=gene-Rv2728c;Dbxref=GeneID:888330;Name=Rv2728c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2728c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3040766 3041461 . - 0 ID=cds-NP_217244.1;Parent=gene-Rv2728c;Dbxref=Genbank:NP_217244.1,GeneID:888330;Name=NP_217244.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2728c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217244.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3041570 3042475 . - . ID=gene-Rv2729c;Dbxref=GeneID:888333;Name=Rv2729c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2729c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3041570 3042475 . - 0 ID=cds-NP_217245.1;Parent=gene-Rv2729c;Dbxref=Genbank:NP_217245.1,GeneID:888333;Name=NP_217245.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2729c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217245.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3042542 3043018 . + . ID=gene-Rv2730;Dbxref=GeneID:888323;Name=Rv2730;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2730
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3042542 3043018 . + 0 ID=cds-NP_217246.1;Parent=gene-Rv2730;Dbxref=Genbank:NP_217246.1,GeneID:888323;Name=NP_217246.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2730;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217246.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3043026 3044378 . + . ID=gene-Rv2731;Dbxref=GeneID:888300;Name=Rv2731;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2731
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3043026 3044378 . + 0 ID=cds-NP_217247.1;Parent=gene-Rv2731;Dbxref=Genbank:NP_217247.1,GeneID:888300;Name=NP_217247.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2731;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217247.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3044375 3044989 . - . ID=gene-Rv2732c;Dbxref=GeneID:888319;Name=Rv2732c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2732c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3044375 3044989 . - 0 ID=cds-NP_217248.1;Parent=gene-Rv2732c;Dbxref=Genbank:NP_217248.1,GeneID:888319;Name=NP_217248.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00343;locus_tag=Rv2732c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217248.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3044986 3046524 . - . ID=gene-Rv2733c;Dbxref=GeneID:888266;Name=Rv2733c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2733c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3044986 3046524 . - 0 ID=cds-NP_217249.1;Parent=gene-Rv2733c;Dbxref=Genbank:NP_217249.1,GeneID:888266;Name=NP_217249.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2733c;product=(dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase;protein_id=NP_217249.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3046821 3047675 . + . ID=gene-Rv2734;Dbxref=GeneID:888303;Name=Rv2734;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2734
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3046821 3047675 . + 0 ID=cds-NP_217250.1;Parent=gene-Rv2734;Dbxref=Genbank:NP_217250.1,GeneID:888303;Name=NP_217250.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2734;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217250.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3047560 3048552 . - . ID=gene-Rv2735c;Dbxref=GeneID:888389;Name=Rv2735c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2735c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3047560 3048552 . - 0 ID=cds-NP_217251.1;Parent=gene-Rv2735c;Dbxref=Genbank:NP_217251.1,GeneID:888389;Name=NP_217251.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2735c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217251.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3048562 3049086 . - . ID=gene-Rv2736c;Dbxref=GeneID:888393;Name=recX;gbkey=Gene;gene=recX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2736c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3048562 3049086 . - 0 ID=cds-NP_217252.1;Parent=gene-Rv2736c;Dbxref=Genbank:NP_217252.1,GeneID:888393;Name=NP_217252.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12218174];gbkey=CDS;gene=recX;locus_tag=Rv2736c;product=regulatory protein RecX;protein_id=NP_217252.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3049052 3051424 . - . ID=gene-Rv2737c;Dbxref=GeneID:888371;Name=recA;gbkey=Gene;gene=recA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2737c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3049052 3051424 . - 0 ID=cds-NP_217253.1;Parent=gene-Rv2737c;Dbxref=Genbank:NP_217253.1,GeneID:888371;Name=NP_217253.1;Note=contains: endonuclease PI-MTUI (MTU RecA intein);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:8639660];gbkey=CDS;gene=recA;inference=protein motif:PROSITE:PS00881;locus_tag=Rv2737c;product=recombinase A;protein_id=NP_217253.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3051806 3052012 . - . ID=gene-Rv2738c;Dbxref=GeneID:888368;Name=Rv2738c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2738c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3051806 3052012 . - 0 ID=cds-NP_217254.1;Parent=gene-Rv2738c;Dbxref=Genbank:NP_217254.1,GeneID:888368;Name=NP_217254.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2738c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217254.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3052023 3053189 . - . ID=gene-Rv2739c;Dbxref=GeneID:888363;Name=Rv2739c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2739c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3052023 3053189 . - 0 ID=cds-NP_217255.1;Parent=gene-Rv2739c;Dbxref=Genbank:NP_217255.1,GeneID:888363;Name=NP_217255.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2739c;product=transferase;protein_id=NP_217255.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3053233 3053682 . + . ID=gene-Rv2740;Dbxref=GeneID:888365;Name=ephG;gbkey=Gene;gene=ephG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2740
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3053233 3053682 . + 0 ID=cds-NP_217256.1;Parent=gene-Rv2740;Dbxref=Genbank:NP_217256.1,GeneID:888365;Name=NP_217256.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ephG;locus_tag=Rv2740;product=epoxide hydrolase;protein_id=NP_217256.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3053914 3055491 . + . ID=gene-Rv2741;Dbxref=GeneID:888339;Name=PE_PGRS47;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS47;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2741
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3053914 3055491 . + 0 ID=cds-YP_177902.1;Parent=gene-Rv2741;Dbxref=Genbank:YP_177902.1,GeneID:888339;Name=YP_177902.1;Note=Member of the M. tuberculosis PE family. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS47;locus_tag=Rv2741;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS47;protein_id=YP_177902.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3055515 3056348 . - . ID=gene-Rv2742c;Dbxref=GeneID:888332;Name=Rv2742c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2742c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3055515 3056348 . - 0 ID=cds-NP_217258.1;Parent=gene-Rv2742c;Dbxref=Genbank:NP_217258.1,GeneID:888332;Name=NP_217258.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2742c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217258.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3056420 3057232 . - . ID=gene-Rv2743c;Dbxref=GeneID:887779;Name=Rv2743c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2743c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3056420 3057232 . - 0 ID=cds-NP_217259.1;Parent=gene-Rv2743c;Dbxref=Genbank:NP_217259.1,GeneID:887779;Name=NP_217259.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2743c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217259.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3057251 3058063 . - . ID=gene-Rv2744c;Dbxref=GeneID:888304;Name=35kd_ag;gbkey=Gene;gene=35kd_ag;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2744c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3057251 3058063 . - 0 ID=cds-YP_177903.1;Parent=gene-Rv2744c;Dbxref=Genbank:YP_177903.1,GeneID:888304;Name=YP_177903.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;gene=35kd_ag;locus_tag=Rv2744c;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177903.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3058193 3058531 . - . ID=gene-Rv2745c;Dbxref=GeneID:888315;Name=clgR;gbkey=Gene;gene=clgR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2745c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3058193 3058531 . - 0 ID=cds-NP_217261.1;Parent=gene-Rv2745c;Dbxref=Genbank:NP_217261.1,GeneID:888315;Name=NP_217261.1;Note=ClgR%2Ctranscriptional regulatory protein%2C controls protease systems and chaperones.;gbkey=CDS;gene=clgR;locus_tag=Rv2745c;product=transcriptional regulator ClgR;protein_id=NP_217261.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3058602 3059231 . - . ID=gene-Rv2746c;Dbxref=GeneID:888375;Name=pgsA3;gbkey=Gene;gene=pgsA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2746c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3058602 3059231 . - 0 ID=cds-NP_217262.1;Parent=gene-Rv2746c;Dbxref=Genbank:NP_217262.1,GeneID:888375;Name=NP_217262.1;Note=PGP synthase PgsA (phosphatidylglycerophosphate synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:10889206];gbkey=CDS;gene=pgsA3;inference=protein motif:PROSITE:PS00379;locus_tag=Rv2746c;product=CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase;protein_id=NP_217262.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3059262 3059786 . + . ID=gene-Rv2747;Dbxref=GeneID:888407;Name=argA;gbkey=Gene;gene=argA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2747
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3071267 3071536 . - . ID=gene-Rv2760c;Dbxref=GeneID:887705;Name=vapB42;gbkey=Gene;gene=vapB42;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2760c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3071546 3072640 . - . ID=gene-Rv2761c;Dbxref=GeneID:887695;Name=hsdS;gbkey=Gene;gene=hsdS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2761c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3072637 3073056 . - . ID=gene-Rv2762c;Dbxref=GeneID:887698;Name=Rv2762c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2762c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3073680 3074471 . - . ID=gene-Rv2764c;Dbxref=GeneID:887728;Name=thyA;gbkey=Gene;gene=thyA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2764c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3076894 3078078 . - . ID=gene-Rv2768c;Dbxref=GeneID:887765;Name=PPE43;gbkey=Gene;gene=PPE43;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2768c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3078158 3078985 . - . ID=gene-Rv2769c;Dbxref=GeneID:888461;Name=PE27;gbkey=Gene;gene=PE27;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2769c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3080581 3081033 . - . ID=gene-Rv2771c;Dbxref=GeneID:888434;Name=Rv2771c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2771c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3081119 3081592 . - . ID=gene-Rv2772c;Dbxref=GeneID:888449;Name=Rv2772c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2772c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3081119 3081592 . - 0 ID=cds-NP_217288.1;Parent=gene-Rv2772c;Dbxref=Genbank:NP_217288.1,GeneID:888449;Name=NP_217288.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2772c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217288.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3081604 3082341 . - . ID=gene-Rv2773c;Dbxref=GeneID:888443;Name=dapB;gbkey=Gene;gene=dapB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2773c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3081604 3082341 . - 0 ID=cds-NP_217289.1;Parent=gene-Rv2773c;Dbxref=Genbank:NP_217289.1,GeneID:888443;Name=NP_217289.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:9098082];gbkey=CDS;gene=dapB;locus_tag=Rv2773c;product=4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase;protein_id=NP_217289.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3082352 3082756 . - . ID=gene-Rv2774c;Dbxref=GeneID:888439;Name=Rv2774c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2774c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3082352 3082756 . - 0 ID=cds-NP_217290.1;Parent=gene-Rv2774c;Dbxref=Genbank:NP_217290.1,GeneID:888439;Name=NP_217290.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2774c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217290.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3082909 3083370 . + . ID=gene-Rv2775;Dbxref=GeneID:888432;Name=Rv2775;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2775
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3082909 3083370 . + 0 ID=cds-NP_217291.3;Parent=gene-Rv2775;Dbxref=Genbank:NP_217291.3,GeneID:888432;Name=NP_217291.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2775;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_217291.3;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3093479 3093748 . - . ID=gene-Rv2785c;Dbxref=GeneID:888455;Name=rpsO;gbkey=Gene;gene=rpsO;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2785c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3095111 3096874 . + . ID=gene-Rv2787;Dbxref=GeneID:888288;Name=Rv2787;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2787
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3096959 3097645 . + . ID=gene-Rv2788;Dbxref=GeneID:888253;Name=sirR;gbkey=Gene;gene=sirR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2788
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3097706 3098938 . - . ID=gene-Rv2789c;Dbxref=GeneID:888258;Name=fadE21;gbkey=Gene;gene=fadE21;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2789c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3098964 3100169 . - . ID=gene-Rv2790c;Dbxref=GeneID:888585;Name=ltp1;gbkey=Gene;gene=ltp1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2790c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3098964 3100169 . - 0 ID=cds-NP_217306.3;Parent=gene-Rv2790c;Dbxref=Genbank:NP_217306.3,GeneID:888585;Name=NP_217306.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ltp1;inference=protein motif:PROSITE:PS00737;locus_tag=Rv2790c;product=lipid-transfer protein;protein_id=NP_217306.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3100175 3102206 . + . ID=id-NC_000962.3:3100175..3102206;Note=IS1602%2C len: 2032 nt. Insertion sequence IS1602.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1602
+NC_000962.3 RefSeq gene 3100202 3101581 . - . ID=gene-Rv2791c;Dbxref=GeneID:888281;Name=Rv2791c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2791c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3100202 3101581 . - 0 ID=cds-NP_217307.1;Parent=gene-Rv2791c;Dbxref=Genbank:NP_217307.1,GeneID:888281;Name=NP_217307.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2791c;product=transposase;protein_id=NP_217307.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3101581 3102162 . - . ID=gene-Rv2792c;Dbxref=GeneID:888274;Name=Rv2792c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2792c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3101581 3102162 . - 0 ID=cds-NP_217308.1;Parent=gene-Rv2792c;Dbxref=Genbank:NP_217308.1,GeneID:888274;Name=NP_217308.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00397;locus_tag=Rv2792c;product=resolvase;protein_id=NP_217308.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3102364 3103260 . - . ID=gene-Rv2793c;Dbxref=GeneID:888587;Name=truB;gbkey=Gene;gene=truB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2793c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3102364 3103260 . - 0 ID=cds-NP_217309.1;Parent=gene-Rv2793c;Dbxref=Genbank:NP_217309.1,GeneID:888587;Name=NP_217309.1;Note=tRNA pseudouridine 55 synthase (PSI55 synthase) (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=truB;locus_tag=Rv2793c;product=tRNA pseudouridine synthase B;protein_id=NP_217309.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3103257 3103940 . - . ID=gene-Rv2794c;Dbxref=GeneID:888226;Name=pptT;gbkey=Gene;gene=pptT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2794c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3103257 3103940 . - 0 ID=cds-NP_217310.1;Parent=gene-Rv2794c;Dbxref=Genbank:NP_217310.1,GeneID:888226;Name=NP_217310.1;Note=CoA:APO-[ACP]pantetheinephosphotransferase (CoA:APO-ACPpantetheinephosphotransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=pptT;locus_tag=Rv2794c;product=4'-phosphopantetheinyl transferase;protein_id=NP_217310.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3103937 3104911 . - . ID=gene-Rv2795c;Dbxref=GeneID:888492;Name=Rv2795c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2795c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3103937 3104911 . - 0 ID=cds-NP_217311.1;Parent=gene-Rv2795c;Dbxref=Genbank:NP_217311.1,GeneID:888492;Name=NP_217311.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2795c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217311.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3105056 3105619 . - . ID=gene-Rv2796c;Dbxref=GeneID:888915;Name=lppV;gbkey=Gene;gene=lppV;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2796c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3105056 3105619 . - 0 ID=cds-NP_217312.1;Parent=gene-Rv2796c;Dbxref=Genbank:NP_217312.1,GeneID:888915;Name=NP_217312.1;gbkey=CDS;gene=lppV;locus_tag=Rv2796c;product=lipoprotein LppV;protein_id=NP_217312.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3105619 3107307 . - . ID=gene-Rv2797c;Dbxref=GeneID:887713;Name=Rv2797c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2797c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3105619 3107307 . - 0 ID=cds-NP_217313.1;Parent=gene-Rv2797c;Dbxref=Genbank:NP_217313.1,GeneID:887713;Name=NP_217313.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv2797c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217313.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3107311 3107637 . - . ID=gene-Rv2798c;Dbxref=GeneID:888431;Name=Rv2798c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2798c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3107311 3107637 . - 0 ID=cds-NP_217314.1;Parent=gene-Rv2798c;Dbxref=Genbank:NP_217314.1,GeneID:888431;Name=NP_217314.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2798c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217314.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3107768 3108397 . + . ID=gene-Rv2799;Dbxref=GeneID:887759;Name=Rv2799;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2799
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3107768 3108397 . + 0 ID=cds-NP_217315.1;Parent=gene-Rv2799;Dbxref=Genbank:NP_217315.1,GeneID:887759;Name=NP_217315.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2799;product=membrane protein;protein_id=NP_217315.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3108416 3110065 . + . ID=gene-Rv2800;Dbxref=GeneID:888932;Name=Rv2800;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2800
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3108416 3110065 . + 0 ID=cds-NP_217316.1;Parent=gene-Rv2800;Dbxref=Genbank:NP_217316.1,GeneID:888932;Name=NP_217316.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2800;product=hydrolase;protein_id=NP_217316.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3110167 3110523 . - . ID=gene-Rv2801c;Dbxref=GeneID:888921;Name=mazF9;gbkey=Gene;gene=mazF9;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mt1;locus_tag=Rv2801c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3110167 3110523 . - 0 ID=cds-NP_217317.1;Parent=gene-Rv2801c;Dbxref=Genbank:NP_217317.1,GeneID:888921;Name=NP_217317.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2801A;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mazF9;locus_tag=Rv2801c;product=mRNA interferase MazF9;protein_id=NP_217317.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3110507 3110737 . - . ID=gene-Rv2801A;Dbxref=GeneID:14515892;Name=mazE9;gbkey=Gene;gene=mazE9;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2801A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3110507 3110737 . - 0 ID=cds-YP_007411507.1;Parent=gene-Rv2801A;Dbxref=Genbank:YP_007411507.1,GeneID:14515892;Name=YP_007411507.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2801c. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187);gbkey=CDS;gene=mazE9;locus_tag=Rv2801A;product=antitoxin MazE9;protein_id=YP_007411507.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3110780 3111823 . - . ID=gene-Rv2802c;Dbxref=GeneID:888931;Name=Rv2802c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2802c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3110780 3111823 . - 0 ID=cds-NP_217318.1;Parent=gene-Rv2802c;Dbxref=Genbank:NP_217318.1,GeneID:888931;Name=NP_217318.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2802c;product=arginine/hypothetical protein;protein_id=NP_217318.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3111822 3112289 . + . ID=gene-Rv2803;Dbxref=GeneID:888416;Name=Rv2803;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2803
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3111822 3112289 . + 0 ID=cds-YP_177678.1;Parent=gene-Rv2803;Dbxref=Genbank:YP_177678.1,GeneID:888416;Name=YP_177678.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2803;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177678.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3112465 3113094 . - . ID=gene-Rv2804c;Dbxref=GeneID:888418;Name=Rv2804c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2804c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3112465 3113094 . - 0 ID=cds-NP_217320.1;Parent=gene-Rv2804c;Dbxref=Genbank:NP_217320.1,GeneID:888418;Name=NP_217320.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2804c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217320.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3112867 3113271 . + . ID=gene-Rv2805;Dbxref=GeneID:888916;Name=Rv2805;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2805
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3112867 3113271 . + 0 ID=cds-NP_217321.1;Parent=gene-Rv2805;Dbxref=Genbank:NP_217321.1,GeneID:888916;Name=NP_217321.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2805;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217321.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3113268 3113459 . + . ID=gene-Rv2806;Dbxref=GeneID:888905;Name=Rv2806;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2806
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3113268 3113459 . + 0 ID=cds-NP_217322.1;Parent=gene-Rv2806;Dbxref=Genbank:NP_217322.1,GeneID:888905;Name=NP_217322.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2806;product=membrane protein;protein_id=NP_217322.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3113658 3114812 . + . ID=gene-Rv2807;Dbxref=GeneID:888907;Name=Rv2807;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2807
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3113658 3114812 . + 0 ID=cds-NP_217323.1;Parent=gene-Rv2807;Dbxref=Genbank:NP_217323.1,GeneID:888907;Name=NP_217323.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2807;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217323.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3115046 3115303 . + . ID=gene-Rv2808;Dbxref=GeneID:888944;Name=Rv2808;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2808
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3115046 3115303 . + 0 ID=cds-NP_217324.1;Parent=gene-Rv2808;Dbxref=Genbank:NP_217324.1,GeneID:888944;Name=NP_217324.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2808;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217324.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3115408 3115719 . + . ID=gene-Rv2809;Dbxref=GeneID:888909;Name=Rv2809;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2809
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3115408 3115719 . + 0 ID=cds-NP_217325.1;Parent=gene-Rv2809;Dbxref=Genbank:NP_217325.1,GeneID:888909;Name=NP_217325.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2809;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217325.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3115744 3116142 . - . ID=id-NC_000962.3:3115744..3116142;Note=IS1555'%2C len: 399 nt. Probable defective Insertion sequence element%2C IS1555. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1555'
+NC_000962.3 RefSeq gene 3116139 3116747 . + . ID=gene-Rv2811;Dbxref=GeneID:887740;Name=Rv2811;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2811
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3116139 3116747 . + 0 ID=cds-NP_217327.1;Parent=gene-Rv2811;Dbxref=Genbank:NP_217327.1,GeneID:887740;Name=NP_217327.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2811;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217327.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3116817 3118225 . + . ID=id-NC_000962.3:3116817..3118225;Note=IS1604%2C len: 1409 nt. Insertion sequence IS1604. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1604
+NC_000962.3 RefSeq gene 3116818 3118227 . + . ID=gene-Rv2812;Dbxref=GeneID:888942;Name=Rv2812;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2812
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3116818 3118227 . + 0 ID=cds-NP_217328.1;Parent=gene-Rv2812;Dbxref=Genbank:NP_217328.1,GeneID:888942;Name=NP_217328.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2812;product=transposase;protein_id=NP_217328.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3118224 3119036 . + . ID=gene-Rv2813;Dbxref=GeneID:888570;Name=Rv2813;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2813
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3118224 3119036 . + 0 ID=cds-NP_217329.1;Parent=gene-Rv2813;Dbxref=Genbank:NP_217329.1,GeneID:888570;Name=NP_217329.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2813;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217329.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119185 3123576 . - . ID=id-NC_000962.3:3119185..3123576;Note=4392 bp direct repeat region. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119185 3119220 . - . ID=id-NC_000962.3:3119185..3119220;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119259 3119294 . - . ID=id-NC_000962.3:3119259..3119294;Note=36 bp direct repeat%2C 35 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119335 3119370 . - . ID=id-NC_000962.3:3119335..3119370;Note=36 bp direct repeat%2C 35 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119411 3119446 . - . ID=id-NC_000962.3:3119411..3119446;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119484 3119519 . - . ID=id-NC_000962.3:3119484..3119519;Note=36 bp direct repeat%2C 35 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119556 3119591 . - . ID=id-NC_000962.3:3119556..3119591;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119627 3119662 . - . ID=id-NC_000962.3:3119627..3119662;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119701 3119736 . - . ID=id-NC_000962.3:3119701..3119736;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119777 3119812 . - . ID=id-NC_000962.3:3119777..3119812;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119848 3119883 . - . ID=id-NC_000962.3:3119848..3119883;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119921 3119956 . - . ID=id-NC_000962.3:3119921..3119956;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3119995 3120030 . - . ID=id-NC_000962.3:3119995..3120030;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120068 3120103 . - . ID=id-NC_000962.3:3120068..3120103;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120141 3120176 . - . ID=id-NC_000962.3:3120141..3120176;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120213 3120248 . - . ID=id-NC_000962.3:3120213..3120248;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120285 3120320 . - . ID=id-NC_000962.3:3120285..3120320;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120359 3120394 . - . ID=id-NC_000962.3:3120359..3120394;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120433 3120468 . - . ID=id-NC_000962.3:3120433..3120468;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3120504 3120523 . - . ID=id-NC_000962.3:3120504..3120523;Note=20 bp partial direct repeat%2C CCCCGAGAGGGGACGGAAAC%2Cof sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3120523 3121897 . - . ID=id-NC_000962.3:3120523..3121897;Note=IS6110-11%2C len: 1375 nt. Insertion sequence IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3121501 3121827 . - . ID=id-NC_000962.3:3121501..3121827;Note=similar to insertion sequence element IS6110 transposase(fragment)%3B Putative Transposase for IS6110 (fragment). Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990). This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3121882 3121897 . - . ID=id-NC_000962.3:3121882..3121897;Note=16 bp partial direct repeat%2C GTCGTCAGACCCAAAA%2C of sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3121938 3121973 . - . ID=id-NC_000962.3:3121938..3121973;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122013 3122048 . - . ID=id-NC_000962.3:3122013..3122048;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122086 3122121 . - . ID=id-NC_000962.3:3122086..3122121;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122158 3122193 . - . ID=id-NC_000962.3:3122158..3122193;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122230 3122265 . - . ID=id-NC_000962.3:3122230..3122265;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122303 3122338 . - . ID=id-NC_000962.3:3122303..3122338;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122375 3122410 . - . ID=id-NC_000962.3:3122375..3122410;Note=36 bp direct repeat%2C 32 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122436 3122471 . - . ID=id-NC_000962.3:3122436..3122471;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122513 3122548 . - . ID=id-NC_000962.3:3122513..3122548;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122585 3122620 . - . ID=id-NC_000962.3:3122585..3122620;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122661 3122696 . - . ID=id-NC_000962.3:3122661..3122696;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122738 3122773 . - . ID=id-NC_000962.3:3122738..3122773;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122811 3122846 . - . ID=id-NC_000962.3:3122811..3122846;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122882 3122917 . - . ID=id-NC_000962.3:3122882..3122917;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3122955 3122990 . - . ID=id-NC_000962.3:3122955..3122990;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123029 3123064 . - . ID=id-NC_000962.3:3123029..3123064;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123102 3123137 . - . ID=id-NC_000962.3:3123102..3123137;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123173 3123208 . - . ID=id-NC_000962.3:3123173..3123208;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123248 3123283 . - . ID=id-NC_000962.3:3123248..3123283;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123318 3123353 . - . ID=id-NC_000962.3:3123318..3123353;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123390 3123425 . - . ID=id-NC_000962.3:3123390..3123425;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123467 3123502 . - . ID=id-NC_000962.3:3123467..3123502;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3123541 3123576 . - . ID=id-NC_000962.3:3123541..3123576;Note=36 bp direct repeat%2C 36 out of 36 bp identical to sequence GTCGTCAGACCCAAAACCCCGAGAGGGGACGGAAAC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3123625 3123966 . - . ID=gene-Rv2816c;Dbxref=GeneID:888520;Name=Rv2816c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2816c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3123625 3123966 . - 0 ID=cds-NP_217332.1;Parent=gene-Rv2816c;Dbxref=Genbank:NP_217332.1,GeneID:888520;Name=NP_217332.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2816c;product=CRISPR-associated endoribonuclease Cas2;protein_id=NP_217332.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3123967 3124983 . - . ID=gene-Rv2817c;Dbxref=GeneID:888506;Name=Rv2817c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2817c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3123967 3124983 . - 0 ID=cds-NP_217333.1;Parent=gene-Rv2817c;Dbxref=Genbank:NP_217333.1,GeneID:888506;Name=NP_217333.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2817c;product=CRISPR-associated endonuclease Cas1;protein_id=NP_217333.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3124996 3126144 . - . ID=gene-Rv2818c;Dbxref=GeneID:888510;Name=Rv2818c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2818c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3124996 3126144 . - 0 ID=cds-NP_217334.1;Parent=gene-Rv2818c;Dbxref=Genbank:NP_217334.1,GeneID:888510;Name=NP_217334.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2818c;product=CRISPR-associated protein Csm6;protein_id=NP_217334.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3126240 3127367 . - . ID=gene-Rv2819c;Dbxref=GeneID:888514;Name=Rv2819c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2819c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3126240 3127367 . - 0 ID=cds-NP_217335.1;Parent=gene-Rv2819c;Dbxref=Genbank:NP_217335.1,GeneID:888514;Name=NP_217335.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2819c;product=CRISPR type III-associated RAMP protein Csm5;protein_id=NP_217335.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3127364 3128272 . - . ID=gene-Rv2820c;Dbxref=GeneID:888908;Name=Rv2820c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2820c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3128253 3128963 . - . ID=gene-Rv2821c;Dbxref=GeneID:887741;Name=Rv2821c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2821c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3128253 3128963 . - 0 ID=cds-NP_217337.1;Parent=gene-Rv2821c;Dbxref=Genbank:NP_217337.1,GeneID:887741;Name=NP_217337.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2821c;product=CRISPR type III-associated RAMP protein Csm3;protein_id=NP_217337.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3128973 3129347 . - . ID=gene-Rv2822c;Dbxref=GeneID:887778;Name=Rv2822c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2822c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3128973 3129347 . - 0 ID=cds-NP_217338.1;Parent=gene-Rv2822c;Dbxref=Genbank:NP_217338.1,GeneID:887778;Name=NP_217338.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2822c;product=CRISPR type III-associated protein Csm2;protein_id=NP_217338.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3129344 3131773 . - . ID=gene-Rv2823c;Dbxref=GeneID:887735;Name=Rv2823c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2823c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3129344 3131773 . - 0 ID=cds-NP_217339.1;Parent=gene-Rv2823c;Dbxref=Genbank:NP_217339.1,GeneID:887735;Name=NP_217339.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2823c;product=CRISPR-associated protein Cas10/Csm1;protein_id=NP_217339.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3131770 3132714 . - . ID=gene-Rv2824c;Dbxref=GeneID:888945;Name=Rv2824c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2824c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3131770 3132714 . - 0 ID=cds-NP_217340.1;Parent=gene-Rv2824c;Dbxref=Genbank:NP_217340.1,GeneID:888945;Name=NP_217340.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2824c;product=CRISPR-associated endoribonuclease Cas6;protein_id=NP_217340.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3132892 3133539 . - . ID=gene-Rv2825c;Dbxref=GeneID:887769;Name=Rv2825c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2825c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3132892 3133539 . - 0 ID=cds-NP_217341.1;Parent=gene-Rv2825c;Dbxref=Genbank:NP_217341.1,GeneID:887769;Name=NP_217341.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2825c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217341.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3133709 3134593 . - . ID=gene-Rv2826c;Dbxref=GeneID:887742;Name=Rv2826c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2826c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3134596 3135483 . - . ID=gene-Rv2827c;Dbxref=GeneID:887707;Name=Rv2827c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2827c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3134596 3135483 . - 0 ID=cds-NP_217343.1;Parent=gene-Rv2827c;Dbxref=Genbank:NP_217343.1,GeneID:887707;Name=NP_217343.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2827c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217343.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3135788 3136333 . - . ID=gene-Rv2828c;Dbxref=GeneID:887749;Name=Rv2828c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2828c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3135788 3136333 . - 0 ID=cds-NP_217344.1;Parent=gene-Rv2828c;Dbxref=Genbank:NP_217344.1,GeneID:887749;Name=NP_217344.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2828c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217344.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3136330 3136599 . - . ID=gene-Rv2828A;Dbxref=GeneID:14515869;Name=Rv2828A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2828A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3136330 3136599 . - 0 ID=cds-YP_007411535.1;Parent=gene-Rv2828A;Dbxref=Genbank:YP_007411535.1,GeneID:14515869;Name=YP_007411535.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2828A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007411535.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3136620 3137012 . - . ID=gene-Rv2829c;Dbxref=GeneID:887730;Name=vapC22;gbkey=Gene;gene=vapC22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2829c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3136620 3137012 . - 0 ID=cds-NP_217345.1;Parent=gene-Rv2829c;Dbxref=Genbank:NP_217345.1,GeneID:887730;Name=NP_217345.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2830c%2C contains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=vapC22;locus_tag=Rv2829c;product=ribonuclease VapC22;protein_id=NP_217345.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3137009 3137224 . - . ID=gene-Rv2830c;Dbxref=GeneID:888537;Name=vapB22;gbkey=Gene;gene=vapB22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2830c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3137009 3137224 . - 0 ID=cds-NP_217346.1;Parent=gene-Rv2830c;Dbxref=Genbank:NP_217346.1,GeneID:888537;Name=NP_217346.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2829c;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB22;locus_tag=Rv2830c;product=antitoxin VapB22;protein_id=NP_217346.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3137271 3138020 . + . ID=gene-Rv2831;Dbxref=GeneID:888519;Name=echA16;gbkey=Gene;gene=echA16;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2831
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3137271 3138020 . + 0 ID=cds-NP_217347.1;Parent=gene-Rv2831;Dbxref=Genbank:NP_217347.1,GeneID:888519;Name=NP_217347.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA16;locus_tag=Rv2831;product=enoyl-CoA hydratase EchA16;protein_id=NP_217347.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3138099 3139181 . - . ID=gene-Rv2832c;Dbxref=GeneID:888554;Name=ugpC;gbkey=Gene;gene=ugpC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2832c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3138099 3139181 . - 0 ID=cds-NP_217348.1;Parent=gene-Rv2832c;Dbxref=Genbank:NP_217348.1,GeneID:888554;Name=NP_217348.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=ugpC;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv2832c;product=sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein UgpC;protein_id=NP_217348.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3139174 3140484 . - . ID=gene-Rv2833c;Dbxref=GeneID:888199;Name=ugpB;gbkey=Gene;gene=ugpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2833c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3139174 3140484 . - 0 ID=cds-NP_217349.1;Parent=gene-Rv2833c;Dbxref=Genbank:NP_217349.1,GeneID:888199;Name=NP_217349.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ugpB;locus_tag=Rv2833c;product=sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter substrate-binding lipoprotein UgpB;protein_id=NP_217349.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3140487 3141314 . - . ID=gene-Rv2834c;Dbxref=GeneID:888534;Name=ugpE;gbkey=Gene;gene=ugpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2834c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3140487 3141314 . - 0 ID=cds-NP_217350.1;Parent=gene-Rv2834c;Dbxref=Genbank:NP_217350.1,GeneID:888534;Name=NP_217350.1;gbkey=CDS;gene=ugpE;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv2834c;product=sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter permease UgpE;protein_id=NP_217350.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3141311 3142222 . - . ID=gene-Rv2835c;Dbxref=GeneID:888569;Name=ugpA;gbkey=Gene;gene=ugpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2835c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3141311 3142222 . - 0 ID=cds-NP_217351.1;Parent=gene-Rv2835c;Dbxref=Genbank:NP_217351.1,GeneID:888569;Name=NP_217351.1;gbkey=CDS;gene=ugpA;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv2835c;product=sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter permease UgpA;protein_id=NP_217351.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3142309 3143628 . - . ID=gene-Rv2836c;Dbxref=GeneID:888547;Name=dinF;gbkey=Gene;gene=dinF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2836c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3142309 3143628 . - 0 ID=cds-NP_217352.1;Parent=gene-Rv2836c;Dbxref=Genbank:NP_217352.1,GeneID:888547;Name=NP_217352.1;gbkey=CDS;gene=dinF;inference=protein motif:PROSITE:PS00213;locus_tag=Rv2836c;product=DNA-damage-inducible protein DinF;protein_id=NP_217352.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3143635 3144645 . - . ID=gene-Rv2837c;Dbxref=GeneID:888920;Name=Rv2837c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2837c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3143635 3144645 . - 0 ID=cds-NP_217353.1;Parent=gene-Rv2837c;Dbxref=Genbank:NP_217353.1,GeneID:888920;Name=NP_217353.1;Note=degrades RNAs of less than 2 bases and dephosphorylates 3?-phosphoadenosine 5?-phosphate;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis%2C protein purification and characterization[PMID:22114320];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2837c;product=bifunctional oligoribonuclease/PAP phosphatase NrnA;protein_id=NP_217353.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3150713 3151201 . + . ID=gene-Rv2844;Dbxref=GeneID:888536;Name=Rv2844;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2844
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3151202 3152950 . - . ID=gene-Rv2845c;Dbxref=GeneID:888539;Name=proS;gbkey=Gene;gene=proS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2845c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3153039 3154631 . - . ID=gene-Rv2846c;Dbxref=GeneID:888575;Name=efpA;gbkey=Gene;gene=efpA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2846c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3154654 3155871 . - . ID=gene-Rv2847c;Dbxref=GeneID:887481;Name=cysG;gbkey=Gene;gene=cysG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cysG2;locus_tag=Rv2847c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3154654 3155871 . - 0 ID=cds-NP_215025.2;Parent=gene-Rv2847c;Dbxref=Genbank:NP_215025.2,GeneID:887481;Name=NP_215025.2;Note=Possible cysG urogen III methylase) (SUMT) (uroporphyrinogen III methylase) (UROM)/precorrin-2 oxidase/ferrochelatase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cysG;locus_tag=Rv2847c;product=multifunctional uroporphyrin-III C-methyltransferase/precorrin-2 oxidase/ferrochelatase;protein_id=NP_215025.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3155874 3155927 . - . ID=id-NC_000962.3:3155874..3155927;Note=54 bp direct repeat 4%2CGGTGGCGACCCGCGGCGCCCGGTCCCCGCGCTTGCGATCGCCACTAGGCTTGGC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3155928 3155981 . - . ID=id-NC_000962.3:3155928..3155981;Note=54 bp direct repeat 3%2CGGTGGCGACCCGCGGCGCCCGGTCCCCGCGCTTGCGATCGCCACTGGCCCTGAT;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3155982 3156035 . - . ID=id-NC_000962.3:3155982..3156035;Note=54 bp direct repeat 2%2CGGTGGCGACCCGCGGCGCCCGGTCCCCGCGCTTGCGATCGCCACTGGCCCTGAT;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3156036 3156089 . - . ID=id-NC_000962.3:3156036..3156089;Note=54 bp direct repeat 1%2CGGTGGCGACCCGCGGCGCCCGGTCCCCGCGCTTGCGATCGCCACTGGCCCTGAT;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3156148 3157521 . - . ID=gene-Rv2848c;Dbxref=GeneID:888499;Name=cobB;gbkey=Gene;gene=cobB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2848c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3156148 3157521 . - 0 ID=cds-NP_217364.1;Parent=gene-Rv2848c;Dbxref=Genbank:NP_217364.1,GeneID:888499;Name=NP_217364.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cobB;locus_tag=Rv2848c;product=cobyrinic acid A%2CC-diamide synthase;protein_id=NP_217364.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3157521 3158144 . - . ID=gene-Rv2849c;Dbxref=GeneID:888236;Name=cobO;gbkey=Gene;gene=cobO;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cobA;locus_tag=Rv2849c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3158165 3160054 . - . ID=gene-Rv2850c;Dbxref=GeneID:887364;Name=Rv2850c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2850c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3160051 3160521 . - . ID=gene-Rv2851c;Dbxref=GeneID:887664;Name=Rv2851c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2851c
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+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3160522 3160583 . - . ID=id-NC_000962.3:3160522..3160583;Note=62 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3160580 3162061 . - . ID=gene-Rv2852c;Dbxref=GeneID:888544;Name=mqo;gbkey=Gene;gene=mqo;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2852c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3160580 3162061 . - 0 ID=cds-NP_217368.1;Parent=gene-Rv2852c;Dbxref=Genbank:NP_217368.1,GeneID:888544;Name=NP_217368.1;Note=Mqo (malate dehydrogenase [acceptor]);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mqo;locus_tag=Rv2852c;product=malate:quinone oxidoreductase;protein_id=NP_217368.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3162268 3164115 . + . ID=gene-Rv2853;Dbxref=GeneID:888171;Name=PE_PGRS48;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS48;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2853
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3162268 3164115 . + 0 ID=cds-YP_177909.1;Parent=gene-Rv2853;Dbxref=Genbank:YP_177909.1,GeneID:888171;Name=YP_177909.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS48;locus_tag=Rv2853;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS48;protein_id=YP_177909.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3164152 3165192 . + . ID=gene-Rv2854;Dbxref=GeneID:888542;Name=Rv2854;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2854
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3164152 3165192 . + 0 ID=cds-NP_217370.1;Parent=gene-Rv2854;Dbxref=Genbank:NP_217370.1,GeneID:888542;Name=NP_217370.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2854;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217370.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3165205 3166584 . + . ID=gene-Rv2855;Dbxref=GeneID:887773;Name=mtr;gbkey=Gene;gene=mtr;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gorA;locus_tag=Rv2855
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3165205 3166584 . + 0 ID=cds-YP_177910.1;Parent=gene-Rv2855;Dbxref=Genbank:YP_177910.1,GeneID:887773;Name=YP_177910.1;Note=NADPH-dependent mycothiol reductase;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:10512639];gbkey=CDS;gene=mtr;locus_tag=Rv2855;product=mycothione reductase;protein_id=YP_177910.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3166684 3167802 . + . ID=gene-Rv2856;Dbxref=GeneID:888643;Name=nicT;gbkey=Gene;gene=nicT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2856
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3166684 3167802 . + 0 ID=cds-NP_217372.1;Parent=gene-Rv2856;Dbxref=Genbank:NP_217372.1,GeneID:888643;Name=NP_217372.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=nicT;inference=protein motif:PROSITE:PS00190;locus_tag=Rv2856;product=nickel-transport integral membrane protein NicT;protein_id=NP_217372.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3168583 3169359 . - . ID=gene-Rv2857c;Dbxref=GeneID:888560;Name=Rv2857c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2857c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3168583 3169359 . - 0 ID=cds-NP_217373.1;Parent=gene-Rv2857c;Dbxref=Genbank:NP_217373.1,GeneID:888560;Name=NP_217373.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2857c;product=3-oxoacyl-ACP reductase;protein_id=NP_217373.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3169356 3170723 . - . ID=gene-Rv2858c;Dbxref=GeneID:888636;Name=aldC;gbkey=Gene;gene=aldC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2858c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3169356 3170723 . - 0 ID=cds-NP_217374.1;Parent=gene-Rv2858c;Dbxref=Genbank:NP_217374.1,GeneID:888636;Name=NP_217374.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=aldC;inference=protein motif:PROSITE:PS00687;locus_tag=Rv2858c;product=aldehyde dehydrogenase AldC;protein_id=NP_217374.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3170720 3171646 . - . ID=gene-Rv2859c;Dbxref=GeneID:887495;Name=Rv2859c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2859c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3170720 3171646 . - 0 ID=cds-NP_217375.1;Parent=gene-Rv2859c;Dbxref=Genbank:NP_217375.1,GeneID:887495;Name=NP_217375.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2859c;product=glutamine amidotransferase;protein_id=NP_217375.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3171468 3171518 . - . ID=id-Rv2859c;Dbxref=GeneID:887495;Note=51 bp direct repeat 1%2CGTCCGATGGTGGCGACCCGCTGCGCCCGGCTTCGCCGCGCTTGCGATCGCC;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv2859c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3171522 3171572 . - . ID=id-Rv2859c-2;Dbxref=GeneID:887495;Note=51 bp direct repeat 2%2CGTCCGATGGTGGCGACCCGCTGCGCCCGGCTTCGCCGCGCTTGCGATCGCC;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv2859c
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3171576 3171616 . - . ID=id-Rv2859c-3;Dbxref=GeneID:887495;Note=(41 bp) part of 51 bp direct repeat 3%2CGGCGACCCGCTGCGCCCGGCTTCGCCGCGCTTGCGATCGCC;gbkey=repeat_region;locus_tag=Rv2859c
+NC_000962.3 RefSeq gene 3171627 3173000 . - . ID=gene-Rv2860c;Dbxref=GeneID:887420;Name=glnA4;gbkey=Gene;gene=glnA4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2860c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3171627 3173000 . - 0 ID=cds-NP_217376.1;Parent=gene-Rv2860c;Dbxref=Genbank:NP_217376.1,GeneID:887420;Name=NP_217376.1;Note=glutamine synthase (GS-II);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=glnA4;locus_tag=Rv2860c;product=glutamine synthetase;protein_id=NP_217376.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3173160 3174017 . - . ID=gene-Rv2861c;Dbxref=GeneID:888596;Name=mapB;gbkey=Gene;gene=mapB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=map;locus_tag=Rv2861c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3173160 3174017 . - 0 ID=cds-YP_177911.1;Parent=gene-Rv2861c;Dbxref=Genbank:YP_177911.1,GeneID:888596;Name=YP_177911.1;Note=map (peptidase M);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19688379];gbkey=CDS;gene=mapB;locus_tag=Rv2861c;product=methionine aminopeptidase;protein_id=YP_177911.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3174059 3174643 . - . ID=gene-Rv2862c;Dbxref=GeneID:887423;Name=Rv2862c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2862c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3174059 3174643 . - 0 ID=cds-NP_217378.1;Parent=gene-Rv2862c;Dbxref=Genbank:NP_217378.1,GeneID:887423;Name=NP_217378.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2862c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217378.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3174747 3174995 . + . ID=gene-Rv2862A;Dbxref=GeneID:14515870;Name=vapB23;gbkey=Gene;gene=vapB23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2862A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3174747 3174995 . + 0 ID=cds-YP_007411570.1;Parent=gene-Rv2862A;Dbxref=Genbank:YP_007411570.1,GeneID:14515870;Name=YP_007411570.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2863;gbkey=CDS;gene=vapB23;locus_tag=Rv2862A;product=antitoxin VapB23;protein_id=YP_007411570.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3174992 3175372 . + . ID=gene-Rv2863;Dbxref=GeneID:888195;Name=vapC23;gbkey=Gene;gene=vapC23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2863
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3174992 3175372 . + 0 ID=cds-NP_217379.1;Parent=gene-Rv2863;Dbxref=Genbank:NP_217379.1,GeneID:888195;Name=NP_217379.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2862A%2Ccontains PIN domain;gbkey=CDS;gene=vapC23;locus_tag=Rv2863;product=ribonuclease VapC23;protein_id=NP_217379.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3175454 3177265 . - . ID=gene-Rv2864c;Dbxref=GeneID:888496;Name=Rv2864c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2864c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3175454 3177265 . - 0 ID=cds-NP_217380.1;Parent=gene-Rv2864c;Dbxref=Genbank:NP_217380.1,GeneID:888496;Name=NP_217380.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2864c;product=penicillin-binding lipoprotein;protein_id=NP_217380.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3177537 3177818 . + . ID=gene-Rv2865;Dbxref=GeneID:887458;Name=relF;gbkey=Gene;gene=relF;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=relB2;locus_tag=Rv2865
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3177537 3177818 . + 0 ID=cds-NP_217381.1;Parent=gene-Rv2865;Dbxref=Genbank:NP_217381.1,GeneID:887458;Name=NP_217381.1;Note=RelF%2C antitoxin%2Cpart of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2866;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:19114484];gbkey=CDS;gene=relF;locus_tag=Rv2865;product=antitoxin RelF;protein_id=NP_217381.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3177822 3178085 . + . ID=gene-Rv2866;Dbxref=GeneID:887450;Name=relG;gbkey=Gene;gene=relG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=relE2;locus_tag=Rv2866
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3177822 3178085 . + 0 ID=cds-NP_217382.1;Parent=gene-Rv2866;Dbxref=Genbank:NP_217382.1,GeneID:887450;Name=NP_217382.1;Note=RelG%2C toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2865;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:19114484];gbkey=CDS;gene=relG;locus_tag=Rv2866;product=toxin RelG;protein_id=NP_217382.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3178458 3179312 . - . ID=gene-Rv2867c;Dbxref=GeneID:887475;Name=Rv2867c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2867c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3178458 3179312 . - 0 ID=cds-NP_217383.1;Parent=gene-Rv2867c;Dbxref=Genbank:NP_217383.1,GeneID:887475;Name=NP_217383.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2867c;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_217383.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3179368 3180531 . - . ID=gene-Rv2868c;Dbxref=GeneID:887463;Name=gcpE;gbkey=Gene;gene=gcpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2868c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3179368 3180531 . - 0 ID=cds-NP_217384.1;Parent=gene-Rv2868c;Dbxref=Genbank:NP_217384.1,GeneID:887463;Name=NP_217384.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gcpE;locus_tag=Rv2868c;product=4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase (flavodoxin);protein_id=NP_217384.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3180548 3181762 . - . ID=gene-Rv2869c;Dbxref=GeneID:887449;Name=rip;gbkey=Gene;gene=rip;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2869c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3180548 3181762 . - 0 ID=cds-NP_217385.1;Parent=gene-Rv2869c;Dbxref=Genbank:NP_217385.1,GeneID:887449;Name=NP_217385.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:19496931];gbkey=CDS;gene=rip;locus_tag=Rv2869c;product=zinc metalloprotease;protein_id=NP_217385.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3181770 3183011 . - . ID=gene-Rv2870c;Dbxref=GeneID:887800;Name=dxr;gbkey=Gene;gene=dxr;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ispC;locus_tag=Rv2870c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3181770 3183011 . - 0 ID=cds-NP_217386.2;Parent=gene-Rv2870c;Dbxref=Genbank:NP_217386.2,GeneID:887800;Name=NP_217386.2;Note=Dxr (DXP reductoisomerase) (1-deoxyxylulose-5-phosphate reductoisomerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=dxr;inference=protein motif:PROSITE:PS00133;locus_tag=Rv2870c;product=1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase;protein_id=NP_217386.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3181794 3181836 . + . ID=id-NC_000962.3:3181794..3181836;Note=(43 bp) part of 51 bp direct repeat%2CGTGTCGACCCGCTGCGCCCGGCTTCGCCGTGCTTGCGATCGCC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3183138 3183395 . + . ID=gene-Rv2871;Dbxref=GeneID:887468;Name=vapB43;gbkey=Gene;gene=vapB43;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2871
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3183138 3183395 . + 0 ID=cds-NP_217387.1;Parent=gene-Rv2871;Dbxref=Genbank:NP_217387.1,GeneID:887468;Name=NP_217387.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2872. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapB43;locus_tag=Rv2871;product=antitoxin VapB43;protein_id=NP_217387.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3183382 3183825 . + . ID=gene-Rv2872;Dbxref=GeneID:887361;Name=vapC43;gbkey=Gene;gene=vapC43;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2872
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3183382 3183825 . + 0 ID=cds-NP_217388.1;Parent=gene-Rv2872;Dbxref=Genbank:NP_217388.1,GeneID:887361;Name=NP_217388.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv2871%2Ccontains PIN domain. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC43;locus_tag=Rv2872;product=ribonuclease VapC43;protein_id=NP_217388.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3183905 3184567 . + . ID=gene-Rv2873;Dbxref=GeneID:887155;Name=mpt83;gbkey=Gene;gene=mpt83;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mpb83;locus_tag=Rv2873
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3183905 3184567 . + 0 ID=cds-NP_217389.1;Parent=gene-Rv2873;Dbxref=Genbank:NP_217389.1,GeneID:887155;Name=NP_217389.1;Note=Mpt83 (lipoprotein P23);experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:8633206];gbkey=CDS;gene=mpt83;locus_tag=Rv2873;product=cell surface lipoprotein;protein_id=NP_217389.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3184847 3186934 . + . ID=gene-Rv2874;Dbxref=GeneID:888162;Name=dipZ;gbkey=Gene;gene=dipZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2874
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3184847 3186934 . + 0 ID=cds-NP_217390.1;Parent=gene-Rv2874;Dbxref=Genbank:NP_217390.1,GeneID:888162;Name=NP_217390.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=dipZ;locus_tag=Rv2874;product=integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein DipZ;protein_id=NP_217390.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3187030 3187611 . + . ID=gene-Rv2875;Dbxref=GeneID:887724;Name=mpt70;gbkey=Gene;gene=mpt70;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mpb70;locus_tag=Rv2875
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3187030 3187611 . + 0 ID=cds-NP_217391.1;Parent=gene-Rv2875;Dbxref=Genbank:NP_217391.1,GeneID:887724;Name=NP_217391.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mpt70;locus_tag=Rv2875;product=major secreted immunogenic protein Mpt70;protein_id=NP_217391.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3187663 3187977 . + . ID=gene-Rv2876;Dbxref=GeneID:887823;Name=Rv2876;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2876
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3187663 3187977 . + 0 ID=cds-NP_217392.1;Parent=gene-Rv2876;Dbxref=Genbank:NP_217392.1,GeneID:887823;Name=NP_217392.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2876;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217392.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3188008 3188871 . - . ID=gene-Rv2877c;Dbxref=GeneID:887196;Name=Rv2877c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=merT;locus_tag=Rv2877c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3188008 3188871 . - 0 ID=cds-YP_177912.1;Parent=gene-Rv2877c;Dbxref=Genbank:YP_177912.1,GeneID:887196;Name=YP_177912.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv2877c;product=integral membrane protein;protein_id=YP_177912.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3188876 3189397 . - . ID=gene-Rv2878c;Dbxref=GeneID:887184;Name=mpt53;gbkey=Gene;gene=mpt53;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dsbE;locus_tag=Rv2878c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3188876 3189397 . - 0 ID=cds-NP_217394.1;Parent=gene-Rv2878c;Dbxref=Genbank:NP_217394.1,GeneID:887184;Name=NP_217394.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:10089161];gbkey=CDS;gene=mpt53;locus_tag=Rv2878c;product=soluble secreted antigen Mpt53;protein_id=NP_217394.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3190701 3191621 . - . ID=gene-Rv2881c;Dbxref=GeneID:888910;Name=cdsA;gbkey=Gene;gene=cdsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2881c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3190701 3191621 . - 0 ID=cds-NP_217397.1;Parent=gene-Rv2881c;Dbxref=Genbank:NP_217397.1,GeneID:888910;Name=NP_217397.1;Note=CDP-diglyceride synthetase (CDP-diglyceride pyrophosphorylase) (CDP-diacylglycerol synthase) (CDS) (CTP:phosphatidate cytidylyltransferase) (CDP-DAG synthase) (CDP-DG synthetase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cdsA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2881c;product=phosphatidate cytidylyltransferase;protein_id=NP_217397.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3191644 3192201 . - . ID=gene-Rv2882c;Dbxref=GeneID:887464;Name=frr;gbkey=Gene;gene=frr;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2882c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3191644 3192201 . - 0 ID=cds-NP_217398.1;Parent=gene-Rv2882c;Dbxref=Genbank:NP_217398.1,GeneID:887464;Name=NP_217398.1;Note=ribosome releasing factor (RRF);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=frr;locus_tag=Rv2882c;product=ribosome recycling factor;protein_id=NP_217398.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3192202 3192254 . - . ID=id-NC_000962.3:3192202..3192254;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3192255 3192307 . - . ID=id-NC_000962.3:3192255..3192307;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3192308 3192360 . - . ID=id-NC_000962.3:3192308..3192360;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3192373 3193158 . - . ID=gene-Rv2883c;Dbxref=GeneID:887709;Name=pyrH;gbkey=Gene;gene=pyrH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2883c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3192373 3193158 . - 0 ID=cds-NP_217399.1;Parent=gene-Rv2883c;Dbxref=Genbank:NP_217399.1,GeneID:887709;Name=NP_217399.1;Note=UK (uridine monophosphate kinase) (UMP kinase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pyrH;locus_tag=Rv2883c;product=uridylate kinase;protein_id=NP_217399.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3193393 3194151 . + . ID=gene-Rv2884;Dbxref=GeneID:887443;Name=Rv2884;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2884
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3193393 3194151 . + 0 ID=cds-NP_217400.1;Parent=gene-Rv2884;Dbxref=Genbank:NP_217400.1,GeneID:887443;Name=NP_217400.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2884;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_217400.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3194166 3196432 . - . ID=id-NC_000962.3:3194166..3196432;Note=IS1539%2C len: 2267 nt. Insertion sequence IS1539.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1539
+NC_000962.3 RefSeq gene 3194166 3195548 . - . ID=gene-Rv2885c;Dbxref=GeneID:887173;Name=Rv2885c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2885c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3194166 3195548 . - 0 ID=cds-NP_217401.1;Parent=gene-Rv2885c;Dbxref=Genbank:NP_217401.1,GeneID:887173;Name=NP_217401.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2885c;product=transposase;protein_id=NP_217401.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3195545 3196432 . - . ID=gene-Rv2886c;Dbxref=GeneID:887424;Name=Rv2886c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2886c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3195545 3196432 . - 0 ID=cds-NP_217402.1;Parent=gene-Rv2886c;Dbxref=Genbank:NP_217402.1,GeneID:887424;Name=NP_217402.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00213;locus_tag=Rv2886c;product=resolvase;protein_id=NP_217402.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3196431 3196850 . + . ID=gene-Rv2887;Dbxref=GeneID:888563;Name=Rv2887;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2887
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3196431 3196850 . + 0 ID=cds-NP_217403.1;Parent=gene-Rv2887;Dbxref=Genbank:NP_217403.1,GeneID:888563;Name=NP_217403.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2887;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_217403.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3196864 3198285 . - . ID=gene-Rv2888c;Dbxref=GeneID:887401;Name=amiC;gbkey=Gene;gene=amiC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2888c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3196864 3198285 . - 0 ID=cds-NP_217404.1;Parent=gene-Rv2888c;Dbxref=Genbank:NP_217404.1,GeneID:887401;Name=NP_217404.1;Note=aminohydrolase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=amiC;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2888c;product=amidase AmiC;protein_id=NP_217404.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3198292 3199107 . - . ID=gene-Rv2889c;Dbxref=GeneID:888187;Name=tsf;gbkey=Gene;gene=tsf;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2889c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3198292 3199107 . - 0 ID=cds-NP_217405.1;Parent=gene-Rv2889c;Dbxref=Genbank:NP_217405.1,GeneID:888187;Name=NP_217405.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=tsf;inference=protein motif:PROSITE:PS01127;locus_tag=Rv2889c;product=elongation factor EF-Ts;protein_id=NP_217405.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3199119 3199982 . - . ID=gene-Rv2890c;Dbxref=GeneID:887187;Name=rpsB;gbkey=Gene;gene=rpsB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2890c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3214628 3215572 . + . ID=gene-Rv2905;Dbxref=GeneID:887421;Name=lppW;gbkey=Gene;gene=lppW;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2905
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3216361 3216891 . - . ID=gene-Rv2907c;Dbxref=GeneID:887188;Name=rimM;gbkey=Gene;gene=rimM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2907c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3217155 3217643 . - . ID=gene-Rv2909c;Dbxref=GeneID:888631;Name=rpsP;gbkey=Gene;gene=rpsP;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2909c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3217155 3217643 . - 0 ID=cds-NP_217425.1;Parent=gene-Rv2909c;Dbxref=Genbank:NP_217425.1,GeneID:888631;Name=NP_217425.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsP;locus_tag=Rv2909c;product=30S ribosomal protein S16;protein_id=NP_217425.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3217827 3218270 . - . ID=gene-Rv2910c;Dbxref=GeneID:887387;Name=Rv2910c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2910c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3217827 3218270 . - 0 ID=cds-NP_217426.1;Parent=gene-Rv2910c;Dbxref=Genbank:NP_217426.1,GeneID:887387;Name=NP_217426.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2910c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217426.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3218339 3219214 . + . ID=gene-Rv2911;Dbxref=GeneID:887189;Name=dacB2;gbkey=Gene;gene=dacB2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dacB;locus_tag=Rv2911
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 3219863 3221698 . - 0 ID=cds-NP_217429.1;Parent=gene-Rv2913c;Dbxref=Genbank:NP_217429.1,GeneID:887809;Name=NP_217429.1;Note=D-amino acid hydrolase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2913c;product=D-amino acid aminohydrolase;protein_id=NP_217429.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3221767 3223524 . - . ID=gene-Rv2914c;Dbxref=GeneID:887642;Name=pknI;gbkey=Gene;gene=pknI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2914c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3221767 3223524 . - 0 ID=cds-NP_217430.1;Parent=gene-Rv2914c;Dbxref=Genbank:NP_217430.1,GeneID:887642;Name=NP_217430.1;Note=protein kinase I (STPK I) (phosphorylase B kinase kinase) (hydroxyalkyl-protein kinase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pknI;locus_tag=Rv2914c;product=serine/threonine-protein kinase PknI;protein_id=NP_217430.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3223568 3224680 . - . ID=gene-Rv2915c;Dbxref=GeneID:888083;Name=Rv2915c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2915c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3223568 3224680 . - 0 ID=cds-NP_217431.1;Parent=gene-Rv2915c;Dbxref=Genbank:NP_217431.1,GeneID:888083;Name=NP_217431.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2915c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217431.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3224708 3226285 . - . ID=gene-Rv2916c;Dbxref=GeneID:888242;Name=ffh;gbkey=Gene;gene=ffh;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2916c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3224708 3226285 . - 0 ID=cds-NP_217432.1;Parent=gene-Rv2916c;Dbxref=Genbank:NP_217432.1,GeneID:888242;Name=NP_217432.1;Note=signal recognition particle (SRP) protein (ala-%2C gly-%2Cleu-rich protein);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ffh;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2916c;product=signal recognition particle protein;protein_id=NP_217432.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3226363 3228243 . + . ID=gene-Rv2917;Dbxref=GeneID:887758;Name=Rv2917;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2917
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3226363 3228243 . + 0 ID=cds-NP_217433.1;Parent=gene-Rv2917;Dbxref=Genbank:NP_217433.1,GeneID:887758;Name=NP_217433.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2917;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217433.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3238086 3238499 . - . ID=gene-Rv2923c;Dbxref=GeneID:887687;Name=Rv2923c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2923c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3239829 3240551 . - . ID=gene-Rv2925c;Dbxref=GeneID:887873;Name=rnc;gbkey=Gene;gene=rnc;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2925c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3240548 3241171 . - . ID=gene-Rv2926c;Dbxref=GeneID:887487;Name=Rv2926c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2926c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3241222 3241959 . - . ID=gene-Rv2927c;Dbxref=GeneID:887317;Name=Rv2927c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2927c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3241222 3241959 . - 0 ID=cds-NP_217443.1;Parent=gene-Rv2927c;Dbxref=Genbank:NP_217443.1,GeneID:887317;Name=NP_217443.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2927c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217443.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3242198 3242983 . + . ID=gene-Rv2928;Dbxref=GeneID:887446;Name=tesA;gbkey=Gene;gene=tesA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2928
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3242970 3243281 . + . ID=gene-Rv2929;Dbxref=GeneID:888112;Name=Rv2929;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2929
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3242970 3243281 . + 0 ID=cds-NP_217445.1;Parent=gene-Rv2929;Dbxref=Genbank:NP_217445.1,GeneID:888112;Name=NP_217445.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2929;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217445.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3243697 3245448 . + . ID=gene-Rv2930;Dbxref=GeneID:887603;Name=fadD26;gbkey=Gene;gene=fadD26;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2930
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3243697 3245448 . + 0 ID=cds-NP_217446.2;Parent=gene-Rv2930;Dbxref=Genbank:NP_217446.2,GeneID:887603;Name=NP_217446.2;Note=fatty-acid-AMP synthetase (fatty-acid-AMP synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=fadD26;locus_tag=Rv2930;product=fatty-acid--CoA ligase FadD26;protein_id=NP_217446.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3245445 3251075 . + . ID=gene-Rv2931;Dbxref=GeneID:888183;Name=ppsA;gbkey=Gene;gene=ppsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2931
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3245445 3251075 . + 0 ID=cds-NP_217447.1;Parent=gene-Rv2931;Dbxref=Genbank:NP_217447.1,GeneID:888183;Name=NP_217447.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ppsA;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2931;product=phthiocerol synthesis polyketide synthase type I PpsA;protein_id=NP_217447.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3251072 3255688 . + . ID=gene-Rv2932;Dbxref=GeneID:888023;Name=ppsB;gbkey=Gene;gene=ppsB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2932
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3251072 3255688 . + 0 ID=cds-NP_217448.1;Parent=gene-Rv2932;Dbxref=Genbank:NP_217448.1,GeneID:888023;Name=NP_217448.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=ppsB;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2932;product=phthiocerol synthesis polyketide synthase type I PpsB;protein_id=NP_217448.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3255685 3262251 . + . ID=gene-Rv2933;Dbxref=GeneID:887686;Name=ppsC;gbkey=Gene;gene=ppsC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2933
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3255685 3262251 . + 0 ID=cds-NP_217449.1;Parent=gene-Rv2933;Dbxref=Genbank:NP_217449.1,GeneID:887686;Name=NP_217449.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ppsC;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2933;product=phthiocerol synthesis polyketide synthase type I PpsC;protein_id=NP_217449.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3262248 3267731 . + . ID=gene-Rv2934;Dbxref=GeneID:887172;Name=ppsD;gbkey=Gene;gene=ppsD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2934
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3262248 3267731 . + 0 ID=cds-NP_217450.1;Parent=gene-Rv2934;Dbxref=Genbank:NP_217450.1,GeneID:887172;Name=NP_217450.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=ppsD;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2934;product=phthiocerol synthesis polyketide synthase type I PpsD;protein_id=NP_217450.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3267737 3272203 . + . ID=gene-Rv2935;Dbxref=GeneID:888210;Name=ppsE;gbkey=Gene;gene=ppsE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2935
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3267737 3272203 . + 0 ID=cds-NP_217451.1;Parent=gene-Rv2935;Dbxref=Genbank:NP_217451.1,GeneID:888210;Name=NP_217451.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ppsE;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2935;product=phthiocerol synthesis polyketide synthase type I PpsE;protein_id=NP_217451.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3272214 3273209 . + . ID=gene-Rv2936;Dbxref=GeneID:888168;Name=drrA;gbkey=Gene;gene=drrA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2936
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3272214 3273209 . + 0 ID=cds-NP_217452.1;Parent=gene-Rv2936;Dbxref=Genbank:NP_217452.1,GeneID:888168;Name=NP_217452.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:12057006];gbkey=CDS;gene=drrA;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv2936;product=daunorubicin ABC transporter ATP-binding protein DrrA;protein_id=NP_217452.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3273206 3274075 . + . ID=gene-Rv2937;Dbxref=GeneID:887968;Name=drrB;gbkey=Gene;gene=drrB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2937
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3273206 3274075 . + 0 ID=cds-NP_217453.1;Parent=gene-Rv2937;Dbxref=Genbank:NP_217453.1,GeneID:887968;Name=NP_217453.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:12057006];gbkey=CDS;gene=drrB;locus_tag=Rv2937;product=daunorubicin ABC transporter permease DrrB;protein_id=NP_217453.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3274072 3274902 . + . ID=gene-Rv2938;Dbxref=GeneID:888491;Name=drrC;gbkey=Gene;gene=drrC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2938
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3274072 3274902 . + 0 ID=cds-NP_217454.1;Parent=gene-Rv2938;Dbxref=Genbank:NP_217454.1,GeneID:888491;Name=NP_217454.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=drrC;locus_tag=Rv2938;product=daunorubicin ABC transporter permease DrrC;protein_id=NP_217454.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3274949 3276217 . + . ID=gene-Rv2939;Dbxref=GeneID:887327;Name=papA5;gbkey=Gene;gene=papA5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2939
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3274949 3276217 . + 0 ID=cds-NP_217455.1;Parent=gene-Rv2939;Dbxref=Genbank:NP_217455.1,GeneID:887327;Name=NP_217455.1;Note=polyketide synthase associated protein PapA;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=papA5;locus_tag=Rv2939;product=phthiocerol/phthiodiolone dimycocerosyl transferase;protein_id=NP_217455.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3276380 3282715 . - . ID=gene-Rv2940c;Dbxref=GeneID:887982;Name=mas;gbkey=Gene;gene=mas;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2940c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3276380 3282715 . - 0 ID=cds-NP_217456.1;Parent=gene-Rv2940c;Dbxref=Genbank:NP_217456.1,GeneID:887982;Name=NP_217456.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mas;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv2940c;product=multifunctional mycocerosic acid synthase;protein_id=NP_217456.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3283335 3285077 . + . ID=gene-Rv2941;Dbxref=GeneID:887454;Name=fadD28;gbkey=Gene;gene=fadD28;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=acoas;locus_tag=Rv2941
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3283335 3285077 . + 0 ID=cds-NP_217457.1;Parent=gene-Rv2941;Dbxref=Genbank:NP_217457.1,GeneID:887454;Name=NP_217457.1;Note=fatty-acid-AMP synthetase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadD28;inference=protein motif:PROSITE:PS00018;locus_tag=Rv2941;product=long-chain-fatty-acid--AMP ligase FadD28;protein_id=NP_217457.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3285070 3287832 . + . ID=gene-Rv2942;Dbxref=GeneID:887548;Name=mmpL7;gbkey=Gene;gene=mmpL7;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2942
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3285070 3287832 . + 0 ID=cds-NP_217458.1;Parent=gene-Rv2942;Dbxref=Genbank:NP_217458.1,GeneID:887548;Name=NP_217458.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mmpL7;inference=protein motif:PROSITE:PS00639;locus_tag=Rv2942;product=transmembrane transport protein MmpL7;protein_id=NP_217458.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3288463 3290504 . + . ID=id-NC_000962.3:3288463..3290504;Note=IS1533%2C len: 2042 nt. Minimum region corresponding to Insertion sequence IS1533.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1533
+NC_000962.3 RefSeq gene 3288464 3289705 . + . ID=gene-Rv2943;Dbxref=GeneID:887834;Name=Rv2943;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2943
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3288464 3289705 . + 0 ID=cds-NP_217459.1;Parent=gene-Rv2943;Dbxref=Genbank:NP_217459.1,GeneID:887834;Name=NP_217459.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2943;product=insertion sequence element IS1533 transposase;protein_id=NP_217459.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3289705 3290235 . + . ID=gene-Rv2943A;Dbxref=GeneID:3205061;Name=Rv2943A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2943A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3289705 3290235 . + 0 ID=cds-YP_177680.1;Parent=gene-Rv2943A;Dbxref=Genbank:YP_177680.1,GeneID:3205061;Name=YP_177680.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2943A;product=transposase;protein_id=YP_177680.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3289790 3290506 . + . ID=gene-Rv2944;Dbxref=GeneID:887636;Name=Rv2944;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2944
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3289790 3290506 . + 0 ID=cds-NP_217460.1;Parent=gene-Rv2944;Dbxref=Genbank:NP_217460.1,GeneID:887636;Name=NP_217460.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv2944;product=insertion sequence element IS1533 transposase;protein_id=NP_217460.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3305279 3306535 . + . ID=gene-Rv2953;Dbxref=GeneID:887772;Name=Rv2953;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2953
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3306666 3307391 . - . ID=gene-Rv2954c;Dbxref=GeneID:887214;Name=Rv2954c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2954c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3307580 3308545 . - . ID=gene-Rv2955c;Dbxref=GeneID:887318;Name=Rv2955c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2955c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3308668 3309399 . + . ID=gene-Rv2956;Dbxref=GeneID:887486;Name=Rv2956;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2956
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3309470 3310297 . + . ID=gene-Rv2957;Dbxref=GeneID:887258;Name=Rv2957;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2957
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3309470 3310297 . + 0 ID=cds-NP_217473.1;Parent=gene-Rv2957;Dbxref=Genbank:NP_217473.1,GeneID:887258;Name=NP_217473.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15292272];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2957;product=PGL/p-HBAD biosynthesis glycosyltransferase;protein_id=NP_217473.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3312101 3312838 . - . ID=gene-Rv2959c;Dbxref=GeneID:887862;Name=Rv2959c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2959c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3312101 3312838 . - 0 ID=cds-NP_217475.1;Parent=gene-Rv2959c;Dbxref=Genbank:NP_217475.1,GeneID:887862;Name=NP_217475.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15292265];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2959c;product=rhamnosyl O-methyltransferase;protein_id=NP_217475.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3312953 3313201 . - . ID=gene-Rv2960c;Dbxref=GeneID:887224;Name=Rv2960c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2960c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3313283 3313672 . + . ID=gene-Rv2961;Dbxref=GeneID:887316;Name=Rv2961;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2961
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3313283 3313672 . + 0 ID=cds-NP_217477.1;Parent=gene-Rv2961;Dbxref=Genbank:NP_217477.1,GeneID:887316;Name=NP_217477.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2961;product=transposase;protein_id=NP_217477.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3313773 3315122 . - . ID=gene-Rv2962c;Dbxref=GeneID:887892;Name=Rv2962c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2962c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3313773 3315122 . - 0 ID=cds-NP_217478.1;Parent=gene-Rv2962c;Dbxref=Genbank:NP_217478.1,GeneID:887892;Name=NP_217478.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15292272];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2962c;product=PGL/p-HBAD biosynthesis rhamnosyltransferase;protein_id=NP_217478.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3315236 3316456 . + . ID=gene-Rv2963;Dbxref=GeneID:887263;Name=Rv2963;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2963
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3315236 3316456 . + 0 ID=cds-NP_217479.1;Parent=gene-Rv2963;Dbxref=Genbank:NP_217479.1,GeneID:887263;Name=NP_217479.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2963;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217479.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3316529 3317461 . + . ID=gene-Rv2964;Dbxref=GeneID:887338;Name=purU;gbkey=Gene;gene=purU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2964
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3316529 3317461 . + 0 ID=cds-NP_217480.1;Parent=gene-Rv2964;Dbxref=Genbank:NP_217480.1,GeneID:887338;Name=NP_217480.1;Note=formyl-FH(4) hydrolase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=purU;locus_tag=Rv2964;product=formyltetrahydrofolate deformylase;protein_id=NP_217480.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3318330 3318815 . - . ID=gene-Rv2965c;Dbxref=GeneID:888423;Name=kdtB;gbkey=Gene;gene=kdtB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=coaD;locus_tag=Rv2965c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3318330 3318815 . - 0 ID=cds-NP_217481.1;Parent=gene-Rv2965c;Dbxref=Genbank:NP_217481.1,GeneID:888423;Name=NP_217481.1;Note=pantetheine-phosphate adenylyltransferase (PPAT) (dephospho-CoA pyrophosphorylase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=kdtB;locus_tag=Rv2965c;product=phosphopantetheine adenylyltransferase;protein_id=NP_217481.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3318835 3318889 . - . ID=id-NC_000962.3:3318835..3318889;Note=55 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3318901 3319467 . - . ID=gene-Rv2966c;Dbxref=GeneID:888469;Name=Rv2966c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2966c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3318901 3319467 . - 0 ID=cds-NP_217482.1;Parent=gene-Rv2966c;Dbxref=Genbank:NP_217482.1,GeneID:888469;Name=NP_217482.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00092;locus_tag=Rv2966c;product=methyltransferase;protein_id=NP_217482.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3319468 3319568 . - . ID=id-NC_000962.3:3319468..3319568;Note=101 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3319569 3319666 . - . ID=id-NC_000962.3:3319569..3319666;Note=98 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3319663 3323046 . - . ID=gene-Rv2967c;Dbxref=GeneID:887299;Name=pca;gbkey=Gene;gene=pca;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2967c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3319663 3323046 . - 0 ID=cds-NP_217483.1;Parent=gene-Rv2967c;Dbxref=Genbank:NP_217483.1,GeneID:887299;Name=NP_217483.1;Note=Pca (pyruvic carboxylase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pca;inference=protein motif:PROSITE:PS00867;locus_tag=Rv2967c;product=pyruvate carboxylase;protein_id=NP_217483.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3323071 3323703 . - . ID=gene-Rv2968c;Dbxref=GeneID:888476;Name=Rv2968c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2968c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3323071 3323703 . - 0 ID=cds-NP_217484.1;Parent=gene-Rv2968c;Dbxref=Genbank:NP_217484.1,GeneID:888476;Name=NP_217484.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2968c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217484.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3323709 3324476 . - . ID=gene-Rv2969c;Dbxref=GeneID:888481;Name=Rv2969c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2969c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3323709 3324476 . - 0 ID=cds-NP_217485.1;Parent=gene-Rv2969c;Dbxref=Genbank:NP_217485.1,GeneID:888481;Name=NP_217485.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2969c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217485.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3324573 3325703 . - . ID=gene-Rv2970c;Dbxref=GeneID:887194;Name=lipN;gbkey=Gene;gene=lipN;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2970c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3324573 3325703 . - 0 ID=cds-NP_217486.1;Parent=gene-Rv2970c;Dbxref=Genbank:NP_217486.1,GeneID:887194;Name=NP_217486.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lipN;locus_tag=Rv2970c;product=lipase/esterase LipN;protein_id=NP_217486.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3325934 3326104 . + . ID=gene-Rv2970A;Dbxref=GeneID:3205038;Name=Rv2970A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2970A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3325934 3326104 . + 0 ID=cds-YP_177681.1;Parent=gene-Rv2970A;Dbxref=Genbank:YP_177681.1,GeneID:3205038;Name=YP_177681.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2970A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177681.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3332787 3333788 . - . ID=gene-Rv2977c;Dbxref=GeneID:888342;Name=thiL;gbkey=Gene;gene=thiL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2977c
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+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3333768 3335792 . - . ID=id-NC_000962.3:3333768..3335792;Note=IS1538%2C len: 2025 nt. Similar to other Insertion sequence elements in M. tuberculosis e.g. IS1535%2C IS1536%2CIS1537%2C %26 IS1539 (EM_NEW:MTCY274 Z74024 Mycobacterium tuberculosis cosmid Y274);gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1538
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3333768 3333773 . + . ID=id-NC_000962.3:3333768..3333773;Note=6 bp inverted repeat at the left end of IS1538%2CTGAGTG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3333785 3335164 . - . ID=gene-Rv2978c;Dbxref=GeneID:887390;Name=Rv2978c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2978c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3335164 3335748 . - . ID=gene-Rv2979c;Dbxref=GeneID:888325;Name=Rv2979c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2979c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3335164 3335748 . - 0 ID=cds-NP_217495.1;Parent=gene-Rv2979c;Dbxref=Genbank:NP_217495.1,GeneID:888325;Name=NP_217495.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00397;locus_tag=Rv2979c;product=resolvase;protein_id=NP_217495.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3335787 3335792 . - . ID=id-NC_000962.3:3335787..3335792;Note=6 bp inverted repeat at the right end of IS1538%2CTGAGTG.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3335960 3336505 . + . ID=gene-Rv2980;Dbxref=GeneID:887506;Name=Rv2980;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2980
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3335960 3336505 . + 0 ID=cds-NP_217496.1;Parent=gene-Rv2980;Dbxref=Genbank:NP_217496.1,GeneID:887506;Name=NP_217496.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2980;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217496.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3336796 3337917 . - . ID=gene-Rv2981c;Dbxref=GeneID:888415;Name=ddlA;gbkey=Gene;gene=ddlA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ddl;locus_tag=Rv2981c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3336796 3337917 . - 0 ID=cds-NP_217497.1;Parent=gene-Rv2981c;Dbxref=Genbank:NP_217497.1,GeneID:888415;Name=NP_217497.1;Note=D-alanylalanine synthetase (D-ala-D-ala ligase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=ddlA;inference=protein motif:PROSITE:PS00843;locus_tag=Rv2981c;product=D-alanine--D-alanine ligase;protein_id=NP_217497.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3337995 3338999 . - . ID=gene-Rv2982c;Dbxref=GeneID:887864;Name=gpdA2;gbkey=Gene;gene=gpdA2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gpsA;locus_tag=Rv2982c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3337995 3338999 . - 0 ID=cds-NP_217498.1;Parent=gene-Rv2982c;Dbxref=Genbank:NP_217498.1,GeneID:887864;Name=NP_217498.1;Note=[NAD(P)+] GpdA2 (NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gpdA2;locus_tag=Rv2982c;product=glycerol-3-phosphate dehydrogenase;protein_id=NP_217498.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3339118 3339762 . + . ID=gene-Rv2983;Dbxref=GeneID:888161;Name=Rv2983;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2983
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3339118 3339762 . + 0 ID=cds-NP_217499.1;Parent=gene-Rv2983;Dbxref=Genbank:NP_217499.1,GeneID:888161;Name=NP_217499.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2983;product=2-phospho-L-lactate guanylyltransferase;protein_id=NP_217499.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3339854 3342082 . + . ID=gene-Rv2984;Dbxref=GeneID:887482;Name=ppk1;gbkey=Gene;gene=ppk1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2984
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3339854 3342082 . + 0 ID=cds-NP_217500.1;Parent=gene-Rv2984;Dbxref=Genbank:NP_217500.1,GeneID:887482;Name=NP_217500.1;Note=PPK (polyphosphoric acid kinase) (ATP-polyphosphate phosphotransferase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ppk1;locus_tag=Rv2984;product=polyphosphate kinase;protein_id=NP_217500.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3342165 3343118 . + . ID=gene-Rv2985;Dbxref=GeneID:888165;Name=mutT1;gbkey=Gene;gene=mutT1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2985
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3342165 3343118 . + 0 ID=cds-NP_217501.1;Parent=gene-Rv2985;Dbxref=Genbank:NP_217501.1,GeneID:888165;Name=NP_217501.1;Note=hydrolase MutT1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16585780];gbkey=CDS;gene=mutT1;inference=protein motif:PROSITE:PS00893;locus_tag=Rv2985;product=8-oxo-dGTP diphosphatase;protein_id=NP_217501.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3343176 3343820 . - . ID=gene-Rv2986c;Dbxref=GeneID:888166;Name=hupB;gbkey=Gene;gene=hupB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=hlp,hup,lbp21;locus_tag=Rv2986c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3343176 3343820 . - 0 ID=cds-NP_217502.1;Parent=gene-Rv2986c;Dbxref=Genbank:NP_217502.1,GeneID:888166;Name=NP_217502.1;Note=homolog HupB (histone-like protein) (HLP) (21-kDa laminin-2-binding protein);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hupB;inference=protein motif:PROSITE:PS00045;locus_tag=Rv2986c;product=DNA-binding protein HU;protein_id=NP_217502.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3344033 3344629 . - . ID=gene-Rv2987c;Dbxref=GeneID:888225;Name=leuD;gbkey=Gene;gene=leuD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2987c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3344033 3344629 . - 0 ID=cds-NP_217503.1;Parent=gene-Rv2987c;Dbxref=Genbank:NP_217503.1,GeneID:888225;Name=NP_217503.1;Note=isopropylmalate isomerase (alpha-IPM isomerase) (IPMI);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=leuD;locus_tag=Rv2987c;product=3-isopropylmalate dehydratase small subunit;protein_id=NP_217503.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3344654 3346075 . - . ID=gene-Rv2988c;Dbxref=GeneID:887875;Name=leuC;gbkey=Gene;gene=leuC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2988c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3344654 3346075 . - 0 ID=cds-NP_217504.1;Parent=gene-Rv2988c;Dbxref=Genbank:NP_217504.1,GeneID:887875;Name=NP_217504.1;Note=isopropylmalate isomerase (alpha-IPM isomerase) (IPMI);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=leuC;inference=protein motif:PROSITE:PS00450;locus_tag=Rv2988c;product=3-isopropylmalate dehydratase large subunit;protein_id=NP_217504.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3346147 3346848 . + . ID=gene-Rv2989;Dbxref=GeneID:887723;Name=Rv2989;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2989
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3346147 3346848 . + 0 ID=cds-NP_217505.1;Parent=gene-Rv2989;Dbxref=Genbank:NP_217505.1,GeneID:887723;Name=NP_217505.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2989;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_217505.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3346859 3347719 . - . ID=gene-Rv2990c;Dbxref=GeneID:887176;Name=Rv2990c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2990c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3346859 3347719 . - 0 ID=cds-NP_217506.1;Parent=gene-Rv2990c;Dbxref=Genbank:NP_217506.1,GeneID:887176;Name=NP_217506.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv2990c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217506.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3347982 3348473 . + . ID=gene-Rv2991;Dbxref=GeneID:887792;Name=Rv2991;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2991
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3347982 3348473 . + 0 ID=cds-NP_217507.1;Parent=gene-Rv2991;Dbxref=Genbank:NP_217507.1,GeneID:887792;Name=NP_217507.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2991;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217507.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3348547 3348619 . - . ID=gene-Rvnt35;Dbxref=GeneID:2700433;Name=gluU;gbkey=Gene;gene=gluU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt35
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 3348547 3348619 . - . ID=rna-Rvnt35;Parent=gene-Rvnt35;Dbxref=GeneID:2700433;Note=gluU%2C tRNA-Glu%3B anticodon ctc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(3348583..3348585));codons=59;gbkey=tRNA;gene=gluU;locus_tag=Rvnt35;product=tRNA-Glu
+NC_000962.3 RefSeq exon 3348547 3348619 . - . ID=exon-Rvnt35-1;Parent=rna-Rvnt35;Dbxref=GeneID:2700433;Note=gluU%2C tRNA-Glu%3B anticodon ctc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(3348583..3348585));codons=59;gbkey=tRNA;gene=gluU;locus_tag=Rvnt35;product=tRNA-Glu
+NC_000962.3 RefSeq gene 3348659 3348730 . - . ID=gene-Rvnt36;Dbxref=GeneID:2700442;Name=glnU;gbkey=Gene;gene=glnU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt36
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 3348659 3348730 . - . ID=rna-Rvnt36;Parent=gene-Rvnt36;Dbxref=GeneID:2700442;Note=glnU%2C tRNA-Gln%3B anticodon ctg%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(3348695..3348697));codons=27;gbkey=tRNA;gene=glnU;locus_tag=Rvnt36;product=tRNA-Gln
+NC_000962.3 RefSeq exon 3348659 3348730 . - . ID=exon-Rvnt36-1;Parent=rna-Rvnt36;Dbxref=GeneID:2700442;Note=glnU%2C tRNA-Gln%3B anticodon ctg%2C length %3D 72;anticodon=(pos:complement(3348695..3348697));codons=27;gbkey=tRNA;gene=glnU;locus_tag=Rvnt36;product=tRNA-Gln
+NC_000962.3 RefSeq gene 3348805 3350277 . - . ID=gene-Rv2992c;Dbxref=GeneID:887850;Name=gltS;gbkey=Gene;gene=gltS;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gltX;locus_tag=Rv2992c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3348805 3350277 . - 0 ID=cds-YP_177915.1;Parent=gene-Rv2992c;Dbxref=Genbank:YP_177915.1,GeneID:887850;Name=YP_177915.1;Note=Glutamyl-tRNA synthetase GltS (glutamyl-tRNA synthase) (GLURS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gltS;locus_tag=Rv2992c;product=glutamate--tRNA ligase;protein_id=YP_177915.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3350274 3350993 . - . ID=gene-Rv2993c;Dbxref=GeneID:887867;Name=Rv2993c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2993c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3350274 3350993 . - 0 ID=cds-NP_217509.3;Parent=gene-Rv2993c;Dbxref=Genbank:NP_217509.3,GeneID:887867;Name=NP_217509.3;Note=HHDD isomerase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv2993c;product=2-hydroxyhepta-2%2C4-diene-1%2C7-dioate isomerase;protein_id=NP_217509.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3351269 3352606 . + . ID=gene-Rv2994;Dbxref=GeneID:888200;Name=Rv2994;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv2994
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3359585 3360586 . - . ID=gene-Rv3001c;Dbxref=GeneID:887483;Name=ilvC;gbkey=Gene;gene=ilvC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3001c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3360624 3361130 . - . ID=gene-Rv3002c;Dbxref=GeneID:887226;Name=ilvN;gbkey=Gene;gene=ilvN;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ilvH;locus_tag=Rv3002c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3360624 3361130 . - 0 ID=cds-NP_217518.1;Parent=gene-Rv3002c;Dbxref=Genbank:NP_217518.1,GeneID:887226;Name=NP_217518.1;Note=acetohydroxy-acid synthase (AHAS) (ALS);experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:20884690];gbkey=CDS;gene=ilvN;locus_tag=Rv3002c;product=acetolactate synthase small subunit;protein_id=NP_217518.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3361130 3362986 . - . ID=gene-Rv3003c;Dbxref=GeneID:887286;Name=ilvB1;gbkey=Gene;gene=ilvB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ilvB;locus_tag=Rv3003c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3361130 3362986 . - 0 ID=cds-YP_177917.1;Parent=gene-Rv3003c;Dbxref=Genbank:YP_177917.1,GeneID:887286;Name=YP_177917.1;Note=acetohydroxy-acid synthase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ilvB1;inference=protein motif:PROSITE:PS00187;locus_tag=Rv3003c;product=acetolactate synthase large subunit IlvB;protein_id=YP_177917.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3363348 3363686 . + . ID=gene-Rv3004;Dbxref=GeneID:887891;Name=cfp6;gbkey=Gene;gene=cfp6;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3004
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3363693 3364532 . - . ID=gene-Rv3005c;Dbxref=GeneID:887305;Name=Rv3005c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3005c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3363693 3364532 . - 0 ID=cds-NP_217521.1;Parent=gene-Rv3005c;Dbxref=Genbank:NP_217521.1,GeneID:887305;Name=NP_217521.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3005c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217521.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3364709 3365830 . + . ID=gene-Rv3006;Dbxref=GeneID:887308;Name=lppZ;gbkey=Gene;gene=lppZ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3006
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3364709 3365830 . + 0 ID=cds-NP_217522.1;Parent=gene-Rv3006;Dbxref=Genbank:NP_217522.1,GeneID:887308;Name=NP_217522.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lppZ;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3006;product=lipoprotein LppZ;protein_id=NP_217522.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3365836 3366450 . - . ID=gene-Rv3007c;Dbxref=GeneID:888938;Name=Rv3007c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3007c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3365836 3366450 . - 0 ID=cds-NP_217523.1;Parent=gene-Rv3007c;Dbxref=Genbank:NP_217523.1,GeneID:888938;Name=NP_217523.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3007c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_217523.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3366644 3367267 . + . ID=gene-Rv3008;Dbxref=GeneID:888530;Name=Rv3008;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3008
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3366644 3367267 . + 0 ID=cds-NP_217524.1;Parent=gene-Rv3008;Dbxref=Genbank:NP_217524.1,GeneID:888530;Name=NP_217524.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3008;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217524.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3367264 3368793 . - . ID=gene-Rv3009c;Dbxref=GeneID:888919;Name=gatB;gbkey=Gene;gene=gatB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3009c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3367264 3368793 . - 0 ID=cds-NP_217525.1;Parent=gene-Rv3009c;Dbxref=Genbank:NP_217525.1,GeneID:888919;Name=NP_217525.1;Note=Glu-ADT subunit B;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gatB;inference=protein motif:PROSITE:PS00041;locus_tag=Rv3009c;product=aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B;protein_id=NP_217525.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3368823 3369854 . - . ID=gene-Rv3010c;Dbxref=GeneID:888509;Name=pfkA;gbkey=Gene;gene=pfkA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3010c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3368823 3369854 . - 0 ID=cds-NP_217526.1;Parent=gene-Rv3010c;Dbxref=Genbank:NP_217526.1,GeneID:888509;Name=NP_217526.1;Note=phosphohexokinase (phosphofructokinase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pfkA;inference=protein motif:PROSITE:PS00433;locus_tag=Rv3010c;product=6-phosphofructokinase;protein_id=NP_217526.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3369950 3371434 . - . ID=gene-Rv3011c;Dbxref=GeneID:887262;Name=gatA;gbkey=Gene;gene=gatA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3011c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3369950 3371434 . - 0 ID=cds-NP_217527.2;Parent=gene-Rv3011c;Dbxref=Genbank:NP_217527.2,GeneID:887262;Name=NP_217527.2;Note=Glu-ADT subunit A;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gatA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3011c;product=glutamyl-tRNA(GLN) amidotransferase subunit A;protein_id=NP_217527.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3371431 3371730 . - . ID=gene-Rv3012c;Dbxref=GeneID:887335;Name=gatC;gbkey=Gene;gene=gatC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3012c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3371431 3371730 . - 0 ID=cds-NP_217528.1;Parent=gene-Rv3012c;Dbxref=Genbank:NP_217528.1,GeneID:887335;Name=NP_217528.1;Note=Glu-ADT subunit C;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=gatC;locus_tag=Rv3012c;product=glutamyl-tRNA(GLN) amidotransferase subunit C;protein_id=NP_217528.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3371815 3372471 . + . ID=gene-Rv3013;Dbxref=GeneID:888642;Name=Rv3013;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3013
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3371815 3372471 . + 0 ID=cds-NP_217529.1;Parent=gene-Rv3013;Dbxref=Genbank:NP_217529.1,GeneID:888642;Name=NP_217529.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3013;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217529.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3372545 3374620 . - . ID=gene-Rv3014c;Dbxref=GeneID:887354;Name=ligA;gbkey=Gene;gene=ligA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=lig;locus_tag=Rv3014c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3372545 3374620 . - 0 ID=cds-NP_217530.1;Parent=gene-Rv3014c;Dbxref=Genbank:NP_217530.1,GeneID:887354;Name=NP_217530.1;Note=polydeoxyribonucleotide synthase [NAD+];experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ligA;locus_tag=Rv3014c;product=DNA ligase A;protein_id=NP_217530.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3374651 3375664 . - . ID=gene-Rv3015c;Dbxref=GeneID:887181;Name=Rv3015c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3015c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3374651 3375664 . - 0 ID=cds-NP_217531.1;Parent=gene-Rv3015c;Dbxref=Genbank:NP_217531.1,GeneID:887181;Name=NP_217531.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3015c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217531.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3375758 3376387 . + . ID=gene-Rv3016;Dbxref=GeneID:888557;Name=lpqA;gbkey=Gene;gene=lpqA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3016
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3375758 3376387 . + 0 ID=cds-NP_217532.1;Parent=gene-Rv3016;Dbxref=Genbank:NP_217532.1,GeneID:888557;Name=NP_217532.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lpqA;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3016;product=lipoprotein LpqA;protein_id=NP_217532.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3376490 3376852 . - . ID=gene-Rv3017c;Dbxref=GeneID:888508;Name=esxQ;gbkey=Gene;gene=esxQ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_8,TB12.9;locus_tag=Rv3017c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3376490 3376852 . - 0 ID=cds-NP_217533.1;Parent=gene-Rv3017c;Dbxref=Genbank:NP_217533.1,GeneID:888508;Name=NP_217533.1;Note=TB12.9 (ESAT-6 like protein 8);gbkey=CDS;gene=esxQ;locus_tag=Rv3017c;product=ESAT-6 like protein EsxQ;protein_id=NP_217533.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3376939 3378243 . - . ID=gene-Rv3018c;Dbxref=GeneID:888940;Name=PPE46;gbkey=Gene;gene=PPE46;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3018c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3376939 3378243 . - 0 ID=cds-YP_177918.1;Parent=gene-Rv3018c;Dbxref=Genbank:YP_177918.1,GeneID:888940;Name=YP_177918.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE46;locus_tag=Rv3018c;product=PPE family protein PPE46;protein_id=YP_177918.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3378711 3379001 . - . ID=gene-Rv3019c;Dbxref=GeneID:888926;Name=esxR;gbkey=Gene;gene=esxR;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_9,TB10.3;locus_tag=Rv3019c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3378711 3379001 . - 0 ID=cds-NP_217535.1;Parent=gene-Rv3019c;Dbxref=Genbank:NP_217535.1,GeneID:888926;Name=NP_217535.1;Note=TB10.3 (ESAT-6 like protein 9);gbkey=CDS;gene=esxR;locus_tag=Rv3019c;product=ESAT-6 like protein EsxR;protein_id=NP_217535.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3379036 3379329 . - . ID=gene-Rv3020c;Dbxref=GeneID:888946;Name=esxS;gbkey=Gene;gene=esxS;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=PE28;locus_tag=Rv3020c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3379036 3379329 . - 0 ID=cds-YP_177919.1;Parent=gene-Rv3020c;Dbxref=Genbank:YP_177919.1,GeneID:888946;Name=YP_177919.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins. A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004).;gbkey=CDS;gene=esxS;locus_tag=Rv3020c;product=ESAT-6 like protein EsxS;protein_id=YP_177919.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3379376 3380452 . - . ID=gene-Rv3021c;Dbxref=GeneID:888924;Name=PPE47;gbkey=Gene;gene=PPE47;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3021c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3379376 3380452 . - . ID=id-Rv3021c;Dbxref=PSEUDO:CCP45828.1,GeneID:888924;Note=PPE47%2C Member of Mycobacterium tuberculosis PPE family. Should be continuation of upstream ORF MTV012.36c but is frameshifted due to missing base at 36448 in v012. Sequence has been checked but no error apparent.;gbkey=misc_feature;gene=PPE47;locus_tag=Rv3021c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3380440 3380682 . - . ID=gene-Rv3022c;Dbxref=GeneID:888512;Name=PPE48;gbkey=Gene;gene=PPE48;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3022c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3380440 3380682 . - . ID=id-Rv3022c;Dbxref=GeneID:888512;Note=PPE48%2C Member of M. tuberculosis PPE family with frameshift due to missing bp in codon 82. The ORF continues in downstream MTV012.35c. The sequence has been checked and no errors were detected.;gbkey=misc_feature;gene=PPE48;locus_tag=Rv3022c;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 3380679 3380993 . - . ID=gene-Rv3022A;Dbxref=GeneID:3205088;Name=PE29;gbkey=Gene;gene=PE29;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3022A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3380679 3380993 . - 0 ID=cds-YP_177685.1;Parent=gene-Rv3022A;Dbxref=Genbank:YP_177685.1,GeneID:3205088;Name=YP_177685.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE29;locus_tag=Rv3022A;product=PE family protein PE29;protein_id=YP_177685.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3381351 3382674 . + . ID=id-NC_000962.3:3381351..3382674;Note=IS1081-5%2C len: 1324 nt. Insertion sequence IS1081.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1081-5
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3381351 3381365 . + . ID=id-NC_000962.3:3381351..3381365;Note=15 bp Inverted repeat at left end of IS1081:TCGCGTGATCCTTCG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3381375 3382622 . - . ID=gene-Rv3023c;Dbxref=GeneID:888525;Name=Rv3023c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3023c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3381375 3382622 . - 0 ID=cds-NP_217539.1;Parent=gene-Rv3023c;Dbxref=Genbank:NP_217539.1,GeneID:888525;Name=NP_217539.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01007;locus_tag=Rv3023c;product=transposase;protein_id=NP_217539.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3382660 3382674 . - . ID=id-NC_000962.3:3382660..3382674;Note=15 bp Inverted repeat at the right end of IS1081:TCGCGTGATCCTTCG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3382785 3383888 . - . ID=gene-Rv3024c;Dbxref=GeneID:888524;Name=trmU;gbkey=Gene;gene=trmU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3024c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3382785 3383888 . - 0 ID=cds-NP_217540.1;Parent=gene-Rv3024c;Dbxref=Genbank:NP_217540.1,GeneID:888524;Name=NP_217540.1;Note=tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase TrmU;gbkey=CDS;gene=trmU;locus_tag=Rv3024c;product=tRNA-specific 2-thiouridylase;protein_id=NP_217540.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3383885 3385066 . - . ID=gene-Rv3025c;Dbxref=GeneID:887677;Name=iscS;gbkey=Gene;gene=iscS;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nifS;locus_tag=Rv3025c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3383885 3385066 . - 0 ID=cds-NP_217541.1;Parent=gene-Rv3025c;Dbxref=Genbank:NP_217541.1,GeneID:887677;Name=NP_217541.1;Note=NIFS protein homolog (nitrogenase metalloclusters biosynthesis protein NIFS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=iscS;inference=protein motif:PROSITE:PS00595;locus_tag=Rv3025c;product=cysteine desulfurase;protein_id=NP_217541.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3385163 3386077 . - . ID=gene-Rv3026c;Dbxref=GeneID:888489;Name=Rv3026c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3026c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3385163 3386077 . - 0 ID=cds-NP_217542.1;Parent=gene-Rv3026c;Dbxref=Genbank:NP_217542.1,GeneID:888489;Name=NP_217542.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3026c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217542.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3386074 3386919 . - . ID=gene-Rv3027c;Dbxref=GeneID:887851;Name=Rv3027c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3027c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3386074 3386919 . - 0 ID=cds-NP_217543.2;Parent=gene-Rv3027c;Dbxref=Genbank:NP_217543.2,GeneID:887851;Name=NP_217543.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3027c;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_217543.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3387075 3388031 . - . ID=gene-Rv3028c;Dbxref=GeneID:888549;Name=fixB;gbkey=Gene;gene=fixB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=etfA;locus_tag=Rv3028c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3387075 3388031 . - 0 ID=cds-NP_217544.1;Parent=gene-Rv3028c;Dbxref=Genbank:NP_217544.1,GeneID:888549;Name=NP_217544.1;Note=alpha-ETF (electron transfer flavoprotein large subunit) (ETFLS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fixB;locus_tag=Rv3028c;product=electron transfer flavoprotein subunit alpha;protein_id=NP_217544.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3388070 3388870 . - . ID=gene-Rv3029c;Dbxref=GeneID:887670;Name=fixA;gbkey=Gene;gene=fixA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=etfB;locus_tag=Rv3029c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3388070 3388870 . - 0 ID=cds-NP_217545.1;Parent=gene-Rv3029c;Dbxref=Genbank:NP_217545.1,GeneID:887670;Name=NP_217545.1;Note=beta-ETF (electron transfer flavoprotein small subunit) (ETFSS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fixA;locus_tag=Rv3029c;product=electron transfer flavoprotein subunit beta;protein_id=NP_217545.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3389101 3389925 . + . ID=gene-Rv3030;Dbxref=GeneID:888604;Name=Rv3030;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3030
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3389101 3389925 . + 0 ID=cds-NP_217546.1;Parent=gene-Rv3030;Dbxref=Genbank:NP_217546.1,GeneID:888604;Name=NP_217546.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3030;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_217546.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3389922 3391502 . + . ID=gene-Rv3031;Dbxref=GeneID:888543;Name=Rv3031;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3031
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3389922 3391502 . + 0 ID=cds-NP_217547.1;Parent=gene-Rv3031;Dbxref=Genbank:NP_217547.1,GeneID:888543;Name=NP_217547.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3031;product=1%2C4-alpha-glucan-branching protein;protein_id=NP_217547.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3391534 3392778 . + . ID=gene-Rv3032;Dbxref=GeneID:888185;Name=Rv3032;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3032
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3391534 3392778 . + 0 ID=cds-NP_217548.1;Parent=gene-Rv3032;Dbxref=Genbank:NP_217548.1,GeneID:888185;Name=NP_217548.1;Note=Alpha-1%2C4-glucosyltransferase (UDP-glucose--glycogen glucosyltransferase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17640872];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3032;product=glycogen synthase;protein_id=NP_217548.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3392812 3393201 . + . ID=gene-Rv3032A;Dbxref=GeneID:11117812;Name=Rv3032A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3032A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3392812 3393201 . + 0 ID=cds-YP_004837058.1;Parent=gene-Rv3032A;Dbxref=Genbank:YP_004837058.1,GeneID:11117812;Name=YP_004837058.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3032A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_004837058.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3393380 3393928 . + . ID=gene-Rv3033;Dbxref=GeneID:888865;Name=Rv3033;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3033
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3393380 3393928 . + 0 ID=cds-NP_217549.1;Parent=gene-Rv3033;Dbxref=Genbank:NP_217549.1,GeneID:888865;Name=NP_217549.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3033;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217549.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3394019 3394921 . - . ID=gene-Rv3034c;Dbxref=GeneID:887470;Name=Rv3034c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3034c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3394019 3394921 . - 0 ID=cds-NP_217550.1;Parent=gene-Rv3034c;Dbxref=Genbank:NP_217550.1,GeneID:887470;Name=NP_217550.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3034c;product=acetyltransferase;protein_id=NP_217550.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3395379 3396461 . + . ID=gene-Rv3035;Dbxref=GeneID:887842;Name=Rv3035;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3035
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3395379 3396461 . + 0 ID=cds-NP_217551.1;Parent=gene-Rv3035;Dbxref=Genbank:NP_217551.1,GeneID:887842;Name=NP_217551.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3035;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217551.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3396458 3397141 . - . ID=gene-Rv3036c;Dbxref=GeneID:887320;Name=TB22.2;gbkey=Gene;gene=TB22.2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3036c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3396458 3397141 . - 0 ID=cds-NP_217552.1;Parent=gene-Rv3036c;Dbxref=Genbank:NP_217552.1,GeneID:887320;Name=NP_217552.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=TB22.2;locus_tag=Rv3036c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217552.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3397214 3398290 . - . ID=gene-Rv3037c;Dbxref=GeneID:888640;Name=Rv3037c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3037c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3397214 3398290 . - 0 ID=cds-NP_217553.1;Parent=gene-Rv3037c;Dbxref=Genbank:NP_217553.1,GeneID:888640;Name=NP_217553.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3037c;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_217553.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3398425 3399408 . - . ID=gene-Rv3038c;Dbxref=GeneID:888517;Name=Rv3038c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3038c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3398425 3399408 . - 0 ID=cds-NP_217554.1;Parent=gene-Rv3038c;Dbxref=Genbank:NP_217554.1,GeneID:888517;Name=NP_217554.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15952732];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv3038c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217554.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3399419 3400183 . - . ID=gene-Rv3039c;Dbxref=GeneID:888216;Name=echA17;gbkey=Gene;gene=echA17;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3039c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3399419 3400183 . - 0 ID=cds-NP_217555.1;Parent=gene-Rv3039c;Dbxref=Genbank:NP_217555.1,GeneID:888216;Name=NP_217555.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=echA17;locus_tag=Rv3039c;product=enoyl-CoA hydratase EchA17;protein_id=NP_217555.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3400192 3401058 . - . ID=gene-Rv3040c;Dbxref=GeneID:887672;Name=Rv3040c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3040c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3400192 3401058 . - 0 ID=cds-NP_217556.1;Parent=gene-Rv3040c;Dbxref=Genbank:NP_217556.1,GeneID:887672;Name=NP_217556.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3040c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217556.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3401055 3401918 . - . ID=gene-Rv3041c;Dbxref=GeneID:887197;Name=Rv3041c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3041c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3401055 3401918 . - 0 ID=cds-NP_217557.1;Parent=gene-Rv3041c;Dbxref=Genbank:NP_217557.1,GeneID:887197;Name=NP_217557.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3041c;product=ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_217557.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3401933 3403162 . - . ID=gene-Rv3042c;Dbxref=GeneID:887815;Name=serB2;gbkey=Gene;gene=serB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3042c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3401933 3403162 . - 0 ID=cds-NP_217558.1;Parent=gene-Rv3042c;Dbxref=Genbank:NP_217558.1,GeneID:887815;Name=NP_217558.1;Note=PSP (O-phosphoserine phosphohydrolase) (pspase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=serB2;locus_tag=Rv3042c;product=phosphoserine phosphatase SerB;protein_id=NP_217558.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3403200 3404921 . - . ID=gene-Rv3043c;Dbxref=GeneID:887881;Name=ctaD;gbkey=Gene;gene=ctaD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3043c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3403200 3404921 . - 0 ID=cds-NP_217559.1;Parent=gene-Rv3043c;Dbxref=Genbank:NP_217559.1,GeneID:887881;Name=NP_217559.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ctaD;inference=protein motif:PROSITE:PS00077;locus_tag=Rv3043c;product=cytochrome C oxidase cytochrome 1;protein_id=NP_217559.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3405136 3406215 . + . ID=gene-Rv3044;Dbxref=GeneID:888745;Name=fecB;gbkey=Gene;gene=fecB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3044
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3405136 3406215 . + 0 ID=cds-NP_217560.1;Parent=gene-Rv3044;Dbxref=Genbank:NP_217560.1,GeneID:888745;Name=NP_217560.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=fecB;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3044;product=FeIII-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein;protein_id=NP_217560.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3406285 3407325 . + . ID=gene-Rv3045;Dbxref=GeneID:888888;Name=adhC;gbkey=Gene;gene=adhC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3045
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3406285 3407325 . + 0 ID=cds-NP_217561.1;Parent=gene-Rv3045;Dbxref=Genbank:NP_217561.1,GeneID:888888;Name=NP_217561.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=adhC;inference=protein motif:PROSITE:PS00059;locus_tag=Rv3045;product=NADP-dependent alcohol dehydrogenase;protein_id=NP_217561.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3407314 3407688 . - . ID=gene-Rv3046c;Dbxref=GeneID:888870;Name=Rv3046c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3046c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3407314 3407688 . - 0 ID=cds-NP_217562.1;Parent=gene-Rv3046c;Dbxref=Genbank:NP_217562.1,GeneID:888870;Name=NP_217562.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3046c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217562.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3408022 3408306 . - . ID=gene-Rv3047c;Dbxref=GeneID:888898;Name=Rv3047c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3047c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3408022 3408306 . - 0 ID=cds-NP_217563.1;Parent=gene-Rv3047c;Dbxref=Genbank:NP_217563.1,GeneID:888898;Name=NP_217563.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3047c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217563.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3408404 3409378 . - . ID=gene-Rv3048c;Dbxref=GeneID:888886;Name=nrdF2;gbkey=Gene;gene=nrdF2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nrdG;locus_tag=Rv3048c
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 3414232 3414684 . - 0 ID=cds-NP_217568.1;Parent=gene-Rv3052c;Dbxref=Genbank:NP_217568.1,GeneID:888885;Name=NP_217568.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=nrdI;locus_tag=Rv3052c;product=NrdI protein;protein_id=NP_217568.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3414719 3414958 . - . ID=gene-Rv3053c;Dbxref=GeneID:888884;Name=nrdH;gbkey=Gene;gene=nrdH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3053c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3415435 3415989 . - . ID=gene-Rv3054c;Dbxref=GeneID:887963;Name=Rv3054c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3054c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3416081 3416695 . + . ID=gene-Rv3055;Dbxref=GeneID:888882;Name=Rv3055;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3055
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3416705 3417745 . + . ID=gene-Rv3056;Dbxref=GeneID:887519;Name=dinP;gbkey=Gene;gene=dinP;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=dinB2;locus_tag=Rv3056
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3417799 3418662 . - . ID=gene-Rv3057c;Dbxref=GeneID:888617;Name=Rv3057c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3057c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3418726 3419376 . - . ID=gene-Rv3058c;Dbxref=GeneID:888878;Name=Rv3058c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3058c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3418726 3419376 . - 0 ID=cds-NP_217574.1;Parent=gene-Rv3058c;Dbxref=Genbank:NP_217574.1,GeneID:888878;Name=NP_217574.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3058c;product=TetR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217574.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3419492 3420970 . + . ID=gene-Rv3059;Dbxref=GeneID:888883;Name=cyp136;gbkey=Gene;gene=cyp136;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3059
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3419492 3420970 . + 0 ID=cds-NP_217575.1;Parent=gene-Rv3059;Dbxref=Genbank:NP_217575.1,GeneID:888883;Name=NP_217575.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cyp136;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv3059;product=cytochrome P450 Cyp136;protein_id=NP_217575.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3421741 3423213 . - . ID=gene-Rv3060c;Dbxref=GeneID:888855;Name=Rv3060c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3060c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3421741 3423213 . - 0 ID=cds-NP_217576.1;Parent=gene-Rv3060c;Dbxref=Genbank:NP_217576.1,GeneID:888855;Name=NP_217576.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00043;locus_tag=Rv3060c;product=GntR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217576.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3423262 3425427 . - . ID=gene-Rv3061c;Dbxref=GeneID:887617;Name=fadE22;gbkey=Gene;gene=fadE22;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3061c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3423262 3425427 . - 0 ID=cds-NP_217577.1;Parent=gene-Rv3061c;Dbxref=Genbank:NP_217577.1,GeneID:887617;Name=NP_217577.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE22;locus_tag=Rv3061c;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE22;protein_id=NP_217577.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3425584 3427107 . + . ID=gene-Rv3062;Dbxref=GeneID:887553;Name=ligB;gbkey=Gene;gene=ligB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3062
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3425584 3427107 . + 0 ID=cds-NP_217578.1;Parent=gene-Rv3062;Dbxref=Genbank:NP_217578.1,GeneID:887553;Name=NP_217578.1;Note=ATP-dependent%3B polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] (polynucleotide ligase [ATP]) (sealase) (DNA repair protein) (DNA joinase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:14985346];gbkey=CDS;gene=ligB;inference=protein motif:PROSITE:PS00697;locus_tag=Rv3062;product=DNA ligase;protein_id=NP_217578.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3427243 3429519 . + . ID=gene-Rv3063;Dbxref=GeneID:887948;Name=cstA;gbkey=Gene;gene=cstA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3063
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3427243 3429519 . + 0 ID=cds-NP_217579.1;Parent=gene-Rv3063;Dbxref=Genbank:NP_217579.1,GeneID:887948;Name=NP_217579.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=cstA;locus_tag=Rv3063;product=carbon starvation protein A;protein_id=NP_217579.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3429825 3430250 . - . ID=gene-Rv3064c;Dbxref=GeneID:888879;Name=Rv3064c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3064c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3429825 3430250 . - 0 ID=cds-NP_217580.1;Parent=gene-Rv3064c;Dbxref=Genbank:NP_217580.1,GeneID:888879;Name=NP_217580.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3064c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217580.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3430387 3430710 . + . ID=gene-Rv3065;Dbxref=GeneID:887550;Name=mmr;gbkey=Gene;gene=mmr;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=emrE;locus_tag=Rv3065
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3430387 3430710 . + 0 ID=cds-YP_177922.1;Parent=gene-Rv3065;Dbxref=Genbank:YP_177922.1,GeneID:887550;Name=YP_177922.1;Note=multidrugs-transport integral membrane protein;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:9811672];gbkey=CDS;gene=mmr;locus_tag=Rv3065;product=multidrug resistance protein Mmr;protein_id=YP_177922.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3430707 3431315 . + . ID=gene-Rv3066;Dbxref=GeneID:888847;Name=Rv3066;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3066
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3430707 3431315 . + 0 ID=cds-NP_217582.1;Parent=gene-Rv3066;Dbxref=Genbank:NP_217582.1,GeneID:888847;Name=NP_217582.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3066;product=DeoR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217582.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3431428 3431838 . + . ID=gene-Rv3067;Dbxref=GeneID:888822;Name=Rv3067;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3067
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3431428 3431838 . + 0 ID=cds-NP_217583.1;Parent=gene-Rv3067;Dbxref=Genbank:NP_217583.1,GeneID:888822;Name=NP_217583.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3067;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217583.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3431840 3431912 . - . ID=gene-Rvnt37;Dbxref=GeneID:2700438;Name=alaU;gbkey=Gene;gene=alaU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt37
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 3431840 3431912 . - . ID=rna-Rvnt37;Parent=gene-Rvnt37;Dbxref=GeneID:2700438;Note=alaU%2C tRNA-Ala%2C anticodon ggc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(3431877..3431879));codons=53;gbkey=tRNA;gene=alaU;locus_tag=Rvnt37;product=tRNA-Ala
+NC_000962.3 RefSeq exon 3431840 3431912 . - . ID=exon-Rvnt37-1;Parent=rna-Rvnt37;Dbxref=GeneID:2700438;Note=alaU%2C tRNA-Ala%2C anticodon ggc%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(3431877..3431879));codons=53;gbkey=tRNA;gene=alaU;locus_tag=Rvnt37;product=tRNA-Ala
+NC_000962.3 RefSeq gene 3431979 3433622 . - . ID=gene-Rv3068c;Dbxref=GeneID:888826;Name=pgmA;gbkey=Gene;gene=pgmA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3068c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3431979 3433622 . - 0 ID=cds-NP_217584.1;Parent=gene-Rv3068c;Dbxref=Genbank:NP_217584.1,GeneID:888826;Name=NP_217584.1;Note=glucose phosphomutase (PGM);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=pgmA;inference=protein motif:PROSITE:PS00710;locus_tag=Rv3068c;product=phosphoglucomutase PgmA;protein_id=NP_217584.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3433692 3434090 . + . ID=gene-Rv3069;Dbxref=GeneID:888859;Name=Rv3069;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3069
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3433692 3434090 . + 0 ID=cds-NP_217585.1;Parent=gene-Rv3069;Dbxref=Genbank:NP_217585.1,GeneID:888859;Name=NP_217585.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3069;product=fluoride ion transporter CrcB;protein_id=NP_217585.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3434087 3434467 . + . ID=gene-Rv3070;Dbxref=GeneID:888651;Name=Rv3070;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3070
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3434087 3434467 . + 0 ID=cds-NP_217586.1;Parent=gene-Rv3070;Dbxref=Genbank:NP_217586.1,GeneID:888651;Name=NP_217586.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3070;product=fluoride ion transporter CrcB;protein_id=NP_217586.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3434464 3435573 . + . ID=gene-Rv3071;Dbxref=GeneID:888649;Name=Rv3071;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3071
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3434464 3435573 . + 0 ID=cds-NP_217587.1;Parent=gene-Rv3071;Dbxref=Genbank:NP_217587.1,GeneID:888649;Name=NP_217587.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3071;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217587.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3435798 3436322 . - . ID=gene-Rv3072c;Dbxref=GeneID:887175;Name=Rv3072c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3072c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3435798 3436322 . - 0 ID=cds-NP_217588.1;Parent=gene-Rv3072c;Dbxref=Genbank:NP_217588.1,GeneID:887175;Name=NP_217588.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3072c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217588.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3436329 3436685 . - . ID=gene-Rv3073c;Dbxref=GeneID:888647;Name=Rv3073c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3073c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3436329 3436685 . - 0 ID=cds-NP_217589.1;Parent=gene-Rv3073c;Dbxref=Genbank:NP_217589.1,GeneID:888647;Name=NP_217589.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3073c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217589.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3436779 3438053 . + . ID=gene-Rv3074;Dbxref=GeneID:888027;Name=Rv3074;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3074
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3436779 3438053 . + 0 ID=cds-NP_217590.1;Parent=gene-Rv3074;Dbxref=Genbank:NP_217590.1,GeneID:888027;Name=NP_217590.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3074;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217590.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3438050 3438973 . - . ID=gene-Rv3075c;Dbxref=GeneID:887178;Name=Rv3075c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3075c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3438050 3438973 . - 0 ID=cds-NP_217591.1;Parent=gene-Rv3075c;Dbxref=Genbank:NP_217591.1,GeneID:887178;Name=NP_217591.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3075c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217591.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3439072 3439548 . + . ID=gene-Rv3076;Dbxref=GeneID:888026;Name=Rv3076;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3076
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3446040 3447278 . + . ID=gene-Rv3081;Dbxref=GeneID:888650;Name=Rv3081;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3081
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3447404 3448426 . - . ID=gene-Rv3082c;Dbxref=GeneID:888657;Name=virS;gbkey=Gene;gene=virS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3082c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3448504 3449991 . + . ID=gene-Rv3083;Dbxref=GeneID:888655;Name=Rv3083;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3083
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3448504 3449991 . + 0 ID=cds-NP_217599.1;Parent=gene-Rv3083;Dbxref=Genbank:NP_217599.1,GeneID:888655;Name=NP_217599.1;Note=hydroxylase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3083;product=FAD-containing monooxygenase MymA;protein_id=NP_217599.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3449997 3450923 . + . ID=gene-Rv3084;Dbxref=GeneID:888652;Name=lipR;gbkey=Gene;gene=lipR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3084
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3449997 3450923 . + 0 ID=cds-NP_217600.1;Parent=gene-Rv3084;Dbxref=Genbank:NP_217600.1,GeneID:888652;Name=NP_217600.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=lipR;locus_tag=Rv3084;product=acetyl-hydrolase LipR;protein_id=NP_217600.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3450920 3451750 . + . ID=gene-Rv3085;Dbxref=GeneID:888656;Name=Rv3085;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3085
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3450920 3451750 . + 0 ID=cds-NP_217601.1;Parent=gene-Rv3085;Dbxref=Genbank:NP_217601.1,GeneID:888656;Name=NP_217601.1;Note=short-chain type dehydrogenase/reductase;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv3085;product=oxidoreductase SadH;protein_id=NP_217601.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3451781 3452887 . + . ID=gene-Rv3086;Dbxref=GeneID:888654;Name=adhD;gbkey=Gene;gene=adhD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3086
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3451781 3452887 . + 0 ID=cds-NP_217602.1;Parent=gene-Rv3086;Dbxref=Genbank:NP_217602.1,GeneID:888654;Name=NP_217602.1;Note=aldehyde reductase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=adhD;inference=protein motif:PROSITE:PS00059;locus_tag=Rv3086;product=alcohol dehydrogenase D;protein_id=NP_217602.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3452925 3454343 . + . ID=gene-Rv3087;Dbxref=GeneID:888653;Name=Rv3087;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3087
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3452925 3454343 . + 0 ID=cds-NP_217603.1;Parent=gene-Rv3087;Dbxref=Genbank:NP_217603.1,GeneID:888653;Name=NP_217603.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3087;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_217603.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3454340 3455764 . + . ID=gene-Rv3088;Dbxref=GeneID:888669;Name=tgs4;gbkey=Gene;gene=tgs4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3088
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3454340 3455764 . + 0 ID=cds-NP_217604.1;Parent=gene-Rv3088;Dbxref=Genbank:NP_217604.1,GeneID:888669;Name=NP_217604.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=tgs4;locus_tag=Rv3088;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_217604.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3455761 3457272 . + . ID=gene-Rv3089;Dbxref=GeneID:888666;Name=fadD13;gbkey=Gene;gene=fadD13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3089
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3455761 3457272 . + 0 ID=cds-NP_217605.1;Parent=gene-Rv3089;Dbxref=Genbank:NP_217605.1,GeneID:888666;Name=NP_217605.1;Note=fatty-acid-CoA synthetase (fatty-acid-CoA synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:20027301];gbkey=CDS;gene=fadD13;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv3089;product=long chain-fatty-acid--CoA ligase FadD13;protein_id=NP_217605.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3458211 3459098 . + . ID=gene-Rv3090;Dbxref=GeneID:888668;Name=Rv3090;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3090
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3458211 3459098 . + 0 ID=cds-NP_217606.1;Parent=gene-Rv3090;Dbxref=Genbank:NP_217606.1,GeneID:888668;Name=NP_217606.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3090;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217606.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3459116 3460807 . + . ID=gene-Rv3091;Dbxref=GeneID:888665;Name=Rv3091;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3091
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3459116 3460807 . + 0 ID=cds-NP_217607.1;Parent=gene-Rv3091;Dbxref=Genbank:NP_217607.1,GeneID:888665;Name=NP_217607.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3091;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217607.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3460814 3461734 . - . ID=gene-Rv3092c;Dbxref=GeneID:888667;Name=Rv3092c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3092c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3460814 3461734 . - 0 ID=cds-NP_217608.1;Parent=gene-Rv3092c;Dbxref=Genbank:NP_217608.1,GeneID:888667;Name=NP_217608.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3092c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217608.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3461760 3462764 . - . ID=gene-Rv3093c;Dbxref=GeneID:888663;Name=Rv3093c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3093c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3461760 3462764 . - 0 ID=cds-NP_217609.1;Parent=gene-Rv3093c;Dbxref=Genbank:NP_217609.1,GeneID:888663;Name=NP_217609.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3093c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_217609.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3462761 3463891 . - . ID=gene-Rv3094c;Dbxref=GeneID:888661;Name=Rv3094c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3094c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3462761 3463891 . - 0 ID=cds-NP_217610.1;Parent=gene-Rv3094c;Dbxref=Genbank:NP_217610.1,GeneID:888661;Name=NP_217610.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3094c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217610.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3463973 3464449 . + . ID=gene-Rv3095;Dbxref=GeneID:888679;Name=Rv3095;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3095
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3463973 3464449 . + 0 ID=cds-NP_217611.1;Parent=gene-Rv3095;Dbxref=Genbank:NP_217611.1,GeneID:888679;Name=NP_217611.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3095;product=HTH-type transcriptional regulator;protein_id=NP_217611.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3464547 3465686 . + . ID=gene-Rv3096;Dbxref=GeneID:888678;Name=Rv3096;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3096
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3464547 3465686 . + 0 ID=cds-NP_217612.1;Parent=gene-Rv3096;Dbxref=Genbank:NP_217612.1,GeneID:888678;Name=NP_217612.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00659;locus_tag=Rv3096;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217612.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3465778 3467091 . - . ID=gene-Rv3097c;Dbxref=GeneID:888677;Name=lipY;gbkey=Gene;gene=lipY;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=PE_PGRS63;locus_tag=Rv3097c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3465778 3467091 . - 0 ID=cds-YP_177924.1;Parent=gene-Rv3097c;Dbxref=Genbank:YP_177924.1,GeneID:888677;Name=YP_177924.1;Note=PE-PGRS family protein Y (esterase/lipase) (triglyceride lipase) (tributyrase) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=lipY;locus_tag=Rv3097c;product=triacylglycerol lipase Lip;protein_id=YP_177924.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3467210 3467662 . - . ID=gene-Rv3098c;Dbxref=GeneID:888676;Name=Rv3098c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3098c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3467210 3467662 . - 0 ID=cds-NP_217614.1;Parent=gene-Rv3098c;Dbxref=Genbank:NP_217614.1,GeneID:888676;Name=NP_217614.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3098c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217614.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3467606 3467926 . + . ID=gene-Rv3098A;Dbxref=GeneID:14515872;Name=Rv3098A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3098A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3467606 3467926 . + 0 ID=cds-YP_007411812.1;Parent=gene-Rv3098A;Dbxref=Genbank:YP_007411812.1,GeneID:14515872;Name=YP_007411812.1;Note=PemK-like protein.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3098A;product=PemK-like protein;protein_id=YP_007411812.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3467967 3468334 . - . ID=gene-RVnc0046;Dbxref=GeneID:14515871;Name=ssr;gbkey=Gene;gene=ssr;gene_biotype=misc_RNA;locus_tag=RVnc0046
+NC_000962.3 RefSeq transcript 3467967 3468334 . - . ID=rna-RVnc0046;Parent=gene-RVnc0046;Dbxref=GeneID:14515871;Note=ssr%2C match to EM_BA:MT10SARNA X60301 M.tuberculosis gene for 10Sa RNA. Ends changed since first submission (-239 nt).;gbkey=misc_RNA;gene=ssr;locus_tag=RVnc0046;product=10Sa RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 3467967 3468334 . - . ID=exon-RVnc0046-1;Parent=rna-RVnc0046;Dbxref=GeneID:14515871;Note=ssr%2C match to EM_BA:MT10SARNA X60301 M.tuberculosis gene for 10Sa RNA. Ends changed since first submission (-239 nt).;gbkey=misc_RNA;gene=ssr;locus_tag=RVnc0046;product=10Sa RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 3468413 3469264 . - . ID=gene-Rv3099c;Dbxref=GeneID:888674;Name=Rv3099c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3099c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3468413 3469264 . - 0 ID=cds-NP_217615.1;Parent=gene-Rv3099c;Dbxref=Genbank:NP_217615.1,GeneID:888674;Name=NP_217615.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3099c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217615.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3469301 3469783 . - . ID=gene-Rv3100c;Dbxref=GeneID:888675;Name=smpB;gbkey=Gene;gene=smpB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3100c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3469301 3469783 . - 0 ID=cds-NP_217616.1;Parent=gene-Rv3100c;Dbxref=Genbank:NP_217616.1,GeneID:888675;Name=NP_217616.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=smpB;locus_tag=Rv3100c;product=SsrA-binding protein;protein_id=NP_217616.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3469786 3470679 . - . ID=gene-Rv3101c;Dbxref=GeneID:888673;Name=ftsX;gbkey=Gene;gene=ftsX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3101c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3469786 3470679 . - 0 ID=cds-NP_217617.1;Parent=gene-Rv3101c;Dbxref=Genbank:NP_217617.1,GeneID:888673;Name=NP_217617.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ftsX;locus_tag=Rv3101c;product=cell division protein FtsX;protein_id=NP_217617.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3470680 3471369 . - . ID=gene-Rv3102c;Dbxref=GeneID:888672;Name=ftsE;gbkey=Gene;gene=ftsE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3102c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3470680 3471369 . - 0 ID=cds-NP_217618.1;Parent=gene-Rv3102c;Dbxref=Genbank:NP_217618.1,GeneID:888672;Name=NP_217618.1;Note=septation component-transport ATP-binding protein ABC transporter;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ftsE;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv3102c;product=cell division ATP-binding protein FtsE;protein_id=NP_217618.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3471413 3471850 . - . ID=gene-Rv3103c;Dbxref=GeneID:888798;Name=Rv3103c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3103c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3471413 3471850 . - 0 ID=cds-NP_217619.1;Parent=gene-Rv3103c;Dbxref=Genbank:NP_217619.1,GeneID:888798;Name=NP_217619.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3103c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217619.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3471852 3472778 . - . ID=gene-Rv3104c;Dbxref=GeneID:888685;Name=Rv3104c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3104c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3471852 3472778 . - 0 ID=cds-NP_217620.1;Parent=gene-Rv3104c;Dbxref=Genbank:NP_217620.1,GeneID:888685;Name=NP_217620.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3104c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217620.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3472768 3473904 . - . ID=gene-Rv3105c;Dbxref=GeneID:888820;Name=prfB;gbkey=Gene;gene=prfB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3105c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3472768 3473904 . - 0 ID=cds-NP_217621.1;Parent=gene-Rv3105c;Dbxref=Genbank:NP_217621.1,GeneID:888820;Name=NP_217621.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=prfB;inference=protein motif:PROSITE:PS00745;locus_tag=Rv3105c;product=peptide chain release factor PrfB;protein_id=NP_217621.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3474007 3475377 . + . ID=gene-Rv3106;Dbxref=GeneID:888839;Name=fprA;gbkey=Gene;gene=fprA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3106
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3474007 3475377 . + 0 ID=cds-NP_217622.1;Parent=gene-Rv3106;Dbxref=Genbank:NP_217622.1,GeneID:888839;Name=NP_217622.1;Note=adrenodoxin reductase;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:12071965];gbkey=CDS;gene=fprA;locus_tag=Rv3106;product=NADPH-ferredoxin reductase FprA;protein_id=NP_217622.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3475378 3476961 . - . ID=gene-Rv3107c;Dbxref=GeneID:887657;Name=agpS;gbkey=Gene;gene=agpS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3107c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3475378 3476961 . - 0 ID=cds-NP_217623.1;Parent=gene-Rv3107c;Dbxref=Genbank:NP_217623.1,GeneID:887657;Name=NP_217623.1;Note=alkyl-DHAP synthase (alkylglycerone-phosphate synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=agpS;locus_tag=Rv3107c;product=alkyldihydroxyacetonephosphate synthase;protein_id=NP_217623.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3477060 3477500 . + . ID=gene-Rv3108;Dbxref=GeneID:888686;Name=Rv3108;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3108
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3477060 3477500 . + 0 ID=cds-NP_217624.1;Parent=gene-Rv3108;Dbxref=Genbank:NP_217624.1,GeneID:888686;Name=NP_217624.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3108;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217624.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3477649 3478728 . + . ID=gene-Rv3109;Dbxref=GeneID:888836;Name=moaA1;gbkey=Gene;gene=moaA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moaA;locus_tag=Rv3109
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3477649 3478728 . + 0 ID=cds-YP_177925.1;Parent=gene-Rv3109;Dbxref=Genbank:YP_177925.1,GeneID:888836;Name=YP_177925.1;Note=moaA1%2Cmolybdenum cofactor biosynthesis protein. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=moaA1;locus_tag=Rv3109;product=cyclic pyranopterin monophosphate synthase;protein_id=YP_177925.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3478779 3479174 . + . ID=gene-Rv3110;Dbxref=GeneID:888683;Name=moaB1;gbkey=Gene;gene=moaB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moaB;locus_tag=Rv3110
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3478779 3479174 . + 0 ID=cds-YP_177926.1;Parent=gene-Rv3110;Dbxref=Genbank:YP_177926.1,GeneID:888683;Name=YP_177926.1;Note=PHS (4-alpha-hydroxy-tetrahydropterin dehydratase) (pterin-4-a-carbinolamine dehydratase) (phenylalanine hydroxylase-stimulating protein) (PHS) (pterin carbinolamine dehydratase) (PCD) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=moaB1;locus_tag=Rv3110;product=pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase;protein_id=YP_177926.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3479171 3479683 . + . ID=gene-Rv3111;Dbxref=GeneID:888680;Name=moaC1;gbkey=Gene;gene=moaC1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moaC;locus_tag=Rv3111
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3479171 3479683 . + 0 ID=cds-YP_177927.1;Parent=gene-Rv3111;Dbxref=Genbank:YP_177927.1,GeneID:888680;Name=YP_177927.1;Note=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC%3B This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;gene=moaC1;locus_tag=Rv3111;product=cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein;protein_id=YP_177927.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3479700 3479951 . + . ID=gene-Rv3112;Dbxref=GeneID:888897;Name=moaD1;gbkey=Gene;gene=moaD1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moaD;locus_tag=Rv3112
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3479700 3479951 . + 0 ID=cds-YP_177928.1;Parent=gene-Rv3112;Dbxref=Genbank:YP_177928.1,GeneID:888897;Name=YP_177928.1;Note=molybdopterin converting factor small subunit (molybdopterin [MPT] converting factor%2C subunit 1) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=moaD1;locus_tag=Rv3112;product=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaD;protein_id=YP_177928.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3480074 3480742 . + . ID=gene-Rv3113;Dbxref=GeneID:888781;Name=Rv3113;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3113
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3480074 3480742 . + 0 ID=cds-NP_217629.1;Parent=gene-Rv3113;Dbxref=Genbank:NP_217629.1,GeneID:888781;Name=NP_217629.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3113;product=phosphatase;protein_id=NP_217629.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3480759 3481289 . + . ID=gene-Rv3114;Dbxref=GeneID:888779;Name=Rv3114;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3114
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3480759 3481289 . + 0 ID=cds-NP_217630.1;Parent=gene-Rv3114;Dbxref=Genbank:NP_217630.1,GeneID:888779;Name=NP_217630.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3114;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217630.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3481399 3482722 . + . ID=id-NC_000962.3:3481399..3482722;Note=IS1081-6%2C len: 1324 nt. Insertion sequence IS1081. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1081-6
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3481399 3481413 . + . ID=id-NC_000962.3:3481399..3481413;Note=15 bp inverted repeat at left end of IS1081: TCGCGTGATCCTTCG. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3481451 3482698 . + . ID=gene-Rv3115;Dbxref=GeneID:888790;Name=Rv3115;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3115
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3481451 3482698 . + 0 ID=cds-NP_217631.1;Parent=gene-Rv3115;Dbxref=Genbank:NP_217631.1,GeneID:888790;Name=NP_217631.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01007;locus_tag=Rv3115;product=transposase;protein_id=NP_217631.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3482708 3482722 . - . ID=id-NC_000962.3:3482708..3482722;Note=15 bp inverted repeat at right end of IS1081: TCGCGTGATCCTTCG. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3482776 3483945 . + . ID=gene-Rv3116;Dbxref=GeneID:888808;Name=moeB2;gbkey=Gene;gene=moeB2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moeB;locus_tag=Rv3116
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3482776 3483945 . + 0 ID=cds-YP_177929.1;Parent=gene-Rv3116;Dbxref=Genbank:YP_177929.1,GeneID:888808;Name=YP_177929.1;Note=MPT-synthase sulfurylase (molybdopterin synthase) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=moeB2;locus_tag=Rv3116;product=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoeB;protein_id=YP_177929.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3483974 3484807 . + . ID=gene-Rv3117;Dbxref=GeneID:888802;Name=cysA3;gbkey=Gene;gene=cysA3;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=sseC3;locus_tag=Rv3117
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3483974 3484807 . + 0 ID=cds-NP_217633.1;Parent=gene-Rv3117;Dbxref=Genbank:NP_217633.1,GeneID:888802;Name=NP_217633.1;Note=rhodanese-like protein (thiosulfate cyanide transsulfurase) (thiosulfate thiotransferase) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14595687];gbkey=CDS;gene=cysA3;inference=protein motif:PROSITE:PS00683;locus_tag=Rv3117;product=thiosulfate sulfurtransferase;protein_id=NP_217633.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3484809 3485111 . + . ID=gene-Rv3118;Dbxref=GeneID:888809;Name=Rv3118;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3118
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3484809 3485111 . + 0 ID=cds-YP_177930.1;Parent=gene-Rv3118;Dbxref=Genbank:YP_177930.1,GeneID:888809;Name=YP_177930.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3118;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177930.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3485132 3485575 . + . ID=gene-Rv3119;Dbxref=GeneID:888811;Name=moaE1;gbkey=Gene;gene=moaE1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=moaE;locus_tag=Rv3119
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3485132 3485575 . + 0 ID=cds-YP_177931.1;Parent=gene-Rv3119;Dbxref=Genbank:YP_177931.1,GeneID:888811;Name=YP_177931.1;Note=molybdopterin converting factor large subunit (molybdopterin [MPT] converting factor%2C subunit 2) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=moaE1;locus_tag=Rv3119;product=molybdopterin synthase catalytic subunit 1;protein_id=YP_177931.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3485572 3486174 . + . ID=gene-Rv3120;Dbxref=GeneID:888828;Name=Rv3120;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3120
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3485572 3486174 . + 0 ID=cds-NP_217636.1;Parent=gene-Rv3120;Dbxref=Genbank:NP_217636.1,GeneID:888828;Name=NP_217636.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3120;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217636.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3486509 3487711 . + . ID=gene-Rv3121;Dbxref=GeneID:887409;Name=cyp141;gbkey=Gene;gene=cyp141;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3121
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3486509 3487711 . + 0 ID=cds-NP_217637.1;Parent=gene-Rv3121;Dbxref=Genbank:NP_217637.1,GeneID:887409;Name=NP_217637.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;gene=cyp141;inference=protein motif:PROSITE:PS00086;locus_tag=Rv3121;product=cytochrome P450 Cyp141;protein_id=NP_217637.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3488089 3488559 . + . ID=gene-Rv3122;Dbxref=GeneID:888890;Name=Rv3122;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3122
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3488089 3488559 . + 0 ID=cds-NP_217638.1;Parent=gene-Rv3122;Dbxref=Genbank:NP_217638.1,GeneID:888890;Name=NP_217638.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3122;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217638.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3488569 3489063 . + . ID=gene-Rv3123;Dbxref=GeneID:888823;Name=Rv3123;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3123
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3488569 3489063 . + 0 ID=cds-NP_217639.1;Parent=gene-Rv3123;Dbxref=Genbank:NP_217639.1,GeneID:888823;Name=NP_217639.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3123;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217639.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3489506 3490375 . + . ID=gene-Rv3124;Dbxref=GeneID:888825;Name=moaR1;gbkey=Gene;gene=moaR1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3124
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3489506 3490375 . + 0 ID=cds-NP_217640.1;Parent=gene-Rv3124;Dbxref=Genbank:NP_217640.1,GeneID:888825;Name=NP_217640.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:20378651];gbkey=CDS;gene=moaR1;locus_tag=Rv3124;product=transcriptional regulator MoaR;protein_id=NP_217640.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3490476 3491651 . - . ID=gene-Rv3125c;Dbxref=GeneID:888892;Name=PPE49;gbkey=Gene;gene=PPE49;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3125c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3490476 3491651 . - 0 ID=cds-YP_177932.1;Parent=gene-Rv3125c;Dbxref=Genbank:YP_177932.1,GeneID:888892;Name=YP_177932.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE family. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE49;locus_tag=Rv3125c;product=PPE family protein PPE49;protein_id=YP_177932.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3491808 3492122 . - . ID=gene-Rv3126c;Dbxref=GeneID:888806;Name=Rv3126c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3126c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3491808 3492122 . - 0 ID=cds-NP_217642.1;Parent=gene-Rv3126c;Dbxref=Genbank:NP_217642.1,GeneID:888806;Name=NP_217642.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3126c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217642.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3492147 3493181 . + . ID=gene-Rv3127;Dbxref=GeneID:888850;Name=Rv3127;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3127
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3492147 3493181 . + 0 ID=cds-NP_217643.1;Parent=gene-Rv3127;Dbxref=Genbank:NP_217643.1,GeneID:888850;Name=NP_217643.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3127;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217643.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3493168 3494181 . - . ID=gene-Rv3128c;Dbxref=GeneID:886263;Name=Rv3128c;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3128c;pseudo=true;pseudogene=unknown
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3501794 3502936 . + . ID=gene-Rv3136;Dbxref=GeneID:888835;Name=PPE51;gbkey=Gene;gene=PPE51;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3136
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3502945 3503277 . - . ID=gene-Rv3136A;Dbxref=GeneID:14515898;Name=Rv3136A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3136A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3502945 3503277 . - 0 ID=cds-YP_007411850.1;Parent=gene-Rv3136A;Dbxref=Genbank:YP_007411850.1,GeneID:14515898;Name=YP_007411850.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3136A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007411850.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3503393 3504175 . + . ID=gene-Rv3137;Dbxref=GeneID:888827;Name=Rv3137;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3137
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3504195 3505283 . + . ID=gene-Rv3138;Dbxref=GeneID:887973;Name=pflA;gbkey=Gene;gene=pflA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3138
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3504195 3505283 . + 0 ID=cds-NP_217654.1;Parent=gene-Rv3138;Dbxref=Genbank:NP_217654.1,GeneID:887973;Name=NP_217654.1;Note=formate acetyltransferase activating enzyme ([pyruvate formate-lyase] activating enzyme);gbkey=CDS;gene=pflA;locus_tag=Rv3138;product=pyruvate formate lyase activating protein PflA;protein_id=NP_217654.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3505363 3506769 . + . ID=gene-Rv3139;Dbxref=GeneID:887971;Name=fadE24;gbkey=Gene;gene=fadE24;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3139
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3505363 3506769 . + 0 ID=cds-NP_217655.1;Parent=gene-Rv3139;Dbxref=Genbank:NP_217655.1,GeneID:887971;Name=NP_217655.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE24;inference=protein motif:PROSITE:PS00073;locus_tag=Rv3139;product=acyl-CoA dehydrogenase;protein_id=NP_217655.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3506790 3507995 . + . ID=gene-Rv3140;Dbxref=GeneID:887417;Name=fadE23;gbkey=Gene;gene=fadE23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3140
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3506790 3507995 . + 0 ID=cds-NP_217656.1;Parent=gene-Rv3140;Dbxref=Genbank:NP_217656.1,GeneID:887417;Name=NP_217656.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE23;locus_tag=Rv3140;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE23;protein_id=NP_217656.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3508095 3509066 . + . ID=gene-Rv3141;Dbxref=GeneID:888051;Name=fadB4;gbkey=Gene;gene=fadB4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3141
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3508095 3509066 . + 0 ID=cds-NP_217657.1;Parent=gene-Rv3141;Dbxref=Genbank:NP_217657.1,GeneID:888051;Name=NP_217657.1;Note=NADPH:quinone reductase (zeta-crystallin);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadB4;locus_tag=Rv3141;product=NADPH quinone oxidoreductase FadB;protein_id=NP_217657.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3509118 3509546 . - . ID=gene-Rv3142c;Dbxref=GeneID:887521;Name=Rv3142c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3142c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3509118 3509546 . - 0 ID=cds-NP_217658.1;Parent=gene-Rv3142c;Dbxref=Genbank:NP_217658.1,GeneID:887521;Name=NP_217658.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3142c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217658.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3509654 3510055 . + . ID=gene-Rv3143;Dbxref=GeneID:887576;Name=Rv3143;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3143
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3509654 3510055 . + 0 ID=cds-NP_217659.1;Parent=gene-Rv3143;Dbxref=Genbank:NP_217659.1,GeneID:887576;Name=NP_217659.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3143;product=response regulator;protein_id=NP_217659.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3510088 3511317 . - . ID=gene-Rv3144c;Dbxref=GeneID:887930;Name=PPE52;gbkey=Gene;gene=PPE52;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3144c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3510088 3511317 . - 0 ID=cds-YP_177936.2;Parent=gene-Rv3144c;Dbxref=Genbank:YP_177936.2,GeneID:887930;Name=YP_177936.2;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PPE52;locus_tag=Rv3144c;product=PPE family protein PPE52;protein_id=YP_177936.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3511682 3512068 . + . ID=gene-Rv3145;Dbxref=GeneID:887397;Name=nuoA;gbkey=Gene;gene=nuoA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3145
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3511682 3512068 . + 0 ID=cds-NP_217661.1;Parent=gene-Rv3145;Dbxref=Genbank:NP_217661.1,GeneID:887397;Name=NP_217661.1;Note=NuoA (NADH dehydrogenase I subunit A);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nuoA;locus_tag=Rv3145;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit A;protein_id=NP_217661.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3512077 3512631 . + . ID=gene-Rv3146;Dbxref=GeneID:888791;Name=nuoB;gbkey=Gene;gene=nuoB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3146
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3512077 3512631 . + 0 ID=cds-NP_217662.1;Parent=gene-Rv3146;Dbxref=Genbank:NP_217662.1,GeneID:888791;Name=NP_217662.1;Note=NuoB (NADH dehydrogenase I subunit B);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nuoB;locus_tag=Rv3146;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit B;protein_id=NP_217662.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3512628 3513338 . + . ID=gene-Rv3147;Dbxref=GeneID:888816;Name=nuoC;gbkey=Gene;gene=nuoC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3147
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3512628 3513338 . + 0 ID=cds-NP_217663.1;Parent=gene-Rv3147;Dbxref=Genbank:NP_217663.1,GeneID:888816;Name=NP_217663.1;Note=NuoC (NADH dehydrogenase I subunit C);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nuoC;locus_tag=Rv3147;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit C;protein_id=NP_217663.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3513338 3514660 . + . ID=gene-Rv3148;Dbxref=GeneID:888851;Name=nuoD;gbkey=Gene;gene=nuoD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3148
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3513338 3514660 . + 0 ID=cds-NP_217664.1;Parent=gene-Rv3148;Dbxref=Genbank:NP_217664.1,GeneID:888851;Name=NP_217664.1;Note=NuoD (NADH dehydrogenase I subunit D);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nuoD;locus_tag=Rv3148;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit D;protein_id=NP_217664.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3514657 3515415 . + . ID=gene-Rv3149;Dbxref=GeneID:887903;Name=nuoE;gbkey=Gene;gene=nuoE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3149
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3514657 3515415 . + 0 ID=cds-NP_217665.1;Parent=gene-Rv3149;Dbxref=Genbank:NP_217665.1,GeneID:887903;Name=NP_217665.1;Note=NuoE (NADH dehydrogenase I subunit E);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nuoE;locus_tag=Rv3149;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit E;protein_id=NP_217665.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3515412 3516749 . + . ID=gene-Rv3150;Dbxref=GeneID:888854;Name=nuoF;gbkey=Gene;gene=nuoF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3150
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3515412 3516749 . + 0 ID=cds-NP_217666.1;Parent=gene-Rv3150;Dbxref=Genbank:NP_217666.1,GeneID:888854;Name=NP_217666.1;Note=NuoF (NADH dehydrogenase I subunit F);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nuoF;inference=protein motif:PROSITE:PS00645;locus_tag=Rv3150;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit F;protein_id=NP_217666.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3516746 3519166 . + . ID=gene-Rv3151;Dbxref=GeneID:887540;Name=nuoG;gbkey=Gene;gene=nuoG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3151
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3516746 3519166 . + 0 ID=cds-NP_217667.1;Parent=gene-Rv3151;Dbxref=Genbank:NP_217667.1,GeneID:887540;Name=NP_217667.1;Note=NuoG (NADH dehydrogenase I subunit G) Contains respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 kDa subunit signature 2 (PS00642). Belongs to the complex I 75 KDA subunit family. Cofactor: may bind two 4FE-4S cluster and one 2FE-2S cluster.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nuoG;inference=protein motif:PROSITE:PS00642;locus_tag=Rv3151;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit G;protein_id=NP_217667.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3519282 3520514 . + . ID=gene-Rv3152;Dbxref=GeneID:887531;Name=nuoH;gbkey=Gene;gene=nuoH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3152
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3519282 3520514 . + 0 ID=cds-NP_217668.1;Parent=gene-Rv3152;Dbxref=Genbank:NP_217668.1,GeneID:887531;Name=NP_217668.1;Note=NuoH (NADH dehydrogenase I subunit H) Contains respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 2 (PS00668). Belongs to the complex I subunit 1 family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nuoH;inference=protein motif:PROSITE:PS00668;locus_tag=Rv3152;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit H;protein_id=NP_217668.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3520507 3521142 . + . ID=gene-Rv3153;Dbxref=GeneID:887530;Name=nuoI;gbkey=Gene;gene=nuoI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3153
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3520507 3521142 . + 0 ID=cds-NP_217669.1;Parent=gene-Rv3153;Dbxref=Genbank:NP_217669.1,GeneID:887530;Name=NP_217669.1;Note=NuoI (NADH dehydrogenase I subunit I) Contains two 4Fe-4S ferredoxins%2C iron-sulfur binding region signatures (PS00198). Belongs to the complex I 23 KDA subunit family. The iron-sulfur centers are similar to those of 'bacterial-type' 4FE-4S ferredoxins. Cofactor: binds two 4FE-4S clusters.;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nuoI;inference=protein motif:PROSITE:PS00198;locus_tag=Rv3153;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit I;protein_id=NP_217669.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3521139 3521927 . + . ID=gene-Rv3154;Dbxref=GeneID:888762;Name=nuoJ;gbkey=Gene;gene=nuoJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3154
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3521139 3521927 . + 0 ID=cds-NP_217670.1;Parent=gene-Rv3154;Dbxref=Genbank:NP_217670.1,GeneID:888762;Name=NP_217670.1;Note=NuoJ (NADH dehydrogenase I subunit J);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=nuoJ;locus_tag=Rv3154;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit J;protein_id=NP_217670.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3521924 3522223 . + . ID=gene-Rv3155;Dbxref=GeneID:888764;Name=nuoK;gbkey=Gene;gene=nuoK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3155
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3521924 3522223 . + 0 ID=cds-NP_217671.1;Parent=gene-Rv3155;Dbxref=Genbank:NP_217671.1,GeneID:888764;Name=NP_217671.1;Note=NuoK (NADH dehydrogenase I subunit K);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=nuoK;locus_tag=Rv3155;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit K;protein_id=NP_217671.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 3525790 3527385 . + 0 ID=cds-NP_217674.1;Parent=gene-Rv3158;Dbxref=Genbank:NP_217674.1,GeneID:888780;Name=NP_217674.1;Note=NuoN (NADH dehydrogenase I subunit N) Belongs to the complex I subunit 2 family.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=nuoN;locus_tag=Rv3158;product=NADH-quinone oxidoreductase subunit N;protein_id=NP_217674.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3527391 3529163 . - . ID=gene-Rv3159c;Dbxref=GeneID:888794;Name=PPE53;gbkey=Gene;gene=PPE53;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3159c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3529990 3531138 . - . ID=gene-Rv3161c;Dbxref=GeneID:888800;Name=Rv3161c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3161c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3529990 3531138 . - 0 ID=cds-NP_217677.1;Parent=gene-Rv3161c;Dbxref=Genbank:NP_217677.1,GeneID:888800;Name=NP_217677.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3161c;product=dioxygenase;protein_id=NP_217677.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3531208 3531645 . - . ID=gene-Rv3162c;Dbxref=GeneID:888756;Name=Rv3162c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3162c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3531208 3531645 . - 0 ID=cds-NP_217678.1;Parent=gene-Rv3162c;Dbxref=Genbank:NP_217678.1,GeneID:888756;Name=NP_217678.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3162c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217678.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3531642 3532913 . - . ID=gene-Rv3163c;Dbxref=GeneID:888789;Name=Rv3163c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3163c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3531642 3532913 . - 0 ID=cds-NP_217679.1;Parent=gene-Rv3163c;Dbxref=Genbank:NP_217679.1,GeneID:888789;Name=NP_217679.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv3163c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217679.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3532943 3533905 . - . ID=gene-Rv3164c;Dbxref=GeneID:887658;Name=moxR3;gbkey=Gene;gene=moxR3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3164c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3532943 3533905 . - 0 ID=cds-NP_217680.1;Parent=gene-Rv3164c;Dbxref=Genbank:NP_217680.1,GeneID:887658;Name=NP_217680.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=moxR3;locus_tag=Rv3164c;product=methanol dehydrogenase transcriptional regulator MoxR;protein_id=NP_217680.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3533913 3534395 . - . ID=gene-Rv3165c;Dbxref=GeneID:887661;Name=Rv3165c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3165c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3533913 3534395 . - 0 ID=cds-NP_217681.1;Parent=gene-Rv3165c;Dbxref=Genbank:NP_217681.1,GeneID:887661;Name=NP_217681.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3165c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217681.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3534392 3535351 . - . ID=gene-Rv3166c;Dbxref=GeneID:888750;Name=Rv3166c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3166c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3534392 3535351 . - 0 ID=cds-NP_217682.1;Parent=gene-Rv3166c;Dbxref=Genbank:NP_217682.1,GeneID:888750;Name=NP_217682.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3166c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217682.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3535431 3536057 . - . ID=gene-Rv3167c;Dbxref=GeneID:888763;Name=Rv3167c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3167c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3535431 3536057 . - 0 ID=cds-NP_217683.1;Parent=gene-Rv3167c;Dbxref=Genbank:NP_217683.1,GeneID:888763;Name=NP_217683.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3167c;product=TetR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217683.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3536102 3537238 . + . ID=gene-Rv3168;Dbxref=GeneID:888778;Name=Rv3168;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3168
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3536102 3537238 . + 0 ID=cds-NP_217684.1;Parent=gene-Rv3168;Dbxref=Genbank:NP_217684.1,GeneID:888778;Name=NP_217684.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3168;product=aminoglycoside phosphotransferase;protein_id=NP_217684.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3537238 3538362 . + . ID=gene-Rv3169;Dbxref=GeneID:888774;Name=Rv3169;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3169
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3537238 3538362 . + 0 ID=cds-NP_217685.1;Parent=gene-Rv3169;Dbxref=Genbank:NP_217685.1,GeneID:888774;Name=NP_217685.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00092;locus_tag=Rv3169;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217685.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3538505 3539851 . + . ID=gene-Rv3170;Dbxref=GeneID:888754;Name=aofH;gbkey=Gene;gene=aofH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3170
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3538505 3539851 . + 0 ID=cds-NP_217686.1;Parent=gene-Rv3170;Dbxref=Genbank:NP_217686.1,GeneID:888754;Name=NP_217686.1;Note=AofH (amine oxidase) (MAO);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=aofH;locus_tag=Rv3170;product=flavin-containing monoamine oxidase;protein_id=NP_217686.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3539846 3540745 . - . ID=gene-Rv3171c;Dbxref=GeneID:887293;Name=hpx;gbkey=Gene;gene=hpx;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3171c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3539846 3540745 . - 0 ID=cds-NP_217687.1;Parent=gene-Rv3171c;Dbxref=Genbank:NP_217687.1,GeneID:887293;Name=NP_217687.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=hpx;locus_tag=Rv3171c;product=non-heme haloperoxidase Hpx;protein_id=NP_217687.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3540882 3541364 . - . ID=gene-Rv3172c;Dbxref=GeneID:888848;Name=Rv3172c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3172c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3540882 3541364 . - 0 ID=cds-NP_217688.1;Parent=gene-Rv3172c;Dbxref=Genbank:NP_217688.1,GeneID:888848;Name=NP_217688.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3172c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217688.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3541443 3542045 . - . ID=gene-Rv3173c;Dbxref=GeneID:888844;Name=Rv3173c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3173c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3541443 3542045 . - 0 ID=cds-NP_217689.1;Parent=gene-Rv3173c;Dbxref=Genbank:NP_217689.1,GeneID:888844;Name=NP_217689.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3173c;product=TetR/Acr family transcriptional regulator;protein_id=NP_217689.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3542138 3542845 . + . ID=gene-Rv3174;Dbxref=GeneID:887989;Name=Rv3174;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3174
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3542138 3542845 . + 0 ID=cds-NP_217690.1;Parent=gene-Rv3174;Dbxref=Genbank:NP_217690.1,GeneID:887989;Name=NP_217690.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3174;product=short-chain dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_217690.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3542860 3544347 . + . ID=gene-Rv3175;Dbxref=GeneID:887294;Name=Rv3175;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3175
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3542860 3544347 . + 0 ID=cds-NP_217691.1;Parent=gene-Rv3175;Dbxref=Genbank:NP_217691.1,GeneID:887294;Name=NP_217691.1;Note=aminohydrolase. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3175;product=amidase;protein_id=NP_217691.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3544344 3545300 . - . ID=gene-Rv3176c;Dbxref=GeneID:888846;Name=mesT;gbkey=Gene;gene=mesT;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=lipS;locus_tag=Rv3176c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3544344 3545300 . - 0 ID=cds-YP_177938.1;Parent=gene-Rv3176c;Dbxref=Genbank:YP_177938.1,GeneID:888846;Name=YP_177938.1;Note=epoxide hydratase (arene-oxide hydratase) This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mesT;locus_tag=Rv3176c;product=epoxide hydrolase MesT;protein_id=YP_177938.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3545447 3546307 . + . ID=gene-Rv3177;Dbxref=GeneID:888766;Name=Rv3177;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3177
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3545447 3546307 . + 0 ID=cds-NP_217693.1;Parent=gene-Rv3177;Dbxref=Genbank:NP_217693.1,GeneID:888766;Name=NP_217693.1;Note=non-haem peroxidase%2C this region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3177;product=peroxidase;protein_id=NP_217693.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3546438 3546797 . + . ID=gene-Rv3178;Dbxref=GeneID:888786;Name=Rv3178;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3178
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3546438 3546797 . + 0 ID=cds-NP_217694.1;Parent=gene-Rv3178;Dbxref=Genbank:NP_217694.1,GeneID:888786;Name=NP_217694.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3178;product=nitroreductase;protein_id=NP_217694.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3547037 3547330 . + . ID=gene-Rv3178a;Dbxref=GeneID:19394684;Name=Rv3178a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3178a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3547037 3547330 . + 0 ID=cds-YP_009030043.1;Parent=gene-Rv3178a;Dbxref=Genbank:YP_009030043.1,GeneID:19394684;Name=YP_009030043.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3178a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030043.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3547618 3548907 . + . ID=gene-Rv3179;Dbxref=GeneID:887947;Name=Rv3179;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3179
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3547618 3548907 . + 0 ID=cds-NP_217695.1;Parent=gene-Rv3179;Dbxref=Genbank:NP_217695.1,GeneID:887947;Name=NP_217695.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3179;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217695.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3549254 3549688 . - . ID=gene-Rv3180c;Dbxref=GeneID:887946;Name=Rv3180c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3180c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3549254 3549688 . - 0 ID=cds-NP_217696.1;Parent=gene-Rv3180c;Dbxref=Genbank:NP_217696.1,GeneID:887946;Name=NP_217696.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3180c;product=ribonuclease VapC45;protein_id=NP_217696.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3549691 3550143 . - . ID=gene-Rv3181c;Dbxref=GeneID:888787;Name=Rv3181c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3181c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3549691 3550143 . - 0 ID=cds-NP_217697.1;Parent=gene-Rv3181c;Dbxref=Genbank:NP_217697.1,GeneID:888787;Name=NP_217697.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3181c;product=antitoxin VapB45;protein_id=NP_217697.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3550374 3550718 . + . ID=gene-Rv3182;Dbxref=GeneID:888795;Name=Rv3182;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3182
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3550374 3550718 . + 0 ID=cds-NP_217698.1;Parent=gene-Rv3182;Dbxref=Genbank:NP_217698.1,GeneID:888795;Name=NP_217698.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3182;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217698.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3550715 3551044 . + . ID=gene-Rv3183;Dbxref=GeneID:888059;Name=Rv3183;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3183
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3550715 3551044 . + 0 ID=cds-NP_217699.1;Parent=gene-Rv3183;Dbxref=Genbank:NP_217699.1,GeneID:888059;Name=NP_217699.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3183;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_217699.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3551227 3551229 . + . ID=id-NC_000962.3:3551227..3551229;Note=3 bp direct repeat%2C cga%2C at 5'-end of IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3551230 3552584 . + . ID=id-NC_000962.3:3551230..3552584;Note=IS6110-12%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-12
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3551230 3551257 . + . ID=id-NC_000962.3:3551230..3551257;Note=28 bp inverted repeat at left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3551281 3552542 . + . ID=id-NC_000962.3:3551281..3552542;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable IS6110 transposase. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990). Start changed since first submission (+ 16 aa). This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3552557 3552584 . - . ID=id-NC_000962.3:3552557..3552584;Note=28 bp inverted repeat at right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3552585 3552587 . + . ID=id-NC_000962.3:3552585..3552587;Note=3 bp direct repeat%2C cga%2C at 3'-end of IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3552710 3552712 . + . ID=id-NC_000962.3:3552710..3552712;Note=3 bp direct repeat%2C att%2C at 5'-end of IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3552713 3554067 . + . ID=id-NC_000962.3:3552713..3554067;Note=IS6110-13%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-13
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3552713 3552740 . + . ID=id-NC_000962.3:3552713..3552740;Note=28 bp inverted repeat at left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3554040 3554067 . - . ID=id-NC_000962.3:3554040..3554067;Note=28 bp inverted repeat at right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3554068 3554070 . + . ID=id-NC_000962.3:3554068..3554070;Note=3 bp direct repeat%2C att%2C at 5'-end of IS6110. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3554298 3554645 . + . ID=gene-Rv3188;Dbxref=GeneID:888103;Name=Rv3188;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3188
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3554298 3554645 . + 0 ID=cds-NP_217704.1;Parent=gene-Rv3188;Dbxref=Genbank:NP_217704.1,GeneID:888103;Name=NP_217704.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3188;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217704.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3554642 3555262 . + . ID=gene-Rv3189;Dbxref=GeneID:888034;Name=Rv3189;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3189
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3554642 3555262 . + 0 ID=cds-NP_217705.1;Parent=gene-Rv3189;Dbxref=Genbank:NP_217705.1,GeneID:888034;Name=NP_217705.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3189;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217705.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3555422 3556687 . - . ID=gene-Rv3190c;Dbxref=GeneID:888119;Name=Rv3190c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3190c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3555422 3556687 . - 0 ID=cds-NP_217706.1;Parent=gene-Rv3190c;Dbxref=Genbank:NP_217706.1,GeneID:888119;Name=NP_217706.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3190c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217706.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3556855 3557064 . + . ID=gene-Rv3190A;Dbxref=GeneID:14515873;Name=Rv3190A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3190A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3556855 3557064 . + 0 ID=cds-YP_007411905.1;Parent=gene-Rv3190A;Dbxref=Genbank:YP_007411905.1,GeneID:14515873;Name=YP_007411905.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3190A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_007411905.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3557311 3558345 . - . ID=gene-Rv3191c;Dbxref=GeneID:887628;Name=Rv3191c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3191c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3557311 3558345 . - 0 ID=cds-NP_217707.1;Parent=gene-Rv3191c;Dbxref=Genbank:NP_217707.1,GeneID:887628;Name=NP_217707.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3191c;product=transposase;protein_id=NP_217707.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3557314 3558345 . - . ID=id-Rv3191c;Dbxref=GeneID:887628;Note=IS1603%2C len: 1032 nt. Insertion sequence IS1603. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1603
+NC_000962.3 RefSeq gene 3559370 3559443 . - . ID=gene-Rvnt38;Dbxref=GeneID:2700465;Name=metU;gbkey=Gene;gene=metU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt38
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 3559370 3559443 . - . ID=rna-Rvnt38;Parent=gene-Rvnt38;Dbxref=GeneID:2700465;Note=metU%2C tRNA-fMet%2C anticodon cat%2C length %3D 74. Described in EM_BA: MTMETA Y08623 M.tuberculosis as metA gene. Name changed to metU as metA encodes homoserine transsuccinylase. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;anticodon=(pos:complement(3559407..3559409));codons=35;gbkey=tRNA;gene=metU;locus_tag=Rvnt38;product=tRNA-Met
+NC_000962.3 RefSeq exon 3559370 3559443 . - . ID=exon-Rvnt38-1;Parent=rna-Rvnt38;Dbxref=GeneID:2700465;Note=metU%2C tRNA-fMet%2C anticodon cat%2C length %3D 74. Described in EM_BA: MTMETA Y08623 M.tuberculosis as metA gene. Name changed to metU as metA encodes homoserine transsuccinylase. This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C2007).;anticodon=(pos:complement(3559407..3559409));codons=35;gbkey=tRNA;gene=metU;locus_tag=Rvnt38;product=tRNA-Met
+NC_000962.3 RefSeq gene 3559563 3560024 . + . ID=gene-Rv3192;Dbxref=GeneID:887899;Name=Rv3192;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3192
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3559563 3560024 . + 0 ID=cds-NP_217708.1;Parent=gene-Rv3192;Dbxref=Genbank:NP_217708.1,GeneID:887899;Name=NP_217708.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3192;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217708.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3560194 3563172 . - . ID=gene-Rv3193c;Dbxref=GeneID:888012;Name=Rv3193c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3193c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3560194 3563172 . - 0 ID=cds-NP_217709.1;Parent=gene-Rv3193c;Dbxref=Genbank:NP_217709.1,GeneID:888012;Name=NP_217709.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3193c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217709.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3563264 3564286 . - . ID=gene-Rv3194c;Dbxref=GeneID:888062;Name=Rv3194c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3194c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3563264 3564286 . - 0 ID=cds-NP_217710.1;Parent=gene-Rv3194c;Dbxref=Genbank:NP_217710.1,GeneID:888062;Name=NP_217710.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3194c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217710.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3564364 3565782 . + . ID=gene-Rv3195;Dbxref=GeneID:888900;Name=Rv3195;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3195
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3564364 3565782 . + 0 ID=cds-NP_217711.1;Parent=gene-Rv3195;Dbxref=Genbank:NP_217711.1,GeneID:888900;Name=NP_217711.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3195;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217711.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3565788 3566687 . + . ID=gene-Rv3196;Dbxref=GeneID:888903;Name=Rv3196;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3196
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3565788 3566687 . + 0 ID=cds-NP_217712.1;Parent=gene-Rv3196;Dbxref=Genbank:NP_217712.1,GeneID:888903;Name=NP_217712.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3196;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217712.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3566696 3566896 . - . ID=gene-Rv3196A;Dbxref=GeneID:3205082;Name=Rv3196A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3196A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3566696 3566896 . - 0 ID=cds-YP_177939.1;Parent=gene-Rv3196A;Dbxref=Genbank:YP_177939.1,GeneID:3205082;Name=YP_177939.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3196A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_177939.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3567024 3568367 . + . ID=gene-Rv3197;Dbxref=GeneID:887858;Name=Rv3197;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3197
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3567024 3568367 . + 0 ID=cds-NP_217713.1;Parent=gene-Rv3197;Dbxref=Genbank:NP_217713.1,GeneID:887858;Name=NP_217713.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3197;product=ABC transporter ATP-binding protein;protein_id=NP_217713.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3568401 3568679 . - . ID=gene-Rv3197A;Dbxref=GeneID:3205083;Name=whiB7;gbkey=Gene;gene=whiB7;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=whmC;locus_tag=Rv3197A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3568401 3568679 . - 0 ID=cds-YP_177940.1;Parent=gene-Rv3197A;Dbxref=Genbank:YP_177940.1,GeneID:3205083;Name=YP_177940.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:22069311];gbkey=CDS;gene=whiB7;locus_tag=Rv3197A;product=transcriptional regulator WhiB7;protein_id=YP_177940.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3569109 3571211 . - . ID=gene-Rv3198c;Dbxref=GeneID:888902;Name=uvrD2;gbkey=Gene;gene=uvrD2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3198c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3569109 3571211 . - 0 ID=cds-NP_217714.1;Parent=gene-Rv3198c;Dbxref=Genbank:NP_217714.1,GeneID:888902;Name=NP_217714.1;Note=Probable UvrD2%2CATP dependent DNA helicase II;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=uvrD2;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3198c;product=ATP-dependent DNA helicase UvrD;protein_id=NP_217714.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3571335 3571589 . + . ID=gene-Rv3198A;Dbxref=GeneID:3205084;Name=Rv3198A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3198A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3571335 3571589 . + 0 ID=cds-YP_177941.1;Parent=gene-Rv3198A;Dbxref=Genbank:YP_177941.1,GeneID:3205084;Name=YP_177941.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3198A;product=glutaredoxin protein;protein_id=YP_177941.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3571602 3572543 . - . ID=gene-Rv3199c;Dbxref=GeneID:887860;Name=nudC;gbkey=Gene;gene=nudC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3199c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3571602 3572543 . - 0 ID=cds-NP_217715.1;Parent=gene-Rv3199c;Dbxref=Genbank:NP_217715.1,GeneID:887860;Name=NP_217715.1;Note=NAD+ diphosphatase (NAD+ pyrophosphatase) (NADP pyrophosphatase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=nudC;inference=protein motif:PROSITE:PS00893;locus_tag=Rv3199c;product=NADH pyrophosphatase;protein_id=NP_217715.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3572602 3573669 . - . ID=gene-Rv3200c;Dbxref=GeneID:887543;Name=Rv3200c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3200c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3572602 3573669 . - 0 ID=cds-NP_217716.1;Parent=gene-Rv3200c;Dbxref=Genbank:NP_217716.1,GeneID:887543;Name=NP_217716.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3200c;product=transmembrane cation transporter;protein_id=NP_217716.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3573731 3577036 . - . ID=gene-Rv3201c;Dbxref=GeneID:887663;Name=Rv3201c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3201c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3573731 3577036 . - 0 ID=cds-NP_217717.1;Parent=gene-Rv3201c;Dbxref=Genbank:NP_217717.1,GeneID:887663;Name=NP_217717.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3201c;product=ATP-dependent DNA helicase;protein_id=NP_217717.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3577033 3580200 . - . ID=gene-Rv3202c;Dbxref=GeneID:887574;Name=Rv3202c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3202c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3577033 3580200 . - 0 ID=cds-NP_217718.1;Parent=gene-Rv3202c;Dbxref=Genbank:NP_217718.1,GeneID:887574;Name=NP_217718.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3202c;product=ATP-dependent DNA helicase;protein_id=NP_217718.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3580286 3580495 . + . ID=gene-Rv3202a;Dbxref=GeneID:19394685;Name=Rv3202a;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3202a
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3580286 3580495 . + 0 ID=cds-YP_009030044.1;Parent=gene-Rv3202a;Dbxref=Genbank:YP_009030044.1,GeneID:19394685;Name=YP_009030044.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3202a;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030044.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3580638 3581312 . + . ID=gene-Rv3203;Dbxref=GeneID:888133;Name=lipV;gbkey=Gene;gene=lipV;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3203
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3580638 3581312 . + 0 ID=cds-NP_217719.1;Parent=gene-Rv3203;Dbxref=Genbank:NP_217719.1,GeneID:888133;Name=NP_217719.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=lipV;inference=protein motif:PROSITE:PS00120;locus_tag=Rv3203;product=lipase LipV;protein_id=NP_217719.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3585677 3585949 . - . ID=gene-Rv3208A;Dbxref=GeneID:3205107;Name=TB9.4;gbkey=Gene;gene=TB9.4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3208A
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3586274 3586834 . + . ID=gene-Rv3209;Dbxref=GeneID:888875;Name=Rv3209;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3209
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3586274 3586834 . + 0 ID=cds-NP_217725.1;Parent=gene-Rv3209;Dbxref=Genbank:NP_217725.1,GeneID:888875;Name=NP_217725.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3209;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217725.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3586844 3587539 . - . ID=gene-Rv3210c;Dbxref=GeneID:888876;Name=Rv3210c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3210c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3586844 3587539 . - 0 ID=cds-NP_217726.1;Parent=gene-Rv3210c;Dbxref=Genbank:NP_217726.1,GeneID:888876;Name=NP_217726.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3210c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217726.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3587798 3589381 . + . ID=gene-Rv3211;Dbxref=GeneID:888840;Name=rhlE;gbkey=Gene;gene=rhlE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3211
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3587798 3589381 . + 0 ID=cds-NP_217727.1;Parent=gene-Rv3211;Dbxref=Genbank:NP_217727.1,GeneID:888840;Name=NP_217727.1;gbkey=CDS;gene=rhlE;inference=protein motif:PROSITE:PS00039;locus_tag=Rv3211;product=ATP-dependent RNA helicase RhlE;protein_id=NP_217727.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3589394 3590617 . + . ID=gene-Rv3212;Dbxref=GeneID:887931;Name=Rv3212;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3212
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3589394 3590617 . + 0 ID=cds-NP_217728.1;Parent=gene-Rv3212;Dbxref=Genbank:NP_217728.1,GeneID:887931;Name=NP_217728.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3212;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217728.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3590692 3591492 . - . ID=gene-Rv3213c;Dbxref=GeneID:888896;Name=Rv3213c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3213c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3590692 3591492 . - 0 ID=cds-NP_217729.1;Parent=gene-Rv3213c;Dbxref=Genbank:NP_217729.1,GeneID:888896;Name=NP_217729.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3213c;product=SOJ/ParA-like protein;protein_id=NP_217729.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3591493 3591569 . - . ID=id-NC_000962.3:3591493..3591569;Note=77 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass I;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3591646 3592257 . + . ID=gene-Rv3214;Dbxref=GeneID:888830;Name=gpm2;gbkey=Gene;gene=gpm2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=entD;locus_tag=Rv3214
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3591646 3592257 . + 0 ID=cds-YP_177944.1;Parent=gene-Rv3214;Dbxref=Genbank:YP_177944.1,GeneID:888830;Name=YP_177944.1;Note=Gpm2 (phosphoglyceromutase) (PGAM) (BPG-dependent PGAM);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gpm2;locus_tag=Rv3214;product=phosphoglycerate mutase;protein_id=YP_177944.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3592254 3593372 . + . ID=gene-Rv3215;Dbxref=GeneID:888824;Name=entC;gbkey=Gene;gene=entC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3215
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3592254 3593372 . + 0 ID=cds-NP_217731.1;Parent=gene-Rv3215;Dbxref=Genbank:NP_217731.1,GeneID:888824;Name=NP_217731.1;Note=isochorismate hydroxymutase (enterochelin biosynthesis);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=entC;locus_tag=Rv3215;product=isochorismate synthase;protein_id=NP_217731.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3593369 3593852 . + . ID=gene-Rv3216;Dbxref=GeneID:888845;Name=Rv3216;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3216;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3593369 3593437 . + . ID=id-Rv3216;Dbxref=PSEUDO:CCP46032.1,GeneID:888845;Note=acetyltransferase (2.3.1.-)%2C contains GNAT domain (GCN5-like N-acetyltransferase. See Vetting et al. 2005)%2C probably pseudogene as appears frameshifted due to 1bp insertion at position 3593438. Frameshift present in all sequenced tubercle bacilli. Start changed since first submission%2C extended by 50aa.;gbkey=misc_feature;is_ordered=true;locus_tag=Rv3216;part=1/2;partial=true;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3593439 3593852 . + . ID=id-Rv3216;Dbxref=PSEUDO:CCP46032.1,GeneID:888845;Note=acetyltransferase (2.3.1.-)%2C contains GNAT domain (GCN5-like N-acetyltransferase. See Vetting et al. 2005)%2C probably pseudogene as appears frameshifted due to 1bp insertion at position 3593438. Frameshift present in all sequenced tubercle bacilli. Start changed since first submission%2C extended by 50aa.;gbkey=misc_feature;is_ordered=true;locus_tag=Rv3216;part=2/2;partial=true;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 3593804 3594235 . - . ID=gene-Rv3217c;Dbxref=GeneID:888843;Name=Rv3217c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3217c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3593804 3594235 . - 0 ID=cds-NP_217733.1;Parent=gene-Rv3217c;Dbxref=Genbank:NP_217733.1,GeneID:888843;Name=NP_217733.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3217c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217733.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3594468 3595433 . + . ID=gene-Rv3218;Dbxref=GeneID:888906;Name=Rv3218;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3218
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3594468 3595433 . + 0 ID=cds-NP_217734.1;Parent=gene-Rv3218;Dbxref=Genbank:NP_217734.1,GeneID:888906;Name=NP_217734.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3218;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217734.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3595713 3595967 . + . ID=gene-Rv3219;Dbxref=GeneID:887980;Name=whiB1;gbkey=Gene;gene=whiB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=whmE;locus_tag=Rv3219
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3595713 3595967 . + 0 ID=cds-NP_217735.1;Parent=gene-Rv3219;Dbxref=Genbank:NP_217735.1,GeneID:887980;Name=NP_217735.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:20929442];gbkey=CDS;gene=whiB1;locus_tag=Rv3219;product=transcriptional regulator WhiB1;protein_id=NP_217735.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3596029 3597534 . - . ID=gene-Rv3220c;Dbxref=GeneID:888801;Name=Rv3220c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3220c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3596029 3597534 . - 0 ID=cds-NP_217736.1;Parent=gene-Rv3220c;Dbxref=Genbank:NP_217736.1,GeneID:888801;Name=NP_217736.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:16026786];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3220c;product=two component sensor kinase;protein_id=NP_217736.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3597551 3597766 . - . ID=gene-Rv3221c;Dbxref=GeneID:888096;Name=TB7.3;gbkey=Gene;gene=TB7.3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3221c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3597551 3597766 . - 0 ID=cds-NP_217737.1;Parent=gene-Rv3221c;Dbxref=Genbank:NP_217737.1,GeneID:888096;Name=NP_217737.1;Note=TB7.3%2CBiotinylated protein;gbkey=CDS;gene=TB7.3;locus_tag=Rv3221c;product=acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit;protein_id=NP_217737.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3598051 3598356 . - . ID=gene-Rv3221A;Dbxref=GeneID:3205091;Name=rshA;gbkey=Gene;gene=rshA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3221A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3598051 3598356 . - 0 ID=cds-YP_177945.1;Parent=gene-Rv3221A;Dbxref=Genbank:YP_177945.1,GeneID:3205091;Name=YP_177945.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:14617153];gbkey=CDS;gene=rshA;locus_tag=Rv3221A;product=anti-sigma factor RshA;protein_id=YP_177945.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3598353 3598904 . - . ID=gene-Rv3222c;Dbxref=GeneID:887655;Name=Rv3222c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3222c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3598353 3598904 . - 0 ID=cds-NP_217738.1;Parent=gene-Rv3222c;Dbxref=Genbank:NP_217738.1,GeneID:887655;Name=NP_217738.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3222c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217738.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3598901 3599551 . - . ID=gene-Rv3223c;Dbxref=GeneID:888094;Name=sigH;gbkey=Gene;gene=sigH;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rpoE;locus_tag=Rv3223c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3598901 3599551 . - 0 ID=cds-NP_217739.1;Parent=gene-Rv3223c;Dbxref=Genbank:NP_217739.1,GeneID:888094;Name=NP_217739.1;Note=belongs to the sigma-70 factor family%2C ECF subfamily;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=sigH;inference=protein motif:PROSITE:PS01063;locus_tag=Rv3223c;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigH;protein_id=NP_217739.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3599851 3600699 . + . ID=gene-Rv3224;Dbxref=GeneID:888852;Name=Rv3224;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3224
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3599851 3600699 . + 0 ID=cds-NP_217740.1;Parent=gene-Rv3224;Dbxref=Genbank:NP_217740.1,GeneID:888852;Name=NP_217740.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3224;product=iron-regulated short-chain dehydrogenase/reductase;protein_id=NP_217740.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3601016 3602440 . - . ID=gene-Rv3225c;Dbxref=GeneID:888804;Name=Rv3225c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3225c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3601016 3602440 . - 0 ID=cds-NP_217742.1;Parent=gene-Rv3225c;Dbxref=Genbank:NP_217742.1,GeneID:888804;Name=NP_217742.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3225c;product=GCN5-like N-acetyltransferase;protein_id=NP_217742.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3602564 3603322 . - . ID=gene-Rv3226c;Dbxref=GeneID:888220;Name=Rv3226c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3226c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3602564 3603322 . - 0 ID=cds-NP_217743.1;Parent=gene-Rv3226c;Dbxref=Genbank:NP_217743.1,GeneID:888220;Name=NP_217743.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3226c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217743.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3603377 3604729 . + . ID=gene-Rv3227;Dbxref=GeneID:888753;Name=aroA;gbkey=Gene;gene=aroA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3227
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3603377 3604729 . + 0 ID=cds-NP_217744.1;Parent=gene-Rv3227;Dbxref=Genbank:NP_217744.1,GeneID:888753;Name=NP_217744.1;Note=5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSP synthase) (EPSPS);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:2123856];gbkey=CDS;gene=aroA;inference=protein motif:PROSITE:PS00885;locus_tag=Rv3227;product=3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase;protein_id=NP_217744.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3604726 3605718 . + . ID=gene-Rv3228;Dbxref=GeneID:888785;Name=Rv3228;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3228
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3605751 3607034 . - . ID=gene-Rv3229c;Dbxref=GeneID:888821;Name=desA3;gbkey=Gene;gene=desA3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3229c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3614457 3617603 . - . ID=gene-Rv3239c;Dbxref=GeneID:888856;Name=Rv3239c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3239c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3617682 3620531 . - . ID=gene-Rv3240c;Dbxref=GeneID:888860;Name=secA1;gbkey=Gene;gene=secA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=secA;locus_tag=Rv3240c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3620610 3621254 . - . ID=gene-Rv3241c;Dbxref=GeneID:888849;Name=Rv3241c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3241c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3620610 3621254 . - 0 ID=cds-NP_217758.3;Parent=gene-Rv3241c;Dbxref=Genbank:NP_217758.3,GeneID:888849;Name=NP_217758.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3241c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217758.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3621570 3622211 . - . ID=gene-Rv3242c;Dbxref=GeneID:888757;Name=Rv3242c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3242c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3621570 3622211 . - 0 ID=cds-NP_217759.1;Parent=gene-Rv3242c;Dbxref=Genbank:NP_217759.1,GeneID:888757;Name=NP_217759.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00103;locus_tag=Rv3242c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217759.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3622249 3623091 . - . ID=gene-Rv3243c;Dbxref=GeneID:888810;Name=Rv3243c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3243c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3622249 3623091 . - 0 ID=cds-NP_217760.1;Parent=gene-Rv3243c;Dbxref=Genbank:NP_217760.1,GeneID:888810;Name=NP_217760.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3243c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217760.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3623159 3624910 . - . ID=gene-Rv3244c;Dbxref=GeneID:888815;Name=lpqB;gbkey=Gene;gene=lpqB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3244c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3623159 3624910 . - 0 ID=cds-NP_217761.1;Parent=gene-Rv3244c;Dbxref=Genbank:NP_217761.1,GeneID:888815;Name=NP_217761.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqB;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3244c;product=lipoprotein LpqB;protein_id=NP_217761.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3624910 3626613 . - . ID=gene-Rv3245c;Dbxref=GeneID:888719;Name=mtrB;gbkey=Gene;gene=mtrB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3245c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3624910 3626613 . - 0 ID=cds-NP_217762.1;Parent=gene-Rv3245c;Dbxref=Genbank:NP_217762.1,GeneID:888719;Name=NP_217762.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:22610443];gbkey=CDS;gene=mtrB;locus_tag=Rv3245c;product=two component sensory histidine kinase MtrB;protein_id=NP_217762.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3626614 3626666 . - . ID=id-NC_000962.3:3626614..3626666;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3626663 3627349 . - . ID=gene-Rv3246c;Dbxref=GeneID:888743;Name=mtrA;gbkey=Gene;gene=mtrA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3246c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3626663 3627349 . - 0 ID=cds-NP_217763.1;Parent=gene-Rv3246c;Dbxref=Genbank:NP_217763.1,GeneID:888743;Name=NP_217763.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=mtrA;locus_tag=Rv3246c;product=two component DNA-binding response regulator MtrA;protein_id=NP_217763.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3627419 3628063 . - . ID=gene-Rv3247c;Dbxref=GeneID:888740;Name=tmk;gbkey=Gene;gene=tmk;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3247c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3627419 3628063 . - 0 ID=cds-NP_217764.1;Parent=gene-Rv3247c;Dbxref=Genbank:NP_217764.1,GeneID:888740;Name=NP_217764.1;Note=Tmk (dTMP kinase) (thymidylic acid kinase) (TMPK);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=tmk;locus_tag=Rv3247c;product=thymidylate kinase;protein_id=NP_217764.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3628160 3629647 . - . ID=gene-Rv3248c;Dbxref=GeneID:888746;Name=sahH;gbkey=Gene;gene=sahH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3248c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3628160 3629647 . - 0 ID=cds-NP_217765.1;Parent=gene-Rv3248c;Dbxref=Genbank:NP_217765.1,GeneID:888746;Name=NP_217765.1;Note=S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (adohcyase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:18815415];gbkey=CDS;gene=sahH;inference=protein motif:PROSITE:PS00739;locus_tag=Rv3248c;product=adenosylhomocysteinase;protein_id=NP_217765.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3629752 3630387 . - . ID=gene-Rv3249c;Dbxref=GeneID:888741;Name=Rv3249c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3249c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3629752 3630387 . - 0 ID=cds-NP_217766.1;Parent=gene-Rv3249c;Dbxref=Genbank:NP_217766.1,GeneID:888741;Name=NP_217766.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3249c;product=TetR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217766.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3630384 3630566 . - . ID=gene-Rv3250c;Dbxref=GeneID:888744;Name=rubB;gbkey=Gene;gene=rubB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3250c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3630384 3630566 . - 0 ID=cds-NP_217767.1;Parent=gene-Rv3250c;Dbxref=Genbank:NP_217767.1,GeneID:888744;Name=NP_217767.1;gbkey=CDS;gene=rubB;inference=protein motif:PROSITE:PS00202;locus_tag=Rv3250c;product=rubredoxin RubB;protein_id=NP_217767.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3630571 3630738 . - . ID=gene-Rv3251c;Dbxref=GeneID:888747;Name=rubA;gbkey=Gene;gene=rubA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3251c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3630571 3630738 . - 0 ID=cds-NP_217768.1;Parent=gene-Rv3251c;Dbxref=Genbank:NP_217768.1,GeneID:888747;Name=NP_217768.1;gbkey=CDS;gene=rubA;inference=protein motif:PROSITE:PS00202;locus_tag=Rv3251c;product=rubredoxin RubA;protein_id=NP_217768.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3630738 3631988 . - . ID=gene-Rv3252c;Dbxref=GeneID:888690;Name=alkB;gbkey=Gene;gene=alkB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3252c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3630738 3631988 . - 0 ID=cds-NP_217769.1;Parent=gene-Rv3252c;Dbxref=Genbank:NP_217769.1,GeneID:888690;Name=NP_217769.1;Note=alkane 1-hydroxylase (lauric acid omega-hydroxylase) (omega-hydroxylase) (fatty acid omega-hydroxylase) (alkane hydroxylase-rubredoxin);gbkey=CDS;gene=alkB;locus_tag=Rv3252c;product=transmembrane alkane 1-monooxygenase AlkB;protein_id=NP_217769.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3632097 3633584 . - . ID=gene-Rv3253c;Dbxref=GeneID:888739;Name=Rv3253c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3253c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3632097 3633584 . - 0 ID=cds-NP_217770.1;Parent=gene-Rv3253c;Dbxref=Genbank:NP_217770.1,GeneID:888739;Name=NP_217770.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3253c;product=cationic amino acid transport integral membrane protein;protein_id=NP_217770.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3633675 3635063 . + . ID=gene-Rv3254;Dbxref=GeneID:887237;Name=Rv3254;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3254
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3633675 3635063 . + 0 ID=cds-NP_217771.1;Parent=gene-Rv3254;Dbxref=Genbank:NP_217771.1,GeneID:887237;Name=NP_217771.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3254;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217771.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3635041 3636267 . - . ID=gene-Rv3255c;Dbxref=GeneID:888698;Name=manA;gbkey=Gene;gene=manA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3255c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3635041 3636267 . - 0 ID=cds-NP_217772.1;Parent=gene-Rv3255c;Dbxref=Genbank:NP_217772.1,GeneID:888698;Name=NP_217772.1;Note=phosphomannose isomerase (phosphomannoisomerase) (PMI) (phosphohexoisomerase) (phosphohexomutase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=manA;locus_tag=Rv3255c;product=mannose-6-phosphate isomerase;protein_id=NP_217772.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3636275 3637315 . - . ID=gene-Rv3256c;Dbxref=GeneID:888696;Name=Rv3256c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3256c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3636275 3637315 . - 0 ID=cds-NP_217773.1;Parent=gene-Rv3256c;Dbxref=Genbank:NP_217773.1,GeneID:888696;Name=NP_217773.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3256c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217773.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3637312 3638709 . - . ID=gene-Rv3257c;Dbxref=GeneID:888699;Name=pmmA;gbkey=Gene;gene=pmmA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3257c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3638811 3639302 . - . ID=gene-Rv3258c;Dbxref=GeneID:888694;Name=Rv3258c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3258c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3644898 3645977 . - . ID=gene-Rv3264c;Dbxref=GeneID:888715;Name=manB;gbkey=Gene;gene=manB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=hddC;locus_tag=Rv3264c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3644898 3645977 . - 0 ID=cds-YP_177951.1;Parent=gene-Rv3264c;Dbxref=Genbank:YP_177951.1,GeneID:888715;Name=YP_177951.1;Note=D-alpha-D-heptose-1-phosphate guanylyltransferase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=manB;locus_tag=Rv3264c;product=D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase ManB;protein_id=YP_177951.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3645979 3646884 . - . ID=gene-Rv3265c;Dbxref=GeneID:888714;Name=wbbL1;gbkey=Gene;gene=wbbL1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=wbbL;locus_tag=Rv3265c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3646895 3647809 . - . ID=gene-Rv3266c;Dbxref=GeneID:888704;Name=rmlD;gbkey=Gene;gene=rmlD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3266c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3647885 3649381 . + . ID=gene-Rv3267;Dbxref=GeneID:888713;Name=Rv3267;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3267
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3647885 3649381 . + 0 ID=cds-NP_217784.1;Parent=gene-Rv3267;Dbxref=Genbank:NP_217784.1,GeneID:888713;Name=NP_217784.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3267;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217784.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3649420 3650109 . + . ID=gene-Rv3268;Dbxref=GeneID:888703;Name=Rv3268;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3268
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3650234 3650515 . + . ID=gene-Rv3269;Dbxref=GeneID:888709;Name=Rv3269;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3269
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3650234 3650515 . + 0 ID=cds-NP_217786.1;Parent=gene-Rv3269;Dbxref=Genbank:NP_217786.1,GeneID:888709;Name=NP_217786.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3269;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217786.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3650526 3652682 . + . ID=gene-Rv3270;Dbxref=GeneID:888705;Name=ctpC;gbkey=Gene;gene=ctpC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3270
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3650526 3652682 . + 0 ID=cds-NP_217787.1;Parent=gene-Rv3270;Dbxref=Genbank:NP_217787.1,GeneID:888705;Name=NP_217787.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ctpC;inference=protein motif:PROSITE:PS00154;locus_tag=Rv3270;product=manganese/zinc-exporting P-type ATPase;protein_id=NP_217787.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3652679 3653347 . - . ID=gene-Rv3271c;Dbxref=GeneID:888716;Name=Rv3271c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3271c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3652679 3653347 . - 0 ID=cds-NP_217788.1;Parent=gene-Rv3271c;Dbxref=Genbank:NP_217788.1,GeneID:888716;Name=NP_217788.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3271c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217788.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3653448 3654632 . + . ID=gene-Rv3272;Dbxref=GeneID:888702;Name=Rv3272;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3272
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3653448 3654632 . + 0 ID=cds-NP_217789.1;Parent=gene-Rv3272;Dbxref=Genbank:NP_217789.1,GeneID:888702;Name=NP_217789.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3272;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217789.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3654637 3656931 . + . ID=gene-Rv3273;Dbxref=GeneID:888700;Name=Rv3273;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3273
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3654637 3656931 . + 0 ID=cds-NP_217790.1;Parent=gene-Rv3273;Dbxref=Genbank:NP_217790.1,GeneID:888700;Name=NP_217790.1;Note=carbonate dehydratase (carbonic dehydratase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00704;locus_tag=Rv3273;product=transmembrane carbonic anhydrase;protein_id=NP_217790.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3656920 3658089 . - . ID=gene-Rv3274c;Dbxref=GeneID:888731;Name=fadE25;gbkey=Gene;gene=fadE25;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3274c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3656920 3658089 . - 0 ID=cds-NP_217791.1;Parent=gene-Rv3274c;Dbxref=Genbank:NP_217791.1,GeneID:888731;Name=NP_217791.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE25;inference=protein motif:PROSITE:PS00073;locus_tag=Rv3274c;product=acyl-CoA dehydrogenase;protein_id=NP_217791.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3658114 3658638 . - . ID=gene-Rv3275c;Dbxref=GeneID:888721;Name=purE;gbkey=Gene;gene=purE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3275c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3658114 3658638 . - 0 ID=cds-NP_217792.1;Parent=gene-Rv3275c;Dbxref=Genbank:NP_217792.1,GeneID:888721;Name=NP_217792.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=purE;locus_tag=Rv3275c;product=5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase;protein_id=NP_217792.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3658635 3659924 . - . ID=gene-Rv3276c;Dbxref=GeneID:888720;Name=purK;gbkey=Gene;gene=purK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3276c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3658635 3659924 . - 0 ID=cds-NP_217793.1;Parent=gene-Rv3276c;Dbxref=Genbank:NP_217793.1,GeneID:888720;Name=NP_217793.1;Note=air carboxylase (AIRC);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=purK;locus_tag=Rv3276c;product=5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase;protein_id=NP_217793.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3658658 3658715 . - . ID=id-Rv3276c;Dbxref=GeneID:888720;Note=58 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region;gene=purK;locus_tag=Rv3276c
+NC_000962.3 RefSeq gene 3659878 3660696 . + . ID=gene-Rv3277;Dbxref=GeneID:888729;Name=Rv3277;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3277
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3659878 3660696 . + 0 ID=cds-NP_217794.1;Parent=gene-Rv3277;Dbxref=Genbank:NP_217794.1,GeneID:888729;Name=NP_217794.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv3277;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217794.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3660651 3661169 . - . ID=gene-Rv3278c;Dbxref=GeneID:888724;Name=Rv3278c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3278c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3660651 3661169 . - 0 ID=cds-NP_217795.1;Parent=gene-Rv3278c;Dbxref=Genbank:NP_217795.1,GeneID:888724;Name=NP_217795.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3278c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217795.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3661212 3662012 . - . ID=gene-Rv3279c;Dbxref=GeneID:888726;Name=birA;gbkey=Gene;gene=birA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3279c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3661212 3662012 . - 0 ID=cds-NP_217796.1;Parent=gene-Rv3279c;Dbxref=Genbank:NP_217796.1,GeneID:888726;Name=NP_217796.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=birA;locus_tag=Rv3279c;product=bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase;protein_id=NP_217796.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3662062 3663708 . + . ID=gene-Rv3280;Dbxref=GeneID:888725;Name=accD5;gbkey=Gene;gene=accD5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3280
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3662062 3663708 . + 0 ID=cds-NP_217797.1;Parent=gene-Rv3280;Dbxref=Genbank:NP_217797.1,GeneID:888725;Name=NP_217797.1;Note=pccase (propanoyl-CoA:carbon dioxide ligase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=accD5;locus_tag=Rv3280;product=propionyl-CoA carboxylase subunit beta;protein_id=NP_217797.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3663689 3664222 . + . ID=gene-Rv3281;Dbxref=GeneID:888732;Name=accE5;gbkey=Gene;gene=accE5;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3281
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3663689 3664222 . + 0 ID=cds-NP_217798.1;Parent=gene-Rv3281;Dbxref=Genbank:NP_217798.1,GeneID:888732;Name=NP_217798.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=accE5;locus_tag=Rv3281;product=bifunctional protein acetyl-/propionyl-CoAcarboxylase subunit epsilon AccE;protein_id=NP_217798.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3664219 3664887 . + . ID=gene-Rv3282;Dbxref=GeneID:888718;Name=Rv3282;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3282
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3664219 3664887 . + 0 ID=cds-NP_217799.1;Parent=gene-Rv3282;Dbxref=Genbank:NP_217799.1,GeneID:888718;Name=NP_217799.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3282;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217799.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3664928 3665821 . + . ID=gene-Rv3283;Dbxref=GeneID:888717;Name=sseA;gbkey=Gene;gene=sseA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3283
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3664928 3665821 . + 0 ID=cds-NP_217800.1;Parent=gene-Rv3283;Dbxref=Genbank:NP_217800.1,GeneID:888717;Name=NP_217800.1;Note=rhodanese (thiosulfate cyanide transsulfurase) (thiosulfate thiotransferase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=sseA;inference=protein motif:PROSITE:PS00683;locus_tag=Rv3283;product=thiosulfate sulfurtransferase SseA;protein_id=NP_217800.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3665818 3666249 . + . ID=gene-Rv3284;Dbxref=GeneID:887966;Name=Rv3284;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3284
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3665818 3666249 . + 0 ID=cds-NP_217801.1;Parent=gene-Rv3284;Dbxref=Genbank:NP_217801.1,GeneID:887966;Name=NP_217801.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3284;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217801.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3689457 3690938 . - . ID=gene-Rv3303c;Dbxref=GeneID:887659;Name=lpdA;gbkey=Gene;gene=lpdA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3303c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3689457 3690938 . - 0 ID=cds-NP_217820.1;Parent=gene-Rv3303c;Dbxref=Genbank:NP_217820.1,GeneID:887659;Name=NP_217820.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:17097323];gbkey=CDS;gene=lpdA;locus_tag=Rv3303c;product=NAD(P)H quinone reductase LpdA;protein_id=NP_217820.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3691141 3691620 . + . ID=gene-Rv3304;Dbxref=GeneID:887605;Name=Rv3304;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3304
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3691141 3691620 . + 0 ID=cds-NP_217821.1;Parent=gene-Rv3304;Dbxref=Genbank:NP_217821.1,GeneID:887605;Name=NP_217821.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3304;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217821.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3691639 3692808 . - . ID=gene-Rv3305c;Dbxref=GeneID:887545;Name=amiA1;gbkey=Gene;gene=amiA1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=amiA;locus_tag=Rv3305c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3692805 3693989 . - . ID=gene-Rv3306c;Dbxref=GeneID:887645;Name=amiB1;gbkey=Gene;gene=amiB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=amiB;locus_tag=Rv3306c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3692805 3693989 . - 0 ID=cds-YP_177956.1;Parent=gene-Rv3306c;Dbxref=Genbank:YP_177956.1,GeneID:887645;Name=YP_177956.1;Note=aminohydrolase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=amiB1;locus_tag=Rv3306c;product=amidase AmiB;protein_id=YP_177956.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3694054 3694860 . + . ID=gene-Rv3307;Dbxref=GeneID:887542;Name=deoD;gbkey=Gene;gene=deoD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=punA;locus_tag=Rv3307
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3694054 3694860 . + 0 ID=cds-NP_217824.1;Parent=gene-Rv3307;Dbxref=Genbank:NP_217824.1,GeneID:887542;Name=NP_217824.1;Note=inosine phosphorylase (PNP);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:11444966];gbkey=CDS;gene=deoD;locus_tag=Rv3307;product=purine nucleoside phosphorylase;protein_id=NP_217824.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3694864 3696468 . + . ID=gene-Rv3308;Dbxref=GeneID:887541;Name=pmmB;gbkey=Gene;gene=pmmB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3308
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3694864 3696468 . + 0 ID=cds-NP_217825.1;Parent=gene-Rv3308;Dbxref=Genbank:NP_217825.1,GeneID:887541;Name=NP_217825.1;Note=phosphomannose mutase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pmmB;inference=protein motif:PROSITE:PS00710;locus_tag=Rv3308;product=phosphomannomutase PmmB;protein_id=NP_217825.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3696470 3697093 . - . ID=gene-Rv3309c;Dbxref=GeneID:887944;Name=upp;gbkey=Gene;gene=upp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3309c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3697198 3698097 . + . ID=gene-Rv3310;Dbxref=GeneID:887988;Name=sapM;gbkey=Gene;gene=sapM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3310
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3697198 3698097 . + 0 ID=cds-NP_217827.1;Parent=gene-Rv3310;Dbxref=Genbank:NP_217827.1,GeneID:887988;Name=NP_217827.1;Note=acid phosphomonoesterase (phosphomonoesterase) (glycerophosphatase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sapM;locus_tag=Rv3310;product=acid phosphatase;protein_id=NP_217827.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3698121 3699383 . + . ID=gene-Rv3311;Dbxref=GeneID:887533;Name=Rv3311;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3311
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3698121 3699383 . + 0 ID=cds-NP_217828.1;Parent=gene-Rv3311;Dbxref=Genbank:NP_217828.1,GeneID:887533;Name=NP_217828.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3311;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217828.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3699404 3700330 . - . ID=gene-Rv3312c;Dbxref=GeneID:887939;Name=Rv3312c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3312c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3699404 3700330 . - 0 ID=cds-NP_217829.1;Parent=gene-Rv3312c;Dbxref=Genbank:NP_217829.1,GeneID:887939;Name=NP_217829.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3312c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217829.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3700356 3700526 . - . ID=gene-Rv3312b;Dbxref=GeneID:19394686;Name=Rv3312b;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3312b
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3700356 3700526 . - 0 ID=cds-YP_009030045.1;Parent=gene-Rv3312b;Dbxref=Genbank:YP_009030045.1,GeneID:19394686;Name=YP_009030045.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3312b;product=hypothetical protein;protein_id=YP_009030045.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3700705 3701016 . - . ID=gene-Rv3312A;Dbxref=GeneID:3205113;Name=Rv3312A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3312A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3700705 3701016 . - 0 ID=cds-YP_177957.1;Parent=gene-Rv3312A;Dbxref=Genbank:YP_177957.1,GeneID:3205113;Name=YP_177957.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17360408];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3312A;product=pilin;protein_id=YP_177957.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3701087 3702184 . - . ID=gene-Rv3313c;Dbxref=GeneID:887994;Name=add;gbkey=Gene;gene=add;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3313c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3701087 3702184 . - 0 ID=cds-NP_217830.1;Parent=gene-Rv3313c;Dbxref=Genbank:NP_217830.1,GeneID:887994;Name=NP_217830.1;Note=Add (adenosine aminohydrolase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=add;locus_tag=Rv3313c;product=adenosine deaminase;protein_id=NP_217830.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3702184 3703467 . - . ID=gene-Rv3314c;Dbxref=GeneID:887929;Name=deoA;gbkey=Gene;gene=deoA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3314c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3702184 3703467 . - 0 ID=cds-NP_217831.1;Parent=gene-Rv3314c;Dbxref=Genbank:NP_217831.1,GeneID:887929;Name=NP_217831.1;Note=tdrpase (pyrimidine phosphorylase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=deoA;inference=protein motif:PROSITE:PS00647;locus_tag=Rv3314c;product=thymidine phosphorylase;protein_id=NP_217831.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3703464 3703865 . - . ID=gene-Rv3315c;Dbxref=GeneID:887975;Name=cdd;gbkey=Gene;gene=cdd;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3315c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3703464 3703865 . - 0 ID=cds-NP_217832.1;Parent=gene-Rv3315c;Dbxref=Genbank:NP_217832.1,GeneID:887975;Name=NP_217832.1;Note=Cdd (cytidine aminohydrolase) (cytidine nucleoside deaminase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cdd;inference=protein motif:PROSITE:PS00903;locus_tag=Rv3315c;product=cytidine deaminase;protein_id=NP_217832.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3704102 3704440 . + . ID=gene-Rv3316;Dbxref=GeneID:887969;Name=sdhC;gbkey=Gene;gene=sdhC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3316
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3704102 3704440 . + 0 ID=cds-NP_217833.1;Parent=gene-Rv3316;Dbxref=Genbank:NP_217833.1,GeneID:887969;Name=NP_217833.1;Note=SdhC (succinic dehydrogenase) (fumarate reductase) (fumarate dehydrogenase) (fumaric hydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sdhC;locus_tag=Rv3316;product=succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit;protein_id=NP_217833.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3704437 3704871 . + . ID=gene-Rv3317;Dbxref=GeneID:887845;Name=sdhD;gbkey=Gene;gene=sdhD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3317
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3704437 3704871 . + 0 ID=cds-NP_217834.1;Parent=gene-Rv3317;Dbxref=Genbank:NP_217834.1,GeneID:887845;Name=NP_217834.1;Note=SdhD (succinic dehydrogenase) (fumarate reductase) (fumarate dehydrogenase) (fumaric hydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sdhD;locus_tag=Rv3317;product=succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor subunit;protein_id=NP_217834.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3704895 3705004 . - . ID=id-NC_000962.3:3704895..3705004;Note=110 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3705000 3706772 . + . ID=gene-Rv3318;Dbxref=GeneID:887639;Name=sdhA;gbkey=Gene;gene=sdhA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3318
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3705000 3706772 . + 0 ID=cds-NP_217835.1;Parent=gene-Rv3318;Dbxref=Genbank:NP_217835.1,GeneID:887639;Name=NP_217835.1;Note=SdhA (succinic dehydrogenase) (fumarate reductase) (fumarate dehydrogenase) (fumaric hydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sdhA;inference=protein motif:PROSITE:PS00504;locus_tag=Rv3318;product=succinate dehydrogenase flavoprotein subunit;protein_id=NP_217835.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3706772 3707563 . + . ID=gene-Rv3319;Dbxref=GeneID:887562;Name=sdhB;gbkey=Gene;gene=sdhB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3319
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3706772 3707563 . + 0 ID=cds-NP_217836.1;Parent=gene-Rv3319;Dbxref=Genbank:NP_217836.1,GeneID:887562;Name=NP_217836.1;Note=SdhB (succinic dehydrogenase) (fumarate reductase) (fumarate dehydrogenase) (fumaric hydrogenase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=sdhB;inference=protein motif:PROSITE:PS00198;locus_tag=Rv3319;product=succinate dehydrogenase iron-sulphur protein subunit;protein_id=NP_217836.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3707642 3708070 . - . ID=gene-Rv3320c;Dbxref=GeneID:887245;Name=vapC44;gbkey=Gene;gene=vapC44;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3320c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3707642 3708070 . - 0 ID=cds-NP_217837.1;Parent=gene-Rv3320c;Dbxref=Genbank:NP_217837.1,GeneID:887245;Name=NP_217837.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0300%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC44;locus_tag=Rv3320c;product=ribonuclease VapC44;protein_id=NP_217837.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3708074 3708316 . - . ID=gene-Rv3321c;Dbxref=GeneID:887577;Name=vapB44;gbkey=Gene;gene=vapB44;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3321c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3708074 3708316 . - 0 ID=cds-NP_217838.1;Parent=gene-Rv3321c;Dbxref=Genbank:NP_217838.1,GeneID:887577;Name=NP_217838.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv0299;gbkey=CDS;gene=vapB44;locus_tag=Rv3321c;product=antitoxin VapB44;protein_id=NP_217838.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3708438 3709052 . - . ID=gene-Rv3322c;Dbxref=GeneID:887520;Name=Rv3322c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3322c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3708438 3709052 . - 0 ID=cds-YP_177958.1;Parent=gene-Rv3322c;Dbxref=Genbank:YP_177958.1,GeneID:887520;Name=YP_177958.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3322c;product=methyltransferase;protein_id=YP_177958.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3709049 3709714 . - . ID=gene-Rv3323c;Dbxref=GeneID:887578;Name=moaX;gbkey=Gene;gene=moaX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3323c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3709049 3709714 . - 0 ID=cds-YP_177959.1;Parent=gene-Rv3323c;Dbxref=Genbank:YP_177959.1,GeneID:887578;Name=YP_177959.1;gbkey=CDS;gene=moaX;locus_tag=Rv3323c;product=MoaD-MoaE fusion protein MoaX;protein_id=YP_177959.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3709715 3710248 . - . ID=gene-Rv3324c;Dbxref=GeneID:887981;Name=moaC3;gbkey=Gene;gene=moaC3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3324c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3709715 3710248 . - 0 ID=cds-NP_217841.3;Parent=gene-Rv3324c;Dbxref=Genbank:NP_217841.3,GeneID:887981;Name=NP_217841.3;Note=molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC3;gbkey=CDS;gene=moaC3;locus_tag=Rv3324c;product=cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein;protein_id=NP_217841.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3710245 3710379 . - . ID=gene-Rv3324A;Dbxref=GeneID:3205081;Name=Rv3324A;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3324A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3710245 3710379 . - . ID=id-Rv3324A;Dbxref=GeneID:3205081;Note=Probable pseudogene moaB3%2Cfragment of pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase%2Cequivalent to C-terminus of MT3426|Q8VJ32 pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase from Mycobacterium tuberculosis strain CDC1551;gbkey=misc_feature;locus_tag=Rv3324A;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3710382 3711736 . + . ID=id-NC_000962.3:3710382..3711736;Note=IS6110-14%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-14
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3710382 3710409 . + . ID=id-NC_000962.3:3710382..3710409;Note=28 bp inverted repeat at left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3710433 3711694 . + . ID=id-NC_000962.3:3710433..3711694;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable transposase for insertion element IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2Cthe sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3711709 3711736 . - . ID=id-NC_000962.3:3711709..3711736;Note=28 bp inverted repeat at right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3711737 3712822 . + . ID=id-NC_000962.3:3711737..3712822;Note=IS1547-2%2C len: 1086 nt. Region corresponding to Insertion sequence IS1547%2C positions 1982 3067 in EM_NEW:MTY13470.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1547-2
+NC_000962.3 RefSeq gene 3711749 3713461 . + . ID=gene-Rv3327;Dbxref=GeneID:887965;Name=Rv3327;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3327
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3711749 3713461 . + 0 ID=cds-NP_217844.1;Parent=gene-Rv3327;Dbxref=Genbank:NP_217844.1,GeneID:887965;Name=NP_217844.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3327;product=transposase fusion protein;protein_id=NP_217844.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3713394 3714332 . - . ID=gene-Rv3328c;Dbxref=GeneID:887964;Name=sigJ;gbkey=Gene;gene=sigJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3328c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3713394 3714332 . - 0 ID=cds-NP_217845.1;Parent=gene-Rv3328c;Dbxref=Genbank:NP_217845.1,GeneID:887964;Name=NP_217845.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15321691];gbkey=CDS;gene=sigJ;locus_tag=Rv3328c;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigJ;protein_id=NP_217845.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3714392 3715708 . + . ID=gene-Rv3329;Dbxref=GeneID:888028;Name=Rv3329;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3329
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3714392 3715708 . + 0 ID=cds-NP_217846.3;Parent=gene-Rv3329;Dbxref=Genbank:NP_217846.3,GeneID:888028;Name=NP_217846.3;Note=Cofactor: pyridoxal phosphate. Could belong to class-III of pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferases.;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3329;product=aminotransferase;protein_id=NP_217846.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3715777 3716994 . + . ID=gene-Rv3330;Dbxref=GeneID:887607;Name=dacB1;gbkey=Gene;gene=dacB1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3330
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3715777 3716994 . + 0 ID=cds-NP_217847.1;Parent=gene-Rv3330;Dbxref=Genbank:NP_217847.1,GeneID:887607;Name=NP_217847.1;Note=D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase) (DD-peptidase) (DD-carboxypeptidase) (PBP) (DD-transpeptidase) (serine-type D-ala-D-ala carboxypeptidase) (D-amino acid hydrolase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=dacB1;locus_tag=Rv3330;product=penicillin-binding protein DacB;protein_id=NP_217847.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3717090 3718598 . + . ID=gene-Rv3331;Dbxref=GeneID:887504;Name=sugI;gbkey=Gene;gene=sugI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3331
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3717090 3718598 . + 0 ID=cds-NP_217848.1;Parent=gene-Rv3331;Dbxref=Genbank:NP_217848.1,GeneID:887504;Name=NP_217848.1;gbkey=CDS;gene=sugI;inference=protein motif:PROSITE:PS00217;locus_tag=Rv3331;product=sugar-transport integral membrane protein SugI;protein_id=NP_217848.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3718595 3719746 . + . ID=gene-Rv3332;Dbxref=GeneID:887518;Name=nagA;gbkey=Gene;gene=nagA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3332
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3718595 3719746 . + 0 ID=cds-NP_217849.1;Parent=gene-Rv3332;Dbxref=Genbank:NP_217849.1,GeneID:887518;Name=NP_217849.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=nagA;locus_tag=Rv3332;product=N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase NagA;protein_id=NP_217849.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3719937 3720782 . - . ID=gene-Rv3333c;Dbxref=GeneID:887632;Name=Rv3333c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3333c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3719937 3720782 . - 0 ID=cds-NP_217850.1;Parent=gene-Rv3333c;Dbxref=Genbank:NP_217850.1,GeneID:887632;Name=NP_217850.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3333c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217850.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3721257 3721697 . + . ID=gene-Rv3334;Dbxref=GeneID:887593;Name=Rv3334;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3334
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3721257 3721697 . + 0 ID=cds-NP_217851.1;Parent=gene-Rv3334;Dbxref=Genbank:NP_217851.1,GeneID:887593;Name=NP_217851.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3334;product=MerR family transcriptional regulator;protein_id=NP_217851.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3721731 3722600 . - . ID=gene-Rv3335c;Dbxref=GeneID:888029;Name=Rv3335c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3335c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3721731 3722600 . - 0 ID=cds-NP_217852.1;Parent=gene-Rv3335c;Dbxref=Genbank:NP_217852.1,GeneID:888029;Name=NP_217852.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3335c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_217852.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3722621 3723631 . - . ID=gene-Rv3336c;Dbxref=GeneID:887559;Name=trpS;gbkey=Gene;gene=trpS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3336c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3722621 3723631 . - 0 ID=cds-NP_217853.1;Parent=gene-Rv3336c;Dbxref=Genbank:NP_217853.1,GeneID:887559;Name=NP_217853.1;Note=tryptophanyl-tRNA synthetase TrpS (TRPRS) (tryptophan translase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=trpS;inference=protein motif:PROSITE:PS00178;locus_tag=Rv3336c;product=tryptophan--tRNA ligase;protein_id=NP_217853.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3723728 3724548 . + . ID=gene-Rv3337;Dbxref=GeneID:887556;Name=Rv3337;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3337;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 3724615 3725844 . - . ID=gene-Rv3339c;Dbxref=GeneID:888013;Name=icd1;gbkey=Gene;gene=icd1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3339c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3724615 3725844 . - 0 ID=cds-NP_217856.1;Parent=gene-Rv3339c;Dbxref=Genbank:NP_217856.1,GeneID:888013;Name=NP_217856.1;Note=NADP Icd1 (oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP+-specific ICDH) (IDP);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=icd1;inference=protein motif:PROSITE:PS00470;locus_tag=Rv3339c;product=isocitrate dehydrogenase;protein_id=NP_217856.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3726127 3727476 . + . ID=gene-Rv3340;Dbxref=GeneID:888037;Name=metC;gbkey=Gene;gene=metC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3340
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+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3754296 3755033 . - . ID=id-Rv3349c;Dbxref=GeneID:888126;Note=IS1561'%2C len: 738 nt. Insertion sequence IS1561'.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1561'
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3767346 3768140 . - . ID=gene-Rv3351c;Dbxref=GeneID:888109;Name=Rv3351c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3351c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3768736 3768996 . - . ID=gene-Rv3353c;Dbxref=GeneID:888095;Name=Rv3353c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3353c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3768736 3768996 . - 0 ID=cds-NP_217870.2;Parent=gene-Rv3353c;Dbxref=Genbank:NP_217870.2,GeneID:888095;Name=NP_217870.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3353c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217870.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3769111 3769500 . + . ID=gene-Rv3354;Dbxref=GeneID:887643;Name=Rv3354;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3354
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3769111 3769500 . + 0 ID=cds-NP_217871.1;Parent=gene-Rv3354;Dbxref=Genbank:NP_217871.1,GeneID:887643;Name=NP_217871.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3354;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217871.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3770773 3771048 . + . ID=gene-Rv3357;Dbxref=GeneID:888135;Name=relJ;gbkey=Gene;gene=relJ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=relB3,yefM;locus_tag=Rv3357
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3770773 3771048 . + 0 ID=cds-NP_217874.1;Parent=gene-Rv3357;Dbxref=Genbank:NP_217874.1,GeneID:888135;Name=NP_217874.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv3358;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:19114484];gbkey=CDS;gene=relJ;locus_tag=Rv3357;product=antitoxin RelJ;protein_id=NP_217874.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3770994 3771091 . + . ID=id-NC_000962.3:3770994..3771091;Note=98 bp imperfect direct repeat 2%2C 82/98 bp identical to the first copy at 3743508..3743605;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3771045 3771302 . + . ID=gene-Rv3358;Dbxref=GeneID:888139;Name=relK;gbkey=Gene;gene=relK;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=relE3,yoeB;locus_tag=Rv3358
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3771045 3771302 . + 0 ID=cds-NP_217875.1;Parent=gene-Rv3358;Dbxref=Genbank:NP_217875.1,GeneID:888139;Name=NP_217875.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv3357;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:19114484];gbkey=CDS;gene=relK;locus_tag=Rv3358;product=toxin RelK;protein_id=NP_217875.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3771344 3772534 . + . ID=gene-Rv3359;Dbxref=GeneID:887668;Name=Rv3359;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3359
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3771344 3772534 . + 0 ID=cds-NP_217876.1;Parent=gene-Rv3359;Dbxref=Genbank:NP_217876.1,GeneID:887668;Name=NP_217876.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3359;product=oxidoreductase;protein_id=NP_217876.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3772651 3773019 . + . ID=gene-Rv3360;Dbxref=GeneID:888136;Name=Rv3360;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3360
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3772651 3773019 . + 0 ID=cds-NP_217877.1;Parent=gene-Rv3360;Dbxref=Genbank:NP_217877.1,GeneID:888136;Name=NP_217877.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3360;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217877.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3773016 3773567 . - . ID=gene-Rv3361c;Dbxref=GeneID:888130;Name=Rv3361c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3361c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3773016 3773567 . - 0 ID=cds-NP_217878.1;Parent=gene-Rv3361c;Dbxref=Genbank:NP_217878.1,GeneID:888130;Name=NP_217878.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3361c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217878.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3773574 3774155 . - . ID=gene-Rv3362c;Dbxref=GeneID:888088;Name=Rv3362c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3362c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3773574 3774155 . - 0 ID=cds-NP_217879.1;Parent=gene-Rv3362c;Dbxref=Genbank:NP_217879.1,GeneID:888088;Name=NP_217879.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3362c;product=ATP/GTP-binding protein;protein_id=NP_217879.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3774136 3774504 . - . ID=gene-Rv3363c;Dbxref=GeneID:888090;Name=Rv3363c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3363c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3774136 3774504 . - 0 ID=cds-NP_217880.1;Parent=gene-Rv3363c;Dbxref=Genbank:NP_217880.1,GeneID:888090;Name=NP_217880.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3363c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217880.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3774482 3774874 . - . ID=gene-Rv3364c;Dbxref=GeneID:888085;Name=Rv3364c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3364c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3774482 3774874 . - 0 ID=cds-NP_217881.1;Parent=gene-Rv3364c;Dbxref=Genbank:NP_217881.1,GeneID:888085;Name=NP_217881.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3364c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217881.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3774871 3777501 . - . ID=gene-Rv3365c;Dbxref=GeneID:887652;Name=Rv3365c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3365c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3774871 3777501 . - 0 ID=cds-NP_217882.1;Parent=gene-Rv3365c;Dbxref=Genbank:NP_217882.1,GeneID:887652;Name=NP_217882.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv3365c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217882.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3777737 3778201 . + . ID=gene-Rv3366;Dbxref=GeneID:887648;Name=spoU;gbkey=Gene;gene=spoU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3366
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3777737 3778201 . + 0 ID=cds-NP_217883.1;Parent=gene-Rv3366;Dbxref=Genbank:NP_217883.1,GeneID:887648;Name=NP_217883.1;Note=tRNA/rRNA methyltransferase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=spoU;locus_tag=Rv3366;product=tRNA/rRNA methylase SpoU;protein_id=NP_217883.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3778568 3780334 . + . ID=gene-Rv3367;Dbxref=GeneID:887404;Name=PE_PGRS51;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS51;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3367
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3778568 3780334 . + 0 ID=cds-YP_177965.1;Parent=gene-Rv3367;Dbxref=Genbank:YP_177965.1,GeneID:887404;Name=YP_177965.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS51;locus_tag=Rv3367;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS51;protein_id=YP_177965.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3780335 3780979 . - . ID=gene-Rv3368c;Dbxref=GeneID:887641;Name=Rv3368c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3368c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3780335 3780979 . - 0 ID=cds-NP_217885.1;Parent=gene-Rv3368c;Dbxref=Genbank:NP_217885.1,GeneID:887641;Name=NP_217885.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3368c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_217885.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3780978 3781412 . + . ID=gene-Rv3369;Dbxref=GeneID:887669;Name=Rv3369;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3369
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3780978 3781412 . + 0 ID=cds-NP_217886.1;Parent=gene-Rv3369;Dbxref=Genbank:NP_217886.1,GeneID:887669;Name=NP_217886.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3369;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217886.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3781501 3784740 . - . ID=gene-Rv3370c;Dbxref=GeneID:887259;Name=dnaE2;gbkey=Gene;gene=dnaE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3370c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3781501 3784740 . - 0 ID=cds-NP_217887.3;Parent=gene-Rv3370c;Dbxref=Genbank:NP_217887.3,GeneID:887259;Name=NP_217887.3;Note=DnaE2 (DNA nucleotidyltransferase);experiment=EXISTENCE:Gene expression[PMID:12705867];gbkey=CDS;gene=dnaE2;locus_tag=Rv3370c;product=error-prone DNA polymerase;protein_id=NP_217887.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3784932 3786272 . + . ID=gene-Rv3371;Dbxref=GeneID:888053;Name=Rv3371;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3371
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3784932 3786272 . + 0 ID=cds-NP_217888.1;Parent=gene-Rv3371;Dbxref=Genbank:NP_217888.1,GeneID:888053;Name=NP_217888.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3371;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_217888.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3786314 3787489 . + . ID=gene-Rv3372;Dbxref=GeneID:888137;Name=otsB2;gbkey=Gene;gene=otsB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3372
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3786314 3787489 . + 0 ID=cds-NP_217889.1;Parent=gene-Rv3372;Dbxref=Genbank:NP_217889.1,GeneID:888137;Name=NP_217889.1;Note=trehalose-phosphatase (TPP);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:15158675];gbkey=CDS;gene=otsB2;locus_tag=Rv3372;product=trehalose 6-phosphate phosphatase;protein_id=NP_217889.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3787726 3788367 . + . ID=gene-Rv3373;Dbxref=GeneID:888123;Name=echA18;gbkey=Gene;gene=echA18;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3373
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3787726 3788367 . + 0 ID=cds-NP_217890.1;Parent=gene-Rv3373;Dbxref=Genbank:NP_217890.1,GeneID:888123;Name=NP_217890.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=echA18;locus_tag=Rv3373;product=enoyl-CoA hydratase;protein_id=NP_217890.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3788368 3788616 . + . ID=gene-Rv3374;Dbxref=GeneID:888100;Name=Rv3374;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;gene_synonym=echA18';locus_tag=Rv3374;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 3788621 3790048 . + . ID=gene-Rv3375;Dbxref=GeneID:888064;Name=amiD;gbkey=Gene;gene=amiD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3375
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3788621 3790048 . + 0 ID=cds-NP_217892.1;Parent=gene-Rv3375;Dbxref=Genbank:NP_217892.1,GeneID:888064;Name=NP_217892.1;Note=acylamidase (acylase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=amiD;locus_tag=Rv3375;product=amidase;protein_id=NP_217892.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3790156 3790809 . + . ID=gene-Rv3376;Dbxref=GeneID:888066;Name=Rv3376;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3376
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3790156 3790809 . + 0 ID=cds-NP_217893.1;Parent=gene-Rv3376;Dbxref=Genbank:NP_217893.1,GeneID:888066;Name=NP_217893.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3376;product=phosphatase;protein_id=NP_217893.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3790848 3792353 . - . ID=gene-Rv3377c;Dbxref=GeneID:888073;Name=Rv3377c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3377c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3790848 3792353 . - 0 ID=cds-NP_217894.1;Parent=gene-Rv3377c;Dbxref=Genbank:NP_217894.1,GeneID:888073;Name=NP_217894.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187). Cofactor: Mg2+.;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:15719101];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3377c;product=type B diterpene cyclase;protein_id=NP_217894.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3792358 3793248 . - . ID=gene-Rv3378c;Dbxref=GeneID:888075;Name=Rv3378c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3378c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3792358 3793248 . - 0 ID=cds-NP_217895.1;Parent=gene-Rv3378c;Dbxref=Genbank:NP_217895.1,GeneID:888075;Name=NP_217895.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187). Cofactor: Mg2+.;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:21228491];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3378c;product=diterpene synthase;protein_id=NP_217895.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3793257 3794867 . - . ID=gene-Rv3379c;Dbxref=GeneID:888080;Name=dxs2;gbkey=Gene;gene=dxs2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3379c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3793257 3794867 . - 0 ID=cds-NP_217896.1;Parent=gene-Rv3379c;Dbxref=Genbank:NP_217896.1,GeneID:888080;Name=NP_217896.1;Note=Dxs2 (1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase) (DXP synthase) (DXPS);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=dxs2;locus_tag=Rv3379c;product=1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase;protein_id=NP_217896.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3795058 3796412 . + . ID=id-NC_000962.3:3795058..3796412;Note=IS6110-15%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-15
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3795058 3795085 . + . ID=id-NC_000962.3:3795058..3795085;Note=28 bp inverted repeat at the left end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3795100 3796361 . - . ID=id-NC_000962.3:3795100..3796361;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable transposase subunit for IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3796385 3796412 . - . ID=id-NC_000962.3:3796385..3796412;Note=28 bp inverted repeat at the right end of IS6110%2CTGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3796448 3797437 . - . ID=gene-Rv3382c;Dbxref=GeneID:887953;Name=Rv3382c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3382c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3796448 3797437 . - 0 ID=cds-YP_177967.1;Parent=gene-Rv3382c;Dbxref=Genbank:YP_177967.1,GeneID:887953;Name=YP_177967.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3382c;product=4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase;protein_id=YP_177967.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3797437 3798489 . - . ID=gene-Rv3383c;Dbxref=GeneID:887680;Name=idsB;gbkey=Gene;gene=idsB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3383c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3797437 3798489 . - 0 ID=cds-NP_217900.1;Parent=gene-Rv3383c;Dbxref=Genbank:NP_217900.1,GeneID:887680;Name=NP_217900.1;Note=polyprenyl transferase (polyprenyl diphosphate synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=idsB;inference=protein motif:PROSITE:PS00723;locus_tag=Rv3383c;product=polyprenyl synthetase IdsB;protein_id=NP_217900.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3799243 3799635 . - . ID=gene-Rv3384c;Dbxref=GeneID:887432;Name=vapC46;gbkey=Gene;gene=vapC46;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3384c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3799243 3799635 . - 0 ID=cds-NP_217901.1;Parent=gene-Rv3384c;Dbxref=Genbank:NP_217901.1,GeneID:887432;Name=NP_217901.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv3385c%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=vapC46;locus_tag=Rv3384c;product=ribonuclease VapC46;protein_id=NP_217901.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3799635 3799943 . - . ID=gene-Rv3385c;Dbxref=GeneID:887429;Name=vapB46;gbkey=Gene;gene=vapB46;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3385c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3799635 3799943 . - 0 ID=cds-NP_217902.1;Parent=gene-Rv3385c;Dbxref=Genbank:NP_217902.1,GeneID:887429;Name=NP_217902.1;Note=part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv3386c;gbkey=CDS;gene=vapB46;locus_tag=Rv3385c;product=antitoxin VapB46;protein_id=NP_217902.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3799987 3801554 . + . ID=id-NC_000962.3:3799987..3801554;Note=IS1560-2%2C len: 1568 nt. Possible Insertion sequence element IS_1560. Second copy in MTCY10G2 from 11273 to 12919.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1560-2
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3799987 3800011 . + . ID=id-NC_000962.3:3799987..3800011;Note=25 bp inverted repeat at the right end of putative IS1560%2C TAATTACTAGGACCTGAAAAAGTCG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3800092 3800796 . + . ID=gene-Rv3386;Dbxref=GeneID:888044;Name=Rv3386;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3386
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3800092 3800796 . + 0 ID=cds-NP_217903.1;Parent=gene-Rv3386;Dbxref=Genbank:NP_217903.1,GeneID:888044;Name=NP_217903.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3386;product=transposase;protein_id=NP_217903.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3800786 3801463 . + . ID=gene-Rv3387;Dbxref=GeneID:887820;Name=Rv3387;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3387
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3800786 3801463 . + 0 ID=cds-NP_217904.1;Parent=gene-Rv3387;Dbxref=Genbank:NP_217904.1,GeneID:887820;Name=NP_217904.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3387;product=transposase;protein_id=NP_217904.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3801530 3801554 . - . ID=id-NC_000962.3:3801530..3801554;Note=25 bp inverted repeat at the right end of putative IS1560%2C TAATTACTAAGACCTGAAAAAGTCG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3801653 3803848 . + . ID=gene-Rv3388;Dbxref=GeneID:888151;Name=PE_PGRS52;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS52;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3388
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3801653 3803848 . + 0 ID=cds-YP_177968.1;Parent=gene-Rv3388;Dbxref=Genbank:YP_177968.1,GeneID:888151;Name=YP_177968.1;Note=Member of the M. tuberculosis PE family;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS52;locus_tag=Rv3388;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS52;protein_id=YP_177968.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3803919 3804791 . - . ID=gene-Rv3389c;Dbxref=GeneID:887923;Name=htdY;gbkey=Gene;gene=htdY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3389c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3803919 3804791 . - 0 ID=cds-NP_217906.1;Parent=gene-Rv3389c;Dbxref=Genbank:NP_217906.1,GeneID:887923;Name=NP_217906.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=htdY;locus_tag=Rv3389c;product=3-hydroxyacyl-thioester dehydratase HtdY;protein_id=NP_217906.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3804865 3805575 . + . ID=gene-Rv3390;Dbxref=GeneID:887627;Name=lpqD;gbkey=Gene;gene=lpqD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3390
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3804865 3805575 . + 0 ID=cds-NP_217907.1;Parent=gene-Rv3390;Dbxref=Genbank:NP_217907.1,GeneID:887627;Name=NP_217907.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqD;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3390;product=lipoprotein LpqD;protein_id=NP_217907.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3805621 3807573 . + . ID=gene-Rv3391;Dbxref=GeneID:887950;Name=acrA1;gbkey=Gene;gene=acrA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3391
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3805621 3807573 . + 0 ID=cds-NP_217908.1;Parent=gene-Rv3391;Dbxref=Genbank:NP_217908.1,GeneID:887950;Name=NP_217908.1;Note=Possible acrA1%2Cmulti functional protein with fatty acyl-CoA reductase activity in C-terminal part.;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=acrA1;locus_tag=Rv3391;product=acyl-CoA-reductase AcrA;protein_id=NP_217908.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3807574 3808437 . - . ID=gene-Rv3392c;Dbxref=GeneID:887961;Name=cmaA1;gbkey=Gene;gene=cmaA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3392c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3807574 3808437 . - 0 ID=cds-NP_217909.1;Parent=gene-Rv3392c;Dbxref=Genbank:NP_217909.1,GeneID:887961;Name=NP_217909.1;Note=cyclopropane fatty acid synthase (CFA synthase) (cyclopropane mycolic acid synthase 1);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=cmaA1;locus_tag=Rv3392c;product=cyclopropane mycolic acid synthase CmaA;protein_id=NP_217909.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3808461 3809387 . + . ID=gene-Rv3393;Dbxref=GeneID:887625;Name=iunH;gbkey=Gene;gene=iunH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3393
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3820653 3821891 . - . ID=gene-Rv3402c;Dbxref=GeneID:887910;Name=Rv3402c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3402c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3822262 3823863 . - . ID=gene-Rv3403c;Dbxref=GeneID:887907;Name=Rv3403c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3403c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3823880 3824584 . - . ID=gene-Rv3404c;Dbxref=GeneID:887902;Name=Rv3404c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3404c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3824702 3825268 . - . ID=gene-Rv3405c;Dbxref=GeneID:887940;Name=Rv3405c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3405c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3826252 3826551 . + . ID=gene-Rv3407;Dbxref=GeneID:887505;Name=vapB47;gbkey=Gene;gene=vapB47;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3407
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3826548 3826958 . + . ID=gene-Rv3408;Dbxref=GeneID:887900;Name=vapC47;gbkey=Gene;gene=vapC47;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3408
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3826548 3826958 . + 0 ID=cds-NP_217925.1;Parent=gene-Rv3408;Dbxref=Genbank:NP_217925.1,GeneID:887900;Name=NP_217925.1;Note=toxin%2C part of toxin-antitoxin (TA) operon with Rv3407%2Ccontains PIN domain;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=vapC47;locus_tag=Rv3408;product=ribonuclease VapC47;protein_id=NP_217925.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3826991 3828727 . - . ID=gene-Rv3409c;Dbxref=GeneID:887502;Name=choD;gbkey=Gene;gene=choD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3409c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3828783 3829910 . - . ID=gene-Rv3410c;Dbxref=GeneID:887510;Name=guaB3;gbkey=Gene;gene=guaB3;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3410c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3828783 3829910 . - 0 ID=cds-NP_217927.1;Parent=gene-Rv3410c;Dbxref=Genbank:NP_217927.1,GeneID:887510;Name=NP_217927.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=guaB3;locus_tag=Rv3410c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_217927.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3829930 3831519 . - . ID=gene-Rv3411c;Dbxref=GeneID:887498;Name=guaB2;gbkey=Gene;gene=guaB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3411c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3829930 3831519 . - 0 ID=cds-NP_217928.1;Parent=gene-Rv3411c;Dbxref=Genbank:NP_217928.1,GeneID:887498;Name=NP_217928.1;Note=imp dehydrogenase (inosinic acid dehydrogenase) (inosinate dehydrogenase) (imp oxidoreductase) (inosine-5'-monophosphate oxidoreductase) (IMPDH) (IMPD);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=guaB2;inference=protein motif:PROSITE:PS00487;locus_tag=Rv3411c;product=inosine-5'-monophosphate dehydrogenase;protein_id=NP_217928.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3831726 3832136 . + . ID=gene-Rv3412;Dbxref=GeneID:887499;Name=Rv3412;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3412
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3831726 3832136 . + 0 ID=cds-NP_217929.1;Parent=gene-Rv3412;Dbxref=Genbank:NP_217929.1,GeneID:887499;Name=NP_217929.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3412;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217929.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3832146 3833045 . - . ID=gene-Rv3413c;Dbxref=GeneID:887925;Name=Rv3413c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3413c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3832146 3833045 . - 0 ID=cds-NP_217930.1;Parent=gene-Rv3413c;Dbxref=Genbank:NP_217930.1,GeneID:887925;Name=NP_217930.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3413c;product=anti-sigma-D factor RsdA;protein_id=NP_217930.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3833038 3833676 . - . ID=gene-Rv3414c;Dbxref=GeneID:887594;Name=sigD;gbkey=Gene;gene=sigD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3414c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3833038 3833676 . - 0 ID=cds-NP_217931.1;Parent=gene-Rv3414c;Dbxref=Genbank:NP_217931.1,GeneID:887594;Name=NP_217931.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:15375142];gbkey=CDS;gene=sigD;locus_tag=Rv3414c;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigD;protein_id=NP_217931.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3833694 3834521 . - . ID=gene-Rv3415c;Dbxref=GeneID:887599;Name=Rv3415c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3415c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3833694 3834521 . - 0 ID=cds-NP_217932.1;Parent=gene-Rv3415c;Dbxref=Genbank:NP_217932.1,GeneID:887599;Name=NP_217932.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3415c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217932.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3834892 3835200 . + . ID=gene-Rv3416;Dbxref=GeneID:887598;Name=whiB3;gbkey=Gene;gene=whiB3;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=whmB;locus_tag=Rv3416
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3834892 3835200 . + 0 ID=cds-NP_217933.1;Parent=gene-Rv3416;Dbxref=Genbank:NP_217933.1,GeneID:887598;Name=NP_217933.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:19680450];gbkey=CDS;gene=whiB3;locus_tag=Rv3416;product=redox-responsive transcriptional regulator WhiB3;protein_id=NP_217933.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3835272 3836891 . - . ID=gene-Rv3417c;Dbxref=GeneID:887877;Name=groEL1;gbkey=Gene;gene=groEL1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cpn60_1;locus_tag=Rv3417c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3835272 3836891 . - 0 ID=cds-NP_217934.1;Parent=gene-Rv3417c;Dbxref=Genbank:NP_217934.1,GeneID:887877;Name=NP_217934.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=groEL1;inference=protein motif:PROSITE:PS00296;locus_tag=Rv3417c;product=chaperonin GroEL;protein_id=NP_217934.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3836986 3837288 . - . ID=gene-Rv3418c;Dbxref=GeneID:887583;Name=groES;gbkey=Gene;gene=groES;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cpn10,mpt57;locus_tag=Rv3418c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3836986 3837288 . - 0 ID=cds-NP_217935.1;Parent=gene-Rv3418c;Dbxref=Genbank:NP_217935.1,GeneID:887583;Name=NP_217935.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=groES;inference=protein motif:PROSITE:PS00681;locus_tag=Rv3418c;product=chaperonin GroES;protein_id=NP_217935.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3837555 3838589 . - . ID=gene-Rv3419c;Dbxref=GeneID:887595;Name=gcp;gbkey=Gene;gene=gcp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3419c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3838586 3839062 . - . ID=gene-Rv3420c;Dbxref=GeneID:887555;Name=rimI;gbkey=Gene;gene=rimI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3420c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3847165 3847701 . + . ID=gene-Rv3429;Dbxref=GeneID:887630;Name=PPE59;gbkey=Gene;gene=PPE59;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3429
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3847642 3848805 . - . ID=gene-Rv3430c;Dbxref=GeneID:887615;Name=Rv3430c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3430c
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+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3847644 3848806 . - . ID=id-NC_000962.3:3847644..3848806;Note=IS1540%2C len: 1163 nt. Insertion sequence IS1540.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1540
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+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3849296 3850140 . - . ID=id-NC_000962.3:3849296..3850140;Note=IS1552%2C len: 845 nt. Insertion sequence IS1552.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1552
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3851792 3853213 . - . ID=gene-Rv3433c;Dbxref=GeneID:887571;Name=Rv3433c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3433c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3851792 3853213 . - 0 ID=cds-NP_217950.1;Parent=gene-Rv3433c;Dbxref=Genbank:NP_217950.1,GeneID:887571;Name=NP_217950.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01050;locus_tag=Rv3433c;product=bifunctional ADP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase;protein_id=NP_217950.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3853215 3853928 . - . ID=gene-Rv3434c;Dbxref=GeneID:887573;Name=Rv3434c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3434c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3853215 3853928 . - 0 ID=cds-NP_217951.1;Parent=gene-Rv3434c;Dbxref=Genbank:NP_217951.1,GeneID:887573;Name=NP_217951.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3434c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217951.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3853939 3854793 . - . ID=gene-Rv3435c;Dbxref=GeneID:887564;Name=Rv3435c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3435c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3853939 3854793 . - 0 ID=cds-NP_217952.1;Parent=gene-Rv3435c;Dbxref=Genbank:NP_217952.1,GeneID:887564;Name=NP_217952.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3435c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217952.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3855015 3856889 . - . ID=gene-Rv3436c;Dbxref=GeneID:887568;Name=glmS;gbkey=Gene;gene=glmS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3436c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3855015 3856889 . - 0 ID=cds-NP_217953.1;Parent=gene-Rv3436c;Dbxref=Genbank:NP_217953.1,GeneID:887568;Name=NP_217953.1;Note=isomerizing GlmS (hexosephosphate aminotransferase) (D-fructose-6-phosphate amidotransferase) (GFAT) (L-glutamine-D-fructose-6-phosphate amidotransferase) (glucosamine-6-phosphate synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glmS;locus_tag=Rv3436c;product=glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase;protein_id=NP_217953.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3856911 3857387 . + . ID=gene-Rv3437;Dbxref=GeneID:887567;Name=Rv3437;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3437
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3856911 3857387 . + 0 ID=cds-NP_217954.1;Parent=gene-Rv3437;Dbxref=Genbank:NP_217954.1,GeneID:887567;Name=NP_217954.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14532352];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3437;product=transmembrane protein;protein_id=NP_217954.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3857397 3858239 . + . ID=gene-Rv3438;Dbxref=GeneID:887561;Name=Rv3438;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3438
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3857397 3858239 . + 0 ID=cds-NP_217955.1;Parent=gene-Rv3438;Dbxref=Genbank:NP_217955.1,GeneID:887561;Name=NP_217955.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3438;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217955.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3858259 3859662 . - . ID=gene-Rv3439c;Dbxref=GeneID:887565;Name=Rv3439c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3439c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3858259 3859662 . - 0 ID=cds-NP_217956.1;Parent=gene-Rv3439c;Dbxref=Genbank:NP_217956.1,GeneID:887565;Name=NP_217956.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3439c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217956.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3859665 3859976 . - . ID=gene-Rv3440c;Dbxref=GeneID:887592;Name=Rv3440c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3440c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3859665 3859976 . - 0 ID=cds-NP_217957.1;Parent=gene-Rv3440c;Dbxref=Genbank:NP_217957.1,GeneID:887592;Name=NP_217957.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3440c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217957.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3860024 3861370 . - . ID=gene-Rv3441c;Dbxref=GeneID:887589;Name=mrsA;gbkey=Gene;gene=mrsA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3441c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3860024 3861370 . - 0 ID=cds-NP_217958.1;Parent=gene-Rv3441c;Dbxref=Genbank:NP_217958.1,GeneID:887589;Name=NP_217958.1;Note=phospho-sugar mutase MrsA;gbkey=CDS;gene=mrsA;inference=protein motif:PROSITE:PS00710;locus_tag=Rv3441c;product=phosphoglucosamine mutase;protein_id=NP_217958.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3861495 3861950 . - . ID=gene-Rv3442c;Dbxref=GeneID:887488;Name=rpsI;gbkey=Gene;gene=rpsI;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3442c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3861495 3861950 . - 0 ID=cds-NP_217959.1;Parent=gene-Rv3442c;Dbxref=Genbank:NP_217959.1,GeneID:887488;Name=NP_217959.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpsI;inference=protein motif:PROSITE:PS00360;locus_tag=Rv3442c;product=30S ribosomal protein S9;protein_id=NP_217959.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3861947 3862390 . - . ID=gene-Rv3443c;Dbxref=GeneID:887584;Name=rplM;gbkey=Gene;gene=rplM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3443c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3861947 3862390 . - 0 ID=cds-NP_217960.1;Parent=gene-Rv3443c;Dbxref=Genbank:NP_217960.1,GeneID:887584;Name=NP_217960.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplM;locus_tag=Rv3443c;product=50S ribosomal protein L13;protein_id=NP_217960.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3862624 3862926 . - . ID=gene-Rv3444c;Dbxref=GeneID:887587;Name=esxT;gbkey=Gene;gene=esxT;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3444c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3862624 3862926 . - 0 ID=cds-NP_217961.1;Parent=gene-Rv3444c;Dbxref=Genbank:NP_217961.1,GeneID:887587;Name=NP_217961.1;gbkey=CDS;gene=esxT;locus_tag=Rv3444c;product=ESAT-6 like protein EsxT;protein_id=NP_217961.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3862947 3863264 . - . ID=gene-Rv3445c;Dbxref=GeneID:887585;Name=esxU;gbkey=Gene;gene=esxU;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3445c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3862947 3863264 . - 0 ID=cds-NP_217962.2;Parent=gene-Rv3445c;Dbxref=Genbank:NP_217962.2,GeneID:887585;Name=NP_217962.2;gbkey=CDS;gene=esxU;locus_tag=Rv3445c;product=ESAT-6 like protein EsxU;protein_id=NP_217962.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3863317 3864531 . - . ID=gene-Rv3446c;Dbxref=GeneID:887586;Name=Rv3446c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3446c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3863317 3864531 . - 0 ID=cds-NP_217963.1;Parent=gene-Rv3446c;Dbxref=Genbank:NP_217963.1,GeneID:887586;Name=NP_217963.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3446c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217963.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3864528 3868238 . - . ID=gene-Rv3447c;Dbxref=GeneID:887581;Name=eccC4;gbkey=Gene;gene=eccC4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3447c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3864528 3868238 . - 0 ID=cds-NP_217964.1;Parent=gene-Rv3447c;Dbxref=Genbank:NP_217964.1,GeneID:887581;Name=NP_217964.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=eccC4;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3447c;product=ESX-4 secretion system protein EccC4;protein_id=NP_217964.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3868352 3869755 . + . ID=gene-Rv3448;Dbxref=GeneID:887624;Name=eccD4;gbkey=Gene;gene=eccD4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3448
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3868352 3869755 . + 0 ID=cds-NP_217965.1;Parent=gene-Rv3448;Dbxref=Genbank:NP_217965.1,GeneID:887624;Name=NP_217965.1;gbkey=CDS;gene=eccD4;inference=protein motif:PROSITE:PS00402;locus_tag=Rv3448;product=ESX-4 secretion system protein EccD4;protein_id=NP_217965.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3869752 3871119 . + . ID=gene-Rv3449;Dbxref=GeneID:887602;Name=mycP4;gbkey=Gene;gene=mycP4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3449
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3869752 3871119 . + 0 ID=cds-NP_217966.1;Parent=gene-Rv3449;Dbxref=Genbank:NP_217966.1,GeneID:887602;Name=NP_217966.1;Note=serine proteas (subtilisin-like protease) (subtilase-like) (mycosin-4);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mycP4;inference=protein motif:PROSITE:PS00138;locus_tag=Rv3449;product=membrane-anchored mycosin;protein_id=NP_217966.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3871084 3872496 . - . ID=gene-Rv3450c;Dbxref=GeneID:887619;Name=eccB4;gbkey=Gene;gene=eccB4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3450c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3871084 3872496 . - 0 ID=cds-NP_217967.1;Parent=gene-Rv3450c;Dbxref=Genbank:NP_217967.1,GeneID:887619;Name=NP_217967.1;gbkey=CDS;gene=eccB4;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3450c;product=ESX-4 secretion system protein EccB4;protein_id=NP_217967.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3872617 3873405 . + . ID=gene-Rv3451;Dbxref=GeneID:887611;Name=cut3;gbkey=Gene;gene=cut3;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clp3,culp3;locus_tag=Rv3451
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3872617 3873405 . + 0 ID=cds-NP_217968.2;Parent=gene-Rv3451;Dbxref=Genbank:NP_217968.2,GeneID:887611;Name=NP_217968.2;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cut3;inference=protein motif:PROSITE:PS00155;locus_tag=Rv3451;product=cutinase;protein_id=NP_217968.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3873452 3874132 . + . ID=gene-Rv3452;Dbxref=GeneID:887610;Name=cut4;gbkey=Gene;gene=cut4;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clp4,culp4;locus_tag=Rv3452
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3873452 3874132 . + 0 ID=cds-NP_217969.1;Parent=gene-Rv3452;Dbxref=Genbank:NP_217969.1,GeneID:887610;Name=NP_217969.1;gbkey=CDS;gene=cut4;inference=protein motif:PROSITE:PS00155;locus_tag=Rv3452;product=cutinase;protein_id=NP_217969.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 3874404 3876090 . + . ID=gene-Rv3453;Dbxref=GeneID:887596;Name=Rv3453;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3453;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 3876052 3876822 . - . ID=gene-Rv3455c;Dbxref=GeneID:887590;Name=truA;gbkey=Gene;gene=truA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3455c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3876052 3876822 . - 0 ID=cds-NP_217972.3;Parent=gene-Rv3455c;Dbxref=Genbank:NP_217972.3,GeneID:887590;Name=NP_217972.3;Note=pseudouridylate synthase I (pseudouridine synthase I) (uracil hydrolyase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=truA;locus_tag=Rv3455c;product=tRNA pseudouridine synthase A;protein_id=NP_217972.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3876890 3877432 . - . ID=gene-Rv3456c;Dbxref=GeneID:887523;Name=rplQ;gbkey=Gene;gene=rplQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3456c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3876890 3877432 . - 0 ID=cds-NP_217973.1;Parent=gene-Rv3456c;Dbxref=Genbank:NP_217973.1,GeneID:887523;Name=NP_217973.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rplQ;locus_tag=Rv3456c;product=50S ribosomal protein L17;protein_id=NP_217973.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3877464 3878507 . - . ID=gene-Rv3457c;Dbxref=GeneID:887629;Name=rpoA;gbkey=Gene;gene=rpoA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3457c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3877464 3878507 . - 0 ID=cds-NP_217974.1;Parent=gene-Rv3457c;Dbxref=Genbank:NP_217974.1,GeneID:887629;Name=NP_217974.1;Note=RpoA (transcriptase alpha chain) (RNA polymerase alpha subunit) (DNA-directed RNA nucleotidyltransferase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpoA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3457c;product=DNA-directed RNA polymerase subunit alpha;protein_id=NP_217974.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3878659 3879264 . - . ID=gene-Rv3458c;Dbxref=GeneID:887620;Name=rpsD;gbkey=Gene;gene=rpsD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3458c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3878659 3879264 . - 0 ID=cds-NP_217975.1;Parent=gene-Rv3458c;Dbxref=Genbank:NP_217975.1,GeneID:887620;Name=NP_217975.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsD;inference=protein motif:PROSITE:PS00632;locus_tag=Rv3458c;product=30S ribosomal protein S4;protein_id=NP_217975.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3879273 3879692 . - . ID=gene-Rv3459c;Dbxref=GeneID:887524;Name=rpsK;gbkey=Gene;gene=rpsK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3459c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3879273 3879692 . - 0 ID=cds-NP_217976.1;Parent=gene-Rv3459c;Dbxref=Genbank:NP_217976.1,GeneID:887524;Name=NP_217976.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rpsK;inference=protein motif:PROSITE:PS00054;locus_tag=Rv3459c;product=30S ribosomal protein S11;protein_id=NP_217976.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3879696 3880070 . - . ID=gene-Rv3460c;Dbxref=GeneID:887514;Name=rpsM;gbkey=Gene;gene=rpsM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3460c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3879696 3880070 . - 0 ID=cds-NP_217977.1;Parent=gene-Rv3460c;Dbxref=Genbank:NP_217977.1,GeneID:887514;Name=NP_217977.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rpsM;inference=protein motif:PROSITE:PS00646;locus_tag=Rv3460c;product=30S ribosomal protein S13;protein_id=NP_217977.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3880286 3880399 . - . ID=gene-Rv3461c;Dbxref=GeneID:887272;Name=rpmJ;gbkey=Gene;gene=rpmJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3461c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3880286 3880399 . - 0 ID=cds-NP_217978.1;Parent=gene-Rv3461c;Dbxref=Genbank:NP_217978.1,GeneID:887272;Name=NP_217978.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rpmJ;inference=protein motif:PROSITE:PS00828;locus_tag=Rv3461c;product=50S ribosomal protein L36;protein_id=NP_217978.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3880432 3880653 . - . ID=gene-Rv3462c;Dbxref=GeneID:887325;Name=infA;gbkey=Gene;gene=infA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3462c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3880432 3880653 . - 0 ID=cds-NP_217979.1;Parent=gene-Rv3462c;Dbxref=Genbank:NP_217979.1,GeneID:887325;Name=NP_217979.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=infA;locus_tag=Rv3462c;product=translation initiation factor IF-1;protein_id=NP_217979.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3880907 3881764 . + . ID=gene-Rv3463;Dbxref=GeneID:888286;Name=Rv3463;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3463
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3880907 3881764 . + 0 ID=cds-NP_217980.1;Parent=gene-Rv3463;Dbxref=Genbank:NP_217980.1,GeneID:888286;Name=NP_217980.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3463;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217980.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3881837 3882832 . + . ID=gene-Rv3464;Dbxref=GeneID:887332;Name=rmlB;gbkey=Gene;gene=rmlB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rfbB;locus_tag=Rv3464
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3881837 3882832 . + 0 ID=cds-NP_217981.1;Parent=gene-Rv3464;Dbxref=Genbank:NP_217981.1,GeneID:887332;Name=NP_217981.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=rmlB;locus_tag=Rv3464;product=dTDP-glucose 4%2C6-dehydratase;protein_id=NP_217981.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3882834 3883442 . + . ID=gene-Rv3465;Dbxref=GeneID:887352;Name=rmlC;gbkey=Gene;gene=rmlC;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rfbC;locus_tag=Rv3465
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3882834 3883442 . + 0 ID=cds-NP_217982.1;Parent=gene-Rv3465;Dbxref=Genbank:NP_217982.1,GeneID:887352;Name=NP_217982.1;Note=dTDP-4-keto-6-deoxyglucose 3%2C5-epimerase (dTDP-L-rhamnose synthetase) (thymidine diphospho-4-keto-rhamnose 3%2C5-epimerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rmlC;locus_tag=Rv3465;product=dTDP-4-dehydrorhamnose 3%2C5-epimerase;protein_id=NP_217982.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3883525 3884193 . + . ID=gene-Rv3466;Dbxref=GeneID:887830;Name=Rv3466;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3466
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3883525 3884193 . + 0 ID=cds-NP_217983.1;Parent=gene-Rv3466;Dbxref=Genbank:NP_217983.1,GeneID:887830;Name=NP_217983.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3466;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217983.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3883550 3884921 . + . ID=id-NC_000962.3:3883550..3884921;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007).;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3883964 3884917 . + . ID=gene-Rv3467;Dbxref=GeneID:888022;Name=Rv3467;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3467
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3883964 3884917 . + 0 ID=cds-NP_217984.1;Parent=gene-Rv3467;Dbxref=Genbank:NP_217984.1,GeneID:888022;Name=NP_217984.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3467;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217984.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3884975 3886069 . - . ID=gene-Rv3468c;Dbxref=GeneID:888007;Name=Rv3468c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rmlB3;locus_tag=Rv3468c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3884975 3886069 . - 0 ID=cds-YP_177974.1;Parent=gene-Rv3468c;Dbxref=Genbank:YP_177974.1,GeneID:888007;Name=YP_177974.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3468c;product=dTDP-glucose 4%2C6-dehydratase;protein_id=YP_177974.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3886073 3887083 . - . ID=gene-Rv3469c;Dbxref=GeneID:888074;Name=mhpE;gbkey=Gene;gene=mhpE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3469c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3886073 3887083 . - 0 ID=cds-NP_217986.1;Parent=gene-Rv3469c;Dbxref=Genbank:NP_217986.1,GeneID:888074;Name=NP_217986.1;gbkey=CDS;gene=mhpE;locus_tag=Rv3469c;product=4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase MhpE;protein_id=NP_217986.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3887144 3888802 . - . ID=gene-Rv3470c;Dbxref=GeneID:888041;Name=ilvB2;gbkey=Gene;gene=ilvB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3470c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3887144 3888802 . - 0 ID=cds-NP_217987.1;Parent=gene-Rv3470c;Dbxref=Genbank:NP_217987.1,GeneID:888041;Name=NP_217987.1;Note=AHAS (acetohydroxy-acid synthase large subunit) (ALS);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C protein purification and characterization[PMID:20884690];gbkey=CDS;gene=ilvB2;inference=protein motif:PROSITE:PS00187;locus_tag=Rv3470c;product=acetolactate synthase large subunit;protein_id=NP_217987.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3888808 3889341 . - . ID=gene-Rv3471c;Dbxref=GeneID:888050;Name=Rv3471c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3471c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3888808 3889341 . - 0 ID=cds-NP_217988.1;Parent=gene-Rv3471c;Dbxref=Genbank:NP_217988.1,GeneID:888050;Name=NP_217988.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3471c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217988.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3889362 3889868 . + . ID=gene-Rv3472;Dbxref=GeneID:888006;Name=Rv3472;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3472
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3889362 3889868 . + 0 ID=cds-NP_217989.1;Parent=gene-Rv3472;Dbxref=Genbank:NP_217989.1,GeneID:888006;Name=NP_217989.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3472;product=hypothetical protein;protein_id=NP_217989.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3889948 3890733 . - . ID=gene-Rv3473c;Dbxref=GeneID:888101;Name=bpoA;gbkey=Gene;gene=bpoA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3473c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3889948 3890733 . - 0 ID=cds-NP_217990.1;Parent=gene-Rv3473c;Dbxref=Genbank:NP_217990.1,GeneID:888101;Name=NP_217990.1;Note=non-haem peroxidase;gbkey=CDS;gene=bpoA;locus_tag=Rv3473c;product=peroxidase BpoA;protein_id=NP_217990.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 3890779 3892133 . + . ID=id-NC_000962.3:3890779..3892133;Note=IS6110-16%2C len: 1355 nt. Insertion sequence IS6110.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS6110-16
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3890779 3890806 . + . ID=id-NC_000962.3:3890779..3890806;Note=28 bp inverted repeat at left end of IS6110 :TGAACCGCCCCGGCATGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 3890830 3892091 . + . ID=id-NC_000962.3:3890830..3892091;Note=similar to insertion sequence element IS986/IS6110 transposase%3B Probable transposase subunit for IS6110. Identical to many other M. tuberculosis IS6110 transposase subunits. The transposase described here may be made by a frame shifting mechanism during translation%2C the sequence UUUUAAAG maybe responsible for such a frameshifting event (see McAdam et al.%2C 1990).;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 3892106 3892133 . - . ID=id-NC_000962.3:3892106..3892133;Note=28 bp inverted repeat at right end of IS6110 :TGAACCGCCCCGGTGAGTCCGGAGACTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 3892371 3893720 . - . ID=gene-Rv3476c;Dbxref=GeneID:888002;Name=kgtP;gbkey=Gene;gene=kgtP;gene_biotype=other;locus_tag=Rv3476c
+NC_000962.3 RefSeq gene 3894093 3894389 . + . ID=gene-Rv3477;Dbxref=GeneID:888474;Name=PE31;gbkey=Gene;gene=PE31;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3477
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3894093 3894389 . + 0 ID=cds-YP_177975.1;Parent=gene-Rv3477;Dbxref=Genbank:YP_177975.1,GeneID:888474;Name=YP_177975.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=PE31;locus_tag=Rv3477;product=PE family protein PE31;protein_id=YP_177975.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3894426 3895607 . + . ID=gene-Rv3478;Dbxref=GeneID:888047;Name=PPE60;gbkey=Gene;gene=PPE60;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=mtb39c;locus_tag=Rv3478
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3960755 3961786 . + . ID=gene-Rv3524;Dbxref=GeneID:888250;Name=Rv3524;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3524
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3960755 3961786 . + 0 ID=cds-NP_218041.1;Parent=gene-Rv3524;Dbxref=Genbank:NP_218041.1,GeneID:888250;Name=NP_218041.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00237;locus_tag=Rv3524;product=membrane protein;protein_id=NP_218041.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 3962439 3963599 . + . ID=gene-Rv3526;Dbxref=GeneID:888268;Name=kshA;gbkey=Gene;gene=kshA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3526
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3962439 3963599 . + 0 ID=cds-NP_218043.1;Parent=gene-Rv3526;Dbxref=Genbank:NP_218043.1,GeneID:888268;Name=NP_218043.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19234303];gbkey=CDS;gene=kshA;locus_tag=Rv3526;product=3-ketosteroid-9-alpha-monooxygenase oxygenase subunit;protein_id=NP_218043.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3963605 3964054 . + . ID=gene-Rv3527;Dbxref=GeneID:888295;Name=Rv3527;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3527
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3963605 3964054 . + 0 ID=cds-NP_218044.1;Parent=gene-Rv3527;Dbxref=Genbank:NP_218044.1,GeneID:888295;Name=NP_218044.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3527;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218044.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3964479 3965192 . - . ID=gene-Rv3528c;Dbxref=GeneID:888297;Name=Rv3528c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3528c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3964479 3965192 . - 0 ID=cds-NP_218045.1;Parent=gene-Rv3528c;Dbxref=Genbank:NP_218045.1,GeneID:888297;Name=NP_218045.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3528c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218045.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3965884 3967038 . - . ID=gene-Rv3529c;Dbxref=GeneID:888324;Name=Rv3529c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3529c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3965884 3967038 . - 0 ID=cds-NP_218046.1;Parent=gene-Rv3529c;Dbxref=Genbank:NP_218046.1,GeneID:888324;Name=NP_218046.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3529c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218046.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3967038 3967820 . - . ID=gene-Rv3530c;Dbxref=GeneID:888338;Name=Rv3530c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3530c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3967038 3967820 . - 0 ID=cds-NP_218047.1;Parent=gene-Rv3530c;Dbxref=Genbank:NP_218047.1,GeneID:888338;Name=NP_218047.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3530c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_218047.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3967817 3968944 . - . ID=gene-Rv3531c;Dbxref=GeneID:888348;Name=Rv3531c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3531c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3967817 3968944 . - 0 ID=cds-NP_218048.1;Parent=gene-Rv3531c;Dbxref=Genbank:NP_218048.1,GeneID:888348;Name=NP_218048.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3531c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218048.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3969343 3970563 . + . ID=gene-Rv3532;Dbxref=GeneID:888370;Name=PPE61;gbkey=Gene;gene=PPE61;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3532
+NC_000962.3 RefSeq CDS 3969343 3970563 . + 0 ID=cds-YP_177984.1;Parent=gene-Rv3532;Dbxref=Genbank:YP_177984.1,GeneID:888370;Name=YP_177984.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE61;locus_tag=Rv3532;product=PPE family protein PPE61;protein_id=YP_177984.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 3970705 3972453 . - . ID=gene-Rv3533c;Dbxref=GeneID:888385;Name=PPE62;gbkey=Gene;gene=PPE62;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3533c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4018358 4019071 . + . ID=gene-Rv3576;Dbxref=GeneID:888444;Name=lppH;gbkey=Gene;gene=lppH;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=pknM;locus_tag=Rv3576
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4019262 4020128 . + . ID=gene-Rv3577;Dbxref=GeneID:888442;Name=Rv3577;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3577
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4020142 4021383 . + . ID=gene-Rv3578;Dbxref=GeneID:888329;Name=arsB2;gbkey=Gene;gene=arsB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3578
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4022394 4023803 . - . ID=gene-Rv3580c;Dbxref=GeneID:888628;Name=cysS1;gbkey=Gene;gene=cysS1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3580c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4022394 4023803 . - 0 ID=cds-YP_177992.1;Parent=gene-Rv3580c;Dbxref=Genbank:YP_177992.1,GeneID:888628;Name=YP_177992.1;Note=Cysteinyl-tRNA synthetase 1 CysS1 (CYSRS 1) (cysteine translase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cysS1;locus_tag=Rv3580c;product=cysteine--tRNA ligase;protein_id=YP_177992.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4023868 4024347 . - . ID=gene-Rv3581c;Dbxref=GeneID:888221;Name=ispF;gbkey=Gene;gene=ispF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3581c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4023868 4024347 . - 0 ID=cds-NP_218098.1;Parent=gene-Rv3581c;Dbxref=Genbank:NP_218098.1,GeneID:888221;Name=NP_218098.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:20189102];gbkey=CDS;gene=ispF;locus_tag=Rv3581c;product=2C-methyl-D-erythritol 2%2C4-cyclodiphosphate synthase;protein_id=NP_218098.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4024344 4025039 . - . ID=gene-Rv3582c;Dbxref=GeneID:887787;Name=ispD;gbkey=Gene;gene=ispD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3582c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4024344 4025039 . - 0 ID=cds-NP_218099.1;Parent=gene-Rv3582c;Dbxref=Genbank:NP_218099.1,GeneID:887787;Name=NP_218099.1;Note=4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase IspD%3B MEP cytidylyltransferase (MCT);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ispD;locus_tag=Rv3582c;product=2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase;protein_id=NP_218099.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4025056 4025544 . - . ID=gene-Rv3583c;Dbxref=GeneID:887854;Name=Rv3583c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3583c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4025056 4025544 . - 0 ID=cds-NP_218100.1;Parent=gene-Rv3583c;Dbxref=Genbank:NP_218100.1,GeneID:887854;Name=NP_218100.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:19596241];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3583c;product=RNA polymerase-binding transcription factor CarD;protein_id=NP_218100.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4025830 4026378 . + . ID=gene-Rv3584;Dbxref=GeneID:887254;Name=lpqE;gbkey=Gene;gene=lpqE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3584
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4025830 4026378 . + 0 ID=cds-NP_218101.1;Parent=gene-Rv3584;Dbxref=Genbank:NP_218101.1,GeneID:887254;Name=NP_218101.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqE;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3584;product=lipoprotein LpqE;protein_id=NP_218101.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4026444 4027886 . + . ID=gene-Rv3585;Dbxref=GeneID:887287;Name=radA;gbkey=Gene;gene=radA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3585
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4026444 4027886 . + 0 ID=cds-NP_218102.1;Parent=gene-Rv3585;Dbxref=Genbank:NP_218102.1,GeneID:887287;Name=NP_218102.1;Note=DNA repair protein SMS;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=radA;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3585;product=DNA repair protein RadA;protein_id=NP_218102.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4027891 4028967 . + . ID=gene-Rv3586;Dbxref=GeneID:887485;Name=Rv3586;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3586
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4027891 4028967 . + 0 ID=cds-NP_218103.1;Parent=gene-Rv3586;Dbxref=Genbank:NP_218103.1,GeneID:887485;Name=NP_218103.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:22529992];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3586;product=DNA integrity scanning protein DisA;protein_id=NP_218103.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4028968 4029762 . - . ID=gene-Rv3587c;Dbxref=GeneID:888057;Name=Rv3587c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3587c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4029871 4030494 . - . ID=gene-Rv3588c;Dbxref=GeneID:887836;Name=canB;gbkey=Gene;gene=canB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3588c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4029871 4030494 . - 0 ID=cds-NP_218105.1;Parent=gene-Rv3588c;Dbxref=Genbank:NP_218105.1,GeneID:887836;Name=NP_218105.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=canB;inference=protein motif:PROSITE:PS00705;locus_tag=Rv3588c;product=carbonic anhydrase;protein_id=NP_218105.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4030493 4031407 . + . ID=gene-Rv3589;Dbxref=GeneID:886639;Name=mutY;gbkey=Gene;gene=mutY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3589
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4030493 4031407 . + 0 ID=cds-NP_218106.1;Parent=gene-Rv3589;Dbxref=Genbank:NP_218106.1,GeneID:886639;Name=NP_218106.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19778963];gbkey=CDS;gene=mutY;locus_tag=Rv3589;product=A/G-specific adenine glycosylase;protein_id=NP_218106.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4031404 4033158 . - . ID=gene-Rv3590c;Dbxref=GeneID:887874;Name=PE_PGRS58;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS58;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3590c
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 4033269 4034042 . - 0 ID=cds-NP_218108.1;Parent=gene-Rv3591c;Dbxref=Genbank:NP_218108.1,GeneID:886316;Name=NP_218108.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3591c;product=hydrolase;protein_id=NP_218108.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4034057 4034374 . + . ID=gene-Rv3592;Dbxref=GeneID:886278;Name=Rv3592;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=TB11.2;locus_tag=Rv3592
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4034057 4034374 . + 0 ID=cds-NP_218109.1;Parent=gene-Rv3592;Dbxref=Genbank:NP_218109.1,GeneID:886278;Name=NP_218109.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:19917297];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3592;product=heme-degrading monooxygenase;protein_id=NP_218109.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4034352 4035710 . + . ID=gene-Rv3593;Dbxref=GeneID:886290;Name=lpqF;gbkey=Gene;gene=lpqF;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3593
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4034352 4035710 . + 0 ID=cds-NP_218110.1;Parent=gene-Rv3593;Dbxref=Genbank:NP_218110.1,GeneID:886290;Name=NP_218110.1;gbkey=CDS;gene=lpqF;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3593;product=lipoprotein LpqF;protein_id=NP_218110.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4035857 4036684 . + . ID=gene-Rv3594;Dbxref=GeneID:885659;Name=Rv3594;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3594
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4035857 4036684 . + 0 ID=cds-NP_218111.1;Parent=gene-Rv3594;Dbxref=Genbank:NP_218111.1,GeneID:885659;Name=NP_218111.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3594;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218111.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4036731 4038050 . - . ID=gene-Rv3595c;Dbxref=GeneID:885464;Name=PE_PGRS59;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS59;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3595c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4036731 4038050 . - 0 ID=cds-YP_177994.1;Parent=gene-Rv3595c;Dbxref=Genbank:YP_177994.1,GeneID:885464;Name=YP_177994.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=PE_PGRS59;locus_tag=Rv3595c;product=PE-PGRS family protein PE_PGRS59;protein_id=YP_177994.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4038158 4040704 . - . ID=gene-Rv3596c;Dbxref=GeneID:885104;Name=clpC1;gbkey=Gene;gene=clpC1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clpC;locus_tag=Rv3596c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4038158 4040704 . - 0 ID=cds-YP_177995.1;Parent=gene-Rv3596c;Dbxref=Genbank:YP_177995.1,GeneID:885104;Name=YP_177995.1;Note=Probable clpC1%2C ATP-dependent protease ATP-binding subunit;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=clpC1;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3596c;product=ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpC;protein_id=YP_177995.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 4040879 4040938 . + . ID=id-NC_000962.3:4040879..4040938;Note=mpr17%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C 82-118 nt bands detected by Northern blot in M. bovis BCG Pasteur.%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 4040981 4041319 . - . ID=gene-Rv3597c;Dbxref=GeneID:885580;Name=lsr2;gbkey=Gene;gene=lsr2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3597c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4040981 4041319 . - 0 ID=cds-NP_218114.1;Parent=gene-Rv3597c;Dbxref=Genbank:NP_218114.1,GeneID:885580;Name=NP_218114.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lsr2;locus_tag=Rv3597c;product=iron-regulated H-NS-like protein;protein_id=NP_218114.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4041423 4042940 . - . ID=gene-Rv3598c;Dbxref=GeneID:885574;Name=lysS;gbkey=Gene;gene=lysS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3598c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4041423 4042940 . - 0 ID=cds-NP_218115.1;Parent=gene-Rv3598c;Dbxref=Genbank:NP_218115.1,GeneID:885574;Name=NP_218115.1;Note=Lysyl-tRNA synthetase 1 LysS (LysRS 1) (lysine translase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=lysS;inference=protein motif:PROSITE:PS00179;locus_tag=Rv3598c;product=lysine--tRNA ligase;protein_id=NP_218115.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4043041 4043859 . - . ID=gene-Rv3600c;Dbxref=GeneID:885572;Name=Rv3600c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3600c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4043041 4043859 . - 0 ID=cds-NP_218117.1;Parent=gene-Rv3600c;Dbxref=Genbank:NP_218117.1,GeneID:885572;Name=NP_218117.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3600c;product=type III pantothenate kinase;protein_id=NP_218117.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4043862 4044281 . - . ID=gene-Rv3601c;Dbxref=GeneID:885596;Name=panD;gbkey=Gene;gene=panD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3601c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4043862 4044281 . - 0 ID=cds-NP_218118.1;Parent=gene-Rv3601c;Dbxref=Genbank:NP_218118.1,GeneID:885596;Name=NP_218118.1;Note=spartate alpha-decarboxylase;gbkey=CDS;gene=panD;locus_tag=Rv3601c;product=aspartate 1-decarboxylase;protein_id=NP_218118.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4044281 4045210 . - . ID=gene-Rv3602c;Dbxref=GeneID:885459;Name=panC;gbkey=Gene;gene=panC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3602c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4044281 4045210 . - 0 ID=cds-NP_218119.1;Parent=gene-Rv3602c;Dbxref=Genbank:NP_218119.1,GeneID:885459;Name=NP_218119.1;Note=pantoate--beta-alanine ligase PanC%3B pantothenate synthetase (pantoate activating enzyme);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:11669627];gbkey=CDS;gene=panC;locus_tag=Rv3602c;product=pantothenate synthetase;protein_id=NP_218119.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4045207 4046118 . - . ID=gene-Rv3603c;Dbxref=GeneID:885583;Name=Rv3603c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3603c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4045207 4046118 . - 0 ID=cds-NP_218120.1;Parent=gene-Rv3603c;Dbxref=Genbank:NP_218120.1,GeneID:885583;Name=NP_218120.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3603c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218120.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4046303 4047496 . - . ID=gene-Rv3604c;Dbxref=GeneID:885232;Name=Rv3604c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3604c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4046303 4047496 . - 0 ID=cds-NP_218121.2;Parent=gene-Rv3604c;Dbxref=Genbank:NP_218121.2,GeneID:885232;Name=NP_218121.2;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3604c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218121.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4047705 4048181 . - . ID=gene-Rv3605c;Dbxref=GeneID:885844;Name=Rv3605c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3605c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4047705 4048181 . - 0 ID=cds-NP_218122.1;Parent=gene-Rv3605c;Dbxref=Genbank:NP_218122.1,GeneID:885844;Name=NP_218122.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3605c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218122.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4048181 4048747 . - . ID=gene-Rv3606c;Dbxref=GeneID:885848;Name=folK;gbkey=Gene;gene=folK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3606c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4048181 4048747 . - 0 ID=cds-NP_218123.1;Parent=gene-Rv3606c;Dbxref=Genbank:NP_218123.1,GeneID:885848;Name=NP_218123.1;Note=7%2C8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase (HPPK) (6-hydroxymethyl-7%2C8-dihydropterin pyrophosphokinase) (PPPK) (2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine diphosphok;gbkey=CDS;gene=folK;locus_tag=Rv3606c;product=2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridinepyrophosphokinase;protein_id=NP_218123.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4048744 4049145 . - . ID=gene-Rv3607c;Dbxref=GeneID:885345;Name=folB;gbkey=Gene;gene=folB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=folX;locus_tag=Rv3607c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4048744 4049145 . - 0 ID=cds-YP_177996.1;Parent=gene-Rv3607c;Dbxref=Genbank:YP_177996.1,GeneID:885345;Name=YP_177996.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=folB;locus_tag=Rv3607c;product=dihydroneopterin aldolase;protein_id=YP_177996.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4049138 4049980 . - . ID=gene-Rv3608c;Dbxref=GeneID:885831;Name=folP1;gbkey=Gene;gene=folP1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3608c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4049138 4049980 . - 0 ID=cds-YP_177997.1;Parent=gene-Rv3608c;Dbxref=Genbank:YP_177997.1,GeneID:885831;Name=YP_177997.1;Note=DHPS 1 (dihydropteroate pyrophosphorylase 1) (dihydropteroate diphosphorylase 1);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:10542185];gbkey=CDS;gene=folP1;inference=protein motif:PROSITE:PS00793;locus_tag=Rv3608c;product=dihydropteroate synthase;protein_id=YP_177997.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4049977 4050585 . - . ID=gene-Rv3609c;Dbxref=GeneID:885346;Name=folE;gbkey=Gene;gene=folE;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=gchA;locus_tag=Rv3609c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4049977 4050585 . - 0 ID=cds-NP_218126.1;Parent=gene-Rv3609c;Dbxref=Genbank:NP_218126.1,GeneID:885346;Name=NP_218126.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=folE;inference=protein motif:PROSITE:PS00860;locus_tag=Rv3609c;product=GTP cyclohydrolase I;protein_id=NP_218126.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4050601 4052883 . - . ID=gene-Rv3610c;Dbxref=GeneID:885732;Name=ftsH;gbkey=Gene;gene=ftsH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3610c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4050601 4052883 . - 0 ID=cds-NP_218127.1;Parent=gene-Rv3610c;Dbxref=Genbank:NP_218127.1,GeneID:885732;Name=NP_218127.1;Note=ATP-dependentFtsH%2C cell division protein%2C membrane-bound protease;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16884108];gbkey=CDS;gene=ftsH;inference=protein motif:PROSITE:PS00674;locus_tag=Rv3610c;product=zinc metalloprotease FtsH;protein_id=NP_218127.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4052949 4052966 . - . ID=id-NC_000962.3:4052949..4052966;Note=18 bp direct repeat 2%2C GGGTTTGCGATCGCCACG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4052971 4052994 . - . ID=id-NC_000962.3:4052971..4052994;Note=(24 bp) part of 111 bp direct repeat unit 6%2CGTGGCGACCCGCTGCACCCGGCTC;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4052995 4053105 . - . ID=id-NC_000962.3:4052995..4053105;Note=111 bp direct repeat unit 5%2CGTGGCGACCCGCTGCACCCGGCTCTGGGGTGATTGCCTGGCTCCTCCTCGGCCCGTTTTGCGGGCCGCATTGTCGCCAGGCGCGGGGTTTGCGATCGCCACGGGGCTGATG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4053004 4053021 . - . ID=id-NC_000962.3:4053004..4053021;Note=18 bp direct repeat 1%2C GGGTTTGCGATCGCCACG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4053106 4053216 . - . ID=id-NC_000962.3:4053106..4053216;Note=111 bp direct repeat unit 4%2CGTGGCGACCCGCTGCACCCGGCTCTGGGGTGATTGCCTGGCTCCTCCTCGGCCCGTTTTGCGGGCCGCATTGTCGCCAGGCGCGGGGTTTGCGATCGCCACGGGGCTGATG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4053217 4053327 . - . ID=id-NC_000962.3:4053217..4053327;Note=111 bp direct repeat unit 3%2CGTGGCGACCCGCTGCACCCGGCTCTGGGGTGATTGCCTGGCTCCTCCTCGGCCCGTTTTGCGGGCCGCATTGTCGCCAGGCGCGGGGTTTGCGATCGCCACGGGGCTGATG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4053328 4053438 . - . ID=id-NC_000962.3:4053328..4053438;Note=111 bp direct repeat unit 2%2CGTGGCGACCCGCTGCACCCGGCTCTGGGGTGATTGCCTGGCTCCTCCTCGGCCCGTTTTGCGGGCCGCATTGTCGCCAGGCGCGGGGTTTGCGATCGCCACGGGGCTGATG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4053439 4053549 . - . ID=id-NC_000962.3:4053439..4053549;Note=111 bp direct repeat unit 1%2CGTGGCGACCCGCTGCACCCGGCTCTGGGGTGATTGCCTGGCTCCTCCTCGGCCCGTTTTGCGGGCCGCATTGTCGCCAGGCGCGGGGTTTGCGATCGCCACGGGGCTGATG;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 4053518 4053847 . - . ID=gene-Rv3612c;Dbxref=GeneID:885381;Name=Rv3612c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3612c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4053518 4053847 . - 0 ID=cds-NP_218129.1;Parent=gene-Rv3612c;Dbxref=Genbank:NP_218129.1,GeneID:885381;Name=NP_218129.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3612c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218129.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4053881 4054042 . - . ID=gene-Rv3613c;Dbxref=GeneID:885124;Name=Rv3613c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3613c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4053881 4054042 . - 0 ID=cds-NP_218130.1;Parent=gene-Rv3613c;Dbxref=Genbank:NP_218130.1,GeneID:885124;Name=NP_218130.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3613c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218130.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4054142 4054696 . - . ID=gene-Rv3614c;Dbxref=GeneID:885777;Name=espD;gbkey=Gene;gene=espD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm10;locus_tag=Rv3614c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4054142 4054696 . - 0 ID=cds-NP_218131.1;Parent=gene-Rv3614c;Dbxref=Genbank:NP_218131.1,GeneID:885777;Name=NP_218131.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=espD;locus_tag=Rv3614c;product=ESX-1 secretion-associated protein EspD;protein_id=NP_218131.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4054812 4055123 . - . ID=gene-Rv3615c;Dbxref=GeneID:885770;Name=espC;gbkey=Gene;gene=espC;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm9;locus_tag=Rv3615c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4054812 4055123 . - 0 ID=cds-NP_218132.1;Parent=gene-Rv3615c;Dbxref=Genbank:NP_218132.1,GeneID:885770;Name=NP_218132.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=espC;locus_tag=Rv3615c;product=ESX-1 secretion-associated protein EspC;protein_id=NP_218132.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4055197 4056375 . - . ID=gene-Rv3616c;Dbxref=GeneID:885377;Name=espA;gbkey=Gene;gene=espA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3616c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4055197 4056375 . - 0 ID=cds-NP_218133.1;Parent=gene-Rv3616c;Dbxref=Genbank:NP_218133.1,GeneID:885377;Name=NP_218133.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=espA;locus_tag=Rv3616c;product=ESX-1 secretion-associated protein EspA;protein_id=NP_218133.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 4058698 4059885 . + 0 ID=cds-NP_218135.1;Parent=gene-Rv3618;Dbxref=Genbank:NP_218135.1,GeneID:885276;Name=NP_218135.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3618;product=monooxygenase;protein_id=NP_218135.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4060295 4060591 . - . ID=gene-Rv3620c;Dbxref=GeneID:885787;Name=esxW;gbkey=Gene;gene=esxW;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_10,QILSS;locus_tag=Rv3620c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4060295 4060591 . - 0 ID=cds-NP_218137.1;Parent=gene-Rv3620c;Dbxref=Genbank:NP_218137.1,GeneID:885787;Name=NP_218137.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:14595687];gbkey=CDS;gene=esxW;locus_tag=Rv3620c;product=ESAT-6 like protein EsxW;protein_id=NP_218137.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4060648 4061889 . - . ID=gene-Rv3621c;Dbxref=GeneID:885097;Name=PPE65;gbkey=Gene;gene=PPE65;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3621c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4061899 4062198 . - . ID=gene-Rv3622c;Dbxref=GeneID:885712;Name=PE32;gbkey=Gene;gene=PE32;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3622c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4061899 4062198 . - 0 ID=cds-YP_177999.1;Parent=gene-Rv3622c;Dbxref=Genbank:YP_177999.1,GeneID:885712;Name=YP_177999.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE32;locus_tag=Rv3622c;product=PE family protein PE32;protein_id=YP_177999.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4062527 4063249 . + . ID=gene-Rv3623;Dbxref=GeneID:885233;Name=lpqG;gbkey=Gene;gene=lpqG;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3623
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4062527 4063249 . + 0 ID=cds-NP_218140.1;Parent=gene-Rv3623;Dbxref=Genbank:NP_218140.1,GeneID:885233;Name=NP_218140.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=lpqG;inference=protein motif:PROSITE:PS00013;locus_tag=Rv3623;product=lipoprotein LpqG;protein_id=NP_218140.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4063254 4063904 . - . ID=gene-Rv3624c;Dbxref=GeneID:885398;Name=hpt;gbkey=Gene;gene=hpt;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=hprT;locus_tag=Rv3624c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4063254 4063904 . - 0 ID=cds-NP_218141.1;Parent=gene-Rv3624c;Dbxref=Genbank:NP_218141.1,GeneID:885398;Name=NP_218141.1;Note=Hpt (HGPRT) (HGPRTase) (hypoxanthine phosphoribosyltransferase) (imp pyrophosphorylase) (imp diphosphorylase) (transphosphoribosyltransferase) (guanine phosphoribosyltransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=hpt;inference=protein motif:PROSITE:PS00103;locus_tag=Rv3624c;product=hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase;protein_id=NP_218141.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4063901 4064872 . - . ID=gene-Rv3625c;Dbxref=GeneID:885409;Name=mesJ;gbkey=Gene;gene=mesJ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3625c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4063901 4064872 . - 0 ID=cds-NP_218142.1;Parent=gene-Rv3625c;Dbxref=Genbank:NP_218142.1,GeneID:885409;Name=NP_218142.1;Note=cell cycle protein MesJ;gbkey=CDS;gene=mesJ;locus_tag=Rv3625c;product=tRNA(Ile)-lysidine synthase;protein_id=NP_218142.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4064851 4065903 . - . ID=gene-Rv3626c;Dbxref=GeneID:885792;Name=Rv3626c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3626c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4064851 4065903 . - 0 ID=cds-NP_218143.1;Parent=gene-Rv3626c;Dbxref=Genbank:NP_218143.1,GeneID:885792;Name=NP_218143.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv3626c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218143.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4065900 4067285 . - . ID=gene-Rv3627c;Dbxref=GeneID:885728;Name=Rv3627c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3627c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4065900 4067285 . - 0 ID=cds-NP_218144.1;Parent=gene-Rv3627c;Dbxref=Genbank:NP_218144.1,GeneID:885728;Name=NP_218144.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3627c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218144.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4067423 4067911 . + . ID=gene-Rv3628;Dbxref=GeneID:885775;Name=ppa;gbkey=Gene;gene=ppa;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3628
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4067423 4067911 . + 0 ID=cds-NP_218145.1;Parent=gene-Rv3628;Dbxref=Genbank:NP_218145.1,GeneID:885775;Name=NP_218145.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=ppa;locus_tag=Rv3628;product=inorganic pyrophosphatase;protein_id=NP_218145.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4067957 4069054 . - . ID=gene-Rv3629c;Dbxref=GeneID:885351;Name=Rv3629c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3629c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4067957 4069054 . - 0 ID=cds-NP_218146.1;Parent=gene-Rv3629c;Dbxref=Genbank:NP_218146.1,GeneID:885351;Name=NP_218146.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:17443846];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3629c;product=integral membrane protein;protein_id=NP_218146.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4069175 4070470 . + . ID=gene-Rv3630;Dbxref=GeneID:885802;Name=Rv3630;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3630
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4069175 4070470 . + 0 ID=cds-NP_218147.1;Parent=gene-Rv3630;Dbxref=Genbank:NP_218147.1,GeneID:885802;Name=NP_218147.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00639;locus_tag=Rv3630;product=integral membrane protein;protein_id=NP_218147.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4070514 4071239 . + . ID=gene-Rv3631;Dbxref=GeneID:885314;Name=Rv3631;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3631
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4070514 4071239 . + 0 ID=cds-NP_218148.1;Parent=gene-Rv3631;Dbxref=Genbank:NP_218148.1,GeneID:885314;Name=NP_218148.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3631;product=transferase;protein_id=NP_218148.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4071236 4071580 . + . ID=gene-Rv3632;Dbxref=GeneID:885711;Name=Rv3632;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3632
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4071236 4071580 . + 0 ID=cds-NP_218149.1;Parent=gene-Rv3632;Dbxref=Genbank:NP_218149.1,GeneID:885711;Name=NP_218149.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3632;product=membrane protein;protein_id=NP_218149.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4071791 4072666 . + . ID=gene-Rv3633;Dbxref=GeneID:885252;Name=Rv3633;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3633
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4071791 4072666 . + 0 ID=cds-NP_218150.1;Parent=gene-Rv3633;Dbxref=Genbank:NP_218150.1,GeneID:885252;Name=NP_218150.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3633;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218150.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4072667 4073611 . - . ID=gene-Rv3634c;Dbxref=GeneID:885765;Name=galE1;gbkey=Gene;gene=galE1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=rmlB2;locus_tag=Rv3634c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4072667 4073611 . - 0 ID=cds-NP_215015.2;Parent=gene-Rv3634c;Dbxref=Genbank:NP_215015.2,GeneID:885765;Name=NP_215015.2;Note=galactowaldenase (UDP-galactose 4-epimerase) (uridine diphosphate galactose 4-epimerase) (uridine diphospho-galactose 4-epimerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=galE1;locus_tag=Rv3634c;product=UDP-glucose 4-epimerase;protein_id=NP_215015.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4073634 4075409 . + . ID=gene-Rv3635;Dbxref=GeneID:885675;Name=Rv3635;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3635
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4073634 4075409 . + 0 ID=cds-NP_218152.1;Parent=gene-Rv3635;Dbxref=Genbank:NP_218152.1,GeneID:885675;Name=NP_218152.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3635;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218152.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 4075615 4077750 . + . ID=id-NC_000962.3:4075615..4077750;Note=IS1534%2C len: 2136 nt. Putative Insertion sequence element%2C IS1534 (IS15C10.2)%2C that resembles IS21%3B possibly defective.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1534
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4075615 4075630 . + . ID=id-NC_000962.3:4075615..4075630;Note=16 bp inverted repeat at the left end of putative IS element IS1534%3B GAAAATTGACCAGCTT.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq pseudogene 4075752 4076984 . + . ID=gene-Rv3636;Dbxref=GeneID:885274;Name=Rv3636;gbkey=Gene;gene_biotype=pseudogene;locus_tag=Rv3636;pseudo=true;pseudogene=unknown
+NC_000962.3 RefSeq gene 4076984 4077730 . + . ID=gene-Rv3638;Dbxref=GeneID:885803;Name=Rv3638;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3638
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4076984 4077730 . + 0 ID=cds-NP_218155.1;Parent=gene-Rv3638;Dbxref=Genbank:NP_218155.1,GeneID:885803;Name=NP_218155.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3638;product=transposase;protein_id=NP_218155.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4077735 4077750 . - . ID=id-NC_000962.3:4077735..4077750;Note=16 bp inverted repeat at the right end of putative IS element IS1534%3B GAAAATTGACCAGCTT.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 4077884 4078450 . - . ID=gene-Rv3639c;Dbxref=GeneID:885244;Name=Rv3639c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3639c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4077884 4078450 . - 0 ID=cds-NP_218156.1;Parent=gene-Rv3639c;Dbxref=Genbank:NP_218156.1,GeneID:885244;Name=NP_218156.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3639c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218156.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 4078506 4079798 . - . ID=id-NC_000962.3:4078506..4079798;Note=IS1553%2C len: 1293 nt. Putative Insertion sequence element%2C IS1553.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1553
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4078506 4078518 . + . ID=id-NC_000962.3:4078506..4078518;Note=13 bp inverted repeat at the right end of putative IS element IS1553%3B GAGTTCGTCGGTG.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 4078520 4079749 . - . ID=gene-Rv3640c;Dbxref=GeneID:885324;Name=Rv3640c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3640c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4078520 4079749 . - 0 ID=cds-NP_218157.1;Parent=gene-Rv3640c;Dbxref=Genbank:NP_218157.1,GeneID:885324;Name=NP_218157.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3640c;product=transposase;protein_id=NP_218157.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4079786 4079798 . - . ID=id-NC_000962.3:4079786..4079798;Note=13 bp inverted repeat at the left end of putative IS element IS1553%3B GAGATCGTCGGTG.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 4079925 4080560 . - . ID=gene-Rv3641c;Dbxref=GeneID:885540;Name=fic;gbkey=Gene;gene=fic;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3641c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4079925 4080560 . - 0 ID=cds-NP_218158.1;Parent=gene-Rv3641c;Dbxref=Genbank:NP_218158.1,GeneID:885540;Name=NP_218158.1;gbkey=CDS;gene=fic;locus_tag=Rv3641c;product=cell filamentation protein Fic;protein_id=NP_218158.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4080571 4080765 . - . ID=gene-Rv3642c;Dbxref=GeneID:885220;Name=Rv3642c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3642c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4080571 4080765 . - 0 ID=cds-NP_218159.1;Parent=gene-Rv3642c;Dbxref=Genbank:NP_218159.1,GeneID:885220;Name=NP_218159.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3642c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218159.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4081160 4081351 . + . ID=gene-Rv3643;Dbxref=GeneID:885600;Name=Rv3643;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3643
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4081160 4081351 . + 0 ID=cds-NP_218160.1;Parent=gene-Rv3643;Dbxref=Genbank:NP_218160.1,GeneID:885600;Name=NP_218160.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3643;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218160.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4081365 4081437 . - . ID=gene-Rvnt39;Dbxref=GeneID:2700461;Name=thrU;gbkey=Gene;gene=thrU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt39
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 4081365 4081437 . - . ID=rna-Rvnt39;Parent=gene-Rvnt39;Dbxref=GeneID:2700461;Note=thrU%2C tRNA-Thr%2C anticodon cgt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(4081402..4081404));codons=39;gbkey=tRNA;gene=thrU;locus_tag=Rvnt39;product=tRNA-Thr
+NC_000962.3 RefSeq exon 4081365 4081437 . - . ID=exon-Rvnt39-1;Parent=rna-Rvnt39;Dbxref=GeneID:2700461;Note=thrU%2C tRNA-Thr%2C anticodon cgt%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(4081402..4081404));codons=39;gbkey=tRNA;gene=thrU;locus_tag=Rvnt39;product=tRNA-Thr
+NC_000962.3 RefSeq gene 4081516 4082721 . - . ID=gene-Rv3644c;Dbxref=GeneID:885553;Name=Rv3644c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3644c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4082807 4084456 . + . ID=gene-Rv3645;Dbxref=GeneID:885620;Name=Rv3645;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3645
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4082807 4084456 . + 0 ID=cds-NP_218162.1;Parent=gene-Rv3645;Dbxref=Genbank:NP_218162.1,GeneID:885620;Name=NP_218162.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3645;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218162.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4084453 4087257 . - . ID=gene-Rv3646c;Dbxref=GeneID:885608;Name=topA;gbkey=Gene;gene=topA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3646c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4084453 4087257 . - 0 ID=cds-NP_218163.1;Parent=gene-Rv3646c;Dbxref=Genbank:NP_218163.1,GeneID:885608;Name=NP_218163.1;Note=omega-protein (relaxing enzyme) (untwisting enzyme) (swivelase) (type I DNA topoisomerase) (nicking-closing enzyme) (TOPO I);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=topA;inference=protein motif:PROSITE:PS00396;locus_tag=Rv3646c;product=DNA topoisomerase I;protein_id=NP_218163.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4087610 4088188 . - . ID=gene-Rv3647c;Dbxref=GeneID:885217;Name=Rv3647c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3647c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4087610 4088188 . - 0 ID=cds-NP_218164.1;Parent=gene-Rv3647c;Dbxref=Genbank:NP_218164.1,GeneID:885217;Name=NP_218164.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3647c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218164.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4088328 4088531 . - . ID=gene-Rv3648c;Dbxref=GeneID:885837;Name=cspA;gbkey=Gene;gene=cspA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3648c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4088328 4088531 . - 0 ID=cds-NP_218165.1;Parent=gene-Rv3648c;Dbxref=Genbank:NP_218165.1,GeneID:885837;Name=NP_218165.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=cspA;inference=protein motif:PROSITE:PS00352;locus_tag=Rv3648c;product=cold shock protein A;protein_id=NP_218165.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4088781 4091096 . + . ID=gene-Rv3649;Dbxref=GeneID:885841;Name=Rv3649;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3649
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4088781 4091096 . + 0 ID=cds-NP_218166.1;Parent=gene-Rv3649;Dbxref=Genbank:NP_218166.1,GeneID:885841;Name=NP_218166.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3649;product=helicase;protein_id=NP_218166.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4091233 4091517 . + . ID=gene-Rv3650;Dbxref=GeneID:885832;Name=PE33;gbkey=Gene;gene=PE33;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3650
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4091233 4091517 . + 0 ID=cds-YP_178000.1;Parent=gene-Rv3650;Dbxref=Genbank:YP_178000.1,GeneID:885832;Name=YP_178000.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE33;locus_tag=Rv3650;product=PE family protein PE33;protein_id=YP_178000.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4091841 4092878 . + . ID=gene-Rv3651;Dbxref=GeneID:885296;Name=Rv3651;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3651
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4091841 4092878 . + 0 ID=cds-NP_218168.1;Parent=gene-Rv3651;Dbxref=Genbank:NP_218168.1,GeneID:885296;Name=NP_218168.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3651;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218168.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 4093468 4093522 . + . ID=id-NC_000962.3:4093468..4093522;Note=mpr18%2C fragment of putative small regulatory RNA (See DiChiara et al.%2C 2010)%2C ends not mapped%2C 82 and 100 nt bands detected by Northern blot in M. bovis BCG Pasteur.%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 4093632 4093946 . + . ID=gene-Rv3652;Dbxref=GeneID:886260;Name=PE_PGRS60;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS60;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3652
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4093632 4093946 . + 0 ID=cds-YP_178001.1;Parent=gene-Rv3652;Dbxref=Genbank:YP_178001.1,GeneID:886260;Name=YP_178001.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS60;locus_tag=Rv3652;product=PE-PGRS family-related protein PE_PGRS60;protein_id=YP_178001.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4093940 4094527 . + . ID=gene-Rv3653;Dbxref=GeneID:886259;Name=PE_PGRS61;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS61;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3653
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4093940 4094527 . + 0 ID=cds-YP_178002.1;Parent=gene-Rv3653;Dbxref=Genbank:YP_178002.1,GeneID:886259;Name=YP_178002.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE_PGRS61;locus_tag=Rv3653;product=PE-PGRS family-related protein PE_PGRS61;protein_id=YP_178002.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4094660 4094983 . - . ID=gene-Rv3654c;Dbxref=GeneID:885612;Name=Rv3654c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3654c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4094660 4094983 . - 0 ID=cds-NP_218171.2;Parent=gene-Rv3654c;Dbxref=Genbank:NP_218171.2,GeneID:885612;Name=NP_218171.2;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3654c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218171.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4094923 4095300 . - . ID=gene-Rv3655c;Dbxref=GeneID:885614;Name=Rv3655c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3655c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4094923 4095300 . - 0 ID=cds-NP_218172.1;Parent=gene-Rv3655c;Dbxref=Genbank:NP_218172.1,GeneID:885614;Name=NP_218172.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3655c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218172.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4095324 4095530 . - . ID=gene-Rv3656c;Dbxref=GeneID:885624;Name=Rv3656c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3656c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4095324 4095530 . - 0 ID=cds-NP_218173.1;Parent=gene-Rv3656c;Dbxref=Genbank:NP_218173.1,GeneID:885624;Name=NP_218173.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3656c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218173.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4095540 4096115 . - . ID=gene-Rv3657c;Dbxref=GeneID:885619;Name=Rv3657c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3657c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4095540 4096115 . - 0 ID=cds-NP_218174.1;Parent=gene-Rv3657c;Dbxref=Genbank:NP_218174.1,GeneID:885619;Name=NP_218174.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3657c;product=membrane protein;protein_id=NP_218174.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4096139 4096939 . - . ID=gene-Rv3658c;Dbxref=GeneID:885618;Name=Rv3658c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3658c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4096139 4096939 . - 0 ID=cds-NP_218175.1;Parent=gene-Rv3658c;Dbxref=Genbank:NP_218175.1,GeneID:885618;Name=NP_218175.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3658c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218175.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4096936 4097994 . - . ID=gene-Rv3659c;Dbxref=GeneID:885627;Name=Rv3659c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=trbB;locus_tag=Rv3659c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4096936 4097994 . - 0 ID=cds-YP_178003.1;Parent=gene-Rv3659c;Dbxref=Genbank:YP_178003.1,GeneID:885627;Name=YP_178003.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3659c;product=conjugal transfer protein;protein_id=YP_178003.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4098096 4099148 . - . ID=gene-Rv3660c;Dbxref=GeneID:885319;Name=Rv3660c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3660c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4098096 4099148 . - 0 ID=cds-NP_218177.1;Parent=gene-Rv3660c;Dbxref=Genbank:NP_218177.1,GeneID:885319;Name=NP_218177.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3660c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218177.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4099386 4099478 . - . ID=gene-RVnc0004;Dbxref=GeneID:14515875;Name=B11;gbkey=Gene;gene=B11;gene_biotype=ncRNA;gene_synonym=mpr19;locus_tag=RVnc0004
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 4099386 4099478 . - . ID=rna-RVnc0004;Parent=gene-RVnc0004;Dbxref=GeneID:14515875;Note=B11%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009%3B DiChiara et al.%2C 2010).;gbkey=ncRNA;gene=B11;locus_tag=RVnc0004;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 4099386 4099478 . - . ID=exon-RVnc0004-1;Parent=rna-RVnc0004;Dbxref=GeneID:14515875;Note=B11%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig and Young%2C 2009%3B DiChiara et al.%2C 2010).;gbkey=ncRNA;gene=B11;locus_tag=RVnc0004;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 4099647 4100510 . + . ID=gene-Rv3661;Dbxref=GeneID:885316;Name=Rv3661;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3661
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4099647 4100510 . + 0 ID=cds-NP_218178.1;Parent=gene-Rv3661;Dbxref=Genbank:NP_218178.1,GeneID:885316;Name=NP_218178.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3661;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218178.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4100669 4100968 . + . ID=gene-RVnc0036a;Dbxref=GeneID:14515876;Name=MTS2823;gbkey=Gene;gene=MTS2823;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0036a
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 4100669 4100968 . + . ID=rna-RVnc0036a;Parent=gene-RVnc0036a;Dbxref=GeneID:14515876;Note=MTS2823%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C 5'-end mapped by RLM-RACE%2C 3'-end not mapped%2C ~~300 bp and ~~250 bp bands detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS2823;locus_tag=RVnc0036a;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 4100669 4100968 . + . ID=exon-RVnc0036a-1;Parent=rna-RVnc0036a;Dbxref=GeneID:14515876;Note=MTS2823%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C 5'-end mapped by RLM-RACE%2C 3'-end not mapped%2C ~~300 bp and ~~250 bp bands detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS2823;locus_tag=RVnc0036a;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 4101265 4102035 . - . ID=gene-Rv3662c;Dbxref=GeneID:885178;Name=Rv3662c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3662c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4101265 4102035 . - 0 ID=cds-NP_218179.1;Parent=gene-Rv3662c;Dbxref=Genbank:NP_218179.1,GeneID:885178;Name=NP_218179.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3662c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218179.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4102032 4103678 . - . ID=gene-Rv3663c;Dbxref=GeneID:885039;Name=dppD;gbkey=Gene;gene=dppD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3663c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4102032 4103678 . - 0 ID=cds-NP_218180.1;Parent=gene-Rv3663c;Dbxref=Genbank:NP_218180.1,GeneID:885039;Name=NP_218180.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=dppD;inference=protein motif:PROSITE:PS00211;locus_tag=Rv3663c;product=dipeptide ABC transporter ATP-binding protein DppD;protein_id=NP_218180.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4103675 4104475 . - . ID=gene-Rv3664c;Dbxref=GeneID:885483;Name=dppC;gbkey=Gene;gene=dppC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3664c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4103675 4104475 . - 0 ID=cds-NP_218181.1;Parent=gene-Rv3664c;Dbxref=Genbank:NP_218181.1,GeneID:885483;Name=NP_218181.1;gbkey=CDS;gene=dppC;locus_tag=Rv3664c;product=dipeptide ABC transporter permease DppC;protein_id=NP_218181.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4104531 4105457 . - . ID=gene-Rv3665c;Dbxref=GeneID:885474;Name=dppB;gbkey=Gene;gene=dppB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3665c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4104531 4105457 . - 0 ID=cds-NP_218182.1;Parent=gene-Rv3665c;Dbxref=Genbank:NP_218182.1,GeneID:885474;Name=NP_218182.1;gbkey=CDS;gene=dppB;locus_tag=Rv3665c;product=dipeptide ABC transporter permease DppB;protein_id=NP_218182.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4105459 4107084 . - . ID=gene-Rv3666c;Dbxref=GeneID:885315;Name=dppA;gbkey=Gene;gene=dppA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3666c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4105459 4107084 . - 0 ID=cds-NP_218183.1;Parent=gene-Rv3666c;Dbxref=Genbank:NP_218183.1,GeneID:885315;Name=NP_218183.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=dppA;locus_tag=Rv3666c;product=dipeptide ABC transporter substrate-binding lipoprotein DppA;protein_id=NP_218183.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4107792 4109747 . + . ID=gene-Rv3667;Dbxref=GeneID:885479;Name=acs;gbkey=Gene;gene=acs;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3667
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4107792 4109747 . + 0 ID=cds-NP_218184.1;Parent=gene-Rv3667;Dbxref=Genbank:NP_218184.1,GeneID:885479;Name=NP_218184.1;Note=Acs (acetate--CoA ligase) (acetyl-CoA synthetase) (acetyl-CoA synthase) (acyl-activating enzyme) (acetate thiokinase) (acetyl-activating enzyme) (acetate--CoAligase) (acetyl-CoAsynthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=acs;inference=protein motif:PROSITE:PS00455;locus_tag=Rv3667;product=acetyl-CoAsynthetase;protein_id=NP_218184.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4109783 4110481 . - . ID=gene-Rv3668c;Dbxref=GeneID:885609;Name=Rv3668c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3668c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4109783 4110481 . - 0 ID=cds-NP_218185.1;Parent=gene-Rv3668c;Dbxref=Genbank:NP_218185.1,GeneID:885609;Name=NP_218185.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3668c;product=protease;protein_id=NP_218185.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4110827 4111345 . + . ID=gene-Rv3669;Dbxref=GeneID:885626;Name=Rv3669;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3669
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4114474 4115157 . - . ID=gene-Rv3673c;Dbxref=GeneID:885190;Name=Rv3673c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3673c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4115157 4115894 . - . ID=gene-Rv3674c;Dbxref=GeneID:885058;Name=nth;gbkey=Gene;gene=nth;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3674c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4116002 4116379 . + . ID=gene-Rv3675;Dbxref=GeneID:885155;Name=Rv3675;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3675
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4116002 4116379 . + 0 ID=cds-NP_218192.1;Parent=gene-Rv3675;Dbxref=Genbank:NP_218192.1,GeneID:885155;Name=NP_218192.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3675;product=membrane protein;protein_id=NP_218192.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4116478 4117152 . + . ID=gene-Rv3676;Dbxref=GeneID:885502;Name=crp;gbkey=Gene;gene=crp;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3676
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4116478 4117152 . + 0 ID=cds-NP_218193.1;Parent=gene-Rv3676;Dbxref=Genbank:NP_218193.1,GeneID:885502;Name=NP_218193.1;Note=transcriptional regulator Crp;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16267303];gbkey=CDS;gene=crp;locus_tag=Rv3676;product=cAMP receptor protein;protein_id=NP_218193.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4117258 4118052 . - . ID=gene-Rv3677c;Dbxref=GeneID:885079;Name=Rv3677c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3677c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4117258 4118052 . - 0 ID=cds-NP_218194.1;Parent=gene-Rv3677c;Dbxref=Genbank:NP_218194.1,GeneID:885079;Name=NP_218194.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:18217931];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3677c;product=beta lactamase;protein_id=NP_218194.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4118059 4118514 . - . ID=gene-Rv3678c;Dbxref=GeneID:885495;Name=Rv3678c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3678c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4118059 4118514 . - 0 ID=cds-NP_218195.1;Parent=gene-Rv3678c;Dbxref=Genbank:NP_218195.1,GeneID:885495;Name=NP_218195.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv3678c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218195.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4118530 4118691 . - . ID=gene-Rv3678A;Dbxref=GeneID:3205049;Name=Rv3678A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3678A
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4118530 4118691 . - 0 ID=cds-YP_178004.1;Parent=gene-Rv3678A;Dbxref=Genbank:YP_178004.1,GeneID:3205049;Name=YP_178004.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3678A;product=hypothetical protein;protein_id=YP_178004.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4118776 4119798 . + . ID=gene-Rv3679;Dbxref=GeneID:885809;Name=Rv3679;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3679
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4118776 4119798 . + 0 ID=cds-NP_218196.1;Parent=gene-Rv3679;Dbxref=Genbank:NP_218196.1,GeneID:885809;Name=NP_218196.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3679;product=anion transporter ATPase;protein_id=NP_218196.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4119795 4120955 . + . ID=gene-Rv3680;Dbxref=GeneID:885317;Name=Rv3680;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3680
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4119795 4120955 . + 0 ID=cds-NP_218197.1;Parent=gene-Rv3680;Dbxref=Genbank:NP_218197.1,GeneID:885317;Name=NP_218197.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3680;product=anion transporter ATPase;protein_id=NP_218197.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4121198 4121554 . - . ID=gene-Rv3681c;Dbxref=GeneID:885320;Name=whiB4;gbkey=Gene;gene=whiB4;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=whmA;locus_tag=Rv3681c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4121198 4121554 . - 0 ID=cds-NP_218198.2;Parent=gene-Rv3681c;Dbxref=Genbank:NP_218198.2,GeneID:885320;Name=NP_218198.2;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:17302817];gbkey=CDS;gene=whiB4;locus_tag=Rv3681c;product=transcriptional regulator WhiB4;protein_id=NP_218198.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4121916 4124348 . + . ID=gene-Rv3682;Dbxref=GeneID:885751;Name=ponA2;gbkey=Gene;gene=ponA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3682
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4121916 4124348 . + 0 ID=cds-YP_178005.1;Parent=gene-Rv3682;Dbxref=Genbank:YP_178005.1,GeneID:885751;Name=YP_178005.1;Note=membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B PonA2 (murein polymerase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=ponA2;locus_tag=Rv3682;product=bifunctional penicillin-insensitive transglycosylase/penicillin-sensitive transpeptidase;protein_id=YP_178005.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4124417 4125376 . + . ID=gene-Rv3683;Dbxref=GeneID:885780;Name=Rv3683;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3683
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4124417 4125376 . + 0 ID=cds-NP_218200.1;Parent=gene-Rv3683;Dbxref=Genbank:NP_218200.1,GeneID:885780;Name=NP_218200.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3683;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218200.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4125439 4126479 . + . ID=gene-Rv3684;Dbxref=GeneID:885598;Name=Rv3684;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3684
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4125439 4126479 . + 0 ID=cds-NP_218201.3;Parent=gene-Rv3684;Dbxref=Genbank:NP_218201.3,GeneID:885598;Name=NP_218201.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3684;product=lyase;protein_id=NP_218201.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4126541 4126614 . + . ID=gene-Rvnt40;Dbxref=GeneID:2700460;Name=proY;gbkey=Gene;gene=proY;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt40
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 4126541 4126614 . + . ID=rna-Rvnt40;Parent=gene-Rvnt40;Dbxref=GeneID:2700460;Note=proY%2C tRNA-Pro%2C anticodon cgg%2C length %3D 74;anticodon=(pos:4126575..4126577);codons=23;gbkey=tRNA;gene=proY;locus_tag=Rvnt40;product=tRNA-Pro
+NC_000962.3 RefSeq exon 4126541 4126614 . + . ID=exon-Rvnt40-1;Parent=rna-Rvnt40;Dbxref=GeneID:2700460;Note=proY%2C tRNA-Pro%2C anticodon cgg%2C length %3D 74;anticodon=(pos:4126575..4126577);codons=23;gbkey=tRNA;gene=proY;locus_tag=Rvnt40;product=tRNA-Pro
+NC_000962.3 RefSeq gene 4127295 4128725 . - . ID=gene-Rv3685c;Dbxref=GeneID:885625;Name=cyp137;gbkey=Gene;gene=cyp137;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3685c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4127295 4128725 . - 0 ID=cds-NP_218202.1;Parent=gene-Rv3685c;Dbxref=Genbank:NP_218202.1,GeneID:885625;Name=NP_218202.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;gene=cyp137;locus_tag=Rv3685c;product=cytochrome P450 Cyp137;protein_id=NP_218202.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4128751 4129083 . - . ID=gene-Rv3686c;Dbxref=GeneID:885306;Name=Rv3686c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3686c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4128751 4129083 . - 0 ID=cds-NP_218203.1;Parent=gene-Rv3686c;Dbxref=Genbank:NP_218203.1,GeneID:885306;Name=NP_218203.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3686c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218203.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4129323 4129691 . - . ID=gene-Rv3687c;Dbxref=GeneID:885599;Name=rsfB;gbkey=Gene;gene=rsfB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3687c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4129323 4129691 . - 0 ID=cds-NP_218204.1;Parent=gene-Rv3687c;Dbxref=Genbank:NP_218204.1,GeneID:885599;Name=NP_218204.1;Note=anti-sigma factor antagonist (regulator of sigma F B);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=rsfB;locus_tag=Rv3687c;product=anti-anti-sigma factor RsfB;protein_id=NP_218204.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4129893 4130357 . - . ID=gene-Rv3688c;Dbxref=GeneID:885563;Name=Rv3688c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3688c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4129893 4130357 . - 0 ID=cds-NP_218205.1;Parent=gene-Rv3688c;Dbxref=Genbank:NP_218205.1,GeneID:885563;Name=NP_218205.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3688c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218205.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4130357 4131712 . + . ID=gene-Rv3689;Dbxref=GeneID:885107;Name=Rv3689;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3689
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4130357 4131712 . + 0 ID=cds-NP_218206.1;Parent=gene-Rv3689;Dbxref=Genbank:NP_218206.1,GeneID:885107;Name=NP_218206.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3689;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218206.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4131739 4132392 . + . ID=gene-Rv3690;Dbxref=GeneID:885114;Name=Rv3690;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3690
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4131739 4132392 . + 0 ID=cds-NP_218207.1;Parent=gene-Rv3690;Dbxref=Genbank:NP_218207.1,GeneID:885114;Name=NP_218207.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21030493];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3690;product=membrane protein;protein_id=NP_218207.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4132518 4133519 . + . ID=gene-Rv3691;Dbxref=GeneID:885623;Name=Rv3691;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3691
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4132518 4133519 . + 0 ID=cds-NP_218208.1;Parent=gene-Rv3691;Dbxref=Genbank:NP_218208.1,GeneID:885623;Name=NP_218208.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3691;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218208.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4133516 4134592 . + . ID=gene-Rv3692;Dbxref=GeneID:885323;Name=moxR2;gbkey=Gene;gene=moxR2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3692
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4133516 4134592 . + 0 ID=cds-NP_218209.1;Parent=gene-Rv3692;Dbxref=Genbank:NP_218209.1,GeneID:885323;Name=NP_218209.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=moxR2;locus_tag=Rv3692;product=methanol dehydrogenase transcriptional regulator MoxR;protein_id=NP_218209.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4134601 4134725 . + . ID=id-NC_000962.3:4134601..4134725;Note=125 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass III.;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 4134726 4136048 . + . ID=gene-Rv3693;Dbxref=GeneID:885059;Name=Rv3693;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3693
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4134726 4136048 . + 0 ID=cds-NP_218210.1;Parent=gene-Rv3693;Dbxref=Genbank:NP_218210.1,GeneID:885059;Name=NP_218210.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3693;product=membrane protein;protein_id=NP_218210.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4136122 4137114 . - . ID=gene-Rv3694c;Dbxref=GeneID:885578;Name=Rv3694c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3694c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4136122 4137114 . - 0 ID=cds-NP_218211.1;Parent=gene-Rv3694c;Dbxref=Genbank:NP_218211.1,GeneID:885578;Name=NP_218211.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3694c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218211.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4137206 4138138 . + . ID=gene-Rv3695;Dbxref=GeneID:885538;Name=Rv3695;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3695
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4137206 4138138 . + 0 ID=cds-NP_218212.1;Parent=gene-Rv3695;Dbxref=Genbank:NP_218212.1,GeneID:885538;Name=NP_218212.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3695;product=membrane protein;protein_id=NP_218212.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4145614 4146891 . - . ID=gene-Rv3703c;Dbxref=GeneID:885128;Name=etgB;gbkey=Gene;gene=etgB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3703c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4146888 4148186 . - . ID=gene-Rv3704c;Dbxref=GeneID:885053;Name=gshA;gbkey=Gene;gene=gshA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3704c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4148318 4148962 . - . ID=gene-Rv3705c;Dbxref=GeneID:885229;Name=Rv3705c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3705c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4149091 4149480 . - . ID=gene-Rv3705A;Dbxref=GeneID:3205111;Name=Rv3705A;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3705A
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4149591 4149911 . - . ID=gene-Rv3706c;Dbxref=GeneID:885222;Name=Rv3706c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3706c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4150030 4151040 . - . ID=gene-Rv3707c;Dbxref=GeneID:885587;Name=Rv3707c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3707c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4151180 4152217 . - . ID=gene-Rv3708c;Dbxref=GeneID:885118;Name=asd;gbkey=Gene;gene=asd;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3708c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4152218 4153483 . - . ID=gene-Rv3709c;Dbxref=GeneID:885223;Name=ask;gbkey=Gene;gene=ask;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3709c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4153740 4155674 . + . ID=gene-Rv3710;Dbxref=GeneID:885092;Name=leuA;gbkey=Gene;gene=leuA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3710
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4153740 4155674 . + 0 ID=cds-NP_218227.3;Parent=gene-Rv3710;Dbxref=Genbank:NP_218227.3,GeneID:885092;Name=NP_218227.3;Note=alpha-isopropylmalate synthase) (alpha-IPM synthetase) (IPMS);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=leuA;inference=protein motif:PROSITE:PS00816;locus_tag=Rv3710;product=2-isopropylmalate synthase;protein_id=NP_218227.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4155740 4156729 . - . ID=gene-Rv3711c;Dbxref=GeneID:885088;Name=dnaQ;gbkey=Gene;gene=dnaQ;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3711c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4156981 4158222 . + . ID=gene-Rv3712;Dbxref=GeneID:885228;Name=Rv3712;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3712
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4156981 4158222 . + 0 ID=cds-NP_218229.1;Parent=gene-Rv3712;Dbxref=Genbank:NP_218229.1,GeneID:885228;Name=NP_218229.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3712;product=ligase;protein_id=NP_218229.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4158227 4158922 . + . ID=gene-Rv3713;Dbxref=GeneID:885584;Name=cobQ2;gbkey=Gene;gene=cobQ2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3713
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4158227 4158922 . + 0 ID=cds-NP_218230.1;Parent=gene-Rv3713;Dbxref=Genbank:NP_218230.1,GeneID:885584;Name=NP_218230.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=cobQ2;locus_tag=Rv3713;product=cobyric acid synthase CobQ;protein_id=NP_218230.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4158931 4159821 . - . ID=gene-Rv3714c;Dbxref=GeneID:885456;Name=Rv3714c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3714c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4158931 4159821 . - 0 ID=cds-NP_218231.1;Parent=gene-Rv3714c;Dbxref=Genbank:NP_218231.1,GeneID:885456;Name=NP_218231.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3714c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218231.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4159889 4160500 . - . ID=gene-Rv3715c;Dbxref=GeneID:885307;Name=recR;gbkey=Gene;gene=recR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3715c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4159889 4160500 . - 0 ID=cds-NP_218232.1;Parent=gene-Rv3715c;Dbxref=Genbank:NP_218232.1,GeneID:885307;Name=NP_218232.1;gbkey=CDS;gene=recR;locus_tag=Rv3715c;product=recombination protein RecR;protein_id=NP_218232.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4160512 4160913 . - . ID=gene-Rv3716c;Dbxref=GeneID:885595;Name=Rv3716c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3716c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4160512 4160913 . - 0 ID=cds-NP_218233.1;Parent=gene-Rv3716c;Dbxref=Genbank:NP_218233.1,GeneID:885595;Name=NP_218233.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3716c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218233.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4161048 4161773 . + . ID=gene-Rv3717;Dbxref=GeneID:885602;Name=Rv3717;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3717
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4161048 4161773 . + 0 ID=cds-NP_218234.1;Parent=gene-Rv3717;Dbxref=Genbank:NP_218234.1,GeneID:885602;Name=NP_218234.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3717;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218234.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4161815 4162258 . - . ID=gene-Rv3718c;Dbxref=GeneID:885582;Name=Rv3718c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3718c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4161815 4162258 . - 0 ID=cds-NP_218235.1;Parent=gene-Rv3718c;Dbxref=Genbank:NP_218235.1,GeneID:885582;Name=NP_218235.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3718c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218235.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4162306 4163718 . + . ID=gene-Rv3719;Dbxref=GeneID:885855;Name=Rv3719;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3719
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4162306 4163718 . + 0 ID=cds-NP_218236.1;Parent=gene-Rv3719;Dbxref=Genbank:NP_218236.1,GeneID:885855;Name=NP_218236.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3719;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218236.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4163736 4164998 . + . ID=gene-Rv3720;Dbxref=GeneID:885219;Name=Rv3720;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3720
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4163736 4164998 . + 0 ID=cds-NP_218237.3;Parent=gene-Rv3720;Dbxref=Genbank:NP_218237.3,GeneID:885219;Name=NP_218237.3;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3720;product=fatty acid synthase;protein_id=NP_218237.3;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4164995 4166731 . - . ID=gene-Rv3721c;Dbxref=GeneID:885361;Name=dnaZX;gbkey=Gene;gene=dnaZX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3721c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4164995 4166731 . - 0 ID=cds-NP_218238.1;Parent=gene-Rv3721c;Dbxref=Genbank:NP_218238.1,GeneID:885361;Name=NP_218238.1;gbkey=CDS;gene=dnaZX;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3721c;product=DNA polymerase III subunit gamma/tau;protein_id=NP_218238.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4166821 4168128 . - . ID=gene-Rv3722c;Dbxref=GeneID:885321;Name=Rv3722c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3722c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4166821 4168128 . - 0 ID=cds-NP_218239.2;Parent=gene-Rv3722c;Dbxref=Genbank:NP_218239.2,GeneID:885321;Name=NP_218239.2;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3722c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218239.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4168154 4168281 . - . ID=gene-RVnc0006;Dbxref=GeneID:14515877;Name=C8;gbkey=Gene;gene=C8;gene_biotype=ncRNA;gene_synonym=mcr6;locus_tag=RVnc0006
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 4168154 4168281 . - . ID=rna-RVnc0006;Parent=gene-RVnc0006;Dbxref=GeneID:14515877;Note=C8%2C possible 4.5S RNA (See Arnvig and Young%2C 2009%3B DiChiara et al.%2C 2010)%2C part of signal recognition particle with protein Ffh. Alternate 3'-ends at positions 4168212 and 4168224.;gbkey=ncRNA;gene=C8;locus_tag=RVnc0006;product=Possible 4.5S RNA in signal recognition particle (small cytoplasmic RNA) (SC-RNA)
+NC_000962.3 RefSeq exon 4168154 4168281 . - . ID=exon-RVnc0006-1;Parent=rna-RVnc0006;Dbxref=GeneID:14515877;Note=C8%2C possible 4.5S RNA (See Arnvig and Young%2C 2009%3B DiChiara et al.%2C 2010)%2C part of signal recognition particle with protein Ffh. Alternate 3'-ends at positions 4168212 and 4168224.;gbkey=ncRNA;gene=C8;locus_tag=RVnc0006;product=Possible 4.5S RNA in signal recognition particle (small cytoplasmic RNA) (SC-RNA)
+NC_000962.3 RefSeq gene 4168345 4168430 . + . ID=gene-Rvnt41;Dbxref=GeneID:2700443;Name=serV;gbkey=Gene;gene=serV;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt41
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 4168345 4168430 . + . ID=rna-Rvnt41;Parent=gene-Rvnt41;Dbxref=GeneID:2700443;Note=serV%2C tRNA-Ser%2C anticodon gga%2C length %3D 86;anticodon=(pos:4168379..4168381);codons=5;gbkey=tRNA;gene=serV;locus_tag=Rvnt41;product=tRNA-Ser
+NC_000962.3 RefSeq exon 4168345 4168430 . + . ID=exon-Rvnt41-1;Parent=rna-Rvnt41;Dbxref=GeneID:2700443;Note=serV%2C tRNA-Ser%2C anticodon gga%2C length %3D 86;anticodon=(pos:4168379..4168381);codons=5;gbkey=tRNA;gene=serV;locus_tag=Rvnt41;product=tRNA-Ser
+NC_000962.3 RefSeq gene 4168536 4169300 . + . ID=gene-Rv3723;Dbxref=GeneID:885791;Name=Rv3723;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3723
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4168536 4169300 . + 0 ID=cds-NP_218240.1;Parent=gene-Rv3723;Dbxref=Genbank:NP_218240.1,GeneID:885791;Name=NP_218240.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3723;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218240.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4170214 4171143 . + . ID=gene-Rv3725;Dbxref=GeneID:885887;Name=Rv3725;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3725
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4170214 4171143 . + 0 ID=cds-NP_218242.1;Parent=gene-Rv3725;Dbxref=Genbank:NP_218242.1,GeneID:885887;Name=NP_218242.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3725;product=oxidoreductase;protein_id=NP_218242.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4171421 4172614 . + . ID=gene-Rv3726;Dbxref=GeneID:885801;Name=Rv3726;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3726
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4171421 4172614 . + 0 ID=cds-NP_218243.1;Parent=gene-Rv3726;Dbxref=Genbank:NP_218243.1,GeneID:885801;Name=NP_218243.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3726;product=dehydrogenase;protein_id=NP_218243.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4172955 4174763 . + . ID=gene-Rv3727;Dbxref=GeneID:885766;Name=Rv3727;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3727
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4172955 4174763 . + 0 ID=cds-NP_218244.1;Parent=gene-Rv3727;Dbxref=Genbank:NP_218244.1,GeneID:885766;Name=NP_218244.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3727;product=oxidoreductase;protein_id=NP_218244.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4174873 4178070 . + . ID=gene-Rv3728;Dbxref=GeneID:885271;Name=Rv3728;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3728
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4174873 4178070 . + 0 ID=cds-NP_218245.1;Parent=gene-Rv3728;Dbxref=Genbank:NP_218245.1,GeneID:885271;Name=NP_218245.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00889;locus_tag=Rv3728;product=membrane protein;protein_id=NP_218245.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4178285 4180615 . + . ID=gene-Rv3729;Dbxref=GeneID:885706;Name=Rv3729;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3729
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4178285 4180615 . + 0 ID=cds-NP_218246.1;Parent=gene-Rv3729;Dbxref=Genbank:NP_218246.1,GeneID:885706;Name=NP_218246.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3729;product=transferase;protein_id=NP_218246.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4180680 4181720 . - . ID=gene-Rv3730c;Dbxref=GeneID:885201;Name=Rv3730c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3730c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4180680 4181720 . - 0 ID=cds-NP_218247.1;Parent=gene-Rv3730c;Dbxref=Genbank:NP_218247.1,GeneID:885201;Name=NP_218247.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3730c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218247.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4181758 4182834 . + . ID=gene-Rv3731;Dbxref=GeneID:885771;Name=ligC;gbkey=Gene;gene=ligC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3731
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4181758 4182834 . + 0 ID=cds-NP_218248.1;Parent=gene-Rv3731;Dbxref=Genbank:NP_218248.1,GeneID:885771;Name=NP_218248.1;Note=ATP-dependent%3B polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] (polynucleotide ligase [ATP]) (sealase) (DNA repair protein) (DNA joinase);experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:14985346];gbkey=CDS;gene=ligC;locus_tag=Rv3731;product=DNA ligase C;protein_id=NP_218248.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4182934 4183992 . + . ID=gene-Rv3732;Dbxref=GeneID:885795;Name=Rv3732;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3732
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4182934 4183992 . + 0 ID=cds-NP_218249.1;Parent=gene-Rv3732;Dbxref=Genbank:NP_218249.1,GeneID:885795;Name=NP_218249.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3732;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218249.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4184012 4184512 . - . ID=gene-Rv3733c;Dbxref=GeneID:885721;Name=Rv3733c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3733c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4184012 4184512 . - 0 ID=cds-NP_218250.1;Parent=gene-Rv3733c;Dbxref=Genbank:NP_218250.1,GeneID:885721;Name=NP_218250.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3733c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218250.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4184526 4185890 . - . ID=gene-Rv3734c;Dbxref=GeneID:885335;Name=tgs2;gbkey=Gene;gene=tgs2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3734c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4184526 4185890 . - 0 ID=cds-NP_218251.1;Parent=gene-Rv3734c;Dbxref=Genbank:NP_218251.1,GeneID:885335;Name=NP_218251.1;Note=triacylglycerol synthase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=tgs2;inference=protein motif:PROSITE:PS00339;locus_tag=Rv3734c;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_218251.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4186089 4186577 . + . ID=gene-Rv3735;Dbxref=GeneID:885318;Name=Rv3735;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3735
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4186089 4186577 . + 0 ID=cds-NP_218252.1;Parent=gene-Rv3735;Dbxref=Genbank:NP_218252.1,GeneID:885318;Name=NP_218252.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00435;locus_tag=Rv3735;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218252.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4186634 4187695 . + . ID=gene-Rv3736;Dbxref=GeneID:885389;Name=Rv3736;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3736
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4186634 4187695 . + 0 ID=cds-NP_218253.1;Parent=gene-Rv3736;Dbxref=Genbank:NP_218253.1,GeneID:885389;Name=NP_218253.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3736;product=AraC/XylS family transcriptional regulator;protein_id=NP_218253.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4187699 4189288 . + . ID=gene-Rv3737;Dbxref=GeneID:885794;Name=Rv3737;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3737
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4187699 4189288 . + 0 ID=cds-NP_218254.1;Parent=gene-Rv3737;Dbxref=Genbank:NP_218254.1,GeneID:885794;Name=NP_218254.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3737;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218254.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4189285 4190232 . - . ID=gene-Rv3738c;Dbxref=GeneID:886262;Name=PPE66;gbkey=Gene;gene=PPE66;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3738c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4189285 4190232 . - 0 ID=cds-YP_178009.1;Parent=gene-Rv3738c;Dbxref=Genbank:YP_178009.1,GeneID:886262;Name=YP_178009.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE protein family;gbkey=CDS;gene=PPE66;locus_tag=Rv3738c;product=PPE family protein PPE66;protein_id=YP_178009.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4190284 4190517 . - . ID=gene-Rv3739c;Dbxref=GeneID:886257;Name=PPE67;gbkey=Gene;gene=PPE67;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3739c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4190284 4190517 . - 0 ID=cds-YP_178010.1;Parent=gene-Rv3739c;Dbxref=Genbank:YP_178010.1,GeneID:886257;Name=YP_178010.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PPE67;locus_tag=Rv3739c;product=PPE family protein PPE67;protein_id=YP_178010.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4190833 4192179 . - . ID=gene-Rv3740c;Dbxref=GeneID:885781;Name=Rv3740c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3740c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4190833 4192179 . - 0 ID=cds-NP_218257.1;Parent=gene-Rv3740c;Dbxref=Genbank:NP_218257.1,GeneID:885781;Name=NP_218257.1;Note=triacylglycerol synthase;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3740c;product=diacyglycerol O-acyltransferase;protein_id=NP_218257.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4192179 4192853 . - . ID=gene-Rv3741c;Dbxref=GeneID:885129;Name=Rv3741c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3741c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4192179 4192853 . - 0 ID=cds-NP_218258.1;Parent=gene-Rv3741c;Dbxref=Genbank:NP_218258.1,GeneID:885129;Name=NP_218258.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3741c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_218258.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4192850 4193245 . - . ID=gene-Rv3742c;Dbxref=GeneID:885263;Name=Rv3742c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3742c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4192850 4193245 . - 0 ID=cds-NP_218259.1;Parent=gene-Rv3742c;Dbxref=Genbank:NP_218259.1,GeneID:885263;Name=NP_218259.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3742c;product=oxidoreductase;protein_id=NP_218259.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4193391 4195373 . - . ID=gene-Rv3743c;Dbxref=GeneID:885106;Name=ctpJ;gbkey=Gene;gene=ctpJ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=nmtA;locus_tag=Rv3743c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4193391 4195373 . - 0 ID=cds-NP_218260.1;Parent=gene-Rv3743c;Dbxref=Genbank:NP_218260.1,GeneID:885106;Name=NP_218260.1;Note=P-type ATPase;gbkey=CDS;gene=ctpJ;inference=protein motif:PROSITE:PS01229;locus_tag=Rv3743c;product=cation transporter ATPase J;protein_id=NP_218260.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4195440 4195802 . + . ID=gene-Rv3744;Dbxref=GeneID:885418;Name=nmtR;gbkey=Gene;gene=nmtR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3744
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4195440 4195802 . + 0 ID=cds-NP_218261.1;Parent=gene-Rv3744;Dbxref=Genbank:NP_218261.1,GeneID:885418;Name=NP_218261.1;Note=ArsR/SmtB family metal sensor;gbkey=CDS;gene=nmtR;locus_tag=Rv3744;product=HTH-type transcriptional regulator NmtR;protein_id=NP_218261.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4195886 4196098 . - . ID=gene-Rv3745c;Dbxref=GeneID:885597;Name=Rv3745c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3745c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4195886 4196098 . - 0 ID=cds-NP_218262.1;Parent=gene-Rv3745c;Dbxref=Genbank:NP_218262.1,GeneID:885597;Name=NP_218262.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3745c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218262.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4196171 4196506 . - . ID=gene-Rv3746c;Dbxref=GeneID:885764;Name=PE34;gbkey=Gene;gene=PE34;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3746c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4196171 4196506 . - 0 ID=cds-YP_178011.1;Parent=gene-Rv3746c;Dbxref=Genbank:YP_178011.1,GeneID:885764;Name=YP_178011.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PE family%2C PGRS subfamily of ala-%2C gly-rich proteins;gbkey=CDS;gene=PE34;locus_tag=Rv3746c;product=PE family protein PE34;protein_id=YP_178011.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4196724 4197107 . + . ID=gene-Rv3747;Dbxref=GeneID:885778;Name=Rv3747;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3747
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4196724 4197107 . + 0 ID=cds-NP_218264.1;Parent=gene-Rv3747;Dbxref=Genbank:NP_218264.1,GeneID:885778;Name=NP_218264.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3747;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218264.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4197236 4197595 . + . ID=gene-Rv3748;Dbxref=GeneID:885776;Name=Rv3748;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3748
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4197236 4197595 . + 0 ID=cds-NP_218265.1;Parent=gene-Rv3748;Dbxref=Genbank:NP_218265.1,GeneID:885776;Name=NP_218265.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3748;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218265.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4197628 4198137 . - . ID=gene-Rv3749c;Dbxref=GeneID:885384;Name=Rv3749c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3749c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4197628 4198137 . - 0 ID=cds-NP_218266.1;Parent=gene-Rv3749c;Dbxref=Genbank:NP_218266.1,GeneID:885384;Name=NP_218266.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00092;locus_tag=Rv3749c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218266.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4198205 4198597 . - . ID=gene-Rv3750c;Dbxref=GeneID:885807;Name=Rv3750c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3750c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4198205 4198597 . - 0 ID=cds-NP_218267.1;Parent=gene-Rv3750c;Dbxref=Genbank:NP_218267.1,GeneID:885807;Name=NP_218267.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3750c;product=excisionase;protein_id=NP_218267.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4205538 4205840 . + . ID=gene-Rv3760;Dbxref=GeneID:886093;Name=Rv3760;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3760
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4206996 4208876 . - . ID=gene-Rv3762c;Dbxref=GeneID:886096;Name=Rv3762c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3762c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4209047 4209526 . + . ID=gene-Rv3763;Dbxref=GeneID:886097;Name=lpqH;gbkey=Gene;gene=lpqH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3763
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4209582 4211009 . - . ID=gene-Rv3764c;Dbxref=GeneID:886094;Name=tcrY;gbkey=Gene;gene=tcrY;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3764c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4209582 4211009 . - 0 ID=cds-NP_218281.1;Parent=gene-Rv3764c;Dbxref=Genbank:NP_218281.1,GeneID:886094;Name=NP_218281.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:12595424];gbkey=CDS;gene=tcrY;locus_tag=Rv3764c;product=two component sensor kinase TcrY;protein_id=NP_218281.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4211080 4211784 . - . ID=gene-Rv3765c;Dbxref=GeneID:886100;Name=tcrX;gbkey=Gene;gene=tcrX;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3765c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4211080 4211784 . - 0 ID=cds-NP_218282.1;Parent=gene-Rv3765c;Dbxref=Genbank:NP_218282.1,GeneID:886100;Name=NP_218282.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression[PMID:12595424];gbkey=CDS;gene=tcrX;locus_tag=Rv3765c;product=two component transcriptional regulator TcrX;protein_id=NP_218282.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4212293 4212982 . + . ID=gene-Rv3766;Dbxref=GeneID:886099;Name=Rv3766;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3766
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4212293 4212982 . + 0 ID=cds-NP_218283.1;Parent=gene-Rv3766;Dbxref=Genbank:NP_218283.1,GeneID:886099;Name=NP_218283.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3766;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218283.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4212996 4213940 . - . ID=gene-Rv3767c;Dbxref=GeneID:886101;Name=Rv3767c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3767c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4212996 4213940 . - 0 ID=cds-NP_218284.1;Parent=gene-Rv3767c;Dbxref=Genbank:NP_218284.1,GeneID:886101;Name=NP_218284.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3767c;product=S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase;protein_id=NP_218284.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4214070 4214429 . + . ID=gene-Rv3768;Dbxref=GeneID:886102;Name=Rv3768;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3768
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4214070 4214429 . + 0 ID=cds-NP_218285.1;Parent=gene-Rv3768;Dbxref=Genbank:NP_218285.1,GeneID:886102;Name=NP_218285.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3768;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218285.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4214615 4214887 . + . ID=gene-Rv3769;Dbxref=GeneID:885239;Name=Rv3769;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3769
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4214615 4214887 . + 0 ID=cds-NP_218286.1;Parent=gene-Rv3769;Dbxref=Genbank:NP_218286.1,GeneID:885239;Name=NP_218286.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3769;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218286.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4215200 4215775 . - . ID=gene-Rv3770c;Dbxref=GeneID:886104;Name=Rv3770c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3770c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4215200 4215775 . - 0 ID=cds-NP_218287.1;Parent=gene-Rv3770c;Dbxref=Genbank:NP_218287.1,GeneID:886104;Name=NP_218287.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3770c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218287.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4216404 4216730 . - . ID=gene-Rv3771c;Dbxref=GeneID:886103;Name=Rv3771c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3771c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4216404 4216730 . - 0 ID=cds-NP_218288.1;Parent=gene-Rv3771c;Dbxref=Genbank:NP_218288.1,GeneID:886103;Name=NP_218288.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3771c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218288.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4216865 4216937 . - . ID=gene-Rvnt43;Dbxref=GeneID:2700457;Name=argU;gbkey=Gene;gene=argU;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt43
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 4216865 4216937 . - . ID=rna-Rvnt43;Parent=gene-Rvnt43;Dbxref=GeneID:2700457;Note=argU%2C tRNA-Arg%2C anticodon acg%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(4216902..4216904));codons=28;gbkey=tRNA;gene=argU;locus_tag=Rvnt43;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq exon 4216865 4216937 . - . ID=exon-Rvnt43-1;Parent=rna-Rvnt43;Dbxref=GeneID:2700457;Note=argU%2C tRNA-Arg%2C anticodon acg%2C length %3D 73;anticodon=(pos:complement(4216902..4216904));codons=28;gbkey=tRNA;gene=argU;locus_tag=Rvnt43;product=tRNA-Arg
+NC_000962.3 RefSeq gene 4216968 4217056 . - . ID=gene-Rvnt44;Dbxref=GeneID:2700421;Name=serT;gbkey=Gene;gene=serT;gene_biotype=tRNA;locus_tag=Rvnt44
+NC_000962.3 RefSeq tRNA 4216968 4217056 . - . ID=rna-Rvnt44;Parent=gene-Rvnt44;Dbxref=GeneID:2700421;Note=serT%2C tRNA-Ser%2C anticodon gct%2C length %3D 89;anticodon=(pos:complement(4217020..4217022));codons=45;gbkey=tRNA;gene=serT;locus_tag=Rvnt44;product=tRNA-Ser
+NC_000962.3 RefSeq exon 4216968 4217056 . - . ID=exon-Rvnt44-1;Parent=rna-Rvnt44;Dbxref=GeneID:2700421;Note=serT%2C tRNA-Ser%2C anticodon gct%2C length %3D 89;anticodon=(pos:complement(4217020..4217022));codons=45;gbkey=tRNA;gene=serT;locus_tag=Rvnt44;product=tRNA-Ser
+NC_000962.3 RefSeq gene 4217134 4218195 . + . ID=gene-Rv3772;Dbxref=GeneID:886105;Name=hisC2;gbkey=Gene;gene=hisC2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3772
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4217134 4218195 . + 0 ID=cds-NP_218289.1;Parent=gene-Rv3772;Dbxref=Genbank:NP_218289.1,GeneID:886105;Name=NP_218289.1;Note=imidazole acetol-phosphate transaminase (imidazolylacetolphosphate aminotransferase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=hisC2;inference=protein motif:PROSITE:PS00599;locus_tag=Rv3772;product=histidinol-phosphate aminotransferase;protein_id=NP_218289.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4218241 4218825 . - . ID=gene-Rv3773c;Dbxref=GeneID:886095;Name=Rv3773c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3773c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4218241 4218825 . - 0 ID=cds-NP_218290.1;Parent=gene-Rv3773c;Dbxref=Genbank:NP_218290.1,GeneID:886095;Name=NP_218290.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3773c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218290.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4218849 4219673 . + . ID=gene-Rv3774;Dbxref=GeneID:886106;Name=echA21;gbkey=Gene;gene=echA21;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3774
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4218849 4219673 . + 0 ID=cds-NP_218291.1;Parent=gene-Rv3774;Dbxref=Genbank:NP_218291.1,GeneID:886106;Name=NP_218291.1;Note=enoyl hydrase (unsaturated acyl-CoA hydratase) (crotonase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=echA21;locus_tag=Rv3774;product=enoyl-CoA hydratase EchA21;protein_id=NP_218291.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4219685 4220932 . + . ID=gene-Rv3775;Dbxref=GeneID:886269;Name=lipE;gbkey=Gene;gene=lipE;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3775
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4231320 4232393 . + . ID=gene-Rv3785;Dbxref=GeneID:886119;Name=Rv3785;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3785
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4231320 4232393 . + 0 ID=cds-NP_218302.1;Parent=gene-Rv3785;Dbxref=Genbank:NP_218302.1,GeneID:886119;Name=NP_218302.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3785;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218302.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4232374 4233597 . - . ID=gene-Rv3786c;Dbxref=GeneID:886108;Name=Rv3786c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3786c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4232374 4233597 . - 0 ID=cds-NP_218303.1;Parent=gene-Rv3786c;Dbxref=Genbank:NP_218303.1,GeneID:886108;Name=NP_218303.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3786c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218303.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4233610 4234536 . - . ID=gene-Rv3787c;Dbxref=GeneID:886118;Name=Rv3787c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3787c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4234780 4235265 . + . ID=gene-Rv3788;Dbxref=GeneID:886120;Name=Rv3788;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3788
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4235374 4235739 . + . ID=gene-Rv3789;Dbxref=GeneID:886109;Name=Rv3789;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3789
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4235374 4235739 . + 0 ID=cds-NP_218306.1;Parent=gene-Rv3789;Dbxref=Genbank:NP_218306.1,GeneID:886109;Name=NP_218306.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3789;product=GtrA family protein;protein_id=NP_218306.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4235779 4237164 . + . ID=gene-Rv3790;Dbxref=GeneID:886125;Name=dprE1;gbkey=Gene;gene=dprE1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3790
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4235779 4237164 . + 0 ID=cds-NP_218307.1;Parent=gene-Rv3790;Dbxref=Genbank:NP_218307.1,GeneID:886125;Name=NP_218307.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=dprE1;locus_tag=Rv3790;product=decaprenylphosphoryl-beta-D-ribose oxidase;protein_id=NP_218307.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4237165 4237929 . + . ID=gene-Rv3791;Dbxref=GeneID:886124;Name=dprE2;gbkey=Gene;gene=dprE2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3791
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4237165 4237929 . + 0 ID=cds-NP_218308.1;Parent=gene-Rv3791;Dbxref=Genbank:NP_218308.1,GeneID:886124;Name=NP_218308.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16291675];gbkey=CDS;gene=dprE2;inference=protein motif:PROSITE:PS00061;locus_tag=Rv3791;product=decaprenylphosphoryl-D-2-keto erythropentose reductase;protein_id=NP_218308.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4237932 4239863 . + . ID=gene-Rv3792;Dbxref=GeneID:886127;Name=aftA;gbkey=Gene;gene=aftA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3792
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4237932 4239863 . + 0 ID=cds-NP_218309.1;Parent=gene-Rv3792;Dbxref=Genbank:NP_218309.1,GeneID:886127;Name=NP_218309.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:16595677];gbkey=CDS;gene=aftA;locus_tag=Rv3792;product=arabinofuranosyltransferase;protein_id=NP_218309.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4239863 4243147 . + . ID=gene-Rv3793;Dbxref=GeneID:886112;Name=embC;gbkey=Gene;gene=embC;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3793
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4239863 4243147 . + 0 ID=cds-NP_218310.1;Parent=gene-Rv3793;Dbxref=Genbank:NP_218310.1,GeneID:886112;Name=NP_218310.1;Note=EmbC (arabinosylindolylacetylinositol synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:9142129];gbkey=CDS;gene=embC;inference=protein motif:PROSITE:PS00044;locus_tag=Rv3793;product=arabinosyltransferase C;protein_id=NP_218310.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4243233 4246517 . + . ID=gene-Rv3794;Dbxref=GeneID:886123;Name=embA;gbkey=Gene;gene=embA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3794
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4243233 4246517 . + 0 ID=cds-NP_218311.1;Parent=gene-Rv3794;Dbxref=Genbank:NP_218311.1,GeneID:886123;Name=NP_218311.1;Note=EmbA (arabinosylindolylacetylinositol synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:9142129];gbkey=CDS;gene=embA;locus_tag=Rv3794;product=arabinosyltransferase A;protein_id=NP_218311.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4246514 4249810 . + . ID=gene-Rv3795;Dbxref=GeneID:886126;Name=embB;gbkey=Gene;gene=embB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3795
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4246514 4249810 . + 0 ID=cds-NP_218312.1;Parent=gene-Rv3795;Dbxref=Genbank:NP_218312.1,GeneID:886126;Name=NP_218312.1;Note=EmbB (arabinosylindolylacetylinositol synthase);experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:9142129];gbkey=CDS;gene=embB;locus_tag=Rv3795;product=arabinosyltransferase B;protein_id=NP_218312.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4249878 4251005 . + . ID=gene-Rv3796;Dbxref=GeneID:886128;Name=Rv3796;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=atsH;locus_tag=Rv3796
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4249878 4251005 . + 0 ID=cds-YP_178016.1;Parent=gene-Rv3796;Dbxref=Genbank:YP_178016.1,GeneID:886128;Name=YP_178016.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3796;product=hypothetical protein;protein_id=YP_178016.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4251085 4252866 . + . ID=gene-Rv3797;Dbxref=GeneID:886122;Name=fadE35;gbkey=Gene;gene=fadE35;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3797
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4251085 4252866 . + 0 ID=cds-NP_218314.1;Parent=gene-Rv3797;Dbxref=Genbank:NP_218314.1,GeneID:886122;Name=NP_218314.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadE35;locus_tag=Rv3797;product=acyl-CoA dehydrogenase FadE35;protein_id=NP_218314.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4252993 4254327 . + . ID=gene-Rv3798;Dbxref=GeneID:886268;Name=Rv3798;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3798
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4252993 4254327 . + 0 ID=cds-NP_218315.1;Parent=gene-Rv3798;Dbxref=Genbank:NP_218315.1,GeneID:886268;Name=NP_218315.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3798;product=insertion sequence element IS1557 transposase;protein_id=NP_218315.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 4252993 4254324 . + . ID=id-Rv3798;Dbxref=GeneID:886268;Note=IS1557-3%2C len: 1332 nt. Insertion sequence IS1557.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1557-3
+NC_000962.3 RefSeq gene 4254380 4255948 . - . ID=gene-Rv3799c;Dbxref=GeneID:886131;Name=accD4;gbkey=Gene;gene=accD4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3799c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4254380 4255948 . - 0 ID=cds-NP_218316.2;Parent=gene-Rv3799c;Dbxref=Genbank:NP_218316.2,GeneID:886131;Name=NP_218316.2;Note=pccase (propanoyl-CoA:carbon dioxide ligase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=accD4;locus_tag=Rv3799c;product=propionyl-CoA carboxylase subunit beta AccD;protein_id=NP_218316.2;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4255945 4261146 . - . ID=gene-Rv3800c;Dbxref=GeneID:886133;Name=pks13;gbkey=Gene;gene=pks13;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3800c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4255945 4261146 . - 0 ID=cds-NP_218317.1;Parent=gene-Rv3800c;Dbxref=Genbank:NP_218317.1,GeneID:886133;Name=NP_218317.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pks13;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv3800c;product=polyketide synthase;protein_id=NP_218317.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4261153 4263066 . - . ID=gene-Rv3801c;Dbxref=GeneID:886130;Name=fadD32;gbkey=Gene;gene=fadD32;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3801c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4261153 4263066 . - 0 ID=cds-NP_218318.1;Parent=gene-Rv3801c;Dbxref=Genbank:NP_218318.1,GeneID:886130;Name=NP_218318.1;Note=fatty-acid-AMP synthetase (fatty-acid-AMP synthase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=fadD32;locus_tag=Rv3801c;product=long-chain-fatty-acid--AMP ligase FadD32;protein_id=NP_218318.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4263355 4264365 . - . ID=gene-Rv3802c;Dbxref=GeneID:886135;Name=Rv3802c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=clp6,culp6;locus_tag=Rv3802c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4264563 4265462 . - . ID=gene-Rv3803c;Dbxref=GeneID:886121;Name=fbpD;gbkey=Gene;gene=fbpD;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=fbpC1,mpb51,mpt51;locus_tag=Rv3803c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4272276 4273475 . - . ID=gene-Rv3809c;Dbxref=GeneID:886142;Name=glf;gbkey=Gene;gene=glf;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ceoA;locus_tag=Rv3809c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4273739 4274593 . + . ID=gene-Rv3810;Dbxref=GeneID:886139;Name=pirG;gbkey=Gene;gene=pirG;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=erp,P36;locus_tag=Rv3810
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4273739 4274593 . + 0 ID=cds-NP_218327.1;Parent=gene-Rv3810;Dbxref=Genbank:NP_218327.1,GeneID:886139;Name=NP_218327.1;Note=Exported repetitive protein precursor PirG;gbkey=CDS;gene=pirG;locus_tag=Rv3810;product=cell surface protein;protein_id=NP_218327.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4274798 4276417 . + . ID=gene-Rv3811;Dbxref=GeneID:886137;Name=Rv3811;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=csp;locus_tag=Rv3811
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4276571 4278085 . + . ID=gene-Rv3812;Dbxref=GeneID:886143;Name=PE_PGRS62;gbkey=Gene;gene=PE_PGRS62;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3812
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4278394 4279215 . - . ID=gene-Rv3813c;Dbxref=GeneID:886147;Name=Rv3813c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3813c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4278394 4279215 . - 0 ID=cds-NP_218330.1;Parent=gene-Rv3813c;Dbxref=Genbank:NP_218330.1,GeneID:886147;Name=NP_218330.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3813c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218330.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4279230 4280015 . - . ID=gene-Rv3814c;Dbxref=GeneID:886150;Name=Rv3814c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3814c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4279230 4280015 . - 0 ID=cds-NP_218331.1;Parent=gene-Rv3814c;Dbxref=Genbank:NP_218331.1,GeneID:886150;Name=NP_218331.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3814c;product=acyltransferase;protein_id=NP_218331.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4280033 4280788 . - . ID=gene-Rv3815c;Dbxref=GeneID:886149;Name=Rv3815c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3815c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4280033 4280788 . - 0 ID=cds-NP_218332.1;Parent=gene-Rv3815c;Dbxref=Genbank:NP_218332.1,GeneID:886149;Name=NP_218332.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3815c;product=acyltransferase;protein_id=NP_218332.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4280792 4281571 . - . ID=gene-Rv3816c;Dbxref=GeneID:886152;Name=Rv3816c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3816c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4280792 4281571 . - 0 ID=cds-NP_218333.1;Parent=gene-Rv3816c;Dbxref=Genbank:NP_218333.1,GeneID:886152;Name=NP_218333.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3816c;product=acyltransferase;protein_id=NP_218333.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4281647 4282402 . + . ID=gene-Rv3817;Dbxref=GeneID:886144;Name=Rv3817;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3817
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4281647 4282402 . + 0 ID=cds-NP_218334.1;Parent=gene-Rv3817;Dbxref=Genbank:NP_218334.1,GeneID:886144;Name=NP_218334.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3817;product=phosphotransferase;protein_id=NP_218334.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4282449 4283999 . + . ID=gene-Rv3818;Dbxref=GeneID:886153;Name=Rv3818;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3818
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4282449 4283999 . + 0 ID=cds-NP_218335.1;Parent=gene-Rv3818;Dbxref=Genbank:NP_218335.1,GeneID:886153;Name=NP_218335.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3818;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218335.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4283996 4284331 . + . ID=gene-Rv3819;Dbxref=GeneID:886146;Name=Rv3819;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3819
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4283996 4284331 . + 0 ID=cds-NP_218336.1;Parent=gene-Rv3819;Dbxref=Genbank:NP_218336.1,GeneID:886146;Name=NP_218336.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3819;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218336.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4284419 4285825 . - . ID=gene-Rv3820c;Dbxref=GeneID:886140;Name=papA2;gbkey=Gene;gene=papA2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3820c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4284419 4285825 . - 0 ID=cds-YP_178020.1;Parent=gene-Rv3820c;Dbxref=Genbank:YP_178020.1,GeneID:886140;Name=YP_178020.1;Note=polyketide synthase associated protein PapA;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=papA2;locus_tag=Rv3820c;product=trehalose-2-sulfate acyltransferase;protein_id=YP_178020.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4285973 4286686 . + . ID=gene-Rv3821;Dbxref=GeneID:886141;Name=Rv3821;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3821
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4285973 4286686 . + 0 ID=cds-NP_218338.1;Parent=gene-Rv3821;Dbxref=Genbank:NP_218338.1,GeneID:886141;Name=NP_218338.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3821;product=integral membrane protein;protein_id=NP_218338.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4286721 4287935 . + . ID=gene-Rv3822;Dbxref=GeneID:886155;Name=Rv3822;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3822
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4286721 4287935 . + 0 ID=cds-NP_218339.1;Parent=gene-Rv3822;Dbxref=Genbank:NP_218339.1,GeneID:886155;Name=NP_218339.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3822;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218339.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4288260 4291529 . - . ID=gene-Rv3823c;Dbxref=GeneID:886145;Name=mmpL8;gbkey=Gene;gene=mmpL8;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3823c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4288260 4291529 . - 0 ID=cds-NP_218340.1;Parent=gene-Rv3823c;Dbxref=Genbank:NP_218340.1,GeneID:886145;Name=NP_218340.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;gene=mmpL8;locus_tag=Rv3823c;product=integral membrane transport protein MmpL8;protein_id=NP_218340.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4291639 4293174 . - . ID=gene-Rv3824c;Dbxref=GeneID:886156;Name=papA1;gbkey=Gene;gene=papA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3824c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4291639 4293174 . - 0 ID=cds-NP_218341.1;Parent=gene-Rv3824c;Dbxref=Genbank:NP_218341.1,GeneID:886156;Name=NP_218341.1;Note=Polyketide synthase-associated protein A1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:17259623];gbkey=CDS;gene=papA1;inference=protein motif:PROSITE:PS00453;locus_tag=Rv3824c;product=acyltransferase;protein_id=NP_218341.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4293225 4299605 . - . ID=gene-Rv3825c;Dbxref=GeneID:886148;Name=pks2;gbkey=Gene;gene=pks2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3825c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4293225 4299605 . - 0 ID=cds-NP_218342.1;Parent=gene-Rv3825c;Dbxref=Genbank:NP_218342.1,GeneID:886148;Name=NP_218342.1;Note=polyketide synthase;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:11278910];gbkey=CDS;gene=pks2;inference=protein motif:PROSITE:PS00606;locus_tag=Rv3825c;product=phthioceranic/hydroxyphthioceranic acid synthase;protein_id=NP_218342.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4299812 4301566 . + . ID=gene-Rv3826;Dbxref=GeneID:886154;Name=fadD23;gbkey=Gene;gene=fadD23;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3826
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4299812 4301566 . + 0 ID=cds-NP_218343.1;Parent=gene-Rv3826;Dbxref=Genbank:NP_218343.1,GeneID:886154;Name=NP_218343.1;Note=fatty-acid-AMP synthetase (fatty-acid-AMP synthase);experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=fadD23;locus_tag=Rv3826;product=long-chain-fatty-acid--CoA ligase FadD23;protein_id=NP_218343.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq mobile_genetic_element 4301543 4303415 . - . ID=id-NC_000962.3:4301543..4303415;Note=IS1537%2C len: 1873 nt. Insertion sequence IS1537.;gbkey=mobile_element;mobile_element_type=insertion sequence:IS1537
+NC_000962.3 RefSeq gene 4301563 4302789 . - . ID=gene-Rv3827c;Dbxref=GeneID:886151;Name=Rv3827c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3827c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4301563 4302789 . - 0 ID=cds-NP_218344.1;Parent=gene-Rv3827c;Dbxref=Genbank:NP_218344.1,GeneID:886151;Name=NP_218344.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3827c;product=transposase;protein_id=NP_218344.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4302786 4303397 . - . ID=gene-Rv3828c;Dbxref=GeneID:886160;Name=Rv3828c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3828c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4302786 4303397 . - 0 ID=cds-NP_218345.1;Parent=gene-Rv3828c;Dbxref=Genbank:NP_218345.1,GeneID:886160;Name=NP_218345.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00397;locus_tag=Rv3828c;product=resolvase;protein_id=NP_218345.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4303398 4305008 . - . ID=gene-Rv3829c;Dbxref=GeneID:886157;Name=Rv3829c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3829c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4303398 4305008 . - 0 ID=cds-NP_218346.1;Parent=gene-Rv3829c;Dbxref=Genbank:NP_218346.1,GeneID:886157;Name=NP_218346.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3829c;product=dehydrogenase;protein_id=NP_218346.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4305056 4305685 . - . ID=gene-Rv3830c;Dbxref=GeneID:886158;Name=Rv3830c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3830c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4305056 4305685 . - 0 ID=cds-NP_218347.1;Parent=gene-Rv3830c;Dbxref=Genbank:NP_218347.1,GeneID:886158;Name=NP_218347.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3830c;product=TetR family transcriptional regulator;protein_id=NP_218347.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4305757 4306239 . + . ID=gene-Rv3831;Dbxref=GeneID:886161;Name=Rv3831;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3831
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4305757 4306239 . + 0 ID=cds-NP_218348.1;Parent=gene-Rv3831;Dbxref=Genbank:NP_218348.1,GeneID:886161;Name=NP_218348.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3831;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218348.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4306236 4306811 . - . ID=gene-Rv3832c;Dbxref=GeneID:886165;Name=Rv3832c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3832c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4306236 4306811 . - 0 ID=cds-NP_218349.1;Parent=gene-Rv3832c;Dbxref=Genbank:NP_218349.1,GeneID:886165;Name=NP_218349.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3832c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218349.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4306867 4307658 . + . ID=gene-Rv3833;Dbxref=GeneID:886162;Name=Rv3833;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3833
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4306867 4307658 . + 0 ID=cds-NP_218350.1;Parent=gene-Rv3833;Dbxref=Genbank:NP_218350.1,GeneID:886162;Name=NP_218350.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3833;product=AraC family transcriptional regulator;protein_id=NP_218350.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4307655 4308914 . - . ID=gene-Rv3834c;Dbxref=GeneID:886163;Name=serS;gbkey=Gene;gene=serS;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3834c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4307655 4308914 . - 0 ID=cds-NP_218351.1;Parent=gene-Rv3834c;Dbxref=Genbank:NP_218351.1,GeneID:886163;Name=NP_218351.1;Note=SERYL-tRNA synthetase SerS (SERRS) (serine translase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=serS;inference=protein motif:PROSITE:PS00179;locus_tag=Rv3834c;product=serine--tRNA ligase;protein_id=NP_218351.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4309047 4310396 . + . ID=gene-Rv3835;Dbxref=GeneID:886168;Name=Rv3835;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3835
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4309047 4310396 . + 0 ID=cds-NP_218352.1;Parent=gene-Rv3835;Dbxref=Genbank:NP_218352.1,GeneID:886168;Name=NP_218352.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3835;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218352.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4310401 4310814 . + . ID=gene-Rv3836;Dbxref=GeneID:886164;Name=Rv3836;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3836
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4310401 4310814 . + 0 ID=cds-NP_218353.1;Parent=gene-Rv3836;Dbxref=Genbank:NP_218353.1,GeneID:886164;Name=NP_218353.1;gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00142;locus_tag=Rv3836;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218353.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4311009 4311707 . - . ID=gene-Rv3837c;Dbxref=GeneID:886169;Name=Rv3837c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3837c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4311009 4311707 . - 0 ID=cds-NP_218354.1;Parent=gene-Rv3837c;Dbxref=Genbank:NP_218354.1,GeneID:886169;Name=NP_218354.1;Note=phosphoglyceromutase (phosphoglycerate phosphomutase);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS00175;locus_tag=Rv3837c;product=phosphoglycerate mutase;protein_id=NP_218354.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4311704 4312669 . - . ID=gene-Rv3838c;Dbxref=GeneID:886170;Name=pheA;gbkey=Gene;gene=pheA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3838c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4311704 4312669 . - 0 ID=cds-NP_218355.1;Parent=gene-Rv3838c;Dbxref=Genbank:NP_218355.1,GeneID:886170;Name=NP_218355.1;experiment=DESCRIPTION:Protein purification and characterization[PMID:15753077];gbkey=CDS;gene=pheA;inference=protein motif:PROSITE:PS00858;locus_tag=Rv3838c;product=prephenate dehydratase;protein_id=NP_218355.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4312765 4313541 . + . ID=gene-Rv3839;Dbxref=GeneID:886171;Name=Rv3839;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3839
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4312765 4313541 . + 0 ID=cds-NP_218356.1;Parent=gene-Rv3839;Dbxref=Genbank:NP_218356.1,GeneID:886171;Name=NP_218356.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3839;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218356.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4313567 4313980 . + . ID=gene-Rv3840;Dbxref=GeneID:886167;Name=Rv3840;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3840
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4313567 4313980 . + 0 ID=cds-NP_218357.1;Parent=gene-Rv3840;Dbxref=Genbank:NP_218357.1,GeneID:886167;Name=NP_218357.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3840;product=transcriptional regulator;protein_id=NP_218357.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4314178 4314723 . + . ID=gene-Rv3841;Dbxref=GeneID:886176;Name=bfrB;gbkey=Gene;gene=bfrB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3841
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4314178 4314723 . + 0 ID=cds-NP_218358.1;Parent=gene-Rv3841;Dbxref=Genbank:NP_218358.1,GeneID:886176;Name=NP_218358.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=bfrB;locus_tag=Rv3841;product=bacterioferritin BfrB;protein_id=NP_218358.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4314738 4315562 . - . ID=gene-Rv3842c;Dbxref=GeneID:886177;Name=glpQ1;gbkey=Gene;gene=glpQ1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3842c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4314738 4315562 . - 0 ID=cds-NP_218359.1;Parent=gene-Rv3842c;Dbxref=Genbank:NP_218359.1,GeneID:886177;Name=NP_218359.1;Note=glycerophosphodiester phosphodiesterase;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=glpQ1;locus_tag=Rv3842c;product=glycerophosphoryl diester phosphodiesterase;protein_id=NP_218359.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq sequence_feature 4314798 4314891 . + . ID=id-NC_000962.3:4314798..4314891;Note=ncrMT3949%2C fragment of putative small regulatory RNA (See Pelly et al.%2C 2012)%2C cloned from M. tuberculosis CDC1551%3B supported by RNA-seq in H37Rv (unpublished data).%3B Fragment of putative small regulatory RNA;gbkey=misc_feature
+NC_000962.3 RefSeq gene 4315568 4316596 . - . ID=gene-Rv3843c;Dbxref=GeneID:886178;Name=Rv3843c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3843c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4315568 4316596 . - 0 ID=cds-NP_218360.1;Parent=gene-Rv3843c;Dbxref=Genbank:NP_218360.1,GeneID:886178;Name=NP_218360.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3843c;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218360.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4317073 4317165 . + . ID=gene-RVnc0040;Dbxref=GeneID:14515878;Name=MTS2975;gbkey=Gene;gene=MTS2975;gene_biotype=ncRNA;locus_tag=RVnc0040
+NC_000962.3 RefSeq ncRNA 4317073 4317165 . + . ID=rna-RVnc0040;Parent=gene-RVnc0040;Dbxref=GeneID:14515878;Note=MTS2975%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C ends not mapped%2C ~~100 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS2975;locus_tag=RVnc0040;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq exon 4317073 4317165 . + . ID=exon-RVnc0040-1;Parent=rna-RVnc0040;Dbxref=GeneID:14515878;Note=MTS2975%2C putative small regulatory RNA (See Arnvig et al.%2C 2011)%2C ends not mapped%2C ~~100 bp band detected by Northern blot.;gbkey=ncRNA;gene=MTS2975;locus_tag=RVnc0040;product=Putative small regulatory RNA
+NC_000962.3 RefSeq gene 4318775 4319266 . + . ID=gene-Rv3844;Dbxref=GeneID:886180;Name=Rv3844;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3844
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4318775 4319266 . + 0 ID=cds-NP_218361.1;Parent=gene-Rv3844;Dbxref=Genbank:NP_218361.1,GeneID:886180;Name=NP_218361.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3844;product=transposase;protein_id=NP_218361.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4319281 4319640 . + . ID=gene-Rv3845;Dbxref=GeneID:886179;Name=Rv3845;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3845
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4319281 4319640 . + 0 ID=cds-NP_218362.1;Parent=gene-Rv3845;Dbxref=Genbank:NP_218362.1,GeneID:886179;Name=NP_218362.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;inference=protein motif:PROSITE:PS01137;locus_tag=Rv3845;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218362.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4320704 4321327 . + . ID=gene-Rv3846;Dbxref=GeneID:886174;Name=sodA;gbkey=Gene;gene=sodA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=sod,sodB;locus_tag=Rv3846
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4320704 4321327 . + 0 ID=cds-NP_218363.1;Parent=gene-Rv3846;Dbxref=Genbank:NP_218363.1,GeneID:886174;Name=NP_218363.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=sodA;inference=protein motif:PROSITE:PS00088;locus_tag=Rv3846;product=superoxide dismutase;protein_id=NP_218363.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4321538 4322071 . + . ID=gene-Rv3847;Dbxref=GeneID:886182;Name=Rv3847;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3847
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4321538 4322071 . + 0 ID=cds-NP_218364.1;Parent=gene-Rv3847;Dbxref=Genbank:NP_218364.1,GeneID:886182;Name=NP_218364.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3847;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218364.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4322326 4323234 . + . ID=gene-Rv3848;Dbxref=GeneID:886159;Name=Rv3848;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3848
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4322326 4323234 . + 0 ID=cds-NP_218365.1;Parent=gene-Rv3848;Dbxref=Genbank:NP_218365.1,GeneID:886159;Name=NP_218365.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3848;product=transmembrane protein;protein_id=NP_218365.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4323499 4323897 . + . ID=gene-Rv3849;Dbxref=GeneID:886184;Name=espR;gbkey=Gene;gene=espR;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3849
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4323499 4323897 . + 0 ID=cds-NP_218366.1;Parent=gene-Rv3849;Dbxref=Genbank:NP_218366.1,GeneID:886184;Name=NP_218366.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=espR;locus_tag=Rv3849;product=ESX-1 transcriptional regulator EspR;protein_id=NP_218366.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4324015 4324671 . + . ID=gene-Rv3850;Dbxref=GeneID:886173;Name=Rv3850;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3850
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4324015 4324671 . + 0 ID=cds-NP_218367.1;Parent=gene-Rv3850;Dbxref=Genbank:NP_218367.1,GeneID:886173;Name=NP_218367.1;Note=A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3850;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218367.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4324683 4324967 . + . ID=gene-Rv3851;Dbxref=GeneID:886186;Name=Rv3851;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3851
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4324683 4324967 . + 0 ID=cds-NP_218368.1;Parent=gene-Rv3851;Dbxref=Genbank:NP_218368.1,GeneID:886186;Name=NP_218368.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3851;product=membrane protein;protein_id=NP_218368.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4325074 4325478 . + . ID=gene-Rv3852;Dbxref=GeneID:886187;Name=hns;gbkey=Gene;gene=hns;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3852
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4325074 4325478 . + 0 ID=cds-NP_218369.1;Parent=gene-Rv3852;Dbxref=Genbank:NP_218369.1,GeneID:886187;Name=NP_218369.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=hns;locus_tag=Rv3852;product=histone-like protein Hns;protein_id=NP_218369.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4325495 4325968 . + . ID=gene-Rv3853;Dbxref=GeneID:886181;Name=rraA;gbkey=Gene;gene=rraA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=menG;locus_tag=Rv3853
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4325495 4325968 . + 0 ID=cds-NP_218370.1;Parent=gene-Rv3853;Dbxref=Genbank:NP_218370.1,GeneID:886181;Name=NP_218370.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rraA;locus_tag=Rv3853;product=RNase E regulator RraA;protein_id=NP_218370.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4326004 4327473 . - . ID=gene-Rv3854c;Dbxref=GeneID:886175;Name=ethA;gbkey=Gene;gene=ethA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=aka,etaA;locus_tag=Rv3854c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4326004 4327473 . - 0 ID=cds-NP_218371.1;Parent=gene-Rv3854c;Dbxref=Genbank:NP_218371.1,GeneID:886175;Name=NP_218371.1;Note=FAD-containing;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:10944230];gbkey=CDS;gene=ethA;locus_tag=Rv3854c;product=monooxygenase EthA;protein_id=NP_218371.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4327549 4328199 . + . ID=gene-Rv3855;Dbxref=GeneID:886189;Name=ethR;gbkey=Gene;gene=ethR;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=aka,etaR;locus_tag=Rv3855
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4327549 4328199 . + 0 ID=cds-NP_218372.1;Parent=gene-Rv3855;Dbxref=Genbank:NP_218372.1,GeneID:886189;Name=NP_218372.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:10944230];gbkey=CDS;gene=ethR;locus_tag=Rv3855;product=HTH-type transcriptional repressor EthR;protein_id=NP_218372.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4328401 4329408 . - . ID=gene-Rv3856c;Dbxref=GeneID:886193;Name=Rv3856c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3856c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4328401 4329408 . - 0 ID=cds-NP_218373.1;Parent=gene-Rv3856c;Dbxref=Genbank:NP_218373.1,GeneID:886193;Name=NP_218373.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3856c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218373.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4329417 4329614 . - . ID=gene-Rv3857c;Dbxref=GeneID:886192;Name=Rv3857c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3857c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4329417 4329614 . - 0 ID=cds-NP_218374.1;Parent=gene-Rv3857c;Dbxref=Genbank:NP_218374.1,GeneID:886192;Name=NP_218374.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3857c;product=membrane protein;protein_id=NP_218374.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4330039 4331505 . - . ID=gene-Rv3858c;Dbxref=GeneID:886196;Name=gltD;gbkey=Gene;gene=gltD;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3858c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4330039 4331505 . - 0 ID=cds-NP_218375.1;Parent=gene-Rv3858c;Dbxref=Genbank:NP_218375.1,GeneID:886196;Name=NP_218375.1;Note=NADH-dependent L-glutamate synthase (L-glutamate synthetase) (NADH-glutamate synthase) (glutamate synthase (NADH)) (GLTS beta chain) (NADPH-GOGAT);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=gltD;locus_tag=Rv3858c;product=glutamate synthase small subunit;protein_id=NP_218375.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4342770 4343321 . + . ID=gene-Rv3867;Dbxref=GeneID:886203;Name=espH;gbkey=Gene;gene=espH;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3867
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4343314 4345035 . + . ID=gene-Rv3868;Dbxref=GeneID:886199;Name=eccA1;gbkey=Gene;gene=eccA1;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3868
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4345039 4346481 . + . ID=gene-Rv3869;Dbxref=GeneID:886166;Name=eccB1;gbkey=Gene;gene=eccB1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm6;locus_tag=Rv3869
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4346481 4348724 . + . ID=gene-Rv3870;Dbxref=GeneID:886204;Name=eccCa1;gbkey=Gene;gene=eccCa1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm1;locus_tag=Rv3870
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4346481 4348724 . + 0 ID=cds-NP_218387.1;Parent=gene-Rv3870;Dbxref=Genbank:NP_218387.1,GeneID:886204;Name=NP_218387.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16368961];gbkey=CDS;gene=eccCa1;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3870;product=ESX-1 secretion system protein EccCa;protein_id=NP_218387.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4348721 4348773 . + . ID=id-NC_000962.3:4348721..4348773;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4348774 4348826 . + . ID=id-NC_000962.3:4348774..4348826;Note=53 bp Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit%2CClass II;gbkey=repeat_region
+NC_000962.3 RefSeq gene 4348827 4350602 . + . ID=gene-Rv3871;Dbxref=GeneID:886202;Name=eccCb1;gbkey=Gene;gene=eccCb1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm2;locus_tag=Rv3871
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4348827 4350602 . + 0 ID=cds-NP_218388.1;Parent=gene-Rv3871;Dbxref=Genbank:NP_218388.1,GeneID:886202;Name=NP_218388.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16368961];gbkey=CDS;gene=eccCb1;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3871;product=ESX-1 secretion system protein EccCb;protein_id=NP_218388.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4350745 4351044 . + . ID=gene-Rv3872;Dbxref=GeneID:886191;Name=PE35;gbkey=Gene;gene=PE35;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3872
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4350745 4351044 . + 0 ID=cds-YP_178021.1;Parent=gene-Rv3872;Dbxref=Genbank:YP_178021.1,GeneID:886191;Name=YP_178021.1;Note=Member of the M. tuberculosis PE family;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16368961];gbkey=CDS;gene=PE35;locus_tag=Rv3872;product=PE family protein PE35;protein_id=YP_178021.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4351075 4352181 . + . ID=gene-Rv3873;Dbxref=GeneID:886201;Name=PPE68;gbkey=Gene;gene=PPE68;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3873
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4351075 4352181 . + 0 ID=cds-YP_178022.1;Parent=gene-Rv3873;Dbxref=Genbank:YP_178022.1,GeneID:886201;Name=YP_178022.1;Note=Member of the Mycobacterium tuberculosis PPE family. A core mycobacterial gene%3B conserved in mycobacterial strains (See Marmiesse et al.%2C 2004 PMID:14766927). Predicted possible vaccine candidate (See Zvi et al.%2C 2008).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=PPE68;locus_tag=Rv3873;product=PPE family protein PPE68;protein_id=YP_178022.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4352274 4352576 . + . ID=gene-Rv3874;Dbxref=GeneID:886194;Name=esxB;gbkey=Gene;gene=esxB;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=cfp10,lhp;locus_tag=Rv3874
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4352274 4352576 . + 0 ID=cds-NP_218391.1;Parent=gene-Rv3874;Dbxref=Genbank:NP_218391.1,GeneID:886194;Name=NP_218391.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=esxB;locus_tag=Rv3874;product=ESAT-6-like protein EsxB;protein_id=NP_218391.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4352609 4352896 . + . ID=gene-Rv3875;Dbxref=GeneID:886209;Name=esxA;gbkey=Gene;gene=esxA;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=esat-6;locus_tag=Rv3875
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4352609 4352896 . + 0 ID=cds-YP_178023.1;Parent=gene-Rv3875;Dbxref=Genbank:YP_178023.1,GeneID:886209;Name=YP_178023.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=esxA;locus_tag=Rv3875;product=ESAT-6 protein EsxA;protein_id=YP_178023.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4353010 4355010 . + . ID=gene-Rv3876;Dbxref=GeneID:886206;Name=espI;gbkey=Gene;gene=espI;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm3;locus_tag=Rv3876
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4353010 4355010 . + 0 ID=cds-NP_218393.1;Parent=gene-Rv3876;Dbxref=Genbank:NP_218393.1,GeneID:886206;Name=NP_218393.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=espI;locus_tag=Rv3876;product=ESX-1 secretion-associated protein EspI;protein_id=NP_218393.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4353280 4353330 . + . ID=id-Rv3876;Dbxref=GeneID:886206;Note=51 bp imperfect direct repeat 1%2CGAACCGGCCGCATCTAAACCACCCACACCCCCCATGCCCATCGCCGGACCC;gbkey=repeat_region;gene=espI;locus_tag=Rv3876
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4353331 4353381 . + . ID=id-Rv3876-2;Dbxref=GeneID:886206;Note=51 bp imperfect direct repeat 2%2CGAACCGGCCCCACCCAAACCACCCACACCCCCCATGCCCATCGCCGGACCC;gbkey=repeat_region;gene=espI;locus_tag=Rv3876
+NC_000962.3 RefSeq repeat_region 4353382 4353432 . + . ID=id-Rv3876-3;Dbxref=GeneID:886206;Note=51 bp imperfect direct repeat 3%2CGAACCGGCCCCACCCAAACCACCCACACCTCCGATGCCCATCGCCGGACCT;gbkey=repeat_region;gene=espI;locus_tag=Rv3876
+NC_000962.3 RefSeq gene 4355007 4356542 . + . ID=gene-Rv3877;Dbxref=GeneID:886207;Name=eccD1;gbkey=Gene;gene=eccD1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm4;locus_tag=Rv3877
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4355007 4356542 . + 0 ID=cds-NP_218394.1;Parent=gene-Rv3877;Dbxref=Genbank:NP_218394.1,GeneID:886207;Name=NP_218394.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16368961];gbkey=CDS;gene=eccD1;locus_tag=Rv3877;product=ESX-1 secretion system protein EccD1;protein_id=NP_218394.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4356693 4357535 . + . ID=gene-Rv3878;Dbxref=GeneID:886198;Name=espJ;gbkey=Gene;gene=espJ;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=TB27.4;locus_tag=Rv3878
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4356693 4357535 . + 0 ID=cds-NP_218395.1;Parent=gene-Rv3878;Dbxref=Genbank:NP_218395.1,GeneID:886198;Name=NP_218395.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=espJ;locus_tag=Rv3878;product=ESX-1 secretion-associated protein EspJ;protein_id=NP_218395.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4357593 4359782 . - . ID=gene-Rv3879c;Dbxref=GeneID:886212;Name=espK;gbkey=Gene;gene=espK;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3879c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4357593 4359782 . - 0 ID=cds-NP_218396.1;Parent=gene-Rv3879c;Dbxref=Genbank:NP_218396.1,GeneID:886212;Name=NP_218396.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=espK;locus_tag=Rv3879c;product=ESX-1 secretion-associated protein EspK;protein_id=NP_218396.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4360199 4360546 . - . ID=gene-Rv3880c;Dbxref=GeneID:886205;Name=espL;gbkey=Gene;gene=espL;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3880c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4360199 4360546 . - 0 ID=cds-NP_218397.1;Parent=gene-Rv3880c;Dbxref=Genbank:NP_218397.1,GeneID:886205;Name=NP_218397.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=espL;locus_tag=Rv3880c;product=ESX-1 secretion-associated protein EspL;protein_id=NP_218397.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4360543 4361925 . - . ID=gene-Rv3881c;Dbxref=GeneID:886214;Name=espB;gbkey=Gene;gene=espB;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3881c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4360543 4361925 . - 0 ID=cds-NP_218398.1;Parent=gene-Rv3881c;Dbxref=Genbank:NP_218398.1,GeneID:886214;Name=NP_218398.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=espB;locus_tag=Rv3881c;product=ESX-1 secretion-associated protein EspB;protein_id=NP_218398.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4362032 4363420 . - . ID=gene-Rv3882c;Dbxref=GeneID:886208;Name=eccE1;gbkey=Gene;gene=eccE1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm7;locus_tag=Rv3882c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4362032 4363420 . - 0 ID=cds-NP_218399.1;Parent=gene-Rv3882c;Dbxref=Genbank:NP_218399.1,GeneID:886208;Name=NP_218399.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=eccE1;locus_tag=Rv3882c;product=ESX-1 secretion system protein EccE1;protein_id=NP_218399.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4363417 4364757 . - . ID=gene-Rv3883c;Dbxref=GeneID:886217;Name=mycP1;gbkey=Gene;gene=mycP1;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=snm8;locus_tag=Rv3883c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4363417 4364757 . - 0 ID=cds-NP_218400.1;Parent=gene-Rv3883c;Dbxref=Genbank:NP_218400.1,GeneID:886217;Name=NP_218400.1;Note=MycP1 (serine protease) (subtilisin-like protease) (subtilase-like) (mycosin-1);experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=mycP1;locus_tag=Rv3883c;product=membrane-anchored mycosin;protein_id=NP_218400.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 4364979 4366838 . - 0 ID=cds-NP_218401.1;Parent=gene-Rv3884c;Dbxref=Genbank:NP_218401.1,GeneID:886210;Name=NP_218401.1;gbkey=CDS;gene=eccA2;inference=protein motif:PROSITE:PS00017;locus_tag=Rv3884c;product=ESX-2 secretion system protein EccA;protein_id=NP_218401.1;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4374484 4375683 . - . ID=gene-Rv3892c;Dbxref=GeneID:886227;Name=PPE69;gbkey=Gene;gene=PPE69;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3892c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4380453 4381940 . - . ID=gene-Rv3895c;Dbxref=GeneID:886231;Name=eccB2;gbkey=Gene;gene=eccB2;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3895c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4380453 4381940 . - 0 ID=cds-NP_218412.1;Parent=gene-Rv3895c;Dbxref=Genbank:NP_218412.1,GeneID:886231;Name=NP_218412.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;gene=eccB2;locus_tag=Rv3895c;product=ESX-2 secretion system protein EccB;protein_id=NP_218412.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4381943 4382851 . - . ID=gene-Rv3896c;Dbxref=GeneID:886216;Name=Rv3896c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3896c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4383008 4383640 . - . ID=gene-Rv3897c;Dbxref=GeneID:886225;Name=Rv3897c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3897c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4383653 4383985 . - . ID=gene-Rv3898c;Dbxref=GeneID:886233;Name=Rv3898c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3898c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4383653 4383985 . - 0 ID=cds-NP_218415.1;Parent=gene-Rv3898c;Dbxref=Genbank:NP_218415.1,GeneID:886233;Name=NP_218415.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3898c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218415.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4384147 4385379 . - . ID=gene-Rv3899c;Dbxref=GeneID:886228;Name=Rv3899c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3899c
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+NC_000962.3 RefSeq gene 4385373 4386308 . - . ID=gene-Rv3900c;Dbxref=GeneID:886235;Name=Rv3900c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3900c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4385373 4386308 . - 0 ID=cds-NP_218417.1;Parent=gene-Rv3900c;Dbxref=Genbank:NP_218417.1,GeneID:886235;Name=NP_218417.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:15525680];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3900c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218417.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4386365 4386814 . - . ID=gene-Rv3901c;Dbxref=GeneID:886226;Name=Rv3901c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3901c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4386365 4386814 . - 0 ID=cds-NP_218418.1;Parent=gene-Rv3901c;Dbxref=Genbank:NP_218418.1,GeneID:886226;Name=NP_218418.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3901c;product=membrane protein;protein_id=NP_218418.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4387365 4387895 . - . ID=gene-Rv3902c;Dbxref=GeneID:886236;Name=Rv3902c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3902c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4387365 4387895 . - 0 ID=cds-NP_218419.1;Parent=gene-Rv3902c;Dbxref=Genbank:NP_218419.1,GeneID:886236;Name=NP_218419.1;Note=This region is a possible MT-complex-specific genomic island (See Becq et al.%2C 2007 PMID:17545187).;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3902c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218419.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4387892 4390432 . - . ID=gene-Rv3903c;Dbxref=GeneID:886229;Name=Rv3903c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3903c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4387892 4390432 . - 0 ID=cds-NP_218420.1;Parent=gene-Rv3903c;Dbxref=Genbank:NP_218420.1,GeneID:886229;Name=NP_218420.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3903c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218420.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4390437 4390709 . - . ID=gene-Rv3904c;Dbxref=GeneID:886237;Name=esxE;gbkey=Gene;gene=esxE;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_12;locus_tag=Rv3904c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4390437 4390709 . - 0 ID=cds-NP_218421.1;Parent=gene-Rv3904c;Dbxref=Genbank:NP_218421.1,GeneID:886237;Name=NP_218421.1;gbkey=CDS;gene=esxE;locus_tag=Rv3904c;product=ESAT-6 like protein EsxE;protein_id=NP_218421.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4390720 4391031 . - . ID=gene-Rv3905c;Dbxref=GeneID:886239;Name=esxF;gbkey=Gene;gene=esxF;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=ES6_13;locus_tag=Rv3905c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4390720 4391031 . - 0 ID=cds-NP_218422.1;Parent=gene-Rv3905c;Dbxref=Genbank:NP_218422.1,GeneID:886239;Name=NP_218422.1;gbkey=CDS;gene=esxF;locus_tag=Rv3905c;product=ESAT-6 like protein EsxF;protein_id=NP_218422.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4391097 4391606 . - . ID=gene-Rv3906c;Dbxref=GeneID:886221;Name=Rv3906c;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3906c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4391097 4391606 . - 0 ID=cds-NP_218423.1;Parent=gene-Rv3906c;Dbxref=Genbank:NP_218423.1,GeneID:886221;Name=NP_218423.1;gbkey=CDS;locus_tag=Rv3906c;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218423.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4391631 4393073 . - . ID=gene-Rv3907c;Dbxref=GeneID:886240;Name=pcnA;gbkey=Gene;gene=pcnA;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3907c
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4391631 4393073 . - 0 ID=cds-YP_178026.1;Parent=gene-Rv3907c;Dbxref=Genbank:YP_178026.1,GeneID:886240;Name=YP_178026.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=pcnA;inference=protein motif:PROSITE:PS00639;locus_tag=Rv3907c;product=poly(A) polymerase PcnA;protein_id=YP_178026.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4393449 4394195 . + . ID=gene-Rv3908;Dbxref=GeneID:886242;Name=mutT4;gbkey=Gene;gene=mutT4;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3908
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4393449 4394195 . + 0 ID=cds-NP_218425.1;Parent=gene-Rv3908;Dbxref=Genbank:NP_218425.1,GeneID:886242;Name=NP_218425.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21920479];gbkey=CDS;gene=mutT4;inference=protein motif:PROSITE:PS00893;locus_tag=Rv3908;product=mutator protein MutT;protein_id=NP_218425.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4394192 4396600 . + . ID=gene-Rv3909;Dbxref=GeneID:886245;Name=Rv3909;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3909
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4394192 4396600 . + 0 ID=cds-NP_218426.1;Parent=gene-Rv3909;Dbxref=Genbank:NP_218426.1,GeneID:886245;Name=NP_218426.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:20429878];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3909;product=hypothetical protein;protein_id=NP_218426.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4396597 4400151 . + . ID=gene-Rv3910;Dbxref=GeneID:886247;Name=Rv3910;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3910
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4396597 4400151 . + 0 ID=cds-NP_218427.1;Parent=gene-Rv3910;Dbxref=Genbank:NP_218427.1,GeneID:886247;Name=NP_218427.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3910;product=peptidoglycan biosynthesis protein;protein_id=NP_218427.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4400186 4400854 . + . ID=gene-Rv3911;Dbxref=GeneID:886246;Name=sigM;gbkey=Gene;gene=sigM;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3911
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4400186 4400854 . + 0 ID=cds-NP_218428.1;Parent=gene-Rv3911;Dbxref=Genbank:NP_218428.1,GeneID:886246;Name=NP_218428.1;experiment=DESCRIPTION:Gene expression%2C mutation analysis[PMID:16735723];gbkey=CDS;gene=sigM;locus_tag=Rv3911;product=ECF RNA polymerase sigma factor SigM;protein_id=NP_218428.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4400870 4401634 . + . ID=gene-Rv3912;Dbxref=GeneID:886234;Name=Rv3912;gbkey=Gene;gene_biotype=protein_coding;locus_tag=Rv3912
+NC_000962.3 RefSeq CDS 4400870 4401634 . + 0 ID=cds-NP_218429.1;Parent=gene-Rv3912;Dbxref=Genbank:NP_218429.1,GeneID:886234;Name=NP_218429.1;experiment=EXISTENCE:Mass spectrometry[PMID:21085642];gbkey=CDS;locus_tag=Rv3912;product=anti-sigma-M factor RsmA;protein_id=NP_218429.1;transl_table=11
+NC_000962.3 RefSeq gene 4401728 4402735 . + . ID=gene-Rv3913;Dbxref=GeneID:886232;Name=trxB2;gbkey=Gene;gene=trxB2;gene_biotype=protein_coding;gene_synonym=trxR;locus_tag=Rv3913
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 4410412 4410789 . - 0 ID=cds-NP_218440.3;Parent=gene-Rv3923c;Dbxref=Genbank:NP_218440.3,GeneID:886248;Name=NP_218440.3;Note=RnpA (RNaseP protein) (RNase P protein) (protein C5);gbkey=CDS;gene=rnpA;inference=protein motif:PROSITE:PS00648;locus_tag=Rv3923c;product=ribonuclease P protein component;protein_id=NP_218440.3;transl_table=11
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+NC_000962.3 RefSeq CDS 4410786 4410929 . - 0 ID=cds-NP_218441.1;Parent=gene-Rv3924c;Dbxref=Genbank:NP_218441.1,GeneID:886258;Name=NP_218441.1;experiment=COORDINATES:Mass spectrometry[PMID:21969609];gbkey=CDS;gene=rpmH;inference=protein motif:PROSITE:PS00784;locus_tag=Rv3924c;product=50S ribosomal protein L34;protein_id=NP_218441.1;transl_table=11
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