config.yaml

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  ### Annotation
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  ### Output and log directory
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  output_dir: "results"
  local_log: "results/local_log"
  cluster_log: "results/cluster_log"
  dir_created: "results/dir_created"
  ##############################################################################
  ### sample info
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  input_dir: "samples"
  input_reads_pattern: ".fastq.gz"
  sample: ["example"]
  example: {adapter: GATCGGAAGAGCACA}
  ##############################################################################
  ### Parameters for independent rules/jobs
  ##############################################################################

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