From 18f580316b4d142493343f9e319b4f85d6ea3663 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: bienchen <stefan.bienert@unibas.ch>
Date: Tue, 13 Feb 2024 18:46:01 +0100
Subject: [PATCH] Update Singularity to working Jupyter.
---
container/Singularity | 5 ++---
1 file changed, 2 insertions(+), 3 deletions(-)
diff --git a/container/Singularity b/container/Singularity
index 21a1b71a..92bde83d 100644
--- a/container/Singularity
+++ b/container/Singularity
@@ -1,5 +1,5 @@
BootStrap: docker
-From: registry.scicore.unibas.ch/schwede/promod3:3.4.0-OST2.6.0-jammy
+From: registry.scicore.unibas.ch/schwede/promod3:3.4.0-OST2.7.0-jammy
%post
##############################################################################
# POST
@@ -14,7 +14,7 @@ ln -sf /bin/bash /bin/sh
# INSTALL SYSTEM DEPS
#####################
apt-get update -y && apt-get install -y ipython3 jupyter python3-pip
-pip3 install ipywidgets==7.6.0
+pip3 install ipywidgets==8.1.1
pip3 install nglview \
six
@@ -46,7 +46,6 @@ cat > $JUPYTER_PATH/kernels/ost-kernel/kernel.json <<EOF
}
EOF
-jupyter nbextension enable nglview --py --sys-prefix
%environment
##############################################################################
--
GitLab