doc: clarify full module path

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modules/mol/alg/doc/contact_score.rst

modules/mol/alg/doc/dockq.rst

modules/mol/alg/doc/helix_kinks.rst

modules/mol/alg/doc/ligand_scoring.rst

modules/mol/alg/doc/molalg.rst

modules/mol/alg/doc/qsscore.rst

modules/mol/alg/doc/scoring.rst

modules/mol/alg/doc/stereochemistry.rst

modules/mol/alg/doc/structure_analysis.rst

modules/mol/alg/doc/trajectory_analysis.rst